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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000468_pilon:41924..44038+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038459 ID=XLOC_038459|Name=XLOC_038459|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2115bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000468_pilon:41924..44038+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATAGTTCAACCGATGAAAGCAAGAGACTTTCAATCAAAGTTTGGAT
TCTCTCATGCTTGTTTGGTATCGGCTCATGGGTTGTGATGAATGGTCTAT
GGGTTGAGCTACCAAACCTTGTCAATCAATTACCTGAAGGCTGGAAATTA
CCTTCTTACTTAACAATAATCGTGCAGATTGCTAATATTGGACCAATAAG
CTACGGTTTACTCAAGAAATATTGTGTTAAACCAGAGCGGAAAGAAACTC
TTGAGCATATCACAATATGccttattttggtttttggaatAATAGGTGCC
ATCCTGTTAGCTTGTTACTggaaaaaaacttcaaacatttttggtGCTGA
ACATAGCACCTCTCTACTTTTATTAACATTTGTTATAGCTCTCGTTGACT
GCACTTCATCTGTTACTTTTTTACCCTTCATGTCgttgttaccagctttt
tacATGAGTCCTTTTTATGTTGGCGAAAACATGAGTTCCCTTGTTGCTGC
TATATTTGGATTAGCACAAGGTGTGGAAGTTTACAATGGTACTCTACCAA
ACGGACAGGGTAGAGAATTGTTGACACCAGTGAGATATTCACAAAGTACA
TTTTTCTTAATTCTTGGTGTATTAATGATCCTTTGTTTTGCTTCATACTT
GATTCTACGCCTATTCCCTTCAATTAAACAATTGCATATCAACAGTGATG
AAGTTCAAGTTTCAACACATTATGACCGGTTCCATACTTCAGTCTCTAGT
GAATTCCAGGGCGATTCTTCAGATAACTACTTGGTCATTGGTGATACTGG
TCATGATAGAAAGTTGATACAAGTCTGTTTTTGTTGTATGACATGGTTGA
ATGTCTTACAGAACGGTGTTATGGCATCTGTCGGCTCGTATGCTTATGGA
CCTTATGGGGAATTATCCTACCATTTTGGTAAGttgatttcttttcattt
caaaaatcatcCTCTgttatagaggtttttcattttttgttaagttacat
gatttctgccattatggaagcaaacgttcgatttgcgaaAGGGATCGCCT
CTgcgaattcgaacgtttgcttccataatggtggaaattacaCAACTCAA
CAAACAATAAGAACCTCTATATGATAGTCTAGGAGCGATCTTGGCAGACA
CAGGCAAATAGTATATCATATgggcttttatttattttctcattatggTC
CCTCGGTACCTCAAAACTAGTGGCAAAGCTGGAGAAAAATTTCTAAGAAG
CATTGAAGGGTGTCAGGTCATTTTAGCGCAGAGAACATTGAAATGTCAAT
TTTGAAGTACTATCAACTAGAGGTATAATTTCTAAGGTAACTATGGCTAG
CTCTTGAGATGTtccaatttaaaattttgcttattCAGCGTTTTTCTGCG
TTTTTTGATGAGTCAAcagaatttcaaattcaaatatctGGAGGTTATGT
ATATTCATTTGATGTACTTTTTCGCCTTCAGCGTCCACTCTTGGTCCCAT
CGTTGCTTCGATAAGTTGTTTCCTCTTCATGTTCTTCCCAAGAAAATCAA
TACATTACGTCATTGGTGGATCTGTTGGTTACACTTTAGCTGTTATTTAT
TTACTCATAATGGCAACACTGAGCCCATACCCCTTACTGTATGACAAAAC
ATTTGGTAAAATTCTAATCGTAAGTGTTCAGCattatttattatattttc
tccttcaatgattttcttccaaaaaaatatcCCATTTGGATTGATTTGCA
GAAAGAATCAGAAGTGCCGCTTTAAAGTCGAATGTTTTCTTCCACGATTC
CACCTTTTCTGataaataaattcttttaaacCTCCAAGTGTGTTCAAATA
ATGTCAGAAGTTGTCAGAAGGGATAATTCCATGGCCCAGTTTGTGCACAa
taaataattctttatttcacCTGTTACCTTAGGTCGTAGTGTGTATGGTG
GCATCGTCCCTTGTGGCTTACACCAAGTTAGCTATTGCATCTGTTATGAG
AGATTTTGGTCACCAATACTTATTTTATACTGGGATTACAATGCAACTTG
GTTCGTTTATTGGTGCTGTTGTTATGTTCCCAATTGTCAATTATGCCAAA
GTATTCAAATCATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000468_pilon:41924..44038+ >XLOC_038459 ID=XLOC_038459|Name=XLOC_038459|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000468_pilon:41924..44038+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATAGTTCAACCGATGAAAGCAAGAGACTTTCAATCAAAGTTTGGAT
