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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000013_pilon:1081764..1088244+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038351 ID=XLOC_038351|Name=XLOC_038351|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6481bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000013_pilon:1081764..1088244+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTAAAAAGGAAATGCTTCCACTAAGATTACTTCTATTGGGATGTTT
TTCAATCAAAGTCATGACAGTATCTTTAGATGACGATCCAAGTTTATGGC
CAGGACATTTGAAGCCCTTTGGAAGTGAGCAAAAAAGTGCCAATGTTGAA
ACTATTGATCATTGGCCTTCTCCACAAGGTATAtgctttttgtcattttt
agtaTGTTATGAATACTGTTTTAATAGAGTTaaatcttactatactaaat
gagtttatgaaaaatttctgtaaCGCTTGATTCGAGTATGAAAGAGGGAT
TTCGTGCAGTTTTAAGACAAAAAATCTTATTGTCTTTCAAAAAGCAGTTG
ATGATACGTCGTGGTTttaattttatgtttaaaatatcattttcatctAT
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atcaaagtatttATTGTTTGGTCTTTTAAAGCACGTCATGTCGACCTCAA
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CAAACTTCCTGAAGAAACTCTCACAATTGAAGGTTTATTTTTTACTAAGC
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CATAAAAAGGTATTTACGAGACATCTTCACACTACTCGATATACTCCCGT
GGttggtaaaaaaaaactaatttaagTCTTAAAGATTTGATAGATAAAGA
TAAATTTAGAGAGCATCAACAGTACCATCTTTCTTATCCTAGGggctttt
gatgcgcaagcTAAAGTGgtgtttgcgacgacgggaaccgccTAGTTATA
GCTAAATTCAAATGACATCGAAActtatgttttgatttgcagCAAAGCAA
CTCTTTATTTCACGTAATAAAACATTGTTATCCTTGtaatttatttcctt
ttttgtattttctagaTTTCTTTGAAGATTATAATGACAACAGTCGACCA
GTATTATTTAAAGGGCTAGCAAAGAAATCACCAGCATTTACATTATGGGA
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ttgaaaaacagaagaaagaaAATCGTACACTGGGAGGAACAGAGATTAGT
TTGAAGCAGTTTATTGAAACCTACCAAAAGGAAGAGATTTACATGGTTAA
TGGCTGTCCTAAAATAATCCGGTAAGCATTTTAATAGATTAATTTTCAAA
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ACTTAAGTATACTTCTATCTGTACTACATTTATCTATTTACACATTAACC
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CTCTTATTCTTTTCTTCAGAAAAGATGTCTTAATACCACCACCACTTCGA
TGTGAAGAGACGAGGCGTTATTTATTAGATGCTGTAAGATTTGGTTTTAG
ATCTGAATTTGTCATAACGTTGTATTTGAAATGACCTTGCTTTGATTAAA
GTCTTTATTAAACTTGTGTTGGATACTGTTTTTGTAAGATAATAATTATA
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aatttaaCATACATCCCAAATTGACCACTACTTATCAGCACAGTAGCGGA
TTATAACTAGATCTTGAATGTTAAGGATCTCATTTTAGGTGACATGGTTC
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AATATCTTAACATACACAACCTTCAAAAAGAAACGCTCTTAGTGTAGggt
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ATGATTCAAATTCAAGTTATTAAATTCAAATGATTAAAACTATAAATATT
CCGTCATTTCATGTCATTTGTGTTCAACATTAATCTTTCATCAGGATTCA
