XLOC_037759 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037759
Unique NameXLOC_037759
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000040_pilon:1185083..1193437+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037759 ID=XLOC_037759|Name=XLOC_037759|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8355bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000040_pilon:1185083..1193437+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTACAACCCATCTAAGTAAGAAATCATTTCAAGTATGTCTAAAGTGACAG TTAAATAGTTGGTGACTTATTTCATGCGACTAGTAAGGGCAAAACTTTGA TCCAGCACAATTAATTCTTTTAGTATTTGAAGGGTAACTTTATTGGGATT CTTTTGTGATTATTAGATTCAGAATGCCGCTGATAACTCTTCGGACATTT TTgcaacaatattttcttttacgTAGAATTCTTGGAGTCACCACCCTCGA TGTTGTCCGTGCTAACACCTTCGTTGCTGAGCTCAAAGGTTTAGATGTCT CCAAAACTAACGTTCCCGTGATCGGAGGACATTCTGGCGTCACCATCTTA CCTTTGTTGTCACAGGTCGTCCCTAAAGTTTCCTTCACCGATGATGAGAT CGCTGCAATGACCACTCGCATTCAAAACGCAGGAACTGAAGTCGTCGAAG CTAAAGCTGGAGCTGTAAGTTTTCATTTCATTAGTCTACATCTATCACTA AGAAATCATGTTCGCCAATGACATCTTGCTCAACGTTTTGTAACCTTTTA GCAAACGTTTGAGTTGTGATGAAATTACAAAATTCAAAGTTTCAATAGAA GTTTGACGACAATGAAAAAGAAGTGACTTTTCTTTATATCTttggaaata atcaaaattattgCATTATTTTTCACCGTTTAACACATCTTTAtcatgaa taaaatgaaaatgaaagtttttacAGTGAATAAATTTCTCGACTTAGGGA TCAGCCACTTTATCGATGGCATACGCTGGCGCTCGTTTCGGTTTCTCCAT CTTGGAAGCCATGAACGGCAAGAAAGGAGTTGTCGAATGTTGTTATCGTG AATCAAGCATCACTGAAGCGTCATACTTCGCTACACCTATGCTTCTTGGC GTAAGTATATATCTTATCTTTATAATTTGAATACTTCTACTTGAGATCCT TCAAATCATTACAGGCAAAGATAATTTAACATTATTTAGCACAATGATTT TTAATCCGTGGTGAATATATGGTGGATATTTCCGTTTTTGGGTAAGTTAC GAAACTTGCGCTATTAGAGaagaaaacgttcgaatttgaaGAGGTGATAT GCAATATGCCTAGTTCCAAAATCACGGAACTTCgtagaaaacataaaaaa cctAAATGAAGGCCTGTGGTACTTGCATTATTCATGTTTTCTCTAATTCT CTTTTAGCCTGGAGGAGCAGAAAAAGATTTGGGTATCGGAGATATGACCG ATTTCGAGAAAGAAAAACTCGATGAGGTATGTATAATTTAGTTTGATGTT AAGTCTTTAAATTAtaaatatctgaaaatgaaaatagtaaATCAAAGTCG TTTAACTTTCTGAGTTTAGTAATTGTGAAACTTCTTTCAGTAATATAGGT ATTCGATTCTCAAAATTAAGTCTCAAAATAAAAGACGTCTTAAATTCatc aatgtcttccacggacccaacagctgtttggttgaaagtaacgcattgac tgattttacgtcacttacaaccaatcagcttaTGGATCCGTGAtctaatg tcagaagacattgcaatgttgcatatcatgaatatggaaactatttttat ttggcttttgttaattgtcaTGTCTTCTTTTGTTACTTTTAGCTGATGCC AGAACTCAAATCAAACATCGCGAAGGGTGAGAAATTCGCCGCTGACAACA TGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000040_pilon:1185083..1193437+

