XLOC_037547 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037547
Unique NameXLOC_037547
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000042_pilon:1339320..1351514-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037547 ID=XLOC_037547|Name=XLOC_037547|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12195bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1339320..1351514- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGACGGGAGCAACGAATCCATCAAATCCAGTTGTTTTCTTTGATAT TTCTATTGGTGGTCAGGTAAACTTTTTAGCTCACTATTCTGCTACCCAAT TTTTGATTCAGAATATACTTGATTATTTGATATCCATCAACCACAATATC TATCACACCATCAAGGATCTGTTTTATGATGTTGTTATTTAAATTTTTTA TTGATGAAGCCAGGCAGTGTCTCGGGCTCGATAGGATCAATGTAATGAAG AATCGATAAAAGAATGATAAATTACATATTGATTCCGATAAGAGATCGAA GTGGGGATTGATACTCAAGATTTTTTTGATCATGATAATTTATCAATTAC TTATCGCCCAGACGATCTCAATCGAACGGAATCGACGATCGAACCAGTCG AACCAAATCAAACGCAATCGACCGATTGAAATTCGATTGTCGTAAGCAAT TGAATCTCAATCGAATATTACCGCAATTTTCAGATTCGATTGATATTCGA TTGCGTTCGATTGATGTTCGATTGCGTTCAATTGCGTTCGATCGTGGATT CATTGACCCCCAGATTGTTCATCGCTTAATTTCTACAGGAAATCGAAAGT AATTTCATTCGGCTTGTGATGTTCGAGAGCTTGGATGTTGGGAAGCTGCA AGAATAAAGCCAGACGATCTCAATCGAACGGAATCGACGATCGAACCAGT CAAACAACAATCGAACCAATCGAATATTACCCAGAATTTTGACGTTCGAT TGAGATTCGATTGCGTTCGACAATAGACCTTTTCGCCTTTCCATCCGCCA TCTTGAATTGTATGCAAAAATAGAGGAACGAAAAAGCCGTGGTTGGATTT AGTTGGAAAGTATGCGAAACATATGCAAGTTTACACAAAGATTAAAAAGA CAACAAAGCATCTTATAAATAAATATTATAATCATTAGAACAATAAACAT 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TCGCGCGGGCGAATAAAGATAGCTCGCATTTTCGCGCTGGCGAATAAAGA TGAGACAGCAATCTTGCACTGAGGGTGCTACTTAGTTTCCGCTCTATTTT GCGCCCACGATAGAATGGTCCAAACACGGGTGCATTCCAAATGATAAACA GGCGGCAAATGCAACGGGTCGAAAACAAAAGTGACGAAAAAAACCCGTGC AAATACACTCGATCACTGTGACCCGTTGCATTTACACAGAGTGGAAAAAT GTTACACTTGATTATAAAAAATGCACAGATCAAAATTTTAACCCGTAGGC AAAAATTTTCTAAAAAGGCAAAAGAATCTTCTAAAGAGAAAATGAAAATG CCATTCTTCTTCGTTTTATGCCATTTTCATTTTAAAGTTGTGATTTGTTA ATTTTCACGCATTTTGCCTTACACGTTCTAGCTCATTTGCACAGGGTCGG AAAAAATCGTTGAAACCGTTGCAAATGCACACCCGGTGCAAATGCAAGGA TTTCCGTGACTGACCTTTTTATAAATTTCAGCTGATAAAAAGGGTGTCGG AATTAGAGGAGGGGTGTTGACATTAGACCAAGTTACGGTATGCATGTTAG CCTCCACTGATGCAAGTTACCCAATCACGATAATAGATCGGATAAGTAAT GGATAAAGGCTCGATATGAATCAATGGAAGATTGATTGAAAAAAAGATCG