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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000168_pilon:676180..688540+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037659 ID=XLOC_037659|Name=XLOC_037659|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12361bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168_pilon:676180..688540+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTTTTGAAATGGATCGTGTTGAGAAAGGGAAAGAGGTGAAAGGTGA
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ATGATCGTCCAAAAGCAGACCTTTGTTGTTGTGCATGTCTGCCAAAACGT
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ctttaaaagctcataagcagagaacaagttggtcaaatttaaaaagtgat
agctcaaattttaagttaggatatctactttctaaatatcaaaactccaa
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ttttcgtgggtcaCccggtatgtgacatttaaataattattagatcaaaa
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ggatatctaaaaatatttgacaTTGCGTTTTGCCTAGAGGTGGACGATAa
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TCCACCTTTAGAAAGAAGTAAACTTGCAACAATCTCATTTTCAGGTTTGA
ATTGTgataattaattttCgttttttttcaaagtttttgacattGCTTTT
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GAGTTCtgtttaaaatttgaacaaaCATTTTTAGTTTACAACACGTCTAA
ACAAAGAAATGTACTAGCACATAATAAAAGAGAACTGGTCTAGAATAACC
TCATCATTTAATATCAAATTCATAATGATTGAAGTAAATTTAATGTTTCA
ATACGTCCATTTTAACTGTCGAATCGTTTTCATTATTTACAGGACCCTTT
GCTGGGACAGTGCTAGGAATGCCACTATCAGGTGTTATTGCTAATTCCTT
TGGATGGCCATGGGTCTTTTATACTTTTGGTAGGTTTGTATAATAACTAC
TGCAATAATATTTTATATTGGACGATGAGAAGGATCTGAGGCCGTCTATG
TATAtggtgttgtttttttatatttcttaaaaatctagCTGCTTAGTTGT
TGTTTGTCAATGATACTACAATAATATTGATATAggaaaatgaatagaaa
acaaaataataacgAAACTTCTGATATTTTAATACGTTACGTTGCTTTCA
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aagaacataaggcttcgaggcccaaaaatttaagaacattctaagaacat
tctaaggctttggagacttaaaacatgcattttcttaagaaattacatca
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tgggattgaatttcggtcaaatgttaaaagtattaattatgacgtttgca
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TTATTGCACACATGACCGAAAACTGGGGATGGTACACATTATTGACACAA
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TTCCATTATCGTTGATACTGTATatggtttttttatgagaacattttATG
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gatgaaaataaaactaagaacattgttCCAAAACTTACTGGTGTTATTGG
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aatttttctttcatcgttattactcttaggtgccaaataaattttccaac
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TCGATTATGAGATCATAATGAGCTAATATTAATTTGAATACCGTAAAGTT
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ATCACTtattgaaaaaggttttttccctctgaccactaagcaaagaaatt
