XLOC_037407 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037407
Unique NameXLOC_037407
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000216_pilon:325565..338831-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037407 ID=XLOC_037407|Name=XLOC_037407|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13267bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:325565..338831- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACACAGGTTGTAGTAGCGAAAGGAGGGAACATGGCACGCATGGGAAATC GTGTTGCACAAGTGGCCAATGCGGAAGCTGAAAACTCGGAAGATCCTGAA TTCAAACATGCTGTGTCTTCTGCCGCCGTTGGTGTTTCTGATAGTAAGTC TGTAGAAAAAAACCTTTTTATAGAGGTGTGATTATTGTTAGAAGATCGAC AAAAAGTCGGACAGAATCCTTCTTTTTCCTGGAAAAAATGACTGGACTGA AAGGATGTATTTTTGTGCATTTTTTCGTCTTAGAAGCAAAGCTATCATCT TTGCGTTATTTATGCCTTGCTTCCCAGTTGGCCAAGAAAGCTGTTTATAT CCTGCTCCTCATCAGCTAGTAATCTCTTCATATTGTGGCTATTTCTCAAG ATATTTAATTATTTCGTTTTCAGGCATCAAACCTTTGGTAGCATCAACAA AGAACGTCGCGTTGAACCCAAGACATCAGCCTATTCAAATTGAATTTAAG CAAACTAGCGAAGGTGTAAGTACTTTATTTTTGCTAGACATAAGTATCAT CTGGGTAATTGGTCAGATTCCATTTAAATGAATATTTAAAAAATGATTTT TGCTACATTGTAATATCAGAACCCTGTATTCACTTTCAATTATTTCCTTC AAAACTCTAGTTAATCGGTCGTGTCGTTGATGTTCGCAACGCCCTAGAGC CGCCACCACCACGTGAACCCACCCCGCCTCCACCACCACCACCCGCACCA GAACTTGATTTTGAAGTACCTGATATTTCTGATATCAAATTACAGGATGG TAAGTGTTTTAGAGAATTGTATTTCGAGCTTATAATTTTCACCTTTCTCT TATCGGCTAAGTTCAGCAATCTTGAATTGACGTTTTCTCATTGGTAACTC ATCAATAACTGCATTTTAGTAGCTCTTGTCTGTCTTTTTTACCCATATAT 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ATGGAAATGAACTTATCCAATTGGCACGACAAATGGCTCTCTTGTTCGCC AAAATGTCTAAATTTATCACGTAAGTAACCTCTTTCTCATTTTTCAAATG TTCTGAAAAGTTCACATTGTTTTTCTTCGGTAAAAATTGTTAGATTTGTT AGCAGCTGAACTCTCTTTTGTGCTGTTAAAAAGTTATCACACTGTGTATT ATAAGCTCCTCTTCATGTCCTAAAAAGCGAAATATTTCGGTTCCAAGAGG TAAATTCGGTATTTGCAACATATTAATTTACAACGGACTAGAAGCACGTC GAACAAAGGTTGCGCGTGTGATTTGTTTTTGTGTAATTTTTGATAGTGTC GATTGCCTCAATGTGACATATGGGTTTTATTTTACAAAAATTAAAACGAA ACGGGTACACGACTGTGGACTGTTGGAGATTAAAAGTTGAGTGCAGAAAA TGACTGTGGGCTGTTGGAGCTTAAAAGTTGAGTGCAGAAAAATGTCAAGA ATTGTTACAAGATTTACAAGTTTTACGAAAATTAGATTTGCAGAAAGCTT CATGGAAAAGGTCAGTAGATTCTTATTTTACCAGAATGAATTAGATTATT CCAAATGGTTCAGTTTTTCTAGATTACTTTTCTTAATAACATATAGGAAA GTAGGACAAAGATAGCAAGTCAGGAAATACTTTATGAGGAGAGTCGTTAT TTATCGAGATAATAATAATTATGTCCAAAGGTTTTGATAACGGTCCTTTC TTTTTGTTACAGAGATGAAGAATATTTTCTCACGCAACCCAAAAAGATGT TGATCGACACAGCAAAACAAATCGCAAAAGTCAGTTCCGAATTCAGCAAG AAAGCAAGAGAAATCAGTCATCAATGTCCTGATAAACGAATGAAACATGT AAGTAATGAATGCCAAAATAAAAATTCATGAGTTTTTTTAAGCTAAAGAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000216_pilon:325565..338831-

>XLOC_037407 ID=XLOC_037407|Name=XLOC_037407|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5850bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000216_pilon:325565..338831- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCTGTCTTTCATACAAAGACGATAGAATCTATCCTTGAACCAGTTGC
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AGACACAGTAGCAAAAGCCAATGATGATATCTTCCGACGTGAAATGCCAC
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CAACTCTTAACACAAGATGTACAATCCAAACGAGGGCAAGCACTATTAAT
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ATCTTCCGACGTGAAATGCCACCAACTTTTGTTAAAGTTGAACAAGCTTC
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AATGGTATCTTGAATGGTACATCTGCACTTTTGCTAACATTCGATGATCA
TGAAGTCCGCAAAATCTTAAAGAAATGCAGGAACGTCTTAGACTACATTC
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AACTTGTCACCTGGACTTTTACAAATGGCAAAAGCTGTTGATAACCGTAT
