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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038356 ID=XLOC_038356|Name=XLOC_038356|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9943bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCACAGGAATTTTGGAACCATCAGATCCATACACATGGGCGGACAATT
ACTTTTGCGAGCGAACAGGACCAGCCTACATTGCAAGTGGTATGAGATGG
AGTTACGCTGGTAAGTGATGCAAATTTTTTCAAATGTATTGTGAAATATT
CTACGCTAAGTTTCTTCTTTTGTTTTATATGAACAAAAGGGATAAATTTT
GCGAAAACATTGTAATTATTTCTTCATCTCACAACAGGTCCAATCTCTGG
CATGAGATGCACACAAATCATCGAGTTCAGCTCACCAGCCAAACACACAT
GGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCACATCACAGCCCCTTCATTTTCGAA
TGGTCAATGGCTGGACCAATCCCTGGAAAACATTGCATACAATGGATTGA
ACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATGGCGTGATAACTATTTGTGTGCTA
CCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCTACAATTAGTAATTTATACCTTTA
ATGTTAGGTAGACAATGAATACAAATAATTTCAAAGTATTGTATTATAAT
TTTTGATTGCTCTTTCTGAATTAAACAACCATTAAAGTCTATTGCTATGA
TCTTCATTTATGTATCAGAGACTCTCCTCCAATCTTAGAGCGTCATAAAT
GCAGAAAAAGATTAAAAAAAATATTCATTCAATCATAGTATAAGAAAGCT
GCGGCTGTCTTATACTATGATTCAATCAAAGGATACAGCTTAAAACTATG
CCCTGGTTGACTTAAAAAAGGGCTCTTTTTGTTGATTTTTGATGATTTTT
GAAGTCAACCATTGATGAACTTTGGACTATATCTTTCGATGGAATAGATT
ATTTAAAAAATTTTTTTCCCATGAATGATATTCTAAGATAAAAAAAAACC
GCTCGTGTGAAAATGATAATTATAGCACGATTATTGAAGAAGTTGGTTTT
CTTCATCTTCATTTTCAATCTTCATTTTCCGATCTTTTTTGAGTTTTTTC
TTCATGACAATATTCCACTCCTGTTTGTCTTTTCAATGAGCACAAAATCG
CTACTTAATTCAAATTCTATCAAAAGTTATTGAGGTTTGAAAAAAGACTG
CCAGCTAATTTGAAATAGACTTTAATAACATCAACCCGAGGCCCGGGGAG
GGTACTAGGGTTGGCGAATGAGGAGTATGTGCGGACCAGGACCTCCAAAA
ACTGACCCTCAGAGGGACTAATTTTTGCTGAAAAGAAATTTTTTTTTCGA
TTTTTGAAAAAAGTCATACCCTTAGAGAGATTTTATTACAATTTTATTTT
TGATTTTTGAAAAAAGTCATACCCTTAAAGAGACTTTATTACAATTTTTT
CTCTGGAAATCAAAAAATTTCCTAAACATCCTGAATTTTCCGACCCTTAG
AGAGAGACCCTAATTTAAAACTTTCTGATTTTTTCCAACCATTAGAGAGA
CTTTGAAAGGTGAAATAACCGATCCGTACCTGTCCGCACATACCCATCAT
CCATTTTTGCCTAATTACCCCCCCCCTCCGGGACCCGAAGCTTCACTGCA
TAACATCTCAAATCATCAACAACAAATCTAATCCTTGAATTGACCCATAG
AGGTCCCAATAGGTATAAATAAACATTCCGTAAAATGCCAGGACAGGACA
