XLOC_038356 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038356
Unique NameXLOC_038356
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038356 ID=XLOC_038356|Name=XLOC_038356|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9943bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCACAGGAATTTTGGAACCATCAGATCCATACACATGGGCGGACAATT ACTTTTGCGAGCGAACAGGACCAGCCTACATTGCAAGTGGTATGAGATGG AGTTACGCTGGTAAGTGATGCAAATTTTTTCAAATGTATTGTGAAATATT CTACGCTAAGTTTCTTCTTTTGTTTTATATGAACAAAAGGGATAAATTTT GCGAAAACATTGTAATTATTTCTTCATCTCACAACAGGTCCAATCTCTGG CATGAGATGCACACAAATCATCGAGTTCAGCTCACCAGCCAAACACACAT GGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCACATCACAGCCCCTTCATTTTCGAA TGGTCAATGGCTGGACCAATCCCTGGAAAACATTGCATACAATGGATTGA ACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATGGCGTGATAACTATTTGTGTGCTA CCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCTACAATTAGTAATTTATACCTTTA ATGTTAGGTAGACAATGAATACAAATAATTTCAAAGTATTGTATTATAAT TTTTGATTGCTCTTTCTGAATTAAACAACCATTAAAGTCTATTGCTATGA TCTTCATTTATGTATCAGAGACTCTCCTCCAATCTTAGAGCGTCATAAAT GCAGAAAAAGATTAAAAAAAATATTCATTCAATCATAGTATAAGAAAGCT GCGGCTGTCTTATACTATGATTCAATCAAAGGATACAGCTTAAAACTATG CCCTGGTTGACTTAAAAAAGGGCTCTTTTTGTTGATTTTTGATGATTTTT GAAGTCAACCATTGATGAACTTTGGACTATATCTTTCGATGGAATAGATT ATTTAAAAAATTTTTTTCCCATGAATGATATTCTAAGATAAAAAAAAACC GCTCGTGTGAAAATGATAATTATAGCACGATTATTGAAGAAGTTGGTTTT CTTCATCTTCATTTTCAATCTTCATTTTCCGATCTTTTTTGAGTTTTTTC TTCATGACAATATTCCACTCCTGTTTGTCTTTTCAATGAGCACAAAATCG CTACTTAATTCAAATTCTATCAAAAGTTATTGAGGTTTGAAAAAAGACTG CCAGCTAATTTGAAATAGACTTTAATAACATCAACCCGAGGCCCGGGGAG GGTACTAGGGTTGGCGAATGAGGAGTATGTGCGGACCAGGACCTCCAAAA ACTGACCCTCAGAGGGACTAATTTTTGCTGAAAAGAAATTTTTTTTTCGA TTTTTGAAAAAAGTCATACCCTTAGAGAGATTTTATTACAATTTTATTTT TGATTTTTGAAAAAAGTCATACCCTTAAAGAGACTTTATTACAATTTTTT CTCTGGAAATCAAAAAATTTCCTAAACATCCTGAATTTTCCGACCCTTAG AGAGAGACCCTAATTTAAAACTTTCTGATTTTTTCCAACCATTAGAGAGA CTTTGAAAGGTGAAATAACCGATCCGTACCTGTCCGCACATACCCATCAT CCATTTTTGCCTAATTACCCCCCCCCTCCGGGACCCGAAGCTTCACTGCA TAACATCTCAAATCATCAACAACAAATCTAATCCTTGAATTGACCCATAG