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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037684 ID=XLOC_037684|Name=XLOC_037684|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6726bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATTCAGGATCCAGGAGGTAAATATACAGGATTAGGTAAACGTTTGAAATA
CTTGCGATTCATCTGTTCGAATCCAAGTACATCCAGGGAGGGTGTTAGGG
AAACATGATGATTTACATAACTTGGTGATTTTAGGTACACCTTCAATTTT
CGAGTTACATGACTCCGTTTTTTAAGGTGCACCTTAATTTTTCGAGTTAT
GTAACTCGATTATTCATGGCGCACCTTAAATCTTGGAGTCTCATAACTCG
GTTGTTTAAGGTACACCTTAAATGTTCGAGTTAATTTTTTATACAACCAA
GTTGGTCAATCATACTGTAATTTTCTCTCTTCAAATAGAGCGGCACAGCG
TCTGTTGCATACAGTGGATCCCATATAATGCACATGCGTAATTTATCGTT
CGTGTTAGCGATTAAATAAACAGCTCTAAATAATAAACACTCTTTCACTT
GCGATCTGCTATTTCTATCATAAAAATGTGGGGGGGTTAATGTTCAGATT
TTCCATGGGCAAGAAAGGTTCGGAAGACACACATGGTTATTTGATGGCCT
CCACTGTATGCAACAGACGCTGTGCCGCTCTATTCGAAGAGAGAAAATTA
CAGTATGATTGACCAACTCGAACATTTAAGGTGTACCTTAAAAACCGAGT
TATTAGACTCAAAAATAGATTCGATTTAAGGTGGCAACAGTATCTTCAGA
TCAATTTCTAAATGGACAACTCCAAAAATACTCTTTATGTTGAGGACGTG
TGACGTCCAGAGAGGTATGAGAAATAGAAAATCCAGAGTGGTGTGGGTTT
TTTGAGTGTAAAAATTCAGAGTATGGTAGCCATGTTGAGGAGAAAACTCC
AGAGTGGTTACCGTCTGTCGAGGAAGAGGATCCAGGGTGGTCCGGCTTTT
CAAGAGGACATGACGACTATCCAAGATCTCCAGTTGTGTTGAAGTTTTTA
TAAGATGCTCACATAATTGGTTATTCAAAACAATAGAGATGACGCGTTCT
TTAGAAAAACATGATAAAAGTTTTTGTTTGAATGGTTAACGACCAATCCA
ATGACAAAAGTTCTTGTAAAATGTTCATCTTGACCCAAGATCTTGGATTA
GGTTTAGATTTAGATTTAGTAATTACTGTTATACATTTGGAGATCATGTT
AAAGATTTCTTTCGAAAGAAAGTCATTTCAATTACACTTGGAGGTTTCTG
GGGAATTCTTAATAGTAAACTGCATACTGATACCATAGTATAAGAAAGCT
GCGGCTGGAATATGTACCGTATTATTGTCTTTTCAGTTAATTGCTGTTTT
ATCTCTGTCTCCGATCTTTATAAGAACATCAAGATTGTCAGTTTATTATT
GGTAGATAATTTTTGAACTTTTTTTCTTTTTTATCTTCACAAAAAGTGTT
TTTATTGCTAGATATTTTTGAGTCTGTACCCAATAGAACACTTGAACTGA
TTTTGGACATATTTTAGGGGTATTTTGTGGAAACGATAGTTTTTCGCCAA
ATTTTAAAATTATAAGAACCATATATTAAAGATGACAACTTTCCTGTCAG
TTTGAATGATAAATTTTGAAGCTGCTGGCTTGAAATTTTCACAAAATTAT
CTTGATGTACTATTTCATGGGGGGGGGGGTTTCATGGTTGGCGGAGGAGA
GGAATCGGCCCTTTTTTCGGACGGAGTGGCGGAATTTGGCGAAAATTTAA
ACGGAATTACGGAAATTGGGTTCTCTGACGGAGACGGACAATTAGACAAT
TTTAGTGCGGAAAAACGGAATTTAGCAAAATAATTTGCGGAATTTCGGAA
TTGGTAAAAGATATTCAAAATTTGCGGAATTTTCGACAAAAATATTGAAT
