XLOC_038109 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038109
Unique NameXLOC_038109
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000121_pilon:793396..803151-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038109 ID=XLOC_038109|Name=XLOC_038109|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9756bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:793396..803151- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTTGTTCATTTCACCAAACTCGCGTCTTTTATTTTCTCAATATTTTTTT CTATCAATATATACTTGGTCTGACAATACCATGTCATAGTTCATCGTTTA CTTGTGGTGCCTCATTTTTAAGTAACTTTATAACGAATGATCGGAGATCT CAAGGGGCGATTGTTTCAAGATAAGGTAGATGTTTTTCTTTGGGTACTTT TTGAAAAGTTTTTTTTTTCTTTTTATGGCTGCAATTAAATTCAATTTCAA ATTTTTCAGCCTACAGAAGTTTTATTCTTGAAGTCGCAAGTTGAATGTCT TCGATGTAATTACCAAAAGTCCATAAGCATCCTTCACAGCACCAACAAAA ACACACCCTCAGATCCATACAAACCCTTACAAACGATGTACCAAAACAAT TTGGGTTGCATTCATTTCCTGACCAAGAAATATAACCTGGCTGTTTCATA TTTTAAGAAAGCTTGCGTTGAAAATGCTGCAATCATGAAGAAACTACAAT CCATCGATAAAAGTAATTTTCAAGTCATTTTAACACCCATATTCAAAGGA TAGCGCGCGCATTTTTTTCCAATCAAACTAGATGTCTATTATCGTCATTA TAAAAACACTGGTCTGGAAGGCTTTTGTCTCTTTTTATTGTTAAAAGATG GAGCTTACGTACCAAATTCGATTTATTTTGATCATGTCATATAGAAATAG ACCAATCCCAAGAGGAGATTTTGGTAACGTGATCAAAAAGTATACAAGTC GCAACTTGCCTTTTGTTTATAACATAAGAAAATTGAACAAAAGCTAAAAC AATACATTGCCAGACCGGGTTTTTTATAATGACTATGGTCAAATCTATAA TATGTGCTACAATAATAACACAATAATAAATTGAGGTTGTTCATGGTACC TTCTTTTCATCTTATTGAAAATTAAAACCTTACCTCAAAGGGAATAGAAA CAAACTCTGGTCTGGAACTTTCGCCTATGTAACGACTTCCCAGACTCTAC TAAATCTGTGAACTGTATACAGATTTCATCAATTTTGTTTCGCGTTTCGC TTAATTATAATTTAATTTTCACTTGAGATTTAGTATCGGCTGATAACATA AGGACGTTTAGTAACTCTCTCCACTAGTTTGACAAGGTGCTAAAACACAA AACTGATGATATTATTGAAACCATTCATTTTGTTCAGATCAACCACTATC AGGTCGTCCTTTACATACACTCACCATCAACAAAAGAGCTGAACTATTCT TTAATATGGGGTTATCCTTACTTTATGCCGGTCGACCTTCACAAGCTTTC GAGTGTCTCTTGCAATCACACAACGTTTACCAATGTAACCCAAGATATTG GCTTCGGTTTGCTGAATGCTGTATAGCAGTTCATCAAGAGGTTTGTGAAT GTAATGATCTACCTTTTGCCTAATACACAGGTTGCAAAATGAAAGTCTGA AGCCAAATCACGCTTTTAATCGAAATTTTTATGGGCTTGTTACATGGCAT TTATTTCTGATTGGTTCGAATTTATTGACACTGATAAAGTTATCAGCTGT