XLOC_038462 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038462
Unique NameXLOC_038462
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000066_pilon:1533329..1543960-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038462 ID=XLOC_038462|Name=XLOC_038462|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10632bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:1533329..1543960- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGACATAGATTGGTCAGATCCAGAAAAATCAATCGAAGGAATCAA GAAATTAATCAAAGCTGTTCCCGATTTCCCAAAGAAAGGGATCTTATTCC GGTAAGGAAAAAAATAAATGATGTAGGGTTTTATTGAATTTCCATTCAGG GGGGGGGGGTTGGACGAACCTTGCGAAATTGCGAATTTGCCAACGGAAAT AATTCTTTTCATACCTGTCAGTGAGGGAGGGAGGACTAACTAAAATCATT CTTTTAACCACTGAATTTTACAAAACTTTTTACCTCCTGGAAATTCTTCT CGGGTTACCATCTGGAAATGTTCGTTCACCTGTATGGATATAAAATAGAA TGGCCTCTTATTTGGGCTACAAAGTAAATAATTTTCAATACTCGAGTGGA AACGTTGCTTGAACGAAAAATACGGCAATTTTCTAAAATCTTGTTTCATT TCTGCTTGCTAGGAATTTTAAGGTACAGAATCAATTTTTTGGAGTTTTCT AACATTAATTATTGCTTAAAGGCTTTGTTGGCTGAAAACTGACAAAAACC TATTATCTTTACCACAAGCTGTTCAAAGATATTCTTTCCAGCAAGCTCTA TCTTAATCATAAAATATTTTCAAACTTCAAAAAAAATTTCTTTCTCCAAT AGAGATATAATGGGAATTTTCCAAGTTCCACAAGCAGTTCAAGCCATGGT TGATATCATGTCTTACCACATCCAACAAAAACATCCTGAGTGTGATGCGA TCGTTGGTGAGTTTGCTTTTTACTCAGTCAGCTTCTGAAATCTGCTAGAT TCATTATTACAGTCAACTCTCTTTAATTCGAACCTCCATAATTTGAATCT TTCTTTAGGTTGGATTAAAACTTTGATCTCCTCCGCTGAAAAGAAGTGTA AAATGCTCTCTATAATTCGAAGAAAAATCTTTCCCTTCCCTTGAAGATCG 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TCTCGAGCGCTTATCACCCTGGGTTTACAACGAAGTTTCTCTTATCCCGA GTAACCGTCACCCTGGGTTTACAATAATTGGACCTTCCTTAATCACGAGC GCCTATCACCCTGGGTTTGCAACGGCCTTCTATTATCATGAGAGCCCATC ACCCTGTTTTAAAAAAGTGTTTACAATTGGGCCTTCCACTTTCACACGTA CACTGAAGTTGAGCCCAGTGCTTTAGCACGTTACAGTATCTCCAAAGTTT TACAATTGGCTCTTCATCTGGAAATTGAGTATGATAAATATATATGTAGC GTATAAAAAATATGATATTCATTAAAAATACTGAGACCGGTTGTAACTAG AGACTAGAAGGCTAAGAGTTGGTAAAGGCAAGTATGTTCGATCAAATACC GTTGTAGAGTAGTATGAGCTTGGCAAAAGTAGACTGAGTGAACGTAGTAC TAGTGGCTTGTGCAAGACCGGTGTAAAACCAAAGTTTGAATTTAGATTAA GCTATAAAATACTACAAAATTGATACAACTATTGATAACAACTAATAGAA CTAATTCCTCCATGGACAGTAAAATAAAGTACGACCAGACTAAAACGCTA GGTAGATCTAGGTAATTAGTAGAGTAAATACGATTGATGAGGTATGTAAG AGTGACACAAGAGTATGACTTGGAATTGCAGAATGTCCAGGAGTAGTAAA TATATAAAATATCACTAGAATAACTCAAAACTAATTAAAATCAAATAATT