XLOC_037322 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037322
Unique NameXLOC_037322
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000018_pilon:382049..383965-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037322 ID=XLOC_037322|Name=XLOC_037322|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1917bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:382049..383965- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAAGAGCTTCAAAGTACAAAAAAGACAATAACAGCAGCAACATTTCC ACCTACCACATTTCCACCTACCACAACTACACCTCCACAGCTTACCACAA CCACAACAACCTGGAACTGGCCTACTAAAAGTACAACAACCAAGTTTCAG CGTACAACAACCACGCCTCTGCCTACAACAACTGCAAAAACAACGCTTAA GCCTACAACAACTACAACAAACACTTCCCCGCCTACCACAACAACTACAA CATACACTTCCCCGCCTACTACAACAACAACAACCACGCCTCAGTCTACC ACAACTACTACAACTACGCCTCCGCCTACAACAACTACGACAACCACGCC TCCGCCTACTACAACTACAACAACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTA ATACAACTACAACAACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTAATACAACT ACAACAACAACCCCTCCGCCTACCACAACTACAACAACCACCTCTCCGCT TACTACAACAACAACAACCACGCCTCCGCCTACCACGACTACAACAACAA CGACGCCCCCGCCTACCACAACTACGACAACCACCCCTCCGCCTACTACA ACAACAACTACAACAACCACGCCTCTGCTTACCACAACTACAACAACAAC GCCTCCGCCTACTACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTGCCACAACTA CGACATCCACCCCTCCGCCTACTACTACAACAACAACTACAACAACCACG CCTCTGCTTACCACAACTACAACAACAACGCCTCCGCCTACTACAACTAC AACAACCACGTCTCCGCCTACCACAACTACAACAACCACCCCTCTGCCTA CTACAACTACTACTACAACCACGCCCCCGCCTACCACAACTACGACAACC ACTCCACCGCCTACTACAACAACAACAACCACGCCTCCGCCTACCACAAC TACAACAACCACGCCCCCGCCTACCACAACTACGACAACCACGCCTCCGC CTACCACAACTACAACAACCACTCCACCGCCTACTACAACAACAACAACC ACGCCTCCGCCTACCACAACTACAACAACCACGCCCCCGCCTACCACAAC TACAACAACCACGCCTCCGCTTACCACAACTACAACAACCACCTCTCCGC CTACTACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTACTACAACTACTACAACA ACCACGCCCCTGCCTACAACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTACTAC AACTACAACAACTACTCCTCCGCCTACCACAACAACTACAACCACTCCTC CGCCTACTACAACAACTACAACAACTACAACAACAACCCCTCCGCCTACC ACAACTACAACAACAACGACGCCCCCGCCTACTACAACTACAACAACCAC CCCTCCGCCTACTACAACAACAACTACAACAACCACCCCTCCGCCTACTA CAACTACAACAACCACCCCTCCGCCTACTACAACTACAACAACCACCCCT CCGCCTACTACAACTACAACAACCACCCCTCCGCCTACTACAACTACAAC AACCATCCCTATGCCTACCACAACTACAACAACTACGCCTCCGCCTACAA CAACTACGACAACAACGACGCCCCCGCCTACTACGACAACAACTACAACA ACCACGCCTCCACCTACTACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTACCAC AACTACGACAACCACCCCTCCGCCTACTACAACAACAACTACAACAACCA CGCCTCCGCCTACTACAACTACAACAACCACGCCTCCGCTTACCACAACT ACGACAACCACTCCGCCGCCTACTACAACAACAACAACTACAACAACCAC GCCTCCGCCTACCACAACTACGACAACCACTCCTCTGTCTACAACAAATA CAACATCATTAGGTTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000018_pilon:382049..383965-

>XLOC_037322 ID=XLOC_037322|Name=XLOC_037322|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:382049..383965- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAAGAGCTTCAAAGTACAAAAAAGACAATAACAGCAGCAACATTTCC
ACCTACCACATTTCCACCTACCACAACTACACCTCCACAGCTTACCACAA
CCACAACAACCTGGAACTGGCCTACTAAAAGTACAACAACCAAGTTTCAG
CGTACAACAACCACGCCTCTGCCTACAACAACTGCAAAAACAACGCTTAA
GCCTACAACAACTACAACAAACACTTCCCCGCCTACCACAACAACTACAA
CATACACTTCCCCGCCTACTACAACAACAACAACCACGCCTCAGTCTACC
ACAACTACTACAACTACGCCTCCGCCTACAACAACTACGACAACCACGCC
TCCGCCTACTACAAATGCAAGAGCTTCAAAGTACAAAAAAGACAATAACA
GCAGCAACATTTCCACCTACCACATTTCCACCTACCACAACTACACCTCC
ACAGCTTACCACAACCACAACAACCTGGAACTGGCCTACTAAAAGTACAA
CAACCAAGTTTCAGCGTACAACAACCACGCCTCTGCCTACAACAACTGCA
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CACAACAACTACAACATACACTTCCCCGCCTACTACAACAACAACAACCA
CGCCTCAGTCTACCACAACTACTACAACTACGCCTCCGCCTACAACAACT
ACGACAACCACGCCTCCGCCTACTACAACTACAACAACAACGCCTCCGCC
TACTACAACTACAACAACCACGTCTCCGCCTACCACAACTACAACAACCA
CCCCTCTGCCTACTACAACTACTACTACAACCACGCCCCCGCCTACCACA
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GCCTACCACAACTACAACAACCACGCCCCCGCCTACCACAACTACGACAA
CCACGCCTCCGCCTACCACAACTACAACAACAACGCCTCCGCCTACTACA
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TCCGCCTACCACAACTACAACAACCACGCCTCCACCTACTACAACTACAA
CAACCACGCCTCCGCCTACCACAACTACGACAACCACCCCTCCGCCTACT
ACAACAACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTACTACAACTACAACAAC
CACGCCTCCGCTTACCACAACTACGACAACCACTCCGCCGCCTACTACAA
CAACAACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTACCACAACTACGACAACC
ACTCCTCTGTCTACAACAAATACAACATCATTAGGTTAGCTACAACAACC
ACGCCTCCACCTACTACAACTACAACAACCACGCCTCCGCCTACCACAAC
TACGACAACCACCCCTCCGCCTACTACAACAACAACTACAACAACCACGC
CTCCGCCTACTACAACTACAACAACCACGCCTCCGCTTACCACAACTACG
ACAACCACTCCGCCGCCTACTACAACAACAACAACTACAACAACCACGCC
TCCGCCTACCACAACTACGACAACCACTCCTCTGTCTACAACAAATACAA
CATCATTAGGTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037322XLOC_037322-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000018_pilongenomesc0000018_pilon:382049..383965 -
Properties
Property NameValue
Aaloc622-894:274
Aaloc379-618:1150
Aaloc268-375:1663
Aaloc58-267:1876
Aaloc1-42:1918