|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037858 ID=XLOC_037858|Name=XLOC_037858|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3768bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGACAAAATGTTGCTGTCAAGTTCAGCAAAGATATGTTTTCATAATATT
TGCACATTTTGGATTTTTCCTCATCTATGCGAGTCGTATGAACCTCAGTG
TCGTATTGGTAGCAATGGTTAATTCAACTTATGCTCATGTAAAGCCATCA
AATGACCCAGAATGTCGAAGAATTGCAGGAAATAATACTATCCCACATAA
TGTAAGAGATTTCCCAACTGTCACACAACGTTGTTTCAACGTTTATCTAA
CGTTCACAATGTCCATATAACGTTAGATCAACGTTGAAACAACGTTGTGT
GCCAGCTCGGTTGAACTACACACTATGCTGCCTATACCGTTTTCTTATGT
TGAGAGGTTCTTAGTCCCCAATTTGTGAGTATTTTTGTGTAATTAGGTGA
TTAAGAGTTCATAAAGCCGTGAAATGTAAATAGCTAATTACCGTATTACT
TTAAAAAAAAGCTCCTTTTTTAAACGCCCTTTCCCGTCAAATAAGCGCCC
CCTCCAAAAAACCAAAAAAATAATAAAGCTTTATTCGAAGTAATATCGCG
TGTGATTCTCTGATGGCGTAATTTTCATCTTTCTAAATTGCGCAATATTT
CATATTGTCAATTCTGAACTCTGTTATTTTCGCATCACTTTACATTATTT
TTCAGAATGGCAGATTCAACTGGGATCAAAGCCAACAAGGTTAATTCCAA
TTTATGACTTATTAACCTATCAGCCCCTTAACAGCGCGGTCGGCTTGTTA
GAGGACTGGTAATAATCTTATAAGGAAAATCTTTTCTCGGCGCACGGCAT
TTTTAGTCTGCCTCGATAAACAAAAAAAATAAAATTCCCGCTAAAACTAT
ACTCCATGCGAGAGACATTTTCTCGAGTCCGTTTCCTAATAACAACTCGA
TAAAGGTATGAAATAAAAGTTCCCTGGATGTGTTGAAAAGTGCCAGAATG
AGGGCTAGAAAAGAGAATAAGGAACTTTAAAAAATATTTTCCAATAAAAA
ATTATTGTGTCGTAAGAATAAGAATGTCCCGGTTGAAATGTTCAGAAAGA
TTAATTAGGGTTAACCACTGAACCTTAGACCAAGTTTCTGAATCCCGGCA
AAGCAAAATTTTTGATCGGAGTTCTTTTGAGAGTGGTACCCTAATTTTCC
TCCAATCTTTGTGATGGTGAAGCGCCGTTTGACGTTGATTTTTAAACACT
GGAATGGCTTCTCCGATCAAAGATTGCGAATTTAACTTTCTCCAGAGTTT
ATAAATGTCAGTGGGGTGAACCTTTTGGTACAGTAGCTCCATATACTACT
TTCTTTATAAATACTTCTTTCATTTTTACCTTTTTAGGTGTAATTTTGAG
TAGTTTTTTCTACGGTTACATTTTAACACAAATATTTGGTGGCTGGGTGT
CACTTCGTTACGGTGGCCGTAAAGTGTTTGGATGGTCGCTAATGGCAACC
TCAATATTGACATTACTAACACCTGTGGCATCTCGAATAAGTTATTTTTG
TTTGGTGACAGTCAGAGTCCTTGAAGGTATTGTTCAAGTAAGTTCCCTTT
AACTTTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTTAACGTTCAAATAACGTTAT
TTGGACGTTGTGAATGTCACATGGACGTTGTTTTGACGTTGTGTGCCGTC
TGGGTTGGGATGAGCTGAGATTTTTATAAGATATCTCAGTATTTAGTCAT
TAGAAGTAAATACATGTTGACGACCAATAGACCGACCAACAACGGTAAGG