AAACAAATAGGGGATAGTTGCTCTAAAGAATAATGACCGGAGTATAAATA TCATTTACTTTCGCGAATTTGACAAAAAAAATTTCGCGAGCATAAACTTT CACGAATGAAGTATATTTTTTGTAGAAAATTCAAGTTTTTGGTTTCATAT TCTTTTTGCGAGTACAAACTTTTGCGAGCACAAACTTTCGCGAAATACCT TCTCAAGAATTTTCAAAGACATTTATATTTGCGAAAAGGCCTAAAATTCG CGAAAATCGTTTCTGCTCGCAAAAGTTTGTACGCCTAAAGTACTATATTT TCATACACCTTCTTCACAGGTTTAGATGCAAGAGGTTTTCTCATGGCACC GATGATTGCAATCAAATTGAACGTCCCGTTCATACCGGTCCGTAAACAAG GCAAGCTACCCGGAGAATGTATTTCAGCGGAATCCGTCAAAGAATACGGG AAGGTGTGAACAATTTTTTATTTTTGAGATCTGTTTTTCCTAAACTTTTA TCAAAATTTTTGAAAATCGTGACACTTTGAGAGGGAAAGTTTAGTGCGAT TTTGGGACCTTAACCTATGAATTTGTACTCCGCTGAGGGACTTTTGAGGT ATGAAAAAGAGTAACCTTATGACTCGCACGTATCCGTCGCCTGTTTTGCC TAAGTACACCCCCCCCTCGGGTTTCTGGACGAGAAGGTGACATGTACAAA AAACAATTAATAATATACTTTTTGTATCCTATATTTCAATGTTTCATTTC TCATAATTTTTTATATCCTTTACGAAAAGCTGAATATCTTCCGATCTCCA GACCACTTAAGCCTTCAACTGCTTTATTTAAATCATTCGTTATATCGTCA CAGAATTCCTTCGTTCGCTCGCTCCTTTTTTCAACTCGTGTCTTCGTTTC TTTCTTCTTCAGTTTGTTCATTATTCTCTCCTTCGTGGATAAAACATTCG AATTTTCTTTTTCACTCGATGATGCTGATGCCCTCGAGTCTTCTTCGTAA TCAAGCATGTTTTGAGTATGATCTGGAGACTCTCTCCAACAATCACATTT ACAGAATTCCAAATCAATAGTTGTTTCTTCTTTTGATGAAGTTTTATTTT CGCAGCTTTCCGATTCTAATCCACGCGATGTCTCGAGAAAGAGATTCAAA GTGTTGGATAAAAATGATTGCTGCCGTTTCTAATTGAAAGAAAATGAAGA TATAAAGTCAAGGTGACTGTGGTATAGTGGTCATTGACCTTGGTTGCTGC ACAGGCGACTGAGGTTCGATTCCCACTCGCCGGGGTTCACTTGGCAAGTG AATGAACCTTCGCCCGGGTCCACCTATGTTATGTGAGGGGACTTGGGTAG TCAGTTCCAAGGTGCTGACGGGGCGCTAATTGAAAGTGTCTATAGTTGCG AAAATGGGTTTCAAAGCCTCCTGCGACTCAACCAAATAGAAATAGAAATG TTGACTATGGATCCTAAAAAAACGAGGGGGGGGTGGAAAAAATCTTCAAA TTTTACTAAACGGGTTGGACATGATTACCGGGGGTTTGAAATTGGAAAAC TTTTCGAAAATTAATAACTGGGTGGGGACGTTACTTGGGAGCTTCGAGTA TACACCAAGAATATCACGAAATCAGTCAATGTGGCAGGAACTCACTTTTC ACTGCAATCACTATTTTAGAATAATAGAATATTCACCCACCTTCAACTTA TACAATCGCTGGTTGACCATTCTACGTTTCGTTTTCGTCTCCACGATATC TTCTCTTACTTCACCACGCACTGACTTTAGTTCACCTAGCCTCGTTCCGA CGCGACTATTTTCTCTTTCAGCCTCGTACTGTTTAATTTCAAGTCGATTG ATACCATCTGTTAAATTTTTACTGTATTTTGCGGCTTCCTTTGAAATGTT TTGATATTTGGTATGCAGTTTTCTGCATTCCGCTTCCAATAATTCAATGT TATCAACGTGGGCCAGTCTTGGGAATTCTTTAGGAACTGTATCGTATGGT TTGTACTTTCCAACGTGTCTTTCCTCAGATGCATCAGCCTGGAGGACTCT TTCGTTAGCCTCTGATTGCACCAAATCTAAGCGATCCTGCCTGTACATTT CTCCAACAAGTAATTTCGAAAAGTAATTATAGTTAAAAGATTCTCTTTTC TACCTTTGTACTAATTCTCTGTTCTATTGGTGTGTTAAAGATATCAAGAA