AAGTTGTAAAGCAAGTAACATGGAAATATTTCGAGTTATCACATGTTTTG ACTGTACTGATATAATTTTGCAACCCGTGTATTATACTGCACTTATCATG AATATATCCAGAATGAAAATATTTTTACAGTAGAGTCTCCATAATTCCAT CCTGACAAGTGCCACGTGTTGACACTAGGGAAATTCTGGAACATTCAACA TGCACATCCTTACGAGATCGCTGGCTCTGTCCTAGAACATGTTGATCAAG AGAAGGATCTTGGAGTGATTATTGATAGTGAATTGAATTTCGAAGAACAC ATCTACACCAAGATCAAGAAGGCTAACTCGATCGTTGGATTGATTAATAG AAGCTTCGACTTCCTTTCTCCCGAGATGCTCCGCACACTTTTCATTGCAT TTGTGAGACCTCACCTTGAGTACGCGCAAGCTGTTTGGTCTCCACGACTG ATCAAACACTCTGATGCAATTGAAAGTGTCCAACGTAGGGCCACAAGACT TGTCGGTGGTTATAGAAACCATTCATATGAAGAACGTTTACAAGTCATGA ACCTACCCAGCCTCAAGATCCGGCGTAAAATCGGGGACATGGTGGAAGTA TATAAACATCTTAATGTCTATGATAAATCTTCCCTATGTCAGAAACTCGT TCTTCGAAATCGACCTCAACGTAAGCACAATCTCGAATTAAAGAGGAATT TCGCTGAAGACGGCATTAGAGGATACCAAACGAATTCACTTTACTATAGG AGCATTGATACTTGGAACAGTTTGGCAACCAATGTTGTAAATGCACCGTC CGTAGGGAAATTCAAACTAGAATTGACAAACGAATGGAAAGATAAGATCT ATAAATTGTAAAGATGTAAGATTGTTTCATAGAGGTCAATAGACCTGAGA AATACACTTCTATAAATTAAAAAAAAAATTAATTCGAATATTCACGGGGA ACATAAAGTTTTTCGAATTATGGAAATTTTAAGTTATTGAGTTATTAGTT TAAAAGGCTTTGCTAACTGAGGGGACCAGAAAACTTGTTAAGGAGACATT CAAGTTAAAGAGATTCGAGTTATGAGGTCTCCCCTGTATTTTGATGCTTC TGGTTTACTATTCTTAATTAATCGATTAGCAATCTAAAATCAGAAAGGAG CGTATGTGTACATGATCGATTTATTATTGCGCAAAGCTTAAAATTTGCAA ACCCTAGATGTGCATTCATGTAGTTAGACCAAGTAGTAGACATCATATGC ATTACATGTTTTTTTTATAAGCGAGTGTATGCCCCTTGGTCAGGCTCGTG TATGCTCAAGTTCTCAAAGCATCCAGGCATAGCTCATGCCTATTATATGT TTATGAATCATGCTTATGATTCATCATCCCGATCCAAGTTTTTAATGAAA TTTCAGAAATTTTATAAAAATGTGTTCAGAAACTCAATGGGAGCAGTAGC TAGCCTGGAATGTCCTTTTTTTACTTGACCTCTACCAAACCTTTTTAAAC AGATAAAAAATTAAAACTTGAAAAATATTTCAGGCTGACTATATGCTTAT GTTTGCTTAAGAATTCTGCAAATCTGAGCCTTCATATGCTTACAAGCGTT ATGCTTATAAAAAAAACATGTACTTGAGTATTCAGGTTGGCAACCTTAAA ATCCGATACATTATCTCTTAACAGATTATTAACACTATATCGGTCGCTTA TATATTTTCTTTATATTTATAGACAATCGAGAAAGAGTTTTCTTGCGTCG ATCGCAAAAATATGAACGTCTATGATGCCATGGGGAGTGGTGTTAATCGA AAACTTGTAGTCGCTCCGACCCATTTTGACCAACAGTAAGACTTTTTTGC AGTTTAACGATGTTTATAAGTTTAATTATCAAATTGTTGTTGCTTCTTTT ACTGTGAAGTGTTATTAATGGCTTTTACGGCGTTTAAACCATACGGATGT CACCGTATATGTATATGTAATTAATCGATTTCATTGTGTTATTAAAAAGG CCAAATTTTGAAAATTTGGCATATTCAGCAGTGAGTTCTATTCTTTCAGC