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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000042_pilon:1206791..1209085- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037572 ID=XLOC_037572|Name=XLOC_037572|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2295bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1206791..1209085- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAATTACCATTTTAATCTACCTCGTAATGCTGGCTAGCTTCGTCTT
CTCGGAGAAGCAGCAATTATCTTTTCGTTCAATTGGTATATATTCCAATT
GTTCTACATCTACAGATATTGACAATCTACCTTTGGCGACAGATACCATG
ATTAAACAAGCCATCGAGGACGTGGTGAAGAAAACTAAAATATTCAAGCA
TTCTGATTTCGAACGTCATTCTTATCATATCGAGTGCAACAACACGGATC
ATTTAGTTGAAACATTAATCGAAATTCTCTTAAGCGAGAGATATCACGTG
CCATGTGAGGCAGGAAGAAACTGTTCTCAACCAGACATTGTAATTTTGTC
TTCGTACATGCAAAATGACTTTATGTTGAACCTAGTCAGTAGATTGCTAA
GCTTTACGTGGTATCCAAAGATGTGTCTACCAACCAGCTGCGATGATAAA
TACAGGTTTGAAACAGTTGATGATTACTCTAAATACTTACTTCATGTCAC
TCGAAAACTAAATTGGAAAAATCTAACAATGCTCTCTTTTTATGAAGATC
ACCCGACACCATCTGAAGAATATTTTATCAACAGTTATAATTTATTTGCT
GCTACCAAGGAGTATTGTCTGCAAAGAAAATCCGTTGATGTCAATAATGT
GTCTTTTGCAGAAGATATTTTTCCTCACTTGGATTCTTGGCGGCGAAGAG
AATCAGCTTTAATCCTGTTTGGCTCATATCAAACACACCAACAAGATGTT
ATTCATTTCTTGGACAATTTCGGTGGCAAATACAATAACACTTTCATCTT
AGCCCATGATCTTCGTCGTAGCTCAAGAACATACAATCTTCAGAATCCAG
GCTATTGGTTTAGTATGGAGAATCTACAACGTAAAGAATTCACTTTTATG
TATTCAACACAAGTTGCAAAAGTTTCCTTGGATGTTTTACTTTCAATCGG
GTACAGTGAAATATTAATCCAATTTCTGGATGATGTATTTGAACTCTTTA
AAGGCGAAATGTCACTTCAAAATTTATCCAAATTAGAGCAACTGTTTGGG
TTTTGGTTAAATAGATTTATGCGAAACCCTGACTACACTATTCCTTTAAA
TGAGTTATTAAACGATGTTAATATGAATTCAAAATGGTCGATAACCTCAG
CTTATACAACATCTGAAAAGCTTTTAGGAGACTTTAATCATGCATCATTA
GGATGTCCAAAACTGAATTGTACACCAGGTTATTACAAAAGCTATGGTGA
AATTTTCCAACGAGAGAAAATCTTTGACACAAAACATGATTGGAAGTGTC
AACTATGTCCAGAAGACCATATCAAAGTTGGGTATGGTGATGGCCATTGC
AAAACATGTTATGGGATCAAGAGCATTGATAATGGCTTGAGAACAGAATG
TATCGATCCATACACAAATCGATACTCCAAATTAAACGCAGCAGAAAAAA
TGATCATTATTTCCTTAACAGTGTTTGGTGTCTTTGTAACATTTTCCACT
TTGTTGATTTTTGTGAAATATCGTGACACCCCCACTGTCAAAGTATCGGA
TGTTCATTTCTCATATTCCCACCTGGTGACTATCGCCATTACCATGTTGG
TGAACAACCTTCTCTACATTCAAGATGAACTCCTCGTTTCCATCTCTTTA
GCAAAATGTGTCAATTTAACTTTCTTTTATACCCTGAACATGGGGTTTGT
GTATACGAAATCACAAAAACTGATCGACGCTTTCAGTTCTACCGTGAAGT
TGACAGGAGGTGAAGCCAAAAAGACGGTTGCTGTACAAGTCTTCACAATC
ATAATGTTTATATTGTTCAGTAATGGTGGCTTATATGTTCTCATTGATAT
GGAGGAGCCTCACATATCGTTCGAATTGGACAAAATCAACTTGATACGAC
ACAACTTCAGCAACACTTACATGTATATGAATCTCATTATTGGATTTCTA
ATTATTTTCCAATTGATTTGTTTGGTTCAAGCGTTTCGTGGACGACATTT
ACCAGGACCTATGAATGATGCAATGTCTCTTGTTTATGCTACCATGTTGA
CTACGATGACCCTTGCAGTCAGTTTTCCAATTGGAATTTTTCGTAAAAAA
ACTGATCGAGAATTTTTGCATTGTTTGCTGGTTGTTTTTAACTGTATCGT
TTATGTAGTTTTTCTGTATGGTAAGAAATGCTTTATCATAATGTTCAAGC