GCTCAGAATAATGCTATGTTTTCAGCCAAAATGTCCCCGTTGTTGCTAAA
GTTTTTACCTGAAACCGACTATAAGGTCCAGAATCGAAGTTTGAAGATTT
CAACTCTTATTGGATTGGTGTTTTTAATGAGCGACTATCGAAAGGCTAAG
AAACTCGTTGATACCTTTTCTCATCGTCATGCTTATCATCTTATAGTTTA
TGAATGCGCATTAATCATTTGAAGTAGTTCCTGGCCCTACAAAATATGAA
AAATAGAATCAATTAGGTCAAAAATTAGACGATGATATCGGTACACTCCT
GCCTCTGTTGACCTCACTGTCATCTCTGTAAAAACTCTTCTAAAAAAGTC
CATTTGACTCATTGGACAAATCATTTGGTCCCTCTGGAATTTTGTTGCCC
CACTGAAAATGTTTGAAATATTCATACATAACAAAATCAAAATGATTCTA
ACGCACCCCAGTAGAACTTTTCTTTCAAAAAATCACCCTAATGGAATCTT
CTCCTCTCAATTCGTCTAGAATTATTTGAAGGTGGAAATACCCAAAGAAA
GTATCGAAATGTTTCACTTCAATGTACTGTCCAAACTTCTATCGAAATTT
TCACAGTGTTTGTTGTCGTAATAATCGACTGCTATCATTAAATCTCATTC
CTTTTTATGAGCAAATTTGAGCTTTTAAACCCTAAAATCCTAAGGTTCGA
AGACTAAAGTCTCATGTTAAAACTCAGAGTTAAAACTCTACTTTCCCCAA
CTGTAGTTTAACTTGCTTAAAAGTCATTTGTGGTGTTAAAATTTCGCAGG
GAAATTCCCTTTGTCCCAAATATTTTGTCCACGATCTTTGCATATATTTG
AAATAAATGAGGTTCAAATATTCTAATAGGTCTTTTCATAAATATACCCC
CTGCTCACAGACCCGATAGGATTTTTTCAGCAAGTGGGGATAAAATAAAC
GGACCGAAACTCGATGGGGATTTATATTCCCTTATGTTTTATGGCAGGGG
ATTTCAATTTTTTTTTTTTCAAGTCAGAAAAATTCAGTAGGGATGGAAAA
ATAGCATAATATTCTGCAGCAAGGATTGGTTTATTTAATCATTTTCAGTG
GGGACAAAAGTAGGAGGATAATTTTTCACCGGGGACGATATTTTGGCCAA
TTTTTCCAGTTGGCAGGGTTCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTATA
AATTATTTTGAGTGCAACGACTGCCTCAATTTGAAACCATTAACATGGCT
ATCAAATCCCTTGAGTCTTCAAGTGATACTTTTATAAATAGAGTGAACAA
ACTTCATGTAAATTATTCAGGGAATCAATTACCATAGCTATATTTTGAAA
ACGAGGTAAGCATTGCTCGTGAGTTAATTTGTAAAAAAAGTCTAGTGCTA
TGTTGTGAGTTTTAAACCAGTTTTCGACTTTACAATATAAAAATCTTTTT
GATAGATTTTTCGCCTTGAGATGAGTATTTTCCAAAGAAAATTGGAGTAG
AAATTAAAGATTGGAGTATTTAAAAGTCAAATTAAGATTTTGCATTTATT
GTCATCGACCATTCGAAGATGAAGGGGCTGTGATGTGGAACGCATAGATA
GTTATCTGGCCATGTGTGTTTGGCTGGTGAACTGAACTCGACGATTCGTG
TGCATCTCATGCCAGAGATTGGACCTGTTGTGAGATGAAGAAATAATTAT
AAATTTTTTGAAGAATATTTTCTGTTGCTAAGGAAGATAGTGACAGATTC
GAAAAAAGTTATATTTCAACGTTTAAAAAATGTTGCATCACTCACCAGCG
TAACTCCATCTCATACCACTGGCAATGTAGGCTAGTCCTGTTCTCTCGCA
AAAGTAATTATCTGCCCATGTGTGTGGATCTGATGGTTCCAAAATTCTTG
TGCATCTCCAGCCATTACCAAGATGTCCAGCATATGACCAACGAAATTCA