TCGAAATCAACGCCATCGACCTCACCAACAAATAACGTACCGACATTGAG TTTCGGAAGTATGTGTTTATCAAACGCATGTACGCTACTCCCTTCAGAGT CGGTACTGGAAGAAAATATGACGAAATTTCTTCAAAACGAAAAACCAGTT CCAGGTGGTGCTGCAGATGATAAAGAGTATGTAATTTTCGTTTTTTAGAA TTCATTTTCGACCGTAGCCGTCAATTGCCGCGCTGGCATTTTTTTGTCCA TTTTACCACCCTGAAACCGTCCCAGTCTTTTTTTTCGCACCTATAGACAA TAGCAAAAAGGTGTAAAAAAGGATTGGATTGAGTTTAGGGGGATAATTAA ATAATAAATTGGCACGCGCCTGACCGCGCGACTACGGTAGAAAAAGTGTA TTCGTTTTCGTTTTCTTTGTTCTACTGCTGTAATTATAAAACGTTTCAAA AAAACAAATGCTGAGCTGGAGTCTTGCATGGTACTGTGATATCCACACAC AATAAAATTCCATAGTAGAATTCTTTTTAATGGGGGAATTTTTAGCAATG CCAAATAATATAACGCTGATAGCGTGTCCTATACGTAGAGTGAATGAAAA ATCTATACTGTCTAACTTATCGGTAATCCTGTCTCTATTCGTATTTGGCT ATTGGCTAAGGAATGAATTTTCCTTTGTGTTTAATTCTTCAAATTTCATA CACAGGTCAGTCAAACGTAGTTTCATCGGACGAATTTTTGTCGATGCACC TCCAGGGCATCCTATACAAACGAAAGAAATTTATCACTTAAGGTGAGAGT CTTTAAAAAATGAAAATATCTGGATTGTCGTACATTATCATTTCTTTACT TTTCTATCGCTTCAAATTCGTGGACTAAAAATGGATTTTGAACAAATGCT GCAAACTTGCATATACCGTAGCAGTCCATGAAAATTTTCCAACGGGACTC GAAATAACGGTCGGACATCGGACATCGTCTGACCCAAATTGCTTTTTCTC CGACCCACTTGAAATCGTTATTTGAAGCCATGCCATAAAATTCTGACGTA GATTTTCATTAATTTGTTAGTTCGCTTGTTTAGCTCGTTCGTTATGAACA TTCTAGAAAGGTTTAGCTTTTATTCTCCTGATGTCTTCAGGTTTTTATTT TCCATTCTCACTTGTAATGCTAACAAAATTCTGTCATTTCAGAGCATCAG TGGTGTGCTGCCAAGCGTACATTTCACTGACCATTGGTGACTATTACAAA TGTGTTGAACATTCCAGATCTCTTCTACGTATGACTCACATCTCGGGCCC TCAAAAGTAAGAAAGGTGCTTTCTACCTTAAGGAAGATAATTTTGCCAGA ATTTCGATGTGCTTGTTACATGACATTTATTTCTGATTGGTTCGAATTTA TTGACACTAATAAATTGATCAGCTTGTAAAGCAAGTAACATGGGGATAAA ATCACGTGAACTTTTTCGAGTAATCACATCATGTTTTGACTGCATTGATA TAATTTTGCAACCCTTGTATTAGATCTCGCCGAAACAAAATTTGCTGTCT CGATGAAAAAAGGCTCCTCGCCAAATTTAGATTTTTATAAGATATGGCAG ATTTCTGAACTTCAGTTGAGCTAGGATTTGAAAATGTAACTTTACCCTTA TATTAGGCGTACGAGTGGCACAGTCTGAGTTTGAGCTGGTGTGGGCAGCA CGTTCGACAGTTCATATGTCCAAGTGAAATTCCTTTAACCAAATCTTCTC CTAAAAAATTCGTCTAAAGGCCGGTCTCCACTTGCGCGCGCTTCAATCGC ACTTTTTGACTTCAATCCTTTTTGTTTGGAAAAAAGATTACGTCATAAAA ATGTTGCGCGCGCTCGAAAGAAAAGTAGAACACATTTCAACCTTTTTCAA CCGTTACGTCAGATCGCGCCAATGGAGTTGCTTCATTTTTCTTTTGACCA ATAGCGTGGAAGCTTTGTTCGAAAAAGTAAGATTGAAGCGCGCGTAAGTG