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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000352_pilon:167776..176310- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038139 ID=XLOC_038139|Name=XLOC_038139|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8535bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000352_pilon:167776..176310- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAGACTGCCCAAAGATATGCGAAGAAAGTAAGTTACCAATATTCAC
CCCTCAAAGTTTACAGGGTATCTGGGGTTTAGAGTAGAGCACTGAAGATA
ATATTCTATTCAGGATATGCACCCCTGTGACATTTGCTGACATAACGTAA
CTTTTACAATAGCTGGTTGCTTGATTAAAAACATAATGGGCTCTTCCAGA
AAATGTTCGTACGTTCGTGCCTTGTCCGGGGGGGGGGGTAAACTTGCTCT
ATTTGAGGGTAATTTTGAGTGTCCTGTGGGTCAACTAATGCTTGTCCGGG
GGTTAGACCTGCTGTCCGAGGGGTCAAAAGTCACGATATCCGGGGGTAGA
TTTATTTCTAAAAAATGTTATATCCTCCACCCCCCCATATTCAAAATTTT
CTGGAAAAGCCCAATTTCATGAAGTCATTGCAGTGGTGCATATCATGGAT
AAACTTGTCTATCCTTGTCGGCGCGGTCGGACTTGTGACGAAAATACAAG
TGAAATTATCCTTGACGAATGTATCAAAAACACAAGTGTAGGAGTGCTCT
TGTGAAACATATACAAAAGATGCCCTTTCATTGAAGTGATAAAGTAATGT
CAATAAAGTTAAGATTAATTCGAATGCTAAAAATAGTTTGCACTCGACTG
TAGAGACTGCAGAGACTCTCTAAAATGTTTCTAGAGTTTTTGCGGGAATT
TCCTTAGAATTGAAAAAATGCCGTGCGCCGAGAATAAATCTTCCTTGTAA
ATTCATTACCAGTCCCCTAAAGAGCCGACCGCGCTTCTAAGGGTTGGTAG
GTGTATTTGATTCTGCATGATAATATTTCTTCTGACTTAGGCTTCAATTA
TTTCTCAGATACCCTTGTTATTGCACTCAACTATGCACAGCATGCTTACC
AGGACCATCACATACGTAACACAATGCACTTCACAAAAGTATAACACTTA
TCTATAAACTCTCACTCTTATAAAATTAGTTTCACCTCGAAATTGACTTA
AAAATGTGTCCCCAGCGGTTTAAGCGCTGACGTGATTTTTAGCGTGATGG
CATGATCTATGATTTAGAAAAGCGTGATACGTGATTGATGGGATGGGAGA
GTTTTTTTTTGGTGTATAAATGGCGTGATGAGAGAATTCTCGGCATGGCG
AAGTCAGTTTTGCCGTTTTGGCATGTCGGTAGACTCCTTTATAGACCTGA
TTAGAACTATATCCAAAAGAAGGTAGAGGAAGAGGTCAATTACATTCCAA
CCGCCTCGGCGGGTGCTAAGAAATTGGTCATGCGTAGCGGCACTCAAAAG
GTCTCTGCTAGTGGTATCCAGTCTAGCAAGAACACAATGTAACGTACCCC
TTCCTCTGGAGAGCGGTTAAAAAGGGTGTCCCGAAAAATAGGTCATATGT
CAAACTATGACTGCAAGTAGAAAATTTAATCATGTTTATAAGTTTATTGC
GTTTCTGTTTCATTGTAACAATTTAACTGTTAATTACAGTGCTGTGTGAG
TGAAACTAGACATACACACGCAAAAACTTTTCTACTTGTAGTTGTGTTCT
GACACGTGACTTTTTGTGAGTCACCCTGTAGTCTTCTTTTCGCGAAAACA
ATTAGATTGACTGCTTTATCATGTAAGAAATTTCAGTTTTCCTAACAAAA
CAAAATATATAGATTTTCTGTTCATCTCCATAATGGGAGCTTTGGGCAGA
ATTAGAAATAGGAAATTTTTCCTGGTTATTCCCCTTTCTAATAATAACTA
