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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000042_pilon:1210599..1212806- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037598 ID=XLOC_037598|Name=XLOC_037598|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2208bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1210599..1212806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATCTTTTCGTTCAATTGGTATATATTCCAATTGTTCCACATCTACAGA
TATTGACAATCTACCTTTGGCGACAGATACCATGATTAAACAAACCATCG
AGGCCGTGGTGAAGAAAACTAAAATATTCAAGCATTCTGATTTCGAATAT
CATTCTTACTATATCGAGTGCAACAACACGGATCATTTAGTTGAAACTTT
AATCGAAATTCTCTTAAGTGAGAGATATCATGTGCCATGTGAGGAAGGAA
GAAACTGTTCACAACCAGACATTGTAACTTTGTTTTCGTACATGCAAAAT
GACTTTATGGTGAACTTAGTCAGTAGATTGTTAAGTTTAACGTGGTATCC
AAAGATGTGTCTACCAACCAGCTGTGATGATAAATACAGGTTTGAAACAG
TTGATGATTACTCTAAATACTTACTTCATGTCACTCGAAAACTAAATTGG
AAGAATCTAACAATGCTCTCTTTTTATGAAGATCACCCGACACCATCTGA
AGAATATTTTATCAACAGTTATAATTTATTTGCTGCTACCAAGGAGTATT
GTCTGCAAAGAAAATCCGTTGATGTCAATAATGTGTCTTTTGCAGAAGAT
ATTTTTCCTCATTTGGATTCTTGGCGGCGAAGAGAATCAGCTTTAATCCT
GTTTGGTTCATATCAAACACACCAACAAGATGTTATTCATTTCTTGGACA
ATTTCGGTGGCAAATACAATAACACTTTCATCTTAGCCCATGATCTTCGT
CGTAGCTCAAGAACATACAATCTTCAGAATCCAGGCTATTGGTTTAGTAT
GGAGAATTTACAGCGTAAAGAATTCACTTTTATGTATTCAACACAAGTTG
CAAAAGTTTCCTTGGATGTTTTACTTTCAATTGGGTATAGTGAAATATTA
ATCCAATTTCTGGATGATATATTTGAACTCTTTAAAGGCGAAATGTCACT
TCAAAATTTATCCAAATTAGAGCAACTGTTTGGGTTTTGGTTAAATAGAT
TTATGCGAAACCCTGACTACACTATTCCTTTAAATGAGTTATTAGACGAT
GTTAATATTAATTCAAAATGGTCAATAACCTCAGCTTATACAACATCTGA
AAAGCTTTTAGGAGACTTTAATCATGCATCATTAGGATGTCCAAAACTGA
ATTGTACACCAGGTTATTACAAAAGCTATGGTGAAATTTTCCAACGAGAG
AAAATTTATGACACAAAACATGGTTGGAAGTGTCAACTATGTCCAGAAGA
CCATATCAAAGTTGGCTATGGTGATGGGCGTTGCAGACCATGTCATGGGA
TCAAGAGCATCGATAATGGCTTGAGAACAGAATGTATCGATCCATACACA
AATCGATACTCCAAATTAAACGCAGCAGAAAAAATGATCATTATCCTGTT
AACAGCGTTTGGTGTCTTTGTAACATTCTCCACTTTATTAATTTTTGTAA
AATATCGTGACACCCCCACTGTCAAAGTATCGGATGTTCATTTCTCATAT
TCCCACTTGGTGACTATCGCCATTACCATGTTGGTGAACAATCTTCTCTA
CATTCAAGATGAGCTCCTCGTTTCCATCTCTTTAGCAAAATGTGTCAATT
TAACATTCTTTTATACCCTGAACATGGGGTTTGTGTATACAAAATCACAA
AAACTGATCGACGCTTTCAGTTCTACCGTGAAGTTGACAGGAGGTGAAGC
CAAAAAGACGGTTGCAGTACAAGTCTTCACAATCATAATGTTTATATTGT
TCAGTAATGGTGGCTTATATGTTCTCATTGACATGGAGGAACCTCACATA
TCGTTTGAATTGGACAAAATCAACATGATACGACACAACTTCAGCAACAC
TTACATGTATATGAATCTCATTATTGGATTTCTAATTATTTTCCAATTGA
TTTGTTTGGTTCAAGCTTTTCGTGGACGTCATTTACCAGGACCTATGAAT
GATGCAATGTCTCTTGTTTATGCTACCATGTTGACTACGATGACCCTTGC
AGTCAGTTTTCCAATTGGAATTTTTCGTGAAAAAACTGATCGAGAATTTT
TGCATTGTTTGCTGGTTGTTTTCAACTGTATCGTTTATGTAGTTTTTCTT
