|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:280470..287367- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037481 ID=XLOC_037481|Name=XLOC_037481|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6898bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:280470..287367- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGGTAATTTTACTT
TAATTCTTTTCGATTTCTTTCACATTGAATCCTTCCTTCAAAGGCAGAAG
AATTCAATTTGTTATTTTAACCCTTTTGATACTCTTCCTTGTACGATAAA
GGGCTTTTGTGGCCTAAATCAGTCAGGGAAATCCTCTTAAAATTGCGTGC
TCATAATTTTTCTCTAAAAAGTTATTTTTTTAAGTTTTAGTTTTATAATT
TTCATATTTTTTTTCTAAAAAGTATATTGGTTTGATGGCTAACTGTGCCC
AAAATAAAGTGAGCTTTTAACAAATTATTTTGTCATTGTAAAGAGGAAAG
GCAGACTTAAAATTTGGTGTATGTTACCAGACAGTTGGCAGATGATATCA
TACTCCAGGATGCAAGTGAAATTTTTCAATCCACGGACACACCCCCGTGG
TACGGTTATTATCAGTTAGGGTTAGGGTTGGAGCTCGAGAGTCGCAATAT
AAGGCCGAAGGCCTTCTTAGGGGCATTCGTACCGGTAGCGTAGGGTTGGG
AGCTTTCTTAATTAAGGTCTGTAAATTACACGCTATAAGTATTTGTGAAT
GACAGCTTTCTGTCGTGTCTCATTGACGTAAGCGGTTAGGCGTTGGGGTT
GTAAACCAAGGTTGCTTGCATTTGGTGGTTCGAGCCAGAAAAATACTTAG
AAAACAGTTAGAAACACTTGAGAAAGACAGAAAATCAGGATAGTAGATAG
GAAATTAGAAAATAGGGGGAAAATAAGAGACGGTGCATCCAGGAGTATGA
TATTGTTTGCCAACCCAGATCCAGTATGGGGCGGATTTCGTGTAACTAAC
GCCGAAGATCTTCGGCGTACAACTGAAACGTTTTTGGCGCATTGGCGTAA
GGGTACTTACAAAGATTGTTTGATTTTCAGTTGGCGTAAAGTAATAATTC
CAGCTCGGCATGAATGACTCCATAATCCATCGATTTTTAGCTTTCATTTG
GCTAAATTTATTGCTTTCGCTTGCTTATAGTTATGCTCGCGTCAATTTAT
TAATTATGTCAGTGAGGCTGGAACATCGATTTTTGAGGATTACGATTTTA
CCAGCTTTTTAGCGATTTTTGCCTCGCTAACCCAAATCTCGCAACCTCTT
TATCTTAAAGGATGATCGAAATTAGAGTTTTTCAGCGTTCCGAAAAAAAC
GCAAAGCAGAAATTTTTTCATCTTCACAGGATCGATTGTCAACAACAAAA
TACATCTTTTGGTCTTTGGGTTTGTTTCTGACGTTTTTCCTTCAAAGAAT
ATCGATCACTTTCCTTTTCCCCTTGAGCGCGCGAGAAAAAAATGATTAGC
TCGCATTCTCGCGCGGGCGAATAAAGATGAGGCGGCAATCTTGCACTGAG
GGTGGTACTTAGTTTCCGCCCTATTTTGCGCCCACCATAGAATGGTCCAA
ATACGGGGGTATTCCAAATGATAAACGATGTCGTTCTGAGTGTTTTATTT
TCTGCTAGATACAAATAGTATATTGAATACTATTAACTTATTTATTTAAG
TATTTTTGAGCCCAAATTTAAATATCTGGTTAAATAAAAAACAAATGACA
TCAGTTCTGTTTTTCCCTCAAACCCCCGGGAAAAGTTTTTTTGCCGACTT
AGCTATTTTACAAATTTCGGAAAAGAACTCCCATAGGAATTCCGATTCAT
AACCCGATTGGTTCATTTCAGAACGGCTTCAAGAAAGTCATAATGGCAGA
TAAATTTTAAAAGTTTCTCTGAGTAAATGTGTGTAATTTATTGATGTTGA
TAGCTTGTTGATTCTTTAAAGAAGAAAGATAACAGGTATAGCTTTTTCTA
ATCCTGGAATATCGAGGTTCCAGCTACACTGTATGTTGGCGCATGCGCCT
