XLOC_037449 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037449
Unique NameXLOC_037449
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:2689752..2699956-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037449 ID=XLOC_037449|Name=XLOC_037449|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10205bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2689752..2699956- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATAGGGATAATACAACACGAGATATTACACGCTTTGGGCTTCAATCATGA ACAATCACGAACGGACAGAGATAACTTTGTTGAAATTCAATGGGAAAATA TCCAGGCTGGTAAGATTTAAATTTTTTCAATCGTACCATATGCTCAAATA TTTTCGTGTTGGTTAAAATTTAAATGATTGAGGGAGAAATGTTTGTCGAA ACTTAGTCAGTCATTATAAAAAATCCCAGTCTGGTAATGTACAGGGTGTC CCTAATTACAGTATCGAGTTTGAACATGCGATTGAGTAGAAAAGTTTGTG TGTGTTATCGCTAAAATATAAGAACGTTCTCCATCACACAGGCTTATTAC AAAAGGTAGTTACAACGTATAAATTAATCGTAATGACAAAGAAAAAAGAG GGAGAGCTTAAAATACAATTTTGTGAACACGCACATAAAACTTTCTACTC ATAGTTGTGTTTCGACTCGATACTTTAATTAGAGACACCCTGTATTGTTT TAGCTTTTTTGTTCAATTTTCTTTCGTTACAAACAAAAGACAAGTTGCGA TTTGCATACTTTTTGATCAGGTTACCAAATTCTCCTCATGGGATTGGTCT AATTTCTAATCACATGATCAAAAAGTTTGAAAACTAAATCGATTTTGGTA CGTAAACTCCATCCTTTAACAATAAAAAGAGACAAAAGCCTTCCCGACCA GTGTTTTTTTAATGACTATGGACGAATAAACATACAGGATGTCCCGAAAA ACAATATCGAGTCGTACCACTTCTATAGACACATATACAGGGTGTCCCTA ATTAAAGTATCGAATTTGAACATGTGATTGAGTAGAAAATTCTGTGTGTG TTATCGCTAAAATATAAGAACGTTCTCCATCACACAGGCTTATTACAAAA GGTAGTTACAACGTATAAATTAATCGTAATGACAAAGAAAAAAGAGGGAG 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ATAAAACACTCATGATGTTCAAAGGGATGCGGAACATTGCGCCAAAATAT TTGTGTGATCGGGTAAAGCCTGCTAGCCAGCGACATGAACGCCGCACTCG CTTTGCAAGAGAGAATAATGTCGTTGTCCCTCTTGCCAAAAACACCTTTT CTAGTCGAACGTTCATTACCTCAACCACACATCTGTGGAACAATCTACCT TTAGAGATGAAACAATGCCAATCCCTCTTATCGTTTAAAAACAAACTCAA AACTCGTATTTTCAATTAGAAATTTATTATTTATTATCTTAATCAGTTAT CGTTCCATTTATTGTTCTGTTATGTTATACAAGTGGCCCCTGGGGGAGAC AATGGCTCAGCTGCCTAAAAGCTGATTCATTATTCTATGGCCAGCCACTT AAAATATTAGTCATTATTATTATTATTATTATTATAAGGGTTAAAGAAGG TGAATAAAAAATTTGAAAATGTGATTTTGTTTGTGTTTTTCAGCTTTTTT GACTGATTTTCGCCCAATAAATGAGTATTTTTAAAAAAGAATAATTTTTG CGATTCTTTTTTAAAATACGTCGTTTTGTACATTTTTGTGCGGGTGTCAC GTGGTTTCTATAATTTTGTTAATTAATTAACGAAAGAAAAAAAAACGAGA GAAATAAATTAAAAATTTAAGTCAAGTCGACTTTAAATAAACTTATATTT