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gagtgtcggaattagaggaggtatgtcgacattagaccaacttacagtag
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CTGCATTACCTTACTTGGCTATGGTGATTGTGGTCCAGTGCGCTGGTCGG
TTGGCTGATTTCTTGAGGAGCAGAAATATGATGAGCACTACCGCTGTCCG
AAAGATGTTCAATTCTATAGGTTTGTTAGccctagtttagacggcccact
tttcgccctgcctattctaattgtggaTTAAAGTGGGCAGTAGGTTGGCT
GTCTAAattcaatgcattgccctcttttgacgtcaatgcaatgttttctt
tcaagcttttccaagcaaagattttaactgccaactttttgCCCTCCttt
tgcctactctaacaattcatgatatgcaccactgcaatgacttcacgaaa
ttatgcaacttttctgtgtTGTTCCACCTGATACGTcactttctattgtt
taagtgacgtatatggtggaaaattttaaaagttctcagaagactctcca
gtggtgcatatcatgaatcagaattcatgatatgcaccattgcaatgtct
tccattccacccaatagctgattggttgaaagtgacgtattgactgattt
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ggccgtctaaagtAGGCCTTATTATCCTTCTTACTAATCTTTCGTCATTA
GCCGACGTTCACGAACTTAACGTTTCacttcgaaacaaaatgaaaccatt
cttttgaattcaatttttacgtcacttctaaccaatagaatggctatATT
TCTTTTTAGAGCGAAACGATAACAAGATCACAAAGTGTCAaagcattttt
tttccaaaactgagaaatttaaaaatcggATGTGTCTttaacatagtgtc
ctccctcaaaccaattttccaattttgaatgagtgagggggggggaggga
aatgaaaatttgaatagtaaaggggggggggggggggggggggggaaggg
gggggaaacatcgatagttggcaaatttggtggggaaagtgtgaaatcac
ttcaattttatctcagcaaccaaggtcagtccacatgatatcatgtgatt
agatcatgattgaaaaattaaccaatcttcgttctattttgtctagtatt
ccttttgcagcaaaattttacgtttgtgccAGGTTgacatttgagaaatt
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aagcaaaaaagaggggggaaactaaaaaactgaaaagtcatagggggggg
agaagggggggggggggagatttaaaaaaatcaagaatttggtgggggaa
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gacgagaaataaagaactaaaaatTACAATTGCGACAACATGAATTTTTG
ataattactcaatttttttcgaatattCAGGAGCACATATATGGTTGCCT
CTCTCTAATTATTTCTTCAAGGAACAAGGgcttttcttttaaataaagaa
agattcgaattataaagtCTCGAATTATAGactgtttttatctttttgta
tcgttttaaagttatattttgaaatccattaagcctgttttttttggaat
ttgattATTGTCATGGAAAAATCTCCTTGTTTGAGAAGTACAACGTTTGC
ActctttaaatattttgaaatgtagcGGAATTCTATTGCTATTGTCAATA
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GGTTTGCATTATAattaaattatcaattaaaatttaaaaaaaatcataaa
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TTTCGCTTGTGATCTTTTCCACATTTGATCTCTAAAATACGCTTTTGTGT
TTTTATGTTGCTGGCACAACAAAGTATAAACTTTTGGTCCataaaaaatg
gtcaaaaacagTGTCTGCGCAACGGCCAATATGAGCATTTGTATTGCACG
TGTGATATTTTTATCACTCTGAAGAAAGTATAATGGGAATATAGTAATGT
AGGTGAAAGTAACTGTTAGCGTTGAATATGCGATTGACATCGCTTCATTG
AAAGGTCCTGGCAAATTTCGTCCTCTGTAAGCTTGGACCGCTGAAAATAG
ATGTTGAATAATGATTAGCAGGATTTGTGCATTGATATGAAACCCAGTGT
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TCTGGCAATCGGATCAGCAATGACCATAGAAGGACACTAGTGTCTATGAC
