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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000025_pilon:1352522..1356841- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037671 ID=XLOC_037671|Name=XLOC_037671|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4320bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1352522..1356841- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCAATACTTACACATTATACGCTGCTGAAGGGATGGCTCCTCCTCC
AGTTGACCCTGCTCCACAGTCTCCACCAACTAGTCAATCTATCTTGACTG
CTGTCAGCAACAATCCCGGTGTTTTCGAAGACTTGCACAAAAAGTGCAAA
GGTATATACTTTTGGGTGCATGTCAATAGTCTGACACTTTCTAGTCCGAC
AGTAAAATAGTCCGAATCTAAAACATAAATTTACAATTTAGAAGTCTTTT
TTTCCGACGCCACTTTTGTCCGAAAACGAAAGATTTTAGAGTGTCGAATG
CTGAATAAAGGGTTTTCACTGGAGAATAATATTAATAAAAGTTCATTTTG
GTGGCATTTTGACATAATTAGAAATAAAGGACCAATGAAATTTGCGTAAA
GATAATTTATAGCAAGAAGAATGCACTGCCTTTAAGGGTCCCTTTTTGCG
TGTTCAGAATTATGCTATAAGGGTTATAAGCACCCCTCCCCAAAAAGGGT
TGTAAAAACAGCTTAATCCAATTTCTTGACTCTTGAAAGCCTAATCCTAA
TAAGCTTCCCAAAATTTAAGAAAAGTCGGGTTTAGGGCCCCAACCTCAAA
GTCAGAACTTTGGATTTTTATAAGCACGTGGTTGCTTATAAAAGATGTGC
CTCCTCTTTGGCGATTCATATTTCGTTTTATATGTTTTTTTGACTCGTTG
TCGGACAAAATTGTTGTCGGAATACTGACGTATTTGTCAAATCCAACGTC
GGCAATTTTTACTGTCGGACTAGAAAGTGTCGGACTACTGACGACCTCCC
ATACTTTTTATTCAATTTCTCTTCTATATCTTCTATATCTATATCAATTT
TTTAGTTCTGTGAATTTTTTTCTAATTTCCCATTGAACTGACTAGGTCAG
TCGAAATTTCTCAGTCTGAGAAATCCTCTCTCAAGTCTGTAAGAGCGCGC
AGTTACACAGTTAAAATTTACGCCTGCTGTGTGCAATTGCTCGGTTATGA
TCCAGTCCAGGTCGAGATTGCTTTAGCAGGTTATAGAGGGTTCAGATTTT
TCAAATCGGGCGAATACATGGTCAACCTGGCAAAAGTTTTTAACACAATC
ATTTTCTACGATAAATTTTGAGTAAGATAGTAGTCCAAGGCTTTCTGATT
TTACCGAAGCGATCTGAAGCAATAAAGTATTTTTAAATGATAGACTAGTT
GAGGGACACCGTCAACTGCTTTAAACTTGGGGCGATCGGACGAAACATGA
GACTGTTGCATATCTGGTCTGTATTTTCACTTACTGTAAAATCGAAAGAG
AAATCGTGTAATTTTTAATACGCAGTTTTTTAACTCAAATCAAATGACTT
TGGAGGTTCGGTGAAATGGTGGCCGAATTGCCGTTCCATGTTTTGTCAAA
TAGTCCCAAGTTGGAGCACTTGACGGTACATGCTTAGCCAGGCTTAGCAC
CCATTCAAATAGTGATAAGCATGTAATTGCACCCTTCAAAAAATTCTACA
ATTTTGATTGCCATGTTTATAATTACGCGTGTAAATCTCAGTTATTAAGA
GGATTTCCCAGACCAAACTCATTTTAAAAATGTCAAAACATATTTAATGA
AAAGCCATTTTGAAAGCTGAACTATATAATGAGGACAAATAAAAATAAAA
TAAAATTTCTTACATTTCCTACAGAAATATGTCTCACAGCTCGAACCTGT
CCTGTTTGTATCAGATTATAAAAAATACAGGATGGGTTTCCTGATCAAAC
TCAAACTGGTAATCCTTAAATTATGACTTCAAGATTTTCAACAACAAAAA
TTGGCAAATTTGGGCCAAATACCGGGGGTTTTGTTAAAATTGCTTTATCA
GATTTTGTTGAGTTTTCCTTACAACAAAGAAAAGATTGTTTATGTTTAAA
ACTTAGCTTGATTTTCAAAAATCATTTTGAATGTGCCTTGGTGTTTTTTT
CCTTTTCCTTTTGAAACATTTGTCATCATCATCCAGCATGTTTTAGCCTA
CCTCTATCAGGTAGGTCCATTCAACATGTTGCTTTTTGGACCTACCCCGG
