XLOC_037672 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037672
Unique NameXLOC_037672
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000025_pilon:1362651..1372356-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037672 ID=XLOC_037672|Name=XLOC_037672|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9706bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1362651..1372356- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAAATAAAAGATGGCGGGCGCTGTGAGTAAGTTTTATCTAATTGATTTG TCTTTTACAACAGACCTTTTAATACCATAGGTATTGTACCGTCAACTGCT CTAACTTTTGGGACTATCTGACAAAACATGGGACGGCAATTCGTCACCAT TTCATCGAACCTCCAAACCAAAGTCATTTGATTTGAGTTATATAAATGAG TGCGCGGCCTGGCTGCTGCGTATATTATAACAAATATACAATTTCTCTTT TGCACTGACAGTCAAGAACAAGTGCAAATTAGGATACCTGTCGGCAATCT CTCCTAACTAGGACAGTTGTATCCTAATTTGGAGATTTAGGTATCCTAGC AGACACTTTGATTTGACCTGAATTTTTGAGGCAGGTTACTGCTTCGATAT CCGCGTAGACCAGGTGATGTCAATTGAAGGTTCAATTGCCAATCGAACCA GTCGAATTTACTCGATTCCAATCGAATGATTGATTTTCGATTAGCCGAAT TGATCGAATGGGTATGTGCGGACGGTACCGTTAGTTGATCTAATGTCAAC ATCCGTCTTCTAATTTCGACACCCTTCTTCTTTAGAGATAGGAACAATAG AAACTGGGGAAGGTCGGAATCGCTGATTGACTTTGATTAGCGCGATTAGA GGAAAAATCTTTAGTCTATCAGTGATTTCGACCTTCTTATTATTCCTATC TATCATAAAGAAGGATGTCGAAATTAGAAGACGGATGTCAACATTAGACT AACTTACGGTAAGGGTCGGTTTTTTCACCTTTCAAAGTCTCCTCGTTTCA ACTAATGTTTCATTTTTGATTTTTCATGTATGCAATCTAATGAATTCCGA AAAAGGGGGATAAAAAATTTATGATACCAATATTAGGAAGCAAAAATGGA CAATCTCAAATCAATGTCGCCTAAGAAAAAGTTAATTTTTTTGAGGAAAA 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CATAAAGTAACTAAGCTAAAAAAATATGAAATAGACCAAAAAGGTTCTTA AAATGAGGTTAAACAACCTGAAAAAGTAGGATGTTTTAGAAGCTTATACC TTCAAACTTAAACAACTGAACGAAAAACGTTTAAGGTATACTACGATAAA AAGTTAACCTCAAAGATTTTTAATTCAGACTTAATTAAGACTTAAGCTTT ACTTTTTTAAGCTCAGTATTGATATCAAAAACAGATTTATAAGTCATTAA AGTATACAACAAAGAATTAAAAAACCCTATAAGCCCAATTCACAAATAAC CTCACTTTTGGTACCCAAACTAAGATATTAACCTCATTTTTTCTACTTTA CCTTGTCCTCAACTCAACCATTGAATAATGGATCCCACTATTTTCATCAC ACAATTTTCCCTTTTTATGAGGTTATCTGAAAGCTTAAAATCAACCCCTT TCTCAGGTACTTGTGTCTCTCAAGTTAATATACGAGTTAACCTCACTTTT TATATCAAAATATAATTTTTCATGTTTTGTTGTTTTTGATAATAGGCTAC