|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000080_pilon:401075..411033+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037460 ID=XLOC_037460|Name=XLOC_037460|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9959bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:401075..411033+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CGACAAACGATGcacttttttaaatacttttccCCTCTAAGTAATACATG
GTTGTTTCTTGATGATTTAAGAGAAGAGAAACAAGAAACAGAGGGAAGGA
AATTGGTAGAAAAGATGTTGCgaccaaaaaaatttattggtaTTGCCATA
TTGTTATTATTGggattttatcatattttttacaCTGGTGCTAATGTTGA
TTTGACTCTATTCAAAACTTCCAAAGCAATAAAAAATGTGAAGTTCGTTG
AAAAAGAACGAATACACGAGTCATACAAGGCAAAAAAGAAGATTGTTAAT
GAAGTTGCTGCAAAGAAAGGTATATTATGATGAATTTATAACAATATTTC
ACGACTCATAAATCATCTAGTAGGTCTACAGTATTCTACAGTAtcttttt
gactttcttttgacttttctcaaactttcattttcactttttcccGACAA
AAACGGCCATCGCCCTCGGGCGCCCAATATTTTCCAACGAAGTTTTTCCA
AAAACGCCCACCGCCCATAGattttgctccacccatccgcctattcaaga
atctttttgactttttcaagactatttttttactttaatttgactttttt
gacttttttgactttttgtagaggtgtacGATAGTTTTTCAAGTGCTTTG
CCCGGGGGtgtcattttcttgaaaatcctTGTCCATTTTGAAGCACAGat
tggtcagattttccaaagtTTGACCCGAAAACTccgtttttctcattttt
tacgCCCTTAGAGTGTACTTTCTCGCATTTCAACTCGTACAGTGTACTTT
GGCAAACCTTAAAAACGCATATTGAACAATTCAGTTACTTCAAGCGTATT
TTACTTTATTCTCTCTTTTTGTACCCGAGTAGGCTCATAACACGAGGTTT
CGTGGAATTAATGATGTTTAAACCCAAATCTGTTAAAGAAGTTTGTTTTA
ATCCAATTACGTGCTGCATACTGTACCGTGGCTGATCAATACGTCTATTA
TATGCTATGAGGATACTATAGTACATAAGTTGGCCGTCCTACGTAAATTT
ACTACATGACAAACTCTCCTGGGAGATTTTTAAACTACCAACCGAGAGTT
CAAATTACCAGGCGAGAGTTTAGACATCCGGCCGGTAGTTTTAAATTATC
GGCCGGTAATTTGAACTCTCGGCCGGTAGTTTGAAACTCTCGGCCGGACG
TTTAAGACACGCGACCGGACGTTTAAAACAGAACACAAACACACTTGTCT
AAATCAGCCACAGTAATACTGTGTAGGAAaaacaaccaaccaaatcatAT
AGGAGCTTGTTAAAACTCCAGTTTGTCCCAAATCTCTATAGATTTGTCTC
CACTAAACCATCTTGActgctcaaaaaaaaaaaactttgtgaCTCTTTGT
GAAATACGCTTTTAAAGTCtctccagatataattggcagtggaaacaaga
atgcctgtaacttttgatagtcaaatataaatataaaatacGCTTTTGGA
ATTGAAACAAGGGATGTAAACGTCCTTTATCCCGTCATATCTCCGCATCA
AATTAGAAATacctttaagggaactaatttttgcgggaactaaattttgc
ggttaTTGCAGATTTAGGCCCAAACCGTAAAATTTAGTTcccacaaaatt
tttcaaatgcaaaaaacaaaggtcgaataattcacagtacggctttaatt
ttctttctagtgagaaatccgcaaaattaagttcccgcaaatattaaata
ttaaatcttgaactgcgaaccgcaaaaattagttcccgcaaaaaatagtt
cccttaaggtttTGAGCGGTCGAGGTGGTTTTGTGCCCAACAAAATAAGA
GGATACCTAGGTGAAACTTTAAAGGCGAACGAAACGAAATTAGACACCCG
GGgagcaaaatactaaaaaatcaTGGtttttttGTGGTGTTTTGGTCAAT
TTCTCCCTAATAGATTTAGCTTCTATGATAAAATTTTCGGGTATCTTTAA
TTTCAGTCTTTCATCTGtctatctaagaaaaaattatatcGAAATCATTT
ATGAAAGAAAAGTTATCAgcgattgaaaaaaaagttaaaatcgtAATTCT