AGGTCCCAATAGGTATAAATAAACATTCCGTAAAATGCCAGGACAGGACA GCTCAGAATAATGCTATGTTTTCAGCCAAAATGTCCCCGTTGTTGCTAAA GTTTTTACCTGAAACCGACTATAAGGTCCAGAATCGAAGTTTGAAGATTT CAACTCTTATTGGATTGGTGTTTTTAATGAGCGACTATCGAAAGGCTAAG AAACTCGTTGATACCTTTTCTCATCGTCATGCTTATCATCTTATAGTTTA TGAATGCGCATTAATCATTTGAAGTAGTTCCTGGCCCTACAAAATATGAA AAATAGAATCAATTAGGTCAAAAATTAGACGATGATATCGGTACACTCCT GCCTCTGTTGACCTCACTGTCATCTCTGTAAAAACTCTTCTAAAAAAGTC CATTTGACTCATTGGACAAATCATTTGGTCCCTCTGGAATTTTGTTGCCC CACTGAAAATGTTTGAAATATTCATACATAACAAAATCAAAATGATTCTA ACGCACCCCAGTAGAACTTTTCTTTCAAAAAATCACCCTAATGGAATCTT CTCCTCTCAATTCGTCTAGAATTATTTGAAGGTGGAAATACCCAAAGAAA GTATCGAAATGTTTCACTTCAATGTACTGTCCAAACTTCTATCGAAATTT TCACAGTGTTTGTTGTCGTAATAATCGACTGCTATCATTAAATCTCATTC CTTTTTATGAGCAAATTTGAGCTTTTAAACCCTAAAATCCTAAGGTTCGA AGACTAAAGTCTCATGTTAAAACTCAGAGTTAAAACTCTACTTTCCCCAA CTGTAGTTTAACTTGCTTAAAAGTCATTTGTGGTGTTAAAATTTCGCAGG GAAATTCCCTTTGTCCCAAATATTTTGTCCACGATCTTTGCATATATTTG AAATAAATGAGGTTCAAATATTCTAATAGGTCTTTTCATAAATATACCCC CTGCTCACAGACCCGATAGGATTTTTTCAGCAAGTGGGGATAAAATAAAC GGACCGAAACTCGATGGGGATTTATATTCCCTTATGTTTTATGGCAGGGG ATTTCAATTTTTTTTTTTTCAAGTCAGAAAAATTCAGTAGGGATGGAAAA ATAGCATAATATTCTGCAGCAAGGATTGGTTTATTTAATCATTTTCAGTG GGGACAAAAGTAGGAGGATAATTTTTCACCGGGGACGATATTTTGGCCAA TTTTTCCAGTTGGCAGGGTTCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTATA AATTATTTTGAGTGCAACGACTGCCTCAATTTGAAACCATTAACATGGCT ATCAAATCCCTTGAGTCTTCAAGTGATACTTTTATAAATAGAGTGAACAA ACTTCATGTAAATTATTCAGGGAATCAATTACCATAGCTATATTTTGAAA ACGAGGTAAGCATTGCTCGTGAGTTAATTTGTAAAAAAAGTCTAGTGCTA TGTTGTGAGTTTTAAACCAGTTTTCGACTTTACAATATAAAAATCTTTTT GATAGATTTTTCGCCTTGAGATGAGTATTTTCCAAAGAAAATTGGAGTAG AAATTAAAGATTGGAGTATTTAAAAGTCAAATTAAGATTTTGCATTTATT GTCATCGACCATTCGAAGATGAAGGGGCTGTGATGTGGAACGCATAGATA GTTATCTGGCCATGTGTGTTTGGCTGGTGAACTGAACTCGACGATTCGTG TGCATCTCATGCCAGAGATTGGACCTGTTGTGAGATGAAGAAATAATTAT AAATTTTTTGAAGAATATTTTCTGTTGCTAAGGAAGATAGTGACAGATTC GAAAAAAGTTATATTTCAACGTTTAAAAAATGTTGCATCACTCACCAGCG TAACTCCATCTCATACCACTGGCAATGTAGGCTAGTCCTGTTCTCTCGCA AAAGTAATTATCTGCCCATGTGTGTGGATCTGATGGTTCCAAAATTCTTG TGCATCTCCAGCCATTACCAAGATGTCCAGCATATGACCAACGAAATTCA