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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000053_pilon:1713931..1718528- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038133 ID=XLOC_038133|Name=XLOC_038133|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000053_pilon:1713931..1718528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACATCACAGAATATTTGGAGGAAAATGTAGAAACTCGTATTTTTCA
ATCACCTATCCCAGAAAGTTGTAAAAACAGTCCTTGCTGTCTAGGGATAG
ATGAAGCTGGAAGAGGACCTGTTTTAGGTAAGAAAGTTTTTAATACACTT
TTTAATACTGGCAGACATTGAAGATAAGGAAAGTAGAGTGATCTTGCTTT
TACAGTTAAACAATTTAAAATGTATAATAATAATATCATTGTTATTTATA
CAAATAAACGAAATATAATTTGATTTTGATTATTGTATGATATGATGTTA
TAGGCCCAATTAAGATCTAATGAGCTTAGATAAAGAAAAGTATGAAAAGT
TTTCAAAGTTCCTTTCAAAATAATCTTTTGTCTTTAGGTCCGATGGTTTA
TGGCATTTGTTACTGTCCAATATCTTTTATGGAAGAATTGAAAGAACTAG
GATTCGCGGGTTGGTATTTCAAATTTTAATGAAAAATGCTCAGTTTGATA
CAATTCTTTCAATGTTAAAAACTATATATGATAAACTGTACCGAGTGCGC
CACAAAAAAGTTTCTCTCTTTAAAAAGTTTTTTTGTCGAAATCTGAAAAT
TTTAAAAGAACCATACCTATTCCGTTTGTGAGAAGAAAGATAAACTCAAA
TTTTGATGGGTCATTATTTGAATTTGGTTAATTAGATGTTCTATAATATG
CTCTATTGAATAAAAAAATAACTTTCTGAAAGTGGTCAAAAACGTTAAAA
ATCGACCTATCAAATTAAACAGAAGCATAATTACATGACGCATCATTATT
TTCGTTTCAGCCATTAAAAATGATAATTAGCTGCCTAAATGACCTTTTAT
TTTATAAAGGAAGGTTGAATTTCAATAAAAAGAAGAAAATTCGTAGAAAA
AGGCCAAAAAATCTGGTAAAATTCATAAAACTACATCAAATATGGGTTTC
GAGGAACATCCATCATTACAAAGTCTTTATCCAGTCTAGAACCAAAAATA
TAAGGAAAATATGATTTCGGTATAATTAAATTAAGTGATTTTGATGAAGA
TTTTAAACCCTTTTGACCCATCAGTTTCAAAATTTATGTATTTAATTATT
GAAAAATGCTTTTAATCACGTAAAGGCTATTGCGATTGCCAATTTTAAAA
TAAAAATTTGATAGATCGATTTTTAACGTTTTCGAGCACTTTCTGAAAGT
AAATTTTTTGTTCAATTGAGCATAACTTTTGATCTAATGAATCGAATTTG
ATAAATGACCCATCAAAATTTAAGTTTATCTTACTTCTTTGCAATGAAAT
AGGAATGGTTCTTTTAAAATTTTTAGATTTTGAGAAAATTAGTTTCAAAG
AGAGAAACTTTTTTATGGCGCACCCGGTAGAAATGTATCAACTTTTAGTT
TTAGAGTTGGAACTAATCCCTTTTCATGAAATTTGAAAGAATTGTTAACT
TTATGTTTTTAAAATTTACATTGTCTTACTTTGACAGACTCCAAAACATT
GAAAAAAGAAGACAGAGATAAACTTTTATCAGTAATTGAGCAAAACATTG
AAAACATTGGATGGGCTATCAAAATTATATCACCAACCTCACTGTCAAAT
GATATGCTGAGAAGGTATATTTTAGAACCTTTCTATAACATGCATTGCTT
AGTTACTGTGAAATTCATGAGACTTTTCTGCTTTTCTAGGAGATATTTTG
AGATGATTATGTATGATATTTACATTTTTGTTGAGTGTGACCAAGGCGTA
AACACTTGCTGGTCAAAATAAAATTAATGCTTCCTTTTTAGTATCAGCCT
AACATAGAAACACTAAATCTTTATTTTTGATTTTGTACCTTCAGCACAAA
AATCAGTTTGAATGAGATTTCACACAATGCAGCAATTGAATTGACCAAAG
TTACAATTAAAGACGGAGCTGACATCAAGGAGGTATGGAGCGGAGACATT
GTTTTTAAACATCCCCTTGGATTAAATCCCCTATGGTAAATGAGTCACAT
TGCTCTCTTTGTTCTCTATTTATTCAAGATAATTGGGATAATGATAAGAT
AGATATTTGTATAGTAAGAGTCCTTGACCCTTAATGATTTACTATTTGTC
CTGTTCAGAGGCAATTTCCCAAAATATTTTTTTCATCCGTATTTTCAAAG
