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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000051_pilon:1245230..1252585- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038337 ID=XLOC_038337|Name=XLOC_038337|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7356bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000051_pilon:1245230..1252585- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTACATAGCGGCTGCTGGGACACATCAAATATGGTCTTATTTCTTGGA
AGATGGCTCATGGCTAAAGAAGGGGTAGGTGATAAAGTTGAAGTGGAAAT
TAGTCTGATTCACAGACATCTACACTTCCTTTTAAAGATTGATCAGAAAC
CTAAAGTCTGTCTCACATAATTTTCAGCGGAGATAAAAAGGCTGTAATTC
TTGATAAAATTTTACCAGAAGTCCCTTTTTAGAAGTCCAAAATGGAACTT
TCATGGATGTTAATAGGGCATTTTCACACGCACAAAACTTGTATCTTTGT
TCGACTATTAGCGTGGCTAGGCATGGAAGCTATTCAAACGGTACAGGATC
TATAGAGTGAGTTTTCGCCGGTTATTCGAGCTAAATCTATGACGCCGTGA
AATTGCCGAAACTCACCCCGTGGAGATTGGGTCGAATTGGTCAGGAAGTA
TGTAAATCAAATCTCACGTCTTCTTTACCCCGCTATTGAGACAGGGAGGG
TTCGTTTACAATCTTTTAATTTCTAATGATTCTTGCTAATTCGAACACAA
ACGAGACGTCTTATTTGTTCGAATTGCAGAGATTCTACTAGAGGGTTTCC
TGTCGGTGGGAGCTGAAAATTATTTGGAATTATATAAAGATTCGAATAAT
AGAAGTTCAAATACGCACGAGTCCACTACTCGCATATTATCTCCCGGGGG
GTGTACTTGGGCAAGACGGGTTCCTTTTTTAAACGAACCCTCGAAAGTTT
CTCAAAGGGATACAAAAATCGATAAATTAACAATCGAAATGGTCCCAAAA
TTACGAAATATTAAAATAGACTCCCTCAAAGGGTCATAAAATTGGGTGAT
TTTAAGCTAAAAATTGGAAAAGTAGCCTCTCAAAGGGTCGCAAAAACGTC
GATTTTCGAACTTTGGCTCGTTCATACCTGTCACATCGCAAACCTAGTAC
CCACCACTGTTTCGTTTTTCCAGATCTCAGACGGAAAGGACTTGTATACG
ATTCGCGGGTAGTGGAAATGAAGAGAACCGCAACAATAGTTATCCGCATA
AAGCCTCATTTGCCCAACCGTCACATCTGTCATTAGGGAAGGTTAAAGGA
CAGAACGTCTTATTTGTTGCGGACAGTGAAAGTAGCAGTGTAAGGACTGT
GGAATTAAAGAGTGGAGCAGTCAAAGCATGTGTTGGTGGTGAAAGAGACC
CGATGGTAAGATGTCTTTGTTATGCAAAATAGGATAGCCTTCTCTTTTTG
GAGATAAGATCTTTGATTGATAAATAAGTAAGTTTGCGCCCGTAGACGAG
ACAACCCCGAACACTCTCTTTCTTTAGCTGTCTACCCGAATGCTATGCCC
TAAGATATTATTGGAAACTTATGTTGACAATTTTGGTTATTTTAACGTTT
TTCAGAATTTAAAACTCGGACGAGTATTGCTATTTCAGTACTTCCAATTG
ATTTCATTGGATTTTTCGATTTGGGAGGGGTAGCGGCTTCCAGACTATAT
TCTTAGCCTTATTGGAACATTTTTAAGCTTTTAGGTACTGAGATCCTAAG
GCCCTAAAACTCAGAGTTACAATCGCACTTCAAAGCACTTAAAAACCACT
TTCGGTTTCAAAATTCTAAAACAAATTCCATTGAGTGCCAAATATTACGT
TTGGCATTGTAGCTGTCTACGACGTCTCATAAATCACCTGCTAATTTTTT
