|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000448_pilon:119668..130152+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037908 ID=XLOC_037908|Name=XLOC_037908|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10485bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000448_pilon:119668..130152+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAACAATCTCCGACGAAAGACGAGAAATCATCACTCACCATCAACCCTTC
TTCAACAGATGAATTGCAACAAAGGTTGGAACAATGCAAGGCTGTCATCA
CTGGACAAGAGGCTATCATACAAGTAGGTTCCAAACCTCTCCGTTCAATT
ATCCATTTTGTGTATTATAAATTCAATTCGATTTTCGGAGGGAAACATAT
TTTCATTGAATAAGGGTTCGAATAGTAGAGTGTATTGAATTGTAGAGAGT
CGTTTATGatagtttcttgttgacggcgaCATCATTATTGAATCGAATAT
TAGACTTCGGTCGATTTAGAAAGGGTCAAATGTATTTGAAATTTGGAAAG
TCGCCGAATCCAATCCTCAGGTGCGAAGAGGGAAAATGGCTAAACATTTG
TTGCTTTCTTTTTATTTTGTAGGAGCTGAAAGAAGGCTATTCGCAAGAAG
CTTTTGAAAGAGCATTGTTGgtaagtctcttaacagatctcATTCATTTT
TCATGCCCCTTTGAAACCgtagtaaaatcaattgtaactCCACTTAAAGT
ATCTCCTTCACTTTTGCCCCTTTGAAACTgttgtaaaatcaattgtaagt
ctcttaacagatctcattcacttttcatgccccctttgaaaccgttgtaa
aatcaattgtaagtctcttaacagatctcttcacttttcatgccccttgA
AACcgttaaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattcactttca
tgcccctttgaaaaccgttgtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatc
tcattcacttttcatgcccctttgaaaccgtagtaaaatcaattgtaagt
ctcttaacagatctcattcacttttcatgcccctttgaaaccgtagtaaa
atcaattgtaagtctcttaacagatctcattcacttttcatgcccctttg
aaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattcacttt
tcatgcccctttgaaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctctcttaaca
gatctcattcactttcaTCATGCCCCTTTTTGAAACCttaataaaatcaa
ttgtaaagATCTCATTCAATTTCCGCTCAGTAAATCATTGTAAGTCTCTT
AATCTCATTCACTTTccatgcccctttgaaaccgtaAAAATCAATTAAGT
CTCTCTCATTCACATTGTATAAAAATCAATTCTTCAGATTTTCATGCCCC
ATTGAAACCGttagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattc
acttttcatgcccctttttgaaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctct
taacagatctcattcacttttcatgcccctttgaaaccgtagtaaaatca
attgtaagtctcttaacagatctcattcacttttcatgccccattgaaac
cgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattcacttttcat
gcccctttgaaaccgtagtaaataaaatcaattgtaagtctcttaacaga
tctcattcacttttcatgccccattgaaaccgtagtaaaatcaattgtaa
gtctcttaacagatctcattcacttttcatgccccattgaaaccgtagta
aaatcaattgtaagtctcttcaCAGATTCAATCAGTCAACTTTTCATGCC
CCTTGAAACCgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattc
acttttcatgcccctttgaaaccgtaataaaatcaattgtaagtctctta
acagatctcattttcacttttcatgccccttcATTCACTTTTCTGAAACC
gtagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattcacttttcatg
ccccAttgaaacAttagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctca
ttcactttcatgcccctttgaaacagtagtaaaatcaattgtaagtctct
taacagatctcattcacttttcatgcccctttgaaaccgtagtaaaatca
attgtaagtctcttaacagatctcattcacttttcatgccccttttTGAA
ACcgtaataaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattcacttttc
atgccccattgaaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatc
tcattcacttttcatgcccctttgaaaccgtaataaaatcaattgtaagt
ctcttaacagatctcattcactttttcatgcccctttgaaaccgtagtaa
aatcaattgtaagtctcttaacagatctcattcacttttcatgccccatt
gaaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatATCATTCACTT
TTccatgcccctttgaaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaaca
gatctcattcacttttcatgcccctttgaaaccgtagtaaaatcattgta
agtctcttaacagatctcattcactttcaTGCCCCTTGAAACCgtagtaa
aatcaattgtaagtctcttaacagatATCATTCACTTTTccatgcccctt
tgaaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattcact
tttcatgccccattgaaaccgtagtaaaatcaattgtaagtctcttaaca
gatctcattcactttccatgcccctttgaaaccgtagtaaaatcagttgt
aagtctcttaacagatctcattcacttttcatgcccctttttgaaaccgt
agtaaaatcaattgtaagtctcttaacagatctcattaCAAACTTACGAT
GTTTACTTCTacggatttgaggaaaattatacaaATCTTTTTATGAATCG
TTGGAAAATGAGCACTTTCAAATGAATGTGACttataggttaaaaatatt
cccCTAATCCATTATGCTCTTCTCTACTCTCtaagaatattcaataaaaa
gttcaataatcGTTTTTGCTCGGGAAAGTTTGTCTGCCTTAAAAGCATTA
AGTATTTTTAGTTATTagggttttttttgttttgaacttgttttacttcc
ggtttcgaattccttgagttcgaaatcgaacttttgaatctttaatttcg
aacgttcgaattataaaaagcaCATTCGAAAACTCTTTTTCCAAAATACA
AGTTTTTGACAAACCCCTTAACGAAAGAACTAACATAAACACGTACCCCT
GCTGGAAAACTTGGGAAAATTTCGTCTCTGGTGGAGAAATTACCCTCTAg
cttcttcaaaaagtttccctTGCAGAGCGAGACCCTAGAGgcaacaaaat
taaacaaacttcAGACATCACCcggtttattgagacagggatgtgaaata
cagagaatttcaagactagaatttaatggaaataaaccagctgcgctgga
agctccggcttaagagattaaaagatgtgaaagatgagcttgcccacaaa
ctgctaatcagaacagatcagaaagcaaagtaataattctattgcagagc
gagtatgagaaataatcttaacgaataaataaaccagctggaagttaagc
tcttctaagtgattccacatgcactttcttgcctaaagaaccaacaccac
cccccgcccactcatcctcgactaaaaagttcaaaattggagctaaatga
gataaacatttagaagtcaatatttccaagttcttgatttgattgtccag
ataaaatttcggggagaaaaatagcctaaattagaggccacaggCTTTTa