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AGAAAATGAAGCTGGCTAAAGAATGGTTGGCAAACCCTGATGGTGAAGCG
AATGGTCTGGGTGAAAGAGCTATCAGAGATATTATCAAGCAAGCCAGGCA
AGTTGGTATGCTTGCAAACGATCAGAAGATCAAAGATTTGTGCGATGACC
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AGCTGCAACTACCTCTGGTCAATTCGAGCAAGCATTGAACTGGATTGATG
ACCCAAGATATAATCCAAACTCAGTTGGCAAACGAGCCATTGATGCTCTT
CTGGCTGATGGCAGAAGACTTGCTGAGAATCTGTCAGGACCAGAGAAACA
AGAACTTTTGGATACCATGGCTAATATTGAACGATTGACAAAACAATTAG
AGGACCTCAAACGAGCTGGAAAAGGCAACACTCCAGAGGCTCTGGCTCTA
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TGCCATCAAAAGAGAGGTAGCTGCTGGAAACCGTCTTCCAGCTGCAACTA
CCTCTGGTCAATTCGAGCAAGCATTGAACTGGATTGATGACCCAAGATAT
AATCCAAACTCAGTTGGCAAACGAGCCATTGATGCTCTTCTGGCTGATGG
CAGAAGACTTGCTGAGAATCTGTCAGGACCAGAGAAACAAGAACTTTTGG
ATACCATGGCTAATATTGAACGATTGACAAAACAATTAGAGGACCTCAAA
CGAGCTGGAAAAGGCAACACACCAGAAGCACAAAGAATTGCTGCAGAACT
AAAAAGAGAATTGGAGAAATTAAAAGGCATTCTCCAACGCGGAGCTGTAC
GCGGTGTTGTTGATAATTTTAAAGATATCTTGTCACCCATCAAGCAACTT
GCTAAAGCCGCCAAGGCCCCTGTCGGGCAACACACCAGAAGCACAAAGAA
TTGCTGCAGAACTAAAAAGAGAATTGGAGAAATTAAAAGGCATTCTCCAA
CGCGGAGCTGTACGCGGTGTTGTTGATAATTTTAAAGATATCTTGTCACC
CATCAAGCAACTTGCTAAAGCCGCCAAGGCCCCTGTCGACACACCGAATC
GTGAACAAGACTTTGAAGAGAAGGCTGGTGCATTTGAATACCATACAAGC
AAAATGGTTGACAGCGCTGAGCAAACAGCCATTCACGGCAAACATGCTAC
GAAACAACTCGTCGATAATATTCATACTGCCACTAAAGAGACACACCGAA
TCGTGAACAAGACTTTGAAGAGAAGGCTGGTGCATTTGAATACCATACAA
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ACGAAACAACTCGTCGATAATATTCATACTGCCACTAAAGAGCTTGCTGA
ACTGACACCTCAAGTTTCACACGCTGGTAAACTCCTCTTGTTGAACCCAG
GGGACAAAGTCATCGAAGCTAATTTTGATATGTTAAAACAAAAATGGGAG
AACAAAGCTGAGGAAGTGATGGGGCTCGTTGACGCCGCCACCGACGCTGC
TGATTTCGTTAAGGCCACTGAAGATGCAATGCGAGCTGAACAGAAAGTTG
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CAAGTTTCACACGCTGGTAAACTCCTCTTGTTGAACCCAGGGGACAAAGT
CATCGAAGCTAATTTTGATATGTTAAAACAAAAATGGGAGAACAAAGCTG
AGGAAGTGATGGGGCTCGTTGACGCCGCCACCGACGCTGCTGATTTCGTT
AAGGCCACTGAAGATGCAATGCGAGCTGAACAGAAAGTTGCTTTTGACGG
ACTTCAGAAAGAAAACCCAGCTGTTGTAGTAGCGAAAGGAGGGAACATGG
CACGCATGGGAAATCGTGTTGCACAAGTGGCCAATGCGGAAGCTGAAAAC
TCGGAAGATCCTGAATTCAAACATGCTGTGTCTTCTGCCGCCGTTGGTGT
TTCTGATAGTTGTAGTAGCGAAAGGAGGGAACATGGCACGCATGGGAAAT
CGTGTTGCACAAGTGGCCAATGCGGAAGCTGAAAACTCGGAAGATCCTGA
ATTCAAACATGCTGTGTCTTCTGCCGCCGTTGGTGTTTCTGATAGCATCA
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TATCAAATTACAGGATGTTAATCGGTCGTGTCGTTGATGTTCGCAACGCC
CTAGAGCCGCCACCACCACGTGAACCCACCCCGCCTCCACCACCACCACC
CGCACCAGAACTTGATTTTGAAGTACCTGATATTTCTGATATCAAATTAC
AGGATGAGGGCCCAGCACGTCCACCACCACCTGTTGTCGAAGGGATCATC
AATGCTGACGAATCCAGGGAATTACATTCTATGCTCGAAAGTGCTCCTGA
TGCTGACAACCGAATGGCAAGGGCCCAGCACGTCCACCACCACCTGTTGT
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GGCACGACAAATGGCTCTCTTGTTCGCCAAAATGTCTAAATTTATCACTT
TGCTGCTCATCAGCTACACGTTGAAGCCAACAAGTGGGAGGAAGATGGAA
ATGAACTTATCCAATTGGCACGACAAATGGCTCTCTTGTTCGCCAAAATG
TCTAAATTTATCACAGATGAAGAATATTTTCTCACGCAACCCAAAAAGAT
GTTGATCGACACAGCAAAACAAATCGCAAAAGTCAGTTCCGAATTCAGCA
AGAAAGCAAGAGAAATCAGTCATCAATGTCCTGATAAACGAATGAAACAT
AGATGAAGAATATTTTCTCACGCAACCCAAAAAGATGTTGATCGACACAG
CAAAACAAATCGCAAAAGTCAGTTCCGAATTCAGCAAGAAAGCAAGAGAA
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AAAGGTGGAAGAGAGACACATCTGCATTGTATTCGTACCAACTGGATAAA
AGGTACTAAATCCACAAGCTGATTTTGAAGCAACTGAAATGTTGGTCGGA
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037407XLOC_037407-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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