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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000336_pilon:200842..208122+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038312 ID=XLOC_038312|Name=XLOC_038312|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7281bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:200842..208122+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATATCGCTTTCACGATTCCGTATAATGGCGGAATAATTCCTTCCACTTT
CTTTTTAGTAGTTGGGTCAATTTTGTACGAAAAAGGAGCAACCATGGTTA
GTTTTATTCTAAGTTTATCCACTCCATCAGCGAATACTGTACTTCTTAAC
CTATCCACAAATTGAGACCTATCTTTCTTCTATATCAGAGTCACACAATT
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ACTATCCCATTTCAGTCTCTCGTACTTCCCGAAAAGTTCCAACATATCCT
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AAAGCTGATATTGACATGAACAAGAGAGCTGGAGAATTATCCGATGAAGA
GGTTGAAAGACTCATCACCATTATGCAGAACCCACGTCAATACAAAATCC
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TATACATTAAGCAGCAGTTAATGGTTAACTATTTGTTTGAGAAAGCAAGA
GTTACATAAAAATGGAGAAGCTGATAATCCCTTAGCTACAAAAACTGTTT
CAGAGCTGGTGAAATGATGTTTATGATGATTCGTGGATGTGACTGAATTT
ATGATATGGACAAATAACATTATTATTTCTTTTTCCATGGAAAGATTATT
CATTACCTAAGCTGTGTGGAAGTGGAAATAGAAATATTTGGAGAGTTGTC
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TTTTGCGATCAAACTGGTTAGAAATGAGATGAGAAGTGTTATTCTTTACA
GAGATTTCATCTGGCATGTGAATGATTGTGGCATTTTATCTGTGTCCCTT
GGAAAGTTGAATTATGCAAATTCCATATTGATATTGTTTGTCagatattt
tattttacatGAATCCCAACTatggaatgctttgtttggggaattattaT
GCGCATACCTTCCTACTTTACACCTGAAAGAATATGTGTCCCCTTAATCC
TGCTGTTGTTGagagaaaatcttcaaagacTCGGTTTCAGGCATCAAAAT
TACTTTTGCCAGGGATATTATAGTTTCCAACATAACTCAATCTATCTATG
AGTTCATTAATAAAGCTGGGGAAGTCAACAATTATTACCCCCAAATATAT
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ACCAGCTAAACCCCTTGTTTAGACAGCACTAGAATTTAGGTACCTTATCA
GCTACAAAATGAAACCCTCTCTGTTAGCTATCCAAGGATATTGGAATCAA
AAAATGACGTCTTTCAAAATAATACAGACTAGTTCTAGAAATAATTGCAC
GCCTAATCTGCACCTTtctacaatttttatttttttaaagcatCATAATA
ATACTAGGCTCAGATTTGGAAAGAATTTAAGCAAATGCTAAGCATTTTCA
GAGACTACATTTTGTggatttggctggaattttacagATGGTTCAATGGT
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CAATGATGATTCCTTTTAAACCATCTTTCGTTTGAAATGATAATGTAACC
ATTTATAATCTGAGGTTGTGtaaatttctttataatttgTAAGGGAATCG
AGGTCCTTTCTTTTTAATACTGGTATTCTGCTTTAAAATTCTGAATTGGA
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TGTCAGAAGCTTGTGCAAAAGGATTTTATTTACAATGATTGTTCCTTGGG
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AATttcattctagatttgaaggactCATCACAAGgcttccaaaaaaccaa
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Gttggttgcggacataactttttgttaaatttgatttaaaatcagcaata
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ttatagagactaaatcaatataaaaccaaaagatttggtttggtttgatt
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tctgataaaatacttcaatagttatgtccgcaacaaacaATTTGCTACAG
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TGATATGAggtgaaaaaactgaaatcttgccaatggaaaattatcagact
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tttttcaatgaaggacaactggtattttagtgttacttggtttggttctc
taatggatgggaagggttaaaaatcaaataactatAGATATTAACACTTC
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ACATCATAAAAGTGCGAATTATGGCGTCACTCAGCTCTAACttgatttct
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Accataaatttggattttactacttaaagttatgcatagcactccttatc