CGTGGCCAGTGTGGATATCTTGGGCATTTCCCGTATGTTAGACCAAGAAG GCCAAAGATTAAGAGCAACTTGATCATGTTATCAATTGGTATCTTTTTTA TAGTCTTCTGAATTTTGCCGACTGCGTTAATCGATATTTTAGGAAAGTTT TAAAGCCCTTTTATATACGATACGACCTTTCGAAGATCATACCCCCTGGT TTTATTCTTTTGGAAGTTGAAGTACTCGTTATGGCTAATGCATATCCTTC CTCTAATTTGAAGCTTGATTCGCGAAACAGCTTTTAAATTACAGGTTATT GGGCTTTATCGTTTCTGTATTCTTTGTAACCTTTTTTGGAGAAATTTCTA ATATGAAACAAAAACAGGCCTTTATCATGCAAACGAGGCCAATTATTTCT TGCTGCTTGTGATTTTGGGAATCTTTAATATTTTGAAACCAGTATGCTCA CTAAAGCCATTTGCGCTATGTAGTTCAGTATTTTTCGTGTTTTGAAGAGA AATTTATTAATTACTCTCTGAATTAGGTGTTTCGGTCGCTTGAATCTTTA GGATTTATTTAAAACTTAAGTTAACTTAGGATTTTGGATGAAAAGCCCGG GGGCACTCGATTTCTAAACAACGGCATGTGCCGCCAAAAAAAGGGCTTCC AAAATCGGACCTTTACAGTGCCACCCTCAGCAATGAAAAGATACCCTTAC AGCCCTTACAGTGCATTTTACCTTTCTGACCCTTACAGTGTAGTTTGATT TCATATCTTATTTTTCTAAAGCCACCTGAAAATGAGACTGAGATATGTTG ACACAATATGTAAAACAAATGAAAATGGGTGCGAGACAAAACTATAGAGA TACCAAAGATTATTACTTTCAAACTTGCAATTCAGTAGCTCCCAAAGACA CCCTTACAGTGTACCCAGTTAAAAAAAGACCCTTCTAGTGCACTCTATCA AAAGTACACCCTTACAGTGCATTTCGAGGGTCACGAAAAACCTACCCTTA AGGGCGGTCAGACGATATTAGTGCCCCCCGGGCTGAAACGATACCATCAT AATTGGATAAACGATTTCTGGTGAGAATTCGATTGACCACAATTTTCCTA AATGTCCTAAGTTTAGGTTAAATAAGTTTAGGTCTTCCCGTGTGCAAGAG CCTGTGCAAAGGTATTTTATGATTGATTATTGTTCCTTGAATTAGAAGAT CTGAGAGGTGGGACCGAGGATGACCGGTTGTGACCACCCGTTGCCATGGA AACTGACGTCATTGGTTACTATGGCAGTCTACGAATTGGAATTTCCAAAC ACACAACACTTGAATTTCGAATAAAATAAAAACATTCGAATTTTGAATAA AAACACTATATTTCTAAATGAATTGAATTCACATTCAAAAATTAAAAATA TTAGCCTTTTTGTCTTTTTCGTGAAAGAAAACTTCCCAAACTTGGATTTT TCTACACACACATTAAAATTTTAAGTTCACTTTTTCTAAAAAAGTCCGAG ATAAAACTTGCTAACTCGAAAACTTGTGAACTTAAAATAAATTCCGAGTT AGCTAACTCGAAAAAATTTTTGCGAAAAATAAAATTCGAGTTAATTCTAA CTCGAAAATCCTTTTTTGAAAATAAAAAATCGAATTAGAGTCAAGTGACG TCATTATTTGCACTTTTATGACGTCATAGTTTTGCTAACTCGAAAATTGC TAACTCGAAGTTTTCTAACTCGAAGATTCCGGGCCTCAATATCAAGTATT ACTACGAAAACATTTGAAAATTCGTTGATATTTTCAGTTTTTGCCTGTGG AAGGTTAGAGCTTGGGGCACGCTCAGCCCAGCACGTTACAGGCAAAAATT TAAAATATCAATTTTGGTCAATAAACTTTTTAAAAATAATTTTCAGTCTT TTTCATAATAATATTTTATGTTCACTGGAAGGTATTTTTCTATTGCAAGG