ATAAGGGATCATGGAAGGATCAATACTCAAGATTTTTTAGAGCTCAATCT TCTATCGATCCCTTATTGGAATCGATAAATAATCTATCGAAGAATTGATA AGGCGAAGGGAAGTCAGGTATTAGTTTACCGTTACCAGTCCGCGCGTGTT TGAGCTACCGCCTAAAAATTTTCATTATTTTAAAAATTTTCATTATTTCT ATTTTTTTTTAGTCCAAATATGAAAAACATCAATACATGACTTACCAATG 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CTACCCGGGGGGGGGTACTAGGGCAAGATGGGTTACGGGGATGCTCCGCT GGTCAAGGTACCTTTCTTGACCTCCACGAGTCCCAGGTAGGGTCGCAAAA ACACCAAAATAGAAAAATCAGTCCCTCGTAGGGTGCCTATTTTTGGAAAA TTTGGGCAAAAAGTAGAAATTTTGAGAAAATTTTGGAATTTTAGTCCCAT TCAGGGTCACTTTTTTCGCAGATTTCGAGTCCCACATAGGGTCCATTTTT CGAACCTCAGCGGAGCACCCCCGTCGGTCGACAAGGGTATAACCCCCCCC CCGGGATTTACTAATGCCAATCTTTCAACTATATTCTATCAAAATTTTGT GACAGCTGCTATTTTAGATCTAAAGATATTTATAGCAAAGAACCTTCCAC AAACAACAAAGAATTCGCAAAATTTGAAGAAGTTTACCTTACGAAAGTTC CCTGATCAAATAAAAACTTCTTTTAAAACTATAAAGAAATTATTACTCGA AAAAAATTTGCATTTTACCTAAAAATACGAGGTTTCGTTGGACAGAATAA CTTTCCTTTAGTTCTTATAATCTATATCTTGACTTATTTTGCTATCAAGG ATTGGTAATCAAAGGAGACCGATTTGAAAGAAATTTCTAAAGAGTTTTAT GACTTCTCTGGCTATTACAGAAAAATTGTTACTCCATTATATTTTTATTA CCTCCATGGTATGGTTAAAATTAATTTTTTTTCAAAAATAATCATTTTGG CCAATCAAGAAAAGATTGCTCCAAACTTTCTTTTTGTCTAAAAACGAAAT TAAAATCTTACTTAGTTCCCGAGATATTAGGGTTTTAAAAACTTTAGAAC AGATTTGAACTTATAATTGGCTATTTGCATAAGACAAAGATGAACATTAT AATTTCTTTTTGCACCTTTTGAAAATCAATGTCTCTGCAATTACTAATCA AACCTGATCAAACAGGCAATTGTCTCTCTCAAAATTTCAAGTCACTGTAG AAAAAAATCAGATTTTGCCATAACTTCAAAAGACTTAAAATCACCCATAG CTTTGAGTTATCGACTTTATTATTTTTTTAATGTATTCCCAGAATATTGG TCTAAAAAACCTTCTCTAAATCATGTCAAAAAAGAATAATCTTGATTTAT CCGAAGTTATTAACAAAAGAACAGAAGGCGTCTTAACCTTAGGTTACCTT AACATACCTTATTAAAACCAAAAGTCAGACATTTTTTGTGTTATTGTCTC ATACAATTATCTTAATCAGTTAATCGTTCCAATTGTTGCTCTGTTATTAT ATACAAGTGGCCCCTGGGGGAGACAATGGCTCAGCTGCCTAAAAGCTGAT TCATTATTCTATGGCCAGCCATTTAAAATATTAGTCATTATTATTATTAT TATTCATTTTGATTTTTGAAATTTCCTCAGTTTTATGATGTGGCAAAATA TTTCCCAATTTTTGGAAAAATTTCTCGATTCACGGTTTTGCTTTTTTTTT ATTTTTGACTGTAGTTTGAATCAGAACCCCAAATGGGGGGGGGGGGAGTA CTTCTGCCAAAAGTTCTGACCTTAAAAAACTTCCATGTTTAAAACTTTGA AAAAACACTACATCTTGAATTATGCTATATTATACTATGTTTCCGATGGA CGGTATGTCCAAGAAAAAGTTTGAAAATCGACCCTTACAGAGACTGAATT TCGAGAATTCATGATGAGACTGAATTTCCAGAATTCATGATGACCTTTTG AGTTGATTTTTGATTTTTGTAATTTTGGAACCCTTACAGAAACTCAATTT TCTATTTATGGTTTTTGGACTTTCCACTCCAGGGTGTGAAAAAGGCACCC