TGTTTGTCTGATATCCAAAATTAGACTGAAATATCATTGTTAACCTCACA ATTAGGGTGTTTTTGTGAAATAACCTCAAATTTTACACCCTACCTGAAAT GTTAACCTCATTTTTTCTAGCCTACCTTGTTGCCCAATCATTAAATAGTA AAACCCAATCATTTATTTTTACTTTACCCTCACATTTCATACCAATTTTG GTCTATCTTTAAGGACCATTAGGCTAACCTCAGTGCAAGTTAACCTCGTA TTCTTAACCCTACTTTGACCAAGAATATCTCTTTAAATTCAACACTTAAC CTCTATAACGTATATATCATTGTGAACCTGAATAAATTTTGAGTTAGCAT GTAAAGTAGCAAATAAAAATAAGTTAACCTCATTTATTTATCCTTTGTTA AAGTCAAAAAGGTTCTTTTGAAAAAGTTAGGCGATTTTTGGGGGTTTTGA CTTGAGATGGTCCAAATACATGGATTTCCGATACGGAAAAAATATCAGAA TTCTGAAATACCATAAAAATTTTGCCCGATTTCCGAAATTCCGAAGAAAA CAAGGTCGATTATGGCAATTCCGAAATACCGTTTGTATCCTATTTCAGCG CTAATTTCGAACTTAAGATTTTATTTATATTTCTGGAGTGTCTTAGTGAG GCTGGAACTTCGATTTTTGAAGATTACAATTTTCCAGTTTTTCAGCGATT TTTGCCTCGCTACCCCTAATCTCGCAACCTCTTTACCTTAAGGAAGATCA AAATTAGAGTTTTTCATCGTTCCGAAAAAAATTCATAGCAGAAGTTTTTT CATCTTCACAGGATCGACTCTCAACAACAAAATACATCTTTTGGTCTTTG GGTTTGTTTCTGACGTTTTTCCTTCAAAAAATATCGATCACTTTCCTTTT CCCCTTGAGCTGGCGTTTTCGCACGGGTAAATAAAGATGAGGCAGCAATC TTGCACTGAGGGTGCTACTAAGTTTCCACCCCATTTTGCGCCCACGATAG AATGGTCCAAACACGGGGGTATTTCAAATGATAAACTATGTTGTTCTGTA AAAGTGTTTATTTTCTGAGAGATACAAATAGTATATTGAATATTATCAAC TTATTTATTTAAGTATTTTTGAGCACAAAATTAAATATATGGTTAAATAA AAAACAAATGATAACAGTTCTGTTCATTCATCGAACCCCCAGGAAAAGTT TTTTTGCCGACTTAGCTATTTTACAAATCTCGGAAAAGAACTCCCATAGG AATTCCGATACCAACCCGATTGGTTAATTTCGGAACGGCTTCAAGAAAGT CATTATGGCAGATAATTTTAAAATTTTCTGAGGAAATGTGTGTAACTTAT TGATGTTGATGGCTTGTTGATTCTTTAAAGAAAAAAGATAACAGGTATAG CTTTTTCTAATCCTGGAATATCAAGGTTCCAGCTGCACTGATTATTACTA CTGAGATAGTTCTGTGGGGTTGGTTCCCATGTAATACGCGAGCCGCACTC GATCAATCCGGCGGTTATTGGATGGCGGGGCTTATTGGGGGAGGCGCTTA TTTCGAAACTTGAGATTACAGTGCAGCTCTTATATTAAGGGAGACGCTTA AAACAGGGCCGGCAGTATAGAGGAAATACGGAACCACAAAAATCGAAATT ACAAAAAAACCGGAACAAAATTTGATTGAATGCCAATCGAACATAAATGG AATCAATCGAATGCCAATCAAACATAAATCGAATTGATCGAACATTAATC GAATCAATCAAAAAGTATATGCAATCGAATCTAATCGAAACTGATCGAAC GTCAATCAAACACCAATCGAACACCAATCGAACGGTAATCGAATCCAATC AAAAAAAAGATGTGAAATTTGATTGGCGTTCGATCAATTTGGCTAATAGA AAATCAATAATTCGATTGGCTTCGATTAAGTTCCATTGATTCGGTAATCG AATTTTTCGATTGACATCCCCTGGTTTGGAAAACTATGCAAACCTTTTCT