cctaagcattattttttctgttgggataatacttgggggagagtaggata
aaccaagtaaaatggtacaatagtgtgtatgtaataaatagtggtatatt
tggaaaaaacctgtttcgggtttaaaaaatcttcaaaaggaacggtcgcc
ccagccaatgaaattacgacaaagtccaaaaaatatcattttcagttata
acactgtgaagatttctccgatcttgttcaaatttacacaggaattgtgt
tttagtatcctttactgaattctcatagtgatatgtttgtaaaaaatctg
tgtcgggtttgaaaaatcaaaggaacggtcgccagccgcgatgaaattaa
gaccaagtccaaaaacgatcattttcagccatactgtgaaaatttctccg
atcttgttcaaatttacacaggaattgtttttttgtatcctttactgaat
tctcatagtgatatgtttgtaaaaaatctgtgtcgggtttgaaaaatcaa
aaggaacggtcgccagcagtgatgaaattacgacaaagtccaaaaacgat
cattttaagccataatactgtgaaaacttctccaatcttgttcaaattta
cacaggaattgtgttttagtatccgttatttaattctcatagtgatatgt
ttgtaaaaaatctgtgtcgggtttgaaaaatcaaaagaaggaacggtcgc
ccagtcaaaaaatgatgaatgcaaaacaggatcattttcagccatacaca
taacaccactaaaactgctcagatcgttttcaaatttgcactgtaatgtt
gtaattttagtattctctttctaattccaatggatgtgtgtttgaaagtt
tcattccattgtcaagttgtagagttttatggttttgaaGATTTAAGCAC
TCTACTACTAGCAGCTGACAATTCATGGCCAAAacttctccaaagtcttt
ccacattgttatagaccagtatgcatcaaaattctcataaatcatgtcaa
aaacatcatgaataatgatgaaaatgatcactatctttcactgagatttg
cagctAAGCCCACACAGCCATCTTTATACTTtcgcaatattatcgaaatc
cagataatccgtttttattaaatcggaatagatcatcggattagataaac
aaaaaaaaatgtcttgaccttgAACGtcgttgtcggaagagagaattaaa
ggctcctaggccggagcaataagTTGACTTatgcaatttcaaaattcaat
aatcatAATCAATTAGGAATATCGTTTAATTGCatcataaattctgaaaa
ttttaaacaacgttctaaaattatattaaaactattagcgctgtaaaatc
ctgagatgaaaataaagaaaaaaccagataaaaagtaaagatCTGAGTTT
TTGAAAGTATTCTTCAACGGTTCTACTAAGCAAAAATCTCTAAATTTTAC
TGGgtgtgtatttttttcaaagttgggaaatcTTAAGGCTCTTAAAAAAT
CTTAAGTATGTTGGAGACAAATATGACAAGACTTTTACCCTTGAGTTGct
gacaaacaggagcaaactcttcacataaaaaagtaaaaaaaaatctgtga
cttttttctcggctgtagGCTGTATTAATTGTAgcacagaaatttaaaac
agttaaagtgcatcataaaaataatgtcaagttttgtcgatgtattttga
cattttacaagtcattaccattatcattatcaacaataaaatcctttaaa
atacaATCACATGTCAATGTTCTATTTCTCTGACCACCAATGTGTATTCA
TAAACAACACTGTTCTTTTTTACGacgaagtaaaaaataataaacgatgt
agaatgaaaacgttttcatttttcatcgcttattttttttcgccctatcg
caaataaaacaataggtttttaattccagacatctgtctggatttatttt
ttgcgacaAACAAATTCGCGATGAActtattttttccagtggacACCCGG
CTTAAAAGTCCAAATTCATGTTGTGCTCTCTACTACCAAGAATCAAAATC
CAATCATCCAAGGAATGGCAGGAATGGTTCTCCCACCATCATAATACAGT
TCATTTTCAGCTTTGAGCCTCTTTTTGCAACGAAGCAACAACTCTGTTGA
GGCTGCTGTCCTGttgatgaaacaataaaaattccatcttctttctttct
cattccacagtttcagctgctttcttcatttcttttcatcaagcaccgtc