CCTCTACTATTACTAAAAGAATACAGAAAATCTTTTGATTTTTAAGGGGA TTCCATTCTGTGAATGGCCGAATTCTGAAATGTTGGAGTGGATTTTCTCA AACTCCCCCCAACCACGCCAGATTTAATCCTCACCAAAATAAATCCATAA TCTCGAAAGCTATCAACTGGCGACATTATGAAATCTATCTGAAACCGCAT GAGATGATATACAAAGTATCAATTTTCTTCTTTGGAGATTATCCAATTAG ATATGGAAAACCTCATGGTCGCGAGCGCCTGATGTGATGAGGGGGTAGTA TTTTGGAACAGAAACAAAATTTGCTTCATCACTAATTATTTTACTAATCA TACTGCGAATTATTTACGCAGCTTATTAACTTAGTTAGTCTCTTATCAAT GCCGGGTCAACGCTCTGTTCATCTTTGATCGTTACTTCACTTAAACGTTT TTTTATAACAAACACCCAACATTTTTGAAGCCTTAGGATGTTCTTAACTT TTTGAGCTTTAAGCCTAAAAATGTTTTCAACATGTTTTTATTTTCACCAT TTTTTGAGTGTTTTTGTCCATTTACCTATGAAGCTCGGTGTTCTAGAGTG CACAAAACCTTAAGATGTCTTTAACTTGTTCTTAACATTTTGGCCTTCAA AGCCTTATGTTCTTGTATAGTTTGTTCTTTATAAAATATTGTATTCGTTT GTCACTAAACAGCAAACACAAGTCCATGTAACGTCCAACTGGAAAAGAAA CTTCCCTCACTAATTCAAGGAAGTAGCTTTTTTGGATTGTAATGTTAAGG TACAAGGAAGAGAACCACGGTGTGCTATTTTTAAACCAGCCATAAAGCAA AAATGATACTTCTTTCAGAGGGGTAGCCAGGAGTTTCCATTTCAGGAGAT GAGTTTGCAAAAATCTTTTGATTAAAATTCTTTTCGCAACTCTCGTTGTA AGTTATCTAGATACATGCGTATCTTTTTGTTGGTAAAAGTTCAAACAGCT CAAAGAAGGCATTAGAAAGGTCAAACCAAGGAAAAGATACTCGAATTCCA TGGCTGGAAAAATACCAATTTAAGGTCAAATCTACCCTGGATTTCTTTTT GCTTGATTTTCTAAGAAGACTGGAATTTAAATAAACGGGTGTTAAAATTG TTCTTTTCCAGCCTTTCAACACAAAAACTCTTGTCTGGAATTTCATTTTC CAGGTGGAAATTTTCCAGGCTGGAAAACAGTAAAATTCAGGTGTGATTTT TTTGTCATTATTTTCAAAAAAATTAGTGACTTGAAAATCCAGCCCTAATT AGATTATTACTTTCCAGGGTGGTAATTTTCCGGTTTGGAAAACAGCCAAA TTCAGGTCTGATTCTTCTTGATATTGGTCAATACACTGATACTGCAGTAA CTTAGAGACAGTAAAGGCGGTATTTACTCTTTCAATAATTAGTAAAAGTA GGTAGTTCTAAAAATATTTTCTGCAGCATCGAACGATTGAAAATTTCAGG CAATCTAGGCATTCTAAATTTTAAATTTTTTCTTGGGCGAAACTCTTGGA ACGCTGCACCGGGTACGGCAGGTACGTTGCTTGCCGTACCATATTTTTCT TTTTGCCAACAAATGGTCAGTCTTAAAGGGGAATTAACGTTTGGAATTAA CCCTGTGATTTTTTTTCGAAATATTAAAGAGGAAGAAAAATGTGATCGAA CAAAAAAAGAACCACTTCAAAATGTCTTTTATTCATTGAGTTATTTAATC TTTAATTTCTCACAATTTTGACTCTACAATGGAGAAAAACTCCCCCTCTG TGTATTTTGTGACGTAAAGTGCGCCCCAACTATTCTCACTGTTACACTCT ATTTGGTTGTTAAAGAGATATAAAACGTTAGAAATTAATCTTTTTTAGAG TAATTATAGCAAAACGTTGAAGACATAAAACTAGGAGAATGTAGTTAGTA TTCCAAAGGTGCAGTAAATTCTCTTCTCTAACGGTAAAAAGAAACTCAAA