TATGGTAAGAAATGCTTTATCATAATGTTCAAGCCACACAATAACACACG
GAATTACTTTAATCAACAACGAATGAAACAAATGACCATCCAATCTCAAA
TGTCTTCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000042_pilon:1210599..1212806- >XLOC_037598 ID=XLOC_037598|Name=XLOC_037598|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4416bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1210599..1212806- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATCTTTTCGTTCAATTGGTATATATTCCAATTGTTCCACATCTACAGA
TATTGACAATCTACCTTTGGCGACAGATACCATGATTAAACAAACCATCG
AGGCCGTGGTGAAGAAAACTAAAATATTCAAGCATTCTGATTTCGAATAT
CATTCTTACTATATCGAGTGCAACAACACGGATCATTTAGTTGAAACTTT
AATCGAAATTCTCTTAAGTGAGAGATATCATGTGCCATGTGAGGAAGGAA
GAAACTGTTCACAACCAGACATTGTAACTTTGTTTTCGTACATGCAAAAT
GACTTTATGGTGAACTTAGTCAGTAGATTGTTAAGTTTAACGTGGTATCC
AAAGATGTGTCTACCAACCAGCTGTGATGATAAATACAGGTTTGAAACAG
TTGATGATTACTCTAAATACTTACTTCATGTCACTCGAAAACTAAATTGG
AAGAATCTAACAATGCTCTCTTTTTATGAAGATCACCCGACACCATCTGA
AGAATATTTTATCAACAGTTATAATTTATTTGCTGCTACCAAGGAGTATT
GTCTGCAAAGAAAATCCGTTGATGTCAATAATGTGTCTTTTGCAGAAGAT
ATTTTTCCTCATTTGGATTCTTGGCGGCGAAGAGAATCAGCTTTAATCCT
GTTTGGTTCATATCAAACACACCAACAAGATGTTATTCATTTCTTGGACA
ATTTCGGTGGCAAATACAATAACACTTTCATCTTAGCCCATGATCTTCGT
CGTAGCTCAAGAACATACAATCTTCAGAATCCAGGCTATTGGTTTAGTAT
GGAGAATTTACAGCGTAAAGAATTCACTTTTATGTATTCAACACAAGTTG
CAAAAGTTTCCTTGGATGTTTTACTTTCAATTGGGTATAGTGAAATATTA
ATCCAATTTCTGGATGATATATTTGAACTCTTTAAAGGCGAAATGTCACT
TCAAAATTTATCCAAATTAGAGCAACTGTTTGGGTTTTGGTTAAATAGAT
TTATGCGAAACCCTGACTACACTATTCCTTTAAATGAGTTATTAGACGAT
GTTAATATTAATTCAAAATGGTCAATAACCTCAGCTTATACAACATCTGA
AAAGCTTTTAGGAGACTTTAATCATGCATCATTAGGATGTCCAAAACTGA
ATTGTACACCAGGTTATTACAAAAGCTATGGTGAAATTTTCCAACGAGAG
AAAATTTATGACACAAAACATGGTTGGAAGTGTCAACTATGTCCAGAAGA
CCATATCAAAGTTGGCTATGGTGATGGGCGTTGCAGACCATGTCATGGGA
TCAAGAGCATCGATAATGGCTTGAGAACAGAATGTATCGATCCATACACA
AATCGATACTCCAAATTAAACGCAGCAGAAAAAATGATCATTATCCTGTT
AACAGCGTTTGGTGTCTTTGTAACATTCTCCACTTTATTAATTTTTGTAA
AATATCGTGACACCCCCACTGTCAAAGTATCGGATGTTCATTTCTCATAT
TCCCACTTGGTGACTATCGCCATTACCATGTTGGTGAACAATCTTCTCTA
CATTCAAGATGAGCTCCTCGTTTCCATCTCTTTAGCAAAATGTGTCAATT
TAACATTCTTTTATACCCTGAACATGGGGTTTGTGTATACAAAATCACAA
AAACTGATCGACGCTTTCAGTTCTACCGTGAAGTTGACAGGAGGTGAAGC
CAAAAAGACGGTTGCAGTACAAGTCTTCACAATCATAATGTTTATATTGT
TCAGTAATGGTGGCTTATATGTTCTCATTGACATGGAGGAACCTCACATA
TCGTTTGAATTGGACAAAATCAACATGATACGACACAACTTCAGCAACAC
TTACATGTATATGAATCTCATTATTGGATTTCTAATTATTTTCCAATTGA
TTTGTTTGGTTCAAGCTTTTCGTGGACGTCATTTACCAGGACCTATGAAT
GATGCAATGTCTCTTGTTTATGCTACCATGTTGACTACGATGACCCTTGC
AGTCAGTTTTCCAATTGGAATTTTTCGTGAAAAAACTGATCGAGAATTTT
TGCATTGTTTGCTGGTTGTTTTCAACTGTATCGTTTATGTAGTTTTTCTT