CCTGTCTCTCTAGATCTCTCAAATTACCCTAGACAATCAATACCCTTTGG
TTAATATTGAATTTTTGTCAAACAATACAATATTTTGTAAGAAATATTAC
AGAAATATTACATATGTTCACCCCCCCTCATTTAATCCCCTTTAAGGGGG
AGTTAAGGTAATTAGGACACCCGACATTTGATTTATTTGCTTTAGAAAAT
GTTTCTCTTTTTTTCCTAGAACTTGTTTGCATACGGTGACCAAGATGGAA
AATCAGTTGATGCCAAGCTTCAACATCCGTTAGCTGTGGTGTATGATCAA
CAAGATGATGTCGTTTATGTGGCTGACTCATACAATCACAAGGTTTGACC
ACACCCATACCCATACTCCTGTCTAGACCATACCCATACTCCTTAGTCTG
AATCGCAGACCTCTACAAAACCCTATAAGGAGCACGAATCCGTTAGTGGA
TGCAAGCAGCCTACATACTCCTGTCTAGACTGTTAGAATCGCTTTAATAG
CATATTCATGTATGTCTATTTTCCTGCGATGGAGATGGTTGATTTTTCTA
GATCCTGATTGACTGAGGACGAAGCTAAATCAGCACGATCATAACTGCGA
GTTATACCAAATCGCTTCAGTTACACCGCCGCCCTCAAAAGTGTAAATAC
ATGAACTCGCTAATGTATTTAGTATTTATGTTTCATTAACTCGAACAGAC
TTTCTCCACCTTTGAGTTAACAATACCTTATAAACCTCACTCTATATCTC
GATATTTACTTTACGAATTTGTGTTCCCCGTGCGTGTTTGAGCTATGGAG
ACCTAACTGTAATTTTTTTTTGCAATGTAACAAGAACTATTCCAGGCTTG
TTTTTCATACAAACCACTAAATCTTGGCTGAGCTTGAGGTTGTTCTTAAA
TTTCCATTGCTCCAGACAATAGAGTCATTGTTCTGAGAGCCTAAATAAAA
TTGTTCTTATAAATATTTCAGGGATACACGCATCATAATTCCCTGTCTTT
TGCCAAATAAAAGGGTGCTAATAAAGGTGTCGACGAAGATTGTTGGCTTT
AGAGAATGGATAGAATAAAACTTAATGAATCAACAATTTACATGTTTTCT
ATAAGGATTCAAAAATTCAAAATCGGGCTCGGGGATACTTAGATCGAGAG
ATAAACAAGGCTTAAAATGCTTGAAGGATGCTTATATTCTAAGCTAAATT
ATAGGGGAATCCAGAAAATCCGAGAAAACCCAGACAAAATCGGAAAGTAT
AGGCTCGTATAATGCTTAGCGTATGCTTAAATATTTGCCATATCTGAGCC
TGATATGCTTATAAGTGCAATGCTTATAAAAAAACACATATATTTTAGAA
AATTGATAATCATCAAAGAATATGTATTTGCCAAGTACATTTCCTCTTTC
CTAATTTTTAGATCAAGAAAATTGAAGCAAGCAAAAATACGTGCAGCACT
TTAACAATACGTGGTGGAGTAGGCTCGACTGATGGCCAAATGCCTGAGTG
TCAATTCAATGAACCGGGAGGTCTCGCCCTACACCCTAATAAACGCCTGC
TTTATGTGGCGGACACTAATAATCATCGTATAAGAGTTATTGATTTGGAA
AAGAATACCTGCACAACGGTTAGTTTTATGTATCACACTTGCTAATGTGC
CACTGAAATTTAGATTATTTTATACTAGATCCTAGCGTGTTAAAGTGTGT
TTCTTAGTTAAACCTGTTCTTGCTCTTCTGTGCTCAATTTTACGGGACAT
TTTCCTTTTCTTTCAACTGTAACCATTTTTTTACCTCAGAAATGCTCTAT
TCATGATATGCAACACTGGAGAGTCTTCCAAGAATTTTTTTAAAATCTCA
ACCCAATACGTCACTTTTTCTATTGTTTAAGTGACGTATTGGGTGGAAGA
TTTCTCATTTCTCAATTAAAAGTTCTCAGAAGATTCTCCAATGGTGCATA
TCATGAATTTCAAAAATTTGGAATTTCTTTAAAAACTAAACAGCCTCAAC
GAGAGCAATACTTTAAGGCACTTATTACCCCTCCTACTACCCCAGAAATA
TTTTTGTCTCACCCCTGCACCCATATTTACGGCCCCAACCTTTTTCACTC
ATATTTCTCTGCGTGAAAAATAATGGATTTGAGATGATTTGAGCAAATGA