GAGAGCCTTAACGGTGAGTTTTAAAATGTAGAAATTGCGATTTCTTGTGA TGGCTTTGCTTTATGTTCAGATTTCTGGGACATTCGTACTTGGCTGAATC GTTGATCAAATTAGACAAGATTGCTGAAGCTATTCAAGAATTATCGACAG ATAACCTGAAAGCTTATCAAACATTTGACCAAGAAACTCTCGAGTTAAGT ACAGGTCAGTCCTACGATTATTTTATCGATTTTTGTTTTATTATTGTTTT GTTGTATCATTTGAGAAAATATTCAATTTTTGAATTGCATACATGTCATA ATCCGTGTAAAATATTACATTCCATATTTTCGCGTCGTCAAATATAGCTC ACTATAGTTTTATTTTGCATCGACTCTTTGAGATTGCCAAAAAAGATTAA TCATCTTCCTTTTTATCTTTAGTCGATACTTTCCCAAAGAGCTTGGGAAG TGCACGCATGGTGATGATGTTGAATTTGGCGAGTGTGTACGCCATACGTG CAGAATACGACAAATGCAAACAGATTCTGCATCAGGTAAGGTTCTAGTAG TTCTTTTATTTATTTATTTCTAAGACTGGTAAACCATATACTAGGTAAGG GGCTAGTACACCAATAATCTTTTCAGCTATTCGAGAATGGTCTTTGAAAA AATATGCGTCATTAAAAACTCAAGTTTGTCAAAATCAAATAATCACAGTA CTTACAAAACACGGTTTTCCCATTTCAGTGTTAGCCCTTAATCAAACCAA GCGACCAAGACAAAAAGGTTTCCTGAAAACTTACGCTTTAGCAGTTTTCT TTAGGCAACTGTAATAATAGCTTGTTCTTTCGTTTATTTAGATTGCGCTA GTTGTAGATATGCATTCACCGATCAAATATCATGCAATATTACTGTCCGC TTATTGTGAACTACAGCTAGGTAAAAAAGCGCCCCAATGAAATATTTTTT AAAAGGCATTATCCTTTTTTATACAAGTCTTTTTCTTCTTTTTTTCGAAT AAATGTTTTCAGAGCTCAGGCCTGCTTTATTACCGAAATTGCTGTCAACC TTGAATAGTGGGGACTGAAAGTCTAAAATCTGATTACTTTTGCCATTTAT TTTTACTTACAGGTAAAATCACCAGTGCGTTAAGCTTGATAAAAAAACAC GAAATCTTTCCACACGGGCGTTTGGTTGATCGTGTTGAAGCGGCCGCGCG GACAGCCAACAACCCAGTCGGCGGACAATACCCTCAAAATATTTTACACA AATTCAACGAAATGACTATGTCTATGAACCAGCCTTTTGTACCAATGATG CAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000121_pilon:793396..803151-

>XLOC_038109 ID=XLOC_038109|Name=XLOC_038109|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:793396..803151- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGTATTTCCACTTTCTTAGCCAATTTTTAAAAACCTAGCTTTACTTTGT
ACCAGTTCTGCTGTTATTTATTTTTCAGAAATTAGAAATATACAAAATGC
CACAAATAAAGCAAGAAACTCAAACAAGAGAAATTGCATCAGCACATAAG
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CAAAGAGAAGAAATATGACCAGTGCTCGCAACAAATGAAGAAACTATCAG
AGCAAAGACCCCATGATCCAAGAGTCATTGTCAACAAAGCTGTTTTGGAT
TATTACATCTCCAACTTTAGCAAGACAGACTATTTTATGAAACAAATGCA
AAATGCTAAAAAGCAGGTGTATTTCCACTTTCTTAGCCAATTTTTAAAAA
CCTAGCTTTACTTTGTACCAGTTCTGCTGTTATTTATTTTTCAGAAATTA
