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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000051_pilon:1223341..1229506+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038389 ID=XLOC_038389|Name=XLOC_038389|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6166bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000051_pilon:1223341..1229506+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGCGACTTTTACCACTCTTATGTCTTATGGTCTTTATTCCATGTGTATT
TTGCCGAACAAAAGACTGGCTTATCAATGACATCACTACCccttctgatt
ggctgaaaaacgaagatgGTAGCTATACATTGACCAATGGGCTAATCAGT
AGAACCTTTTCTACAAGCCCTGGGTTTACAACAATCGATTATTACTCTCA
TGAGAAATCAACGTCTTTATTACGAGCTTTAAGTCCTGAAGCTGTTCTCA
AACTCGATGACGTCATGTATAATATTGGTCACGTGATAACAAAAATGTCA
CGTGGTTATTTGAACCGAACAGAACTTTCCGAAACGATTGGACATGATCC
TGCCAGTTTCCAGTATGCCGGCCACAGGACTCATCCGATCGAAGTTGATT
TTCCTTACACTCCTTTGAGGGGTGCACCGCCCAATATCCATTGGCCACCC
AAGGGCGTTAGAGTAGATGTGATTTTCAAAGCGCCCCAGTCCGCCCCTAC
CACACATCAAGGTAAAGTAGCTGTTgacttatctgattattttcctCAAT
TTTCCTCAATTTTGACAGTCAAAATCGTAGTATGCATTTTAGAGTCTAAA
CGAAGAAGATATACTTTATATGTGTTTCTTTGGAGATGTTTTTCTATGGG
TTTATTCTttaacttattaaaaaaaaacaatacagcAATGCGTTAGACTC
TCTTAAATTCGATATTCAATAGACATactatttcttttcaaattagaGAA
GAATTTCGAGATTTTCGAGTGCGAGCGTGAGGGGTTTCCCTTCAAGGAAT
GATTGCTGGCTGTAACATTTGTTGTTTTCACCACTCTAGGTATTACTGTC
ACAATTCATTACCAAATATATGATGGTATACCAGCAATGTCCAAATGGGT
ATCCGTCCAAGCCGACCAAAAGGTCTGGGACCAAGTCACGTGTACTTTAG
TTTCGATTGAGCTTTTAGCTGTCAATCAACCATTCTCAAAAATTTCAACC
TGGGATGGATACACGTTCAAACCTGATGGTGCTGATAATGCATATGATTG
GTTGTATATTGATCTTAATCGACCCTACGGTGGCTTAGTAACCTGGCTCC
AAGATCCAGCTCAAGCCCAAGTCGCTGGCTCTTTTCAGCCGTTACTTAAC
GTCTCTAATAGTGTGCCAGTACCAGTGGTAAGCGTTGGGAAAGACGGTTA
CACATCATTTAAAGTGAACGAACTTATACACTGCTCTGAAGATCCTACAC
GAAAATCGCTATCTAAGAATCgacttttgaagcttttggcACCTCATGTT
CAAGAGAATCCGAttttttttCACATGACTGACTCGAGAAGTGAACAGTT
TCGCGCGACTGTTGACCAATTAGCTGAAGTGGGGTTTGAAATGATTATCT
ATAGTTTTGGGAGTGGCCTTTATATGGAGGAGGAGAACGAAACTTATTTG
GATGGTGTTCGTAAAGATGTAGCGTACGCTAACAGTAAAGGAATGGAGGT
aggtttgtattttttttctctcgaaagCTTCTTAACGCTCACTATTCAGG
ATATCTCTATTCATTCATATctctgattttacgtcacttacaaccaatca
cctattgggtctgtgatgtatgtcagaagacattgcagtggtgtaTATTA
TGAATTAGAAAACATTAACTCAATGAACTATACTATGATTTATAGGGATC
AGGACTCTTCAGGTTTGTCTGGGACTGGGATATTTACACAATATTCATTG
GGGGAGACTTATTCTGACTTATTCAAACTTTTCCAAGCATAAATTTTAAC
AGCCAACTATGTGTccactttctgcctactctaacaattagaataggcag
ggcagaaagtcggccgtctaaactagagcttaagatccagataaaaaaaa