AAGCTTTTGTGACGCGGTCGGCTTTTGAGGGGTTTGGTAATGAATTAACA
AGGTGATGACGTTAAAACTCTTTGTCTACATAAATATTTACATGCAACGA
TTTCAGACATTTTGACGTCATTTCCTCCTGGTAAATTCGAATCCAGTCTC
CTAACGCTTTGAGGGTTGATAGGTGTGTTAAATTTGGGTTTTGATACAAA
GAGCTTTTCTATACTGTTTCGATCAAACTTGTTAATAATAGTAATTCCTT
TTTTCAGCTACCACTCATTGAGAGTGATTCCAAAGATTCGCCAGTTCCTT
TAGAATTCAAAGCGTTGGTCAACATTCAACGAAATCCACCCACAGTACTG
GAGAAAATCACCAGAGATTTGAGCAGTGTTGTATCTGCACGTGTTCAACT
TGTCTTTCCTGAACATTTGCATTTTACTGAAGGTGTCAATAGCAAAGTTC
AACTTAGTTTATCGGACATGGGTAAGTGAGGGTTACACGGTTGAATGAAA
AGCTGGCGCGTTTAAAATCTTCTCTCATCCATCTACTTGAGCCAACCTTC
CATGGTTACAAACATCCTGAGTCTAATGAAAAACGATATTTTCATTAGTC
ATTTATCGACGGCCCACCTTTTGCCTTGCCTTTTCTAATTAAGATGGGCA
GAAATTTTGCTGTCTAAAGTCCATGCATTGCCCTCTATTGACATCAGTGT
AATGTAAACTTCTTGCAAAGACTAGAGCTGCCAATTTTCTGCCCACTTTT
GAAGTGGGCCGTTTAAACTTATTTCAAGCCTTTTAAGGATATGTTGCTCA
ACTTTAAAATTTGCAAGTGGCGCTTTATATTTCTGACTTCGGTGTCTTAT
CTTCATAGAATTTTTAACTCGCAACACAGAAACCTCTAATAACTTGCTAC
TACTCGCATATTGTTAATTGAAATATTTTCCAGCCCAATTAACAATTAAA
GTAGGTGTTTATCAGTACGAAATTTGCCCAATTTAGATGGTGAGGTCATC
AGTTTCGAATCAGGAGAGATCGAACGAGAAAAGAAAACTTTCGGATGTAA
CCTATCAACCCATCACGCCAACAAAGACTTGTTATTGAAGGTATGACCCA
TTGGATCTACCTATCCATCATGTTTTTCTTTTAATTCACTGTATCACCAT
ATCACAGTTTTGTTCAAAGTGTATCGAGATATAGTGGGGTGCGTACGGTA
TTTCGGAATTGCGGAAATCGACCTTTTTTTCTTTGAAATTTGGAAATTGG
GCAAAATTCTTTCGGTATTTCGGAATTCTGAAATTGTTTCGGTATCGGAA
ATCCGTGAATTTTTACTTCGAAATTTCCGTATTATAAAGTTTTTATCCCC
CTTTTTCGGAACTCATACATGAAAAATCAAATTTGACGAAAAATTAGTCA
AAACAACGAGGAAAAATACCCAAAGAAAATGGTATCGAAATTGCAAGTAT
TTTTTTACGGAATTTCGGAAATTCTGGCTAAATTATTCGTCGGAAATTGC
AAACCCCGTACGCAAGAATGCTTTTGATAGTCAAATATAATTGCGAAAAT
CTTTTTGTTTACAGTAAGTGAATCAAAAGCGCTATATTTGAATATGGCCC
CCTCCCCAGCGGACCCAAAATTCACATCACGCCAATTTTTTTCGATTTCA
CGCCATCACGCCTGAAAAATTTGATTTTCCCGATCACGCCAATTTTTTTC
GATTTCACGCCATTACGCCTAGAAAATTTAGTTTTCACGCTCATATTCTC
TGGATAAATTCAGTTTTAGACCACATTTAGACCCATTGGTATGGATAAAA
TTCCGTTATATAAACTTAATTTTTGCCCACAAATAGGTGTGTGTTTGGTC
GTCAATCAGTTTTTCGGCATTTACATACGCGTCAGATTATATAGTCAAGA
TTATATAATTTTTCCTACCGGAAACACCTGATAAATCTGGAAGGAATTTG
ACCTCTGTTTTTCTATTTTTAGTAATACAAAGGGGTCAAATTCTAGTTTT
TTCGGGTGTTTCCGATAGGAAAAATGACGTGATCTTGACTTATGCATATC
AAAAATTGTTCTACAACTGGTGGGTCACATCAAAGGGCTTGAGGGCTGAG
