XLOC_037352 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037352
Unique NameXLOC_037352
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000064_pilon:793871..807975-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037352 ID=XLOC_037352|Name=XLOC_037352|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14105bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:793871..807975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTACACGAAATCCATACTGGTAAGGGGAACGTACAATAAGGTACAAGGGG AAAGTACAATAAGGAACACAGGAAACCTACAGGGAACGTACAATAAGGTA TATACACGGGGAACATACAATAAGGTACAGGGGAACGTACAATAAGGTAC ATGGGGTACGTATGTATACGGGGAACTGCACAATAAGATACACTGGAACG TAAATAAGATACACATGGAGCGTACAAAAAGGTACCCAGGAACACACAAA AAGGACCAACAGAGAGCGTACAAAAGGTACCCTGAAAGCATTCAAAAAGG ACCATGGGTAGTGTACAAAAAGGAAAACGTACCAAAGGATCCCAGAGAGC GCACAAAAGATACAAGGGAGGGGAGCATACAAAAAGGTAAACAGGGAGTA AAAGCATATATTATGATCTAGTTTTCTTTTTAGCATCTGGCATCAAGGCT AAAAATGGGGCACTGAGAAGAGTGCAAGCTTTTCCAAGTTTTGACGGTTC TAGACAATATATACATGATGGAAATCAGAAAGAAATTTATGCTCACCTTC TTCTCAAGTCAAGATAGGAATGGATTGGATTTCCATGTGTTTCAGCTTCT TTCTCCACCCTTCTTCTTCTCCTTATGGGAAAAACAACAAATACAGCACA CAGAGGCAGTCCTCTGAGCTTTACACACAATCATTTGTTTTATGAAAAGC TGGTAAAAACCACAGATATCTGTAAAGCCCGAAGGGCTAGATTTGCGGCT TTTATCAAAAAGTGAAGCTCATCTTTGGAAGGATTTCCTACCAGAGTCAC GTGACTAAAATATGCAATTTCACCGGCTTGAGAGATGTGAAATAGCGTTT GTCCCCTACGTTTTTTGATCTCGCGCTCCGAAAACAATTAAAATGCTAGA TCCTATCCATCGGCACGAAATTTAAAAAGTCAAATTTTTGCTTCACTTTT TTTTGCTGGAGAAAGCTTAAAGTTGCAAATCTAGCCCTTCGGGCTTAGAT ATCTGTGGTAAAAACCCCTGCAAAGGATACTATTTTTTTCCCCGCTAAAT CTTCGCGACGATTTTTAGTCACGTGACTGAAGAGCCTAGTCATAATGTGC AGCACGAATATAGAAAACATTAACATCGAAAATGGAAGAAACGGAAAAAG GCCGTTTTAATAAATATTCCCCTATAGTAGGGAAATATTTAAAAATGTAC ATGTTTAAAATATACGTAGTAGAATGTAAAAAATGAAACACAACTATTAA TCGCCTTACTTCTTGAGACACTTATTTCGATCTTAGATGTAATTTCAGAG TTACACTGCCTTTTCTGAAAAAAAAAAGCAAACAAAAAAAACAAAGGAAA TTTGTCCTGAGTTTTCCGATCTTATTACTTATGTTTGAATGAGTTTGGTA TTTTTCTATTAACAAAAGATGATATTTCTGCCAGCTTAAAAACTCCAATA CCTTATCATCTCCGGTCCTTCCTATCTATAATAAAAATATAAAAAATTCT CTAATTTAAATACCTTAAGGGAAGAAATTTTCGCGGTGTTTATTAAGGGC GTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAAGGTGTCTC TGTGTGGGCCATCTGTATAGACTCTATGGTGGTGGGTGTGAAAGGCGTGA ATGGGTGTTTATTAAGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGT TCCAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATTATAGACTCTATG GTGGTGGGTGTGAAAGGCGTGGATGGGCGTTTTAATAACTGTTCTAGTGT TCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGAC TCTATGGTGGTGGGTGTGAAAGGCGTGTGATGGGTGTTTATTAAGGGCGT TTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTG TGTGGGCCATCTGTATAGACTCTATGGAGGTGGGTGTGAAAGGCGTGAAT GGGTGTTTATTAAGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTC CAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGACTCTGTGGTGGT GGGTGTGAAAGGCGTGGATTGGCGTTTATTAAGGGCGTTTTATTAACTGT TCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCT GTATAGACTCTGTGGTGGTGGGTGTGAAAGCGTGAATGGGTGTTTATTAA GGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTG TCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGACTCTGTGGTGGTGGGTGTGAAAGGC GTGGATTGGCGTTTATTAAGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAG CTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGACTCTGT GGTGGCGGGCGTGAAAGGCGTGGATGGGTGTTTTTAAGGGCGTTTTATTA ACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGC CATCTGTATAGACTCTATGGTGGTGGGTGTGAAAGGCGTGAATGGGTGTT TATTAAGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGC AGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATACACTCTGTGGTGGTGGGTGTG AAAGGCGTGAATGGGTGTTTATTAAGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTG TTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGA CTCTGTGGTGGTGGGTGTGAAAGGCGTAGATTGGCGTTTATTAAGGGCGT TTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTG TGTGGGCCATCTGTATAGACTCTGTGGTGGTGGGTGTGAAAGGCGTGGAT TGGCGTTTATTAAGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTC CAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGACTCTGTGGTGGT GGGTGTGAAAGGTGTGAATGGGTGTTTATTAAGGGCGTTTTATTAACTGT TCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCT GTATAGACTCTGTGGCGGTGGGTGTGAAAGGCGTGGATTGGCGTTTATTA AGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAATTGCAGGGT GTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGACTCTATGGTGGCGGGCGTGAAAGG CGTGGATGGGTGTTTTTTAAGGGCGTTTTATTAACTGTTCTAGTGTTCCA GCTGTTCCAATAGCAGGGTGTCTCTGTGTGGGCCATCTGTATAGACTCTA TGGTGGTGGGTGTGAAAGGCGTGAATGGGTGTTTATTAAGGGCGTTTTAT TAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCGATTGCAGGGTGTCTCTGTGTGG GCCATCTCTATTATAGACTCTATGGTGGTGGGTGTGAAAGGCGTGGATGG GCGTTTTGATAACTGTTCTAGTGTTCCAGCTGTTCCAGCTGTTCCAATTG CAGGGTATCTCTGTGTGGCCATCTGTATAGACTCTATGGTGGTGGGTGTG AAAGGCGTGAATGGGTGTTCTCAACTTCAGTTGAGCTATAATCTGAGAAT GTCTGTATGTCTGTCTGTATGTATGTCCGTCCGAAAACTTTAGGGCAGGC TGGACACTTCAAAAAAGGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTGTTC 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CCAGAAAACGTTAAAGTGATGTATGTAGTTATGAATAGTGTTTGTTAGGA GAAATATAATCTCATAACAGATCATCCATTCTGCGCATAACACGCTCTGC CCTTAAGAGATATGGTAAATGTGGCAACCTTACCTGGTTGCTCAGCCAAA ACAATCAAAACCGTGTTGCTTTTTTCTTGGAAGCGAATATGACAGCGCAA GCGACTGGGTTCTAATGTTTAAGTTTAAGTTTATGATTGGCTTTTGATCT TGGTACGATTGTTTTGCCTAAGACAAACATTTAATATTCATCCCAAAACT