TCGTCGAGATTTGCACTACTGACCAAAATTTCAAGTAATTTCTCTGGGGG ATTCCTTGAAAATTAACATCCTTAATAATCTGCCGTTCAGAGCCTAAAAT TTTGCGAACACGAGCTAAAGATTTGTTTCTCTTTTTACGGGGAACAGCCC GCTATGGTCCGATTTTCGCGCAAAAAAAGCGTTCGTGAATTCTAGTTGGC ACATTTGAGTGGTGTTTTTTGGCCTATAGTTTTGCATTCCACCAGCCAAA CTCAATGAAATTCAGTACACAATCTCATTTACTTATTATTTACATCTTGG AAGTGGTAAGATGGCGCGGATGTCTCTGGTTGGTGAAAAAAACAGGTTTT TTGGTTTATAGTATATATCCTAATTAGGATGTTGATTGCTATTTTGGATA CTTTTTTGTATCCAATTTAAGATACTCTCCTAAGTAGGAGAGATTGCCGA AGGTATCCTAATTTTCACTTGTTCTTGACTGACTCAGTTGTGTAGAAGTT TTTGTAAGATGCTCACATAATTGGTTATTCAAAACAATAGAGATGATGCG TTCTTTAGAAAAATATAATAAAAGTTTTTGTTTGAATAGTTAACGACCAA TAAAATGACAAAAATTCTTGTAAAATGTTCATCTTGACCCAACTGACTGA GTATATACCGTCAACTGCTCCAACTTGGGACTATCTTACGCAACATGGGA CGGCCATTCCACCACCATTTCACCAAACCTCCAAAGTCATTTGATTTGAG TTCAATGCGCCGCGTATTAAAAAATACACAATTTCTCTTTCACACCGAGT AGGCTTTTAAATCGAAATATGAAAAAATAGGTGGTTAGGCGGCGGGCGTT CTCTAATTCTCCATTGGGCGTCTGGTCATTTTAAATGAAAACAAAAGTTA AAAAGGGCGCGCTATCAGTGAAGGTTATCGTGACATGTTATGACAGAAAG TATGATTGATAAACTTGGCGGAGTTATCAAAACAAATTTGTTGTCAAAGA GATATAACAGTAAGTGAAAATACAGGCCAGATATCAACAAGTCCCATGTT GTGTACACTCGTCCCAAGTTGGAGCAGTTGACGGTAGGCTTTTAAATCGA AATATGAAAAAAATAGGCGGTTAGGTGGCGGGCGTTCTCTAATTCTCCAT TCGGCGTCCGGTCATTTTAAATGAAAACAAAAGTTAAAAAGGGCGCGCTA TCAGTGAAGGTTATCGTGACATGTTATGACAGAAAGTATGATTGATAATC TTGGTGGAGTTATCAAAACAAATCTGTTGTCAAAGAGATTTAACAGTAAG TGAAAATACAGGCCAGATATCAACAAGTCCCATGTTGCGTACACTCGTCT CAAGTTGAAGCAGTTGACTGCTAATTATGTTGTAGTAATTTGTTCTTCAA TAGAACCTCACACTCTCCCAAAGGTCTATCGTTGGGCTGGATATTGATTG GTTCAAATAATTATCATAGGTCTGTCAAAGATAGTGGATACGATAATCAA ATCCTTCTAAAGGCAACCATCAACAATATGTTCTGTTTGCGTCGTCCGAC TGACTCACCTTCAGAACATAAACCCCGAGTCGGCCCAGTCGCAATAATGT CAGAATTTTTTTTGATAGCTAAGCCTTTTCTACATCACCATATTCGCTTC AAGTTTTTGTTTATTCAGGTTTACTTCACCCACATTGAGTCTTGTTTGAG TTTTTTTCCAACCACCCTCATTGAAATTGTCAAATTGAAATTCACTGAAG TGGTAGCCAAAAATCAGGTCCGGTTTTGAGGTCAACGGTTTTTACTGGAT TTATTTTAGCAAATTTAAACAGGGCGGAAAGGGATTCTGTTTTTTTGCCG ACTGGATTTATCGGGAGTTACTAAATTTAAAAAATCAGACAACATTTGCT ACCGACTGGATTTGGGGATGTTTTATGACGCGAACGGAACATATTATTGA TATACGCCTAATTATTACACTCTTTACTCCTGCGGGAGTAAACTTGTAAA