CGAACTCTATAAATGAACCCCCACTTTATACAGAAGAAACAATAACATTT CGTGCTATTTCACATGAAACCATTATTGTTTGAATTAAGAGTGGGAGCAA ATTAACCCGTTTTTTTTGTCAAATTTTAAAATTAGGGTCGGCAAAATTTG CCATACTCAAATGATCGAGTCGAGTTTAAATAAAATTTTGGTTTTAACGA CGCTTTTTTTGTTGAACTAAATTCAAATTAGGAGTTTTTGCACTTTGCTG AGTTAGGCAAAAGAGCAGTTGTATAAACTACGCCTAAAAAGCTACGCCTG AGTTTATTTTCTATGATGTGATTAGAAAAGAATCCAAATTTTTATTTACA CAACAAATGATAGATCCACTATCTAAAAAAATCCCCACAAACATGAAGAA AGCAATACAGAGCTGTTAATGAAGGCCAAAAACTACCTTTCCAAAAGAAA AAGTTTAAGAACTGAACCCAAAACTAGCAAATTAATCAAAAGAAAAATAT ATAAGACAAAATCAATAGTAAAGATTATCGATGGAAATAGTTCAAAACAA ATGCTCGAATACTACCACTGTCCAAACCTAGTGTAAAAACTGCCACTTAT TACACATCCATCGACCCAATGCCACACACCTAAATAACCATTTCCATCCG ACATACACATGAAAAGACAAATCCAATAAAATGACAAATCCGATACCAAT ATTGTAAGGGTACATAAGTAGCTCAGTTTCGACCCTTGTTGCTGGACTGA CTTATGTCGAGATAAGCAGCTAAAGTAAAATGAAATTAGGATTGTAACTG CGCTAAAACTTTCAATAAAATAAAAATTCAATAAAAATAAACACACTATC ATGAGCAATCACTTGTTTCTATGGCAATATACTATAGCACTCCCTAAAGA CGCTTTCTTTTTCAGAAACAATAATAAACGTTTTGATCCAAAGTCTTGAT ATTCAAGCTGGAACTTTTTGAATTTTAGCAGAAAACAATAAAATTTTAAC GAAAAAACTGTATTTTTAGAAATTGCAAATTGTAATATCTCGACTTTGGA AAATACATTAAACAAAATTGGGTGTCTGGTATGTGGACGAGATAGAGTTT TTACAAGCTCTTATTTGATTTGGTTGGTCCATACACAGTAAAAAATTTTC GATTTCCAAGGTTGGAAATTCAATATTTTTGGGTTGGAAATTTTGGTTTT ATAATTGAAGGTTGGAAATTTGAGTGAAATTCTTCGATATCTCTTCTGTT TCGCTGTTTTCATAATCAAACATAACCTAAGGGACTCCTTTAATCTAATG AGCCTCTTCCCTGGATTAAAAATCTAACCTCCCTCGAGGCTACAGGGGTC AGTCTAATTCGCCAATCTGACGGATCTTTTGGTAGGACAAAAAACCTTGG TTCGTTAATAAAATAATAAATCTCTTCTTGTCTTCTTCTGTTCTGTTTCG TTCTCCTCCATCGCTTGATAGGTTATTCGGTCCCTATATTGTCGGCAATC GCCGTATGTTCATACGAATGAAAATGAATGTAATCGATTAATGAAGTTTA AGTACACGACCTTGCGTTGCAAATAAGATGTCAAGTCTACACCGTTCCTC CCTTTTATAACGTTTTGTACCATTTTCTGCGCATGTCCTTTGAGAAAACC ACAAGCAATTTTTCGCGCAGAACTATCGTGATAGCAAACCTAGATATTGG GCTTTAACGTGAGCAGTCAAGCTGTAAGTTTCCGTCAGGTGAAGCGTCCC TTCGGAGCGGCCTCGGTCAATCGCAGTGAGTTCGCACAGTGAAGCACATA GGGTACTTGTGTCATAGTTTCAAATGGTTCTCTCCTGAGCTGTGTGAGTA TTCTAAGATCAACCACGTATCTGTGCGAATAATAACAAGATATTGACCGG GAGCCATCGAGCCTAGGATAGCAAGTGACTGTTCACAAGAAAAACCTTGT TTAAGATCTTTCTTTCCACATATCTGTCATCACTTTTTGGATTTTGACTT TTTTTAACCTGGATTTTTGAAAATTCCAACAATTTTTAGGTTGGATTTTG GTTTTATTCAACCTGGATTTTTGAAAATTCCAAGCCATGGAAAATGCAAA