CACACAATAACACACGGGATTACTTCAATCAACAACGAATGAAACAAATG
ACCGTCCAATCTCAAATGTCTTCATCAAACCTTATCAGAAGTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000042_pilon:1206791..1209085- >XLOC_037572 ID=XLOC_037572|Name=XLOC_037572|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4590bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1206791..1209085- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAATTACCATTTTAATCTACCTCGTAATGCTGGCTAGCTTCGTCTT
CTCGGAGAAGCAGCAATTATCTTTTCGTTCAATTGGTATATATTCCAATT
GTTCTACATCTACAGATATTGACAATCTACCTTTGGCGACAGATACCATG
ATTAAACAAGCCATCGAGGACGTGGTGAAGAAAACTAAAATATTCAAGCA
TTCTGATTTCGAACGTCATTCTTATCATATCGAGTGCAACAACACGGATC
ATTTAGTTGAAACATTAATCGAAATTCTCTTAAGCGAGAGATATCACGTG
CCATGTGAGGCAGGAAGAAACTGTTCTCAACCAGACATTGTAATTTTGTC
TTCGTACATGCAAAATGACTTTATGTTGAACCTAGTCAGTAGATTGCTAA
GCTTTACGTGGTATCCAAAGATGTGTCTACCAACCAGCTGCGATGATAAA
TACAGGTTTGAAACAGTTGATGATTACTCTAAATACTTACTTCATGTCAC
TCGAAAACTAAATTGGAAAAATCTAACAATGCTCTCTTTTTATGAAGATC
ACCCGACACCATCTGAAGAATATTTTATCAACAGTTATAATTTATTTGCT
GCTACCAAGGAGTATTGTCTGCAAAGAAAATCCGTTGATGTCAATAATGT
GTCTTTTGCAGAAGATATTTTTCCTCACTTGGATTCTTGGCGGCGAAGAG
AATCAGCTTTAATCCTGTTTGGCTCATATCAAACACACCAACAAGATGTT
ATTCATTTCTTGGACAATTTCGGTGGCAAATACAATAACACTTTCATCTT
AGCCCATGATCTTCGTCGTAGCTCAAGAACATACAATCTTCAGAATCCAG
GCTATTGGTTTAGTATGGAGAATCTACAACGTAAAGAATTCACTTTTATG
TATTCAACACAAGTTGCAAAAGTTTCCTTGGATGTTTTACTTTCAATCGG
GTACAGTGAAATATTAATCCAATTTCTGGATGATGTATTTGAACTCTTTA
AAGGCGAAATGTCACTTCAAAATTTATCCAAATTAGAGCAACTGTTTGGG
TTTTGGTTAAATAGATTTATGCGAAACCCTGACTACACTATTCCTTTAAA
TGAGTTATTAAACGATGTTAATATGAATTCAAAATGGTCGATAACCTCAG
CTTATACAACATCTGAAAAGCTTTTAGGAGACTTTAATCATGCATCATTA
GGATGTCCAAAACTGAATTGTACACCAGGTTATTACAAAAGCTATGGTGA
AATTTTCCAACGAGAGAAAATCTTTGACACAAAACATGATTGGAAGTGTC
AACTATGTCCAGAAGACCATATCAAAGTTGGGTATGGTGATGGCCATTGC
AAAACATGTTATGGGATCAAGAGCATTGATAATGGCTTGAGAACAGAATG
TATCGATCCATACACAAATCGATACTCCAAATTAAACGCAGCAGAAAAAA
TGATCATTATTTCCTTAACAGTGTTTGGTGTCTTTGTAACATTTTCCACT
TTGTTGATTTTTGTGAAATATCGTGACACCCCCACTGTCAAAGTATCGGA
TGTTCATTTCTCATATTCCCACCTGGTGACTATCGCCATTACCATGTTGG
TGAACAACCTTCTCTACATTCAAGATGAACTCCTCGTTTCCATCTCTTTA
GCAAAATGTGTCAATTTAACTTTCTTTTATACCCTGAACATGGGGTTTGT
GTATACGAAATCACAAAAACTGATCGACGCTTTCAGTTCTACCGTGAAGT
TGACAGGAGGTGAAGCCAAAAAGACGGTTGCTGTACAAGTCTTCACAATC
ATAATGTTTATATTGTTCAGTAATGGTGGCTTATATGTTCTCATTGATAT
GGAGGAGCCTCACATATCGTTCGAATTGGACAAAATCAACTTGATACGAC
ACAACTTCAGCAACACTTACATGTATATGAATCTCATTATTGGATTTCTA
ATTATTTTCCAATTGATTTGTTTGGTTCAAGCGTTTCGTGGACGACATTT
ACCAGGACCTATGAATGATGCAATGTCTCTTGTTTATGCTACCATGTTGA
CTACGATGACCCTTGCAGTCAGTTTTCCAATTGGAATTTTTCGTAAAAAA
ACTGATCGAGAATTTTTGCATTGTTTGCTGGTTGTTTTTAACTGTATCGT
TTATGTAGTTTTTCTGTATGGTAAGAAATGCTTTATCATAATGTTCAAGC