CTCATATTCGCCCAGTTTTGTTTAGGAGGTTTGGTCAACCAACCATCTCT
TATTAAAACCATTCAAAATTCGAAAACAATTTTATGTTCGTTTTTTGTCT
TGATTGGCAAGCGTCTTTTAATTTTGCTAAGGATTGTGAGCAGCTTGTAT
GAATGATCTTGCTCACTGCTACATTTCTAATACAGTTTTCACTTTAAACT
TTTCTTCAGCTACAAACATGGGTTTGATGGTATTTATCGTGTGGTAGTCG
AAGGTAAGGACCTTGGTTAATTTTGTCCATTGTTCCATCTCTTTAGATTT
AAATATGAAATGAATAATAACATTTTCAAATTACATATAGGTCTTTTACT
GTACCGGGTGCACCAAAATAAAGTATACAGGTTTGCCAAATTGTTTTGAG
TTTACGGATAAACATTTCCAGTTGATTCTCTTTTTATTGTACAGAAGAAA
GCCACTTAAATTTTGGTGTATAAAACTTCAATTTCAATTCAGTCCATCAA
AACAAAAGTTATGTTTAAAAAGCTGAAAATTTTGACCTACTCAAAATGTC
AAAATTGATTTGATTTTTTTTTGCTTGCTTGATAATTATGGTTGATGCTT
GATGATTATGAGTTTGTACATTAATTTTCGCGATTTTCGTTTGGTTGAAG
CTTGATGATTATGAGTTTGTACATTAAATTTTGCGATTTTCGTTTCTAGA
GTTGTTTGTACGTCTTAAGAATTTCTTTTCCTTTATAACTTTGAATATGG
GAATTTTTTACTTTCAGAAAGATTCCACACGTTATTTGCTGGTGTAACGA
TGACGGCAACGAGAGGTCTTTTCATGACTCTTGGACAGGTTTGGAGATTT
CTTAACCCAGCTGGCACACAACATTGTTTCAACGTTTTTCTAACAATCAC
AACGTCCATATAACGTTAGATGAACGTTGAAACAACGCTGTGTGCCAGCT
GGGAATACACCTATCAACCGTTAAAGGTTTTGTTTTTAAATAAGAGTGAT
ATCATTTGCTTACTCATCAATTTTAATTCACGAGCTTTTTTGCATTGGAT
TGGCATAGATGTGGAGCAAAATTGGCCAGAAAGAGGAAAAGAAAAACATT
TTTGCTTATATCAGCATAATATAACAATAGCAAGACACTGTCCTGATATG
AAATATGTGTCTGATATGAAACGGAAACACTTATGTACAAAAGAAAACCG
TTAACGGTGCGGTCGGCTTTTGAGAGGTCTGGTAATGAATTGACAAGGAA
ATGACGTCAGGTTTATCAAATGTGAGAATATGACCTTATCGGAGTTTTTG
ATTTTTCTAAAACAGCGATACATTGTGGGATTGTTTCAGGTGTATTACAA
TAGAGTTCCTTCGAGGGATTTTTAAGAGATTTCTATTGTAATACTCCCGA
AACATTCCCACACTGCATCACTTTTTAAGAAAAAATCAAAAACTCCGATA
AGATCTATTCTGAACTTGCACTTACATTTACTAACCCTTAACACCACGAA
TGAAGTCCACAGATATCTTAAATAAAGTACTAGATAGAGCTTTTCCAACC
CTATTTGAAGCAAAACAATTCGCCATCTTGAATGTAGTGACGTCACAAAT
TAGCTTGCGAGATCCTTGAAATTTTGAAGTTATTTAAATGTCAAAAAAGT
TTCAACAGTGAAAACCAAGATTTCTACTGTGACCTATTGTGACCTACTTT
CAGCAAAGATGGCGCATTGTTTTAGCTTCACCTGTCTTGGCTTGGAAAAG
ATAGAGTAGCTCTATCTAGTGTTTTATATAAGATATCTGTGGCCAAGTCT
CCTAGGAAGGAATGACTTCGAAAATCTTTACCTTTGAGAGGATATCAATG
CTACGACTTTTTGACGTCAATTCATAACATGAACTCTTTACAATTAAAGG
AACGTTTGTCCTGAACGTTTCACGTTTTCCCATCCAGGAGTTTCTGATCT
AGCACCTTCGAGGCTTTGAAATCAATGACGTACTGGCTAAAATATTTCAT
TTGCCTTCAACGAGTTTCCGTTTGATTTTCGTTCAAAAAGCAAACCTGAT
ACCTTAAGGGCTCTGACCATAGTCGGAAAATTGATTTTAGTATCTGAACA
TGAAAGTTATGTTTTAGATTCTTTAACACTTTTAACAAAGAATTGCCTTT
