XLOC_037317.2 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037317.2
Unique NameXLOC_037317.2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000008_pilon:593352..614215-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037317.2 ID=XLOC_037317.2|Name=XLOC_037317.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20864bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:593352..614215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTCGCCTTCTTTAGAAATTTTGAAATAAGGAAAATCGGGACTAAAAATT TCTCGTTGCCTTATATACTTTTACTTGAGTCCCGAATCCAATATGTTCGT AAAGTAAATCGGGACTAAAAATTTCTCGTTGCTATATATACTTTTACTTG AGTCCCGAATGCAACCTTTTCGTAGACCAATTCGGGACCGTCCCGAATCA AACCTTTATATAGACAGATTCGGGACCGTCCCGAAATTTACATTTTCAAG ACAAGCTATCATTAGCCCGTATAAATAAAGATCTGCCCCACACTTCCCTG ATTTTCAAATTCAAGCCGCCATATCCATCTTTTCAGTGACTCAGATATTA AATATGTTTTATATATACTTTTACTTGAGTCCCGAATTCAATATGTTCGT AAGGTAAATCGGGACTAAAAGTTTCTCGTTACTATATATACTTTTACTTG AGTCCCGAATTCAACCTTTTCGTAGACCAATTCGGGACCGTCCCGAATCA AACCTTTATATAGACAGATTCGGGACCGTCCCGAAATTTACATTTTCAAG ACAAGCTATAATTAGCCCGTATAAATAAAGATCTGCCCACACTTCCCTGA TTTTCAAATTCAAGCCGCCATATCCATCTTTTCAGTGACTCAGATATTAA ATATGTATTATATATACTTTTACTTGAGTCCCGAATCCAATATGTTCGTA AGGTAAATCGGGACTAAAAGTTTCTCGTTACTATATATACTTTTACTCGA GTCCCGAATTCAACCATTTCGTAGGCCAAATCGGGAATTTTAATTTAGTC CCGAATCCAAACATTTCGTACGCAAAATCGGGACTCAAGTAAAAGTATAT ATAGTAACGAGAAACTTTTAGTCCTCGTTTACTATATAATAGTATAAATC AAACCATCGATCAATTTTTTTTTTCATCGATTTCGACTTCCTAACTACGT CGTTCTAGTCTGTTCTAGTTCGGGACAGTCCCGAGCGGGACTCAAGTTAA ATTAGGCCATTAAATTTGATTGAATTCAAAGAATGAAATACTCACCAAAT ATAATACACTTAACCTTAGCCCCAAAAAAATAAATCCAGACATTCCATAA ATTTGCGACAAACTTATTTTTCCCCAGTTTTACATTGTCTCACTTTTAAA TTTCATTTTTTATTGTTTCTTACCAGGGTCATGTCTGAGGATTACATAAA CAAAGGTGGAAATGATCAAAACATTCTAAATTATTTCTCAAAACTTGAAA AAGAAATCGAATATCTAAAAGATGGCTTAGAAGGTGACCATGGCAATAGA GAGGCAATCAACACAAGCCCAGGTTTGTTTATAACCCGGGGGGCACTGAG CTTGATGGCCGACGGGGACGTGCCGCTGGACTTGGAATGAAAAAAATTAA CAAGCGGGGGGGGGGGCGTTTATTTGGAACCTAAGAGTAACAATCTAAGA TTCTGAACTATTTACTTGTTTTGAAAACTTAAACAGGATAATTCTACAGT TATAACATTTAATACAGGGTAAGAAAAAATATGGTCAAAATTTCTATGAC ATTAATTTCTCTGCAAGTAGCACAATCTTTGTCAGACCATATTATTTAAC CCATCCATGTGACTAATTTTTAGTTGGCACAACTCTCGAGCAATTACAAA ATCAATTAAAAAAATTCGAAGATAAGAACCAATACCTGGAAGATGAAATT AATCACCTTAAACGGACGCAACAAGTATCAAATAATCAAAATCAGAAGTC AAATGCACAGGTATAATGTTGTCTGTTAACAGTTCCAATATATACGGAAA TAGGGAGTGGGTACGTTTTGAGTAATCAAACTGGGGGCTGTGCTAACAAT TCAAATAATTTTCTTATATACTAGTATGCAAATTTAAAATGTAATTTAGC TTGCCCTTATGTGATAAACATCCTTTTTTAATAAGCAACTCCAATTTTCG GGTCAGGGCTGGGGTTGCTTAGCATTCTTGCTCATTTTCTGAAAAATTTG CTTTGACCCCTAATATTATACCATTTTTATGCTTATTCGGTCAATGGCTG TGGGTTGCCATGCTTAGATTATCTGAAAAGCTTTAGCTTTTCGAGATAGT GAAAACGATTTGGCTAATTGTCAGGGCTCGTGCCTTAGCAACCTGGTTGC TTATAAAAAATGTCTAATGTATCATGGAGATATTTGGTAATAGGAAAAAA TGTTATTGCATTTAAGTGACCTTTTTGATTATTTTGTTTGAGAACTTTCG TCAACTAATTTTTGATTTTACGTTTCGTGGAGATGGGGTTACACCCTTAA