GTCCAGTGAGCACTTAGTGAGGTCCCTTATCTTGAAAGAAAGACATCAAA
AACCCAAATAAGAAAAAAAACTACTTGGAATCGAAAAATATAATCAAGAA
TGAGGAACCGATATAAAAATGGCGGAAAGTTTTACGTTCCACCTAAGCAA
AAAATTTAAAAATTGAGAACTATAATATACTAAATGGTCGCTTAATCGCG
CCATCTAGTCTATTAAAAAGCTTTAATTTATGGATTTCAAGCTACTAGAG
ATTGGATGAATTTTGTTAATGTTGTACCATCCACATCATCCACCAAAACG
TCAATACCGTTCTACCTCGAATAAACGCGCTATCTAATTCGATTTTCAAG
GGGATTGGATTTTTACCGAATAAGGGAGCGTATCGAATGGTAGAATGTCG
TTAATGAGAGTTTCCTGATGACGGTGACTTTCAATATAAACATTCGATCT
CCCAGGTCTAGTGCAAATAGAAAAGGGGATACAATTAATCACTCCCGGCT
CCGCCGACAGGCACCAGATGTACTTACTATATACTATACTTATACTTATT
ATTTCTTTGTCATAGGGTGGTCTCTTTTCAGCGTTGAATCAGTTGGTATC
ACAATGGGTTCCACAATCTCAAGTCACATCTTTCTTTGTTGTTGTGTATG
CAGGTAGAGTTGTCTCTTTCTAATTCGATATTCAAGTGACCAAAACTTTT
CTTCGAATTAGAGAATGATTTGTATAATAAAGGACCTTTCTACTTTCCCA
CTGAGCGGAGTCAACGCTTTGATTCGAATTATAGATGTTCGAAATATAGA
GGTTCAAATTAAAGAGACTTGACTTGGATCAGCAACAAGTCAATTTAATG
CACCTATCAACCCTTGACTGCGCGGTTGGGTTTTGAGGAGACTGGTAATG
AATTTACAAGGAAATGACGTCTCTAAACTCATTGTTTAAGAAAATGTCAA
TGCAACGACTTCAGACATTTTGACGTCATTCCTTCATTGTAAGCTCGAAC
CCAGTCTCCCCCACACTTTAAAGATTTTTTACAACGAGACAGTCAATTAT
CAAATCTTACTCACTTTGAAGGTATGTCAGGGTGTGCTGACAACGTCTCC
TGAAAAACAGTATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCGTTCCACC
CAAAAGTGACGTAATGACTGCTTTTACGTCACTTTCAACCAATCAGCTAT
TGGGTGGAACAGAAGACATTGCAATGGTGCATATCATGAATTGGAACTCA
AACATGGAATCAGATTTGTTCGAATTACATGGAGATCCAAGAGATTTTCT
CCTTGGCGGGGACTGGAAACAAGTTCGAATAAGTAAGAGTTTACTGTAAA
TCTTGGACTCCTTTTTTTTTCATGATACAGGTTTACAATCAGGATCAGTG
GTAGCTTTGTCAACTTCTGGTTACCTTGCCGACTCGTCTTATGGATGGCC
TTCTTCCTTCTACTTATACGGTATGCTATATATACAGTGTGTCCCGAAAA
AGCAGACAAATTGTTATATAAAATAATATCCAATGTATGTGCCCTCCCGG
TTATTACCATTATGGCTTTTTGGCAACTCCTGAACTTGGGCACAGGATGT
ACGGTTACACATTTTATGGATTGCATTGTGGAGTCACAAAAATAAAATCC
TCATTATTTATGTAAAGTTTTATGACTTTAATATATTCAACGCTCTGGGG
TCTGTACATTTTTAACATTACTCGCGAGGGAAAAATATATCTTTAAAAGT
ATATGGTCAGCTTCCAAATAATTGACGATCTGTACATTTTGTTAAAAATT
GCTTGTGAGGGAGGGAGTACATTCAACTCTCTCTCTAATTCGACTCGAAC
GCTATCTCCCTGTTCAAGTCGACGCTCTAACTGAAAGCTGACAGGATGAA
ATTCCTTACTTTTTCTATATTTTCATTCATAGGAGGGTTATCTTTCATTA
TGTCAGTATTATGGTTCATATTTGTTTACGATTCACCATCTCAGCATCCT
TTCATATCTGATGAAGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878- >XLOC_037858 ID=XLOC_037858|Name=XLOC_037858|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1398bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:670111..673878- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGACAAAATGTTGCTGTCAAGTTCAGCAAAGATATGTTTTCATAATATT TGCACATTTTGGATTTTTCCTCATCTATGCGAGTCGTATGAACCTCAGTG TCGTATTGGTAGCAATGGTTAATTCAACTTATGCTCATGTAAAGCCATCA AATGACCCAGAATGTCGAAGAATTGCAGGAAATAATACTATCCCACATAA TATGACAAAATGTTGCTGTCAAGTTCAGCAAAGATATGTTTTCATAATAT TTGCACATTTTGGATTTTTCCTCATCTATGCGAGTCGTATGAACCTCAGT GTCGTATTGGTAGCAATGGTTAATTCAACTTATGCTCATGTAAAGCCATC AAATGACCCAGAATGTCGAAGAATTGCAGGAAATAATACTATCCCACATA ATAATGGCAGATTCAACTGGGATCAAAGCCAACAAGAATGGCAGATTCAA CTGGGATCAAAGCCAACAAGGTGTAATTTTGAGTAGTTTTTTCTACGGTT ACATTTTAACACAAATATTTGGTGGCTGGGTGTCACTTCGTTACGGTGGC CGTAAAGTGTTTGGATGGTCGCTAATGGCAACCTCAATATTGACATTACT AACACCTGTGGCATCTCGAATAAGTTATTTTTGTTTGGTGACAGTCAGAG TCCTTGAAGGTATTGTTCAAGTGTAATTTTGAGTAGTTTTTTCTACGGTT ACATTTTAACACAAATATTTGGTGGCTGGGTGTCACTTCGTTACGGTGGC CGTAAAGTGTTTGGATGGTCGCTAATGGCAACCTCAATATTGACATTACT AACACCTGTGGCATCTCGAATAAGTTATTTTTGTTTGGTGACAGTCAGAG TCCTTGAAGGTATTGTTCAAGGTGGTCTCTTTTCAGCGTTGAATCAGTTG GTATCACAATGGGTTCCACAATCTCAAGTCACATCTTTCTTTGTTGTTGT GTATGCAGGGTGGTCTCTTTTCAGCGTTGAATCAGTTGGTATCACAATGG GTTCCACAATCTCAAGTCACATCTTTCTTTGTTGTTGTGTATGCAGGTTT ACAATCAGGATCAGTGGTAGCTTTGTCAACTTCTGGTTACCTTGCCGACT CGTCTTATGGATGGCCTTCTTCCTTCTACTTATACGGTTTACAATCAGGA TCAGTGGTAGCTTTGTCAACTTCTGGTTACCTTGCCGACTCGTCTTATGG ATGGCCTTCTTCCTTCTACTTATACGGAGGGTTATCTTTCATTATGTCAG TATTATGGTTCATATTTGTTTACGATTCACCATCTCAGCATCCTTTCATA TCTGATGAAGAAGAGGGTTATCTTTCATTATGTCAGTATTATGGTTCATA TTTGTTTACGATTCACCATCTCAGCATCCTTTCATATCTGATGAAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000008_pilon | genome | sc0000008_pilon:670111..673878 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 616-699:85 |
| Aaloc | 526-612:637 |
| Aaloc | 436-522:1454 |
| Aaloc | 238-435:2430 |
| Aaloc | 202-234:3114 |
| Aaloc | 1-201:3769 |
|