XLOC_038341 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038341
Unique NameXLOC_038341
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000390_pilon:174232..187181+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038341 ID=XLOC_038341|Name=XLOC_038341|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12950bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000390_pilon:174232..187181+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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tagcctatactagacgtcacccgcgttttttttacgcaattaacgtctat tccactttgcgactttttcgaatgttttgagcccgggttttcgggctcta aacattccattttttgacgtcacttttaactttcgaagctcctgcagtag taaaataatcgaatttgcgtcaaaacacttgaaaggcttctatttttcga aaatcgtcaaagtggaactcactaagaaacgagatgaaaaattccggttt ttagtgaggtgctcgctacttTAACTATTGTTTTGTCTTTTCATCATAGG TTTTGGTCTCGTCTTTTTCTCTATCCACAAATCGTGTTATTTTCAACTGG CTTTATCGCGCGAACGATGTTACCTGAAGCTAACTTCTATTTTTTGTTTA ACGTCATGCTGTGGTCTCTGATGTGTCTTAACGTGTGGTGGTTTCATTTC ATTCTTGCGCTGGTGTATCGTATTGCAACTGGTCAAACTAAAGGCGTTGA AGATACAAGAGAATATGTCTCGGAAAAAGAAAACGGTGCAGCACACCATG TTAAGAATGGAGATGCAACCAATGGCTCTGCTAACAAAAAGCAGAAAGCA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000390_pilon:174232..187181+

>XLOC_038341 ID=XLOC_038341|Name=XLOC_038341|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2094bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000390_pilon:174232..187181+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcttcaaaaatgaaaataagagataatccaaatgaaaattataCCTT
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AAAGAGGACCCACTCAACATTTTCTCAGTGATTTTCAACAAGATGTTATG
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ATTCTTATTCACAATTCACAGATTTGTACTCACAAAACTCATCTTACGAa
tggcttcaaaaatgaaaataagagataatccaaatgaaaattataCCTTA
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ATGGAGATGCAACCAATGGCTCTGCTAACAAAAAGCAGAAAGCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038341XLOC_038341-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000390_pilongenomesc0000390_pilon:174232..187181 +
Properties
Property NameValue
Aaloc748-1047:12651
Aaloc592-744:2773
Aaloc412-588:1173
Aaloc250-408:676
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