AATTTAGCTGGGGGATATTTTCACTAGCCCCTCCCCTCAAAAATTGCTGG GGGCTAGACCCCCTTCGTCATTTTATATTAGTCCGTTGAGTACTTATTAG AGTACTTAATCAAACTTAGTAATTAGGTTATTGCATTTCAATGGAAATTA GGTCTAGTAAACATTTTTCACACAATATTTTACATAAACTTTCTAGGAAA ATGTTGAATCGACATTGCATCCTTTTGGCTTTCACCAAGGTAACGACAAT GTTTAATTTATCAATTGGGATTCTTTCAATAAAATAGAAAAAACTGTCTA AAATTCCTAGGTTATTACTGTGCTATCCACCTCTAACTATCGACCCTATC TATCTATCATTCTTCTAACTTCCACTATAGGGCACTTGCAGAATGATCAT GTACCAATGATAAGTCACCACAAAGGTGATTTTCACGAACAGAGGCTCAT GGGAATTCGTCAAGAAACGGAATATTATCGCCAACAACTTGAGCTTGAAC AGCTAAGACAGGTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000008_pilon:593352..614215-

>XLOC_037317.2 ID=XLOC_037317.2|Name=XLOC_037317.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1746bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:593352..614215- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATGAAATCGATTTAAAGTGTGGAAGATGTAATTTGAAGTTCCACTG
CCTAGCTGCTTTGAAAAAGCACAAGAGAAACTTTTGCTCTTACCTCAATA
ATAACAATAACAACAACCAGTCTCCAACTATTCCAAAACTATCAAAAATG
GATGAAATCGATTTAAAGTGTGGAAGATGTAATTTGAAGTTCCACTGCCT
AGCTGCTTTGAAAAAGCACAAGAGAAACTTTTGCTCTTACCTCAATAATA
ACAATAACAACAACCAGTCTCCAACTATTCCAAAACTATCAAAAGATGCT
GGCAAAATTGATCAATCCCAAATATTGAGCAACAAAAACCTTAAGGAACA
AGCCTTTCAATTAGAAAAGGAAAGAAAAGGATGCTGGCAAAATTGATCAA
TCCCAAATATTGAGCAACAAAAACCTTAAGGAACAAGCCTTTCAATTAGA
AAAGGAAAGAAAAGAATTGTTGAGCCAATTAAAATTGCTTGGGGGAGATA
TTAACCGCTTTGATAAGAATGAAAATTGTTGAGCCAATTAAAATTGCTTG
GGGGAGATATTAACCGCTTTGATAAGAATGAACTATCTGGTAACAACGAT
GACCATGAACAATTGTTTAAAGCAGGAAAAGTCTATCTGGTAACAACGAT
GACCATGAACAATTGTTTAAAGCAGGAAAAGTTCCGCAATATGCATGGGA
TGGGCATGAAGATTTTGAAAATCAGAACCCTTCTCAACTATTGCAAGATC
TCAGTCCGCAATATGCATGGGATGGGCATGAAGATTTTGAAAATCAGAAC
CCTTCTCAACTATTGCAAGATCTCAGGGTCATGTCTGAGGATTACATAAA
CAAAGGTGGAAATGATCAAAACATTCTAAATTATTTCTCAAAACTTGAAA
AAGAAATCGAATATCTAAAAGATGGCTTAGAAGGTGACCATGGCAATAGA
GAGGCAATCAACACAAGCCCAGGGTCATGTCTGAGGATTACATAAACAAA
GGTGGAAATGATCAAAACATTCTAAATTATTTCTCAAAACTTGAAAAAGA
AATCGAATATCTAAAAGATGGCTTAGAAGGTGACCATGGCAATAGAGAGG
CAATCAACACAAGCCCAGTTGGCACAACTCTCGAGCAATTACAAAATCAA
TTAAAAAAATTCGAAGATAAGAACCAATACCTGGAAGATGAAATTAATCA
CCTTAAACGGACGCAACAAGTATCAAATAATCAAAATCAGAAGTCAAATG
CACAGTTGGCACAACTCTCGAGCAATTACAAAATCAATTAAAAAAATTCG
AAGATAAGAACCAATACCTGGAAGATGAAATTAATCACCTTAAACGGACG
CAACAAGTATCAAATAATCAAAATCAGAAGTCAAATGCACAGGAAAATGT
TGAATCGACATTGCATCCTTTTGGCTTTCACCAAGGAAAATGTTGAATCG
ACATTGCATCCTTTTGGCTTTCACCAAGGGCACTTGCAGAATGATCATGT
ACCAATGATAAGTCACCACAAAGGTGATTTTCACGAACAGAGGCTCATGG
GAATTCGTCAAGAAACGGAATATTATCGCCAACAACTTGAGCTTGAACAG
CTAAGACAGGTAGGCACTTGCAGAATGATCATGTACCAATGATAAGTCAC
CACAAAGGTGATTTTCACGAACAGAGGCTCATGGGAATTCGTCAAGAAAC
GGAATATTATCGCCAACAACTTGAGCTTGAACAGCTAAGACAGGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037317.2XLOC_037317.2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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