CAGAAACGCAATAACCATAGATGATTGAATaatatttgatttctttttat
ccGAATGCGTTACCACCGTTTTAGCTCTGAATGCAGCCAATATCTTGTGT
GATTTGACTAAAATGATGATCGCTGGACATGTAGATAGTAGAAAAATAGA
TATTGGTCGGAGTTGACATTTCAATAAAGATGGCTCGCCAATGAAAAGCA
GAGGGATAAACAGAAATTGTAAGCCAGTCACTGCTAAATGCAACAAGCAA
TTATACGTATTAATTGCTTTGGCGAACAGTGAATTTCTGTGCGCTAAAAG
AACTGTAATAGTAAATAGTGATACCAGGAAGCCTATACTGCAAACAGATA
CGGTAAGTATTGGTAATAATTGATGAAATTTGATATACTCTTTATAGTAA
GGGCTGTAACAATGGCTTCGATCCTTTGATGATACCATCATTTCTGGACA
ACTCTGGCAGCTTTGATTTGATGCTGGTTTATCATtgtaataatttaaaa
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ttgattttgccGAAGAATGGCTCATAACCTGTCGCACAGGTAGACAAGAG
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GTGCTTGAAATCTTTAAACGTAAAAAAGGACAAGACGCCCATGTTTTTCC
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ACAAATTCCAATACTCGAAGTCATACCATTCTGTGTTATAGTCGAAATCG
TAAGAAATCCAAGTTCTTTTTGTACCTTCGGTGTAGTTTTTAGCATATAA
TCTGAATAGCGTATTTTGACTTTGTGAATCTCCAATAACTATAAAAATCT
TAAGCTGGGTGTTTCGGTTGACTTCTTTTACAAGACTCTTAAGGGCTGTA
GCGTTTGAAGAATCGATTTTATATAGTGTATGGCAAAGCTTCAATTCTTG
GTACTTTGAcattaactttttataaaaatgttcaatAGCTACATCATAAA
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TGAGGACATGGTTCCAATAGCTTTGTCTCCTATTGTAAGCCTTGTCTATT
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TTTTTCCAGTTTATCTAAGCCAATAAGTATGGGGATTAAATTGTAGTAGC
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CTACGAGAAGTATGTTTCGTTGGAACTAATATTGATTTTGAACTTCGATT
TCTTTGTTTGAATAAGAACTGTGAGATTGTTGAATTAACCAGAAGGTGTA
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ATACGTTTTTTCACTATCCAGTGATTAGATTagaatctaaacatagaatt
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AATccattgaaatttttaattaaagtTTGACTGTTCGTGACATCTCCAAA
TTCAATTTACGTCTCTTTTTTGTggagaaaaacatttaattgaAAAAGAC
ACGTAAGAGGTCGAAATATcgttaaagaaaaatgtgttatgttttattta
aattttgaatgagggttctttaaaaaataataattttacagtgaaattga
agattttcattttcattctgaGCAAAAGAGTTATAAGTGAGAAGCGTAAA
AATTACTTTCCCTCTTTGATTTTATggattctaaaacacccaatttctta
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aacctttttggaattaaaactcaaaaaggtaaGAGCACCCATAGGCTTCA
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GAAGACATTCAGGATAGATTCAGCCtttgtttacgttttttgctGACAAT
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ATAGCGGAAAAGTTggattttctcaactttttattttccgCCGAGAAAAC
TTCAAATTCCGCCTTGCTTATAGATCGAACATGCGCAGATGAACCAATGT
AGGCGGAAAGCACTTTGCGTTTTCCGCCGAATGGAAAACGGCCTTTAGAT
ATCTTTAAAGTCAAGGAAAAAACGTTTTAAGTCAATAAGTGAACAGAGTA
AACATATCAAGAATATTGAAGAATATTTAACCCTTCGATTATCTTGGGGA
AgggggggAGCTCAGTCTGAGGCTGAATAAAAcgaaattttttgATAagt
tttgaaatatttctccGATTGACTTGAAACTTTGCAAGTGTGCGCAAATA