CTTTTCCCATCTTGCACCCTTATTGAAAAATTGAATGTTGGTACAAAAGA
AATTTTGCTTGGCGTGAGGCTTGCTGTACGGAAAAATATCTTTGGCGCGA
TATTTCGTGGAATCCATACTGGTAATAGACAGTGTCAATCGAACGAATCG
AACGAATACTACCTAGGATTTGCCATTTGATTGCTTCGATAACGTTCTAT
TGTATTCGATTATGTTCGATTACGTTCGATTGATTTAGATTTTAATCGCT
TTCGTACAATACTTTAGCGCTCGGCCGCCCATGCTAAAAAGCTCTAGCTT
TTTTGTAGTGTTAAATGGTAAATAGATACTTACTTACTTACTAACGGAGT
GATCCAATTTAATTTAATCGCAATCAAACTCGTCGAACGTTATCGTAATC
GAACAAAATTGAATATTAAATTGAATGTAATTGACAATCAATCGAACCAA
TGGAACATAGTCAACTATTAATCGAACCAATCTAACCTTACTCGAACGCA
ATCGAACACAATAGAATATTACCCAGGAATTGACCGAGATTCGATTACGT
TCGACAATGGAATTCGCAATTATTCGATCGAGTTCGATTACGTTCGATTG
GTTCGATTGCGATTTTTGTTCAAAGTTGTTCGATTGACACCGTCTGGATG
TTACCGGGCAAGGCATGAGATTGGGTAACATGCATCAGCGGAGGCTAACA
TGCATAGCCCTCAAATGAATGACCTGGCTGGTCATTAAAATACAAAGTTG
AATCAAAACAAAAATAGTAGAGTAGAGCTGCTAGTTCATTTGTTTTGAAA
TTTTGCTGCTTTGATTGCTGGTCAGTCATTTGATGGCAATACAAGTTTCC
CTCCACTGATGCAAGTTACCCAACTTCACGGTATAACTTTTTTAATTTGT
CAAGTTATAAGCTTTTAAAGTCAAAATTTGCTTTTGAAAAAGTCCAAAAA
CATGTCAAACTTTTACAGAAACCCTCAAAATTTCACTTTGTTAATGACTT
TTACAACTTAATTAATGATCCCAGCTGATTTTGTTCAATTATCCCAACAA
AAGCTATAATAATAATAGGCAAATAATAGGAAAACAGTAATTCTGAATGA
TTCTTAAAAAAAAATTAGTGAAAAATGTTTAAAAAAACTGATTTGATTTG
ATACTCCTTTCTAAGTGTTTTTGGACTTTTTCAAAAGTGAATTTTATTTT
AGAACCACACTGTACCAATTTTAAAAAGCTATCTGCCAACTTTCAAGTTT
GTCTTTCCCCTTGACAATTTAAAAAGAATATATTATATATACCAGGCGGT
GTCAATCGAACTGTTCGATTATCGAACTTAATCGAACCCTATCGAACGAT
AGCTGTTCGATTACCGAACCCAATCGAACACCTATCAAACCGGGAAAACA
TTTGTAAAGTTTGATGACTGTTCGATTATACGATTAAAGTTCGATCGCAG
TTCGCTGAATACGATTGAGGTTCGATCAGTTCGATTAAGATCGATGAAGT
TCGATTGGTTTGCTTAAATCGATTTATACCTTGCCGCCAAATTTTTTATT
TATGTTCCGAGGGCGTATTGGCGGCCGCCCACGGGCCATTCTCGCGGGCC
ATCCTATATCTATCCCATCGAATGGGACAAGCTGGAGCTTTTACAAGCTC
TTTGGTCGTTAATTTGTAAAAAAAAGATTTTTATTTTTATTACTTTCTTT
AAAGAAAGTATCATCTCTATTATTTCAAATGAGCAATAATGAGTGAAGCA
TACGGTGCCTGTGTTTTGATTAAACAACCTCGTAATTTTCTGAAAGGTAA
AGAAAAGTAGAATCAATCCGACACAATCATTGAACCACATCGAACTTTCA
TCGAACAACATCGAACTTAAATCGAACTCATCGAACATCAATCGAACTTC
ATCGAACAAAGAACACTCATCGAACTAAATCGAACTTATCAAGAATTTTT
CGTAAAGTTTGATAGCTGTTCGATCGGGTTCGGTAATCGAACAGCTATCG
TTTGATTTTGTTCAATAAAGTTCGATGGTTCGATAACGAAAATCGGTTTG
ATAATGTTTGGTTGACACCGCCTGGTATATATAGTAAAAATTCACATTAT
TTTGGACACAGTTATCCATCAAACCTTTATACTTTTTTCTGGGTCACCCG