TGCCTGCACTTATCAAAGTCTGCCCGAGTACACACACATTGCACGCTTAA TTTCCCGCTCTGCTTGAAGAAGCTTGAGGTCTGAGGAAAATAGTAGGTTT CAGTTTTAATTTAAAACAGATGGAGCCGTGTTTTTAATGTTTGCCTTCTT CTATTTCTTCAAGTGTAGAAAGGTCCTTGAACAATTTTTAATGTACCACA TTATAATGCGCGACATCAATTATAATGGATGCAAGACATTATAATTTATT AAAAATCAACATATAATGATGTACAACTTTATTTTCCGTGGTGAGTTAGA GCTGAAGAACAACATATTTCAAACCCTAACCCTAACTATCAAAGAACAAA ACAAAATCCATAACTCCGACAGAAAGTGACTGTACGGTCACCCTGTTTAC CTGTACCGTCATTCCTCATTCGGGAATTAACTGCATGTGGTTTAAAAGAA CAATAAATTATGCGTGTGCATAAGTCTTTATGTGAAACATTTACCGTATC TACACATAAGGTAGATTTACGGATTCTACATATCTACACATTATGGTAGA AATAAGTGCGAGAATGTGTTGGCCTTTTTGGTTATGGGGGTATATACAAA GTATAGGACAAGGACACGATTTAGATTTTTTCTTGGGTGGGGGTAGGAAC TCCAGAAGTCACACAACTTTTGTTGATGTCAAACCAAATGTTTCATTTTC CCGTGAACTTTGAAGACAAAGTCACTTAAAAAATAAATGCATAATCAATG CAACGCCAGTAATAGATGCAAAATATATATTCAATCAGAAGCGAAATGAG ATCTCTCAGTAGTTTTAGAGCAATCTGCCTTTAAAAGCCTGAGGTACACA CATTATGAATATTGAATTTATAGGTTGTTGGTTAGTAAATCGAGCAACAA GTCGTTGGCTCTTAACTTCTATTTATGATACTAATAGACTAAAGCTTTGT TATTTTTTTCAGCAAAAACTCAAAAATGAATGGAATGTCTGACACAACAG GTGGTTATGATGTCGAGTTTGCAGAGAGTTTGTCTGCAAATCTAGATGAC ATCAAATGTGCCATTTGCTTACTGATTTTGAAAGAGCCACTTCAAGCAAA CCCTTGTGGTCATAGATTTTGTAAGAGCTGTATCGAAAGAGTTCCTGGTT TTGGGTGAGTCAAAGAAGGCTTTCAGAAATCCGATAACTATTTCATAATA ATAATTGAATTGAATGGTTTTCATTATCTTTTGTATTCGAACAGATTCGA AAGATATTATTTTCTCACTTCAACAATTCTAGATTTAATGATTCTGCTAA CCCTCCTACGAAGAGCTAAGACAAGTTTTGCTTTGCTGTGATTTTCTATT TTTTTCACGTACATTTGTCTAAGAGAGCTTTTCTTCCTGAAAATTTTTAA ATAGCAAACAAGTAACTAAGATCTCTTCAAAAATTTTTGTTTTTATAATC TAGTTCGTTTATATCTTTCAGGTTGGACAATGAACTAGTTTGTCCAAGCG ATCGACAGTCTGTTAAGGTATAATATTCACTTTTTCTTAGTATTCATGCA ACTATAGCAACATTAAGTACATTTTAATGATAACTTACTTGCTGTACTAA ATCTATCTAAATCCATCAATTTTAATTTGGTTCCTTAGGTATTTGCTGAT ATCGGCAAGGAGAGGGAAATATTAAATCTTCAAGTCAAATGCACAAGTTT CGATTTATCCTGTAATTGGACTGGTGAATTGCGCACTCTTGAGGTAAAGA ACTTTCATATCAATTTCTAAATTCTTTCATTTCAATACATTATAAAATTA TGAAGCTTTGGCAGGTAATATATGCAATCTTTATTGTTCTTTTTTAACAT TTCAAGGACCCCCTTGTTAGGACTTGCTAATTGTTATGAAGCACAATTTT ACTCGATCAAAGGCAGTCAATGTCCTAAAAATCCATAGTTCTTTTTCTTT TTAACCCTTCTTGTGTCTTTGGACAGAGATAAATCATTGCTTGTTAGCAG