ATTTCCATCCTTGGAGAGTGTCCTAAGTTTCCAGGTTGGATTTCCATTGG ATTTTATCTATTTTACAACTAAGAAATCTTGAAATCTTCAACCTTGGAAA TCGAATTTTTTTCCTGTGTTAACCAGCAATAAAGTTACTTTTTTCTAATG AACGCTTAATTTTTATTTGTAAAAAGAATAACCAGAAGCTTCATGTTTTT GATGTTTTTAATAACTATACTGTGTGTCCGGAAAAAAAAGTATCGAGTCG TAACACTTTTATAGGAAGAAAGTTCTTTTGCGTGTTTCACTAAATTTGCA ATGTTTATCAAAGTTTTTCTCTGTGTCATATTAATTGTCACGAGACATCT TTTATGGAGAACTTTTACTAAAAACAATTCTCAATAACTTTAACGTCATG AAATTGTAAAGGAAGTTAATTCTTTTTAATCATTTTTAATCAGTTTCTAC TCAGAATCATGTTCCAAATCGATACTTTCTCTCCGGACACCCTGTATATT CGACGCTCACTACAAGAGGTTATCTTCAAAGTAAAAAATCTAATAACAAA AGGAAATCTTTTAAAAACTAATTTTCAAAAATGACCAGTGAAATAGTGCT AAAAATACAATTAAAAACAATGCAATAAAACGATAGAAAATAAACCTTAG GGACTAAAATGATTGAAACGTGCAAATAAGAAAGTATCGAAAAGTAATAA TACAAAAAAAGCAAAAAAAGTTGCAAAAAAGAATATGTCGTAAAAAGCTG TATTGTTTTAAACAAATTCTGTACATTAAGTGTAGGTTTCTGATCGATGA TTAAAAAAGGTTCAGTCATCTTTCTTATTTCATTGGGTGCTTTTTCACTA CGCTAGATAGATAAGTGGTTCTCATCGACGGTCCTTTCCATAAATTTCTA AGGATTGTAAAAAATATACAATGAAGATTCGTGCTTAACATCGGATTTTG ATCGCTTCATATCAGCATTCCATATTTAACGTCGAAAATTGGTCATTAAA CCTTTTGTCCTTCAAGAGAAGGGTAGACCTCACTTGGCTTAATGACCAAT TAAGCGAAAAAGGCAGCATAAATAAATTGGTTGCCATGAAAGTAGCAGAA TGTGCAGAGGGATTCTTTTGTAAAAAATTGGTCATGTGGGAAAAGTGTTT TCTTTCCCGATAGAGTTGAAGAGCAAACTTTCATCTGTATTGAAAATGTT CATTATAGAAGGCTGCAGTTCTAAATCCCTTGATATGCGAGTTGATGATT TTTAATAAAATTTTCTTCAAATTCAAAGGGTTGTAAACGCTTTGACAACT GTTTTGGGAGTCAGTAATGTTTTCCTACCAATTTTCTTTGTTTCAGCTAA TCGATTTTCGCCAGACAGTCTCAGTGAAAAAACACCCATTATTTTTGAAT CCCTTGGCAATTATTTTTTATTAGCTCAAATGACCAATTATTAAAGTATC TTTCTCTATCTCACCTGCTGATACGTGTGACTCACATTCTCGAAAGTCTC TCTAATAATGGCTACAAAAAACCAATTTTATCTCTAAAAGGGACCAAAAT GACTGTTAAGGGCGGAAGGGCGCCACCAAGCCGTACCTTCATTTGCCAAA AGATCATGATGTGGTGGAATTTGACAAAAAGTTTTTGGGAAAAGTCTCTC TAAGGGCCTCAAAAAAGTAAATTTTCTATTTGTGGCCCGAACACACCCGT CACTTTCGCAAAGCTAATACCTACCCTGAGTACCAGAGGCTGATTTTTCA AAGAAGATTATCAACATCTGACGACCAAGTATAATAGTTTTTATTGTAGG TTGCGGGTTGTTCTAAATCGTCTTAGCCATACTTCGTCCTCAGAAGCGTA AATACATAATCTCGGGTATGAATTTGGTATATGCTTTTCACTGTAACTAA TACCCCACCCCGAAAGAGATTTTACTCAAGACCACAGATGGTTTCTGCAA GCCAAAGATCTCAAATCATCTGATTAACCCTTTATTTATTCACCAGAAAT ACGATTATGAATCAGTGATGCATTTCTCGAATACGACGTTTTCAAAGAAT GGGAAAGAAACAATTGTAGCCGCCAAAAATGCTATTAATCCACCTGCCAC