ATAAATTGCTTTTTAATCAAATACCTTAAGAGTAATTAAGAACTTAATTG
CAAAAATGACGTTATGAACTTTAAAAAGACGTTAATAATATGTTGCATCA
CCTTCTTTTATAAAAAGTGCTAAGTTTTAATGGGTAATTAACCTTTTTGT
TTCGAAGTTTTTTCAAACTGTCCGCAAAGAATTGAACTATTTTAAATTTT
GCGGAAAATTTTTCTAAAAAGATGTGTCAAAAGTTATGACTGTTTTTTTA
AGCAAAATCCAGATGAAAAATTGATGAAAATCCACTATTTTGAAGATTTT
GAGACAAAGAAGCATTTGCAAAAATTTTCCGCAAAATTTTTTATTGTTCG
GTAAAAGATACACCATCTACTGCGAAAATTTTTTCAAAATGTTTTTTTCT
TCGCCGAAACTAAGCTCTTCAAAGTTGAAATACTCTTCCTCGCAAAAGTC
TTCATTTTCTTCTTCATCAAATTTTTTCAATGCAATTTTTGAATTTTCAG
ATTCAAGAATAGTTTGTCTAACAGAAAATGTATAACATGCCATAGTTTTG
TTGGTTACACCAGTCAGAAAACACATTTTAAACACGGCAATTATGAAAAA
TTCACTATGGTCAGAGCCCTTAATGGTATTAAATTTCGCGTGTTACAAAA
TTTCGCGGGTACTTAATTTTACGATTTTTTAGGTCAAATTTCGCGAATTT
TAATACCGTTTAAATTTTTCAAAAATTTATTAAATATTAATTAAAAATTA
ATTAAATACACGCGAGAATTTTCAAAATACGCCGAAAATAGCGATTTTTT
TTGTGACACTTAAGGTCTACTTAGACTACACAATATATTGACGTACAATA
TTTGGCAATATCTTTTTCGGACCGTAATGTAAGACGTAAATAACATGTGC
TCGATTATAAAAAGTAATTTTATTTCTGTAAACGATCCCCCTGTATTGTT
AGAAAATTGCAAATCTAGCTGACAATATATTTTGGACACCTTTTCAATAT
GTTGCCGGCCGGCTCTCAGCAATATATCATCAATATATTGCCTGACAATA
TATTGTGTAGTGTATGTAGCCCTTTAGTTACTATTTTTGCCATTAGTTTT
GTTACTATTTTTGGTATGTTTACACCCAATACGTTGTGTTTCAAGCAAAA
TCAGTCATTTTCTTTCCGTATTCCCACTTTTTGAAAATGCCCGATTTAGT
GAATCGCGAAATTTAATACACGTGAAAATTTCCAGAAACTGGCAATCGCG
AAATTTAATACACGCGAATTTTAATACCATTAAGGTATTTTTCACGGGAT
GTCTACCTTGCTTTCCGCTTAGTAACCTTTTACTCCTCTTCTTCAATCAT
CAAACAGGTAGCAACTTATGACCAAACAAAACAGATACTCATTATGACAG
GGTAAGTTTTCTATATTTAGTGAAAAAATCTCGCGGAAGAATTTTTGACC
GTCACATTTCTACATAACTGCTCTCAAAAGTAAATTTTGACACATTTTAG
CCCTGATTGTACATGAATTAATTAAAACCTTGAGTAAAAAAAGTGTTTTA
GTGCGAAATATTTTAAAAGCTCGATTCACGAAAAAGGTTTTCTTGAAATT
TTTGAATATTAGAATAGTTTCATTGAAGACGAAGAAAATTCATTCTTTCT
AATACGATACTTGGGACTGTTTTTCGCTATTTTTTGTTGAAAGTAGGACC
CATATCTAAGTATCGTTGGGAAATGATTGCGTAAATCTAATTTATACCCT
TTTTTTTTCTCGCAGATACTTCAAAGATAATGTCCCTACGCATGTCCTTG
GTAGCTTTTTTGCAGTAAGCGAATTCCTCGATTCTCCCCATGTAGTTAAA
AGCCCGAAGAGCTACAATCCCCTAATTTATATCTGAAACATGCCCCCCCC
TTCCCCCCTTTCCCCCTTTCCCCCATTGTCAGCGTTGAGTTCTCTGCCAT
TTCCGGACTCAACACTGTTAGTGGCCTTGGGTCCGGGGGACGGATTTTTA
TCTTTCAATAATGTTTAGAATTCTTCTATCTCAAGATATTTGTTGGGGGA
TTGTAGAGTGGAATCAACCATTACTCTGTTAGCTGTCAGTTAAAAAGAAG
AGGAAGAAGAGGATTAAATATTGTATTGATGAATAATCTGGACAAAATTG