CCAAGTTAATTCAATTGCTAACGAGAAGAAACAGAACGTAGCTGTCAACA
TTTGGTTTAAACACACAAGAGGGCATAAACCAAAAACTTGCAAACTATCT
CCAGAAGATGCTACCATTGATAAATATTATTTCTCAGAATTGGAAAAAAC
CCAAGCTAGTATTGATGGCCGTGAACCACCTAAAGAAACTCCGATGTAGG
TTTTGAAAACTTCAGTTTcatttctttaaatattttcttttgtgaGGGAA
TTTTGTATAGGTGCAAGAGATATCCAGTGAAGGATATAGAAGGATTTACT
TCAATTTAAGTAATATTaacataaggcttcactttGTCTTGCCTTGCAAA
GGTTGGAGATTCTCTTCCAACTTTCGTTTCAAAACTCaatgagtatgaaa
ttaacAACCTTCTCTCTAAAAAGACTCATTTATTTATTtccatcttttta
tttttttagtgaaaaatatGAAGCTTTTTTGGACGAAACAAAGAAATTGC
GAATGAAATTCAGCACTTTTGTCAAGTTATATTACATGGTAAGTTTCATA
AATAAATCTGTCTTGAAATGTTATAGATCACTTTTGGGGATAAAATTTgg
actaaattttatgaagaataTTTGTTTATGGCCTATTTTGAAAGCGTTGT
GGTATGCTGCACCACTACTATCAAGTACTATATGTGTCAGGCTGTTGAAA
AGGAGTTTTGACATTGCGTATTCTCCATTCTAGCATCTGTTGATAACTTT
GGCATTTTAAAATATAGGGTTTTCAAACATGGAGGAAGGAATACGGACTT
TTGTTTGAAAGCTAAGGAAAAGGAAACTGTAATGTACTACGTGTTACCAT
TACATGCAGAATTTCCTTATCAGGACTGAATGGTAGAAAATATTGAACGC
GGATATTGCTTTTATGATAAAGGAAACTGTTGATGTTTACGACAAGGAAG
TAAAACCTGTCTTTGCTTTTGCGAAATTGGAATGAGAAAtgggaaatttt
taaattaacaTGAACTTCCGCGTTCATGTCACTGACCTCTCACTACTTGT
GATGTCTGTGATTCCTGTCTTTTCAATATACAAAATACTGCAATGtaact
ttgaatattttctaTATAATACGTGCATATCCCGCAAATTATGTTTTGAA
ACTCTCGTGTGTTTGTCCCAGTATTTTGTTGGGCTCATTACAGTTTCTTT
TTTATACAGAGTGAAATCTTGGATGACGAAGTGAGAGAATTTGCAGAAGA
AAATTCAGAAGAACTGAACAAGGTACTTAAAAAGGTAAAATACTCAATTT
GTTCTTTGAATCCTTACAATATCTCCCCTTAACACTAGCATTTGAAAGTC
CTTAAATGATTCCTTTCCTCTTTTGGAGGACACTATGTAATTTTTGCTAC
ACTTATTTCTCCTGAGAAATTAGGATTTTGTcccatgtttttgtttttcg
gGGTGAGTTAAGGCCTTTCCCAACATTGGTTATCTTGAGTGAACAAGCTT
TCGTGAATGAACTAAATATTGTTTGTATCAAATGTTCTATCCTAGCCAAA
AGGTACAGCCCTTTCATAATAATCTTTTAAggttttttgaggaaatttca
atAACTTAGagtgtatttctttttttcttgagaGAATCTTTAGCGCGatt
aaattccgcgaatttGCCTAAAATTCAAAGccatcgcgaaagtttcttcc
ctttaattATTTCTATCAATAGATTAGTGACTGGGAGACAAGAAAATGGA
CACAAAATTGAGTCGTTTGACCCTTATGGAATATATTCTGTAGTAtggcg
agactaattttagcgttttagcgagttttccctattttcgctaaaataaa
tctcgctaaaacacgccgattCGACCGAtagctaaaatttatccgcgcga
aatttttcgaaaagctgattcgctaaaataaatccagtatgtttttcttt
cattttttatcattttcatatttttttcaaaaactacaATCTTTTGCAAA
ATATGTGAGACACTTTACAAAAAAGCAAcccccctcccccAAAACAATGT
TGTTTATGGAATCAAGCTGTTACTGCACTCAACATTGTTTTGGGGGAGGG
GGAAGCTTAAATTTGCTATATTTGCAAGGTGTCTCATGATATTTTGCAGA
AGATTGTAGTAACCGGGGATGGGGGCCAGACCACCTTGAACAAGTGGAGA
CCTACGGTAGTTTACCGAAGTTAAAATTGCCATCATTCTTGCACCTCTTT
CTAACAAGAATTTTGTAACCCTCGATATTTCACGAGGTAGATGCCCTCTA
ATAACGCCATCTTTGTAGGTTGTTTTAGTGGCAAAAACATCGAATGGATG
AAACTTTCTTCAGGGAAACATTTcgtggattaattttttcttcaaaatca
ttgccctcgctaaaattaatccacgcgaaatttttatCAGACGAgaattc
