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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000042_pilon:1217460..1236229+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037571 ID=XLOC_037571|Name=XLOC_037571|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18770bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1217460..1236229+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTGTAGAGTCAAATACTAGATCTTCTTTCTCATTTGATGGCAATTA
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CTGGAAAATTACTTCGTGAATATTCATCAACAGATGATGTAGAATCTACT
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aaatttgtccccagtttttctaattcaagatgccttttgttaatattttt
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aaatttaatcaaatcTACTCTCGACAATTTGGTTTTCATAAGGCTCACTC
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gacacagttgatcacgaaattttacttgaaaaacttgatcaccacggagt
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ggagttcctcagggtTCAGTCTTGGGTCCTCTGTTGTTCTTGCTGgttct
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ctttgctgatgatactaatttactaaatttttcaaaaactgtaatGGAGT
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taccaacaaaatttctatgaatgctagcaaaactgagtttgttatttttc
gttccccttggagacagatggactgtattccaagaattaagctttgcggg
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tagtcaactctggggactgtgtgacaatactgtcacacatagaattctta
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actttataaataaaactactcaaagaaattgtcataaaataaaagtaaaa
atatttcttatattcattattttgtgtcactGTTAATAtgtgtcctgcca
agcgatttccataaCACCTGATTTAAACCGGTTATCGAAAAACCGATCTT
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TTTGGAAGAGAAGAACACCGGTTTTGCAATAGATTTCAGCTGCCAGCAGT
TCCAAAATAATATACTGCGCATgcctttattaaaaaaaaagtaaacaaag
cccCTCCATACAAATCTATCtttcgtaaataaattttttatgcaaGTTTA
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GATTagttataatttttcattatgtCAGATTATGTTACTCAGGCTTCAGC
ATATGAGGCCTGCGATTCATCGCACTAGTAAAATATGTAAAATCAATTCA
GGCGTGCGATGCATCGCACGTGCAGAaaaaacttctttaaaaaagaaagt
ttctttcTCAATCTTTCCACGCTTTTCTCTCTGGCATCATAAAAGAAGAA
ACTCCCTTATTTGCTTGCCTTTTTGCTGAAGAGAAAATCTCTTCGTTAAT
TGTTGCtgagtaatttttctttctctctggTTATTACGTCATAACAAATG
CTCGGTTCATATCTTAgtaaaagatgaagaaaaagaagcacatgcgaaaa
aattccttttacattttacaagtctagacatttatcttctcttttgaatt
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TTTGCatatttaattaatattgttcaaTGTGCACTCACTCTCCCCTGTAT
CACTATCGATCTTTTTAAAGACaccccattctcacagacccggtgggatt
ttttcggccagtgggggtaaaaataacggactaaaactcaACGGGGATTA
ATAATCCCATACTCTTTattgctggggatttcaattcttttgttttcaag
tcagaagattcagtggggatgggccaaaataagttttttaaccaaaatta
aaaaaaatctttgatttgctgaaatttaaaaaaattcctgtttgaccaaa
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aaatcttgttcaaaattttataatctTCAAGATAGACCATCAGACCCACC
TCCCTAAATTTAGGATTGGGTGACAGCAACCAAACACCGGCTGTTTCTCA