AAAAATAAATTTCTTAAGTATTATCAAGGGGGAGGGGGTGTTTAAGTTCC
CACCAACTCAGCAAATGAGTCGCTTAGACTGGATAATCTGATCCGAACAA
GCGGTAACCAACTGGAAGCTGAGAGTAAATATGATACTCTACTTCCGCTT
TCTGTATCCATAGTCATTATAAAAAACCCTGGTCTGGCAATGTATTGTTT
TAGCTTTCTGACTTTTGATCACGTTACCTAAATCTCCTCTTGGAATTGGT
CTATTTTCTAATCACATGATTAAAAAGTTTGCAAAATAAATCGATTTTGG
TACGTAAGCTCCATCTTTTAACGATAAAAGAGACAAAAGCCTTACAAAAA
GACCAGTGTTTTTTTGACTCTAACATAAGTAGAAGGGATGAACCACTGGG
GTCAGTTTCTCAATTCCGGCCAACCAAAATCGCTAGACAAACCTTTAACA
CTGATACGGCTTCCTTGCGGAAGAAACTATAATCAAAGATGGCAAATAAA
ACTTAGTCTAGGGTTTATGAAGGTCCCGGCTCCGCCTTGCCGACAGATGA
ATATTTATGTTTATTTGTTTCTAGGGAACGATAGCGACAAGTATCACACA
GCCGTTTGACGTCATCAAAACACGGATGATGAATGCTAAACCTGGTGAAT
ATCAGGTGGGTTTCCAGCTGGCACCACTACGTTATTAGTCAGCCCAGGTG
ACTCTTCAAATCGGTTCGACGATTTTTTTCCCGCTGGTCGTCGTCGTTAA
GACTTTAAGTTTTAATTCCGATTTCGGATTATTTTCGGGAAACAGGATTT
CGGAATTACTTAGCGCGCGAAAATAATTTTTTCTTAGTAAGATAAAATAG
GACGAGAAAAACACATAACATAAAAAGACGCGTATAATTAAGAATAAGAA
AAAAAGGAAAAATATTCTTTTTTGCGTCATATTCAATAGTTAATAAAAGA
TACTTTTGCATTGTAAATAAAGAAAGAGAACTAATTATAGAGAAAGTGAG
TATTAAAGAAATTACTTTTCTTTGAATAATGTTAAGTTGTATACTACTTG
TAGAAATTCTTCTATTTGTGTCTTTTATTTTATTGTCATGACAAGACACC
CCTCGAGTGTTTTTTATAATCTGATATCTCTGATATAAACTAGACAGGTT
CGAGCTGTGAGTCCAATTTTGGACTCACATTTTTAACAGTTGAACAAGCG
CAGGACTCACTCACTGAATAAAAATGAGTAAACGACTGGACCACAAAAAA
TCGCGCTTTTTTCTGAGGCAGTTTGAAAAGAGAAACTAAAACAAGCTTTC
ATTGGCTAATTCATCAACTGTCATTTTGAGGAGCGAAATTCAAATTCAAT
ACAGCAATGGTATTAATTTGTTTCACCGACTTCTGCTTTGGACGGATCCC
ACTATGCACCACTACTTTTTCGTCTGAACGTTTCAAGCAAATAGATACGC
TCTTTCAAGCTTTTCAGATTTTAACAAAGCTATATTTCTTATTTGTACTT
CTAAGCCTTCTAAGCCTTTTGGGCTGACTTTCCAGCGCAGCTGGTTTATT
TCAACGTTCATCTAATGATCACAACGTCCATATAACGTTAAATGAACGTT
GAAACAACGTTGCGTGTCAAGTGGATTGCTAACGGAACAGAAACCTCACC
AAAAACAAATCAAAGGAAAATATCATGCTACTGGGACTTAAATTTTCATC
CATAATTGTTTTTTTGCGCAGGGTATTTATCATTGTGCGAAAGACATATC
AAAAGATGGTATCTTCAAAGGATTGTACCGAGTAAGACTCACTTCATTTT
CTTATTCGAACTAATTTCAAACCATCTAGACGTGTTTTCATTTACGTCCA
CTTTATTTAGGGTGCGCTTTTCAATATATTCTGCGACTTTAATGGATTTC
GCTGTAACTCAAACAAGTAATTTCTATGTTAACAGCCTCAGAAATGTCGT
TTAAAAGCTCCATTGGTTTTTAACATAATATTCTTGATATGCATGAGTCG
TTTTCCTAATGGAAAAAAAACCCGAAAAAAGCCGGGATTTGACAAATGTT
TCATGGCCCCCGGCGTGACAATCGAATTGAGGGGGCCAAAAAAATATGTT
GCCCACCATGGTTGGGCGACGAAGAAACTTTTCACCCTTGTTTCACCCCT
CTAAACTGTATATATAAGATTTTTTAAAGTAAAAAAAGATTACTTTGGAA