GTATATTTGAGTAAATCGACAAAGCCCACCATGGTTGGGCAGCGAAGAAA
ATTTTTGAATTTTGTAGGGTTCAAAGTGCTATCTTAGGACCCATTTCAAT
TCAATTTGAAAAATAATTCATGTAAAAATCTTTCAAAAGTACAACGGGAG
TGCACCGACGGGAGAAATTTTCAATACACGGGTTTCGAATTAAATCTGGC
GCGAGAGAAAAAATCAAGTAAATAAAAGGAGCGATAAGGGGAAATGCCTT
ATAAAAGGTTGATAGATTTCCTTTCTTCTCTTTTGAAAGCCAGGTGTTCA
TTCAAAAGATGTTTTTCTATTTTAAATTCAATAAAAGAAATATGATTAAA
CGATTGACTTTTTATTTTAATGTTTTTTGTTTTCATAATGACCCATAAAG
TCTGTCAAAATGGAAAAATGGGCTAAAATTGCTTGATACACGGCCAATTT
TCGTTCTGTTTACTTGATATTTTTCGTGCAAATTTACATGGGATCAAAGC
TAAAGCTAAGCAAAAATTTAATTCGAAACCCGTGTATTTAGTATGGCTAG
AATCGCCCTCATTTACTCTTTTTTTTTTCCGAAATATGGTTTAAACATCA
CGAGGATTCTTTTGATCAATGCCAATCTGCTCAAAATTACAAAATTACAA
AATTCTGTTTGAGGCTTTGCTACAAATATATATTTTCCTTAAATAAAGGA
CCCGATCTCTTTGATGCATCTAAGAATAAGCATCTAAGAAAGAGTTAGTT
ACGGAGGAAGCGCAATCATGGTTTGCGCCGACGGGAGAAATTTTTGACTC
TCTCATAGCATTCAACTTTATTTTGAAGAATAGCTAGCAACTGCTAAAAG
CAATTGAAAGTTACAAGGATAAATGGCAGATGAATGAAACTATTTGCACC
GTTTCTTTTATGTTTTAAAATGAGATCTAATAATCTAACTCGACTTCACG
ATCACGCCGTTTTTTCAAAATTTCACGCCATCACGCCAACCACTGGGGGG
GGGGCTCTTGAATGTATTTTTGGTTGAAAAATTTGCTATTTTTAGCGGAT
AAGTTTGTGATTAAAAAATTGAATTTTTTTTCTACTCATGCTATAATGTT
CATTTTTAGACCAGTGGTAGTTAGTGAATTAATAAAGACAATAAGAACAT
TTTAGGCTCAAAATTGTCACAAAAATAAGCACAGCCCAGGCCTACCCCAA
ATTAAGAAGTTCTAAAAAAAAGTGTGTAGTGCGTCTGCAAAAATAATTTT
TTTAATGTTTTTTTTTTCAAACAGGTTGAAATGGTCCTTTATGTGTGCAT
TGGTGAATCTTGTATGATGAAATCTTACGTCATCCAACAACACGTGACTC
ATGACGTCACTTCCACTAATGACGTCATCGGAATTGAGCATCAAGTTGTG
GTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000051_pilon:1245230..1252585- >XLOC_038337 ID=XLOC_038337|Name=XLOC_038337|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2172bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000051_pilon:1245230..1252585- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTACATAGCGGCTGCTGGGACACATCAAATATGGTCTTATTTCTTGGA
AGATGGCTCATGGCTAAAGAAGGGATGTACATAGCGGCTGCTGGGACACA
TCAAATATGGTCTTATTTCTTGGAAGATGGCTCATGGCTAAAGAAGGGAT
CTCAGACGGAAAGGACTTGTATACGATTCGCGGGTAGTGGAAATGAAGAG
AACCGCAACAATAGTTATCCGCATAAAGCCTCATTTGCCCAACCGTCACA
TCTGTCATTAGGGAAGGTTAAAGGACAGAACGTCTTATTTGTTGCGGACA
GTGAAAGTAGCAGTGTAAGGACTGTGGAATTAAAGAGTGGAGCAGTCAAA
GCATGTGTTGGTGGTGAAAGAGACCCGATGATCTCAGACGGAAAGGACTT
