XLOC_037808 (mRNA) -

Overview


Name	XLOC_037808
Unique Name	XLOC_037808
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:1142425..1153855+
coding sequence from alignment at sc0000081_pilon:1142425..1153855+

mRNA from alignment at sc0000081_pilon:1142425..1153855+

Legend: CDSpolypeptide

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>XLOC_037808 ID=XLOC_037808|Name=XLOC_037808|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11431bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:1142425..1153855+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGACGTCAGCGAACATGATTCCGACAGCGAcacagaaattcttaa
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TTGTGGTTCATCAACCTCTTCAATTTGTATTCGAGTTGCCGAATTCCAGC
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ACCTTTACTACTCCATGATCTTTATCATCAGCGATGTTATACCAAGCACA
ttctttccaattcttttttgctgcagtcccatcttttccgttttttccat
cctttccattgactccatcttttccattaattccgtttcGACCATCTCTG
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TCCATCTCGTCCATCTTTACCACAGTAATTATTGAATCCATGCGCACTCG
ATCCctgttttttgattgaaaatattatatttaaGTTAGGGAATTGGAAG
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tccctttttggacctaccccggtggaggtcctataaattaaccgttgtat
gttcgtttgttcgttagttaccagcttttctcgagattggctcattaatt
ttttctgatttttttgcacaaagatgtttaactataaaccctcgaatgtg
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gcaaaaaaaattttttggctcaaaaaacgcatgtttatctataagaatca
ctattaataagcatacatcaatattcttagtcaaattactcaattctttt
tatgagatggatgtttttttgctacgagggcttacttttgaagaatatgt
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ggccaaattcgatatttatttataagcacattatcaattacttaggtact
TTTCTCGAGGTTGGCGCTTTCattctttgagattttttgcacaaagatgc
attaAACACTCAAATTTGTCGAAGCCCGATTTAAAAATTACTCAACtttt
tttacgagatagatgtttttttgcttgcttgaatatgaaagaatatttaa
agaacatgaaattttggtttctaaacgattttttataagaaacaaacgac
tacttttaatagatcgtcactatttgggttttgaatgattgtttaatagt
cacgctcacgtagatatcaattatatatgtgttaaatgcataaccaggta
ggtccataaaagtatcacttgtcttTTATAGTTTTCCGCCAAAtttggat
ttgttttattaGATTATGTTCTTTAGCGATTTAATTTGAATTGTAACATT
TTCCAGTCTCTGAAGCTATCTTACGAGCTATTAAAGAAGCTTCTAATTAC
TTGTTACATCAGGAGATATAACAGTTTAAATTGTTTTAAGGGTTGTGAGA
AAAAGAACGAAATGATTTTCATATACCTACCTTCATCATGGCTTGTGTCA
GGGTCAGTATTGCCAAAAGAGTAATAACCAAAATAATTTGCCTCATTGTG
AATTTAACACCTAAGCTTTATATATGTTTTATAAAAGTCGCCTGTGTCCT
GCCTACCGTTCCTTTTAAAAGCTCGTAATGAAGTTTGGCTGGCAGAGGCA
GCCTATTTAAAGATTCAAGGCAGTCTAGATTCAAGTGGTAGTGGGTCAGA
TtaagattgttttgtttttactttacgCCAACGAGTCATAACCAGTACGA
TAAACGAACTATTTTAGGATGTTTGTCGTTTTTTCAAGAAGCTGGGTATC
tggaatcaaaacaaacacttAGAAACTTCTCTTTCGAGTAAAAAATAACA
