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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000013_pilon:1124125..1127801+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038354 ID=XLOC_038354|Name=XLOC_038354|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3677bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000013_pilon:1124125..1127801+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATGATAAAAAAGTAGGATTTATTGGCGCCGGCAACATGGCATATGC
CATTGGAAAGGCTCTTGTATCGAGCGGTGTTATTAAAGCTGGAAACATCA
TGGCTAGTGCTCGAACTAGAACAAGGCTTGATGCATGTTGGAAGGTGCGA
ATGTAATTATTTGTTGAGTAAAATCTAGCCCGGGGTccgcttttttatag
actgaatggtgcgattaagtggcccagtagtatatggtaatatgccagaa
gtatatggtaatatgccagtagtatatggtaatatgccagtagtatatgg
taatatgccagtagtatatggtaatatgccagtagtatatggtaatatgc
ttttgcttaggcggactgtaaaacagtccgtcagattttcgttgtttttg
ccaggtaaaaaaagaatgaagcattgaagcattgattaattgattgattg
attgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgat
tgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattg
attgattgattgattgattgattgattgattgatttgctTTCTAGGACTT
GGGAACCAAATCAACACTTGACAATGAAGATGTGGTCAAATTTGCAGATA
TCATTTTTCTCAGTGTAAAACCTCACCTTATATGTGACGTCattaaacaa
atcaaacaaagctCAGGTCCAGCAAAATTGTTTATCTCTGTTGCAGCTGG
AATTACGATAGCCACCATGAATGAGgtataatatctttttttgccaTCTA
GAACATTTACACGGATTTATCATTACAGTGGAGCCTCTTTAACTCGATCT
TCTATTactgaatgtctccttaactcgaataaattttcTAGTTCCTCCAG
TCAACAACACCTTATATACAAAATCAAGGCTTCAATTTACATGAGTTATA
AGACCTAGGATAAAGTCAGTCTCAAACTTTTATGCATGTAAAAGCTCTAC
ACCGTTCGATTTTTACGGAGAATAATCTGAaagattaagggctctgacca
tagtgaatttttcataattgctgtgtttaaaatgtgttttctgaatgatg
taaccaacaaaattatgaaatgttatacattttctgttagacaaactatt
cctgaatctgaaaattcaaaaattgcattggaaaaatttgatgaagaaga
aaatgaagacttttgcgaggaagagtatttcaactttgaagagcttagtt
tcggcgaagaaaaaacattttgaaaaatttttcgcagtagatggtgtatc
ttttaccgaataataaatatttttgcggaaaatttttgtaaatgcttctt
tgtctcgaaatcttcaaaatagtggtttttcatcaatttttcatctggat
ttttcttaaaaaaacagtcataacttttgacacatctttttagaaaaatt
ttccgcaaaatttacaaaagttcaattctttgcggaaagtttgaaaaaag
ttcgaaacaagaaggttaattacccattaaaacttagcacTttttataaa
agaaggtgatgcaacatattattaacgcctttttaaagttcataacgtca
tttttgcaattaagttcttaattactcttacggggtttgattaaaaagca
atttataaaagcaattctttgttaaaagtgttaaagaatctaaaacataa
cttttatgctcagatactaaaatcaattttctgactatggtcagagccct
taaaggtTATTGAAAAACTGAAGAACGCGTGCTGAGAAACTGTTCAAACA
GTAAAATAATATCAACCTACTCATTCTAAGGCAGATtattattgtatttt
tctcttctttatcCCCAAGACTTTTGGAGTACCAACACGTATTGTCCGTA
CCATGCCCAATACTCCATGTATGGTTGAATGCGGTGTCATTGTGTACGCA
CTAAGCTCGGAATGTCTACCCAGTGATGGTGAAATGATCAAAACCATGTT
GGATCCTATAGGTGGGtgttttttattattctttGCTTATGTTGCGATTA
TACGAAGCGCAATTTATGATAGTTTGCTCTTCAAATCGTTCCGACGATGC
ATTCGATTAAGAGCAAGCCAgggggggCACTAAGGCAGggcacagatttc
tgtaaagcccgatgggctagatgtcgtactttaagctcttccaagtaAAA
AAGCGAATATCGCAATAATATtactgctattgttttcgaaaacctgcgaa
gcttcttattggtctaGCGCTAAAATTCTactgtaatgtcacgtgactaa
GGTATGATTACCTAAGCTTGGcattttttcagccaaagcacgataTCTAA
ACGGGTATGTGTGAGCAATAAGGGTACTGTTTTCCATACCTAATACCCCC
ggagagccattgtttaggtaccaaaaattGAGCCTACATATGACCGACGC
AGTAATTATAAACCTCGGAAGTAGACGAGCGAGACGGATCAGAGATATTT
TGTTTTACATTTAAAATGCGGTCAAGGAAATTGCTAGAGTTTCCCCAAAA
CTGATTATGGGTTAGCCAAATATGTGAACGCCAAACTTAATTGTCTCATT
CTATTATACTCCCCTCCGCTCCAACCAGATGaacgaatttggaaattaaa
tgtttatttaACAATAGTTAAATTGTAGTTCAATTTTAAATCGTCTAAAT