AACTGCATTTTAAATCATCATTCACCACTCTTCCCTTATAAAAAAGAGAA ACACAGTTCGCACCCTACGTCACATTTTTCGTATCCATAGCAACACAAGA GAATTTTCAAACAACTCTTATTCCGGATGTAGAAGAGTAAAGCCCTATAA ACCAAATATATTTGAAATCGTCTCAATGAGCTCTATTCGAATCTGTCATT TGTTTGTTGAAAAATTTGAAACGTTAATTCCCCTTTAAATAAATCAAAAA TTGTGTGACCAAACAAGGCATACTTGGCTAACAATAGCGTATTAAGGCCG TTTTTCAATAACAAAGGAGAGCGAAAATTGCCGAAAATTTTTCACCCTTG CTTCGCTCGCCTTCTTATTTTCCATTTATTTTCTTTCCTCCGATAGGGGA GGTTACCTTTAGATTCCACGTCCTCTAGTTGCACCACAGCACCACCTCTA TGAAGCCTGTGTTGAAGTCTACGGCTTCTCAGACCATGATTGGCCCAAAC CTCGATTTTAAATTAGTTCTCAAATAAAAGACATCTTACGGGTCTGCGAG GAAGAAATTATTGGGGGAAAGGCTTAATTTTGCATTTACCTCCCGTAACA AGCAAGTAACTTTGGCGCGGTAGACCTAAAATGTTGCTTTATGAAAGCTC AAAAAAAAACTTTATATATTGGCGAAAATGTTTGGTATAAGAATAGGCCA ATTTGTATAAAAGAGACCATAAAAAGGTTAAATTTAGCCCAATAAGGTCA CACTCGTTTAACCAAAGATGTAAAAGCAAAATTGGTGCGTGAACGTGAAA ATGTTTTTTTTTCGCGCGTGAATACGTGAATTGGCAAAAATTTGTGCACG AATACCTGAATTGAGGGTTGACTGGGGGGCCTCGTAAAGTACGAGACTTG TTTGTACAGTTTCTAATTTGTTTTATATTAGTCTCTCTCAGGGTCGGAAA ATTCAGGATTTTTAGGAAATTTTTTGATTTCCAGAGAAAAAATTGTAGGG TATGACTTTTTTCAAAAATCGAAAAAAAGGTTCACCTTTTCAGCAAAAAT CAGTCTTTCTAAGGGTCGGTTTTCGGAGGTCCCGTCCGCACATACCCCTC ATTCGCCAACCCTAGTACCCCCCGGGGTTACTACACAATAGATTTGATAA CTGAAAATTCATTATAATATCGGTATCGGTATTAGGCTTCATTCACCGAC GGTATTACGGTATTTGACCCAAAATATTGTCGGTATGACGGTATTTAAGA CCCCTGAAACCCCCCCTTCTAGGCTAGATTCCAAGCCTTATTGGAGCAGA TTTGAGTTAAAACCTGACTTTCCAACTCTAGTTTAACACACTTAAAAATC ATTTGTTGTGTTTAAAATTTCACTGGGAAATCACCTTTTTCTCAAATATT TTGTGTAGGATTGTAGCTGTCAGCTTCCTTTTCAATAAATATAACAAGAT AAAGTAAAGTTTGTTTCTGTTTCAAAATGCTTCCCCTCCTCCATGGTTTC TACGATTAAGTGTTCTGGGGAATTAACTGGCTCATTTCCAAACGAGCTAA TTATTAATTGATACTTTTTTTATCATTCCATGCGACTTCCGTGGGAAATG AAACAATACATTTGAGATAACCCCCTTGTCATAAGTTTAAAAGATAATAC ATCTAACCTGAAATCGATAAAAACTAGGGGGTAGAACTTCCAGTGACCGT ATTGTATATAAAGGGTTCTCAAAAACATTGGAAAACAACAAGCAACACTC AAAGTGTAAAAGAAAAAAATTAATTCAAAAAGCACAGTTGACAAAATGTT GAAGTTACTCTTAATCTTTGGCCTTCTTGGTCTAACATACGGGCAATGCC CAAGATATCCACACTGGCCGCGTGAATTTCGTTGGTCATATGCAGGACAT CTTGGTAATGGCTGGAGATGCACAAGAATTTTGGAACCATCAGATCCATA CACATGGGCGGACAATTACTTTTGCGAGCGAACAGGACCATCCTACATTG