TGGGGTAGAGGTCCTATAAATTAATCTGTGTTCGTCCGTTCGTCCGTTCT
TTCGTTCGTCTGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATCATAGGAATCTTT
TGATTTTTGGTACAAAGGTGCAAAATGGTGATGGCCAAAAAGTGACGGAG
CTCGATTTTCGGGAAAACAATTTTTTGGGCTAATTTGGGCTAAAAAACAG
GTTTTTTGGACTTCGTGAAAAGTTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTT
GTATGAAAGTAGGGTACCATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTT
TGCAAAAAATTTTTGTTGGCTCAAAAAACACATGTTTATTTATAAGAATC
ACTATTAATAAGCATACATTAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATATTTT
TTAAGAGATAGATGTTTTTTTGCTCATGAGGGCTTACTTTTGATGTGTTA
AATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTTATTTTGGTCT
TACTCCCACTAATTCTTGGGGTTAACTTTAACCAAATTTCTAGGGGGGTC
GGTGAGAAAAGCCTGTTAATACCCATTTCCTTTTCTACTTTAACCAAACT
TGACCAATTGATTGCACCGATTGAGCTTCATTGAACTCCATTGAAATCCA
TTGGGCAATTGAAAAAACACCAGGCATGAGGTACTTAATTAAGACATTAC
TCAAATTTTGGGGATCCTACTGAGACAAATTTTCCTTTTCAAAAATCTTT
CTCTCTTTCAGAACTTTTCCCTGTCCCATTTGATGGGTTTCGACTTGCAA
TCAACAAAGGCTTAAGTAATCATTTCCAAGTCAGTCACACACTAAATTTG
ACGTCAGCTCCACAAGGATCATCATATCACTTTGGTGCTACCTATGTTGG
TGGATCACAGACAAGTCCATCGGAAGTTAGTCTTGTTTAAATTTTGTATG
AAATGTTTTTGTTGACATATGAAATAGCAGTCATTTGCCATCTTTCAATG
ATGATGAATTGATTGTCCTTTTTATTGTTTTTTTCTGTAATATAGAATAA
CACTTGATTGTGTCCAATAAGGAATTTAGATAATGGAGTTTGGAAACAAT
ACAAAAAGAGTTCAGGAAGTTGAACCAGGCCATTTTTTATGCCTTTTAAA
GGTCCGATTATCGGACGCTGCCCCAACAAAAAGTTAAAAATATGTTGAAA
TTAGTAGCAAAAATTGCCTTTTTGTTAGAAAATCACCAGAAAAAGTGCCC
TTTTTGGTTCCAAGCTGACGCTTCCTTTTTTTTCTAGAAAATTGCCTGAG
AGGGCTTATTAGGTGCCTTATTACTCACTGGTTCTAAGGGTTTTGTTTTA
GAAAAAAATATTAATCAAGTATCGTTCAATCAAAATACTGACTTAAAATT
TCACAATGGCATCTTTCAGGCTTATCCAGTCATTCTTGGAGATATTGACA
ACAGCGGAAGTTTGAGTGCGCAAATCATTCATCAGTTTTCTCAAAGAATA
AAAGGAAAATGTGTTGTCCAGGTATAAATAGCTTTTTTGATAAGTATTTA
TCTTTTTAAATGATTTTTGTGGTCATTTCTTGCAATTACTCTTTGATTTT
GTACTCTCAAAATATTCTAAATTAACATACTATCGAGTGACATTTACTTT
TAATGGTCGACACATAGAATTTTCACATTAAAAAACATGAAACCTGTTAA
AAATCTTCTATATAATTATAGAGTCAAAAACAAGAATTAGCCATGGTACA
ATTTGATGCTGATTATCGAGGTGATGATTTCACAGCCACCTGTACCCTTG
GAAATATTGATGTAATTAATGAGTCTGGTATAATTGTTGGTCATTACTTA
CAACGTCTGACAAAAAGTTTAGATCTTGGTGCCGAAATACTTTATCATTA
TGGACAAGGCCAAGAATCAGCTACTCTTTCAGTAGCAGGAAAATATACAC
AAGAAAAATGGATAGGAGCTGCTCAGATAAACCCAGGAGGCTGGCATGTT
TCTTATTATCATAAAGCAAACGATAATATACAGGTTGGAGTTGATTATGA
ATATAGTTCACGGATGCAAGACTCTTGCGTAAGTTTAGGTTACCAAGTGG
ATGTTCCTAAAGCTAATGTTACTTATCGTGGTTTGGTTGATACTAACTGG
ACTGTTGCTGGTATATTCGAGAAAAGATTACACCCATTACCATTTTCTTT
TGTATTAAGTGGAATGTTAAACCATGTCAAGAATCAATGTCGGTTCGGTT
TTGCATTACAAATTGGTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000025_pilon:1352522..1356841- >XLOC_037671 ID=XLOC_037671|Name=XLOC_037671|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1932bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1352522..1356841- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCAATACTTACACATTATACGCTGCTGAAGGGATGGCTCCTCCTCC
AGTTGACCCTGCTCCACAGTCTCCACCAACTAGTCAATCTATCTTGACTG
CTGTCAGCAACAATCCCGGTGTTTTCGAAGACTTGCACAAAAAGTGCAAA
GATGGGCAATACTTACACATTATACGCTGCTGAAGGGATGGCTCCTCCTC
CAGTTGACCCTGCTCCACAGTCTCCACCAACTAGTCAATCTATCTTGACT
GCTGTCAGCAACAATCCCGGTGTTTTCGAAGACTTGCACAAAAAGTGCAA
AGAACTTTTCCCTGTCCCATTTGATGGGTTTCGACTTGCAATCAACAAAG
GCTTAAGTAATCATTTCCAAGTCAGTCACACACTAAATTTGACGTCAGCT
CCACAAGGATCATCATATCACTTTGGTGCTACCTATGTTGGTGGATCACA
GACAAGTCCATCGGAAAACTTTTCCCTGTCCCATTTGATGGGTTTCGACT
TGCAATCAACAAAGGCTTAAGTAATCATTTCCAAGTCAGTCACACACTAA
ATTTGACGTCAGCTCCACAAGGATCATCATATCACTTTGGTGCTACCTAT
GTTGGTGGATCACAGACAAGTCCATCGGAAGCTTATCCAGTCATTCTTGG
AGATATTGACAACAGCGGAAGTTTGAGTGCGCAAATCATTCATCAGTTTT
CTCAAAGAATAAAAGGAAAATGTGTTGTCCAGGCTTATCCAGTCATTCTT
GGAGATATTGACAACAGCGGAAGTTTGAGTGCGCAAATCATTCATCAGTT
TTCTCAAAGAATAAAAGGAAAATGTGTTGTCCAGAGTCAAAAACAAGAAT
TAGCCATGGTACAATTTGATGCTGATTATCGAGGTGATGATTTCACAGCC
ACCTGTACCCTTGGAAATATTGATGTAATTAATGAGTCTGGTATAATTGT
TGGTCATTACTTACAACGTCTGACAAAAAGTTTAGATCTTGGTGCCGAAA
TACTTTATCATTATGGACAAGGCCAAGAATCAGCTACTCTTTCAGTAGCA
GGAAAATATACACAAGAAAAATGGATAGGAGCTGCTCAGATAAACCCAGG
AGGCTGGCATGTTTCTTATTATCATAAAGCAAACGATAATATACAGGTTG
GAGTTGATTATGAATATAGTTCACGGATGCAAGACTCTTGCGTAAGTTTA
GGTTACCAAGTGGATGTTCCTAAAGCTAATGTTACTTATCGTGGTTTGGT
TGATACTAACTGGACTGTTGCTGGTATATTCGAGAAAAGATTACACCCAT
TACCATTTTCTTTTGTATTAAGTGGAATGTTAAACCATGTCAAGAATCAA
TGTCGGTTCGGTTTTGCATTACAAATTGGTTAGAGTCAAAAACAAGAATT
AGCCATGGTACAATTTGATGCTGATTATCGAGGTGATGATTTCACAGCCA
CCTGTACCCTTGGAAATATTGATGTAATTAATGAGTCTGGTATAATTGTT
GGTCATTACTTACAACGTCTGACAAAAAGTTTAGATCTTGGTGCCGAAAT
ACTTTATCATTATGGACAAGGCCAAGAATCAGCTACTCTTTCAGTAGCAG
GAAAATATACACAAGAAAAATGGATAGGAGCTGCTCAGATAAACCCAGGA
GGCTGGCATGTTTCTTATTATCATAAAGCAAACGATAATATACAGGTTGG
AGTTGATTATGAATATAGTTCACGGATGCAAGACTCTTGCGTAAGTTTAG
GTTACCAAGTGGATGTTCCTAAAGCTAATGTTACTTATCGTGGTTTGGTT
GATACTAACTGGACTGTTGCTGGTATATTCGAGAAAAGATTACACCCATT
ACCATTTTCTTTTGTATTAAGTGGAATGTTAAACCATGTCAAGAATCAAT
GTCGGTTCGGTTTTGCATTACAAATTGGTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000025_pilon | genome | sc0000025_pilon:1352522..1356841 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 418-966:550 |
| Aaloc | 316-417:852 |
| Aaloc | 154-315:1508 |
| Aaloc | 1-150:4321 |
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