GCACAAGAGCAAAACTCACTTAAGAAAACTGAGAATGCACGCTGACAGGA
AAAACATTTAGATTTTGACCGTGTTATATGCGTTGAAATGACACTATTTC
AGACTAACTTTGCCCAGAAACGAAGCTATTGAAAGTATGAACCGTGATGT
TGTAGAAAATTAGTGCAATTAGAGTAATTCCATTACTTTTGGCACCTATT
GTAACTTTATCAGATCGCCTTTTAGATCTTTTAACGACCCatttcgaaat
tttaagcaatgaCATTTAGGGTGGGTTTACATCTGTAGGGGAGAATCGAT
TAACAACacacaaaaaaactcaaaatcacTTTTACGAATTCTTTTATAAA
CATATCGATCTCGTTATTGCCATTGTTACAAAAGGTAGGTTTGGGTACCT
CTAAAGACAAAGGACGTAACGATGAGAAAATCcattaagttttaaaaata
aattgtgtaaagaaattttccaattccTTTTAAATGAGTAAATAATTGGA
AAATGATTTCGATGACGATGATGACAACTACGCAAATGACTTTTTCAATA
AAGCGTTACTATGCAACAtggtggtttttcactgagactgtctggcgaaa
atcgattagctgaaacaaagaaaattgataggaaagcattactgactccc
aaaacagttgtctaagcgtttacaaccctttgaatttgaagaaaatttta
ttaaaaatcatcagcTCGCATATCAAAggatttagaattacagccttcta
atgaacattttctgtgacaagattcctcgtcttttCTATCAAATCCATAC
Acatgaaagtttgctcttcgactctatcggggaaaaaaaaacttttccca
tacgaccaattttttacaaaagaatcccactgcacattctgctactttta
tgACAATCAATTTATTTATGCTGTCTTTTTtgcttaattggtcattaagc
caagagaggtctatccctctcttggagaacaaaaggtttaatgaccaatt
ttcgacgttaaatctggaatgctgatatgaagcgatcaaaatctgatgtt
aagcacgaatcctcattgtatattttttacaacccttagaaatttatgaa
aaggaccgttgatgagaaccacttatctatctagcgtagtgaaaaagcac
ccataGACTGATgaatatacagggtgtccctaattaaagtatcgagtcga
aacacaactatgagtagaaagttttatgtgcgtgttcacaaaattgtatt
ttaagctctccctcttttttctttgtcattacgattaatttgtacgttgt
aactaccttttgtaataagcctgtgtgatggagaacgttcttatatttca
gcgataacacacacaaacctttctactcaatcgcatgttcgatactttaa
ttagggacaccctgtagaaaaACATAATATTCCCATTCTATAATAAAATT
TGAACCATTCCGAAAGCTTAGGGAAAATTAACTATGACTTAAAAAAGGAA
TTGGGATGGAATCAAAAGAAAACGTGCGATTATCATTGTATTccttacag
tatgtggcccccaaaacggcgatcaaatttgaaatttctctcaaatctag
aggaaaagagattttacaaaaatttttgctgcatgaaaacctttaacatc
tctactttatttcctggaagttatttttcaaaattttcaatttcaacaat
atttttcaatcgcttaaagatagatagcttttttctaatggcccccaaaa
cggaggtttgaaattttagcgatttctcgagatatctttaagatatgaat
acaaaattttgaccatagttttgaaatatgatttagagggttttgggtat
aaatttatttgataaaatctttacagtatacccctggttgtcaaaatgca
ggtttggggcccccaaattggaggtgtagttaaaatcaaattattaagcc
cagtcgtaatagggggaaaaactatgaacatatttgtgttttcccttaga
TTTACGACCctatggatgtaaaatttatgattttcatgaaatatttcaag
attttcgatattgcaaagtccaaactgaaaaattagaaattttcaaaatg
acaattttgatttaacaacgtcttaattaagtttttgaaaacaaatctta
tttgaaaatagttccattcatgtatggaataagctgtgaaaattttagaa
aaaaagcttaactgaaactgaaaatattaagctttaaagatatttttctc
ctatattttgcaaaaaaatgacagaatttgccgtttttgctgattcagcg
aaaaattttatttataatgttaattttttgttataaactattacctcaag
gtgataggaatagaattccaagattttttgctttttctcatatttagaat
tttcggttttgtcaatgctgattcgagggctccaaaatactggttgacct