CTACTTCTGGCTTATTGATAATACTGTAGTGCAATGAAAACTCGAATGTT
TTTAGGATCAGTGACaaaaataaggatttttttaatgtttagtTTTAACG
GTCTTTGCAAGCTTCAAGACGCTTTTAGAAGGAAGCCTTTATATTGAAGA
GGGCAAAAAAGACAtataccgtaaatcctcgaataagcgccccgctcgaa
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ATTAGCGCCccctttgaataagcgccctctccagggaggggcgcttattt
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aaagaaagaaagcgacTAAGAATAAAATGAGagaaattgtcaattggatt
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TTACGGTAtccagattttttgcacagggCTTAGAAAAATCTTGTGCAGGA
AATGGTCCTTTCACACGTCCATTTTCATTTCCgggacatttttcaaatag
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AATAGTCccttagaatttcttttcttagtTTTACTACCAGGTACTACCAC
TCTCCAATTCTCTCAAAATTCACAGGTTTGAGTAAGTTTAGTCATTACTC
AAACctcaaaaaattgtaaaaaagtattGGAGTTGGCCGAATAAATAAAA
GTGGTATATATGTTCAAAAAGGCACATCTTTctttatcataaaaaaaaag
aatatctaaaaaactttttcttcatttttcaccaGGAGCGTACACTTACA
CGGATCCAAATGATGGGACTGTTTATGAATGGGATGAGACAAAACGGGGA
TGGATCCCAAAGGTACGTTGATTGATAGATTTCACATTAAAtaagtaaaa
ataaattttttggcgttatttacacTTTTAAAAGTTCTTTCGTCTTAGAC
GGATTTCTGTTTCCGCGTATATAAAGAGGCTTTCCTGTCTCTGCGTAATT
CACCAAAGTTTCAAGATTGTGCactaatttgctgtgtaaaatctaTTTTC
CGTCCCAGACgaaaaactttgctttgacGCTTTGACCACTGTAAGAGCCT
AATCAGTGAAGGTACAAAATTGATCAGTGACGGTTTAAAGAGACCGGCGT
CTATTACTTATCACCGATAAGGTACGAGAAATCCCATTATTAAATTCATG
AGGTTTTCAATCTTCTCCATATCTTCCTTTTAAAGATCGACGAAGATTTC
ATAGCGATGTATCAAGCGAATTATGGGTTCACTGCGACAGGTGAACATGA
TCCTAATGTCAATGCAGAAACAGATGAAAAACCTGGAGCTGGAGACGAAA
AGAACACAGATGATGGTAGGTTGACAGTTTGAAACTTGATGTATCAAGAA
TTTCGAATGGAATCCAAAATAGACTTAAGTCCCTTGGGAAGCTCCATACA
AATTTTGAGAACGTCCACTTCGAAAGTTTGCTTTTTTAAGGGTATTGCGA
AATAAAATAGAGTGAGTCATTTTCAACATGGGAGGTTTAGAGAAAAACAC
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AAGGACGACAAACATATTAAAAGTTTACTTATTAAAAGTGGTGCATTATT
TACGCCAGGCCACTTATTAGCGCCaaccagtctatcaaaaagcaatAAGT
GCCCCCGGGCTACGGACAGAGTAgatctatctagtgttttatataagata
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ctatgaattaacatgtgtatgtccgtccgtccgtccgtccgtccgtccgt
ccgtctgttattATTAAGTTTTATCGGAAttggttcattagttttttctg
atattttgcacaatgatgcaaaatgataatgcccaaaatgtgacggagcc
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taaccaggtaggtccataaaagtatcgcttgttttttttggtAGACAAGA
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GGTAAAAAGCGAAAGGCTGCGGAACAGAAAAAAGAATGGTTCGACATAGA
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GTGAAGAGGAATTCGAAGAACTCATGTCGAAATGTGGTATCATCATGGAT
GACGATACTGGTAAGAAGAAAGTTATTGAACTTTTCGCGTTTCATTAAAA
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AATCATTTATTATGCATCATAGAACCTTCCCAGGGGCATTGACGGACAAA