AATATTTGGGGGGGGGGGGATGTGTTTGTTACTAAAAATAGAAACACGGT
GGCCGAAACCCGACTTTTTCTGGTGCGTCCGTTAGGAAATATGACATCAA
AAATAACCGTTAAATTGTTTTGAGACCAAAATTTGAATACTAACAGAATA
ATAAAAACTGATTAATTTTTGATATTTATTCAACAGGGTTTTGTACCACG
CTGGATCCGCCTTGGTCCGCACACCATCCTAACATGGGTATTTCTTGAAC
AGTTACGTAAAGCGTTTCCTTTGAAAAACGATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000352_pilon:167776..176310- >XLOC_038139 ID=XLOC_038139|Name=XLOC_038139|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1118bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000352_pilon:167776..176310- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAGACTGCCCAAAGATATGCGAAGAAAATGTCAGACTGCCCAAAGA
TATGCGAAGAAAATACCCTTGTTATTGCACTCAACTATGCACAGCATGCT
TACCAGGACCATCACATACGTAACACAATGCACTTCACAAAAATACCCTT
GTTATTGCACTCAACTATGCACAGCATGCTTACCAGGACCATCACATACG
TAACACAATGCACTTCACAAAACTACAAACATGGGTTTGATGGTATTTAT
CGTGTGGTAGTCGAAGCTACAAACATGGGTTTGATGGTATTTATCGTGTG
GTAGTCGAAGAAAGATTCCACACGTTATTTGCTGGTGTAACGATGACGGC
AACGAGAGGTCTTTTCATGACTCTTGGACAGAAAGATTCCACACGTTATT
TGCTGGTGTAACGATGACGGCAACGAGAGGTCTTTTCATGACTCTTGGAC
AGGTAGCAACTTATGACCAAACAAAACAGATACTCATTATGACAGGGTAG
CAACTTATGACCAAACAAAACAGATACTCATTATGACAGGATACTTCAAA
GATAATGTCCCTACGCATGTCCTTGGTAGCTTTTTTGCAATACTTCAAAG
ATAATGTCCCTACGCATGTCCTTGGTAGCTTTTTTGCAGGAACGATAGCG
ACAAGTATCACACAGCCGTTTGACGTCATCAAAACACGGATGATGAATGC
TAAACCTGGTGAATATCAGGGAACGATAGCGACAAGTATCACACAGCCGT
TTGACGTCATCAAAACACGGATGATGAATGCTAAACCTGGTGAATATCAG
GGTATTTATCATTGTGCGAAAGACATATCAAAAGATGGTATCTTCAAAGG
ATTGTACCGAGGTATTTATCATTGTGCGAAAGACATATCAAAAGATGGTA
TCTTCAAAGGATTGTACCGAGGTTTTGTACCACGCTGGATCCGCCTTGGT
CCGCACACCATCCTAACATGGGTATTTCTTGAACAGTTACGTAAAGCGTT
TCCTTTGAAAAACGATTGAGGTTTTGTACCACGCTGGATCCGCCTTGGTC
CGCACACCATCCTAACATGGGTATTTCTTGAACAGTTACGTAAAGCGTTT
CCTTTGAAAAACGATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000352_pilon | genome | sc0000352_pilon:167776..176310 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 460-558:100 |
| Aaloc | 400-459:765 |
| Aaloc | 319-399:1912 |
| Aaloc | 271-318:2870 |
| Aaloc | 226-267:3279 |
| Aaloc | 157-225:6017 |
| Aaloc | 112-153:6576 |
| Aaloc | 91-108:7618 |
| Aaloc | 34-90:7676 |
| Aaloc | 1-30:8536 |
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