tcttttcaatttcaaaacaacaatgatttatttttcaaagacagagtcaa
cattcgaattcagagtcaacattcgaattcagagtcaacattcgaaaGTC
TTTGCCCGAGTCAATGCAACGACTCCTTGAAAAACGAGCGtttgaacgct
tcttgaacgCTTCCATCCCCCGCTGATTTTTCGATCTCTTCtttaaattt
cctaatttaaacatTAGGGAGGTAATCGAAACAGAAACTCAAGGCAAGAT
TATCTCCGTAATATTTTAGATCTGGTATACATCCTCTATACTAGAAACCA
ATTTTCCAAATCTACGGAAGCGACGGGAAGCAATGTATGAGAAAGTGCCG
TCTGACGGATCGAAATGATGTTTTCGGTACCGTAGAAAACGCACATCAAG
TTTTCCTTGGCGCTCCCCTGGTATATAGAATTCaaaggtacatgcacacg
atagcaaaactacttcgctcatgtatattcgcttcgcaaaaagatAGCAA
AGGagttttcgaataaattcacttaatagaatgtcttcatttaaaaatag
aagcactcgatttcattcaaaaagaaaaagacattcttttttttatgtaa
gtcttttttaagtgttgttgaacattatagtaaattatattcactttttt
gaatatattttttggaataaagtcacttttggtttttgttatgaaccagc
actcctaaatactcctccgtatggatgtttgtgccaatgctagatcagca
tttcataaatataccatgcgtcgttcccttAATACTAATACTACCTTTTC
TGCTGTACTTTACTGTATGGTCAGACTTTGTGCctatgttttaatttctt
tcttcctGTTAAGCTGACAGATGACTCTAGAGTGGCAGGAGATGCTTACT
CAAGGTACCGcacctgatctcagacttcggtcttcagcttatcacttcct
tttgtttttttttttgttgtttttttcttcaaaaatgtaTATTGGGTTTT
TTGTTACAGATTGTCATGGTTAGTCGCTAGTTTTTAGCTTCTCCAGTGTA
TATAACTTCACTTTACTTCTTTTATTTCTTACCTACAGACATTTGGTTTA
TCTGAAGAAAATTACGAAGCATCTgaaaaacgtttgaagaagctgagaga
ggaagaagaaaaattgtgcgaagaacgaaaaaaTTTCACTGATTACGTTC
TCAAAGTTTCTAAAGAGGTACgtgggtgggtgggtgtgggtggttgtggg
tgtAGGCTCATATTTCTAAGTTCTTTCAAGCTAGTAAATTTAGCGTGCAT
AAAATTTTCGTGAATGGATTTAAATGTCTGCGAAAAAGAGGTTAATTcgt
gaaaataattgaaatttttgatgcAGCAAAAAATCTATTCCCGCGAGATA
AACTTTTTCTGACGAGTTTTAAACTATATTCCATCAATAAAAAAGCGAAA
TTTCGGGAATCCACAGACCCACGAAATTAACAGGGCTCCCACAGCTCCTC
TAATCTCCTCAATTctccttaaatttcaaatgtcTCCTAAAATCTCctac
tttttctcgaatttctccaatattttcttcaaatctcCTCAATTAAGTtt
gaccaaaaataaaaaacgttcAACGTAATATCGCTGGCCCTCTAGATGTT
TCGAAAATTGATTATcaagaataaaatgaaaaattttttgctcgcttcgc
tctcACATTTCTTTACTCTAATATCATGTTTCCATTTCCTCATTGCTCTT
CAATAACTCGAAATTAAGAAGTTCTGCTAAGGACAGGGGGCCACGACCCC
ACAACAGAGtttttttAAAAGGGCGAAATCAATTACgaagtaaaagttta
gaaactctGGGGGTGGGGGtgttatttaaaaaagactATTGACCGCTAGC
CGCTTGGTTCATGCTGTTATAACATGTCtacatttaaaaatgttttcagg
TTTTTGTAGTTTTACACTTAGAGCCACTGCTCCCCTCTAAGGATAATTAc
ctatccccccccccccaagaagGAGACTTTGGTAAACCTTTAATtcgtaa
aaagttttttacaataAAGGAGACAAtctcaaaagatttttgtgcTTCTT
TAAAGGTCATTTTCAGGAAGAGCCACGCCCCTATGGCATGTGTGGATCAT
GCCGATGTAAAACattatccaatttttttattGGACAGTGCAGTGTTGct
tttttaacaacaaaaagtATCATTTTAACTTGGAAAGAAAATCTcctcaa
