XLOC_038138 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038138
Unique NameXLOC_038138
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000352_pilon:199640..211272-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038138 ID=XLOC_038138|Name=XLOC_038138|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11633bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000352_pilon:199640..211272- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTCACGGTCAGGATTTTGACACCACCCTTTTAGTACACTCTAACTTTCTT CCACAGCCGGAGCTTTGATACCACCCTTTTAGTACACTGTACTGACGTTT TTCCACAACTAGATTTTTATTACCACGCTTTCAGTACACTGTACTGACTT CTCCATGACATGATTTTTTATACTACCCTATTAGTACACTGTACTAGCTG TTTTTTCGATCAGATAAGTTTTGAAACCACCCCTTATAGTGCACTGTTCT AATTTCTTCTTAGCCAGATAAGTTTAATTGCCACCATATACAAAGGTTTT TAAGTATTTTGCTAAGAAAAGCACCAAATTATATAAAAGGAAAGATTTGA ATATTAAAATACTTGAATCTTTATATAGTACAAACACTGAAACAATGAAA CAGACAAAGCAAAGTCAATCAAATACAGTGAAACTAGCTGAAATTAGCAC GTCAAAACACTCAAAACCAACTTTGAGTTATTTCCCTTCTTGTGACTTGT TTCTGGTTGTCTGGCAAGCTGTAGCAGTTTTTCTTTTTAGAAAAATAAAA ATAAAAGACTTAATAACATTGTACACAAACTGAAATGGAAAATCTTTTAT CAAATGTAATATTATACAAAATATATAAAAAGGTGCTTTCCGGGGGGGGG GGGCACTCCAGGTAAGTGACCTACCGGACGTGCGGCCCTTAAGGGTAGGT TTTTTGGACTTTGGAAAGTGCACTGTAAGGGTGTAAAATTTTATAAAATA CCAAATTAGGTCAAATTTGAGAAATTTCAAAACATTTTGCCCTGAAAAGG GCAAAAAATTTGTAAAAATTACACTATAAGGGTCGATCTTCAGCCAAATT TTCCTGCACTGTAAGGGACCGATTTTAGAGACCTGATTTTTGGCCGAATG TACGGTCGTTTTCACCCCCTCCCCCCCCGGTGATTTCACTTATATACAGA 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TTAATTTACGTTGTGTTAGAATGAGAAAAACTTGTTTTCATTTTCAGGAG TCTAAAGTGTGGTACATAATATAAGTGATTAATAAGAGGAATGTTCTTTG AATAAAAAAATCCACAGATTTTGTTTAGTGTCCCTTGTATGCAGTATCCT ATGCATAGAAACTTCTTGCATTTTTACTGATTGCCAATTTAGGGGGGGGG TTGGTTCCCCCTTTTTCAGAAAAATCGGGATTTTCAAGTTGGTATCGATA CCAATTTAGGGGGGTGGGTCCCCCCTTTTTTAGAAAATTGGGGTTTTCAA GTTGGTATTGATACCAATTTAGGGGGTGGTGGTGTCTGCTACTTTCAAAT CTCGAAAAGTCAGGTTTTTGGGCCCTGGGTTGGTATCCTGGACCTTGACC CCCCCTGCAATGTACTCACTTCTCAGTGTGTATCAATACTAACTTTTTCA TTGTATTTTTCTCAGAGGACCACCCTTTTCGTACAATGTACTAACTTTTT CATTGTAATTTTCTCAGAGGACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACTTT TTCATTGTATTTTTCTCAGAGGACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAACT TTTTCATTGTATTTTTCTCAGAGGACCACCCTTTTAGTACACTGTACTAA CTCAATTTAATCTAAAAAATACACCACCCCACCAGCTATGGGCCAGTACA CTGACTCGATACCCCCCCCCCCTGGGGAAACTAAAAAACTGAAAAGCCAT AGGGGGAAAAAAAGAGGGGGAAGATTTACAAAAATCAAGAAGTTGGTGGG GGAACAAACCCTGGAGGACACTATGAAGACTTGCATCAGTGGATGCTAAC ATGCATAGCCCTCAAATGAATGACCTGGCTGGTCATTAAATTACAAAGTT AAATAAAAACAAACCTGATTTACAAAATTTGCGGGTGGTAAAATGTATAT CTCCTAATTATAAGTGATGTCATGCATAATTACGTTTCATATAATATATC TCTTATCTAGAGTACAATCCCCGCTTCTTAAATAAATTGAACTTCTGCAA ACCAATTAAACAATGATTAAGCTGTCTCTATCTTTACCAAATCCCACGTT TGACAAATTGAAATGCATTCGTCAAACATGGTCTAATCGATTAATGATCA ATGGATGTTTTGTGTCTATTATCAATCGAGACACCTATTTTGTCCATACC GTCATTCCTGGAAAGTGCTGCATGACTTTATATTTCAGCATTTTATATAT ATTGAAATGAATGCAATATTCTCTACTGATTTTTTCCTTTGAGAGAGCCT CTTAAACACTTTTTCGCTCTGTTATTTGATTTTTAGCATAAAAAAGGGCC TGTAAGACGAAGTATTCAGACTTTGAACTTTTAATTTTTTTTGTTCCTTA ATTGGAATCCCAATTGAATTTTTGAAATACGATTCTAAGAACTTTTCAAA TAGGCAAACTTTGACATTGGATCAATAATAATTGATTGAAAATTGATAAG AGATGCTAAGGTGATTTAATTAGCTAACGATTAATATCGATTATCCATCG AATTAAATAAATGATCGGTTTTATCAATTAAGACCATCTGGAAGAAGTTG CTCACTTTCATGGCATCCTCCAGCTTTTTGGTCCCCCCCCTAATATGAGC TAAAATTCCCCATCTGGCCTTTCCCCCCACCTGTTTTTAAAATTCGTGCT CCCCCCAATTGGGCTATCCCCCTAGCCGTATTGTATAAGGGTTGCGAAGT GATGATCCAGACTCGCCTCAATTCGCAAGCTACTATAGCAAAAAAAAGAC TCTCAAAATCCCTAGAAAGACAGGCTCATAACAAGCCTGAATGCCCAAAC ACACCAGGAAGGTCTGTATTTATCCTATTACTCCCCCCACTAGGTAGAGG ACTGAATATAACCCCTATTCGCCTTTCTCCCCTCATCAAGCTTGAAATTT TCACTTCCCCCCTGGCACCAAAATCTGATTCCCCCCCATCTTCCTGGGGG GGATGATCCCATGACTTTCCCGTGGAAATAATATATGTTTTTCAGTTTTT TGGGACCCTTGGGGCATAAGCTACCCTCGCGACCCTATGACATCACAGAT TTTTGAAAAACGTGAAAATGGGATATCTCGAGTCGAGTTTGAAAATTGGG AAGTCGTTGACCCCTCATTGGATGAAGGATATGAGATGGCTTTAATTAAA GTGACTTTGAAATCTAGCTATAAAATTTTTGGGCGTTTTCACTTGGTGTC ATCAAAATAGTCTCGAGATTGGAAAGGAGTTGGAAGATAATTTGACCCCC TATTCAATCAGAAATTTTAAGGAGAAAAGGTCAGGGTAGACTGCGCGCAT TCTCGGAGTTGATTTTGATATAGAAAATACCTAACATGTATGAAATTCTT GTTCGAGAGTTACCCCAAATTTGGGGTAACAAAAGGTTGCATGAGCTTAT AATTTTGTCACATCAAATCAAAGAAAGAAAAAAGTCATTGTGTTGTTGCT TTCATAATTATAAGTCTTTATTCATTGAACAAAGAAAAAAAGAAGTCATT GTATTGCTATGACACATAATCAAAAAAGAAAAAAGAAAAGACAGGGGTTA