TTTTTTTTTGTTTTTATTTGACGTCAAATTTTTATATCTTGACGTCAATT TCATCACGTGGAAAATCGATAAAATGTCTAAAAAATTTGATATGATTTCT CTATTCGTTGGTTTGGGGTTGGTTTAGACTTGGAGCCTTCATAATTCATG TAATACAGTAATATGGGTGTTGTATGATAATATACGATAATTGTTACGGA ATAATATCTGTTTGTATAATCAATTTGTCACTTCAATTCTTTTTGCTTAT TTTCTAATACATATGGCTGAATAAGTTGTCTCGTATGTTTATTTCATTTT CAATTTAACATGTAGCAATAAATAATTATTTTGGTAGCTACGCGTGACAA AATTGGAGAAAGATTAATTACAATATTTTAGCGTTAAATAAATTGACTGT GGTAGATAAGATATCTTCATTAATCTCATGGTTGATTGAAATTCGATTGC TTACGTTAATTTGTAATTTCCCGCAAAAGTGAGATTTAAATCGTTTGGAA ATTCATCACCTTTTTCGAATTTCTTACTAACTTCGAAAGCTTAAGTAAAT GGTATACTATCCAATTAAAACTCGATTCGCGTTACTATGACTTTTTTGAG GCCTCTTTTAAAAGTTTCAGATTGATTTCCAGTGTTCAATTGATGTCTTT CAGAATTGTTAGAATTTCAATCAAAACCATGAGATTGACCAGGAATCCCA TCCTTGCTTTCGTGAAATTTTAAGAAAAATTACCCTCTGTCAAATTGCGA AATATTTTAAATTTCTGAATTGACTTCGGGAAATTTATCCCTAATTTCCC TCGTAACCATGAGATTACTAGTACAAACTCGTTATCATGAATTATCTAAC GAATCTTCTGTGTAGCTCAGTGTTTTACCGTTACACGTACTGGCAGCTTC ATTCAATTGGGATTTATGCCATCCTTTTTTCAAAAATATTGCTCCAAGAT TGAGTTTTTCATTTGCAAGACTTAACTTCACGCCCCAATTAGAAGAAAAG TAATAGCTGCTCAAATTCCCGCCACGCGTTAATAATTGGAGTAAAATTAC ACGCTTGTTTTTTTATAAGAACCATCTTGGCTGATCCTGGGATTGTTCTT AAATTTATATACTTTCAAACAATAGAGCTTCTGAGGGCCTAAATCTGATA GCTGGTGTTCTTATAAAATTGTTCTTCAAAATGAAAAAGCGTGTAGTTAT AATTCAGACCAAAAACAAGGTAGTGAAGTCGTGTGATGAAAAATAAGATA AAAATAATATTTTGACAAAAAATTTTCATAAAAATATGATCTAGAGTTTT ATTAGCCAAATTCTGGAGCCGCTCGCTGCGCTGCAGTTGATGTGCGTGTC GGGACAAAAATCGAGGCGGAAGCCATTTTGTTTACATTTTGGCTGGGGGA AGCACTGCGAAACAGTAGATTTGGTGATTCTTGGGAAGAAAAAAGAAGAA TACTGTTTGGAACCAACATCAAATGTATTGGAATAGACTTCTATCATACA TTGGAATAACAGACAATACTTTGTGAACATAATGGATGTGTGAAACTTGC TTTTTTGTTTACAAACTTCACTCAAGTACTTTTGTGGATTTTGCTGCTTT CGAAAGCTGTCTGGCTGTTGGTGGAGACTACTAACTTGCAGAAGTAACTT TATATTGATGCAAACAATGACTATAGTAGCTTCAAAAACATTCTCTCTCA TGGAATTCAGCTAGGAAAGATTTTTTTGATCGCATCGGACAGTTTTGATA TGGAGAGAGATATCCAAGTTCAAACATGGTTTCACCCGTCCCTTTGGATA ACAAAAATTTCATGATTCATTTTATTCATTTCAAAAATGGCTGAAGAGAC ACCATCGGTCAGATCGGGGTCATCACTGACTGCGCTGAAGGATAAATTTC TTACTTTAACTCTCAAAATGTTGTCGAATTGCAACATGTTTTGTCTGTCG TTGAATCTTTCCTTCCAGTCATCAAAGACCAAGTTATGTTATAGAAGTGA CTTGATTTGGGCTACGTTTTACGTGCAGGTTTTGATTGGATCCAGGACAA GAAAAGGATTTAAGCAAATCCGCCGCTAAAAATTGAAAGTATGTTTTGAC ATTGACATGACTGTATATCATATAATGGGATTGTTATTGTTTTGGATATC