tcaagatgctatatcttttacccagcctctaaagtcacagatatatttgg
attttctgaacggcattaggtgtagaaagtttcctatacccagttttcat
aacttattttcaatatccaaggagctagagtgagttatatgcaattttta
tctaatttgggtgttaaaatatttcctttagacgcaaaatatgttatttt
gaatctgtctcaaaccatcaaaaacatgctcattttttagtatagctatc
attttttcaaaataaacaaaaatcgtttaattctgataaatctacaagtc
agaatcttcattttaatgaaaacctccgttttgggggccgtctccgtttt
gggggccatatactgtaatcGATTCTCTCCTAGATGTAAACCCACCCTTA
ACCCTTTGGTTTGATCgatttaatttgatttaaaattgatCATTTCATCT
AAATTACTTGTTAcagcatgaaggtaataaagatatagatggagagaaaa
cgtctcggtaatgatctaaatggtcgttgaaatcttttataaatctattc
aaagcggcttttctttgatgtaccatcattggaagcaaaaaacatcaggg
gggtttcaggggttaCCAGATTCCGCAATcccgccaattttttcttccga
tttccgtcaaaccgtcttaaattgaaccaaaattccgtcaccgaaaattc
ctttgaaattcaatatttttgtcgaaaattccgcaaatttggaatatctt
ttaccaattccgaaattccgcaattttttttgctaaattccgtttttcca
cactaaaattgtctaattttccgtctccgtcagagaacccaatttccgta
attccgtctaaattttcgccaaattccgtcactccgtccgaaaaaagggc
cgattccgctcctctgCCAAACGTGAAACAGAAAgagactgtttggttga
ttttgaaaaacttaattttagcCTCTATCGATgactttatgggcagcttc
ccctagaagtttggagtattgtgcttattagagcttattatgtgaagttt
ttttcaatttttcatgacaaggctattatatttcaatattatacttgtta
aaaatgtaatgtcttttcattcatcttaaatattcccacgagtataccca
aaattaatcatcttattcccaaagcaaccaaacagctctttgcttccgat
gataaatcagaatagaacaaaaggcattgactctccatctatctttatta
ccttcatggttaTAGTACAAGCAACCACTTTTgtactagcctggatatcc
aagctaaaaattttagaaaaaataagttttacctcagccagacaaagttc
taaaataataaagcTTGGAATTAGGTGAACCcatgttgacagattttcct
gcatgaatcccatggctgcaaataaatatatgcacataatgacatgcata
atttcaagatggtaccccagcagtgataaatcaatttagaatggcagcct
tgaccataaaacatagacagtgtggtggagtCTATTAGacagaaagtgca
aagtgaattttggagaaaaagaatcatcaaaacaaaactttcaacccaaa
acagcactacaaaattggcaaacagaaaagaagaattgaagcaaaataaa
gatataccttttatagttttagttctttacacggtGCAACAAAGtcaata
agaaaattaaaacatgatatctaagcaagtatgaaaagaaaacaaccaga
acatctaaaaattcccatcttttgatcttcccacttcttccctaccatta
ttgttatttttatttggatgcgtggtcaaacacccaagggagataattag
gcattctattgttatttgcttcgaagaagaaaaatcagggagatttgcaa
agcagcatACACGCCTTTCTGATCGCCTGCGCGATCCATCCAAATACTTA
GGCGGacacttcaagtcggctcgcataatttctataCGCtcgccaccatt
cagatctctgatttgCTTGgacccaaccaatcagaatatctgcataatca
tcctcagataatcctcagatcagaatgcacacgatctaggtaaaccagac
cgtaaatataagaaatcaaaaagaaaattacgggctggatatctaGGCTA
CTTTTGTCCATGCAACAGATAGATAATGAAATTTCGAtatttattttaca
atttttactcTGCCTGCGCTATTGATAGAAAACATAGCTTCAACATATTT
ATTCTAGACGTTGGGATTTAAATTTTACTAGATGTAATAGTTAAAACAAT
TTCTGATCTAAAATTTATCACTGATTTAAAATGTGTTGTGATAGTGAAGT
GGAGACCCCCTTTTACCACCGTTgaaggaggggggggggcagtaaGATTC