GAGAGTTTGTTTGAGTTTTTTAGCATGCTGGGTGGTAAATTCAAAAGATA
ACATTATTCACAAAGATTTTATTTCTGGGATTGTAAACGACTCTAGTGTA
TTGCTTGCGTGATCCGACTCGTTCAACATAGGGTTATATACCGAATGCAC
CAGAAATGGGTGTATctctttgaaattctttttctcaaattctttttctc
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taaaacttaaaaaaactgcCTATTTCCAGTATAGGATGTTTCAGTATGTT
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GTCCATATTTATCAGTGTTATCTTtaatttttagagtattttacaatttt
tgttgCTTTCAGGTAAAAAGAAGCTCAAACTTTACAAAACACCAGACGGC
AAAGTCAAAGGTGACGGCCGTTGCTGTTACTTGAaagtatattatttttt
tactgGTCTATTACAGTCCTTTGTTTAATGCGCGAGTTGAAATGTCCCTG
CTTTCGATCAGCTTCTTAACTTTAATACCCAATTTCTTGATGtttttttG
AATccgatttttgaatttcaagagTAAAATCAGTTGAGTGTGAATAACGT
GGTGGGAGACAGTGTCCGTTGATTCTACCAAGTAGTTCGTGCTAATTTTT
TGGATACATTGCACTACCATTTCTACTCATTTTTATAATGTACCGTCGTT
TTGGCTAATATACCACTTTCCAGACTACCGGGATAGCTAGTCTGAAATGC
AGATTTCTACAAAACCACATCTATATAAGGaacacgaatccgttagtgga
tgccagcagatTACGGGATAGCCGGGTGCAAATTGTAAAGAGTTTTTCTA
GAGGTACAGAAAATAGCTAGTGTTGACCGGCTAACTTTCCTAAGCCGGAG
TGATGTTTTTCCCACTAGAAAGTGGCAGTTGAATCTTTATCCGTAAAATG
AATTTTGACCGAAACGACCTTAAATATTTGGCTCATTTTTTCTAGCACGA
GTCAGTTGTATTGGCGTGCCAATTGCTGGATGAGGGTGATTTCAAAGGAA
GTAAAATCAAAGTCGAACTGGTAAGAAGAACATCATTTTTTCATGTGGAT
CAAACGTTATGTATTATTCTTTCGAGGTTAAACATGAAGATATGTattct
aaggtcccgaatagtagcGGGAAAGGGGTCTGAATATAAAGGGGGGTCCG
AAAGTTTAAGAAACATTAAGGTCGAACTAAGAATAAATAAACgggggtgg
gTCGGTgggTGTAATGAGAACAGCGGGgtccgaaaaattaaaaactggGT
GGGGACCCTAGAGTGTGGACGTGCAGTGAGTTATGCACGAGGTGTTTGCA
AAGTCATGGGATTTAAGGTTACGTATTAAGCTATGTACGACGTTAAGTTT
ACGACTCGAATATGTACGGTCTAACTAACCAATTCAGTCCAATCCCTGCT
GGCCAAGTATTTTCTTAGCTCCTAAACGACGCGAGTTTCAGTAATTTTAT
GTTTTAGTTTGTATAATCTGAGAAAAGCACATCTAGCTGATAATGTTCTT
CAGATTTCCTTAACTCTAACCCATATTTGGATTAACTGGAATAGCTCAAT
AGTTTATCAAGATGTTTTACGAGTACTTGTTTCAtgattttgttattatt
tttttaaggcCGTTTTTGAACTGAAAGGACAATTTGATCcaaacaaaaaa
ccgaagaagaagaaaaagaagatcaagaaaggaaaaggacaagataagta
agaaTCTAATTCGActgattttattatatttatggTTAGAATGGGTCGCG
GTTGTCAACTGATACGttaaattctttcaaattatgTAAGACTTGACTAG
CAGAGATAAAAGCTGAAAAACTGTTCCACTTCTCTTACTTTTGATTGATC
TACTCTCATATAAGAAACTTTTCAAactgttaaaaatgttttcatatATA
TTCAGAGAGTTTAAAAGCTAGAAGCATTGAAATGCGCGACATTTGTAGCC
TGTACCAACCTCTTTTTTCGCGGAAAAGAACgtgcaaagtttttttttac
atttaggCAACTAAGGCACTATTtcatgtttaaaatattttctcgcAACT
CTTTTGCCTTTTTTGGTGAAGTGATGTTCTATTTTTAACACGTAAACTCT
AACCGTAACACTGAAACACTGCAACACtgcaagaattttcaaaaaaaatc
taaatggcCCGCCGTAGGTGTGCAGGCTAGGAAGTTTATTACATACCATT
ATTAGACGCATCTACTGTAATTATTAAAGTTGTTTTCCATATTTGACctt
cttttgcttttgtttgtttttaggTTGTTAGATTGGGTTGACCGGCCAAA
GAAACGAAGTAAATTTGATAGAATTGTTATC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:1142425..1153855+

