XLOC_038051 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038051
Unique NameXLOC_038051
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000379_pilon:91666..100740+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038051 ID=XLOC_038051|Name=XLOC_038051|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9075bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379_pilon:91666..100740+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTGTGCTGCTCTCAAGAGACCTCACAACTTTGATCTTCTTGGTAA CAGTCCTGATCATAAAGTCAGTGCATCTCCTAAAAGGAGAAGATGTGGAG CTGTAGTTACATCTTGTTCGTCAACAAGTATTTCTCCTTTCCTTGAAGCT ACTCCAAAATTATGCAAAGGTAAGTTTTTTGCATTGCTTGGaaatttgat tgaaagaaaatttatatGAATCATACTGTAAGTAATATTCTGATTTAAAA CAGTTGAATATCAAGATGATTGAGTTGTCTCTGTTGAAAATAATTGCTTT GATTTTTATTTGGAGCCATCTTCTttaggggccgtcgacattcgactttc aaattttttaacggcatttggccgttaaaaggggggggagggggtcgacC ATGTACCGTTAAGGGAAGGTCGAAAATCTCTTTAGGGGTCAACTCACCAC ATATCAATTCTTTTCACcagaaaatatcgatttttgagacgtttattcca tacaaatgttactttccatatttcttttcctccttttatcaaCTAAGATC TGCTAAAGTCGCATCCTAAAGTATTCACTTCgctattttttagaataatt ttaaccaaaacaaacgacctgatgtttatgtctcgtgttccttttgttta gacggtccgcacggcccttgaatttcgcagacggtcggtcttttttcttt gaaatgctGTATTCTTTTGAGTATGATTACAGAGATAATTAATTCGCCca actttcggaaaaaagtttagaaattatctccattatttttaaaatgtaaa ctgagcaAAGCCGTAGCgatattaaagatggctgacgaaagaacgatgaa agtgaaggagaaaattaagagtttcattgatttttgacaattttttaact ttacagaatttgatggccgttaacgtagaggggggagggggtcagaacca 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000379_pilon:91666..100740+

>XLOC_038051 ID=XLOC_038051|Name=XLOC_038051|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379_pilon:91666..100740+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTGTGCTGCTCTCAAGAGACCTCACAACTTTGATCTTCTTGGTAA
CAGTCCTGATCATAAAGTCAGTGCATCTCCTAAAAGGAGAAGATGTGGAG
CTGTAGTTACATCTTGTTCGTCAACAAGTATTTCTCCTTTCCTTGAAGCT
ACTCCAAAATTATGCAAAGATGGCTTGTGCTGCTCTCAAGAGACCTCACA
ACTTTGATCTTCTTGGTAACAGTCCTGATCATAAAGTCAGTGCATCTCCT
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CAGTACGACTCCTTTTTGAAGTTCACTCAAGATCAAATAATGAggaaata
tcaaaattcatcaTGTAGTAACAGTACGACTCCTTTTTGAAGTTCACTCA
AGATCAAATAATGAggaaatatcaaaattcatcaTGTAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038051XLOC_038051-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000379_pilongenomesc0000379_pilon:91666..100740 +
Properties
Property NameValue
Aaloc502-570:9007
Aaloc172-498:8069
Aaloc1-168:1