GGATTTAAGTCAGTAATTTGAAACAAATTACAGTTTTTGCtagtgattaa
atcttaaatttattttgtcgGCTCCGTAAACCAGGTTGACACGGTTCCAA
AACCGGTAGAGATCGCTTTTCAAACTGGTTTGTACCGGTTTGTATGTAAA
AATCAACAAGCTCGAGATactcaattttagaaactttgacaTCGATTTCT
CACCCGTTTTAAACCGGTTTAAGTCGGGAAAAACCAATCTCAACCGGTGT
TGCGAGTCAAAACCGGTGTGTTTTTGCTGTATGGAAATCGCTTGGTAGGA
CAcatattatgataatcgtttattcattttttctttagttctgtaataat
ttttcagtttcttctaggttccccattgtattagagaaatctattatttt
tttgtaaggggttatcctgctgtgttgcagcgaaaatatattcaattaaa
aaaaaatacattcaattATCAAGGAGAGTAGCGTGGGAAATGTGGTATGT
TAGCAATATCactaaaatttgacattttataATTCAGCAGAATAAATCTT
AAAGTTTTTCTGAGATCTGTCCAGGGCATTGGTTAATAACTTGGTTGCAT
ATcttcaagaaaaaacatttgactGCTTGGTCATTTCAAATTCTTGGAAA
TTGTGTAAAGGCCTAAATCAAAAACTTGTGTATAAGTAAAAAAGAGCAAA
TCTCAATGACAAAGTGgtctttttcaatgaaattttcactCAGCCTATCA
GAAAAACTTCCACTCAAAAGACAAAGACAGGGGTATCTCTCAGACAGGAA
CTTTATACACGAAATGCATTCAATTTTGGGGATACATGCAGCCTACCACA
GCCTAATCTCAAATAACTTTTACGTAAGAAAAAGATTGAGACCATTCAAG
TGTTatcaaatgtttgaaaaacaattattgaatGATGTAACTTTAACTTA
TTTCACAAAAGGtcgaaaaaaagaggggggtcgaacttaaacctgggaaa
aagagggggttggagaattttcatttttaagagAGGGTTGAGCTAAAAGA
GGCGGTGCCATTTTAAGGGGGGGGGCTTGATACCCCTCTGCCCACTATGT
GCACCTAATCCAAACTGAGTGATATGctttatatcaaatttcaattgtca
atataccttattacatgaaaataaatatggaagtatttaacacaaattga
aaatagacgatatcgactttaccgaattctccccgaatgattacccatga
tgcattgcgaaaaaaaattcacggacgataacccaaaccctaacaatgca
tcatgggtaatcattcggggagaattcagaaagccgatatcgtctattgt
cattgaaaaagcaaataaaatttgtgttaaatacttccatatttattttc
atgtaataaggtatttcAATATCAATGGAGGGTctgcttcaaaaatttaa
tgTCGTCAAGCTTTTATTAAACCAGTATTTGTGTAATTTGGACTTTTTTG
TGTTGCCATGCTAAATTCCAAGGCaaaaaaaCCTGATTTAtagggggtct
tcaaaatcaaaaatgaccTATATTACATCAATTTCTAGAGTTATGGGCTT
ATGGCTGCTTTTGTTGTGAAAAATGCCTTTAATCTCGCAAAAACTatgaa
ttttttgagttttcctTAGGGAAATTAGTTTTTGGCTAATCTTTTCATGC
ActtctttaaaagaaatttggaaAGTAATATTGCTTCAGTAAGAACTAAA
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tctaacatctataaaatattttgcttttaaGGATGGTCGTaaaaggaaga
aagaaaaagggaaaagagaaCAACTTTCCAGCTTACTGATTGGATACAGG
AATGGTGGCTTGGTTGCCTACAATAGCAATTCTGACCAACTTGAGCAAAA
CTATGTAAGTATTTCTGTTCAGCACTTTTATCTTGAAAGTCTCCTGGGGT
TTAAGGTCATACACAAATAGTAAAAGAAGTGAAAGACCTTTTGCTGCTGG
CCAGAGAAGTTaaatgaaaaacaagaaaactgTTTTTCTGATAGCCTTAT
TGTCTTGATAGAAAATTCCTTTAATAATTTGAGTCAAGCCTAAGAAGTTA
TATACTGTATGTCCCAATTTAACACAAATCTGAAATCCagtggaatttct
ttttttaatttgaacaagttcaaaataattgaaacttttttttcatttag
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TAATAATTTCTACAGTTGCTCTGATGACAAGCATATAGTAGAATGGAATA
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TTTCAGGCCttgatatttatttattaaattgatctttttaaaaaagaact
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TGGATTTGACTAGGACAATCTGAAGAGtgtttaaaaataaacttttatct
GTTGGACATTATTGAAAGTAGCCATCATAAGTAGGGCTGCTTTACCTaca
aaatttttggacctaccccggtggaggtcctataaattaacctgtgtttg