CTGCATATAAATCCACTTTGTAGTCATTGCATTTTTAGGCAAAGTTATGA TGCCTCACTGTCTGAAATTATTTTTTATTTGAATTATATAGTTATATAAG TGCTCAATTCTTTTTGGTAGAAAAGCTTCCAACTTCCCATCACAAAGGAT TATAATAAAATTTTTTCGAGATGTTTTTACTTTATAGTTAGAATATATAA AATTTGCACAAAATTTGCTTTAGCCAAATATTTTTATGCTTGAAAATAGT TTATAATTTCTATTCTGTTGGATAATTGTGGTGGTAAAGATAAGAAAAAC ATAACATGAAGTCAAGTCAAAATACTCTCAAACACTCAAACATGTTTATG TATAATTTTACTTTCTACCTATTTCCCAACCCAAAATCTACCTATCATAC ACAATTGAGGCCCAAAGTGAGCAGAAAAAGTTTTTATAGGAAAAGTACTA GCCCAAATAAAGCTAAATACAGTACAAAAAGTTCATAGGCTATAGGCCAA AGACTGAGGCCAGGATAATTGAAAATTTCCCAAACTATGAGTGATTATAA ACGTTTCATGTTTGGAAGAGACTTTTTCTTGAAATTCCAAAAAAGTTTAT AAATCCAATGTCTTTTTCCTACTTTTTGCTGGTAAATAGAAGGGGAAGTC TCACTATTTTCCTACCAAATACCAGCGCATCCCGCCTAAAAACGAAAGCG AAAGTAGTTTTTGTCCCTACAAGCTGCGCACGGCAGCGCAGCGAGCGGCT CCAGAATTTGGCTAATTATTTGCTATGGGTCAGTTTTTTCCAGGCCCATG ATACAAGACGATAATGCGCCTTGTATCGCTTTGATACGGATGTGGAGCAA GATTGGTCAGAAAGAGGAAAAGAAAGAAAATGTTTTGTTCAATTCAACAC AAAATCGAGCACAATATAACAAAAGTAGACACCGGCCTGATATAATATAT GTGTCGGATACGAAACGGGATCACTTATGGAAAACGAAAACCTTTAACAT ATTATCAACTTCTTTCATTTCACATTATTTAGGATGTACTGGAGATGCAA AAAGGTTGCTTGAAAGAAGGACAAAAAGTCGTCATCGTCGATGATTTGCT GGCGACTGGAGGTAAATCCTTTCTTTATTATTCCGATGGTGGATTGGCGG CCGCCCACGCTAAAGCTCTAAAGGGGGCCCGACCAAGTTCCAATCGGAGA GAGATACTCGTCCTTCGATGTGCCGCATCCCCAGTCGGGCTAACCTACCC TTGCGTCTAAAGCTAAAAATATTTCGTTTGGACCCGTCTATCTCCGAAAA TGAGAGCTGGGTTACAGTTCTGCTGCTGCGAAATCCTTGATGCGGTCTTG CAAGATTCAGTAATGTAAACCTTCCAGATATTGAAAACGTTCCAGACCCT CAGAGCTTTAGCGTGTCGGAGGAAAATCTCTGCATCTGGGTCCCAGTTAA TCGTTTCTTCTATTCAACAAATAGTTGACGATCTCTAATTCGATGTTCTA CTTTACGATAAGCTATCAATTTTTCGATAATATTGAAAGTCACCATCAAC AAGAAACTCTCATAAACGACGCTCCCTTGTTCGTAGGCTTCTGCTCATCT TTCTATCAAAAAAAGTTTCGTATTTAGGAAGTATCTGCGATCAGACCTGC GATTCAGACTACCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTTAACGTTCAAATAAC GTTATTTGGACGTTATGAATGTCACATGGACGTTATATGGATGTCATACA GGACGTCCCCTGTATTCTCTCTCTGTGTCTGTCTCATCTTTTTGATAAAT TTAGGGAAAGCCCTGGGGTCCAATTTCGATGAACGTATTTTTACTTGTAC ATCTTTGGATAAGTAAGCTAATTTCTTATTTCAGAAGAATTTGGGGGCTT TGAGGTTGATTTTATTTTTGCCAAAACGAGGCTAACCATGTTTTTCACTT ACGCTTTTGCTCTGTTCTTTTCCGTAAAGTCAATAAAGCCATTATATTGG CTCCTTTGAGATCACGTCAATTCACTTATCACTCCTAATGCCACAAGAGA ATTAGGACCCGAGCTTACGGTGATTAAGAGCGCACTGACCTTTATAAATC CTGGAAAAACAAACTATATAAATCCCCCGCCATCTTTGGCCTTAGTTTTT TTTTAATGTAGTACACGCAAACAAGGCATTGCAGTGTTGAAACTTTGTCT