tcaccaTCCAATCTTTAGAAAAAGCTTTCAGTGGACCCCGGTTTATTATC
AACCTTGAAAGCGCTAGGCGACTGGGTTCGACTTTACCAGGAAGCAATGA
TGTCAGAATCTTTACATTGGCATTCTTATAGACTAAGAATTTTAACCATG
GCGTTCTAtatttccttgtaaattcatgACCAATGTTGGTATATTTTCTG
CTCCTGCTATCAAATAGATATTAATGTTTTTTCTGCATCTATGTATTAGG
TTGGAGGTTACGATTTGATCGTTTTGGATCGTGGTGATTTACCGAAAGAA
ATGCGTGCTACTGATGCTCAAGGTTTGGCTCTTATTCATTCGTTAGTTTA
GATTTTAATTTGTCGGCAACATAATTTATTGTCTGAGAAAAACCCGAGAA
CGTTCAGTTATTTGGAAAAACATATGCattcttttgaaattatttttttc
accgATGAAAATGAGAtatattcttttgtttaatgttttattttgctCGA
CTTTAGGTAATCAACTATAATCTGAACTTCAATATAAgggagcggtcatt
aagtatagCACATACCTGGGTGGAAGATATTTTTTAGGGGGACTTTCAAT
TATATACCCTGacaaaaattcgcaaaaaatttCTTACCCTGACaaaaaaa
GAGGTAAAACTTTTATACCCTACCAACGAGGTTTATGAGTACATGAAATA
CCGACGCAAAAGTGGTGTCTACAAGAACAAAATTGTTGTATCCAAAAAAT
TTCACATCATCTGTCTCGTTCCATAAAAAGTGggttaacattttcaaatt
tccctTTATTAAAAGTTAGTGCAAATCCATGAAAGAGTATGAATATATTC
TATGAGAAATGTTAAACAAGAACAACAAGGTTTTTTAAACTATCTGAAAA
CGTCTTTCCAACTCGTCGTATTTCAACGAGATATTGGTTGTCAAAAGATT
TCATACCCTACCCAAACTTACAATCTTTTTTCCATACCCTACCaaaaaaa
agagtaaaattTCCATACCCTACCCAAATATCTTCCACCCTACCAAGTTc
catacttaatgaccgctcccTAACATCTCATCTTAGTTCTTATTGATGAC
CAAATGTCCTCTTTCGCATTCCCAGACATCGATGCTCTTCTCTTAGGTAA
CCCTGGAGGGAATGCATGTTTAGCTTCTGAATGGTATGAAACAATATACG
GGAAGTTGTTGAATTTCATGACTAAAACCAATATGACCATGGTAGAGACT
GATGGCCCTTATGGAGGGTGAGTTGAATTTAAAGGGATAACCCGAAAAGA
AGTGAAATTTAGCTCAAAGATTACTTTAGGcttacaaactttcgcgagca
gaaactttcgcgattttcgcaaattttagccctttttgcgaaagtaaata
tctttgaaaattcttgagagtgtaattcgcaaaagtttatgctcgcgaaa
agaaatctgaaaagaaaatctacTTAAACTCTCCTCTTTGATGATAACAA
GGGTAAGATTTAGTGCAGATATTATGCAAAAGAGCGTCTGTTCTGGTTCG
AGTATATTTGAACGATCAAAACACTGGTTTCATGCACCGGAAACTTGAAT
TTTCTACTAGAAATATACCCCTTCCGCGAAAGTCTATGCTcgcgaaagat
ttttttgtcaaactcgcgaaagtaaatgtcgcagATGAAGACCACCAAAT
ATTTGCAAGAATTAACGTATTCTGAATAAAATATGGCGATTTCAAATCTT
AGATTTTCTCACACGTACCTCAagttgaaattctattatttCTAAGCAGA
ACAACTAAGAAATAAGAATTACAAAGCTAAATATcttgacccgggggggg
ggggcactcaattttgaaaatgaccgtacgttcggccaaaaaccagaact
ctaaaatcggacccttacagtacaggaaaaatttggctgaaaatctaccc
ttacagtgcaatttttctaatttttctacccttttcagggcaaaatcttt
tgaaattcctcaaattttacctcagaatttggtatttttccaaattttac
acccttacagtgcattttttcccacttgctcactaATCGACCcctacagt
gcactttccaaagtccaaaaagcctacccttaagggctgcatgtccggta
ggtcacttacctggagtgccagcccccccccccccgggtatctTGACTTC
GAAAAACAAGTAGCAAGTAGAATTTAGAAGTTTTGCTAAGGACTGTCGAA
GGAATCTTTgggttgattttcattttttatctggttatccctttaagaGT