CAGCTCCAATTGTATTACAGTCATTGTATTGAAATGCTTTTATTTTATAG GGACATTTGAAGTCGTGTCCGCATGCAATATTCCCATGCAAATATCAGGC ATTAGGATGTAAATTTCAGGTATACAAGATTAGTTAATGCTTTGGTTTCA AAATTAGTCCATGTCTTTTGAATGTGATTGTGTGTCTTAGCTGTTGACGT TTCACAGTATCATTGAATTGAGCATACAATTCTCTGTACTCACTTTTGAG TTAACGATAAGAGATGGCGGGAAAAGACATTGTTCAACTATTGAAGCGTT TATTTGACTTATTTGACACAAGACCCATGGACTTTCATAACTGAATTATT TTCTACATAAGTACACGAGTCTCTCTCATCTAAGGGTTACAAAAGAAATT AAAACTCAAAACAAAATAGTCTATTCAAAATCGGCTCTCTTAATGTCACT TTCTCTGTCTGTCTTGACTAAAATTCTATTTCCTAAGGCATAGTTTTCGT AAGACTGATCTGCACATGCCCAACATTCTTCAACCAAATCTCCATGGACT CTAGTGCTCAACTAGATTATTTATTCTGTATTTGTCTCCCATCCTCTACA CGTAGGGTAATCGGCAGCAACTGTGCACTCATTTAAAAGAAGATATAGAT GATCATTTCTCATTACAAATGGAAAAGATTATGCGACAGGAAAATCAAAT CAGAGAACATGAGATTGAAATCGCTCAACATCAAGAGACAATATCACAAC AGAATAATGTTATATCAAGTCTACTGGTTGAAGTTAAAAGTCTTTCAGTC ATGTTTTTTCCACGTTGCCCTTATGAATTCGTCATTGAGAATTTCAAAGC AAGACTAACGAATTCTAAACAACAAAACGATTTCATATATTCGGAGACGT TTTATTATTTAAATGGTTACAGGGCACGATTAAAAGTTTATTTGAACGGT CGGAACGCTGTTCAAGGGACTCACATGTCAGTTTATTTTCAAATCATGAA GGGACCATTAGACGATAGTTTACAATGGCCGATGATTTTTGGACTGATTA AAATTTCACTGATCATAAATGAGAAATGCAAACATAAAATGGCAATCAAT TGCAAGCAAGACCAAGAACATTTAAAAACTCGTTTTGTGAAACCTTTAAG AGAGGAAGGAGAAGCTTATGGTGTGAAATATTTTGCGCATAGAGACTTGC CTATTGATATACATGGTGACTTGATAAAATTGGTTGTTCATGTCACAAAG TTATAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000025_pilon:1362651..1372356-

>XLOC_037672 ID=XLOC_037672|Name=XLOC_037672|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2172bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1362651..1372356- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAAATAAAAGATGGCGGGCGCTAAAAATAAAAGATGGCGGGCGCTCAAA
AACTCAAAAATGAATGGAATGTCTGACACAACAGGTGGTTATGATGTCGA
GTTTGCAGAGAGTTTGTCTGCAAATCTAGATGACATCAAATGTGCCATTT
GCTTACTGATTTTGAAAGAGCCACTTCAAGCAAACCCTTGTGGTCATAGA
TTTTGTAAGAGCTGTATCGAAAGAGTTCCTGGTTTTGGCAAAAACTCAAA
AATGAATGGAATGTCTGACACAACAGGTGGTTATGATGTCGAGTTTGCAG
AGAGTTTGTCTGCAAATCTAGATGACATCAAATGTGCCATTTGCTTACTG
ATTTTGAAAGAGCCACTTCAAGCAAACCCTTGTGGTCATAGATTTTGTAA
GAGCTGTATCGAAAGAGTTCCTGGTTTTGGGTTGGACAATGAACTAGTTT