TTATGGCTCGCAGATACCCTGCAGCCATTTTGCCTAAGTATCCCCCTTTT GGATTTTCAGGTAAAATTCAGTTAAACATTTTAAAACTGTACTTTTTGTA AAACAAACCTTTTCATAAAAATTTAAATTTTGAATTGCTGTATAAAGATG TATGCTTTCTGGCATAATAGATTTTAAGAACTTTCAGACCCTTATTTTGC ATACTGTGTTGTAGCAAAATCAACAATCTTGGAGTGGCACTAATATGGGT TAACTGAGGCATTCTTAAAGTTCTGATTCAGATGGTTTCATGGACATCTA CTTGATTTCAACGAGGCTTCATTTTGTAGCCTTGACACAGACGTTTTGCC TCATTTGATAACCAACTTCCAATTTTTAAATTAAGGTGGTGTGAAATCAT GTTTATTTCTATTTTTAAGGATGTTGGTCGATTAAAAATTGAACTTTTTG CAGATGTTGTGCCAAAAACAGCTGAAAACTTTCGGCAGTTTTGCACTGGT GAATACACGTAAGCCAGATTCCTTTTTTAAATATGCATCTCCTAAACTGT CATCATCTCTCTGAAGTGAACTTGTAAAGAAAAGTTAGGGACTTCAGCTG ACAATTCGTCAACAATTGTTACATAACTTTTTGGATCAAAAATGCCTAAG AAAATTTCATTATAATGAGAAATTTTCACTCTATGCAGAAACCTTAAAAC TACATATCTTCTTTATTCTTACGGTAACTTCAAAACATTTTTTTCAGGAA AGACAAAATCCCAATTGGGTATAAAGGAGCTACATTTCACAGGTTAGTTT GCACGCTTCCATCCCTTTTGTTCCTAATAGACAATGCAATGGTGGTTGTT AGCTATTAATATATTTGACCCTTTTTCAATTAATTAGATGGTTGATAAAA GATGATAGATAAAATGATAGAGATCACTCTTGGTAATGAGTCATTAATAA ATTATTACTGTTTTAGTTCAAACTCAAAATTGTTAAATATTTTTAGCCAG 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GGAATGTTGAACCAAGCTGCACTTTCCAATGAGCATAGTGCGGAAGGGGT CTGACCGCCCTTCTTGGCATCCCCCCAACCTTTAAAAATGCCTATCCCCC AAGGATTTTGGACATAATTGGCTAACAAATATATGTAAAATATCTTTAAA GAGAGAAAGCGAAATGATAAACTTCTTTCTTCTTTTTGACTCAGACTACT CTAACAGAAAACTTCCTTTTATAAAGACCAAATTTCATAGCAGTGTTTGA AAATAATCTACAATATATATGTAAGCCTATCCCCCTTCGTTGCTATCCCC CCTTTTTCATGAAAATTTCTGACCCCTTCTTTATTTTTTCGGAAGGTGTC ATCCCCCTTAAAAAGGGGGGGGGGTCTGAACTATGGAAGGACTGATCTCT CAAGGGTTTAAATGCTTTTATCAGTCCACAAAATCTATATCCTGAACAGA CCGATCTTTGAATGTGATGTTTAAAGTCAGTAGAAGTTGCTAACGTGTTG TTAAGTGGGAGAAAATCTGACAGTGATTTTGTTCACAATCGTAAAAGAAT CTTTCGGTTTTGATCACTCAAGTAATGAACCTACAATTTGTTTTTCAGGC CAATAGTGGAGTTGATACGAATGGCTGTCAGGTAAATGTCTCTATTGTGT TATTTATTTAATGAATAATTCAGAAAAGTTCTTGTCTTTTGCTTATCAAC GATATCGCTTTTTATAGTCAGGCTTAGCATACGCTTTAAATTATATTTGA GCCGTTATCAGAGCTAAGGTATGCGCATAAAAGAAAAATACAGTAATTGT GTTTTAAATGACTTTTCTAATGACTTATTTATCCATCCCTTTAAACGGAA CTTGCTTGTAAGAATTGATTTACCTTTTTTTCAGTTCTTTATAACATGCG CAAAATGTGATTTCCTTGATGGCAAGCACGTTGTTTTTGGTAGGTTCCCT TTTGCAAAATTAAAGAAAGTAAATAAAAAAGAAGTTTTCGTGGAAAGAAA CTTTCGCGAATGCAGGGAGGGGGCACGCCGTTACTACAAGCATAGAGGTA TAAAGAAAGACAGGAGATGAATTTGTCGGTAATTGGTCGTTAAAGTCTTT