GTTCGTTAGCGCGGAGAGAAAATATTGTCTGAAACATCTGTACCCTACTT
ATGTAAAggacttttttttttgggggggggggggggcggtttGCAAAAAC
TGGTCGAAAATTCTCTTGTCATGCGGAGAATTGCGCTGTCCAGGGGTATT
TTTTATGTCCGAAGAGACTATTGTTGTGGGTATTAAATTCCTTTAAAATG
TTATAATCTTAAACCCCATATACTGTGTTTTCAAGCCCATTCTCTCACTT
TTTAGTGGTTCGTGTCATTCAACTACGCATGCGCACCACAAAGGATATGG
TGATTCTGTTTACAAGCAAAATATGCTTCAAGAAAAAATGTATAATGAGT
TTCGAAGACGAAGTTTTTATATCAATTCGCCTGATTCTTACTACTATGGT
GGTTCTAATCGTAATGGTAATTATTTTTGCACTTCCTCACTGTTAAATAA
TGGGCTGCCAgcacattgagtttaaagcccgaaaggctcgagtagaatct
ctaacctttctcaggcaagaaaaagtgaagccacttatttcccatccaga
acgcgcctagaacgtgccgcaatcatgacgacagattgttatctagtggt
tcctttgtttttgaggacatttttttttaaatctagcgatagactttact
ttcaatccggcgtttgtgtaaaaaccacgcgcaggcgttctggatgggaa
attaagtggcttcatttcccatccaggagtttcgaGTCTAGGCCTTcagg
cttggaagtcaatgtaCCAGCATTCATTTGTTATGTTTGTCATTAGGGTA
CGAATCGTCCTCAATAACACGCCTTGGAAGTCAATGTGCCAGCATTCATT
TGTTATGTTTGTCATTAGGGTACGAATCGTACCTTAGAAAGCTTTTACTT
AGCAGGAGTCTTTCTGTCATTCCTTAGAGAGGAAGGATATTATGATGGTA
GACAAAGTCATAGTTCCTTTTCTGTTCCAAAAATATGGCACCACAAAAAT
CTTACATATATGTACTCTAAGCGGTGGGgttggctgaaaaaaaattttta
tcaatttaaaaaaaaatgtttttatcgaATTTTGAACTTTAAAGCGTCAA
AAAccaattaataaaaatattgctaaGAAACATGTTGGTGGGCTTTACAG
ACTCTACAAAATTGCACAGcaaactcaaaaataaaaataagaataaaaga
ataagaataaaaaacagaaaactagaaaattaataaacgggggggtccga
aaATTAATAACCGGATGGGGACGTTTATTCTACCCAACCTATGGACGATG
TAAAGTTCccattcttttcatttttcaggactAGGTTACAATGAGAATCA
ATATAGTCTACCTCGTTGGATGGACCTTGGTATCAGTCGGCAAACTGTTT
TTGACCGTGTGTACTCAGTACCGCCAACCGCTGGCTGGATGTTTGTGCCA
CTCCAAGATTATCATGGCGGCGGAGAAGCAGCGGCTTTTGAACCGCTTCA
ACAACATCTAGCAGAATTGAATTTCGCTTTTGCTCAGTATTTAGGTGCAG
GTGTTGCAGCTTGTTACCGTGGCAACCGTATCTATGATAGTGATGCTACG
AAAGAGCTAGTTCAACATTGGGTATCGTTCTACAAGAAATATCGAGCATT
AGTTACGAGTGATATAATTCGAATTACGAGACCGGATATGCAGAATATCG
ATGCTTTTATGCATGTTAATTGGCAAAATGAAGACGATAAAGCCTTAGTA
ATGGTTTTTAATCCAACCGCTGAAAAAAGGAACGTCACTCTGGGAGTTCC
GGTGTATTATACCGGTATACGGAACAAGGCTTTGGTGTCGGAACAGGAGG
CCGGATATGTGCTGTATGATATTGGTGTTGGTCCGCAgggaattgaaatt
gaaatagaaGTCGCATTGGAAGCACGCAGCACGACTTGGTTCAAATTAAA
GCCGACTACGTCATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000051_pilon:1223341..1229506+ >XLOC_038389 ID=XLOC_038389|Name=XLOC_038389|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4326bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000051_pilon:1223341..1229506+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGCGACTTTTACCACTCTTATGTCTTATGGTCTTTATTCCATGTGTATT
