XLOC_037994 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037994
Unique NameXLOC_037994
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000008_pilon:1335890..1349071-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037994 ID=XLOC_037994|Name=XLOC_037994|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13182bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:1335890..1349071- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTGATGTCGACATCCCTCTTCTAATTTCGACATCCTTCTTCCGTCACCTA ATGCAATGTAAAAATTATGGTAGTTTTCAGTTTTTGAGACATGCCATTTA ACCTCCCCGAGAAGGGAACTAGACCTCACGAGTTAGGCTAACTGTTATGA TCACAAATCCTCAAAAGGAGCCCCATCCATGAATAAATCCTGGGATGGTG CACCAACGACTGGGTGTATAGGGGTCACTCTCCTTTGTTCCAGGAACAAG CTCACTAATTCTTAGGGGTGTGTCTACTATAGGCTCTGCCTCCCCTGCTG CATGAAATTTGCATCTTCTTTATTAAAGAATTTACCTGCTTCTAGATTGA TATTGACACCTGCCCTTATGCCTAAAATTGTTGTTTTTGGCAATCTTTTT CTGTTTATTGCAAGGTAGGAAAAGCCAAATGTATTCTTTAACTTGCCAGA TGGCATTTGTTGATGACTTTAAAATTTGGTCAATTGCCTATAAAGGTCTA TGGTTAGCTATCGAAAAATAATTCTAACATTTTTCTGAATGAGCCGACTC TGGATTTTTGACCTGGAGGTAAAAAAAGTTAGAAAGTCTCTGTAAGGGTC AACAGGTTTTTTTCCTTTTTTGGTTCTCTTTCAGAAAAACCAAATCCAAT TAAATCATTCTTGAGATTGTTGTTGAGGCACTAGATATTGGAGACTTTTT ATAGCATTATTTAGCTGTTCACCTGATTTTTTGTGTTCAACAAATTTGTT AACATAAATCTAAAGTATAATGAGATTCCAGACAAAATTCAATCTGTCTG TAACTTAGGCTAGACTTTCCTATCCTAGCTTGCTAAATTTTATCATATGC AATGAAAAATGCAAAGACTTAATTATCACAACAAACTTTTACCTCTACAA CAATGATCAAATCATTTAAAATGTCTAAACATATTATCAGTTGCTTATCG TTTATTGAATAAACATCAAATCTCAAATGATATCCCTCTTTCAGATAATC ATATATTTTTAAAAAGGAAATCATCTATGTTGATCCAAATCTGAAATACA AACAAGATTTTGTAAAATCATGGGAAATCCATCAATTAAGACACAAATCT ATACATTTATGAGCTGACATTGTTGCAAAGTGTGTTTTCATTATGGCAGA AAAATATGAAATTGAAGAGAATTCTTCATTGACATTTCAAGACTCTCCAC GTCACAAGAAAGGATTTTTTATTAGCAAAGGCCAACTTATAGTCTGCCTT TTAGCTGTGATATGCTTGATAATAATTATAGCTGTACTGTCTGCTACATT CAGTTGGTATGCAGCCAAGAATGATAATACTAATGGGAAGTCAGGTACTG TATAACTAGTTTCATAAGACCTGTATTTTTTTTATTTTTTTGGTCTATGA ACATTTGCAGATGATCTTTCATTTCAAATTTAATCATCATTTGCTTATAA TGATTAAATTTTTAAAACAATTGCGTGATTGTGTGAATGGGAAAGCTTTG CGTGAACAAAAATTTCGTAAATTGTGAAAAAACATTGTGTGAATGTGTGA ATTTGGGAAAAAAATTTGCTTGATTGCATGAATTGAAGGTCCGCTAGGGG GGGGGGCTCATAAAGGAAGCATGTTAGATAGAATTATGGTCATACCGTAA AATCGATAATCAATTAAATAGTTTCTGTTGGGTAATGTGTCAAAGTTACG GTGAAAGGAATTAAATTAAAGAGAAAATGTTTTTAGCTATAATAACTATT TTCCTTCCTTAATAAAATAAAGTTTTGTGAAACAATTTCTCATTCATTGA AAATCAGACAGGGTCTTTGCAAATAACAATTTTATCTCATTTTTGCAAAT AACAATTTAATCTCATTTTTGCAAAAAACAATGTTTTCTGTTATCCATAA 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ATTATAATAACAATTACAACTTAAAATAATTTTCAGATAAGATTGATAGA GAGTAAGGCACTATAAAAGGTAGCTAAAGTAATTTACCAGGAAATTTTTG TTCACCTTGACCAATTAAGTATGGCACTCCGCAACCTCAAATTTTTGCTC CTACTGGTGGTACAGGACTGAAAAAAATTCAGCAATTTCATATGATACCA GTGGGACTTTATGAAAACTTCTCTGTGAAAACTATAAGTTGAAGGTTAAG TGTTGCTACGATAGTGCTCTTACCAACAAAAGAAGTATGATAAAATTTCA AAAGAAAAACACATAATTTGCTATACACAAGGATTTTTTAAGCACTTTGT GCTGGAGCCGTTTTTGTAAACTTAGATTGAATTTCTAATATGCCTGAAAG AGAATTTCCTCAGCAAAACTGTACATTTAGGAAGCTGGGGAACTTGTGGG