GGATGAAAAAGATCAAAGCGGTGTGTCAACCTGAGCAGATTCTCTTTTAA GGCCGGTCTCTACTTGCGCGCTGCGATCGCACTTTTTCGAGCAAAGCTAC CAAGCTATTTTGGTCGAAAGGAAAATGAAGCAATTCCGTTGGCGCGATCT GACGTAACGGTTGAGAAAAGTTGAAATGTGTTCAACTTTTTTTTTCGAGC GCGCGCTACATTTTTATGACGTAATCTTTTTTCCAAGCAAAAAGGATTGG CGCCAAAAGGTGCGATTGCAACGCGCGCAAGTGGAGGCCGGCCTTTGGAT ACGTAATATGCGTGGATCATCAGAATCTTCTTGGAGATTAGGAGAGTTAC CGTAGAAAACTTCTTTTTTTCTTCTCTAGATTGCAAGGAAACCATTGAAA GCTTTGTGTGATTTTCAAATCCAACATGGCGCACAAATCCATGAGAGTAA GGAATCCCTGGCAAGGAAAGGCATCAAATACCGAATATTTGAGAAGAAGT TTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000064_pilon:793871..807975-

>XLOC_037352 ID=XLOC_037352|Name=XLOC_037352|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:793871..807975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGTAGCAGGAAATTATATGGAAGAAGATTGTGGGAACGATCCACA
TTATTTATTCCCTTTCCAAGAGATTGATGAAATTGAGCAGATCACGGTTA
AAAGACCTAATTGTTTACGTTGTAAACGACCTGAGCGTGTTTGTGTTTGC
TTTGCTTTTCCAAAAGTTCCAGTACCAATTACAACTACATTGCATATCTT
ACAACATCCTAGAGAGATGGTTGTAGCAGGAAATTATATGGAAGAAGATT
GTGGGAACGATCCACATTATTTATTCCCTTTCCAAGAGATTGATGAAATT
GAGCAGATCACGGTTAAAAGACCTAATTGTTTACGTTGTAAACGACCTGA
GCGTGTTTGTGTTTGCTTTGCTTTTCCAAAAGTTCCAGTACCAATTACAA
CTACATTGCATATCTTACAACATCCTAGAGAGCAAGATTTTCGTCAGCTA
ACCACTGTTCCTCTGTTACAAGAATGTATTCCCAAAGATAAATGTGTCAT
CTACCGTGGTAAAAGATTTCCAAAGTCTAAATTTGCCAAGTTACACGAAG
TCTGTGCGCAGACGAACACAGCTGTTCTTTATCCAGCAAAAGATGCAAGA
TTTTCGTCAGCTAACCACTGTTCCTCTGTTACAAGAATGTATTCCCAAAG
ATAAATGTGTCATCTACCGTGGTAAAAGATTTCCAAAGTCTAAATTTGCC
AAGTTACACGAAGTCTGTGCGCAGACGAACACAGCTGTTCTTTATCCAGC
AAAAGATGCTGTGGACATTAAAGATTTCGTAGCACAACTAGACGGTGAGC
CTCTCCAATTGATCGTCTTGGATGGAACGTGGCAAGAAGCCAGAGCTATC
GGACACAATTGTTCAGCACTCTTAAAAGGCATTCCCAAAGTGAAAATAAC
TGGCTCATGGCGTAGTGAATTTGTCATCAAAACACAGCCCACTGATGAAA
GTGTTTCAACGTTGGAAGCAGTGGCCATTGCATTGTCACAGATTGAACAA
ATACCTGATTTCATTACTCTGTGGACATTAAAGATTTCGTAGCACAACTA
GACGGTGAGCCTCTCCAATTGATCGTCTTGGATGGAACGTGGCAAGAAGC
CAGAGCTATCGGACACAATTGTTCAGCACTCTTAAAAGGCATTCCCAAAG
TGAAAATAACTGGCTCATGGCGTAGTGAATTTGTCATCAAAACACAGCCC
ACTGATGAAAGTGTTTCAACGTTGGAAGCAGTGGCCATTGCATTGTCACA
GATTGAACAAATACCTGATTTCATTACTATTGCAAGGAAACCATTGAAAG
CTTTGTGTGATTTTCAAATCCAACATGGCGCACAAATCCATGAGAGTAAG
GAATCCCTGGCAAGGAAAGGCATCAAATACCGAATATTTGAGAAGAAGTT
TTAAATTGCAAGGAAACCATTGAAAGCTTTGTGTGATTTTCAAATCCAAC
ATGGCGCACAAATCCATGAGAGTAAGGAATCCCTGGCAAGGAAAGGCATC
AAATACCGAATATTTGAGAAGAAGTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037352XLOC_037352-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000064_pilongenomesc0000064_pilon:793871..807975 -
Properties
Property NameValue
Aaloc640-765:127
Aaloc382-639:1496
Aaloc217-378:13119
Aaloc1-216:14106