GAAATATACAAAATGCCACAAATAAAGCAAGAAACTCAAACAAGAGAAAT
TGCATCAGCACATAAGGCTATAACAGATCAAGATCGACAGATAGCCGCAT
CTGCATCTTCATGTTTCAAAGAGAAGAAATATGACCAGTGCTCGCAACAA
ATGAAGAAACTATCAGAGCAAAGACCCCATGATCCAAGAGTCATTGTCAA
CAAAGCTGTTTTGGATTATTACATCTCCAACTTTAGCAAGACAGACTATT
TTATGAAACAAATGCAAAATGCTAAAAAGCAGTTCGAATTTGGTAACTCA
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TGTTTTACATTTTTATTTCGAATTTGGTAACTCAGGAGATGAGCTGGATG
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CGTTTATACAAAGTTATTGAACCACTAGGGGATCTACTTGCAGCTAAAGT
CTGCTTCCTTTTCGTTGAAGTCTGTTTATTGAATAACCAGGGGATCTACT
TGCAGCTAAAGTCTGCTTCCTTTTCGTTGAAGTCTGTTTATTGAATAACC
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TCAAAACAAACTACGACTGCATGACCAAGCTTTTGGAATGATTACGTACA
TCGAATCTGTCATCTTGGCAAAACCTCTGGATAATAATGCCAAAAATGTT
GAGTTCATGAAAGCCTGTCAAAACAAACTACGACTGTCTAAAGCAAGACT
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TTTTACGCTCAATGCAAGAAGGAACTCGAACTTGCCATAAGTGGTGAACA
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TTGCATTCATTTCCTGACCAAGAAATATAACCTGGCTGTTTCATATTTTA
AGAAAGCTTGCGTTGAAAATGCTGCAATCATGAAGAAACTACAATCCATC
GATAAAACCTACAGAAGTTTTATTCTTGAAGTCGCAAGTTGAATGTCTTC
GATGTAATTACCAAAAGTCCATAAGCATCCTTCACAGCACCAACAAAAAC
ACACCCTCAGATCCATACAAACCCTTACAAACGATGTACCAAAACAATTT
GGGTTGCATTCATTTCCTGACCAAGAAATATAACCTGGCTGTTTCATATT
TTAAGAAAGCTTGCGTTGAAAATGCTGCAATCATGAAGAAACTACAATCC
ATCGATAAAAATCAACCACTATCAGGTCGTCCTTTACATACACTCACCAT
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CCGGTCGACCTTCACAAGCTTTCGAGTGTCTCTTGCAATCACACAACGTT
TACCAATGTAACCCAAGATATTGGCTTCGGTTTGCTGAATGCTGTATAGC
AGTTCATCAAGAGATCAACCACTATCAGGTCGTCCTTTACATACACTCAC
CATCAACAAAAGAGCTGAACTATTCTTTAATATGGGGTTATCCTTACTTT
ATGCCGGTCGACCTTCACAAGCTTTCGAGTGTCTCTTGCAATCACACAAC
GTTTACCAATGTAACCCAAGATATTGGCTTCGGTTTGCTGAATGCTGTAT
AGCAGTTCATCAAGAGACAATCGAGAAAGAGTTTTCTTGCGTCGATCGCA
AAAATATGAACGTCTATGATGCCATGGGGAGTGGTGTTAATCGAAAACTT
GTAGTCGCTCCGACCCATTTTGACCAACAACAATCGAGAAAGAGTTTTCT
TGCGTCGATCGCAAAAATATGAACGTCTATGATGCCATGGGGAGTGGTGT
TAATCGAAAACTTGTAGTCGCTCCGACCCATTTTGACCAACACTCGAAAT
CAACGCCATCGACCTCACCAACAAATAACGTACCGACATTGAGTTTCGGA
