XLOC_037684 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037684
Unique NameXLOC_037684
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037684 ID=XLOC_037684|Name=XLOC_037684|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6726bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTCAGGATCCAGGAGGTAAATATACAGGATTAGGTAAACGTTTGAAATA CTTGCGATTCATCTGTTCGAATCCAAGTACATCCAGGGAGGGTGTTAGGG AAACATGATGATTTACATAACTTGGTGATTTTAGGTACACCTTCAATTTT CGAGTTACATGACTCCGTTTTTTAAGGTGCACCTTAATTTTTCGAGTTAT GTAACTCGATTATTCATGGCGCACCTTAAATCTTGGAGTCTCATAACTCG GTTGTTTAAGGTACACCTTAAATGTTCGAGTTAATTTTTTATACAACCAA GTTGGTCAATCATACTGTAATTTTCTCTCTTCAAATAGAGCGGCACAGCG TCTGTTGCATACAGTGGATCCCATATAATGCACATGCGTAATTTATCGTT CGTGTTAGCGATTAAATAAACAGCTCTAAATAATAAACACTCTTTCACTT GCGATCTGCTATTTCTATCATAAAAATGTGGGGGGGTTAATGTTCAGATT TTCCATGGGCAAGAAAGGTTCGGAAGACACACATGGTTATTTGATGGCCT CCACTGTATGCAACAGACGCTGTGCCGCTCTATTCGAAGAGAGAAAATTA CAGTATGATTGACCAACTCGAACATTTAAGGTGTACCTTAAAAACCGAGT TATTAGACTCAAAAATAGATTCGATTTAAGGTGGCAACAGTATCTTCAGA TCAATTTCTAAATGGACAACTCCAAAAATACTCTTTATGTTGAGGACGTG TGACGTCCAGAGAGGTATGAGAAATAGAAAATCCAGAGTGGTGTGGGTTT TTTGAGTGTAAAAATTCAGAGTATGGTAGCCATGTTGAGGAGAAAACTCC AGAGTGGTTACCGTCTGTCGAGGAAGAGGATCCAGGGTGGTCCGGCTTTT CAAGAGGACATGACGACTATCCAAGATCTCCAGTTGTGTTGAAGTTTTTA TAAGATGCTCACATAATTGGTTATTCAAAACAATAGAGATGACGCGTTCT TTAGAAAAACATGATAAAAGTTTTTGTTTGAATGGTTAACGACCAATCCA ATGACAAAAGTTCTTGTAAAATGTTCATCTTGACCCAAGATCTTGGATTA GGTTTAGATTTAGATTTAGTAATTACTGTTATACATTTGGAGATCATGTT AAAGATTTCTTTCGAAAGAAAGTCATTTCAATTACACTTGGAGGTTTCTG GGGAATTCTTAATAGTAAACTGCATACTGATACCATAGTATAAGAAAGCT GCGGCTGGAATATGTACCGTATTATTGTCTTTTCAGTTAATTGCTGTTTT ATCTCTGTCTCCGATCTTTATAAGAACATCAAGATTGTCAGTTTATTATT GGTAGATAATTTTTGAACTTTTTTTCTTTTTTATCTTCACAAAAAGTGTT TTTATTGCTAGATATTTTTGAGTCTGTACCCAATAGAACACTTGAACTGA TTTTGGACATATTTTAGGGGTATTTTGTGGAAACGATAGTTTTTCGCCAA ATTTTAAAATTATAAGAACCATATATTAAAGATGACAACTTTCCTGTCAG TTTGAATGATAAATTTTGAAGCTGCTGGCTTGAAATTTTCACAAAATTAT CTTGATGTACTATTTCATGGGGGGGGGGGTTTCATGGTTGGCGGAGGAGA GGAATCGGCCCTTTTTTCGGACGGAGTGGCGGAATTTGGCGAAAATTTAA ACGGAATTACGGAAATTGGGTTCTCTGACGGAGACGGACAATTAGACAAT TTTAGTGCGGAAAAACGGAATTTAGCAAAATAATTTGCGGAATTTCGGAA