CGTGGCCAGTGTGGATATCTTGGGCATTTCCCGTATGTTAGACCAAGAAG
GCCAAAGATTAAGAGCAACTTGATCATGTTATCAATTGGTATCTTTTTTA
TAGTCTTCTGAATTTTGCCGACTGCGTTAATCGATATTTTAGGAAAGTTT
TAAAGCCCTTTTATATACGATACGACCTTTCGAAGATCATACCCCCTGGT
TTTATTCTTTTGGAAGTTGAAGTACTCGTTATGGCTAATGCATATCCTTC
CTCTAATTTGAAGCTTGATTCGCGAAACAGCTTTTAAATTACAGGTTATT
GGGCTTTATCGTTTCTGTATTCTTTGTAACCTTTTTTGGAGAAATTTCTA
ATATGAAACAAAAACAGGCCTTTATCATGCAAACGAGGCCAATTATTTCT
TGCTGCTTGTGATTTTGGGAATCTTTAATATTTTGAAACCAGTATGCTCA
CTAAAGCCATTTGCGCTATGTAGTTCAGTATTTTTCGTGTTTTGAAGAGA
AATTTATTAATTACTCTCTGAATTAGGTGTTTCGGTCGCTTGAATCTTTA
GGATTTATTTAAAACTTAAGTTAACTTAGGATTTTGGATGAAAAGCCCGG
GGGCACTCGATTTCTAAACAACGGCATGTGCCGCCAAAAAAAGGGCTTCC
AAAATCGGACCTTTACAGTGCCACCCTCAGCAATGAAAAGATACCCTTAC
AGCCCTTACAGTGCATTTTACCTTTCTGACCCTTACAGTGTAGTTTGATT
TCATATCTTATTTTTCTAAAGCCACCTGAAAATGAGACTGAGATATGTTG
ACACAATATGTAAAACAAATGAAAATGGGTGCGAGACAAAACTATAGAGA
TACCAAAGATTATTACTTTCAAACTTGCAATTCAGTAGCTCCCAAAGACA
CCCTTACAGTGTACCCAGTTAAAAAAAGACCCTTCTAGTGCACTCTATCA
AAAGTACACCCTTACAGTGCATTTCGAGGGTCACGAAAAACCTACCCTTA
AGGGCGGTCAGACGATATTAGTGCCCCCCGGGCTGAAACGATACCATCAT
AATTGGATAAACGATTTCTGGTGAGAATTCGATTGACCACAATTTTCCTA
AATGTCCTAAGTTTAGGTTAAATAAGTTTAGGTCTTCCCGTGTGCAAGAG
CCTGTGCAAAGGTATTTTATGATTGATTATTGTTCCTTGAATTAGAAGAT
CTGAGAGGTGGGACCGAGGATGACCGGTTGTGACCACCCGTTGCCATGGA
AACTGACGTCATTGGTTACTATGGCAGTCTACGAATTGGAATTTCCAAAC
ACACAACACTTGAATTTCGAATAAAATAAAAACATTCGAATTTTGAATAA
AAACACTATATTTCTAAATGAATTGAATTCACATTCAAAAATTAAAAATA
TTAGCCTTTTTGTCTTTTTCGTGAAAGAAAACTTCCCAAACTTGGATTTT
TCTACACACACATTAAAATTTTAAGTTCACTTTTTCTAAAAAAGTCCGAG
ATAAAACTTGCTAACTCGAAAACTTGTGAACTTAAAATAAATTCCGAGTT
AGCTAACTCGAAAAAATTTTTGCGAAAAATAAAATTCGAGTTAATTCTAA
CTCGAAAATCCTTTTTTGAAAATAAAAAATCGAATTAGAGTCAAGTGACG
TCATTATTTGCACTTTTATGACGTCATAGTTTTGCTAACTCGAAAATTGC
TAACTCGAAGTTTTCTAACTCGAAGATTCCGGGCCTCAATATCAAGTATT
ACTACGAAAACATTTGAAAATTCGTTGATATTTTCAGTTTTTGCCTGTGG
AAGGTTAGAGCTTGGGGCACGCTCAGCCCAGCACGTTACAGGCAAAAATT
TAAAATATCAATTTTGGTCAATAAACTTTTTAAAAATAATTTTCAGTCTT
TTTCATAATAATATTTTATGTTCACTGGAAGGTATTTTTCTATTGCAAGG
CCTCTACTATTACTAAAAGAATACAGAAAATCTTTTGATTTTTAAGGGGA