ttcgttcgttcgtctgataccaacttttctcagtattgaatcataggaat
cttttgatttttggtacaaaggtgcaaaatgtgacggagcccaatttttg
ggcaaatttgggccaaaaaacggctaaaaaacggggtttttggactttgg
atcattaattttttttgattttttgcatgaaagtagggtatcataggtaa
aagatggctcaggcagaattttgcaaaaacattttgttggctcaaaaaac
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agtcaaattacttaattttttatgagatagatgtttctTTTTGCTTACAT
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tttatgatattttgcacaaagatgcataactataaaccttcgaatgtgaA
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ttaaaaacacatctttatctataagaatcACTATTAATAAgtatacatca
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ttgctcacaaagtcttgaatatgaaagaatatttcaagagcatgaaattt
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atcaattataaatgtgttaaatgcatgaccaggtaggtccataaaagtat
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AATCTATTGTCAGCTGGGATGGTAATAAAGTTATGGGATCTAGAgacaaa
gaaagaaattatgGTAAATATTTCCTTATGTATTTAcaggggggtcaggg
tccaggataccaacccagggcccaaaaacctgacttttcgagatttgaaa
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aaccctaattttctaaaaaaaaagggGACCCACCCACCTAAATTGGTGTC
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ttcttgggtacctaataagcgtccccccccTTGACTTAAGACTCAGTGAG
TCGcttaatttttgcctgggatcGTAACCTAGGCCGAAGCTATGAATCTT
CTTTCCATTTTAGAAATTCGATGGACATGCTTCACCTGTATCCATATTAC
AGTTCTCTGGATATCGCTCTCCAAACAAGACatctgatgatgatgatgat
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TTGGTATTAAGATTTGTTTTCCAACTTTGTGTTATACAAGACCAAAAATT
TGTCACTTCATTTTCCTTGCATGAATACCTTGTCTTTTTCAATTTCCGAA
AACAAATTGTTTTCTTGTTATTGCTaaaaaaaTTGCATTCAAACCATGGa
aaaaaaCTTAACCCGTTGTGATGTTTATGTTTgactattttattttctca
taatACAGCCTCTTGGGGCATCAAATCAGACACTGACAAGGCTGggaaaa
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CAAAATCTTGACGCAGAAACCCATTCTATAATACCACTAATCAAAATTAC
TCCTGAAAGTAATATTTTATTACCTTTGATTATTGTAAGGGTCAACCAAG
AcctttttaaactattttcaaaTATCTGTTTATAGGCAAATTAATCATTC
ACAACCTGATAAATCAACAGTGGCTTCCTTTGTCACCAATGAAATTCCTT
TGTATCTCAGTGTTGCTCTGGAAAAGGATTCAAAGGTAATGTGGTTCCCT
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GAGCTTCTCCACACAAAACCAAAGATTATTTAAGTTGCAATCAATCACAC
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aattttgtatTGGTATAGCTTTCATGACTGAGACCCCtctctgaaaaatt
attacaaagGCAGGATCCTTTATTAATACTGTTCTACAAAACAACACCTA
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CTGTCAAAATGGTTGTTGGTTGCCAAAATGGAACAGTTCATTTCTATGAA
TTCCAAATGAATGGGTAATTATCATTAACTTCCTCTGTTATTTTTGAACC
AATAGCTCTTTTAGGTATACCTCAAAGAATAAATAACACTCACTTTGTTA
TTTCAGAAAAGTTCAAAGACCATTAGAACCAAGCAAATCATTGTCACTTT
CTCTTAAAGACGGAAATGTAAGTTGACATTTTGATTAAATTgtctaaata
tttttagtctGTTAAAAGTGTTTTCCTATgatatagaaaggttgaaaaca
TTTTATGCTTTGGGAAATTTTTGTTAGTGCAGTGAAGAAAATTGTTCTTT
GTTGTGGCAAATGGTAAATGatctccttttcaaaaagtttgaacaaatta
ttgaaaatctgATTTCATACCtttttttCATTCATAGAAAAATATACCAG
