XLOC_037858 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037858
Unique NameXLOC_037858
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037858 ID=XLOC_037858|Name=XLOC_037858|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3768bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAAAATGTTGCTGTCAAGTTCAGCAAAGATATGTTTTCATAATATT TGCACATTTTGGATTTTTCCTCATCTATGCGAGTCGTATGAACCTCAGTG TCGTATTGGTAGCAATGGTTAATTCAACTTATGCTCATGTAAAGCCATCA AATGACCCAGAATGTCGAAGAATTGCAGGAAATAATACTATCCCACATAA TGTAAGAGATTTCCCAACTGTCACACAACGTTGTTTCAACGTTTATCTAA CGTTCACAATGTCCATATAACGTTAGATCAACGTTGAAACAACGTTGTGT GCCAGCTCGGTTGAACTACACACTATGCTGCCTATACCGTTTTCTTATGT TGAGAGGTTCTTAGTCCCCAATTTGTGAGTATTTTTGTGTAATTAGGTGA TTAAGAGTTCATAAAGCCGTGAAATGTAAATAGCTAATTACCGTATTACT TTAAAAAAAAGCTCCTTTTTTAAACGCCCTTTCCCGTCAAATAAGCGCCC CCTCCAAAAAACCAAAAAAATAATAAAGCTTTATTCGAAGTAATATCGCG TGTGATTCTCTGATGGCGTAATTTTCATCTTTCTAAATTGCGCAATATTT CATATTGTCAATTCTGAACTCTGTTATTTTCGCATCACTTTACATTATTT TTCAGAATGGCAGATTCAACTGGGATCAAAGCCAACAAGGTTAATTCCAA TTTATGACTTATTAACCTATCAGCCCCTTAACAGCGCGGTCGGCTTGTTA GAGGACTGGTAATAATCTTATAAGGAAAATCTTTTCTCGGCGCACGGCAT TTTTAGTCTGCCTCGATAAACAAAAAAAATAAAATTCCCGCTAAAACTAT ACTCCATGCGAGAGACATTTTCTCGAGTCCGTTTCCTAATAACAACTCGA TAAAGGTATGAAATAAAAGTTCCCTGGATGTGTTGAAAAGTGCCAGAATG AGGGCTAGAAAAGAGAATAAGGAACTTTAAAAAATATTTTCCAATAAAAA ATTATTGTGTCGTAAGAATAAGAATGTCCCGGTTGAAATGTTCAGAAAGA TTAATTAGGGTTAACCACTGAACCTTAGACCAAGTTTCTGAATCCCGGCA AAGCAAAATTTTTGATCGGAGTTCTTTTGAGAGTGGTACCCTAATTTTCC TCCAATCTTTGTGATGGTGAAGCGCCGTTTGACGTTGATTTTTAAACACT GGAATGGCTTCTCCGATCAAAGATTGCGAATTTAACTTTCTCCAGAGTTT ATAAATGTCAGTGGGGTGAACCTTTTGGTACAGTAGCTCCATATACTACT TTCTTTATAAATACTTCTTTCATTTTTACCTTTTTAGGTGTAATTTTGAG TAGTTTTTTCTACGGTTACATTTTAACACAAATATTTGGTGGCTGGGTGT CACTTCGTTACGGTGGCCGTAAAGTGTTTGGATGGTCGCTAATGGCAACC TCAATATTGACATTACTAACACCTGTGGCATCTCGAATAAGTTATTTTTG TTTGGTGACAGTCAGAGTCCTTGAAGGTATTGTTCAAGTAAGTTCCCTTT AACTTTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTTAACGTTCAAATAACGTTAT TTGGACGTTGTGAATGTCACATGGACGTTGTTTTGACGTTGTGTGCCGTC TGGGTTGGGATGAGCTGAGATTTTTATAAGATATCTCAGTATTTAGTCAT