CACTCATTCCGCCTGCGGTACTACTGGGCCTTGCGAGTAGCGTTACTTCT
TATTTGGTTCTGCGCGGTATTGGCTATACTCTGAAAGCACAGACAAGGTT
AAGAACCACAACGACCAATGTAACAATCCTTTCAGGTTTAATTGAAGAAG
TGCCTGAAAAACAAATCGATTCTGTCACAtctttaatgggatgcagtatA
GCATGGTATCAAATGGTCATCGAAGCCATGGCGGACGGGGGTGTTAAAAA
TGGCGTACCAAGGGCGTTGGCGTATAAAATGGCTGCTAAATCAATGGAAG
GATCAGCTAAGTTGGTATTGGAAACTGGGAACGCACCAGGAGTGGTAATT
CTCTATAATCTATTTAAGCCTTTATGTGCCAACTTTATCCTCAATGATAT
TTCTTGGTGCTTCGACTTTCTACAATCatgtcgaaatatattgagatttt
agtgtgttttaacgtttttcagaatttaagttCGGGCCagaatttctatt
ttagcacttccactttctttcattgaatatttcgattttggaggggtggc
ttctaggctatattccgagccttattggagcaaatttgagcttctagctt
ctaagtcttaagtctcatgttaattTGTTATGTTTAAAATTTGGCAGGGA
AATTCTCTTTGTATCAAATATtgtgtccatgattgtagtccCCCTACTAC
TGTATATTTGTTAGTGCCATAAGAAGTTGAATCTTAGAATCAAGAGAGTA
ATATTCTCCGTTCGGATGTGTTATACAGGAGTTCTTCACTTGAACTTCTT
GACAAGTgctatatatttttctttatttgtaTCTTACAGTTGAAAGATCA
AGTGACGTCACCTGGCGGGTCGACTATTTGTGGATTGTACGAATTAGAGC
AGAGTGGCATCAGAGGTGCTTTTATGAAAGCTGTCGACGCTGCCACCAAA
CGGAATCAAGATCTTGGAAAGAAATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000013_pilon:1124125..1127801+ >XLOC_038354 ID=XLOC_038354|Name=XLOC_038354|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000013_pilon:1124125..1127801+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATGATAAAAAAGTAGGATTTATTGGCGCCGGCAACATGGCATATGC
CATTGGAAAGGCTCTTGTATCGAGCGGTGTTATTAAAGCTGGAAACATCA
TGGCTAGTGCTCGAACTAGAACAAGGCTTGATGCATGTTGGAAGATGGAT
GATAAAAAAGTAGGATTTATTGGCGCCGGCAACATGGCATATGCCATTGG
AAAGGCTCTTGTATCGAGCGGTGTTATTAAAGCTGGAAACATCATGGCTA
GTGCTCGAACTAGAACAAGGCTTGATGCATGTTGGAAGGACTTGGGAACC
AAATCAACACTTGACAATGAAGATGTGGTCAAATTTGCAGATATCATTTT
TCTCAGTGTAAAACCTCACCTTATATGTGACGTCattaaacaaatcaaac
aaagctCAGGTCCAGCAAAATTGTTTATCTCTGTTGCAGCTGGAATTACG
ATAGCCACCATGAATGAGGACTTGGGAACCAAATCAACACTTGACAATGA
AGATGTGGTCAAATTTGCAGATATCATTTTTCTCAGTGTAAAACCTCACC
TTATATGTGACGTCattaaacaaatcaaacaaagctCAGGTCCAGCAAAA
TTGTTTATCTCTGTTGCAGCTGGAATTACGATAGCCACCATGAATGAGAC
TTTTGGAGTACCAACACGTATTGTCCGTACCATGCCCAATACTCCATGTA
TGGTTGAATGCGGTGTCATTGTGTACGCACTAAGCTCGGAATGTCTACCC
AGTGATGGTGAAATGATCAAAACCATGTTGGATCCTATAGACTTTTGGAG
TACCAACACGTATTGTCCGTACCATGCCCAATACTCCATGTATGGTTGAA
TGCGGTGTCATTGTGTACGCACTAAGCTCGGAATGTCTACCCAGTGATGG
TGAAATGATCAAAACCATGTTGGATCCTATAGGTTTAATTGAAGAAGTGC
CTGAAAAACAAATCGATTCTGTCACAtctttaatgggatgcagtatAGCA
TGGTATCAAATGGTCATCGAAGCCATGGCGGACGGGGGTGTTAAAAATGG
CGTACCAAGGGCGTTGGCGTATAAAATGGCTGCTAAATCAATGGAAGGAT
CAGCTAAGTTGGTATTGGAAACTGGGAACGCACCAGGAGTGGTTTAATTG
AAGAAGTGCCTGAAAAACAAATCGATTCTGTCACAtctttaatgggatgc
agtatAGCATGGTATCAAATGGTCATCGAAGCCATGGCGGACGGGGGTGT
TAAAAATGGCGTACCAAGGGCGTTGGCGTATAAAATGGCTGCTAAATCAA
TGGAAGGATCAGCTAAGTTGGTATTGGAAACTGGGAACGCACCAGGAGTG
TTGAAAGATCAAGTGACGTCACCTGGCGGGTCGACTATTTGTGGATTGTA
CGAATTAGAGCAGAGTGGCATCAGAGGTGCTTTTATGAAAGCTGTCGACG
CTGCCACCAAACGGAATCAAGATCTTGGAAAGAAATAGTTGAAAGATCAA
GTGACGTCACCTGGCGGGTCGACTATTTGTGGATTGTACGAATTAGAGCA
GAGTGGCATCAGAGGTGCTTTTATGAAAGCTGTCGACGCTGCCACCAAAC
GGAATCAAGATCTTGGAAAGAAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000013_pilon | genome | sc0000013_pilon:1124125..1127801 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 676-813:3540 |
| Aaloc | 469-675:2838 |
| Aaloc | 325-465:1870 |
| Aaloc | 145-324:596 |
| Aaloc | 1-144:1 |
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