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TTAGGTTTATCAATGTTTTCCTCGTCCTATTCTAATATTAATATCAAGAA
ATGATGTTGTAATGCTGTTATTGAGTTCTACTGGATCAGAGTATATATCA
TCTTTTAATATTAGTCTCCATTCTGACGTCATGGTGTATTTTGAACTTTA
TAATTTTAGAATTTCACTGAAGCAGGAAAGGAGGAGAGCATAACAAAAGA
CTTATCATCAAACTTGTTTATGAAAGAGCATtccaaaatatcaaagaaac
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TGTTGTTCCCTAAGTCTCACCTACTGTCTTCACAAGAAGAAAAGGTGCAA
TGTTTCAATTAGGAGAGAACTATTCCATGTGATTGAGGTcttaaatttgg
aaaaacatTTAAATGAGCAATAATTTCTCTACTGAAACAGCATCTGCTTA
TGGTGTGTTTAACCCAAAATTTTGAGATGGTTCTGTGAGCTGGTACTAAA
TGGGTTAACACTTTCCAGATACAATAcagggatcgaattagcgtatcgca
tttcgcaattcgcgatgcgtttttggattacttgcaagctaaaaattgaa
aattgatccattttaggatgcaaaatcatgcttatcaaaaaattgcgatg
cactttctatcccttatttcgatgcctgCAATACCATAATTGAGGAAGGC
ATTGctattatttctttctttttttcttccagaTGTCAATGGTTGAAAGG
CTGAAGAATTTAAAAGATAACGAATTCGggtaattcttttttatatttgg
caAAATCTTGATGTCTTTAAGTTGAAATTCTCCTTCAGACAAGACCAAGA
GGTTACTAGGTCAGTTTGGATTTAGGTGCATTAGTTTTGACCTCTGAAAT
CAAATTCATGGCTAGTCGTACTGACTGACCAACTATAGATAATTGGCtca
taaaacaaaaatagatcaattttaaatattttatggTGTTCCATCTTAAT
TGAGCTGGTGAATTTTCATGAATTATACCTTATCTTCACAGTCAAATGAC
AAATGCTGGTTCAATTTCCGTGCTACTCACACAAGGACTTCACACAAAAG
ATACTAAACTATTAGATGAAGTCATATCAAAACAATACCATGTCAATGTT
ATTAAAAATACTTTGAAGAGAATGTCTGCTTCTGATGCTGTAAAACTACT
GATCCTTGTAAGTTGCTCGctcatgtttttattgtttgttttttgttgct
gtttttcttttAGTATATCAGGCAAACTGAATTCCCCTCAGTTGTAGAGC
TTTCTGCCTGCAATTAATTATGCAACCTGTCTCTCATTGCATGCAACCAT
ATGTTTAAAATTGCAGCAACcatatgtttaaaattttgcagaagGATTTC
CATCTATGCTTACTACAGCTTATATTCAACTCTTTTTATTCTAGATTGTT
GATCAGATTCATCACCAACCTAAGCTTATGGTGTAAGTTTATtcgtgttt
tgttttgttttgttgactTCTTTGATAGACAACTAAGAAAAATTGCAAGA
TCAGCAACTGTAGTGCAAAGGTagattaccttattacacaaatatcacta
ggcaagtattcaacggccttgaaatttgcacgatctgaaattaacacaaa
ttttgctttttcaaggaaacagcggctggttttaattaagggttTTTTAA
ATGACTAGTGATATTTGTCATGGTATGCAACACGTATGCCAGATCATGGC
AACATTGTCAGGAATAGTGTGTGGTATCTCTCTGCTTTAATGACCGACAA
TTAATGAGAAGGTTAGCTATTGCAATCCATTGAGAAAAAGTGGCACTCTG
CCATACATTCATTTCTAATATTCAGAACCTGAGTGAAATCTTTTTTACTG
TTTTAGATTCAACAACATGATGGCTTGGACAAAGAATATATTAGCAATTC
ATCTCTCGTCCATTTTGTTGGTAAGAAAGGTCTTGAAaatgtatttattt
atttatatgaAACGCATGTCTATGATGAGTTGTGCAGGGGTATTGAATTT
GCATGCATGTATGCAAAAATGGTGAACAAGACTGACTAAACTTCAAGTGG
AAGGTTGGTTGGTCCCTGTTTGCATTAAAATTGCACAATCTGAGCAGCAT
GACATCCTCATAAGCTGTTTTCTAGTTTGGTTATTGTCACACACTCTTCA
TAACATAGCTATCTTTTTACAATTTAGATGTCTGATGTTGGTGATGCGAC
TGGCAAACTATTTAATCTCTTGAAAGCTCAACAGGAAACATATCCTGCTC
TCTTCAGCTTTCAGGGAAAAGTCGACCTGTTGATTTCTCAGGTAAgtttt
ttttagtccaaaattTCAGCTGAATGTCTTTGGCAATTTTGTTGTTATAT
GAAGTCTGTATTTATGATGAGTGAGAACTAACTGATGTTCCTAAATTCTC
TGAAATAGGACATATAAAAcaaataaacattaaatttccAAAGTGACTGC
CAGATGATGACTTATGATAGGAATTGCCGTCTGAACGACAATTGaagcta
attttttttatctgatggcgttttgttattttctttttgattatatataa