TTGGTAAAAGATATTCAAAATTTGCGGAATTTTCGACAAAAATATTGAAT TTCAAAGGAATTTTGGTTCAATTTAAGACTGTTTGACGGAAATTGGAGAA AAAATCGGCTGAATTGCGGAATCGGGTACCCCCTGAAACCCCCCCTTTCA TTGATTTCTAAAAAGATTTTACTGAAATATTGTGAAGGCATTTCGAGGCA CTTTATTAATTTTTTAGTTCTTTCAGCCCAGCGATCTTGTGCTTGTTTAA ATTCTCGGGTGAGTTAGGGCGTGTCTAGATTTTTAAAAATCACAAATCCC GAATCCGCGACCAATAGCACCCATTCTCAGGGATTCACTTATGAATTTTT AGATGACCTATAACTTAAAGTTTCAGGATCCGGTGTTACGTAATTAAATA TTAACCTAAAAATTAATTATTAAAGAAAGTGTGAATTGTGACGTAATCAA ATTATGACGTCATAAATCGTAAATTAGCTCTTACTCTATAAGTACATGTC AAATCTTTGTCAAATTTGGACCAAAGACGCATCTTAATGGTGCCAAACTT TTCAATGAAAATTTTTTTGACGATTTTGATGACGTCAGCAAAAAATGCAA AATATCGAAAAATGCAATTTTTTGCTGACGTCATCAAATTTTTCCAAAAA TATTTTTTCAAAAAGTTACATTTCAGTTAGATGCATCATTGGTTCAAATT TGGGAAAGATTTGACATGTATTTTTATATTATAGCGATTATACGATTCAT GACGTCACTAAATTGGATCAAATTATGACGTCATGATTACAATTTCTTTA ATAATTAATTTTTAGGTTAATATTTAATTACGTAACAACCGGACCCTGAA ACCTAAGTAAGTAGTAACGACAAACCAATAAAATTTGCCATTAAAGATGC TGCATTACTGATTTCTTGATCAACAAATAGTCAAATACGACAGAGATAGA ACAACAGAAATTCAAATGTTATCATTCCAGATGCGGTTTTCTTATACTAT GTTGATACAATCTGCTAGACATTAATATGGTAATATTTGATTTTCATCTT TGATTCTCTCTACAGTGATTAGATTGACACATCTGCAATAAAATTTCTAT TATTGGTCTTTGGAGGTTGATATATTCTTTGAAAACTCAAACTCTGATAG TGATACTCAGGGTACAACATAAGGGGTAAAAACTTTTTCTAGAATAGCCC AATACCCCTATGATGCAAAATACTGCTAATTTCATTGTAGGTTTGAAGTT TGAGGTGATGGAAAAGTATGATCATATTGAAAAGCAAAATTGGTTCAAGA GGAGACGAATTTTGGCATGGTTTACTCTTCTGATGCAATGTCTTATATAT TTTGAATACAGTGCTGTGTCAATCAGTGCATTATATTATTACAAGGATGA TTTAAAGGTAGGGTGTTCTGGGAACGAAAATGTGATGAAAATGATAACGC CACTTAGACCATGTTTAGACGTTATGGTTCGGTTCCGTTCGCGAAACGAA AAGAAACGGTTTCGAAACAAGTGTGAACGTCAAAAAAGAAGACGTTACAC AGAAAAACAGATCGAAACGGTTTCGCTCCACCATTCTCATCGGCACGGAA TTGCTCTGTTTTCTTGCTCCGAAACGTTGCGAAACTAATATGAACACTCT CGATCCGTAACAAAAATCACACCGGAGCGAAACGGAGCCGTAACGTCTGA ACATAATCTTGATGTAATAAAATTACAGATATTTTATATAAAACACTACA TAGTGATTCTCGGTCTTTTTCAAGGCACAGCAGTTTAATACTTAATATTT TTGAATAGAATCTCAAAAGTTCTCACTGTGTCACAGCATCTAAAGAGTTT TATTCTTGATATTCATAAGTTAAGATTACATCTTTTTCATTTCAGAAACA ACCGGAAAAGATTTTATTTTCAAGTTGAAACTTATCCAGCTGGCACACAA CGCTTTTTTGACGTTTATCTAACGTTCATAACGTCCATATAACGTTAGAT GAACGTGTGCCACCTGGGTATCTTGCGCTTCTGTTAAAGCAAATATTCGA TTTGAGTTAGGAATCGCTTCTCAGGGGGGGAGTTAGGCGAAATGGGTCCC GGCAATGATCAAGCTCTCTTAGATCTTAAGTTCTCTTTTTCACACCCTCA