TTTTGGTCAAAGGGATCACCTAACAGAATTGGATAAAGAAGAGTTACGAG CAGTCTACGGGTAGGTGTCAGTAATTGCCATCGCAGTGAGCCTTAAGCTC TTTAGGATGGCTTTCATAGTTTCGCGCATACCCTTCGGGATAGGGGTACT AAGATTTGAGAATTTCGGATATGTGGCTGACCGAATATCCGAAAGCTGAC CCTCAGAGACCAAATTTTAGTGAAAAACTGAACTGACATTTTTGAAATAT TTTTTTAGAATTTAGAAGCCTTTTTTTTTCTTCAAAACTAAAAAAATGTT TCAAACAATTTCCATCCCGTAGAGTGGCTGATTTAATTTTTTTTGACCCT TAAATATACTTTTTGAGACGATAAAACCAATCCTTGCAGTTCGCACTTAC TCAACATCTATTTTTGCCTAACTACCCACTCCCCCCTCGGGCACGCATAA GAAAGATGGGAAAACATCGTTTTTCAGTATTAATAATATTTCATAAAAAG TGTCTCGGTAGCATTACTGTCTTAACGGTTACTCCATTACTTTTTCGGAG TTATTTTTATCTGATCACCAATGGCAAAATAGATATAGATATGAGCCCTC CGAATGCATTCGGGATGGGTCCTACCAATGAAGCAGTAGGAATCACAGCG CTGCCAAATACTGCGACTTGACAGACGCGAGCTGCCAAGCCTGGGCGTAT ACCATAACACTCGAACGAAACTGGGAGAGCGGTGCTCACGCTAGGCCGAA CCTCATGAGTGTCATGGCACGTCATAATGTCAGTCTAATCTACACACACT CTTGTATCAGAGTAATGGTACCCAATTCCCCTGACACGGCATGGGTTGAC CCAGGCGAAGGTATATTAACTTGCCAAGTTAATCGTAGAGACACGATGGG TATCGAACTCGGGCCTCCTAGGCGAGAGTCAAGTACGATAACATTATACC ACTACGACTAGCAAAAGTACTAACTAAGATAAGTGTGCACTCTTTTTTCT TTTAACTATAACTTTTGAAGGAATTCTTTAATCTTAATAGATTTGGTATC GTTGGAGAGATATTTGTCCGATGGAACAATTTGAAATAGAAATATGTCTT TAAAAAAATTCTAAAAACGAAGATGGAAAGAAGAAAAATGAAGATCTTGT AGAAAAGTGCTATAACTTTGATTTTCACTGGAGAGATTTTTTGACCTTAG GAGGTCATCACTGTGAAGTAATTTCACTAAAATATTTATTTAATATAAAG TTATGATACAAAGTTAATAAATGGTTGACCCCAAAAAACAGCAGAAAACA GCAGAAAGCAGCGTTTTTAGACGTCAATCAGCTTTGTTTGATATCTTTTG ACTGAATGGTTATTTTTGAGATATTTTTTCACAATGATGACGTTCGATGC TCAAGGATTCATTTCAGTGAAAATACTAGTTATAGCACTTTTCTACAAGA TCTTCTTTTTTTCTTCTTCGTTTTCATCTTCATTTTATTTCAAATTGTTC CACTCGTTAATATCTTTCCAATGACACCAAATTTATAAAGATTCAAGAAT TCCTTCAAATGTTATAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTAAATAGT AATTAATCCCACCTTTTATTACCACTAAATAATGAATCTAAGAAGGTGCC CTTTTATTGGTCAAGTCTCTTTATTAAAAGCAAGTACTTAGGTAAGTCAA AAATGTATGTCTCATACAATATGTGAGAATCGTTACAGTTAAACGATATC TTCAAGAAGAAGAACTAGTAAGATTTTTGCCTTCAATTTCTCATGCTTCA ATACTCTTGTCTCCCGAATAGACGTCCCTCCGCTTATTGTTAAGAGAAAA AAAATCCATCACCCCGCTCTTATTAAGACCCCTCGCTAATTAAGACCCCC CCCGCTAATTAAATTCAATCCTTTTCTATATTATTTGGAGCGTATAATTC ATTTCCAGGACAGATTTCCCTTCAAAAAGGACTTTGAAAAAACTTTTTAA GGTACTAAAAACATGAATTCTGTATTGCTAATTGTTTCAACATGGTATCC TCATGTTTATGTTTCCTAGTCAGGTTCTTACCGTAATTTTTCAAATTTAC