agtacattttgctagttcctttgttgtttttatCCACAGTAATCAAATGA
TGACTCTTGATGGGAATTGCCGTTTGAACGATAATTGAAGCCAAATCTTA
AGTCTGATGATTACTCTCTGATTTTTGTGTCTGTATTCTGGTTGTTTTGA
CTATGACTTGATGATGATTTCCATATAATTGATAGGAAGAGTCTGATTTT
AATTGATGTTTCCTTTATATTCTGAGAGTGCAAGTCAAACTACcatttat
taaaaattgacCATCAGGTTCAAATTTCTAGAAATACTTGATATTATCTT
GATGATGCTTGATGACTCAGAAGTGGTCCTGGAAACTTCAAGATAAGCTG
ATCATCCTGAAACCCTTCGTCAGTCCACTATGAATTACTATCTTGCTTTA
TTAGGTTTCAAAAACTCCAGATGAAACCAAGACTGAGAAGGCTCAAGAAG
AAGACCTCCTCAACCCATGTGTCGTTTTTCATGATGGTAAGTGTTTCTCC
TACTTTAGTATTGTGAATACTGTAATTCATAATTAATTCAAATCATTAAG
TACTTATCGATGATGAGTGAGAATTTTTGATAGGAAGAGTCTGATTACTG
ATGCTCCTAAATTCTCTGAGATAACAAATATCGCAAATACATTTTGGACT
TTTCTCAAAAGAATTGATTGCCAGATGATGACTTTTGATAGGAATTGCCG
TCTGAACGACAATTGAAGCTAATTTTATGATCTGATGGCAACTTGACaaa
aaaaTAGTATACATttactaaaatactgaaaaggGATGGTGGTATGccaa
aaattctcgaaattccCTTTTGTATGTCTAGGATCTTCGACCCTGCTCTC
AGATGAGTTAAAAATCTGAATGTCCAATACCAAATGACGACGTAAGATAG
GAATTCTGtgatttccttgaaatttaaacATTCAAGAAGTCAGGTTCAAT
ATCAAATGATGACTTTTGATAGGAATTGCCGTCCGAACGATAATTGAAGC
CAAATATTCAGTCTGATGATATTACGAGCTTTCCAGAATCGTTATTTCTG
CCTTCATTTGTTAATTTAACTCTTTTAAATCCACACCGAATCCAATTTTA
TTGCCTCAAccatttcaattcttttgtaatAATTCAAATCattacaaaat
taaattttggagCCAGATCGATGCAAGTCTTTTCGCATTCATAGACTCTG
TAATGTTTATGCGTGTAGTAAAACCTTGCGACACAAATTATTGAGTTTGA
AAACTTGGCTTGCTAGTTGTATTTGGCCATTCCATTTCATATCCATACAT
GGGGTGGACCAgggggggTACATGTTCAGTGTAGTGACCCATGGCCGGTG
GGGTGGTGGTTTTTCGAAGTTATTTCCATTTAGTACATGGTAGAAAAAAG
GGTGGTCTCCtaaaaaaaatcccagaaaaaatTACTACCATGTACTAAAT
TGGGTGGTACCAAagtaaactttaattttaaaggatAGTATGATGTAGTA
TATTCAGCTAGATttgatcaaaccaaatcgaaaaaCTGCCAGTTCTATTA
TCGTACTGCACTGCACTGCGTGCCTTaactaaaatctttctttctttctt
tttgttatgtttagaaatttcaatttcgaatgtttgaaatattcgaattt
cgaataTTTACATAAATCAGTGCTGATTTCGCCGTGACGTTTAATGTTAT
TGAAGGACTTACTTATTCAAAATGTAAAATGCAGTCATTAACTCAAGAAA
TGATTTTCAATAGGTTTACTgtattactttcaaataaacgccccctcaaa
taaacgcccctcctaaaagaaaaattatttaataaacgcccccttggAAT
GAACGCCCTCTCTCgcggaggggcgtttattagaaacttgttaCTTTCAA
TacagattttagtcatttcttgtaaccagagcagtttttCGATGCaatcc
cggggggtactaggtttgcgaggtgacgggtatgtccgagccgaaaatcg
aaaattgaccctttgagagacaaaattttggtgattttgggaccctttga
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ggctcgcacatacccggcacccattttgcctaagtacccccccccccccc
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ACTTGAgtctaaaataattaaaaaaacgcccccttcttttaaacgccccc
ctccctcgaaaaaaacgcccctcttaaaatagaaaaaattaaatattaaa
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AATGGGTGGTGCTAGCTTCTACAGGTTATTAAAAGGGTGGTATAGGGATT
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aaaaaaaatcccagaaaaaactagtaccatgtactaaaaaagggtggtgg
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
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Properties
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|