AAAGTCCCTCAAAAGAAATTAAAAATCAATTGAGTCTCTGTTCCAAAATT ACCAAAATCTAAAATCTCAAAGGGTCATAAATTCTAAAATTTGAAAATTT CAGCTGAAATTGTCGGGAGATTCTCTTTAAGGGTGGTAAAACCGTAAAAA AGGGGACAAAATTTTCGAAATTTACTCTCTCAACTTTGGCTCGGACAAAC CATCATCTCGCAAACCTAAGACCCCTTCCCGGGAGTCACATCTAAAATTT TCCTTTTAAGTTACGTGACTTAGGTGAAACCTGATAAACCTCTATTTAAA CAGACCTCATCAGGTGTTTTCAATAAGACCTGTTATTTTCTTCTTAGGTG CAGAACCCTAAGTTTTATTACTCACTTTCAATGGGTGCAATGTACATCTC TATTTTCATATCCGTCATTACGTGTGCGAGGTACATGGATAAAACACGGA ATCTCCGACGAATCGCCTTAACAACCATCGTTTTTTCTATCGTTGGTAAT TTGACGTATACTATTACAATTTCGCCGTATTTACCCATTATTGGACGCTT TTTATGTGGTATTAATGATGGAGTACGTATTTGTGCCGCAGGTAATATTT AGTTCATGGTTTCTGGGAGCTACTGCTAAATCGGTCCAGTCTATTTTAAA AACAATACTTTGTCAGGTTATCTGATATATCGATGGCGGATTGGCGGCCA CCCACGCTAAAGCTCTAAAGGAGTGGGCCAATTTCTCAAAGGTAGTCGTA TGACATTCAGCCTTTGATGTGTCTGATCCCGCTTGTGTTTAACTACCCTT GTGGGTAAACTTAAACATATTTCGGTTGGACCCGCCACCCTCCGAAAACG AGGGCTGGGTTACCACACCTCCCGCTGCAAAATCCTTAACATAGTCTTTC CGTAAAATTCCGTAATGTAAACCTTCAGGATTCTGAAAACTTTCTGGAAC TTCAGGGCTTTAGAGTTTCCTATCGGGAGAAAATTTATGCACTTTGCAGA TATTTCGTCAGGAGGATCAATTTTTTCAGAAAGACAAAAACCTGTTCAAG TCTTTTTCCCGGGGGGGGGGGGGGTACTAGGGCAAGATGGGTTACAGGGA TGCTCCGCTGGTCAGGGTACCTTTTTTTCACCTCCACGAGTCCCAGGTAC GACAGGTAGGGTCGCAAAAACACTAAAATAGAAAAATCAGTCCCTCGTAG GGTGCCTATTTTTGGAAAATTTGGGGAAAAAGTAGAAAATTTGAGAACAT GTTGGAATTTCAGTCCCAATCAGGGTCTCTTTTTTCGCAAATTTCGAGTC CCACGTAGGGTCCATTTTTCGAACCTCAGCGGAGCACCCCCGTCGGTCGA CAAGGGTAGCCCCCCCCCCCCGGGTCTTTTTTTAGTTAATCTTTTATCGG AAATTTCATCATTTAATTAATCATTTTAAGTGCAACGACTGTCTCGTTTT GAGATCATCACTAAGGTGATTAAATCCGCTGGATCTTAAAGTGTTTTGAA TAGAGTAGACTTCTTCTGTGCTCCTTTCGTAATCAATTACTATAGCAATA TTTTGAAAACGAGCTAATTGGCTAACTAATACATTGGTCCCCTCGGCTCT GTAATCTAATGTATCTAATCTTTCTCTCTGGAATTCGACGAAGATTTTTT GTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGAGTAAACTGTATTTAAAATTTTCAA TTTGAATCTCCCCCTGTATCATTTGTACAGGTGAATTATCAAGAGTTTAC GGTAAACACGAGCTCGGCAAAATCTTCTCCACCAATGAAATTGTTGGACT AATTGTAACCTCATTGGCACCTTGTACACCCGTTTTATTTACCGGTATTA ATTTCCACATCGGATTCTGGCATATCACGACCAACAACTTTATTGGATTA TTTCTGGCAGTGGTAGCAACTATTATATGGGTTGCAACCTATTTGTTTTT ACCTAATTTAACATTAGAACCTATATACAAAACTATGAAAAATGATATTT TCTCATCAACAGAAGTCTCAGATTCCGTCACAAATAATAATACAAATAAC