TGTTCAGAGGGCAAAGCTCCCAAAAATTCTTGAATATATAGATAATAATT AGTTATTGTTGCTCATAAACAACTCACTGAGGAATTTCTTTTTTTTTCAC AGGAAAGTCGCCGCTACGCAATTTGAGCCTGTGGATGCCCGTTCAGCATT CCCATGTTTTGACGAACCAGCTATGAAAGCGACTTTTGATATCTCAATGA AACGAGATAAAAGTTATCTTGCATTGAGTAACATGCCGGTCATCAGAACT GAAGCTGATGGAGATGAAGTGACCAATTATTTCCAAACAACTCCCATTGT ATCCACTTACTTGATCGTCTTTGTGATTTGTGATTTCGAAAAAAGAATGG TTGTTGCAAATACTAAGGTTCCTACTAACGTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000008_pilon:1335890..1349071-

>XLOC_037994 ID=XLOC_037994|Name=XLOC_037994|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1914bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:1335890..1349071- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGAAAGCAATGGTCAACATGTCAACGGAGCAGTTGACAGTCGACAG
CTCCGGTAAATCAGGAAGTGGTAGAAAGAATATGATTCTTATGATTGTCC
TAGTCCTCGTTGTTGTCTTGGCAATAATCTTTGTGGCATTGTATGCAAGC
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TGAACTAAAAGATGTCGAAAGCAATGGTCAACATGTCAACGGAGCAGTTG
ACAGTCGACAGCTCCGGTAAATCAGGAAGTGGTAGAAAGAATATGATTCT
TATGATTGTCCTAGTCCTCGTTGTTGTCTTGGCAATAATCTTTGTGGCAT
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AAATTGAATAATGAACTAAAAGATATGAAGAAAGGCGGCTCAAATAAAAC
TACCATGGCTCCAACGACTGTCCCAACAACACCAGGAACAGAAGTTTATC
ATAATATTCGTTTACCCAAATACATTAGACCCATTCATTATGTAGTGGAT
ATGAAGAAAGGCGGCTCAAATAAAACTACCATGGCTCCAACGACTGTCCC
AACAACACCAGGAACAGAAGTTTATCATAATATTCGTTTACCCAAATACA
TTAGACCCATTCATTATGTAGTGGCTTTGGAAATTGATATGCAGCTAGAG
TTTGTAGATGGTACAACAAACATCAAGACCGAAGTCTCAAAACGCTCAAA
ATATATCATGGTGCACGCTATGAAATTTAATAATGTTAAAGTCGTTGTAA
AAAAATTTGATACTCAAGAAAAATACCCCCTTGAGAAAGAGCATGGTGAT
AACGGCGGCTTTTTATACAAACAAAATCTTTATTTTGTTATTGAAGCTCA
TGATTATTTTGAAGTTGGAAATTATTCTTTGGAATTCAAATTCGATTATA
AATTGCGAAAAGATTTGGCTGGATTTTATTTGTCTACTTACAATAATACA
AAGGGTCAAATTGTCTTTGGAAATTGATATGCAGCTAGAGTTTGTAGATG
GTACAACAAACATCAAGACCGAAGTCTCAAAACGCTCAAAATATATCATG
GTGCACGCTATGAAATTTAATAATGTTAAAGTCGTTGTAAAAAAATTTGA
TACTCAAGAAAAATACCCCCTTGAGAAAGAGCATGGTGATAACGGCGGCT
TTTTATACAAACAAAATCTTTATTTTGTTATTGAAGCTCATGATTATTTT
GAAGTTGGAAATTATTCTTTGGAATTCAAATTCGATTATAAATTGCGAAA
AGATTTGGCTGGATTTTATTTGTCTACTTACAATAATACAAAGGGTCAAA
TTGTGAAAGTCGCCGCTACGCAATTTGAGCCTGTGGATGCCCGTTCAGCA
TTCCCATGTTTTGACGAACCAGCTATGAAAGCGACTTTTGATATCTCAAT
GAAACGAGATAAAAGTTATCTTGCATTGAGTAACATGCCGGTCATCAGAA
CTGAAGCTGATGGAGATGAAGTGACCAATTATTTCCAAACAACTCCCATT
GTATCCACTTACTTGATCGTCTTTGTGATTTGTGATTTCGAAAAAAGAAT
GGTTGTTGCAAATACTAAGGTTCCTACTAACGTAGAAAGTCGCCGCTACG
CAATTTGAGCCTGTGGATGCCCGTTCAGCATTCCCATGTTTTGACGAACC
AGCTATGAAAGCGACTTTTGATATCTCAATGAAACGAGATAAAAGTTATC
TTGCATTGAGTAACATGCCGGTCATCAGAACTGAAGCTGATGGAGATGAA
GTGACCAATTATTTCCAAACAACTCCCATTGTATCCACTTACTTGATCGT
CTTTGTGATTTGTGATTTCGAAAAAAGAATGGTTGTTGCAAATACTAAGG
TTCCTACTAACGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037994XLOC_037994-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000008_pilongenomesc0000008_pilon:1335890..1349071 -
Properties
Property NameValue
Aaloc679-957:280
Aaloc340-675:1235
Aaloc214-336:1530
Aaloc1-210:13183