CACACAATAACACACGGGATTACTTCAATCAACAACGAATGAAACAAATG
ACCGTCCAATCTCAAATGTCTTCATCAAACCTTATCAGAAGTTGAATGGA
AATTACCATTTTAATCTACCTCGTAATGCTGGCTAGCTTCGTCTTCTCGG
AGAAGCAGCAATTATCTTTTCGTTCAATTGGTATATATTCCAATTGTTCT
ACATCTACAGATATTGACAATCTACCTTTGGCGACAGATACCATGATTAA
ACAAGCCATCGAGGACGTGGTGAAGAAAACTAAAATATTCAAGCATTCTG
ATTTCGAACGTCATTCTTATCATATCGAGTGCAACAACACGGATCATTTA
GTTGAAACATTAATCGAAATTCTCTTAAGCGAGAGATATCACGTGCCATG
TGAGGCAGGAAGAAACTGTTCTCAACCAGACATTGTAATTTTGTCTTCGT
ACATGCAAAATGACTTTATGTTGAACCTAGTCAGTAGATTGCTAAGCTTT
ACGTGGTATCCAAAGATGTGTCTACCAACCAGCTGCGATGATAAATACAG
GTTTGAAACAGTTGATGATTACTCTAAATACTTACTTCATGTCACTCGAA
AACTAAATTGGAAAAATCTAACAATGCTCTCTTTTTATGAAGATCACCCG
ACACCATCTGAAGAATATTTTATCAACAGTTATAATTTATTTGCTGCTAC
CAAGGAGTATTGTCTGCAAAGAAAATCCGTTGATGTCAATAATGTGTCTT
TTGCAGAAGATATTTTTCCTCACTTGGATTCTTGGCGGCGAAGAGAATCA
GCTTTAATCCTGTTTGGCTCATATCAAACACACCAACAAGATGTTATTCA
TTTCTTGGACAATTTCGGTGGCAAATACAATAACACTTTCATCTTAGCCC
ATGATCTTCGTCGTAGCTCAAGAACATACAATCTTCAGAATCCAGGCTAT
TGGTTTAGTATGGAGAATCTACAACGTAAAGAATTCACTTTTATGTATTC
AACACAAGTTGCAAAAGTTTCCTTGGATGTTTTACTTTCAATCGGGTACA
GTGAAATATTAATCCAATTTCTGGATGATGTATTTGAACTCTTTAAAGGC
GAAATGTCACTTCAAAATTTATCCAAATTAGAGCAACTGTTTGGGTTTTG
GTTAAATAGATTTATGCGAAACCCTGACTACACTATTCCTTTAAATGAGT
TATTAAACGATGTTAATATGAATTCAAAATGGTCGATAACCTCAGCTTAT
ACAACATCTGAAAAGCTTTTAGGAGACTTTAATCATGCATCATTAGGATG
TCCAAAACTGAATTGTACACCAGGTTATTACAAAAGCTATGGTGAAATTT
TCCAACGAGAGAAAATCTTTGACACAAAACATGATTGGAAGTGTCAACTA
TGTCCAGAAGACCATATCAAAGTTGGGTATGGTGATGGCCATTGCAAAAC
ATGTTATGGGATCAAGAGCATTGATAATGGCTTGAGAACAGAATGTATCG
ATCCATACACAAATCGATACTCCAAATTAAACGCAGCAGAAAAAATGATC
ATTATTTCCTTAACAGTGTTTGGTGTCTTTGTAACATTTTCCACTTTGTT
GATTTTTGTGAAATATCGTGACACCCCCACTGTCAAAGTATCGGATGTTC
ATTTCTCATATTCCCACCTGGTGACTATCGCCATTACCATGTTGGTGAAC
AACCTTCTCTACATTCAAGATGAACTCCTCGTTTCCATCTCTTTAGCAAA
ATGTGTCAATTTAACTTTCTTTTATACCCTGAACATGGGGTTTGTGTATA
CGAAATCACAAAAACTGATCGACGCTTTCAGTTCTACCGTGAAGTTGACA
GGAGGTGAAGCCAAAAAGACGGTTGCTGTACAAGTCTTCACAATCATAAT
GTTTATATTGTTCAGTAATGGTGGCTTATATGTTCTCATTGATATGGAGG
AGCCTCACATATCGTTCGAATTGGACAAAATCAACTTGATACGACACAAC
TTCAGCAACACTTACATGTATATGAATCTCATTATTGGATTTCTAATTAT
TTTCCAATTGATTTGTTTGGTTCAAGCGTTTCGTGGACGACATTTACCAG
GACCTATGAATGATGCAATGTCTCTTGTTTATGCTACCATGTTGACTACG
ATGACCCTTGCAGTCAGTTTTCCAATTGGAATTTTTCGTAAAAAAACTGA
TCGAGAATTTTTGCATTGTTTGCTGGTTGTTTTTAACTGTATCGTTTATG
TAGTTTTTCTGTATGGTAAGAAATGCTTTATCATAATGTTCAAGCCACAC
AATAACACACGGGATTACTTCAATCAACAACGAATGAAACAAATGACCGT
CCAATCTCAAATGTCTTCATCAAACCTTATCAGAAGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000042_pilon | genome | sc0000042_pilon:1206791..1209085 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-2295:2296 |
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