TATGGTAAGAAATGCTTTATCATAATGTTCAAGCCACACAATAACACACG
GAATTACTTTAATCAACAACGAATGAAACAAATGACCATCCAATCTCAAA
TGTCTTCATTATCTTTTCGTTCAATTGGTATATATTCCAATTGTTCCACA
TCTACAGATATTGACAATCTACCTTTGGCGACAGATACCATGATTAAACA
AACCATCGAGGCCGTGGTGAAGAAAACTAAAATATTCAAGCATTCTGATT
TCGAATATCATTCTTACTATATCGAGTGCAACAACACGGATCATTTAGTT
GAAACTTTAATCGAAATTCTCTTAAGTGAGAGATATCATGTGCCATGTGA
GGAAGGAAGAAACTGTTCACAACCAGACATTGTAACTTTGTTTTCGTACA
TGCAAAATGACTTTATGGTGAACTTAGTCAGTAGATTGTTAAGTTTAACG
TGGTATCCAAAGATGTGTCTACCAACCAGCTGTGATGATAAATACAGGTT
TGAAACAGTTGATGATTACTCTAAATACTTACTTCATGTCACTCGAAAAC
TAAATTGGAAGAATCTAACAATGCTCTCTTTTTATGAAGATCACCCGACA
CCATCTGAAGAATATTTTATCAACAGTTATAATTTATTTGCTGCTACCAA
GGAGTATTGTCTGCAAAGAAAATCCGTTGATGTCAATAATGTGTCTTTTG
CAGAAGATATTTTTCCTCATTTGGATTCTTGGCGGCGAAGAGAATCAGCT
TTAATCCTGTTTGGTTCATATCAAACACACCAACAAGATGTTATTCATTT
CTTGGACAATTTCGGTGGCAAATACAATAACACTTTCATCTTAGCCCATG
ATCTTCGTCGTAGCTCAAGAACATACAATCTTCAGAATCCAGGCTATTGG
TTTAGTATGGAGAATTTACAGCGTAAAGAATTCACTTTTATGTATTCAAC
ACAAGTTGCAAAAGTTTCCTTGGATGTTTTACTTTCAATTGGGTATAGTG
AAATATTAATCCAATTTCTGGATGATATATTTGAACTCTTTAAAGGCGAA
ATGTCACTTCAAAATTTATCCAAATTAGAGCAACTGTTTGGGTTTTGGTT
AAATAGATTTATGCGAAACCCTGACTACACTATTCCTTTAAATGAGTTAT
TAGACGATGTTAATATTAATTCAAAATGGTCAATAACCTCAGCTTATACA
ACATCTGAAAAGCTTTTAGGAGACTTTAATCATGCATCATTAGGATGTCC
AAAACTGAATTGTACACCAGGTTATTACAAAAGCTATGGTGAAATTTTCC
AACGAGAGAAAATTTATGACACAAAACATGGTTGGAAGTGTCAACTATGT
CCAGAAGACCATATCAAAGTTGGCTATGGTGATGGGCGTTGCAGACCATG
TCATGGGATCAAGAGCATCGATAATGGCTTGAGAACAGAATGTATCGATC
CATACACAAATCGATACTCCAAATTAAACGCAGCAGAAAAAATGATCATT
ATCCTGTTAACAGCGTTTGGTGTCTTTGTAACATTCTCCACTTTATTAAT
TTTTGTAAAATATCGTGACACCCCCACTGTCAAAGTATCGGATGTTCATT
TCTCATATTCCCACTTGGTGACTATCGCCATTACCATGTTGGTGAACAAT
CTTCTCTACATTCAAGATGAGCTCCTCGTTTCCATCTCTTTAGCAAAATG
TGTCAATTTAACATTCTTTTATACCCTGAACATGGGGTTTGTGTATACAA
AATCACAAAAACTGATCGACGCTTTCAGTTCTACCGTGAAGTTGACAGGA
GGTGAAGCCAAAAAGACGGTTGCAGTACAAGTCTTCACAATCATAATGTT
TATATTGTTCAGTAATGGTGGCTTATATGTTCTCATTGACATGGAGGAAC
CTCACATATCGTTTGAATTGGACAAAATCAACATGATACGACACAACTTC
AGCAACACTTACATGTATATGAATCTCATTATTGGATTTCTAATTATTTT
CCAATTGATTTGTTTGGTTCAAGCTTTTCGTGGACGTCATTTACCAGGAC
CTATGAATGATGCAATGTCTCTTGTTTATGCTACCATGTTGACTACGATG
ACCCTTGCAGTCAGTTTTCCAATTGGAATTTTTCGTGAAAAAACTGATCG
AGAATTTTTGCATTGTTTGCTGGTTGTTTTCAACTGTATCGTTTATGTAG
TTTTTCTTTATGGTAAGAAATGCTTTATCATAATGTTCAAGCCACACAAT
AACACACGGAATTACTTTAATCAACAACGAATGAAACAAATGACCATCCA
ATCTCAAATGTCTTCA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000042_pilon | genome | sc0000042_pilon:1210599..1212806 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-2208:2209 |
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