CACTTCCCAGACTAGATTCTAACGTAGGGTTTACTACATAAACCTTAACC
ACTTACAATCAGGGTtctaatatttgagaaaaaaaagggaaattcccacg
aaatcttgtGGCCACAAACGATTcggaagcgctctaacttatGTTGAAAG
GGTTTTAACGCTAGTTTTAGGACTTGAAGatatccaaaagttcaaaaatg
gtccaataagactcagaatatagcttggaagtcaatgaaCCCTTCCGAAC
TGAAATATTTGATTACATTTAACAAATAGCCCAAAAGCAACTTTCTCACC
CGagcttcaaatttcgaaaaacgaggaaataaccaATATGCTCAATACAG
TGTGTTCTGCAAAATAGTAtactcaaaaaagtaaaatagaattatgaaaa
gtttttaagCTTAACCAACTTAAATTCTAAATTTGCTGAAGACACATTTA
TTCAGCGTTCTACAGTGCGAGAAGTCTTTGTTTTACAGATATAAAGCTTC
AAGCACACCAAGTTGGagatttaaaaagatagaagaatagaaaagagatt
ttcaaagcaaaaagctaaaacttttGATTGATAGCTCTCTCTATCTCTTa
tgtcattttgataaaaatttcccaTTTTAATGGTCAAACTTATTCACCTT
CCGAGTCGAATTTCTCGTTAGTGAAAAGCTGGTTGAATATAATTCTTTCA
GCAATGAAAAGAAGGGACATTTTTCTTTCTGCTGCATATAAAATTAACTG
TCTTAGACATTTCTACCTTTTGCAAATTAACGTTAGTTATGACTTATCAT
AGCTTACTCTGGAGTAACTTACTCCATTTTcaatgtttaaaagttttgca
CCCTTGAGTACTTAAAACTTGATATCTCTTAAACTAAAAAACCTTctgaa
gaacatttttaagcacAGAGAGCTGAATAGCTACACTTTCAGCTATACCA
AGAATTGAAATTATTTGtttagtcatttttttcaaagaactaCCTTAGTT
TTTAAACATACTTTTTTGCGGAACACGCTGTATATTTCAAAGCAGATTGT
AGGAGGCTCAGAAAACCCGAAGTTAGAGAGACCCCCGAATTAGAAAAACC
CAAGCTACGACAAATATGTCCCCCAAAAATATACTCAAAAATGTGAAAAC
TAACTTTTGAAAGaacttttcgagtttttttgaatttatgacgtcatatt
ttggCACAAGTCATTAGACaaaaaaaaGATCAGAATAGTGAGTATCTATA
GATAAATCGCGTCGACGGACGAATTTTCTCTAGCCTTCTTTCGCACCACG
CCACTGTTTTACAGGCTGATCGGAAAGCAAGCTAGACTTTCCCCGCAATG
AAATGAACTTTGCTTCCAGAACGAATTTCCGCTTGATTTTCCGCTTGATT
TTCCCTTCTAGAAGCAAAGCAGATATAATACACGGGATAAGTTTAGCTTG
CTTTCCGATCAGCCTGTAAAAAAGTACCGTGGTGCGAATGAAGGCTAGAg
aaaattcgtccgtcgtcgtgatttatcTATAGATACTTAACCTATCGATA
TTAACTTCACTATTGACAGTCGTTCCTCTACCAAACTTGTTATAGGCTTA
GCTAACATTAACATAGggaaattatattttcttcCATCACTCTGCATAAT
CATTGACGTATTTTGTACCAGATTGTATCTAACGTAAACGTAGCATaact
ctacggcaatgaattttaaagttttcgTAGATATCGAGCCTGTTTAAGAC
AACTTTTGGTGTTTAAATTGAATTAAAGGCTGGGAAATGTTTACCAGATA
GGCATATCAAATAATTTTactttcagctcaaaaaatatAGGTGTAACGGC
GTAACCGTTTTGCGGTAATATTATAGGAATATGTAGTGACGTAACTACTC
TCCCTTTATTGTTTCAGGTACGGTCGATCGAGCACCGACAAGTCTTCATG
ATTCACTTGTGTTCCCTTCAACTGCAAATGATTTTACTTCAAAATTAGAA
TACGCTTATTCAAAGAGTGGACAAGACTTGAAAGTCTTACAAAAAGAAGT
AGAAGAAAGACGATCGAAGCTTGTACGTAGTCCACTTTACGGCGAAGATC
AATCGTGTAAGAATAATAATCGAATCGCTGGACTTACCAAATTGTTTGAT
GCATGGGCACATATGGCAAAATTGTTTAATATTCGATATTTTATCGTATA
TGGATCGCTGATCGGAGCGGAGAGAGATCGTAAGTATTCTTTAACCTGAA
CTGAAAATATTCGGTATTGAAGTAACTGTAACTTATTTATCTAAGAGCGA
CACGAAAAATTTTAGTACAAATCTTTTATcgcgtcatccagtctatcaaa
aagctttaagtggaccccgggctaatcATGAATACAATAGACCACTAAAG
AATCAACCAGAGCAACGTATTTCAACTGTATTGGACCACTTACATTACAA