GAAAATATTCTTTTGTATTTAGAAAAACTTTAGTTCCTGTATTTTTGAAG
GAAAATGGGTTTTTATTATGATATACATGTTACAGCACTCTTTGGTCTAT
TCACTTATTCATGTAAAAGATCAGAGATGCAATTGAACATTTCATTGATG
ATTTTTTTAAAGTGATCCAGATTAATTTTACATTAGGCAATTTATATGTT
GAATTCTCAAGGAAGTCAACATCAGTTTCTCATTTTTACCAAATGAAATA
TCAAATAATGAAAATAGCAAAAAATTGCTTTAGTTAGTTTTCTTGGTTTA
TATAAAAAATTGTCTGATGTGATTTTCTTGGAAAATGCAAGAATTAGCTT
AAGGTTGTTTTCCTTGCCTACTACAGGTAATGAATGGTAAGGAAATATAT
TTATCTAATTTTCCTTGGAAAATACAAGAAATTGCTCAAGATAATTTTCC
TTGGAAAATACAAGAAATTCCTTAAGATAATTTTCCTTGGAAAATACAAG
AAATTGCTCAAGATGATTTTCCTTGGGAAATACAAGAAATTGCTCAAGAT
GATTTTCCTTGGGAAATACAAGAAATTATTTTAAGTAATTTTCCCTGGAA
AATACAACAAATTTGTTTTAGTTTATTTCCCACAAAAATGTTAAGTTGGA
AATTTTTCACTACATAATTTTCCTTGGAAAATACAGGAAAGTGTTTTAAT
TAATGCTTCATTCAATATACAAGAAAATATTTTTGTTCAGGCTGGACTTT
GAAATGTTGGTTTGCTGTAACCCTACGTGGAAACATGTTGACCAAAAAAA
TTTACTATAATTATATTTACAATAACTATTGTTATGTAATGTTCAGGGTG
GAAATTTTTGAAAGTGAGACTAATACAGCAGAATCAGGGCAAAAAAATTC
GAAATTGATTGATCAGCGGATCCCCCCCGGGGAATTATTGTTAGGTAGTT
ATACTTAGGGGCTTATTAGGTGCCCAAAAGTAAAATTAAAAAATACATTT
AATGTCTCAAAAATGACAGCAGTAAAGGAAGCTTGATTATCATCGTAAAG
AAGAGTCTTTTCGGACGACGAGGGCTAGTTTTGATTATGAATATTTCTAT
TTCTTTATTTCAATAGATGTATGTTGACACAGTTGGCCCAGCTCAAAAAT
ATCAGGACAAATTATCAGAAATTTTCAAATCAATAAATGTTACTGTGACA
CCAAAAGCTGATTCCAAGTTCCCAATTGTCAGTGCTGCTAGTATTTGTGC
TAAGGTATGATCAGCCCCAAACCAAACTAAATGATTATAAGTCCACTTTT
TTACATTTTCGACAAAGTTAAGATGATGCTAGTACTTGTATGATTAAGTT
TAATATTTATATTTCTTTTCGAATTTAGTATTTTAGACAAAATTCTTGTG
TACAAAAAATTTTATTGAACAAAATTTTTTTTTCAAAGGTTGCACGTGAT
CAATGTTTAGAAGGGTGGAAATTTGGTGAAGGGGAATTCCCTACTGAATA
TGGGTGTGGTTATACATCAGGTAAATATTTAAATCATAATAGCAGAAACT
CTTTTATTAATGGCACTTGAATCAGATTTGCCCTCTTTAGAGCAAAAATT
GATAATGGCTTCTTGTAATATGTATGAAAATTTTTTATGTTGGAAGGTAT
AAGTTCTTTGAATTTTCTCTTGATAGATTCACTGACACAAAAATGGTTGA
AAGACGTCATCGATCCTGTATTTGGACATCCACAATTTGTGAGGTTTGGA
TGGTCAACCTGTAGCGAGATGTTAAAAAAACATGCCCGAGACGTTACGTG
GTATGATAATTTAGTTTAAAGGAAGAAATTTTGGCAAAACGAATTTGGCA
GATTTAGCAGCAATCCTGCAAATTAAGTTCTCACAAAAGTTTTTTTTTTC
AGCCATCCATCAAATTTGAATTTGTTTATTCATTATCCCAGGGCTTTAAA
CAGGTTTTTTGCTTATTTGATAGTGTTTTTGGTCAAAAATAAAATTCATC
CGCCAAATTAAATTCTTACCAAAATTTCTCCCTTTAAGGTAGTTGTATTC
TTATCAATAGACTACCATATTTCAGTTTTACTTATTTCATAAGTTCAACA
AATCTTATATAGTTGAAAGACCATTTTTTGTCATTATTGACAAATTTAAA
CCATCAGTATAGAAAGTGGCAAATACCCAGTGTTTGTTTTGAAAAGAGAA
CTTCATGATATGAATTTTTGCTATTAATATAGTATTTCACAAATTATTGT
GTTCTTAGATTTAAACAATTAATCTAAAAAAATTATTTTCTCTCTCTTAG
GGAGGATGATGACGATGAGGGAAAACCTAAAAAGAAGAAAAGTTCCTTTG
CCATCACGTCATTCTACACTCAAGAGAAAAACAACCAAAAAGTTGACCAC