TGAATTGGCATCTTTGACATcattgatgatgtcatcatatTTTAAAATGC
TCAAAGTAGAACCCCCTCTAACTTCTTTTAAGTTAAAttgtttttgctca
aattttgcaagGAACTCCACATAAAAtgtattttaaatttcaaactcata
AGCACTTGTCAATATTGAGATGTTCAGGGGAGcctccccctccccccaag
AAGCTTCCCCTCGtaaaaaaataggaagatgctcgaagggttaagcTTGA
AAATCGCAAATAATAAGACAAACCAAGCCTCGGTCTAATTCTTATGACTT
TTAActtccttttctatttttccacaCACAGGTTTCTTCTCACAGGCTTT
ATTCATGGTCATCGTTGGTTACACCAAGAATAAGGACTTGGCAATCATTG
GATTGACCTTAGCTGTTGGATTAGGTGGTTTTGCATGGACGGGTTTTCCA
ATCAATCACTTGGATATCGCACCACGTTATGCCTCCATTTTGTTTGGTAT
TAGTAATTGTTTTGCAACGCTACCTGGTATTATAAGTCCATTGGTCGTCG
GGTTGATTACTCCACATGAGgtttgtacacgcttttttgtatgaaaacaa
tttttatcaGAAAAGGAGTTATTAGCATGATAGCATAATTTTCATTGGCG
CTTTTAAGCAAAGTGTGTACTTCCGTATCTACTTGACGGTACTTTGAACT
TGCGCTTTATCGAGATTTTATGATTTATAGATACTTCTATAAAATGAGCT
AGTTCTCTGTCCCTGTCAAGAGAATATCATTGAAATGCTTTTTTAATCCG
AGTCCCTCTGTATTAGATGTGGCGTCGATACCTTGCCTTGATAGTTTCAA
CCGAAAGACAGTGGGAAATCGAACTATTTATTCAACACGGCCCTCGTTAT
TCCatatttcttaaaagaaataTGTAAATAAAACTCGTATTGTGTTTTCG
TACATTTCAGACACAAGAAGAATGGCGAGTTGTTTTCTTCATTGCTGCTT
CAATCTACTTATTTGGTTTATTGTTTTACTGTATCTTTGCGTCTGGTGAG
AAACAAGAATGGGCTGATGGCAATCAATACTTCAACCATACCAATGATGA
TGGTGAAGAGGGTCATGAATTGCTGGCTAACAAGAGTGGCGTTGACGAGG
AGGATGAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000168_pilon:676180..688540+ >XLOC_037659 ID=XLOC_037659|Name=XLOC_037659|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3096bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168_pilon:676180..688540+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTTTTGAAATGGATCGTGTTGAGAAAGGGAAAGAGGTGAAAGGTGA
AAATTCTGATCTTTACTCTTATGATGCAAGTAGTAATCACAAAGCCAATC
ATGATCGTCCAAAAGCAGACCTTTGTTGTTGTGCATGTCTGCCAAAACGT
TACCTGGTCGCTATCATGgctttttttggatttgttAATGTTTACGCATT
GAGAGTAAATCTTAGTGTAGCTATGGTGGCAATGGTATCCAATAGGACAG
CCAAATATGCAAATGGGACTGAGTATACTGTgATGTCTTTTGAAATGGAT
CGTGTTGAGAAAGGGAAAGAGGTGAAAGGTGAAAATTCTGATCTTTACTC
TTATGATGCAAGTAGTAATCACAAAGCCAATCATGATCGTCCAAAAGCAG
ACCTTTGTTGTTGTGCATGTCTGCCAAAACGTTACCTGGTCGCTATCATG
gctttttttggatttgttAATGTTTACGCATTGAGAGTAAATCTTAGTGT
AGCTATGGTGGCAATGGTATCCAATAGGACAGCCAAATATGCAAATGGGA
CTGAGTATACTGTgagTCCAGAACTTGACTGGAGTCCAAAACTTCAAGag
TCCAGAACTTGACTGGAGTCCAAAACTTCAAGGATTTGTTCTTAGTTCAT
TTTTCTATGGTTATATTATCACACAAATACCTGGTGGCTGGCTTGCTACA
AAATATGGTGGTAAAAACTTGTTTGGTTGTGGTGTCCTAATGACAGCTCT
TTTTACATTGATTACACCACCTGCAGCTAGATGTAATGTTTATTTACTGG
TGGCCGTAAGAATGGCGGAAGGATTATTCGAgGATTTGTTCTTAGTTCAT
TTTTCTATGGTTATATTATCACACAAATACCTGGTGGCTGGCTTGCTACA
AAATATGGTGGTAAAAACTTGTTTGGTTGTGGTGTCCTAATGACAGCTCT
TTTTACATTGATTACACCACCTGCAGCTAGATGTAATGTTTATTTACTGG