TGATTTCTTTTATGTAATAAATCAAAAGAAATTCTAGGCTCGCCCGAAGA AATACGACTTTTTAGTAGAACTCAAGTTTGCTCTGAACATTCTTACTATC AGCATCGAAGATTTCTAGCCTTCTAATATACGAGAATAAAATAAAATTTA GCTCCACGAAATAAGTTTGCGTTCAATTTTGTCATCCATTAAATATTGTT TTGAAAAGATATTTTCTCCAGCCAGAAAATAAAAAGTTATGTATAAGCAC ACACAATTTCAGACCCAATTTGTAGACAAAAAGTCGCTGGAGGTTGTTGG AGGAAAGTATTAAGCAATAGAGTTCACCTTGAAGAAAATGTTGATCGAAA AATTTTGTCCTTTGATGAAGGATTGCAAAGTTTACAGGCCTTTTTTTAAT ACAAATATTTTCTTACACTAATGTCAGAAACAATGAATCTCGTCTCATCT TATTTCCAACACTTAAGTTAGCCAATAAGATTTCACCTATCAACAAAAGA GCTCATTAAAAATGCACGATATATGAGATTATGAGCATGCATACCTCGTA ATTTTTTTAATCGTAGGGCGAGCATAGTTACAATAGCATACTTCTCCTGT TTCTTTATACCTCCATGCTACAAGACAGTATGACACTTACTACCGTGGTG GTACTGTTTTCAAAAGATTTGTTTGAAAGTAGTTACTACACAGTGTAGTA ACTGCTGTTTTGGGTGGTGCCTTATTTTTAACTAGCTGCGAAAAATTTCA AAATAAGCTCTGAAAGCCCATGTTGTTTTTATTGAATTTGGAGAGTTTGG GGGATAATTCCAGAAGCCAAATCCACTCGACATTGAAGGAAAGTCTTCAG GCGTTTTTTTTTATGTCTGAGATTGAAGATTGAAGGTTTAATGAGTTTTG CTCGTCAACTTTTTCGAGAAGATATTAAATCGTATTTGAGATGGTTTAAT CAATTATAAACAACTTTTCAGAGCTCTCTGATACACCCACCACCCACCTA CCTGTGTGTCTGAAGGTTCACCCATTTTCAGTCATTTGAAGTTTTTGGAA GTCTAAAAATCACAAGGACTAAAAGCCACAAGGACTGCTAGCAAGCCTGT ATATGTCGTCTGCCAAATAACCACTTTCATTCGTTCATTTGGGAAATTTT AATTAATTTTGATAACCGTCTATATTTGCACATTTCAGTTGGCAATTCAG AACTAATGGGTGCAAGTTAAGTTGGTTCAAAATTTCTATTTGTTTTTTTA TGAAGTTAAAATAGATGTTTCATTCAGTTTCATTAGGTTTCATTGTGTAG TTTATGATTAATTCAGATTAATTCATATTTTATAGAAGAGATGATAAAGT ATTTAGTTTATTTTTGCAAAATATTTCGACAAGGCCTCTTAAAACTGTTA AAGATAAGTACAGTCAACTTGGGAGTTTTCCTTATGTATCGGTTACTTTT CACAGCAGAAATTCGAGAATTTTGTTTACCCGCAGTTACCAGGCCTATAA TGTATAGGTGTATTTTCATTGTTAAATGAAAGTGAAAGTAAACAGAAATA TTTCTTCACAAAGTTGCATAGGAGTGGTGTCTTTGATATTTCCACCCGAA AATGGGGTTGATACCTGAAATTTTTCCCGGAAAACAGTTACTACCCTGGT GTAGTAAATGCAAACAGGGGTGGTGCATAAAATTATTTTCCAAAAACAGT TACTGCCCGGTAGTAACTGCAATAGGTGCTGAAAAGACTTGTAGTAACTG CGTGCTCCCCCCTGGCAGTTGCGAAATTTTGCATTTCGCGAAAAATAGCT TTCACAAAGCTAGGTTTTATTAGCGAGAAAAATATTATTAGATTCTTCAG TGTTTTTTTAAACATTTTTACTAAATATTGGCTGGGCTAAATAAAGCCTG ACTTTTTGTTACATCCCTCTACCTAAAAGCTCTGCCAAAATGAACATATT TTCGTGAGAATAAATTACGAAAAATCTTTCAAAATTTCGCGACAGTTTTT TTTTCTTTAAGTAACTTTGAGAGCAGTGACTTCCATGGCCCTATGTAGAG CACACCAGCAAGATCGATTACAAAGCTAGGCACAAAATTGAGAAATCAGT TTATTAAATAAAACTCCATTTCAATCTATAATTTTTGATCTCCCAGAAAA