GTACAATAGATTTTGAGTAAGATAGTCAAAGGTCAATATCCCTTCTTCCT
TGTCTTATTTTGGTACCCTTCTTATTGTTAGGATTAAAAAAGGTCAGAAT
CACTGATTGAAAAAAAAATGTTTTCCTCTCTGACTGTTTATTAGCAATCA
GTGATTCCGATTTTTTTTTGTTTTATTCTGGAATGCGTCTATTGACATTC
TCTAATGAATGATTTTTTTAAAAGTAAAAACCCAATTTTTTCTTTATTGG
TACAACAACGACCCTTCCAGCGCACCAGACTATCTGGTGATTAACACCAG
ACTATTTTCATTTTATTGCGCGCATGACACACAGGACTTATTACAACCTG
TTCAGTGTTTGTATTGTCTGGTGCTAAAAAGTTTTCTCATTTGACACCTT
CAAGTTCAGTGCGTTGGCAGGGTGTTGTGTACTATGGAAATATAAGACTA
GTGCTGATTGAACAGTTTTTTTATCTCATATAGATTTGATGATGACATGG
ACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGATGAGAATTTGGTAAGC
AATAATTTGTATGATAAAATATTTTGTATAAAATAGAATAGCTTTTCTAA
GATATTTTGAACTTAATCAAATCTCTTGCAAAGTCAGACAATGTTATTAA
AGATCACAAATTTCTGAGAAAAATAAGTTTTTCAAAGCATAACCTTTTAC
AAACTATGGTTTCAGATAACATTCAACGTATCGCAGCCCATTGCATGAAA
ATTTTAAAAGCATGCAGAAAATTAAGCCTTAATAAGCAGTTTCTCTTTGT
TTATACAGGGTGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGGT
AACAAAGTGCATAGCTCTTGATAATTTTCACAATCAACAGAGACTTTATT
TGGATAAAGCTTAAGAAGATATAATTTTATCGATATTTGATTTTTTAAAT
GGTAAAATAGGTTTTCCTAAATAGACTTAAATGTATATGTAATATGTAAT
TTATGTAATTTTTTTGTAGATGATAACCAACCACAAGCTCCAAAGAAAAA
AGTGACAACTCCATACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAGTTCTTGGTA
CAAGGGCTTTACAAATCAGGTAATTGTGGAGTGATTTATTAAAAAGGGAT
AGTTTATTTTATGTCCTCAATGCTATGTATGTACAGTATGCAATTAGGGG
TCATGACAACCCCTATTTATGTAGCTTTCCCCTTATCATGCATCCAATTT
GTTTTTTTAGTTTCCAATTAGGAGTTTACCAATTGAAATACGCAAAAAGC
TTAAAATTTCTGTAGTAAAGTGTAAATGTAAAATGGTCGCACAAGTAAAA
ATTTTGCCATTTACATTGATCCAATTATTTAGGTGTTATGATATGATATT
ACAGTATGATACATAATTTGATCAAAATATTGTTAACCCTCTACCCTAAA
AGCTTTAAAACCCCTATCGTATTTGGAAGAAGTCTTACACGTCAAAGCTT
TTTTTTTTAATATGAAAAGTTGGACTTGTGTGGAAAAGTTGGACTTACAC
TCTCTGTGCAGATTCTGGCATTATGCCAAGCAACAGTTGTGATGTTGTTT
GGAGGGCGTTGTGATTTCTGTTAGATTACCTTTGTCCGCTTTGCCCATTG
TGGATTCTGTTATCAACAACTTAGTTTCTGTATTCAGCTTACTGAGGATT
AAAGAATTTTTATGCTTAAAAAAGAAGAATATAGTATAAAGCAACGAAAT
TGCTAAGCATGTAAATAAGTTTTATCTAAGAATATTAGAGAGGTATAATA
AGTAAGTGTATTATAATGATTATGCTGGCATTATGCCAAGGTTTTTTCAT
AAGTTCGATTTCTTCAGTTAAATGAATGACAAAAGTGAAAGAAGTAAAAT
ATATTTGAATTATGTTTTTCATAATTTTACATTTTATACTCAAAGTAAAC
ACATATCACTTATATATTCCTGATAATTTGGGAAAGTCAAGCTAAATGTG
ATATACTGACATGTAACAAATAGGTTCTGAAGTTCTAACCTCCATTTTCC
CTGCAGCGAATAGGTTGATCCTTAAAAAAACAACTTGGTAGTTAAAGGGT
TAAAAAAGGGTCCAAGCTGTAGAATGTTTTCAGACTGAATCATTGTCAAT