TTCCATTCTGTGAATGGCCGAATTCTGAAATGTTGGAGTGGATTTTCTCA
AACTCCCCCCAACCACGCCAGATTTAATCCTCACCAAAATAAATCCATAA
TCTCGAAAGCTATCAACTGGCGACATTATGAAATCTATCTGAAACCGCAT
GAGATGATATACAAAGTATCAATTTTCTTCTTTGGAGATTATCCAATTAG
ATATGGAAAACCTCATGGTCGCGAGCGCCTGATGTGATGAGGGGGTAGTA
TTTTGGAACAGAAACAAAATTTGCTTCATCACTAATTATTTTACTAATCA
TACTGCGAATTATTTACGCAGCTTATTAACTTAGTTAGTCTCTTATCAAT
GCCGGGTCAACGCTCTGTTCATCTTTGATCGTTACTTCACTTAAACGTTT
TTTTATAACAAACACCCAACATTTTTGAAGCCTTAGGATGTTCTTAACTT
TTTGAGCTTTAAGCCTAAAAATGTTTTCAACATGTTTTTATTTTCACCAT
TTTTTGAGTGTTTTTGTCCATTTACCTATGAAGCTCGGTGTTCTAGAGTG
CACAAAACCTTAAGATGTCTTTAACTTGTTCTTAACATTTTGGCCTTCAA
AGCCTTATGTTCTTGTATAGTTTGTTCTTTATAAAATATTGTATTCGTTT
GTCACTAAACAGCAAACACAAGTCCATGTAACGTCCAACTGGAAAAGAAA
CTTCCCTCACTAATTCAAGGAAGTAGCTTTTTTGGATTGTAATGTTAAGG
TACAAGGAAGAGAACCACGGTGTGCTATTTTTAAACCAGCCATAAAGCAA
AAATGATACTTCTTTCAGAGGGGTAGCCAGGAGTTTCCATTTCAGGAGAT
GAGTTTGCAAAAATCTTTTGATTAAAATTCTTTTCGCAACTCTCGTTGTA
AGTTATCTAGATACATGCGTATCTTTTTGTTGGTAAAAGTTCAAACAGCT
CAAAGAAGGCATTAGAAAGGTCAAACCAAGGAAAAGATACTCGAATTCCA
TGGCTGGAAAAATACCAATTTAAGGTCAAATCTACCCTGGATTTCTTTTT
GCTTGATTTTCTAAGAAGACTGGAATTTAAATAAACGGGTGTTAAAATTG
TTCTTTTCCAGCCTTTCAACACAAAAACTCTTGTCTGGAATTTCATTTTC
CAGGTGGAAATTTTCCAGGCTGGAAAACAGTAAAATTCAGGTGTGATTTT
TTTGTCATTATTTTCAAAAAAATTAGTGACTTGAAAATCCAGCCCTAATT
AGATTATTACTTTCCAGGGTGGTAATTTTCCGGTTTGGAAAACAGCCAAA
TTCAGGTCTGATTCTTCTTGATATTGGTCAATACACTGATACTGCAGTAA
CTTAGAGACAGTAAAGGCGGTATTTACTCTTTCAATAATTAGTAAAAGTA
GGTAGTTCTAAAAATATTTTCTGCAGCATCGAACGATTGAAAATTTCAGG
CAATCTAGGCATTCTAAATTTTAAATTTTTTCTTGGGCGAAACTCTTGGA
ACGCTGCACCGGGTACGGCAGGTACGTTGCTTGCCGTACCATATTTTTCT
TTTTGCCAACAAATGGTCAGTCTTAAAGGGGAATTAACGTTTGGAATTAA
CCCTGTGATTTTTTTTCGAAATATTAAAGAGGAAGAAAAATGTGATCGAA
CAAAAAAAGAACCACTTCAAAATGTCTTTTATTCATTGAGTTATTTAATC
TTTAATTTCTCACAATTTTGACTCTACAATGGAGAAAAACTCCCCCTCTG
TGTATTTTGTGACGTAAAGTGCGCCCCAACTATTCTCACTGTTACACTCT
ATTTGGTTGTTAAAGAGATATAAAACGTTAGAAATTAATCTTTTTTAGAG
TAATTATAGCAAAACGTTGAAGACATAAAACTAGGAGAATGTAGTTAGTA
TTCCAAAGGTGCAGTAAATTCTCTTCTCTAACGGTAAAAAGAAACTCAAA
AACTGCATTTTAAATCATCATTCACCACTCTTCCCTTATAAAAAAGAGAA