GTTGGGACAGAAATATTATAGACAATATATATCCCCTATATGAGATATAT ACATATTCAGCGTATCCCGTTTAGGCTAGATCCTTCTGTCAAAATATCAG TTCAATTAATTGATTGGATCCAATTGATTGAGTCTGGTCTGGCAATTTTT TATCCTTTTATATCTTGCAGGTTAAAACTAAGACTTATTTACAATTGTCA TTTTCTATTTGAAGAAAGTTTTACTTTTGTCTTTTGTTTACAGGAGGAAG CTAAAAGTCTTGGTGTTGACGAGCCAGAAGCAGTAATACAAGGACCACCA CCCTCAGCCACTCAAAGGAGGCGTAGAGGTGCTGTCAGTGCAGCTGTCAT CTCAGAAGAAGATGCCGCTTCTTATGTTAAAAAGGTTTGGAAAGAATTTA ATATTTGATTGAGTCTAAGATCAGCTAGAGTTGTGTAGTTAACTTATTAC CTTAAGCTTTCCCTCAATTTTGACAAAAGTTAGTAGGAAATCAATTTGGG GCTTTCCTTTGATGTCAGTGCAATGTCCTCCTTCTATCTTTTCAATCAAA GGATTCAAACTGGCAACTCTCTGTTGATTTTCTAGGCTGTCCAAATTAGG TCCTTCGAGGTCTATTTCATCACTCAATAGGTAGCTCTCAAATTGATATT GATTTTAAGGTCCTCTCTTTTTTGTAGCCTCTCTTTTTTTATATATATGG TGAAGATCAGAGATCTGACCTCAAGGAGAGAAAGTGTTGAAAATACTAAA TAAAATAAAGATGAAACATAAAAAGGCACTAATATTTTTATAATTATATG TTTTTTTCCATTTTTTTGAATTTTTGTAAATATATAAATCAAACCAATCA AACATCCTGTCAAGAAATGAGTTTTAAAAATCAATCTTTTCAGCTATGCT CGCTTGCCTGAGATGCACTAATGAAGGAAGGACAAGAACATGTCTTGGAT AGAAAATTATCATTTAATAAACTTTTTCAAATATTGAATTTAGGTCATTC CCAAAGATTACAAAACCATGGCAGCTTTATCAAAAGCCATTGAGAAGAAT GTCTTGTTTTCACACTTAGACGATTCCGAACGAAGGTAAACAGACACTCG ATTATCCACTTTCCTTGTTGTAGTTTTTTATCTGACCATCTTTAACTCAA CCCTTTATAGCTCGAATGTCTCTTTAAACTCGAAGTTTTCTCGTCTCTCA AGTTAAGATAACAATGCCTTATAAACCTTACTCCATAACTCAAAACTCCT TTAATTTGAACAAATTTGTGTTCCTGGTACGTGTTAGAGTTATAGAAACT CCACTGTATTGGTTGTTTTCTTCAACAGTGATATTTTCGATGCAATGTTT ATGGTAAAGCACAGCGAAGGAGAGGTCATCATTAACCAAGGAGATGAAGG AGATAACTTCTATATCATTGACCATGGTGATGTTGAGGTATGAAAGATTT GTTCTCCTCCCCTCTTTTTATATTCTCCACTCTTGGTAGTTTTCTTTTGT TTTTAGGGTCAATTTGTCATATAGAGATTTTTTATGTTTGGTTTCATAAT TTCTGCGGCAAACGTTTGAATCTGTGGAGGCGATCCCTTTCGTGCATCGA ACGTTCTCTTCCATAATGGCGGAAGTTATGTAACTTGAAAAAACCCTCCT AATATGAAATATTGGGTTTGTTTTCTGTCCCAACTGCTACTCAATAAATC TTGGTCTCTTGAGATATTGCACCCAGGTGCACTAAAACTGTACTAAAGAA TCTGTACTAAAACTCAAATTTCGGTTTTATGAACGACCTTAGAATAAGTC CAAAAGTTTTAAATATCCAAACTGTTTCCTTTACATTTCTGCTCTTGCTA TAAATATAAAAAAGTTCTTCTCAATTTTTATCCCTTATATTTTTAAGGTT TACGTAAACGATCAACTTGTTGTGAGTATTTCTCCTGGAGGAAGTTTCGG TGAATTAGCTCTCATCTATGGGACACCTCGAGCTGCTACTGTTAAGGTAT CAGTCACTTTTTGATTTACCTACATAGATGTTCTGGTGCGCTAGGTTTTT