TAGAAGTAAATACATGTTGACGACCAATAGACCGACCAACAACGGTAAGG GTCCAGTGAGCACTTAGTGAGGTCCCTTATCTTGAAAGAAAGACATCAAA AACCCAAATAAGAAAAAAAACTACTTGGAATCGAAAAATATAATCAAGAA TGAGGAACCGATATAAAAATGGCGGAAAGTTTTACGTTCCACCTAAGCAA AAAATTTAAAAATTGAGAACTATAATATACTAAATGGTCGCTTAATCGCG CCATCTAGTCTATTAAAAAGCTTTAATTTATGGATTTCAAGCTACTAGAG ATTGGATGAATTTTGTTAATGTTGTACCATCCACATCATCCACCAAAACG TCAATACCGTTCTACCTCGAATAAACGCGCTATCTAATTCGATTTTCAAG GGGATTGGATTTTTACCGAATAAGGGAGCGTATCGAATGGTAGAATGTCG TTAATGAGAGTTTCCTGATGACGGTGACTTTCAATATAAACATTCGATCT CCCAGGTCTAGTGCAAATAGAAAAGGGGATACAATTAATCACTCCCGGCT CCGCCGACAGGCACCAGATGTACTTACTATATACTATACTTATACTTATT ATTTCTTTGTCATAGGGTGGTCTCTTTTCAGCGTTGAATCAGTTGGTATC ACAATGGGTTCCACAATCTCAAGTCACATCTTTCTTTGTTGTTGTGTATG CAGGTAGAGTTGTCTCTTTCTAATTCGATATTCAAGTGACCAAAACTTTT CTTCGAATTAGAGAATGATTTGTATAATAAAGGACCTTTCTACTTTCCCA CTGAGCGGAGTCAACGCTTTGATTCGAATTATAGATGTTCGAAATATAGA GGTTCAAATTAAAGAGACTTGACTTGGATCAGCAACAAGTCAATTTAATG CACCTATCAACCCTTGACTGCGCGGTTGGGTTTTGAGGAGACTGGTAATG AATTTACAAGGAAATGACGTCTCTAAACTCATTGTTTAAGAAAATGTCAA TGCAACGACTTCAGACATTTTGACGTCATTCCTTCATTGTAAGCTCGAAC CCAGTCTCCCCCACACTTTAAAGATTTTTTACAACGAGACAGTCAATTAT CAAATCTTACTCACTTTGAAGGTATGTCAGGGTGTGCTGACAACGTCTCC TGAAAAACAGTATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCGTTCCACC CAAAAGTGACGTAATGACTGCTTTTACGTCACTTTCAACCAATCAGCTAT TGGGTGGAACAGAAGACATTGCAATGGTGCATATCATGAATTGGAACTCA AACATGGAATCAGATTTGTTCGAATTACATGGAGATCCAAGAGATTTTCT CCTTGGCGGGGACTGGAAACAAGTTCGAATAAGTAAGAGTTTACTGTAAA TCTTGGACTCCTTTTTTTTTCATGATACAGGTTTACAATCAGGATCAGTG GTAGCTTTGTCAACTTCTGGTTACCTTGCCGACTCGTCTTATGGATGGCC TTCTTCCTTCTACTTATACGGTATGCTATATATACAGTGTGTCCCGAAAA AGCAGACAAATTGTTATATAAAATAATATCCAATGTATGTGCCCTCCCGG TTATTACCATTATGGCTTTTTGGCAACTCCTGAACTTGGGCACAGGATGT ACGGTTACACATTTTATGGATTGCATTGTGGAGTCACAAAAATAAAATCC TCATTATTTATGTAAAGTTTTATGACTTTAATATATTCAACGCTCTGGGG TCTGTACATTTTTAACATTACTCGCGAGGGAAAAATATATCTTTAAAAGT ATATGGTCAGCTTCCAAATAATTGACGATCTGTACATTTTGTTAAAAATT GCTTGTGAGGGAGGGAGTACATTCAACTCTCTCTCTAATTCGACTCGAAC GCTATCTCCCTGTTCAAGTCGACGCTCTAACTGAAAGCTGACAGGATGAA ATTCCTTACTTTTTCTATATTTTCATTCATAGGAGGGTTATCTTTCATTA TGTCAGTATTATGGTTCATATTTGTTTACGATTCACCATCTCAGCATCCT TTCATATCTGATGAAGAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878-