GCAACAGGGTCGGAGATATTTGAAGAAACAAACGAATCATTTAAGCCATT TAAGCAACACAAAAAGATACCTTCAACTTCTACTGAAGAACTTGAAACAA TTTCAGTTTTATGGACCACTAAAGATATCGTTCAAAGAACTGATGTCTTT TTTATCATTTTGACGCAAGCATTCTTAAGTGGTCAATACTATCAGATGGA ATTACTAATAAATATGACTGCATTACTTATCTTTCAGTTCAATATGACTG AAATCAGCATTGCTACTACGATTGGAGTTGTGTTTGCATCATTAGTGATG TTGGCAATAAGAAGTCGTTTACTAGGCTCGTCTGTTAACATTGTTTTTCT GTTCGCCTTATCATTTGTGTTGGCAACAATACTAGAGAGCTATTTAAACA TTATCATCTTATCAGGATTTCGCATCAAAATTATTCTTCAAGCCACTATA TCGATTGTGGTGTTTTTGAATACGCTCCAAGCTTTCGGCGCAGGAAGCTA CACCAAAATTATACTTTTCTCGATGGCTCCACAGCACTCGGCAGCCATTA TTGAAAGTCATCGTAAAGCGAGTGCAAGCTTTTTCATCTGTGTGGCATTT TTTACTGCCAGTTCAGTTTTCTCTGTTCAATACCTTGTGACACCTGTATA TAATTTGATTTCTTTGGTCGTTGCAGGAGCATTATTATACAAAAGACATT GTTATATAGGATTTATAAAGCTGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406-

>XLOC_037684 ID=XLOC_037684|Name=XLOC_037684|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2946bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTCAGGATCCAGGAGATTCAGGATCCAGGAGGTTTGAAGTTTGAGGTGA
TGGAAAAGTATGATCATATTGAAAAGCAAAATTGGTTCAAGAGGAGACGA
ATTTTGGCATGGTTTACTCTTCTGATGCAATGTCTTATATATTTTGAATA
CAGTGCTGTGTCAATCAGTGCATTATATTATTACAAGGATGATTTAAAGG
TTTGAAGTTTGAGGTGATGGAAAAGTATGATCATATTGAAAAGCAAAATT
GGTTCAAGAGGAGACGAATTTTGGCATGGTTTACTCTTCTGATGCAATGT
CTTATATATTTTGAATACAGTGCTGTGTCAATCAGTGCATTATATTATTA
CAAGGATGATTTAAAGGTGCAGAACCCTAAGTTTTATTACTCACTTTCAA
TGGGTGCAATGTACATCTCTATTTTCATATCCGTCATTACGTGTGCGAGG
TACATGGATAAAACACGGAATCTCCGACGAATCGCCTTAACAACCATCGT
TTTTTCTATCGTTGGTAATTTGACGTATACTATTACAATTTCGCCGTATT
TACCCATTATTGGACGCTTTTTATGTGGTATTAATGATGGAGTACGTATT
TGTGCCGCAGGTGCAGAACCCTAAGTTTTATTACTCACTTTCAATGGGTG
CAATGTACATCTCTATTTTCATATCCGTCATTACGTGTGCGAGGTACATG
GATAAAACACGGAATCTCCGACGAATCGCCTTAACAACCATCGTTTTTTC
TATCGTTGGTAATTTGACGTATACTATTACAATTTCGCCGTATTTACCCA
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GCAGGTGAATTATCAAGAGTTTACGGTAAACACGAGCTCGGCAAAATCTT
CTCCACCAATGAAATTGTTGGACTAATTGTAACCTCATTGGCACCTTGTA
CACCCGTTTTATTTACCGGTATTAATTTCCACATCGGATTCTGGCATATC
ACGACCAACAACTTTATTGGATTATTTCTGGCAGTGGTAGCAACTATTAT
ATGGGTTGCAACCTATTTGTTTTTACCTAATTTAACATTAGAACCTATAT
ACAAAACTATGAAAAATGATATTTTCTCATCAACAGAAGTCTCAGATTCC
GTCACAAATAATAATACAAATAACGCAACAGGGTCGGAGATATTTGAAGA
