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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000025_pilon:1278039..1280279- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037627 ID=XLOC_037627|Name=XLOC_037627|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2241bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1278039..1280279- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACCGGTCGACCTTAATCACAATTATCTTTGCATTATGCATTGGTAT
AGTTTTGGCAAAATACCATAGCTATGGTCACTCGTCAAGGAGATATAGAA
CACGTCAAGTTGGTGGCAGTCATCGAGGTAGAGTCAGGAGACACTGCGAC
CAACGCTGTGAGCATCCTACACCAGGTACTGGTGTCTGTCAACCTGATGG
TCGTTGCTTATGTTGGTGGGGATGGACTGGACCTAATGCAGTATCTCTCA
CTGGAGGGTCACTAGATAAGAGAGTTAAAGCAGATCATTGTCGAGTACCA
TGTCACTACACGCCTTCGTGGTCACGTGTCTGTACACCCTTTCTTTCGAC
AACTTCAAAACCCACGACGACAACGACCACCACTACAACGACAACAACCA
AAGCTCCATCAACCAAATGTCATTCTAGATGCGAAAAAGACAAAAAAGCG
TACGGCCGGTGTTTACCGAACGGTCGCTGCTTATGCCGATGGAAATGTAC
GGGTCCTAATTCACAATATGTTAACAAAGGTACGAATCGAAACCGCATCA
CAGCTGATTATTGTACGACATTCTGTCACTACAACAGGTGGTATCGAAAC
CCTAAATGTGTAAGTGTCGTTACGCCGAAACCGCCGAAAAAGAAATGCAA
CGTTAAATGTCATTTGTTTGGTAAAGGTCAATGTTTGACTACTGGCGAAT
GCTTATGTAAATGGAGCTGGACAGGTCCTAATTCTCGTTACATTGACCGT
GGGCTTTATCGAGATAGAATTGTGGCAGACTATTGCAATCAATATTGTTA
CTACGCTAGGTATTGTCGAAATGACGAGTGTTTGATAAAGAAAACGACCA
GAACTACAACGACCACTCCAACCACTACAACGACCACTCCAACCACTACA
ACGACCAAACCTACAACAACAACGACCACTCAAACTACTACAACGACCAC
TCCCACCTCTACAACTACAACAACTAATTCCACTCCTAAAACAAAAACGA
CAACGACCACACCTACAACTACAACGACCACACCTACAACGACAACGACC
AAACCTACAACGACAACGACCAAACCTACAACGACAACGACCACTCCTAC
AACCACGACGACCACTCCAACTACAACAACAACCACACCTACAACTACAA
CAACAACGACCACACCTACAACTACAACGACCACTCCAACAACAACAACG
ACCACTCGAACTACAACAACGACCACACCTACAACTACTACGACCACTCC
TACAACGACAACGACTACTCCAACTACTACAACGACCACTCCTACAACTA
CAACTACAACGACCACTCCTACAACTACAACTACTACTCCAACTACTACA
ACGACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGACCAC
TCCTACAACAACAACTACAACGACCACTCCTACAACGACAACAACTACTC
CAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACT
ACAACGACCACTCCCACTACTACAACGACCACACCTACAACTACTACGAC
CACTCCTACAACGACAACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACAACTA
CAACGACCACTCACTACAACCAAACACACTACAACTACAACTACAACGAC
CACTCCTACAACTACAACTACTACTCCAACTACAACAACGGCCACTCCAA
CTACTACAACGACCACTCCTACAACGACAACTCCAACAACTACAACGACC
ACTCCTACAACAACAACCACACCTACAACTACCACTACAACGACTACTCC
AACTACTACAACGGCCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTA
CAACGACCACTCCTACAACTACAACTACAACGACCACTCCTACAACTAAA
ACTACTACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGACCAC
CCAACTACAACGACCACTCCTACAACAACGACAACGACCACTCCTACAAC
CACAACAACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGA
CCACTCCAATTACTACAACGACCACTCCTACAACAACGACAACGACCACT
CCTACAACCACAACAACCACTCCGACTACAACAACGACCACTCCAACTAC
TACAACTACAACGACCACACCTACAACTATAACAACGACAACAAGCACGA
CCACAACTACTGAATATGTTCCTGAGGAGATATTTAGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000025_pilon:1278039..1280279- >XLOC_037627 ID=XLOC_037627|Name=XLOC_037627|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3000bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1278039..1280279- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACCGGTCGACCTTAATCACAATTATCTTTGCATTATGCATTGGTAT
AGTTTTGGCAAAATACCATAGCTATGGTCACTCGTCAAGGAGATATAGAA
CACGTCAAGTTGGTGGCAGTCATCGAGGTAGAGTCAGGAGACACTGCGAC
CAACGCTGTGAGCATCCTACACCAGGTACTGGTGTCTGTCAACCTGATGG
TCGTTGCTTATGTTGGTGGGGATGGACTGGACCTAATGCAGTATCTCTCA