AGTATGTGTTTATCAAACGCATGTACGCTACTCCCTTCAGAGTCGGTACT
GGAAGAAAATATGACGAAATTTCTTCAAAACGAAAAACCAGTTCCAGGTG
GTGCTGCAGATGATAAAGACTCGAAATCAACGCCATCGACCTCACCAACA
AATAACGTACCGACATTGAGTTTCGGAAGTATGTGTTTATCAAACGCATG
TACGCTACTCCCTTCAGAGTCGGTACTGGAAGAAAATATGACGAAATTTC
TTCAAAACGAAAAACCAGTTCCAGGTGGTGCTGCAGATGATAAAGAGTCA
GTCAAACGTAGTTTCATCGGACGAATTTTTGTCGATGCACCTCCAGGGCA
TCCTATACAAACGAAAGAAATTTATCACTTAAGGTCAGTCAAACGTAGTT
TCATCGGACGAATTTTTGTCGATGCACCTCCAGGGCATCCTATACAAACG
AAAGAAATTTATCACTTAAGAGCATCAGTGGTGTGCTGCCAAGCGTACAT
TTCACTGACCATTGGTGACTATTACAAATGTGTTGAACATTCCAGATCTC
TTCTACGTATGACTCACATCTCGGGCCCTCAAAAAGCATCAGTGGTGTGC
TGCCAAGCGTACATTTCACTGACCATTGGTGACTATTACAAATGTGTTGA
ACATTCCAGATCTCTTCTACGTATGACTCACATCTCGGGCCCTCAAAAAT
TTCTGGGACATTCGTACTTGGCTGAATCGTTGATCAAATTAGACAAGATT
GCTGAAGCTATTCAAGAATTATCGACAGATAACCTGAAAGCTTATCAAAC
ATTTGACCAAGAAACTCTCGAGTTAAGTACAGATTTCTGGGACATTCGTA
CTTGGCTGAATCGTTGATCAAATTAGACAAGATTGCTGAAGCTATTCAAG
AATTATCGACAGATAACCTGAAAGCTTATCAAACATTTGACCAAGAAACT
CTCGAGTTAAGTACAGTCGATACTTTCCCAAAGAGCTTGGGAAGTGCACG
CATGGTGATGATGTTGAATTTGGCGAGTGTGTACGCCATACGTGCAGAAT
ACGACAAATGCAAACAGATTCTGCATCAGTCGATACTTTCCCAAAGAGCT
TGGGAAGTGCACGCATGGTGATGATGTTGAATTTGGCGAGTGTGTACGCC
ATACGTGCAGAATACGACAAATGCAAACAGATTCTGCATCAGATTGCGCT
AGTTGTAGATATGCATTCACCGATCAAATATCATGCAATATTACTGTCCG
CTTATTGTGAACTACAGCTAGATTGCGCTAGTTGTAGATATGCATTCACC
GATCAAATATCATGCAATATTACTGTCCGCTTATTGTGAACTACAGCTAG
GTAAAATCACCAGTGCGTTAAGCTTGATAAAAAAACACGAAATCTTTCCA
CACGGGCGTTTGGTTGATCGTGTTGAAGCGGCCGCGCGGACAGCCAACAA
CCCAGTCGGCGGACAATACCCTCAAAATATTTTACACAAATTCAACGAAA
TGACTATGTCTATGAACCAGCCTTTTGTACCAATGATGCAATGAGTAAAA
TCACCAGTGCGTTAAGCTTGATAAAAAAACACGAAATCTTTCCACACGGG
CGTTTGGTTGATCGTGTTGAAGCGGCCGCGCGGACAGCCAACAACCCAGT
CGGCGGACAATACCCTCAAAATATTTTACACAAATTCAACGAAATGACTA
TGTCTATGAACCAGCCTTTTGTACCAATGATGCAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038109XLOC_038109-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000121_pilongenomesc0000121_pilon:793396..803151 -
Properties
Property NameValue
Aaloc2053-2244:193
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