GTATACGATTCGCGGGTAGTGGAAATGAAGAGAACCGCAACAATAGTTAT
CCGCATAAAGCCTCATTTGCCCAACCGTCACATCTGTCATTAGGGAAGGT
TAAAGGACAGAACGTCTTATTTGTTGCGGACAGTGAAAGTAGCAGTGTAA
GGACTGTGGAATTAAAGAGTGGAGCAGTCAAAGCATGTGTTGGTGGTGAA
AGAGACCCGATGAACTTGTTTGCATACGGTGACCAAGATGGAAAATCAGT
TGATGCCAAGCTTCAACATCCGTTAGCTGTGGTGTATGATCAACAAGATG
ATGTCGTTTATGTGGCTGACTCATACAATCACAAGAACTTGTTTGCATAC
GGTGACCAAGATGGAAAATCAGTTGATGCCAAGCTTCAACATCCGTTAGC
TGTGGTGTATGATCAACAAGATGATGTCGTTTATGTGGCTGACTCATACA
ATCACAAGATCAAGAAAATTGAAGCAAGCAAAAATACGTGCAGCACTTTA
ACAATACGTGGTGGAGTAGGCTCGACTGATGGCCAAATGCCTGAGTGTCA
ATTCAATGAACCGGGAGGTCTCGCCCTACACCCTAATAAACGCCTGCTTT
ATGTGGCGGACACTAATAATCATCGTATAAGAGTTATTGATTTGGAAAAG
AATACCTGCACAACGATCAAGAAAATTGAAGCAAGCAAAAATACGTGCAG
CACTTTAACAATACGTGGTGGAGTAGGCTCGACTGATGGCCAAATGCCTG
AGTGTCAATTCAATGAACCGGGAGGTCTCGCCCTACACCCTAATAAACGC
CTGCTTTATGTGGCGGACACTAATAATCATCGTATAAGAGTTATTGATTT
GGAAAAGAATACCTGCACAACGCTACCACTCATTGAGAGTGATTCCAAAG
ATTCGCCAGTTCCTTTAGAATTCAAAGCGTTGGTCAACATTCAACGAAAT
CCACCCACAGTACTGGAGAAAATCACCAGAGATTTGAGCAGTGTTGTATC
TGCACGTGTTCAACTTGTCTTTCCTGAACATTTGCATTTTACTGAAGGTG
TCAATAGCAAAGTTCAACTTAGTTTATCGGACATGGCTACCACTCATTGA
GAGTGATTCCAAAGATTCGCCAGTTCCTTTAGAATTCAAAGCGTTGGTCA
ACATTCAACGAAATCCACCCACAGTACTGGAGAAAATCACCAGAGATTTG
AGCAGTGTTGTATCTGCACGTGTTCAACTTGTCTTTCCTGAACATTTGCA
TTTTACTGAAGGTGTCAATAGCAAAGTTCAACTTAGTTTATCGGACATGG
ATGGTGAGGTCATCAGTTTCGAATCAGGAGAGATCGAACGAGAAAAGAAA
ACTTTCGGATGTAACCTATCAACCCATCACGCCAACAAAGACTTGTTATT
GAAGATGGTGAGGTCATCAGTTTCGAATCAGGAGAGATCGAACGAGAAAA
GAAAACTTTCGGATGTAACCTATCAACCCATCACGCCAACAAAGACTTGT
TATTGAAGGTTGAAATGGTCCTTTATGTGTGCATTGGTGAATCTTGTATG
ATGAAATCTTACGTCATCCAACAACACGTGACTCATGACGTCACTTCCAC
TAATGACGTCATCGGAATTGAGCATCAAGTTGTGGTTTGAGTTGAAATGG
TCCTTTATGTGTGCATTGGTGAATCTTGTATGATGAAATCTTACGTCATC
CAACAACACGTGACTCATGACGTCACTTCCACTAATGACGTCATCGGAAT
TGAGCATCAAGTTGTGGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000051_pilon | genome | sc0000051_pilon:1245230..1252585 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 955-1086:133 |
| Aaloc | 853-954:2519 |
| Aaloc | 637-849:3250 |
| Aaloc | 430-636:4246 |
| Aaloc | 307-429:5438 |
| Aaloc | 76-306:6383 |
| Aaloc | 1-72:7357 |
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