CCAGTTAATAAAGCTTTGTAtggcaattttgttttgatgatgagCGCATG
GAGGAAGTCAAGAAAGAATTCTGGACAAAGAAGCTTCAAATAAGGCTCTA
TAATcgttaaaatcttaaaatatataGTTTGGTTgatagacaggagaccc
gttctgtatttttttataatcttctatatacaggacgggtatgacctaTG
AGgaagatttctgcctcaaaaaatttatagcgggaaattcgaatttagcg
ctgtcctcacttactaaaataaaaaccaaatttagGACCTTGCGCTTTCT
CTATGAATGTGACCAGTAACAGAATAACAAATTTTGATtagctgtgtttt
caaccgtcattTGGATCTAAGAAATTCAAACTCctagcccataccatgct
atgtATTTCGCtatcagtatataaaataagaaatcatagcatggatctcc
aggctaagaTATCTAATATTCTAAATTCCTAAATATAATTTCCATTATTA
CTACAGGTAACATCGTCCCGTATGATTTAGACGACGACGTTATGATGTCA
GAAGATGAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000080_pilon:401075..411033+ >XLOC_037460 ID=XLOC_037460|Name=XLOC_037460|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1368bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080_pilon:401075..411033+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CGACAAACGATGcacttttttaaatacttttccCCTCTAAGTAATACATG GTTGTTTCTTGATGATTTAAGAGAAGAGAAACAAGAAACAGAGGGAAGGA AATTGGTAGAAAAGATGTTGCgaccaaaaaaatttattggtaTTGCCATA TTGTTATTATTGggattttatcatattttttacaCTGGTGCTAATGTTGA TTTGACTCTATTCAAAACTTCCAAAGCAATAAAAAATGTGAAGTTCGTTG AAAAAGAACGAATACACGAGTCATACAAGGCAAAAAAGAAGATTGTTAAT GAAGTTGCTGCAAAGAAAGCGACAAACGATGcacttttttaaatactttt ccCCTCTAAGTAATACATGGTTGTTTCTTGATGATTTAAGAGAAGAGAAA CAAGAAACAGAGGGAAGGAAATTGGTAGAAAAGATGTTGCgaccaaaaaa atttattggtaTTGCCATATTGTTATTATTGggattttatcatatttttt acaCTGGTGCTAATGTTGATTTGACTCTATTCAAAACTTCCAAAGCAATA AAAAATGTGAAGTTCGTTGAAAAAGAACGAATACACGAGTCATACAAGGC AAAAAAGAAGATTGTTAATGAAGTTGCTGCAAAGAAAGGTACGGTCGATC GAGCACCGACAAGTCTTCATGATTCACTTGTGTTCCCTTCAACTGCAAAT GATTTTACTTCAAAATTAGAATACGCTTATTCAAAGAGTGGACAAGACTT GAAAGTCTTACAAAAAGAAGTAGAAGAAAGACGATCGAAGCTTGTACGTA GTCCACTTTACGGCGAAGATCAATCGTGTAAGAATAATAATCGAATCGCT GGACTTACCAAATTGTTTGATGCATGGGCACATATGGCAAAATTGTTTAA TATTCGATATTTTATCGTATATGGATCGCTGATCGGAGCGGAGAGAGATC GTACGGTCGATCGAGCACCGACAAGTCTTCATGATTCACTTGTGTTCCCT TCAACTGCAAATGATTTTACTTCAAAATTAGAATACGCTTATTCAAAGAG TGGACAAGACTTGAAAGTCTTACAAAAAGAAGTAGAAGAAAGACGATCGA AGCTTGTACGTAGTCCACTTTACGGCGAAGATCAATCGTGTAAGAATAAT AATCGAATCGCTGGACTTACCAAATTGTTTGATGCATGGGCACATATGGC AAAATTGTTTAATATTCGATATTTTATCGTATATGGATCGCTGATCGGAG CGGAGAGAGATCGTAACATCGTCCCGTATGATTTAGACGACGACGTTATG ATGTCAGAAGATGAGGTAACATCGTCCCGTATGATTTAGACGACGACGTT ATGATGTCAGAAGATGAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000080_pilon | genome | sc0000080_pilon:401075..411033 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 634-684:9909 |
| Aaloc | 322-630:8870 |
| Aaloc | 1-318:1 |
|