>XLOC_037759 ID=XLOC_037759|Name=XLOC_037759|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2040bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000040_pilon:1185083..1193437+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTGCAAATACTTTACGAAGACAAGTTTCTAAATCCGTTAGACAATT
ATCCACCTCATCCCAAATGATTGCAAATACTTTACGAAGACAAGTTTCTA
AATCCGTTAGACAATTATCCACCTCATCCCAAAACAATGTGAAAGTAGCA
GTGCTTGGTGCCAGCGGTGGTATCGGTCAACCTTTGGCTTTGCTGTTAAA
GCATTCTCCAATGGTCAGTCACTTGGCTCTTTACGATCTTGCTCCTTTCA
CTCcagAACAATGTGAAAGTAGCAGTGCTTGGTGCCAGCGGTGGTATCGG
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CGAGAAAACCAGGAGTTGGATGTGATCTTTCACACATTGAAACCATTGGA
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CTCGGGATGATTTATTCAATACTAACGCTTCCATTGCAATGAACTTGGCT
GATGCTTGTGCACGGAATGACTCGGGATGATTTATTCAATACTAACGCTT
CCATTGCAATGAACTTGGCTGATGCTTGTGCACGAAACTGTCCAGAAGCT
GTACTTGGCATCATCACAAACCCAGTCAACTCCACCGTCCCAATCGCTgc
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AAGCTGTACTTGGCATCATCACAAACCCAGTCAACTCCACCGTCCCAATC
GCTgctgaagttttcaaaaaacacGGTGTCTACAACCCATCTAAAATTCT
TGGAGTCACCACCCTCGATGTTGTCCGTGCTAACACCTTCGTTGCTGAGC
TCAAAGGTTTAGATGTCTCCAAAACTAACGTTCCCGTGATCGGAGGACAT
TCTGGCGTCACCATCTTACCTTTGTTGTCACAGGTCGTCCCTAAAGTTTC
CTTCACCGATGATGAGATCGCTGCAATGACCACTCGCATTCAAAACGCAG
GAACTGAAGTCGTCGAAGCTAAAGCTGGAGCTAATTCTTGGAGTCACCAC
CCTCGATGTTGTCCGTGCTAACACCTTCGTTGCTGAGCTCAAAGGTTTAG
ATGTCTCCAAAACTAACGTTCCCGTGATCGGAGGACATTCTGGCGTCACC
ATCTTACCTTTGTTGTCACAGGTCGTCCCTAAAGTTTCCTTCACCGATGA
TGAGATCGCTGCAATGACCACTCGCATTCAAAACGCAGGAACTGAAGTCG
TCGAAGCTAAAGCTGGAGCTGGATCAGCCACTTTATCGATGGCATACGCT
GGCGCTCGTTTCGGTTTCTCCATCTTGGAAGCCATGAACGGCAAGAAAGG
AGTTGTCGAATGTTGTTATCGTGAATCAAGCATCACTGAAGCGTCATACT
TCGCTACACCTATGCTTCTTGGCGGATCAGCCACTTTATCGATGGCATAC
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ACTTCGCTACACCTATGCTTCTTGGCCCTGGAGGAGCAGAAAAAGATTTG
GGTATCGGAGATATGACCGATTTCGAGAAAGAAAAACTCGATGAGCCTGG
AGGAGCAGAAAAAGATTTGGGTATCGGAGATATGACCGATTTCGAGAAAG
AAAAACTCGATGAGCTGATGCCAGAACTCAAATCAAACATCGCGAAGGGT
GAGAAATTCGCCGCTGACAACATGTGACTGATGCCAGAACTCAAATCAAA
CATCGCGAAGGGTGAGAAATTCGCCGCTGACAACATGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037759XLOC_037759-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000040_pilongenomesc0000040_pilon:1185083..1193437 +
Properties
Property NameValue
Aaloc958-1020:8293
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Aaloc1-66:1