TTGAAATTGTCTTTTTTTTCTTTTGAAGGTAAAGTGATCGATGGTATGTT GGTGATGAGAAAAATTGAGGTACCACTTCTCACCATTTGTGTTTTGTTTG CTTGGAAATTAACTTAATACCAAAGTTGCTCATGTGGCATCGTGTGCAAT AATAGCAATCCTTGCAGTGTTGGATCGAACAATTAAGTTACGTCACGTGC TATCTTTTGTTTTGATGATTGGTTGCATAACTGCAATCTTTATGCAAGCT CAGCGTTTTTGATGCAGCGATTCAGACCTCGGAAAACATAATGTCAATCT GGCTTTAAATTATTTTTGTCTTTTAGAATGTACCGACGGGTGCCAACAAC CGACCGAAGCTTTCCGTTATCGTATCCCAGTGTGGCGAAATGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000042_pilon:1339320..1351514-

>XLOC_037547 ID=XLOC_037547|Name=XLOC_037547|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1074bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000042_pilon:1339320..1351514- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGACGGGAGCAACGAATCCATCAAATCCAGTTGTTTTCTTTGATAT
TTCTATTGGTGGTCAGATGGCGACGGGAGCAACGAATCCATCAAATCCAG
TTGTTTTCTTTGATATTTCTATTGGTGGTCAGGATGTTGGTCGATTAAAA
ATTGAACTTTTTGCAGATGTTGTGCCAAAAACAGCTGAAAACTTTCGGCA
GTTTTGCACTGGTGAATACACGATGTTGGTCGATTAAAAATTGAACTTTT
TGCAGATGTTGTGCCAAAAACAGCTGAAAACTTTCGGCAGTTTTGCACTG
GTGAATACACGAAAGACAAAATCCCAATTGGGTATAAAGGAGCTACATTT
CACAGGAAAGACAAAATCCCAATTGGGTATAAAGGAGCTACATTTCACAG
AATAATTAAAGATTTCATGATACAAGGTGGAGATTTTATCAAGAATAATT
AAAGATTTCATGATACAAGGTGGAGATTTTATCAAGGGAGATGGTACTGG
TGTATGTAGTATTTATGGTGGAATTGATTTTCCTGATGAAAATTTCGAGA
AGAAGCATGAAGGACCTGGTTTACTTTCTATGGGAGATGGTACTGGTGTA
TGTAGTATTTATGGTGGAATTGATTTTCCTGATGAAAATTTCGAGAAGAA
GCATGAAGGACCTGGTTTACTTTCTATGGCCAATAGTGGAGTTGATACGA
ATGGCTGTCAGGCCAATAGTGGAGTTGATACGAATGGCTGTCAGTTCTTT
ATAACATGCGCAAAATGTGATTTCCTTGATGGCAAGCACGTTGTTTTTGT
TCTTTATAACATGCGCAAAATGTGATTTCCTTGATGGCAAGCACGTTGTT
TTTGGTAAAGTGATCGATGGTATGTTGGTGATGAGAAAAATTGAGGTAAA
GTGATCGATGGTATGTTGGTGATGAGAAAAATTGAGAATGTACCGACGGG
TGCCAACAACCGACCGAAGCTTTCCGTTATCGTATCCCAGTGTGGCGAAA
TGTAAAATGTACCGACGGGTGCCAACAACCGACCGAAGCTTTCCGTTATC
GTATCCCAGTGTGGCGAAATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037547XLOC_037547-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000042_pilongenomesc0000042_pilon:1339320..1351514 -
Properties
Property NameValue
Aaloc469-537:70
Aaloc430-468:366
Aaloc373-426:2762
Aaloc340-372:3048
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Aaloc157-198:4848
Aaloc67-153:5177
Aaloc1-66:12196