CTGGAGGGTCACTAGATAAGAGAGTTAAAGCAGATCATTGTCGAGTACCA
TGTCACTACACGCCTTCGTGGTCACGTGTCTGTACACCCTTTCTTTCGAC
AACTTCAAAACCCACGACGACAACGACCACCACTACAACGACAACAACCA
AAGCTCCATCAACCAAATGTCATTCTAGATGCGAAAAAGACAAAAAAGCG
TACGGCCGGTGTTTACCGAACGGTCGCTGCTTATGCCGATGGAAATGTAC
GGGTCCTAATTCACAATATGTTAACAAAGGTACGAATCGAAACCGCATCA
CAGCTGATTATTGTACGACATTCTGTCACTACAACAGGTGGTATCGAAAC
CCTAAATGTGTAAGTGTCGTTACGCCGAAACCGCCGAAAAAGAAATGCAA
CGTTAAATGTCATTTGTTTGGTAAAGGTCAATGTTTGACTACTGGCGAAT
GCTTATGTAAATGGAGCTGGACAGGTCCTAATTCTCGTTACATTGACCGT
GGGCTTTATCGAGATAGAATTGTGGCAGACTATTGCAATCAATATTGTTA
CTACGCTAGGTATTGTCGAAATGACGAGTGTTTGATAAAGAAAACGACCA
GAACTACAACGACCACTCCAACCACTACAACGACCACTCCAACCACTACA
ACGACCAAACCTACAACAACAACGACCACTCAAACTACTACAACGACCAC
TCCCACCTCTACAACTACAACAAATGAACCGGTCGACCTTAATCACAATT
ATCTTTGCATTATGCATTGGTATAGTTTTGGCAAAATACCATAGCTATGG
TCACTCGTCAAGGAGATATAGAACACGTCAAGTTGGTGGCAGTCATCGAG
GTAGAGTCAGGAGACACTGCGACCAACGCTGTGAGCATCCTACACCAGGT
ACTGGTGTCTGTCAACCTGATGGTCGTTGCTTATGTTGGTGGGGATGGAC
TGGACCTAATGCAGTATCTCTCACTGGAGGGTCACTAGATAAGAGAGTTA
AAGCAGATCATTGTCGAGTACCATGTCACTACACGCCTTCGTGGTCACGT
GTCTGTACACCCTTTCTTTCGACAACTTCAAAACCCACGACGACAACGAC
CACCACTACAACGACAACAACCAAAGCTCCATCAACCAAATGTCATTCTA
GATGCGAAAAAGACAAAAAAGCGTACGGCCGGTGTTTACCGAACGGTCGC
TGCTTATGCCGATGGAAATGTACGGGTCCTAATTCACAATATGTTAACAA
AGGTACGAATCGAAACCGCATCACAGCTGATTATTGTACGACATTCTGTC
ACTACAACAGGTGGTATCGAAACCCTAAATGTGTAAGTGTCGTTACGCCG
AAACCGCCGAAAAAGAAATGCAACGTTAAATGTCATTTGTTTGGTAAAGG
TCAATGTTTGACTACTGGCGAATGCTTATGTAAATGGAGCTGGACAGGTC
CTAATTCTCGTTACATTGACCGTGGGCTTTATCGAGATAGAATTGTGGCA
GACTATTGCAATCAATATTGTTACTACGCTAGGTATTGTCGAAATGACGA
GTGTTTGATAAAGAAAACGACCAGAACTACAACGACCACTCCAACCACTA
CAACGACCACTCCAACCACTACAACGACCAAACCTACAACAACAACGACC
ACTCAAACTACTACAACGACCACTCCCACCTCTACAACTACAACAACGAC
CACTCCTACAACTACAACTACAACGACCACTCCTACAACTACAACTACTA
CTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACT
ACTACAACGACCACTCCTACAACAACAACTACAACGACCACTCCTACAAC
GACAACAACTACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGA
CCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCCACTACTACAACGACCACACCT
ACAACTACGACCACTCCTACAACTACAACTACAACGACCACTCCTACAAC
TACAACTACTACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGA
CCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCTACAACAACAACTACAACGACC
ACTCCTACAACGACAACAACTACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAAC
TACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCCACTACTACAA
CGACCACACCTACAACTACAACGACAACGACCACTCCTACAACCACAACA
ACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCC
AATTACTACAACGACCACTCCTACAACAACGACAACGACCACTCCTACAA
CCACAACAACCACTCCGACTACAACAACGACCACTCCAACTACTACAACT
ACAACGACCACACCTACAACTATAACAACGACAACAAGCACGACCACAAC
TACTGAATATGTTCCTGAGGAGATATTTAGTTAACAACGACAACGACCAC
TCCTACAACCACAACAACCACTCCAACTACTACAACGACCACTCCAACTA
CTACAACGACCACTCCAATTACTACAACGACCACTCCTACAACAACGACA
ACGACCACTCCTACAACCACAACAACCACTCCGACTACAACAACGACCAC
TCCAACTACTACAACTACAACGACCACACCTACAACTATAACAACGACAA
CAAGCACGACCACAACTACTGAATATGTTCCTGAGGAGATATTTAGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000025_pilon | genome | sc0000025_pilon:1278039..1280279 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1399-1494:97 |
| Aaloc | 1234-1398:265 |
| Aaloc | 1138-1230:793 |
| Aaloc | 964-1128:958 |
| Aaloc | 868-960:1363 |
| Aaloc | 631-867:1609 |
| Aaloc | 1-630:2242 |
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