ACACAGTTCGCACCCTACGTCACATTTTTCGTATCCATAGCAACACAAGA
GAATTTTCAAACAACTCTTATTCCGGATGTAGAAGAGTAAAGCCCTATAA
ACCAAATATATTTGAAATCGTCTCAATGAGCTCTATTCGAATCTGTCATT
TGTTTGTTGAAAAATTTGAAACGTTAATTCCCCTTTAAATAAATCAAAAA
TTGTGTGACCAAACAAGGCATACTTGGCTAACAATAGCGTATTAAGGCCG
TTTTTCAATAACAAAGGAGAGCGAAAATTGCCGAAAATTTTTCACCCTTG
CTTCGCTCGCCTTCTTATTTTCCATTTATTTTCTTTCCTCCGATAGGGGA
GGTTACCTTTAGATTCCACGTCCTCTAGTTGCACCACAGCACCACCTCTA
TGAAGCCTGTGTTGAAGTCTACGGCTTCTCAGACCATGATTGGCCCAAAC
CTCGATTTTAAATTAGTTCTCAAATAAAAGACATCTTACGGGTCTGCGAG
GAAGAAATTATTGGGGGAAAGGCTTAATTTTGCATTTACCTCCCGTAACA
AGCAAGTAACTTTGGCGCGGTAGACCTAAAATGTTGCTTTATGAAAGCTC
AAAAAAAAACTTTATATATTGGCGAAAATGTTTGGTATAAGAATAGGCCA
ATTTGTATAAAAGAGACCATAAAAAGGTTAAATTTAGCCCAATAAGGTCA
CACTCGTTTAACCAAAGATGTAAAAGCAAAATTGGTGCGTGAACGTGAAA
ATGTTTTTTTTTCGCGCGTGAATACGTGAATTGGCAAAAATTTGTGCACG
AATACCTGAATTGAGGGTTGACTGGGGGGCCTCGTAAAGTACGAGACTTG
TTTGTACAGTTTCTAATTTGTTTTATATTAGTCTCTCTCAGGGTCGGAAA
ATTCAGGATTTTTAGGAAATTTTTTGATTTCCAGAGAAAAAATTGTAGGG
TATGACTTTTTTCAAAAATCGAAAAAAAGGTTCACCTTTTCAGCAAAAAT
CAGTCTTTCTAAGGGTCGGTTTTCGGAGGTCCCGTCCGCACATACCCCTC
ATTCGCCAACCCTAGTACCCCCCGGGGTTACTACACAATAGATTTGATAA
CTGAAAATTCATTATAATATCGGTATCGGTATTAGGCTTCATTCACCGAC
GGTATTACGGTATTTGACCCAAAATATTGTCGGTATGACGGTATTTAAGA
CCCCTGAAACCCCCCCTTCTAGGCTAGATTCCAAGCCTTATTGGAGCAGA
TTTGAGTTAAAACCTGACTTTCCAACTCTAGTTTAACACACTTAAAAATC
ATTTGTTGTGTTTAAAATTTCACTGGGAAATCACCTTTTTCTCAAATATT
TTGTGTAGGATTGTAGCTGTCAGCTTCCTTTTCAATAAATATAACAAGAT
AAAGTAAAGTTTGTTTCTGTTTCAAAATGCTTCCCCTCCTCCATGGTTTC
TACGATTAAGTGTTCTGGGGAATTAACTGGCTCATTTCCAAACGAGCTAA
TTATTAATTGATACTTTTTTTATCATTCCATGCGACTTCCGTGGGAAATG
AAACAATACATTTGAGATAACCCCCTTGTCATAAGTTTAAAAGATAATAC
ATCTAACCTGAAATCGATAAAAACTAGGGGGTAGAACTTCCAGTGACCGT
ATTGTATATAAAGGGTTCTCAAAAACATTGGAAAACAACAAGCAACACTC
AAAGTGTAAAAGAAAAAAATTAATTCAAAAAGCACAGTTGACAAAATGTT
GAAGTTACTCTTAATCTTTGGCCTTCTTGGTCTAACATACGGGCAATGCC
CAAGATATCCACACTGGCCGCGTGAATTTCGTTGGTCATATGCAGGACAT
CTTGGTAATGGCTGGAGATGCACAAGAATTTTGGAACCATCAGATCCATA
CACATGGGCGGACAATTACTTTTGCGAGCGAACAGGACCATCCTACATTG
CAAGCGGTATGAGATGGAGTTACGCCGGTGAGTGATGGAACATTTTTTAA