>XLOC_037858 ID=XLOC_037858|Name=XLOC_037858|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1398bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAAAATGTTGCTGTCAAGTTCAGCAAAGATATGTTTTCATAATATT
TGCACATTTTGGATTTTTCCTCATCTATGCGAGTCGTATGAACCTCAGTG
TCGTATTGGTAGCAATGGTTAATTCAACTTATGCTCATGTAAAGCCATCA
AATGACCCAGAATGTCGAAGAATTGCAGGAAATAATACTATCCCACATAA
TATGACAAAATGTTGCTGTCAAGTTCAGCAAAGATATGTTTTCATAATAT
TTGCACATTTTGGATTTTTCCTCATCTATGCGAGTCGTATGAACCTCAGT
GTCGTATTGGTAGCAATGGTTAATTCAACTTATGCTCATGTAAAGCCATC
AAATGACCCAGAATGTCGAAGAATTGCAGGAAATAATACTATCCCACATA
ATAATGGCAGATTCAACTGGGATCAAAGCCAACAAGAATGGCAGATTCAA
CTGGGATCAAAGCCAACAAGGTGTAATTTTGAGTAGTTTTTTCTACGGTT
ACATTTTAACACAAATATTTGGTGGCTGGGTGTCACTTCGTTACGGTGGC
CGTAAAGTGTTTGGATGGTCGCTAATGGCAACCTCAATATTGACATTACT
AACACCTGTGGCATCTCGAATAAGTTATTTTTGTTTGGTGACAGTCAGAG
TCCTTGAAGGTATTGTTCAAGTGTAATTTTGAGTAGTTTTTTCTACGGTT
ACATTTTAACACAAATATTTGGTGGCTGGGTGTCACTTCGTTACGGTGGC
CGTAAAGTGTTTGGATGGTCGCTAATGGCAACCTCAATATTGACATTACT
AACACCTGTGGCATCTCGAATAAGTTATTTTTGTTTGGTGACAGTCAGAG
TCCTTGAAGGTATTGTTCAAGGTGGTCTCTTTTCAGCGTTGAATCAGTTG
GTATCACAATGGGTTCCACAATCTCAAGTCACATCTTTCTTTGTTGTTGT
GTATGCAGGGTGGTCTCTTTTCAGCGTTGAATCAGTTGGTATCACAATGG
GTTCCACAATCTCAAGTCACATCTTTCTTTGTTGTTGTGTATGCAGGTTT
ACAATCAGGATCAGTGGTAGCTTTGTCAACTTCTGGTTACCTTGCCGACT
CGTCTTATGGATGGCCTTCTTCCTTCTACTTATACGGTTTACAATCAGGA
TCAGTGGTAGCTTTGTCAACTTCTGGTTACCTTGCCGACTCGTCTTATGG
ATGGCCTTCTTCCTTCTACTTATACGGAGGGTTATCTTTCATTATGTCAG
TATTATGGTTCATATTTGTTTACGATTCACCATCTCAGCATCCTTTCATA
TCTGATGAAGAAGAGGGTTATCTTTCATTATGTCAGTATTATGGTTCATA
TTTGTTTACGATTCACCATCTCAGCATCCTTTCATATCTGATGAAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037858XLOC_037858-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000008_pilongenomesc0000008_pilon:670111..673878 -
Properties
Property NameValue
Aaloc616-699:85
Aaloc526-612:637
Aaloc436-522:1454
Aaloc238-435:2430
Aaloc202-234:3114
Aaloc1-201:3769