AGCGTCAAACGGTGCTACATCATCAGAAGGTTCCAGTTAAATTTTATCTA GCAGTTTCGATGCATTACGCCACGTTTGAGTGTATTTATCATTAGGGTAC CACTTTCAAAAAAAACTCTGACCAAAGTTTTTGGTTAGCCGGTATCGAAA AACTGTTTACATGCTATGCTGGCTTTTAGTTCAAGAAGTGTATTTTTGCA AACGTACTTTAACAAAATTGGTACCCATTTTTTCGAACTGTAACCTCTGA ACATAAAAACCTTCAAATTTAAAATATGATCCTATTCCTATACCTTTTCC ATTATGGTCCTCAGCAGCTACTGATTTACAGAATATTCATTTCAGGTACC ATGGCAACAACATGTTCATTAGTTCGACAATTTGGTTGTAGTGTGTCTGG TACCATATGTTTGGTGGAACTAGCAGAATTGAACGGTGTAAAGAAATTAG ATGCCCCTTTTCATGCAATGATTAAATATTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:1533329..1543960-

>XLOC_038462 ID=XLOC_038462|Name=XLOC_038462|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1110bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:1533329..1543960- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGACATAGATTGGTCAGATCCAGAAAAATCAATCGAAGGAATCAA
GAAATTAATCAAAGCTGTTCCCGATTTCCCAAAGAAAGGGATCTTATTCC
GATGGCAGACATAGATTGGTCAGATCCAGAAAAATCAATCGAAGGAATCA
AGAAATTAATCAAAGCTGTTCCCGATTTCCCAAAGAAAGGGATCTTATTC
CGAGATATAATGGGAATTTTCCAAGTTCCACAAGCAGTTCAAGCCATGGT
TGATATCATGTCTTACCACATCCAACAAAAACATCCTGAGTGTGATGCGA
TCGTTGAGATATAATGGGAATTTTCCAAGTTCCACAAGCAGTTCAAGCCA
TGGTTGATATCATGTCTTACCACATCCAACAAAAACATCCTGAGTGTGAT
GCGATCGTTGGTTTAGATGCAAGAGGTTTTCTCATGGCACCGATGATTGC
AATCAAATTGAACGTCCCGTTCATACCGGTCCGTAAACAAGGCAAGCTAC
CCGGAGAATGTATTTCAGCGGAATCCGTCAAAGAATACGGGAAGGTTTAG
ATGCAAGAGGTTTTCTCATGGCACCGATGATTGCAATCAAATTGAACGTC
CCGTTCATACCGGTCCGTAAACAAGGCAAGCTACCCGGAGAATGTATTTC
AGCGGAATCCGTCAAAGAATACGGGAAGGATGTACTGGAGATGCAAAAAG
GTTGCTTGAAAGAAGGACAAAAAGTCGTCATCGTCGATGATTTGCTGGCG
ACTGGAGGATGTACTGGAGATGCAAAAAGGTTGCTTGAAAGAAGGACAAA
AAGTCGTCATCGTCGATGATTTGCTGGCGACTGGAGGTACCATGGCAACA
ACATGTTCATTAGTTCGACAATTTGGTTGTAGTGTGTCTGGTACCATATG
TTTGGTGGAACTAGCAGAATTGAACGGTGTAAAGAAATTAGATGCCCCTT
TTCATGCAATGATTAAATATTAGGTACCATGGCAACAACATGTTCATTAG
TTCGACAATTTGGTTGTAGTGTGTCTGGTACCATATGTTTGGTGGAACTA
GCAGAATTGAACGGTGTAAAGAAATTAGATGCCCCTTTTCATGCAATGAT
TAAATATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038462XLOC_038462-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000066_pilongenomesc0000066_pilon:1533329..1543960 -
Properties
Property NameValue
Aaloc421-555:136
Aaloc340-417:1651
Aaloc208-339:6712
Aaloc103-204:9980
Aaloc1-99:10633