CATTTTAAAATATAGCTGCTCAGGGTTGCCGCCTCCATCAACAACAACCA CGACGACAACAACAAAAAAACCACCAACGACTACAATAACTCAAAAACCT CCAACAACACTTTTTACAGAAGGACCGACAACAACAAAAAAACCACTGAC GACTACAATAACTCAAAAACCTCCAACAACACTTTCTACAGAAAAACCCG GAAGACCAGATGAAAATCTATTATGTAAACTTGTTACAGGTGATGTAGAC AATGGCACGGTGTGCAATGCTACAAACTTTAATACAACAAGTATCAAACG AATATATGGCGACGGTAAGTTAATATTTACACATTTCATCATTCTACGCT ACTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:2689752..2699956-

>XLOC_037449 ID=XLOC_037449|Name=XLOC_037449|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1194bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2689752..2699956- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATAGGGATAATACAACACGAGATATTACACGCTTTGGGCTTCAATCATGA
ACAATCACGAACGGACAGAGATAACTTTGTTGAAATTCAATGGGAAAATA
TCCAGGCTGATAGGGATAATACAACACGAGATATTACACGCTTTGGGCTT
CAATCATGAACAATCACGAACGGACAGAGATAACTTTGTTGAAATTCAAT
GGGAAAATATCCAGGCTGGAAAGGAGAGCAACTTCAAAAAGATGAGTGAT
ATGACTTTGGTCAGCCAAAAATCGGAAAGGAGAGCAACTTCAAAAAGATG
AGTGATATGACTTTGGTCAGCCAAAAATCGAAATACGATTATGAATCAGT
GATGCATTTCTCGAATACGACGTTTTCAAAGAATGGGAAAGAAACAATTG
TAGCCGCCAAAAATGCTATTAATCCACCTGCCACTTTTGGTCAAAGGGAT
CACCTAACAGAATTGGATAAAGAAGAGTTACGAGCAGTCTACGGAAATAC
GATTATGAATCAGTGATGCATTTCTCGAATACGACGTTTTCAAAGAATGG
GAAAGAAACAATTGTAGCCGCCAAAAATGCTATTAATCCACCTGCCACTT
TTGGTCAAAGGGATCACCTAACAGAATTGGATAAAGAAGAGTTACGAGCA
GTCTACGGCTGCTCAGGGTTGCCGCCTCCATCAACAACAACCACGACGAC
AACAACAAAAAAACCACCAACGACTACAATAACTCAAAAACCTCCAACAA
CACTTTTTACAGCTGCTCAGGGTTGCCGCCTCCATCAACAACAACCACGA
CGACAACAACAAAAAAACCACCAACGACTACAATAACTCAAAAACCTCCA
ACAACACTTTTTACAGAAAAACCCGGAAGACCAGATGAAAATCTATTATG
TAAACTTGTTACAGGTGATGTAGACAATGGCACGGTGTGCAATGCTACAA
ACTTTAATACAACAAGTATCAAACGAATATATGGCGACGGTAAGTTAATA
TTTACACATTTCATCATTCTACGCTACTGAAAAAACCCGGAAGACCAGAT
GAAAATCTATTATGTAAACTTGTTACAGGTGATGTAGACAATGGCACGGT
GTGCAATGCTACAAACTTTAATACAACAAGTATCAAACGAATATATGGCG
ACGGTAAGTTAATATTTACACATTTCATCATTCTACGCTACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037449XLOC_037449-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005_pilongenomesc0000005_pilon:2689752..2699956 -
Properties
Property NameValue
Aaloc436-597:163
Aaloc331-432:340
Aaloc166-327:2560
Aaloc112-165:8855
Aaloc1-108:10206