AGACTTTAGTTTACTAGATATATTCAGTTTTTCTGCTTGTTTCAGTCTAA TTTCGATATTCCTTTTTATGAAGTTTTGATGTTACTTGGGCCTATCTTTT CCAAATTGCTATTGAAACCTGAATTAGAACATCTTTCTTTTCTGTCTGGA GTTTTTTGGATAATAGCCTTTTGTTTCATCGTCAGAGGTGGGTACTTAGT TCAAGATTTCTGTTTCATTATTAGACTTTGCAGAATTCAAACCACATAAT TATCTTCTCTTTAGGCAAAAACAGACGTCAAATTATGGGCAATCGATCGA GTGACATACCGTCGTATTTTGATGGGTAGCACAATGCGAAAACGAAAGAT GTACGAGCAGTTCTTGGAGAAAGTTTCCATCTTGGAATCTCTGGACAAAT GGGAAAGATTGACAGTGTGCGATGCATTGGAACCATGTAGTTTTGACGAC GGCGAAGAGATTGTGATTCAAGGACAACCTGGGGATGATTTCTTCATCAT TGTCGAGGTAGATTGCTTTAATCTTTTACTCATTCATTCACTTGTAATTT TGAGGGTTTTAATTCTTATACTTCAGTGTTAAGAGTTGTCTCAGCTAAGT ATATAAAAAGGCTTTTCCATCTCAAAATTCTCTATAATTCACTAATTTAT GTGATGTTCGTGCTGTGTTTTTCTTGGCGAACAACCAGTCAACTAAACAC TGACATTGCTCTTCATTTTCAGGGCACGGCGACTGTCTTGCAACGACGTA CAGAAACGGACGATCCAATTGAAGTCAGCCGACTCGGCCTCTCCGACTAT TTCGGTAGGATGTTTTTTCCTTCTTTCTAATGAGATTTTTTGGTTGCTTC TTTGAAGAATATTTTTGTGTAAATTTATTTGTAAACCTCTGGACACCTGT ATCACCCCCTGAAATAAGCACCTAATTGACTCATTTAACATTGCAACCCC TAGGGCAGTAAATCTTAAGGCTTTTCAATACTCCAAAACAAGATGTCATC CTAACCTTTTTTTAAAATTTGCTTTCTTAAAGTCCCGTTTTTCAAAATGA TAATTTTTGACAGAAAATTTGATTTTTCATCGATTGATCCTCAACTTTTT TGATTCTCAGGTGAAATTGCTTTGGTTCTAAACCGACCCCGTGCGGCCAC AGTCGTTGCACAGGGCCAATTGAAATGCGTCAAACTGGATCGTCAACGTT TTGAACGTGTCCTGGGCCCTTGTGTCGATATTCTGCGTCGAAACATTCAA CAGTACAACAGTTTTGTGTCGTTGGTAGTGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000352_pilon:199640..211272-

>XLOC_038138 ID=XLOC_038138|Name=XLOC_038138|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2214bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000352_pilon:199640..211272- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGTCGGACCAAGAGACAGATGCTGAAATGATCAAAGAATGTGAAGA
TTATGTCAGCAAACACAACATTCAAGTTCTCTTAAAAGATGCTATTGTAC
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TTTGAGAAGCTAGAAAAGATGGCGTCGGACCAAGAGACAGATGCTGAAAT
GATCAAAGAATGTGAAGATTATGTCAGCAAACACAACATTCAAGTTCTCT
TAAAAGATGCTATTGTACAAATTTGTATCAACAAACCAGATAAACCATAT
AAATTTCTCAGGGAACACTTTGAGAAGCTAGAAAAGGAGGAAGCTAAAAG
TCTTGGTGTTGACGAGCCAGAAGCAGTAATACAAGGACCACCACCCTCAG
CCACTCAAAGGAGGCGTAGAGGTGCTGTCAGTGCAGCTGTCATCTCAGAA