GTCCAAGCGATCGACAGTCTGTTAAGGTTGGACAATGAACTAGTTTGTCC
AAGCGATCGACAGTCTGTTAAGGTATTTGCTGATATCGGCAAGGAGAGGG
AAATATTAAATCTTCAAGTCAAATGCACAAGTTTCGATTTATCCTGTAAT
TGGACTGGTGAATTGCGCACTCTTGAGGTATTTGCTGATATCGGCAAGGA
GAGGGAAATATTAAATCTTCAAGTCAAATGCACAAGTTTCGATTTATCCT
GTAATTGGACTGGTGAATTGCGCACTCTTGAGGGACATTTGAAGTCGTGT
CCGCATGCAATATTCCCATGCAAATATCAGGCATTAGGATGTAAATTTCA
GGGACATTTGAAGTCGTGTCCGCATGCAATATTCCCATGCAAATATCAGG
CATTAGGATGTAAATTTCAGGGTAATCGGCAGCAACTGTGCACTCATTTA
AAAGAAGATATAGATGATCATTTCTCATTACAAATGGAAAAGATTATGCG
ACAGGAAAATCAAATCAGAGAACATGAGATTGAAATCGCTCAACATCAAG
AGACAATATCACAACAGAATAATGTTATATCAAGTCTACTGGTTGAAGTT
AAAAGTCTTTCAGTCATGTTTTTTCCACGTTGCCCTTATGAATTCGTCAT
TGAGAATTTCAAAGCAAGACTAACGAATTCTAAACAACAAAACGATTTCA
TATATTCGGAGACGTTTTATTATTTAAATGGTTACAGGGCACGATTAAAA
GTTTATTTGAACGGTCGGAACGCTGTTCAAGGGACTCACATGTCAGTTTA
TTTTCAAATCATGAAGGGACCATTAGACGATAGTTTACAATGGCCGATGA
TTTTTGGACTGATTAAAATTTCACTGATCATAAATGAGAAATGCAAACAT
AAAATGGCAATCAATTGCAAGCAAGACCAAGAACATTTAAAAACTCGTTT
TGTGAAACCTTTAAGAGAGGAAGGAGAAGCTTATGGTGTGAAATATTTTG
CGCATAGAGACTTGCCTATTGATATACATGGTGACTTGATAAAATTGGTT
GTTCATGTCACAAAGTTATAGGGTAATCGGCAGCAACTGTGCACTCATTT
AAAAGAAGATATAGATGATCATTTCTCATTACAAATGGAAAAGATTATGC
GACAGGAAAATCAAATCAGAGAACATGAGATTGAAATCGCTCAACATCAA
GAGACAATATCACAACAGAATAATGTTATATCAAGTCTACTGGTTGAAGT
TAAAAGTCTTTCAGTCATGTTTTTTCCACGTTGCCCTTATGAATTCGTCA
TTGAGAATTTCAAAGCAAGACTAACGAATTCTAAACAACAAAACGATTTC
ATATATTCGGAGACGTTTTATTATTTAAATGGTTACAGGGCACGATTAAA
AGTTTATTTGAACGGTCGGAACGCTGTTCAAGGGACTCACATGTCAGTTT
ATTTTCAAATCATGAAGGGACCATTAGACGATAGTTTACAATGGCCGATG
ATTTTTGGACTGATTAAAATTTCACTGATCATAAATGAGAAATGCAAACA
TAAAATGGCAATCAATTGCAAGCAAGACCAAGAACATTTAAAAACTCGTT
TTGTGAAACCTTTAAGAGAGGAAGGAGAAGCTTATGGTGTGAAATATTTT
GCGCATAGAGACTTGCCTATTGATATACATGGTGACTTGATAAAATTGGT
TGTTCATGTCACAAAGTTATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037672XLOC_037672-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000025_pilongenomesc0000025_pilon:1362651..1372356 -
Properties
Property NameValue
Aaloc436-1086:652
Aaloc367-435:1207
Aaloc262-366:1619
Aaloc217-261:1785
Aaloc25-213:2294
Aaloc1-21:9707