ACGTTGAAATATAACTTTTTTCGAATCTGTTATCTTCCTTTGCAACAGAA
AATATTCTTCAAAAAATTGACAATTATTTCTTCATTTCATAACAGGTCCA
ATCTCTGGCATGAGATGCACACGAATCATCGAGTTTAGTTCACCAGCCAA
ACACACATGGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCACATCACAGCCCCTTCA
TTTTTGAATGGTCGATGGCTGGACCAATCCCTGGAAAACATTGCATACAA
TGGATTGAACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATGGCGTGATAACTATTT
GTGCGCTACCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCTACAGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064- >XLOC_038356 ID=XLOC_038356|Name=XLOC_038356|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=906bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCACAGGAATTTTGGAACCATCAGATCCATACACATGGGCGGACAATT ACTTTTGCGAGCGAACAGGACCAATGCACAGGAATTTTGGAACCATCAGA TCCATACACATGGGCGGACAATTACTTTTGCGAGCGAACAGGACCAGACA TCTTGGTAATGGCTGGAGATGCACAAGAATTTTGGAACCATCAGATCCAT ACACATGGGCGGACAATTACTTTTGCGAGCGAACAGGACCATCCTACATT GCAAGCGGTATGAGATGGAGTTACGCCGGACATCTTGGTAATGGCTGGAG ATGCACAAGAATTTTGGAACCATCAGATCCATACACATGGGCGGACAATT ACTTTTGCGAGCGAACAGGACCATCCTACATTGCAAGCGGTATGAGATGG AGTTACGCCGGTCCAATCTCTGGCATGAGATGCACACGAATCATCGAGTT TAGTTCACCAGCCAAACACACATGGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCAC ATCACAGCCCCTTCATTTTTGAATGGTCGATGGCTGGACCAATCCCTGGA AAACATTGCATACAATGGATTGAACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATG GCGTGATAACTATTTGTGCGCTACCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCT ACAGTTAAGTCCAATCTCTGGCATGAGATGCACACGAATCATCGAGTTTA GTTCACCAGCCAAACACACATGGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCACAT CACAGCCCCTTCATTTTTGAATGGTCGATGGCTGGACCAATCCCTGGAAA ACATTGCATACAATGGATTGAACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATGGC GTGATAACTATTTGTGCGCTACCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCTAC AGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000048_pilon | genome | sc0000048_pilon:551122..561064 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 208-453:247 |
| Aaloc | 76-204:497 |
| Aaloc | 1-72:9944 |
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