CAAGCGGTATGAGATGGAGTTACGCCGGTGAGTGATGGAACATTTTTTAA ACGTTGAAATATAACTTTTTTCGAATCTGTTATCTTCCTTTGCAACAGAA AATATTCTTCAAAAAATTGACAATTATTTCTTCATTTCATAACAGGTCCA ATCTCTGGCATGAGATGCACACGAATCATCGAGTTTAGTTCACCAGCCAA ACACACATGGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCACATCACAGCCCCTTCA TTTTTGAATGGTCGATGGCTGGACCAATCCCTGGAAAACATTGCATACAA TGGATTGAACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATGGCGTGATAACTATTT GTGCGCTACCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCTACAGTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064-

>XLOC_038356 ID=XLOC_038356|Name=XLOC_038356|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=906bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048_pilon:551122..561064- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCACAGGAATTTTGGAACCATCAGATCCATACACATGGGCGGACAATT
ACTTTTGCGAGCGAACAGGACCAATGCACAGGAATTTTGGAACCATCAGA
TCCATACACATGGGCGGACAATTACTTTTGCGAGCGAACAGGACCAGACA
TCTTGGTAATGGCTGGAGATGCACAAGAATTTTGGAACCATCAGATCCAT
ACACATGGGCGGACAATTACTTTTGCGAGCGAACAGGACCATCCTACATT
GCAAGCGGTATGAGATGGAGTTACGCCGGACATCTTGGTAATGGCTGGAG
ATGCACAAGAATTTTGGAACCATCAGATCCATACACATGGGCGGACAATT
ACTTTTGCGAGCGAACAGGACCATCCTACATTGCAAGCGGTATGAGATGG
AGTTACGCCGGTCCAATCTCTGGCATGAGATGCACACGAATCATCGAGTT
TAGTTCACCAGCCAAACACACATGGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCAC
ATCACAGCCCCTTCATTTTTGAATGGTCGATGGCTGGACCAATCCCTGGA
AAACATTGCATACAATGGATTGAACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATG
GCGTGATAACTATTTGTGCGCTACCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCT
ACAGTTAAGTCCAATCTCTGGCATGAGATGCACACGAATCATCGAGTTTA
GTTCACCAGCCAAACACACATGGCGAGATAACTATCTATGCGTTCCACAT
CACAGCCCCTTCATTTTTGAATGGTCGATGGCTGGACCAATCCCTGGAAA
ACATTGCATACAATGGATTGAACCATCAGAACCGTTGGGTCATACATGGC
GTGATAACTATTTGTGCGCTACCGTGTTCCCACGTGCACGACTCACCTAC
AGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038356XLOC_038356-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000048_pilongenomesc0000048_pilon:551122..561064 -
Properties
Property NameValue
Aaloc208-453:247
Aaloc76-204:497
Aaloc1-72:9944