TCTCTCATGCTTGTTTGGTATCGGCTCATGGGTTGTGATGAATGGTCTAT
GGGTTGAGCTACCAAACCTTGTCAATCAATTACCTGAAGGCTGGAAATTA
CCTTCTTACTTAACAATAATCGTGCAGATTGCTAATATTGGACCAATAAG
CTACGGTTTACTCAAGAAATATTGTGTTAAACCAGAGCGGAAAGAAACTC
TTGAGCATATCACAATATGccttattttggtttttggaatAATAGGTGCC
ATCCTGTTAGCTTGTTACTggaaaaaaacttcaaacatttttggtGCTGA
ACATAGCACCTCTCTACTTTTATTAACATTTGTTATAGCTCTCGTTGACT
GCACTTCATCTGTTACTTTTTTACCCTTCATGTCgttgttaccagctttt
tacATGAGTCCTTTTTATGTTGGCGAAAACATGAGTTCCCTTGTTGCTGC
TATATTTGGATTAGCACAAGGTGTGGAAGTTTACAATGGTACTCTACCAA
ACGGACAGGGTAGAGAATTGTTGACACCAGTGAGATATTCACAAAGTACA
TTTTTCTTAATTCTTGGTGTATTAATGATCCTTTGTTTTGCTTCATACTT
GATTCTACGCCTATTCCCTTCAATTAAACAATTGCATATCAACAGTGATG
AAGTTCAAGTTTCAACACATTATGACCGGTTCCATACTTCAGTCTCTAGT
GAATTCCAGGGCGATTCTTCAGATAACTACTTGGTCATTGGTGATACTGG
TCATGATAGAAAGTTGATACAAGTCTGTTTTTGTTGTATGACATGGTTGA
ATGTCTTACAGAACGGTGTTATGGCATCTGTCGGCTCGTATGCTTATGGA
CCTTATGGGGAATTATCCTACCATTTTGATGGATAGTTCAACCGATGAAA
GCAAGAGACTTTCAATCAAAGTTTGGATTCTCTCATGCTTGTTTGGTATC
GGCTCATGGGTTGTGATGAATGGTCTATGGGTTGAGCTACCAAACCTTGT
CAATCAATTACCTGAAGGCTGGAAATTACCTTCTTACTTAACAATAATCG
TGCAGATTGCTAATATTGGACCAATAAGCTACGGTTTACTCAAGAAATAT
TGTGTTAAACCAGAGCGGAAAGAAACTCTTGAGCATATCACAATATGcct
tattttggtttttggaatAATAGGTGCCATCCTGTTAGCTTGTTACTgga
aaaaaacttcaaacatttttggtGCTGAACATAGCACCTCTCTACTTTTA
TTAACATTTGTTATAGCTCTCGTTGACTGCACTTCATCTGTTACTTTTTT
ACCCTTCATGTCgttgttaccagctttttacATGAGTCCTTTTTATGTTG
GCGAAAACATGAGTTCCCTTGTTGCTGCTATATTTGGATTAGCACAAGGT
GTGGAAGTTTACAATGGTACTCTACCAAACGGACAGGGTAGAGAATTGTT
GACACCAGTGAGATATTCACAAAGTACATTTTTCTTAATTCTTGGTGTAT
TAATGATCCTTTGTTTTGCTTCATACTTGATTCTACGCCTATTCCCTTCA
ATTAAACAATTGCATATCAACAGTGATGAAGTTCAAGTTTCAACACATTA
TGACCGGTTCCATACTTCAGTCTCTAGTGAATTCCAGGGCGATTCTTCAG
ATAACTACTTGGTCATTGGTGATACTGGTCATGATAGAAAGTTGATACAA
GTCTGTTTTTGTTGTATGACATGGTTGAATGTCTTACAGAACGGTGTTAT
GGCATCTGTCGGCTCGTATGCTTATGGACCTTATGGGGAATTATCCTACC
ATTTTGCGTCCACTCTTGGTCCCATCGTTGCTTCGATAAGTTGTTTCCTC
TTCATGTTCTTCCCAAGAAAATCAATACATTACGTCATTGGTGGATCTGT
TGGTTACACTTTAGCTGTTATTTATTTACTCATAATGGCAACACTGAGCC
CATACCCCTTACTGTATGACAAAACATTTGGTAAAATTCTAATCCGTCCA
CTCTTGGTCCCATCGTTGCTTCGATAAGTTGTTTCCTCTTCATGTTCTTC
CCAAGAAAATCAATACATTACGTCATTGGTGGATCTGTTGGTTACACTTT
AGCTGTTATTTATTTACTCATAATGGCAACACTGAGCCCATACCCCTTAC
TGTATGACAAAACATTTGGTAAAATTCTAATCGTCGTAGTGTGTATGGTG
GCATCGTCCCTTGTGGCTTACACCAAGTTAGCTATTGCATCTGTTATGAG
AGATTTTGGTCACCAATACTTATTTTATACTGGGATTACAATGCAACTTG
GTTCGTTTATTGGTGCTGTTGTTATGTTCCCAATTGTCAATTATGCCAAA
GTATTCAAATCATAAGTCGTAGTGTGTATGGTGGCATCGTCCCTTGTGGC
TTACACCAAGTTAGCTATTGCATCTGTTATGAGAGATTTTGGTCACCAAT
ACTTATTTTATACTGGGATTACAATGCAACTTGGTTCGTTTATTGGTGCT
GTTGTTATGTTCCCAATTGTCAATTATGCCAAAGTATTCAAATCATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000468_pilon | genome | sc0000468_pilon:41924..44038 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1117-1299:1933 |
| Aaloc | 931-1116:1484 |
| Aaloc | 1-927:1 |
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