TGGCCGTAAGAATGGCGGAAGGATTATTCGAgGGTGTAACATTCCCAAGC
ATTTATGCAATCTGGAGAAAATGGGCTCCACCTTTAGAAAGAAGTAAACT
TGCAACAATCTCATTTTCAGGGTGTAACATTCCCAAGCATTTATGCAATC
TGGAGAAAATGGGCTCCACCTTTAGAAAGAAGTAAACTTGCAACAATCTC
ATTTTCAGGACCCTTTGCTGGGACAGTGCTAGGAATGCCACTATCAGGTG
TTATTGCTAATTCCTTTGGATGGCCATGGGTCTTTTATACTTTTGGACCC
TTTGCTGGGACAGTGCTAGGAATGCCACTATCAGGTGTTATTGCTAATTC
CTTTGGATGGCCATGGGTCTTTTATACTTTTGGATTGTTTGGTGTGATTT
GGAGTTTCTTTTGGTTTGCACTGGTGACAGACTCTCCTTGTGATCATCCG
AAAATCTCTAAAGAAGAATTAGATTACATTCAAAACTCTTTGAAGCAAGA
TAAACCGGAAAAACAGGATTGTTTGGTGTGATTTGGAGTTTCTTTTGGTT
TGCACTGGTGACAGACTCTCCTTGTGATCATCCGAAAATCTCTAAAGAAG
AATTAGATTACATTCAAAACTCTTTGAAGCAAGATAAACCGGAAAAACAG
GTTGAAAATATACCTTGGAAAGACTTTATAACCTCGTTGCCAGTATGGGC
AATCATTATTGCACACATGACCGAAAACTGGGGATGGTACACATTATTGA
CACAACTTCCAACATATCTGAAAAGCGTGCTGGATTTTAATCTACAAGCT
GTTGAAAATATACCTTGGAAAGACTTTATAACCTCGTTGCCAGTATGGGC
AATCATTATTGCACACATGACCGAAAACTGGGGATGGTACACATTATTGA
CACAACTTCCAACATATCTGAAAAGCGTGCTGGATTTTAATCTACAAGCT
GCTGGATTTTTAGCTGCATTACCTTACTTGGCTATGGTGATTGTGGTCCA
GTGCGCTGGTCGGTTGGCTGATTTCTTGAGGAGCAGAAATATGATGAGCA
CTACCGCTGTCCGAAAGATGTTCAATTCTATAGGCTGGATTTTTAGCTGC
ATTACCTTACTTGGCTATGGTGATTGTGGTCCAGTGCGCTGGTCGGTTGG
CTGATTTCTTGAGGAGCAGAAATATGATGAGCACTACCGCTGTCCGAAAG
ATGTTCAATTCTATAGGTTTCTTCTCACAGGCTTTATTCATGGTCATCGT
TGGTTACACCAAGAATAAGGACTTGGCAATCATTGGATTGACCTTAGCTG
TTGGATTAGGTGGTTTTGCATGGACGGGTTTTCCAATCAATCACTTGGAT
ATCGCACCACGTTATGCCTCCATTTTGTTTGGTATTAGTAATTGTTTTGC
AACGCTACCTGGTATTATAAGTCCATTGGTCGTCGGGTTGATTACTCCAC
ATGAGGTTTCTTCTCACAGGCTTTATTCATGGTCATCGTTGGTTACACCA
AGAATAAGGACTTGGCAATCATTGGATTGACCTTAGCTGTTGGATTAGGT
GGTTTTGCATGGACGGGTTTTCCAATCAATCACTTGGATATCGCACCACG
TTATGCCTCCATTTTGTTTGGTATTAGTAATTGTTTTGCAACGCTACCTG
GTATTATAAGTCCATTGGTCGTCGGGTTGATTACTCCACATGAGACACAA
GAAGAATGGCGAGTTGTTTTCTTCATTGCTGCTTCAATCTACTTATTTGG
TTTATTGTTTTACTGTATCTTTGCGTCTGGTGAGAAACAAGAATGGGCTG
ATGGCAATCAATACTTCAACCATACCAATGATGATGGTGAAGAGGGTCAT
GAATTGCTGGCTAACAAGAGTGGCGTTGACGAGGAGGATGAGTAAACACA
AGAAGAATGGCGAGTTGTTTTCTTCATTGCTGCTTCAATCTACTTATTTG
GTTTATTGTTTTACTGTATCTTTGCGTCTGGTGAGAAACAAGAATGGGCT
GATGGCAATCAATACTTCAACCATACCAATGATGATGGTGAAGAGGGTCA
TGAATTGCTGGCTAACAAGAGTGGCGTTGACGAGGAGGATGAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000168_pilon | genome | sc0000168_pilon:676180..688540 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1348-1548:12161 |
| Aaloc | 1111-1347:11534 |
| Aaloc | 976-1107:5488 |
| Aaloc | 826-975:4446 |
| Aaloc | 694-825:3251 |
| Aaloc | 607-690:2895 |
| Aaloc | 517-603:2507 |
| Aaloc | 319-516:1034 |
| Aaloc | 283-315:584 |
| Aaloc | 1-282:1 |
|