tttttctaaaaatatatgaaaaactcctcaaatttttacagaaatctcct
caaaaaagtggaaaatcctccTTAATTCTCCTCAATTCgccttaaatttg
aaattttgaaagctgtGGGAACCCTGATTAATCAGGATTTGTAACAGTTA
AATCCTATTAGCCCcaacaaaaatcgaaaaagctTAAAAGGGGTTAAAGT
ATTCtgattttatttctcaaaaccatgtttgattttttctttccagCGAG
AGGAATTCGAAAAGGAGCGTGTTGAATTTTATATGCATTGTATATCCACG
CCCGTCCTTAACAAAGATAAGAAATTAAACCCAAGAAGTGGTAAGTTTTA
TATGCATTGTATATCCACGCCCGTCCTTAACAAAGATAAGAAATTAAACC
CAAGAAGTGGTAAGTTTTAAGTTGTATATCAGTCCTTAACAAAGAAAGTG
GTAAGTTTTATATGCATTGTATATCCACGCCCGTCCTTAACAAAGATAAG
AAATTAAACCCAAGAAGTGGTAAGTTTTATATGCATTGTATATCAACACC
CGTCCTTAACAAAGATAAGAAATTAAACCCAAGAAGTGGTAAGTTTTATA
TGCATTGTATATCTACGCCCGTCCTTAGCAAAGATAAGAAACTAAACCCA
AGAAGTGTTGAATTTTATATGCATTGTATAACCACGCCCGTCCTTAACAA
AGATAAGAAATTAAACGCAAGAAGTGGTAAGTTTTAACCATCATTGGCTG
TACATGACCGAAATCTTAAGGAGCGTACGGGGCTTGctatttccgaaata
ccgaataattttgctaaaatttccgaaattccgtaaaaaaatacttgcaa
tttcgaTACCGACttttttgggtatatttccttgttttgattaatttttc
atcaaatttgttttttcatgtataaattccgaaaaagggggataaaaact
ttataataccgaaattccgaagcaaaaattcttggatttccgataccgaa
gcaatttcagcattccgaaataccgaaggaattttgcccgatttccgaaa
ttctgaagaaaaaaggctcgatttccgcaataccgaaataccgtacgccc
ccaccTTGAGGTTTTGCTCAAATCTCGAACTTGTCGCAAAATTCGACGTC
CCTTGATAGAGGATGActtataaatttattgttaCCAGTTCTCGTTCTTG
TTTGtaactttattttaatttaattcatATTCATTTATTACAGTGGCCCC
TGGCGGAGACAATGGCTGAGCTGCCTAAAAAACTACCACTCAAAACATTA
GATATTGTTATTGTTGTTATAGGAATCTCAACCAAACATAGTCTTCGTAT
GGCAACGCCCGCTTTCAGCCCTGCACCTTCAACTTTTGCATCATCCAAGA
AGGAGAGATTACCAACTTCAAAACAAATGCCCTCCACCGCAGAACTGTAC
CGTTTCATGTCATTGAATTACGATGGATCTGTGTCAAGGAATATTGATCG
gtaattaccttatcggccaaaacttagtcggtcctaagtgacgaaatttt
ggcttggtgactaaaaattagggccgactaaaaattttggccaaattaaa
agtttatgatGAAGTTTTCCTTAACCAACTTTTTTGAGTACTACATCATG
GTAATTTATTAATTCGTCCGCTATTATTCATTATATATTAGTCTGCCCTT
actgactaaattttgacgaggtgactaaaattagggccgaacGGAAAATG
TTATGTTGATACATCACGCTGaaaaaaaaaGTGGtcacgtctagtatagg
ctagctTTTTGTTTTAGATATTGATGTCGAAGccagggcccacgccatga
aattgaaagtggagGCCAATGATTAAAGAGTCTAAGTAGGCGCAACCAAA
AGATTTTACTTCTCAAAAAAGTGGGCCCTGGAAGCTCAATtgtcttttct
ccttttttctagaaatttaaACGGTTCATTCGTCCAAGCAGATATCTCAC
CTGATGGTTCACCCTCTCCCAAAAAGTTACACGAGCACGCGGAAAATATT
CGTCGCGCGGTCGAAGAGCATCACAATAAAAGTATTGAAGAGAGTGTCAC
TGAACTACAAAAAACTCCTAGATCACACACAAGCTCAAACACTGGATTTA