CAAACATTTTGATTATTTGTTTTGTTTTTAGTATGAATGCTCCTGTGATG
GTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGAAAGAATT
AAAGTAAATCATTACATTATTTGTGCTTTTCAAAATGAAGTTTTTTTTTT
TAATCTTTATAGTATAATTTCTTTCAATGCAGCTTTAGTTTTATAGCTGC
AAAATCCAATACTCTACGGTCCTAACTCTTTGTCCTCGCTCTTTGTCCTC
ATCTTACATTGTCTGTTAAGCTACCAGAGTATTGGCCATCATTTATCTAA
AGAAAATTGTAACAACAAGCATTTGTAAAAAAGATAGGTTCTTAGAGGCC
CACGGCGCACCTTGAACCTCAATCCTGAATAATATAATCAATGTTGCAAC
TTTTTCGTCTGTAAACCAAAATCTGTCCAATTGAGATTTCAAACTAGGAG
TTTCGTCCTGGTAGCTTTGAAGCAATGATGTTAAATTGGTGTATAGTTTT
GAACTTTTCGCCCAGCTTCACCCAGCTTCACCAAAGGCAGTTGCAACACT
GGGGCATAATCGAAGGTCATTTGCCCGTTGAAATACTCATACTCTCTTTC
TCTCTTTCAGAGCCAGAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCA
GATGGAAGTTTTGAAGATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:280470..287367- >XLOC_037481 ID=XLOC_037481|Name=XLOC_037481|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=798bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:280470..287367- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGACGAAGAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGATGGCGGACGAA
GAAGATGTTGGAGATGGCATGGGAGGATTTGATGATGACATGGACAATGC
TGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGATGAGAATTTGATTTGATGATGAC
ATGGACAATGCTGGGGATGATGACTTTGAGGAACCTGATGAGAATTTGGG
TGACGACATGCCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGGGTGACGACATG
CCTCAAGTAGATGTGCTCCCTGCAACAGATGATAACCAACCACAAGCTCC
AAAGAAAAAAGTGACAACTCCATACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAG
TTCTTGGTACAAGGGCTTTACAAATCAGATGATAACCAACCACAAGCTCC
AAAGAAAAAAGTGACAACTCCATACATGACAAAATATGAAAGAGCAAGAG
TTCTTGGTACAAGGGCTTTACAAATCAGTATGAATGCTCCTGTGATGGTT
GAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTACAAATTGCCATGAAAGAATTAAA
TATGAATGCTCCTGTGATGGTTGAGCTGGAAGGTGAAACAGACCCTCTAC
AAATTGCCATGAAAGAATTAAAAGCCAGAAAAATCCCTATCATTATTCGA
CGATACCTACCAGATGGAAGTTTTGAAGATTGGGCAATTGATGAGCTGAT
TATTGATTAAAGCCAGAAAAATCCCTATCATTATTCGACGATACCTACCA
GATGGAAGTTTTGAAGATTGGGCAATTGATGAGCTGATTATTGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:280470..287367 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 313-399:88 |
| Aaloc | 241-309:667 |
| Aaloc | 142-237:1828 |
| Aaloc | 100-138:2041 |
| Aaloc | 40-99:2365 |
| Aaloc | 1-36:6899 |
|