TTCAAAGGAATTTTGGTTCAATTTAAGACTGTTTGACGGAAATTGGAGAA
AAAATCGGCTGAATTGCGGAATCGGGTACCCCCTGAAACCCCCCCTTTCA
TTGATTTCTAAAAAGATTTTACTGAAATATTGTGAAGGCATTTCGAGGCA
CTTTATTAATTTTTTAGTTCTTTCAGCCCAGCGATCTTGTGCTTGTTTAA
ATTCTCGGGTGAGTTAGGGCGTGTCTAGATTTTTAAAAATCACAAATCCC
GAATCCGCGACCAATAGCACCCATTCTCAGGGATTCACTTATGAATTTTT
AGATGACCTATAACTTAAAGTTTCAGGATCCGGTGTTACGTAATTAAATA
TTAACCTAAAAATTAATTATTAAAGAAAGTGTGAATTGTGACGTAATCAA
ATTATGACGTCATAAATCGTAAATTAGCTCTTACTCTATAAGTACATGTC
AAATCTTTGTCAAATTTGGACCAAAGACGCATCTTAATGGTGCCAAACTT
TTCAATGAAAATTTTTTTGACGATTTTGATGACGTCAGCAAAAAATGCAA
AATATCGAAAAATGCAATTTTTTGCTGACGTCATCAAATTTTTCCAAAAA
TATTTTTTCAAAAAGTTACATTTCAGTTAGATGCATCATTGGTTCAAATT
TGGGAAAGATTTGACATGTATTTTTATATTATAGCGATTATACGATTCAT
GACGTCACTAAATTGGATCAAATTATGACGTCATGATTACAATTTCTTTA
ATAATTAATTTTTAGGTTAATATTTAATTACGTAACAACCGGACCCTGAA
ACCTAAGTAAGTAGTAACGACAAACCAATAAAATTTGCCATTAAAGATGC
TGCATTACTGATTTCTTGATCAACAAATAGTCAAATACGACAGAGATAGA
ACAACAGAAATTCAAATGTTATCATTCCAGATGCGGTTTTCTTATACTAT
GTTGATACAATCTGCTAGACATTAATATGGTAATATTTGATTTTCATCTT
TGATTCTCTCTACAGTGATTAGATTGACACATCTGCAATAAAATTTCTAT
TATTGGTCTTTGGAGGTTGATATATTCTTTGAAAACTCAAACTCTGATAG
TGATACTCAGGGTACAACATAAGGGGTAAAAACTTTTTCTAGAATAGCCC
AATACCCCTATGATGCAAAATACTGCTAATTTCATTGTAGGTTTGAAGTT
TGAGGTGATGGAAAAGTATGATCATATTGAAAAGCAAAATTGGTTCAAGA
GGAGACGAATTTTGGCATGGTTTACTCTTCTGATGCAATGTCTTATATAT
TTTGAATACAGTGCTGTGTCAATCAGTGCATTATATTATTACAAGGATGA
TTTAAAGGTAGGGTGTTCTGGGAACGAAAATGTGATGAAAATGATAACGC
CACTTAGACCATGTTTAGACGTTATGGTTCGGTTCCGTTCGCGAAACGAA
AAGAAACGGTTTCGAAACAAGTGTGAACGTCAAAAAAGAAGACGTTACAC
AGAAAAACAGATCGAAACGGTTTCGCTCCACCATTCTCATCGGCACGGAA
TTGCTCTGTTTTCTTGCTCCGAAACGTTGCGAAACTAATATGAACACTCT
CGATCCGTAACAAAAATCACACCGGAGCGAAACGGAGCCGTAACGTCTGA
ACATAATCTTGATGTAATAAAATTACAGATATTTTATATAAAACACTACA
TAGTGATTCTCGGTCTTTTTCAAGGCACAGCAGTTTAATACTTAATATTT
TTGAATAGAATCTCAAAAGTTCTCACTGTGTCACAGCATCTAAAGAGTTT
TATTCTTGATATTCATAAGTTAAGATTACATCTTTTTCATTTCAGAAACA
ACCGGAAAAGATTTTATTTTCAAGTTGAAACTTATCCAGCTGGCACACAA
CGCTTTTTTGACGTTTATCTAACGTTCATAACGTCCATATAACGTTAGAT
GAACGTGTGCCACCTGGGTATCTTGCGCTTCTGTTAAAGCAAATATTCGA
TTTGAGTTAGGAATCGCTTCTCAGGGGGGGAGTTAGGCGAAATGGGTCCC
GGCAATGATCAAGCTCTCTTAGATCTTAAGTTCTCTTTTTCACACCCTCA
AAAGTCCCTCAAAAGAAATTAAAAATCAATTGAGTCTCTGTTCCAAAATT