gctaaaatttatccacgcgaaattttttgaaagaaaaaaaatcaagattt
tcttgacccgctaatatacgctaaaattagtctcgctaaaatttctacga
ttaaagtattctATAAGTGTTATATACAAATGTGGCGGAAATATTGGGGT
CACGCCTAGAGGAACTTAGTGCATGGCGTAGTAGTATACCCTTAATAGGG
CATATACCAGAGGCGGCAAACCAGAGGGAGTAAACTAGAGACTCTGTACA
AAAGGCACGACAGGCAGTGTGAACATCAGAGGCCCAAAGAGAATCTAGAC
GTCACAACCAAGTGACCAACCGCGACAGTGAGAGGAGAGACCCAGTTTTC
AACTATCAAATTTATCTCTATTTGATCTTTGTATATTCCATATTTCAGAT
CTTCGATGCATTAGATTACACAGACAATGGTTCAGTCAATCATGCTGATT
TTGAACAAGCTATCGTAGATGGGAAAGAAAAGGTAACTACTAATCCCTTA
ATCTTTCAATCGCCAAATCTATAAACAATTCTTGTTAAGGGTTACGTAAA
GAATATAATGAATattaatttcaaagttttaattgaCCTAAACCTTTCTA
GACGGGTTCAAAAGGCTGAAAGCTGAATTACAATCTTTTCGCTAAAGCAA
GCTGATTGATTATCAACACgcattttccttaaaattttccattttagaTG
CCCGAGCACAGTATTGTCTCACACTTATTGATACTTTTACCAAcataaaa
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CTCatgtttgtttgtttcaaacttttaggaacaacaccaaaagattttag
AAGCGGAAACCCTTGTGGAAGACTTTTTTAAGAACTCTGGTATAATACCt
ttatttccattttttgacaTCCTTCTCTCTTTTCTAATGGATGGATGGTT
TATTTTGCTGAAAACTTTGTGTTCTTTCTTTAATTCAGTGCATCGAAATC
GGCTGCAAGCTGTAGTAAGCATTGAATGTTGTACACTTAGTGGGAAAGAC
TAAGGGCCGGACAGCATTTGCAACGAAACTTGGAATGTAGAAATTGACCT
AAAAGTCAAACTTAACGTTGTTAACGATAAAGGACGTTAATTGCACTAAG
ACTATGTCAACCTTTTTCAGTCTTAAATTTCAAAGTACAAACTATCAGTC
AATCTTTTGCCTTCCTATATCGaacaaaaataaggtaaaatcaGCCGACA
TTAGAATTAGgtttaacatttttttgctccTTGCATTTGCAGTTGATGAT
CAAACCAATGGAGTAACCAGAGATGCTGAAGATGAATCTGATGGAGAAGA
AGTGAATAAACGACCAACCGGTGAATTATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000013_pilon:1081764..1088244+ >XLOC_038351 ID=XLOC_038351|Name=XLOC_038351|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2706bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000013_pilon:1081764..1088244+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTAAAAAGGAAATGCTTCCACTAAGATTACTTCTATTGGGATGTTT
TTCAATCAAAGTCATGACAGTATCTTTAGATGACGATCCAAGTTTATGGC
CAGGACATTTGAAGCCCTTTGGAAGTGAGCAAAAAAGTGCCAATGTTGAA
ACTATTGATCATTGGCCTTCTCCACAAGATGATTAAAAAGGAAATGCTTC
CACTAAGATTACTTCTATTGGGATGTTTTTCAATCAAAGTCATGACAGTA
TCTTTAGATGACGATCCAAGTTTATGGCCAGGACATTTGAAGCCCTTTGG
AAGTGAGCAAAAAAGTGCCAATGTTGAAACTATTGATCATTGGCCTTCTC
CACAAGaTTTCTTTGAAGATTATAATGACAACAGTCGACCAGTATTATTT
AAAGGGCTAGCAAAGAAATCACCAGCATTTACATTATGGGATGATGAATA
TCTTAAGAACCATCCTGGAGCAGATAAATCTCTTGTCTTTGttgaaaaac
agaagaaagaaAATCGTACACTGGGAGGAACAGAGATTAGTTTGAAGCAG
TTTATTGAAACCTACCAAAAGGAAGAGATTTACATGGTTAATGGCTGTCC
TAAAATAATCCGaTTTCTTTGAAGATTATAATGACAACAGTCGACCAGTA
TTATTTAAAGGGCTAGCAAAGAAATCACCAGCATTTACATTATGGGATGA