TTGCCGAACAAAAGACTGGCTTATCAATGACATCACTACCccttctgatt
ggctgaaaaacgaagatgGTAGCTATACATTGACCAATGGGCTAATCAGT
AGAACCTTTTCTACAAGCCCTGGGTTTACAACAATCGATTATTACTCTCA
TGAGAAATCAACGTCTTTATTACGAGCTTTAAGTCCTGAAGCTGTTCTCA
AACTCGATGACGTCATGTATAATATTGGTCACGTGATAACAAAAATGTCA
CGTGGTTATTTGAACCGAACAGAACTTTCCGAAACGATTGGACATGATCC
TGCCAGTTTCCAGTATGCCGGCCACAGGACTCATCCGATCGAAGTTGATT
TTCCTTACACTCCTTTGAGGGGTGCACCGCCCAATATCCATTGGCCACCC
AAGGGCGTTAGAGTAGATGTGATTTTCAAAGCGCCCCAGTCCGCCCCTAC
CACACATCAAGaTGCGACTTTTACCACTCTTATGTCTTATGGTCTTTATT
CCATGTGTATTTTGCCGAACAAAAGACTGGCTTATCAATGACATCACTAC
CccttctgattggctgaaaaacgaagatgGTAGCTATACATTGACCAATG
GGCTAATCAGTAGAACCTTTTCTACAAGCCCTGGGTTTACAACAATCGAT
TATTACTCTCATGAGAAATCAACGTCTTTATTACGAGCTTTAAGTCCTGA
AGCTGTTCTCAAACTCGATGACGTCATGTATAATATTGGTCACGTGATAA
CAAAAATGTCACGTGGTTATTTGAACCGAACAGAACTTTCCGAAACGATT
GGACATGATCCTGCCAGTTTCCAGTATGCCGGCCACAGGACTCATCCGAT
CGAAGTTGATTTTCCTTACACTCCTTTGAGGGGTGCACCGCCCAATATCC
ATTGGCCACCCAAGGGCGTTAGAGTAGATGTGATTTTCAAAGCGCCCCAG
TCCGCCCCTACCACACATCAAGGTATTACTGTCACAATTCATTACCAAAT
ATATGATGGTATACCAGCAATGTCCAAATGGGTATCCGTCCAAGCCGACC
AAAAGGTCTGGGACCAAGTCACGTGTACTTTAGTTTCGATTGAGCTTTTA
GCTGTCAATCAACCATTCTCAAAAATTTCAACCTGGGATGGATACACGTT
CAAACCTGATGGTGCTGATAATGCATATGATTGGTTGTATATTGATCTTA
ATCGACCCTACGGTGGCTTAGTAACCTGGCTCCAAGATCCAGCTCAAGCC
CAAGTCGCTGGCTCTTTTCAGCCGTTACTTAACGTCTCTAATAGTGTGCC
AGTACCAGTGGTAAGCGTTGGGAAAGACGGTTACACATCATTTAAAGTGA
ACGAACTTATACACTGCTCTGAAGATCCTACACGAAAATCGCTATCTAAG
AATCgacttttgaagcttttggcACCTCATGTTCAAGAGAATCCGAtttt
ttttCACATGACTGACTCGAGAAGTGAACAGTTTCGCGCGACTGTTGACC
AATTAGCTGAAGTGGGGTTTGAAATGATTATCTATAGTTTTGGGAGTGGC
CTTTATATGGAGGAGGAGAACGAAACTTATTTGGATGGTGTTCGTAAAGA
TGTAGCGTACGCTAACAGTAAAGGAATGGAGGTATTACTGTCACAATTCA
TTACCAAATATATGATGGTATACCAGCAATGTCCAAATGGGTATCCGTCC
AAGCCGACCAAAAGGTCTGGGACCAAGTCACGTGTACTTTAGTTTCGATT
GAGCTTTTAGCTGTCAATCAACCATTCTCAAAAATTTCAACCTGGGATGG
ATACACGTTCAAACCTGATGGTGCTGATAATGCATATGATTGGTTGTATA
TTGATCTTAATCGACCCTACGGTGGCTTAGTAACCTGGCTCCAAGATCCA
GCTCAAGCCCAAGTCGCTGGCTCTTTTCAGCCGTTACTTAACGTCTCTAA
TAGTGTGCCAGTACCAGTGGTAAGCGTTGGGAAAGACGGTTACACATCAT
TTAAAGTGAACGAACTTATACACTGCTCTGAAGATCCTACACGAAAATCG
CTATCTAAGAATCgacttttgaagcttttggcACCTCATGTTCAAGAGAA
TCCGAttttttttCACATGACTGACTCGAGAAGTGAACAGTTTCGCGCGA
CTGTTGACCAATTAGCTGAAGTGGGGTTTGAAATGATTATCTATAGTTTT
GGGAGTGGCCTTTATATGGAGGAGGAGAACGAAACTTATTTGGATGGTGT
TCGTAAAGATGTAGCGTACGCTAACAGTAAAGGAATGGAGGTTGGAGGTT