TGTCGATTCTTCAAAGAACGAAACCTTCAACAAGTCTCCTCTTTATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000053_pilon:1713931..1718528- >XLOC_038133 ID=XLOC_038133|Name=XLOC_038133|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1812bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000053_pilon:1713931..1718528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACATCACAGAATATTTGGAGGAAAATGTAGAAACTCGTATTTTTCA
ATCACCTATCCCAGAAAGTTGTAAAAACAGTCCTTGCTGTCTAGGGATAG
ATGAAGCTGGAAGAGGACCTGTTTTAGATGGACATCACAGAATATTTGGA
GGAAAATGTAGAAACTCGTATTTTTCAATCACCTATCCCAGAAAGTTGTA
AAAACAGTCCTTGCTGTCTAGGGATAGATGAAGCTGGAAGAGGACCTGTT
TTAGGTCCGATGGTTTATGGCATTTGTTACTGTCCAATATCTTTTATGGA
AGAATTGAAAGAACTAGGATTCGCGGGTCCGATGGTTTATGGCATTTGTT
ACTGTCCAATATCTTTTATGGAAGAATTGAAAGAACTAGGATTCGCGGAC
TCCAAAACATTGAAAAAAGAAGACAGAGATAAACTTTTATCAGTAATTGA
GCAAAACATTGAAAACATTGGATGGGCTATCAAAATTATATCACCAACCT
CACTGTCAAATGATATGCTGAGAAGACTCCAAAACATTGAAAAAAGAAGA
CAGAGATAAACTTTTATCAGTAATTGAGCAAAACATTGAAAACATTGGAT
GGGCTATCAAAATTATATCACCAACCTCACTGTCAAATGATATGCTGAGA
AGCACAAAAATCAGTTTGAATGAGATTTCACACAATGCAGCAATTGAATT
GACCAAAGTTACAATTAAAGACGGAGCTGACATCAAGGAGCACAAAAATC
AGTTTGAATGAGATTTCACACAATGCAGCAATTGAATTGACCAAAGTTAC
AATTAAAGACGGAGCTGACATCAAGGAGATGTATGTTGACACAGTTGGCC
CAGCTCAAAAATATCAGGACAAATTATCAGAAATTTTCAAATCAATAAAT
GTTACTGTGACACCAAAAGCTGATTCCAAGTTCCCAATTGTCAGTGCTGC
TAGTATTTGTGCTAAGATGTATGTTGACACAGTTGGCCCAGCTCAAAAAT
ATCAGGACAAATTATCAGAAATTTTCAAATCAATAAATGTTACTGTGACA
CCAAAAGCTGATTCCAAGTTCCCAATTGTCAGTGCTGCTAGTATTTGTGC
TAAGGTTGCACGTGATCAATGTTTAGAAGGGTGGAAATTTGGTGAAGGGG
AATTCCCTACTGAATATGGGTGTGGTTATACATCAGGTTGCACGTGATCA
ATGTTTAGAAGGGTGGAAATTTGGTGAAGGGGAATTCCCTACTGAATATG
GGTGTGGTTATACATCAGATTCACTGACACAAAAATGGTTGAAAGACGTC
ATCGATCCTGTATTTGGACATCCACAATTTGTGAGGTTTGGATGGTCAAC
CTGTAGCGAGATGTTAAAAAAACATGCCCGAGACGTTACGTGATTCACTG
ACACAAAAATGGTTGAAAGACGTCATCGATCCTGTATTTGGACATCCACA
ATTTGTGAGGTTTGGATGGTCAACCTGTAGCGAGATGTTAAAAAAACATG
CCCGAGACGTTACGTGGGAGGATGATGACGATGAGGGAAAACCTAAAAAG
AAGAAAAGTTCCTTTGCCATCACGTCATTCTACACTCAAGAGAAAAACAA
CCAAAAAGTTGACCACTGTCGATTCTTCAAAGAACGAAACCTTCAACAAG
TCTCCTCTTTATGAGGAGGATGATGACGATGAGGGAAAACCTAAAAAGAA
GAAAAGTTCCTTTGCCATCACGTCATTCTACACTCAAGAGAAAAACAACC
AAAAAGTTGACCACTGTCGATTCTTCAAAGAACGAAACCTTCAACAAGTC
TCCTCTTTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000053_pilon | genome | sc0000053_pilon:1713931..1718528 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 760-906:148 |
| Aaloc | 637-756:771 |
| Aaloc | 553-633:1011 |
| Aaloc | 415-552:1333 |
| Aaloc | 328-414:2754 |
| Aaloc | 202-324:3110 |
| Aaloc | 130-198:4210 |
| Aaloc | 1-126:4599 |
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