AACAAACGAATCATTTAAGCCATTTAAGCAACACAAAAAGATACCTTCAA
CTTCTACTGAAGAACTTGAAACAATTTCAGTTTTATGGACCACTAAAGAT
ATCGTTCAAAGAACTGATGTCTTTTTTATCATTTTGACGCAAGCATTCTT
AAGTGGTCAATACTATCAGATGGAATTACTAATAAATATGACTGCATTAC
TTATCTTTCAGTTCAATATGACTGAAATCAGCATTGCTACTACGATTGGA
GTTGTGTTTGCATCATTAGTGATGTTGGCAATAAGAAGTCGTTTACTAGG
CTCGTCTGTTAACATTGTTTTTCTGTTCGCCTTATCATTTGTGTTGGCAA
CAATACTAGAGAGCTATTTAAACATTATCATCTTATCAGGATTTCGCATC
AAAATTATTCTTCAAGCCACTATATCGATTGTGGTGTTTTTGAATACGCT
CCAAGCTTTCGGCGCAGGAAGCTACACCAAAATTATACTTTTCTCGATGG
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AGCTTTTTCATCTGTGTGGCATTTTTTACTGCCAGTTCAGTTTTCTCTGT
TCAATACCTTGTGACACCTGTATATAATTTGATTTCTTTGGTCGTTGCAG
GAGCATTATTATACAAAAGACATTGTTATATAGGATTTATAAAGCTGTAA
GTGAATTATCAAGAGTTTACGGTAAACACGAGCTCGGCAAAATCTTCTCC
ACCAATGAAATTGTTGGACTAATTGTAACCTCATTGGCACCTTGTACACC
CGTTTTATTTACCGGTATTAATTTCCACATCGGATTCTGGCATATCACGA
CCAACAACTTTATTGGATTATTTCTGGCAGTGGTAGCAACTATTATATGG
GTTGCAACCTATTTGTTTTTACCTAATTTAACATTAGAACCTATATACAA
AACTATGAAAAATGATATTTTCTCATCAACAGAAGTCTCAGATTCCGTCA
CAAATAATAATACAAATAACGCAACAGGGTCGGAGATATTTGAAGAAACA
AACGAATCATTTAAGCCATTTAAGCAACACAAAAAGATACCTTCAACTTC
TACTGAAGAACTTGAAACAATTTCAGTTTTATGGACCACTAAAGATATCG
TTCAAAGAACTGATGTCTTTTTTATCATTTTGACGCAAGCATTCTTAAGT
GGTCAATACTATCAGATGGAATTACTAATAAATATGACTGCATTACTTAT
CTTTCAGTTCAATATGACTGAAATCAGCATTGCTACTACGATTGGAGTTG
TGTTTGCATCATTAGTGATGTTGGCAATAAGAAGTCGTTTACTAGGCTCG
TCTGTTAACATTGTTTTTCTGTTCGCCTTATCATTTGTGTTGGCAACAAT
ACTAGAGAGCTATTTAAACATTATCATCTTATCAGGATTTCGCATCAAAA
TTATTCTTCAAGCCACTATATCGATTGTGGTGTTTTTGAATACGCTCCAA
GCTTTCGGCGCAGGAAGCTACACCAAAATTATACTTTTCTCGATGGCTCC
ACAGCACTCGGCAGCCATTATTGAAAGTCATCGTAAAGCGAGTGCAAGCT
TTTTCATCTGTGTGGCATTTTTTACTGCCAGTTCAGTTTTCTCTGTTCAA
TACCTTGTGACACCTGTATATAATTTGATTTCTTTGGTCGTTGCAGGAGC
ATTATTATACAAAAGACATTGTTATATAGGATTTATAAAGCTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037684XLOC_037684-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000025_pilongenomesc0000025_pilon:1858681..1865406 -
Properties
Property NameValue
Aaloc787-1497:712
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Aaloc448-717:1045
Aaloc202-444:2430
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