ACGATTTGATCGTTTTGGATCGTGGTGATTTACCGAAAGAAATGCGTGCT
ACTGATGCTCAAGGTTGGAGGTTACGATTTGATCGTTTTGGATCGTGGTG
ATTTACCGAAAGAAATGCGTGCTACTGATGCTCAAGGTAACCCTGGAGGG
AATGCATGTTTAGCTTCTGAATGGTATGAAACAATATACGGGAAGTTGTT
GAATTTCATGACTAAAACCAATATGACCATGGTAGAGACTGATGGCCCTT
ATGGAGGGTAACCCTGGAGGGAATGCATGTTTAGCTTCTGAATGGTATGA
AACAATATACGGGAAGTTGTTGAATTTCATGACTAAAACCAATATGACCA
TGGTAGAGACTGATGGCCCTTATGGAGGTGGTTCGTGTCATTCAACTACG
CATGCGCACCACAAAGGATATGGTGATTCTGTTTACAAGCAAAATATGCT
TCAAGAAAAAATGTATAATGAGTTTCGAAGACGAAGTTTTTATATCAATT
CGCCTGATTCTTACTACTATGGTGGTTCTAATCGTAATGTGGTTCGTGTC
ATTCAACTACGCATGCGCACCACAAAGGATATGGTGATTCTGTTTACAAG
CAAAATATGCTTCAAGAAAAAATGTATAATGAGTTTCGAAGACGAAGTTT
TTATATCAATTCGCCTGATTCTTACTACTATGGTGGTTCTAATCGTAATG
gactAGGTTACAATGAGAATCAATATAGTCTACCTCGTTGGATGGACCTT
GGTATCAGTCGGCAAACTGTTTTTGACCGTGTGTACTCAGTACCGCCAAC
CGCTGGCTGGATGTTTGTGCCACTCCAAGATTATCATGGCGGCGGAGAAG
CAGCGGCTTTTGAACCGCTTCAACAACATCTAGCAGAATTGAATTTCGCT
TTTGCTCAGTATTTAGGTGCAGGTGTTGCAGCTTGTTACCGTGGCAACCG
TATCTATGATAGTGATGCTACGAAAGAGCTAGTTCAACATTGGGTATCGT
TCTACAAGAAATATCGAGCATTAGTTACGAGTGATATAATTCGAATTACG
AGACCGGATATGCAGAATATCGATGCTTTTATGCATGTTAATTGGCAAAA
TGAAGACGATAAAGCCTTAGTAATGGTTTTTAATCCAACCGCTGAAAAAA
GGAACGTCACTCTGGGAGTTCCGGTGTATTATACCGGTATACGGAACAAG
GCTTTGGTGTCGGAACAGGAGGCCGGATATGTGCTGTATGATATTGGTGT
TGGTCCGCAgggaattgaaattgaaatagaaGTCGCATTGGAAGCACGCA
GCACGACTTGGTTCAAATTAAAGCCGACTACGTCATAAgactAGGTTACA
ATGAGAATCAATATAGTCTACCTCGTTGGATGGACCTTGGTATCAGTCGG
CAAACTGTTTTTGACCGTGTGTACTCAGTACCGCCAACCGCTGGCTGGAT
GTTTGTGCCACTCCAAGATTATCATGGCGGCGGAGAAGCAGCGGCTTTTG
AACCGCTTCAACAACATCTAGCAGAATTGAATTTCGCTTTTGCTCAGTAT
TTAGGTGCAGGTGTTGCAGCTTGTTACCGTGGCAACCGTATCTATGATAG
TGATGCTACGAAAGAGCTAGTTCAACATTGGGTATCGTTCTACAAGAAAT
ATCGAGCATTAGTTACGAGTGATATAATTCGAATTACGAGACCGGATATG
CAGAATATCGATGCTTTTATGCATGTTAATTGGCAAAATGAAGACGATAA
AGCCTTAGTAATGGTTTTTAATCCAACCGCTGAAAAAAGGAACGTCACTC
TGGGAGTTCCGGTGTATTATACCGGTATACGGAACAAGGCTTTGGTGTCG
GAACAGGAGGCCGGATATGTGCTGTATGATATTGGTGTTGGTCCGCAggg
aattgaaattgaaatagaaGTCGCATTGGAAGCACGCAGCACGACTTGGT
TCAAATTAAAGCCGACTACGTCATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000051_pilon | genome | sc0000051_pilon:1223341..1229506 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1528-2163:5531 |
| Aaloc | 1366-1524:4457 |
| Aaloc | 1246-1362:3049 |
| Aaloc | 1171-1242:2150 |
| Aaloc | 514-1170:842 |
| Aaloc | 1-510:1 |
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