GTGGTGGCGAAATTCCGTTCTATTTAATGGAGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000448_pilon:119668..130152+ >XLOC_037908 ID=XLOC_037908|Name=XLOC_037908|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1728bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000448_pilon:119668..130152+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAACAATCTCCGACGAAAGACGAGAAATCATCACTCACCATCAACCCTTC
TTCAACAGATGAATTGCAACAAAGGTTGGAACAATGCAAGGCTGTCATCA
CTGGACAAGAGGCTATCATACAAGAACAATCTCCGACGAAAGACGAGAAA
TCATCACTCACCATCAACCCTTCTTCAACAGATGAATTGCAACAAAGGTT
GGAACAATGCAAGGCTGTCATCACTGGACAAGAGGCTATCATACAAGAGC
TGAAAGAAGGCTATTCGCAAGAAGCTTTTGAAAGAGCATTGTTGGAGCTG
AAAGAAGGCTATTCGCAAGAAGCTTTTGAAAGAGCATTGTTGACATTTGG
TTTATCTGAAGAAAATTACGAAGCATCTgaaaaacgtttgaagaagctga
gagaggaagaagaaaaattgtgcgaagaacgaaaaaaTTTCACTGATTAC
GTTCTCAAAGTTTCTAAAGAGACATTTGGTTTATCTGAAGAAAATTACGA
AGCATCTgaaaaacgtttgaagaagctgagagaggaagaagaaaaattgt
gcgaagaacgaaaaaaTTTCACTGATTACGTTCTCAAAGTTTCTAAAGAG
CGAGAGGAATTCGAAAAGGAGCGTGTTGAATTTTATATGCATTGTATATC
CACGCCCGTCCTTAACAAAGATAAGAAATTAAACCCAAGAAGTGGTAAGT
TTTATATGCATTGTATATCCACGCCCGTCCTTAACAAAGATAAGAAATTA
AACCCAAGAAGTGCGAGAGGAATTCGAAAAGGAGCGTGTTGAATTTTATA
TGCATTGTATATCCACGCCCGTCCTTAACAAAGATAAGAAATTAAACCCA
AGAAGTGGTAAGTTTTATATGCATTGTATATCCACGCCCGTCCTTAACAA
AGATAAGAAATTAAACCCAAGAAGTGGAATCTCAACCAAACATAGTCTTC
GTATGGCAACGCCCGCTTTCAGCCCTGCACCTTCAACTTTTGCATCATCC
AAGAAGGAGAGATTACCAACTTCAAAACAAATGCCCTCCACCGCAGAACT
GTACCGTTTCATGTCATTGAATTACGATGGATCTGTGTCAAGGAATATTG
ATCGGAATCTCAACCAAACATAGTCTTCGTATGGCAACGCCCGCTTTCAG
CCCTGCACCTTCAACTTTTGCATCATCCAAGAAGGAGAGATTACCAACTT
CAAAACAAATGCCCTCCACCGCAGAACTGTACCGTTTCATGTCATTGAAT
TACGATGGATCTGTGTCAAGGAATATTGATCGaaatttaaACGGTTCATT
CGTCCAAGCAGATATCTCACCTGATGGTTCACCCTCTCCCAAAAAGTTAC
ACGAGCACGCGGAAAATATTCGTCGCGCGGTCGAAGAGCATCACAATAAA
AGTATTGAAGAGAGTGTCACTGAACTACAAAAAACTCCTAGATCACACAC
AAGCTCAAACACTGGATTTAGTGGTGGCGAAATTCCGTTCTATTTAATGG
AGTAGaaatttaaACGGTTCATTCGTCCAAGCAGATATCTCACCTGATGG
TTCACCCTCTCCCAAAAAGTTACACGAGCACGCGGAAAATATTCGTCGCG
CGGTCGAAGAGCATCACAATAAAAGTATTGAAGAGAGTGTCACTGAACTA
CAAAAAACTCCTAGATCACACACAAGCTCAAACACTGGATTTAGTGGTGG
CGAAATTCCGTTCTATTTAATGGAGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000448_pilon | genome | sc0000448_pilon:119668..130152 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 643-864:10264 |
| Aaloc | 466-639:9625 |
| Aaloc | 301-462:8547 |
| Aaloc | 172-300:7139 |
| Aaloc | 124-171:423 |
| Aaloc | 1-123:1 |
|