ACCAAAATCTAAAATCTCAAAGGGTCATAAATTCTAAAATTTGAAAATTT
CAGCTGAAATTGTCGGGAGATTCTCTTTAAGGGTGGTAAAACCGTAAAAA
AGGGGACAAAATTTTCGAAATTTACTCTCTCAACTTTGGCTCGGACAAAC
CATCATCTCGCAAACCTAAGACCCCTTCCCGGGAGTCACATCTAAAATTT
TCCTTTTAAGTTACGTGACTTAGGTGAAACCTGATAAACCTCTATTTAAA
CAGACCTCATCAGGTGTTTTCAATAAGACCTGTTATTTTCTTCTTAGGTG
CAGAACCCTAAGTTTTATTACTCACTTTCAATGGGTGCAATGTACATCTC
TATTTTCATATCCGTCATTACGTGTGCGAGGTACATGGATAAAACACGGA
ATCTCCGACGAATCGCCTTAACAACCATCGTTTTTTCTATCGTTGGTAAT
TTGACGTATACTATTACAATTTCGCCGTATTTACCCATTATTGGACGCTT
TTTATGTGGTATTAATGATGGAGTACGTATTTGTGCCGCAGGTAATATTT
AGTTCATGGTTTCTGGGAGCTACTGCTAAATCGGTCCAGTCTATTTTAAA
AACAATACTTTGTCAGGTTATCTGATATATCGATGGCGGATTGGCGGCCA
CCCACGCTAAAGCTCTAAAGGAGTGGGCCAATTTCTCAAAGGTAGTCGTA
TGACATTCAGCCTTTGATGTGTCTGATCCCGCTTGTGTTTAACTACCCTT
GTGGGTAAACTTAAACATATTTCGGTTGGACCCGCCACCCTCCGAAAACG
AGGGCTGGGTTACCACACCTCCCGCTGCAAAATCCTTAACATAGTCTTTC
CGTAAAATTCCGTAATGTAAACCTTCAGGATTCTGAAAACTTTCTGGAAC
TTCAGGGCTTTAGAGTTTCCTATCGGGAGAAAATTTATGCACTTTGCAGA
TATTTCGTCAGGAGGATCAATTTTTTCAGAAAGACAAAAACCTGTTCAAG
TCTTTTTCCCGGGGGGGGGGGGGGTACTAGGGCAAGATGGGTTACAGGGA
TGCTCCGCTGGTCAGGGTACCTTTTTTTCACCTCCACGAGTCCCAGGTAC
GACAGGTAGGGTCGCAAAAACACTAAAATAGAAAAATCAGTCCCTCGTAG
GGTGCCTATTTTTGGAAAATTTGGGGAAAAAGTAGAAAATTTGAGAACAT
GTTGGAATTTCAGTCCCAATCAGGGTCTCTTTTTTCGCAAATTTCGAGTC
CCACGTAGGGTCCATTTTTCGAACCTCAGCGGAGCACCCCCGTCGGTCGA
CAAGGGTAGCCCCCCCCCCCCGGGTCTTTTTTTAGTTAATCTTTTATCGG
AAATTTCATCATTTAATTAATCATTTTAAGTGCAACGACTGTCTCGTTTT
GAGATCATCACTAAGGTGATTAAATCCGCTGGATCTTAAAGTGTTTTGAA
TAGAGTAGACTTCTTCTGTGCTCCTTTCGTAATCAATTACTATAGCAATA
TTTTGAAAACGAGCTAATTGGCTAACTAATACATTGGTCCCCTCGGCTCT
GTAATCTAATGTATCTAATCTTTCTCTCTGGAATTCGACGAAGATTTTTT
GTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGAGTAAACTGTATTTAAAATTTTCAA
TTTGAATCTCCCCCTGTATCATTTGTACAGGTGAATTATCAAGAGTTTAC
GGTAAACACGAGCTCGGCAAAATCTTCTCCACCAATGAAATTGTTGGACT
AATTGTAACCTCATTGGCACCTTGTACACCCGTTTTATTTACCGGTATTA
ATTTCCACATCGGATTCTGGCATATCACGACCAACAACTTTATTGGATTA
TTTCTGGCAGTGGTAGCAACTATTATATGGGTTGCAACCTATTTGTTTTT
ACCTAATTTAACATTAGAACCTATATACAAAACTATGAAAAATGATATTT
TCTCATCAACAGAAGTCTCAGATTCCGTCACAAATAATAATACAAATAAC
GCAACAGGGTCGGAGATATTTGAAGAAACAAACGAATCATTTAAGCCATT