>XLOC_037808 ID=XLOC_037808|Name=XLOC_037808|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:1142425..1153855+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGACGTCAGCGAACATGATTCCGACAGCGAcacagaaattcttaa
aaaagaagaacaatctAATAAACAACAACTGAAGACCCATGTCATCTCAA
GTGGACCACAAATTATAAATGCGCCTCAAGATGTCTGACGTCAGCGAACA
TGATTCCGACAGCGAcacagaaattcttaaaaaagaagaacaatctAATA
AACAACAACTGAAGACCCATGTCATCTCAAGTGGACCACAAATTATAAAT
GCGCCTCAAGTATATACGCAACCCTCAGAGACACCAACATCGACAATAAc
aacagaaaaaactgaaagTGCTGGCAGTGCTGCGGATGGCAATGTGTTGG
ATGAATTGAAACATCAAGCTGAAAGTGCTGTTGCCGATCAAGAAAAACCT
GAATGGCAAAAATACTTGGATCAAAACCAACAAACAGTATATACGCAACC
CTCAGAGACACCAACATCGACAATAAcaacagaaaaaactgaaagTGCTG
GCAGTGCTGCGGATGGCAATGTGTTGGATGAATTGAAACATCAAGCTGAA
AGTGCTGTTGCCGATCAAGAAAAACCTGAATGGCAAAAATACTTGGATCA
AAACCAACAAACAGGAGCGTACACTTACACGGATCCAAATGATGGGACTG
TTTATGAATGGGATGAGACAAAACGGGGATGGATCCCAAAGGAGCGTACA
CTTACACGGATCCAAATGATGGGACTGTTTATGAATGGGATGAGACAAAA
CGGGGATGGATCCCAAAGATCGACGAAGATTTCATAGCGATGTATCAAGC
GAATTATGGGTTCACTGCGACAGGTGAACATGATCCTAATGTCAATGCAG
AAACAGATGAAAAACCTGGAGCTGGAGACGAAAAGAACACAGATGATGAT
CGACGAAGATTTCATAGCGATGTATCAAGCGAATTATGGGTTCACTGCGA
CAGGTGAACATGATCCTAATGTCAATGCAGAAACAGATGAAAAACCTGGA
GCTGGAGACGAAAAGAACACAGATGATGACAAGACCAAGAAGTCAAAAGC
AGCCGATCCAAGTACTTCTAACAACAGTGAGATTGGTAAAAAGCGAAAGG
CTGCGGAACAGAAAAAAGAATGGTTCGACATAGACCCTAAGAAGAACAAC
AATGTGTATGTGAGTGGTCTACCGGAGTCTACAAGTGAAGAGGAATTCGA
AGAACTCATGTCGAAATGTGGTATCATCATGGATGACGATACTGACAAGA
CCAAGAAGTCAAAAGCAGCCGATCCAAGTACTTCTAACAACAGTGAGATT
GGTAAAAAGCGAAAGGCTGCGGAACAGAAAAAAGAATGGTTCGACATAGA
CCCTAAGAAGAACAACAATGTGTATGTGAGTGGTCTACCGGAGTCTACAA
GTGAAGAGGAATTCGAAGAACTCATGTCGAAATGTGGTATCATCATGGAT
GACGATACTGGTAAAAAGAAGCTCAAACTTTACAAAACACCAGACGGCAA
AGTCAAAGGTGACGGCCGTTGCTGTTACTTGAaaGTAAAAAGAAGCTCAA
ACTTTACAAAACACCAGACGGCAAAGTCAAAGGTGACGGCCGTTGCTGTT
ACTTGAaaCACGAGTCAGTTGTATTGGCGTGCCAATTGCTGGATGAGGGT
GATTTCAAAGGAAGTAAAATCAAAGTCGAACTGCACGAGTCAGTTGTATT
GGCGTGCCAATTGCTGGATGAGGGTGATTTCAAAGGAAGTAAAATCAAAG
TCGAACTGgcCGTTTTTGAACTGAAAGGACAATTTGATCcaaacaaaaaa
ccgaagaagaagaaaaagaagatcaagaaaggaaaaggacaagataagcC
GTTTTTGAACTGAAAGGACAATTTGATCcaaacaaaaaaccgaagaagaa
gaaaaagaagatcaagaaaggaaaaggacaagataagTTGTTAGATTGGG
TTGACCGGCCAAAGAAACGAAGTAAATTTGATAGAATTGTTATCgTTGTT
AGATTGGGTTGACCGGCCAAAGAAACGAAGTAAATTTGATAGAATTGTTA
TC

Gene-mRNA-Prot

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_037808	XLOC_037808-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000081_pilon	genome	sc0000081_pilon:1142425..1153855 +

Properties


Property Name	Value
Aaloc	970-1026:11375
Aaloc	880-966:10709
Aaloc	805-879:10046
Aaloc	733-804:9415
Aaloc	517-729:8447
Aaloc	385-513:6636
Aaloc	310-384:6188
Aaloc	133-306:549
Aaloc	1-129:1

You are here

XLOC_037808 (mRNA) -