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TGACGAGCCAGAAGCAGTAATACAAGGACCACCACCCTCAGCCACTCAAA
GGAGGCGTAGAGGTGCTGTCAGTGCAGCTGTCATCTCAGAAGAAGATGCC
GCTTCTTATGTTAAAAAGGTCATTCCCAAAGATTACAAAACCATGGCAGC
TTTATCAAAAGCCATTGAGAAGAATGTCTTGTTTTCACACTTAGACGATT
CCGAACGAAGGTCATTCCCAAAGATTACAAAACCATGGCAGCTTTATCAA
AAGCCATTGAGAAGAATGTCTTGTTTTCACACTTAGACGATTCCGAACGA
AGTGATATTTTCGATGCAATGTTTATGGTAAAGCACAGCGAAGGAGAGGT
CATCATTAACCAAGGAGATGAAGGAGATAACTTCTATATCATTGACCATG
GTGATGTTGAGTGATATTTTCGATGCAATGTTTATGGTAAAGCACAGCGA
AGGAGAGGTCATCATTAACCAAGGAGATGAAGGAGATAACTTCTATATCA
TTGACCATGGTGATGTTGAGGTTTACGTAAACGATCAACTTGTTGTGAGT
ATTTCTCCTGGAGGAAGTTTCGGTGAATTAGCTCTCATCTATGGGACACC
TCGAGCTGCTACTGTTAAGGTTTACGTAAACGATCAACTTGTTGTGAGTA
TTTCTCCTGGAGGAAGTTTCGGTGAATTAGCTCTCATCTATGGGACACCT
CGAGCTGCTACTGTTAAGGCAAAAACAGACGTCAAATTATGGGCAATCGA
TCGAGTGACATACCGTCGTATTTTGATGGGTAGCACAATGCGAAAACGAA
AGATGTACGAGCAGTTCTTGGAGAAAGTTTCCATCTTGGAATCTCTGGAC
AAATGGGAAAGATTGACAGTGTGCGATGCATTGGAACCATGTAGTTTTGA
CGACGGCGAAGAGATTGTGATTCAAGGACAACCTGGGGATGATTTCTTCA
TCATTGTCGAGGCAAAAACAGACGTCAAATTATGGGCAATCGATCGAGTG
ACATACCGTCGTATTTTGATGGGTAGCACAATGCGAAAACGAAAGATGTA
CGAGCAGTTCTTGGAGAAAGTTTCCATCTTGGAATCTCTGGACAAATGGG
AAAGATTGACAGTGTGCGATGCATTGGAACCATGTAGTTTTGACGACGGC
GAAGAGATTGTGATTCAAGGACAACCTGGGGATGATTTCTTCATCATTGT
CGAGGGCACGGCGACTGTCTTGCAACGACGTACAGAAACGGACGATCCAA
TTGAAGTCAGCCGACTCGGCCTCTCCGACTATTTCGGGCACGGCGACTGT
CTTGCAACGACGTACAGAAACGGACGATCCAATTGAAGTCAGCCGACTCG
GCCTCTCCGACTATTTCGGTGAAATTGCTTTGGTTCTAAACCGACCCCGT
GCGGCCACAGTCGTTGCACAGGGCCAATTGAAATGCGTCAAACTGGATCG
TCAACGTTTTGAACGTGTCCTGGGCCCTTGTGTCGATATTCTGCGTCGAA
ACATTCAACAGTACAACAGTTTTGTGTCGTTGGTAGTGTAAGTGAAATTG
CTTTGGTTCTAAACCGACCCCGTGCGGCCACAGTCGTTGCACAGGGCCAA
TTGAAATGCGTCAAACTGGATCGTCAACGTTTTGAACGTGTCCTGGGCCC
TTGTGTCGATATTCTGCGTCGAAACATTCAACAGTACAACAGTTTTGTGT
CGTTGGTAGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038138XLOC_038138-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000352_pilongenomesc0000352_pilon:199640..211272 -
Properties
Property NameValue
Aaloc937-1107:172
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