TGAATATCTTAAGAACCATCCTGGAGCAGATAAATCTCTTGTCTTTGttg
aaaaacagaagaaagaaAATCGTACACTGGGAGGAACAGAGATTAGTTTG
AAGCAGTTTATTGAAACCTACCAAAAGGAAGAGATTTACATGGTTAATGG
CTGTCCTAAAATAATCCGAAAAGATGTCTTAATACCACCACCACTTCGAT
GTGAAGAGACGAGGCGTTATTTATTAGATGCTAAAAGATGTCTTAATACC
ACCACCACTTCGATGTGAAGAGACGAGGCGTTATTTATTAGATGCTGTGA
CATGGTTCAGCTCAGGAGGTACTCAATCTGTCATTCACCACGACGATCTA
GACAACATCAATTGTTTATTTCGTGGTCAAAAGGAACTTGTCTTCGTCAG
TTATGACAAATATGGTGATTTTCTACCATTAGATCAAGGAGGATATTCAT
CTATTGATGTTGACAAAGTCAATTTTACTGCTTTTCCACAAGTCAGAAAA
GTTCAGGAGTATGTAAGAGCTTCAATGGAAGCTGGTGATTGTCTCTTTAT
TCCTTATAAATGGTGACATGGTTCAGCTCAGGAGGTACTCAATCTGTCAT
TCACCACGACGATCTAGACAACATCAATTGTTTATTTCGTGGTCAAAAGG
AACTTGTCTTCGTCAGTTATGACAAATATGGTGATTTTCTACCATTAGAT
CAAGGAGGATATTCATCTATTGATGTTGACAAAGTCAATTTTACTGCTTT
TCCACAAGTCAGAAAAGTTCAGGAGTATGTAAGAGCTTCAATGGAAGCTG
GTGATTGTCTCTTTATTCCTTATAAATGGATTCACCAAGTTAATTCAATT
GCTAACGAGAAGAAACAGAACGTAGCTGTCAACATTTGGTTTAAACACAC
AAGAGGGCATAAACCAAAAACTTGCAAACTATCTCCAGAAGATGCTACCA
TTGATAAATATTATTTCTCAGAATTGGAAAAAACCCAAGCTAGTATTGAT
GGCCGTGAACCACCTAAAGAAACTCCGATGATTCACCAAGTTAATTCAAT
TGCTAACGAGAAGAAACAGAACGTAGCTGTCAACATTTGGTTTAAACACA
CAAGAGGGCATAAACCAAAAACTTGCAAACTATCTCCAGAAGATGCTACC
ATTGATAAATATTATTTCTCAGAATTGGAAAAAACCCAAGCTAGTATTGA
TGGCCGTGAACCACCTAAAGAAACTCCGATtgaaaaatatGAAGCTTTTT
TGGACGAAACAAAGAAATTGCGAATGAAATTCAGCACTTTTGTCAAGTTA
TATTACATGtgaaaaatatGAAGCTTTTTTGGACGAAACAAAGAAATTGC
GAATGAAATTCAGCACTTTTGTCAAGTTATATTACATGAGTGAAATCTTG
GATGACGAAGTGAGAGAATTTGCAGAAGAAAATTCAGAAGAACTGAACAA
GGTACTTAAAAAGAGTGAAATCTTGGATGACGAAGTGAGAGAATTTGCAG
AAGAAAATTCAGAAGAACTGAACAAGGTACTTAAAAAGATCTTCGATGCA
TTAGATTACACAGACAATGGTTCAGTCAATCATGCTGATTTTGAACAAGC
TATCGTAGATGGGAAAGAAAAGATCTTCGATGCATTAGATTACACAGACA
ATGGTTCAGTCAATCATGCTGATTTTGAACAAGCTATCGTAGATGGGAAA
GAAAAGgaacaacaccaaaagattttagAAGCGGAAACCCTTGTGGAAGA
CTTTTTTAAGAACTCTGgaacaacaccaaaagattttagAAGCGGAAACC
CTTGTGGAAGACTTTTTTAAGAACTCTGTTGATGATCAAACCAATGGAGT
AACCAGAGATGCTGAAGATGAATCTGATGGAGAAGAAGTGAATAAACGAC
CAACCGGTGAATTATAGTTGATGATCAAACCAATGGAGTAACCAGAGATG
CTGAAGATGAATCTGATGGAGAAGAAGTGAATAAACGACCAACCGGTGAA
TTATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000013_pilon | genome | sc0000013_pilon:1081764..1088244 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1267-1353:6395 |
| Aaloc | 1204-1263:5929 |
| Aaloc | 1120-1203:5499 |
| Aaloc | 1045-1119:3860 |
| Aaloc | 967-1044:3111 |
| Aaloc | 766-963:2646 |
| Aaloc | 499-762:2039 |
| Aaloc | 436-498:1721 |
| Aaloc | 181-432:1268 |
| Aaloc | 1-177:1 |
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