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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:462193..469861+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037461 ID=XLOC_037461|Name=XLOC_037461|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7669bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:462193..469861+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATCCTGCAACTCATCAATGTGCACCAGGTGCCTGGGAAAAGGtaaa
cattatttttcattgctactctatttttcaaaagtagattGATTGAATTC
AAGCTGTTAAGTATTGTGTTGAAATGAATCAATTATCTTTCAGCATTATG
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AATGTCTTGcaaaatttgccaaactaaAGTTAGGTCAAGAGACAAGAAAA
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TGGAGGATCATGATGTAGTTGCACTACTTCAGCAAGCAATTGAGAAACGC
AATGTAAGTTTTGGACActaattcaaaaattattataaCAATATTTTAAC
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aatacacgttttttttttaagaaacacacctttaagaaacacgaggctca
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gagaaaataacattttttaattcgttttttttaagaactttccaATCCAA
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TTCCAACCGTTCTTAAATACAAAAATTAAGCAAAGTTTTGAGGAGTATGT
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TTTGAGCACTGGAAAGCAGTGACTCCACAGTGGAATAAGTGccggtggtg
gtgtgacaaaGGTTTTCCCAAAATGGTATTTATTCATTACAGTGTCATGG
AGAAAGTGCATGACCCCCaataaaatgtctttaaaatgtCCCCCTAAAAT
GTCTTTATATTGTTTATAGGAAATTGAAGTTGAGCAGATTGCGTTATTGA
ATGATACAACCGGAGTGATGATGTCTTGTGCTTATAACGATCCTGATGTT
ATGGTTGGGATGATCTTAGGTAAGAAAGTTGCATGTTGTTTGTACCGTAT
TTCATATAATACCGATATACCCTGTCTAATTCCGTCATAACAACTTTCTg
gtcttttaaatgtttataaaaccTTCTCAGTAAGCTGTTTAAAAGAACTA
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GTGTATTGTTTGCAATAATGTTTTACTGCCGCTgcacccattgagtttaa
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gctgtaacccctctggaattctgaattttactatgatttaaaaagctacc
ccatggaatttgagttatttttgacagatttttgtatctccctatgacAT
TCCGCCACataccttacccccttggaacggaaatggaccttatgaggtat
acggtttttttctggaaaaacttATTCCAAAGAACGACAACACTCGAGTT
ATTATTTCACCACCTTATTCCAAAGAATACTTCTCTGTGATGTGAGTTAA
TAACTTGTGAAATTATTCATTAATTAGTCAAAAATGATCTATGATCGaga
caatgcaatgacttcattcAACTCTGTTAAACTTAACTTGAACCAAGTCC
TCTTTAATACAGCTTTTAGAGCAAGGGTTGATAAAGATGTATTAAAAGTT
TGTATCGCCTAACATAAAAAACTTCTATAAAGACGCACTTTAAAGTTCGA
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GGTTTAATTTTCTCAGGTTTtaataaaacttctaattttCAGGAACTGGT
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ATGGTGATATGGATGAATTGCAATCAGTTAGTACATCTTATGACAAGATT
GTTGATGAAGAATCATTATATCCTGGAAAACAATTGTAAGTGCTGGGTGA
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CggattgaaattattttattttattcttcgTTTTTATACGACATTACAAA
TTAGTCACTTTTACTGACTTTTCCTGACTTTTCCTCggctttcaattttc
tttaattgTATAATTCGCTTGTTTTTACGATTACTTTAATGGCCTGAGAG
ATATAATCCCGGGTTATGGAAACCTAAGTTATAaaatcccgagttatgac
gtcttAACTCGAATTTTTTAAGGTGTGCCTTTATTTTCCGAGCTAACTTC
CGAGTTAACTCAGTCATTTTAGATGTACCTAAATTTTCGATCTttataac
tcgggttttccaggCCTCGATGTTTTTTAACAATTTAATTAACGAAACTC
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AGATTCGAGAAGATGATATCTGGCATGTATCTTGGTGAAATCGTTCGTCA
ATGCATTCTGTCTCTaatcaaagattttgtcttATTCCGAGGCTACATAT
CACCACAGTTGAGCAAAAAAGACAGTTTCACTACAATTTACGTATCTGAA
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ATGTATTTCTAAACTAGGGTGCCTGAAGGTCTACTACGCTGTATCGAAAA
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GGTATTTTTCATCCCGTTTCTAAGTGAATTCagagtgataaaaaaatcgc
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CTGTTTCGCTTCGTGCCGCTCGATTAGCTGCCGCTGGTCTTACCTGCATT
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TCCGACTTTATTACatgaatattactagtcattttatttattaacacgaa