TAAGCAACACAAAAAGATACCTTCAACTTCTACTGAAGAACTTGAAACAA
TTTCAGTTTTATGGACCACTAAAGATATCGTTCAAAGAACTGATGTCTTT
TTTATCATTTTGACGCAAGCATTCTTAAGTGGTCAATACTATCAGATGGA
ATTACTAATAAATATGACTGCATTACTTATCTTTCAGTTCAATATGACTG
AAATCAGCATTGCTACTACGATTGGAGTTGTGTTTGCATCATTAGTGATG
TTGGCAATAAGAAGTCGTTTACTAGGCTCGTCTGTTAACATTGTTTTTCT
GTTCGCCTTATCATTTGTGTTGGCAACAATACTAGAGAGCTATTTAAACA
TTATCATCTTATCAGGATTTCGCATCAAAATTATTCTTCAAGCCACTATA
TCGATTGTGGTGTTTTTGAATACGCTCCAAGCTTTCGGCGCAGGAAGCTA
CACCAAAATTATACTTTTCTCGATGGCTCCACAGCACTCGGCAGCCATTA
TTGAAAGTCATCGTAAAGCGAGTGCAAGCTTTTTCATCTGTGTGGCATTT
TTTACTGCCAGTTCAGTTTTCTCTGTTCAATACCTTGTGACACCTGTATA
TAATTTGATTTCTTTGGTCGTTGCAGGAGCATTATTATACAAAAGACATT
GTTATATAGGATTTATAAAGCTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406- >XLOC_037684 ID=XLOC_037684|Name=XLOC_037684|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2946bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1858681..1865406- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATTCAGGATCCAGGAGATTCAGGATCCAGGAGGTTTGAAGTTTGAGGTGA TGGAAAAGTATGATCATATTGAAAAGCAAAATTGGTTCAAGAGGAGACGA ATTTTGGCATGGTTTACTCTTCTGATGCAATGTCTTATATATTTTGAATA CAGTGCTGTGTCAATCAGTGCATTATATTATTACAAGGATGATTTAAAGG TTTGAAGTTTGAGGTGATGGAAAAGTATGATCATATTGAAAAGCAAAATT GGTTCAAGAGGAGACGAATTTTGGCATGGTTTACTCTTCTGATGCAATGT CTTATATATTTTGAATACAGTGCTGTGTCAATCAGTGCATTATATTATTA CAAGGATGATTTAAAGGTGCAGAACCCTAAGTTTTATTACTCACTTTCAA TGGGTGCAATGTACATCTCTATTTTCATATCCGTCATTACGTGTGCGAGG TACATGGATAAAACACGGAATCTCCGACGAATCGCCTTAACAACCATCGT TTTTTCTATCGTTGGTAATTTGACGTATACTATTACAATTTCGCCGTATT TACCCATTATTGGACGCTTTTTATGTGGTATTAATGATGGAGTACGTATT TGTGCCGCAGGTGCAGAACCCTAAGTTTTATTACTCACTTTCAATGGGTG CAATGTACATCTCTATTTTCATATCCGTCATTACGTGTGCGAGGTACATG GATAAAACACGGAATCTCCGACGAATCGCCTTAACAACCATCGTTTTTTC TATCGTTGGTAATTTGACGTATACTATTACAATTTCGCCGTATTTACCCA TTATTGGACGCTTTTTATGTGGTATTAATGATGGAGTACGTATTTGTGCC GCAGGTGAATTATCAAGAGTTTACGGTAAACACGAGCTCGGCAAAATCTT CTCCACCAATGAAATTGTTGGACTAATTGTAACCTCATTGGCACCTTGTA CACCCGTTTTATTTACCGGTATTAATTTCCACATCGGATTCTGGCATATC ACGACCAACAACTTTATTGGATTATTTCTGGCAGTGGTAGCAACTATTAT ATGGGTTGCAACCTATTTGTTTTTACCTAATTTAACATTAGAACCTATAT ACAAAACTATGAAAAATGATATTTTCTCATCAACAGAAGTCTCAGATTCC