acacgcctaaagtactttttaggaGTGCGATtgattgaccacacgcctgg
aattttcaaatgacaaagcctGCTTTTACACTTAGGGAAAATCAACAATG
AAACCCATTGCAAAAGCAGCTGTCTTACTTATTCAGTGTGTCATCAGTTT
AATGATTAAAGGATCCTCACGAGTTTTAACCCAGTTACTATATTTGTCTC
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TTAACTGAAGGTAATGTCTCAGTCGGATTATAATAGGCTCCACTGAAAAG
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AGTATCTAAAATCTTGCGCAAAAACTGTATAGGTACTGACTGAGAGTTAT
TTGATGGCAAAGTGTCAATTCATGacctttttattatcaaaatagAGAAA
ATCGCCACTTAAACATCATTAAATAAATCCCTGCTCAGTACAGAAATTGG
CCATACTCGCTTGATAATCTTCGATGTACTAATTTAAGACTAAGAGCTTT
CAGATCCTATAATTGGTTTTGGCTTGAGATAGTTCGAAAAATTTCCACAT
AATTTGGGCTCTTGGTATTTAGCCTAGGTCTTCAATAAATATGGAGTTAG
AAAACAATTCTAGTTGAGAAGTTGCTAGTTGCTACTTTCGAGTTTCAGTT
GGGAAGTTGAATaattaccggctaccgaaaaagaataaacatacatcaaa
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TCATATGCTCATTTCCCTTAAACACGTGGGCTGAGAGCATGAAAAGCCAT
TTCCACCGTCAATTCAGATCCATTTATACTTCCTGCATCATattgagtat
aaatataattcttgttgtatttttgtaatgtcatcaaaatttttattaaa
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tagttcttataaaccatctctacgaattttttcgaggctaaaatgaccct
caAATCatatccttttatacaataagcatcacttgcagtatcaatatttt
tttgggaatttgtttgacaatcgttgtatttaaaggttttgtcaatattt
tacaaaaacgtgtcatgttgtcagcCAATGACGATGGCTTCCCATATCAA
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ATTTGAAAGCTCTCAAGGTTTTCTTAGTTTTCCAGACTGATAAGtgttca
aagaaaatttgagttaGCTGATTGTGACACaatctcttttttttattttt
agtctCCGTGTCCGTGGTCAACACACAAAAACAACTGGACGTAAAGGAAG
AACTGTTGGTGTATCCAagaaaaagaattaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000336_pilon:200842..208122+ >XLOC_038312 ID=XLOC_038312|Name=XLOC_038312|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1110bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:200842..208122+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATATCGCTTTCACGATTCCGTATAATGGCGGAATAATTCCTTCCACTTT
CTTTTTAGTAGTTGGGTCAATTTTGTACGAAAAAGGAGCAACCATGAATA
TCGCTTTCACGATTCCGTATAATGGCGGAATAATTCCTTCCACTTTCTTT
TTAGTAGTTGGGTCAATTTTGTACGAAAAAGGAGCAACCATGTCTCTCGT
ACTTCCCGAAAAGTTCCAACATATCCTTCGTGTTATGAACACGAATATCG
ATGGCAAAACCAAAATTATGTATGCCATGACAAGCATCAAAGGTGTTGGT
CGACGTTTCTCAAATATCTGCTTGAAGAAAGCTGATATTGACATGAACAA
GAGAGCTGGAGAATTATCCGATGAAGAGGTTGAAAGACTCATCACCATTA
TGCAGAACCCACGTCAATACAAAATCCCAGATTATTTCTTGAACAGAAAG
AAGGATATCAAAGATGGAAAATACTCTCAATCTCTCGTACTTCCCGAAAA
GTTCCAACATATCCTTCGTGTTATGAACACGAATATCGATGGCAAAACCA
AAATTATGTATGCCATGACAAGCATCAAAGGTGTTGGTCGACGTTTCTCA
AATATCTGCTTGAAGAAAGCTGATATTGACATGAACAAGAGAGCTGGAGA
ATTATCCGATGAAGAGGTTGAAAGACTCATCACCATTATGCAGAACCCAC
GTCAATACAAAATCCCAGATTATTTCTTGAACAGAAAGAAGGATATCAAA
GATGGAAAATACTCTCAAGTTTTGGCTAATGGATTGGACAACAAACTTCG
TGAGGATCTTGAACGATTGAAGAAAATTCGTGCCCACAGAGGTTTAAGAC
ATTACTGGGGGTTTTGGCTAATGGATTGGACAACAAACTTCGTGAGGATC
TTGAACGATTGAAGAAAATTCGTGCCCACAGAGGTTTAAGACATTACTGG
GGtctCCGTGTCCGTGGTCAACACACAAAAACAACTGGACGTAAAGGAAG
AACTGTTGGTGTATCCAagaaaaagaattaatctCCGTGTCCGTGGTCAA
CACACAAAAACAACTGGACGTAAAGGAAGAACTGTTGGTGTATCCAagaa
aaagaattaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000336_pilon | genome | sc0000336_pilon:200842..208122 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 478-555:7204 |
| Aaloc | 385-474:2021 |
| Aaloc | 97-384:266 |
| Aaloc | 1-96:1 |
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