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CCTGTTTGATTGATTTATcttggatttcatttttttcgaaacataAGTTT
GAATAATAAACGGGTTCGAGTAAACGCgggggggggcgggaaaattttca
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GCTGTCTAAACCCTATTTCTATTCGCCAAATCATCCATTTTAAGGGCAGA
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TATGAAAACCCCCCGGGTTActactgtttttattttaactttgctaaaat
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ttttcacagCGTTTGAAACGATCATCAGTAAGTGTGGCCATGGACGGAAG
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AGGAATTTTTGCCAACAACACAGGTTAATTTGAGGCTGGCTGAAGATGGC
TCAGGGCGTGGGGCGGCTGTTGTTGCAGCCGTAGCTCAACGACTTGCAAA
AACCGCCCTTGTCGATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:462193..469861+ >XLOC_037461 ID=XLOC_037461|Name=XLOC_037461|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2772bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:462193..469861+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATCCTGCAACTCATCAATGTGCACCAGGTGCCTGGGAAAAGATGTA
TCCTGCAACTCATCAATGTGCACCAGGTGCCTGGGAAAAGGAAAAGGTCA
AGACATTActgaaaaaattcgaatttccacGCGAATCAGCAGAAGAATTG
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TGAGACTTTTCCAATATCTCAAGAAATTATGAAAGGTGATGCCGATGGTT
TGTTTGGATACATTGCAGAATGTCTTGcaaaatttgccaaactaaAGTTA
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AACTGAACGATGGGAATGTGTCAATGAGTCATGAGACTTTTCCAATATCT
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ATGTCTTGcaaaatttgccaaactaaAGTTAGGTCAAGAGACAAGAAAAC
TTGGAACAGTAGggtttactttttcttttcctgtaCGCCAGGAAAGTTTG
ACCTGTGGATCATTGATTAAATGGACTAAAGGTTTTGATGTGGACGATGT
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ATGAAATTGAAGTTGAGCAGATTGCGTTATTGAATGATACAACCGGAGTG
ATGATGTCTTGTGCTTATAACGATCCTGATGTTATGGTTGGGATGATCTT
AGGAAATTGAAGTTGAGCAGATTGCGTTATTGAATGATACAACCGGAGTG
ATGATGTCTTGTGCTTATAACGATCCTGATGTTATGGTTGGGATGATCTT
AGGAACTGGTTCAAATGCCTGTTACATGGAGAAATTGGAATATGTTGGCA
AATGGTTTCACCCACAATCTCCTTACAAAGAGTGCATTATCAATACGGAA
TGGGGAGCATATGGTGATATGGATGAATTGCAATCAGTTAGTACATCTTA
TGACAAGATTGTTGATGAAGAATCATTATATCCTGGAAAACAATTGAACT
GGTTCAAATGCCTGTTACATGGAGAAATTGGAATATGTTGGCAAATGGTT
TCACCCACAATCTCCTTACAAAGAGTGCATTATCAATACGGAATGGGGAG
CATATGGTGATATGGATGAATTGCAATCAGTTAGTACATCTTATGACAAG
ATTGTTGATGAAGAATCATTATATCCTGGAAAACAATTATTCGAGAAGAT
GATATCTGGCATGTATCTTGGTGAAATCGTTCGTCAATGCATTCTGTCTC
TaatcaaagattttgtcttATTCCGAGGCTACATATCACCACAGTTGAGC
AAAAAAGACAGTTTCACTACAATTTACGTATCTGAATTTTGCAGATTCGA
GAAGATGATATCTGGCATGTATCTTGGTGAAATCGTTCGTCAATGCATTC
TGTCTCTaatcaaagattttgtcttATTCCGAGGCTACATATCACCACAG
TTGAGCAAAAAAGACAGTTTCACTACAATTTACGTATCTGAATTTTGCAG
TGGTGATGCAATGAAATGTGTGAACATCTTACATCAATTAGGATATGAGG
CAGCCACCATTGAAGATTGTCACGTTATGCAAGATATTTGTATCGCTGTT
TCGCTTCGTGCCGCTCGATTAGCTGCCGCTGGTCTTACCTGCATTTTAAG
ATGGTGATGCAATGAAATGTGTGAACATCTTACATCAATTAGGATATGAG
GCAGCCACCATTGAAGATTGTCACGTTATGCAAGATATTTGTATCGCTGT
TTCGCTTCGTGCCGCTCGATTAGCTGCCGCTGGTCTTACCTGCATTTTAA
GACGTTTGAAACGATCATCAGTAAGTGTGGCCATGGACGGAAGTCTTTAC
AAAAAACACCCAACGTTCAAACGATTCATGCATCAAGCATTGGAGGAATT
TTTGCCAACAACACAGGTTAATTTGAGGCTGGCTGAAGATGGCTCAGGGC
GTGGGGCGGCTGTTGTTGCAGCCGTAGCTCAACGACTTGCAAAAACCGCC
CTTGTCGATTAGCGTTTGAAACGATCATCAGTAAGTGTGGCCATGGACGG
AAGTCTTTACAAAAAACACCCAACGTTCAAACGATTCATGCATCAAGCAT
TGGAGGAATTTTTGCCAACAACACAGGTTAATTTGAGGCTGGCTGAAGAT
GGCTCAGGGCGTGGGGCGGCTGTTGTTGCAGCCGTAGCTCAACGACTTGC
AAAAACCGCCCTTGTCGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:462193..469861 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1177-1386:7460 |
| Aaloc | 1027-1176:6307 |
| Aaloc | 871-1023:4354 |
| Aaloc | 679-867:3095 |
| Aaloc | 577-675:1870 |
| Aaloc | 46-576:373 |
| Aaloc | 1-45:1 |
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