GTCACAAATAATAATACAAATAACGCAACAGGGTCGGAGATATTTGAAGA AACAAACGAATCATTTAAGCCATTTAAGCAACACAAAAAGATACCTTCAA CTTCTACTGAAGAACTTGAAACAATTTCAGTTTTATGGACCACTAAAGAT ATCGTTCAAAGAACTGATGTCTTTTTTATCATTTTGACGCAAGCATTCTT AAGTGGTCAATACTATCAGATGGAATTACTAATAAATATGACTGCATTAC TTATCTTTCAGTTCAATATGACTGAAATCAGCATTGCTACTACGATTGGA GTTGTGTTTGCATCATTAGTGATGTTGGCAATAAGAAGTCGTTTACTAGG CTCGTCTGTTAACATTGTTTTTCTGTTCGCCTTATCATTTGTGTTGGCAA CAATACTAGAGAGCTATTTAAACATTATCATCTTATCAGGATTTCGCATC AAAATTATTCTTCAAGCCACTATATCGATTGTGGTGTTTTTGAATACGCT CCAAGCTTTCGGCGCAGGAAGCTACACCAAAATTATACTTTTCTCGATGG CTCCACAGCACTCGGCAGCCATTATTGAAAGTCATCGTAAAGCGAGTGCA AGCTTTTTCATCTGTGTGGCATTTTTTACTGCCAGTTCAGTTTTCTCTGT TCAATACCTTGTGACACCTGTATATAATTTGATTTCTTTGGTCGTTGCAG GAGCATTATTATACAAAAGACATTGTTATATAGGATTTATAAAGCTGTAA GTGAATTATCAAGAGTTTACGGTAAACACGAGCTCGGCAAAATCTTCTCC ACCAATGAAATTGTTGGACTAATTGTAACCTCATTGGCACCTTGTACACC CGTTTTATTTACCGGTATTAATTTCCACATCGGATTCTGGCATATCACGA CCAACAACTTTATTGGATTATTTCTGGCAGTGGTAGCAACTATTATATGG GTTGCAACCTATTTGTTTTTACCTAATTTAACATTAGAACCTATATACAA AACTATGAAAAATGATATTTTCTCATCAACAGAAGTCTCAGATTCCGTCA CAAATAATAATACAAATAACGCAACAGGGTCGGAGATATTTGAAGAAACA AACGAATCATTTAAGCCATTTAAGCAACACAAAAAGATACCTTCAACTTC TACTGAAGAACTTGAAACAATTTCAGTTTTATGGACCACTAAAGATATCG TTCAAAGAACTGATGTCTTTTTTATCATTTTGACGCAAGCATTCTTAAGT GGTCAATACTATCAGATGGAATTACTAATAAATATGACTGCATTACTTAT CTTTCAGTTCAATATGACTGAAATCAGCATTGCTACTACGATTGGAGTTG TGTTTGCATCATTAGTGATGTTGGCAATAAGAAGTCGTTTACTAGGCTCG TCTGTTAACATTGTTTTTCTGTTCGCCTTATCATTTGTGTTGGCAACAAT ACTAGAGAGCTATTTAAACATTATCATCTTATCAGGATTTCGCATCAAAA TTATTCTTCAAGCCACTATATCGATTGTGGTGTTTTTGAATACGCTCCAA GCTTTCGGCGCAGGAAGCTACACCAAAATTATACTTTTCTCGATGGCTCC ACAGCACTCGGCAGCCATTATTGAAAGTCATCGTAAAGCGAGTGCAAGCT TTTTCATCTGTGTGGCATTTTTTACTGCCAGTTCAGTTTTCTCTGTTCAA TACCTTGTGACACCTGTATATAATTTGATTTCTTTGGTCGTTGCAGGAGC ATTATTATACAAAAGACATTGTTATATAGGATTTATAAAGCTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000025_pilon | genome | sc0000025_pilon:1858681..1865406 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 787-1497:712 |
| Aaloc | 718-777:772 |
| Aaloc | 448-717:1045 |
| Aaloc | 202-444:2430 |
| Aaloc | 37-201:3685 |
| Aaloc | 19-33:6727 |
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