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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000120_pilon:541938..552307- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037271 ID=XLOC_037271|Name=XLOC_037271|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10370bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:541938..552307- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTGGGATATTGAATATTTGCCTTTGAATTTGGAAAATCCAGTGCCAAG
GTTTGTATCCTGACGTATCATTAATTGCTGAATTGAATACTGAGACAACA
ATGATAAGAAGTACATTTTGTAATTTTGGGACTAATACATTCTCTTTTTT
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AACAAAGAAATTTATATAAAATTACAAAATAAGATGAATAAAGATATTTT
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TTTTTTTTAGATATGTCATAACTTATCCAAGACCTTTCCTATTTTCAGTT
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TACTTGGTAAATATTTAGTAATAAAAATTTCTTACAAGTAAGTAAAGATT
TTCTCTGTAGCTGCCTCATGGAAAACATAAAACTTATGCTGACACCTGGA
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GACTAGTGGGTTTGTGACTTCGGTTTGTGATTAAAAGTTTTTAATTTCCA
AGAAAAACTAGCTTTGCACCATGTGGTTTGAGTCAAATTTTATCTTCTTT
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TTTTCAGTAACAGTTGTAAAATTTTAGGGTTTTGTCTGATGCAAGAGGTT
GCTTTTTTTCACCAAAGATAAACGATTACTGTATTAATTCCTCAAGAAAA
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AAGATTTAAGTCATTTCTATAATTGGTGTTCAAGCAGCACTTGTAGGTCA
AAAAATGTTTGTTTACTGAATTCTTTGCTCTCGACCTTCATTAGGCTTTT
AAAAAGTCTGTAGTTTTGCCTAACAAAGTCATATCGGGTTAGCATTTAAA
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CTTCGGAAAATTACTGTAGGACAATCACCAACTGAAAAAGGAAGAACCAG
GGAGGTTAGTAACCTCTTAATAATCTATATGGCGTTTGGGAAAGTGAATA
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GATTATTATACAAATTTTAGTTTGTTTTAGTTTGTTTCAATTAGAATTGG
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CCAATTACTGCTGATGATCTGGTACGAACATAAATTTTAATTACCCCTTC
TTTTTTCAATAGATATCACTGAATATATGTTAAAATCAACCCCAAACTTA
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TTTATAACACAGCAATTATCCATTCATAATATAAAAAGATAATTACAGTG
TGGCATAAAAATCTCATACACAAATTTTGTGCCCCTCCTATCTACACTAC
TGCTTAAATGCTCCAATCTCTTACCAAGTTGAGTGAAAATAATAGCATTG
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AAATTACCCCTAGACAGAGCAAATTTACCCCCCGGACAGTATATCCTCCA
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TGTATAAAGGCAAATAAACGAGGCTTTTGTTACCGTTAAGAATTTAGCAA
TTAATTATCATCATTTATAGGGTGTGGGAGGAGCATTGACTGTCCTCATG
AAAGATGCTATCAAACCAAATCTAATGCAAACTTTAGAGGTAAAAGAGGC
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TCTAATAATCGTTTAAGGGCTATCTTCATAGTCAGACAATATATTGATGA
GTGCCGGAAATATTTTGTAATGTGTCAGTTTGATTTCTTGATTGAACTTT
CATAGTGAAAAATATGTTTAAAATGTTCTCCTCTTTTACACGTTTTATAT
AATAACAAACTATTTAAAAACATAAAGCTTCAATGGCCAAAATGTTAAGA
ACAAGTTAAGAACATTTTAAAAGGCTTTGCGGACTCTAACTAAAGATACT
CTTTGCGGACAAAAATACTCACAAAATAGTAAATAAGAACATGTTAAGAA
CATTTTTAGGGTTAAATCTCAAAAAGTTAAGGCTTCAAACATTTTGGATG
TTACTATAAAAAACGTGTGTTACACCATAATTTCTTAACTCTCAAATTTT
TACCTTTCCAATAAATCTTCTTAACAGCAGTGCAGAGAAAATCTTTTTAT
GACCAGATACTTTACAGAAATGTTTTATCTTTGTTAGGGATCACCAGTGT
TTGTTCATGCAGGTCCTTTTGCAAATATTGCTCATGGAAATTCATCCATC
CTGGCAGACAAAATAGCATTGAAGCTGGTGGGCCAAGATGGTTTTGTTGG
TATGTGTGATAGATACATCGATCCCAAATTTTACCTTATTATTTAGAACA
ATTAGCCGTTGACTCTCAGTAACTATTTGTTTTATTAAAGGCCATCATTT
AAAGTGTCTCCTACCATTTGCTTACATAGCATTTTAAACAAAGGAAAGAA
CTAGCTTCTCACCTTATGGGACCGCACGAGCACAAATTCTTTGTTGCATA
TATCATAAAACTGCATAAAAATATATCTTTTAATAATGCCATTCATTTTA
CTTTCAATCTTCTTTTGCAGTGACTGAATGTGGATTTGGAGCTGACATTG
GGATGGAGAAATTCTTCAACATCAAATGCAGATACAGCGGTTTGTATTTA
GAATGTCTTTCGAGTTTCATGCTTTATTGGGAGAAAGGATTTTCTTTATT
TCCAAGATAAAAGCTGAGTTACTGCAAGTGTGGTTTTTATTACCTCCTTT
TCATTTTTCTAGAGAAAACATAAGTTTCTTAAAAAGATCAGTTTTCCTAG
AGTCTGTCAATACTGCTTTTTGGACCTACCTGGAGGTCCTATAAATTAAC
CTTTGTCGCTCCGTACCAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCATTAGTTTTTTC
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GCATGGTTCAATTGTCGATAAAATTGATTTTTGAAGCCGGAACTATTTAA
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TCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTTATGAAATTTTGCACACTGATTCAA
TATGACAATACCTAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAACATTTTT
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TTCTCGAATTTTCACCTTTATTTTTTTCTGATTTTTTTGCAGAAAGATGC
GTATTCGCAATGCTCAAATTATGGCTGAGTTCGATTTTTGAGAAATTTTT
TTTTCCGTTTGAAAATGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCAGTAG
ATTTTTTTCATTGTATTTCTATGTTTTTCACACAAAAACATTATTGATAA
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CAGAACTTTCTATTTATTTTTTCCCTACAACCCTTCCCTCTCCCCCCATC
AACAATCAATGATGAATTTATTGCGTTATGCATTTTCGCTAAACGCTATA
TTTTCTGACTGATTTTTTTCTCCTCGCATTGCTATCTAACTTTTATCATC
AGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTTGAACTTATAGTTGATACGAGA
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ATGTACTTTTTTTCTTTATCAGGACTTCTACCATCATGTGTAGTACTTGT
AGCGACAGTTCGTGCTCTCAAGATGCATGGCGGTGGTCCTAAAGTGAGAT
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GAAAATATTATTATTTGAAATAAAGTTTCTCCTTTGTGATTAAAGTAGAG
GCAGCGTTAAATGAACCTATGAACCCCTGAAAATTTGGAGGATTACCAAA
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TTCAAACCAATTATTCCACAGGTTGTAGCTGGTTCCCCTTTACCTGAAGC
TTATACAACCGAGGTAGGTCCTAGTTATGTAAATATTTCAGACATAAAAT
TTTGTCTGTGCCGTCAGTAAACATTTATTTGTTTTGTATAAGAAGAAAAT
TCGATGAAAGGTGATGTATTCCATTTTATGTTCTTCAATTTCTTTGCAAT
GAAGCATGAGAATAAGAGTGCTATTAAATCCCTACGTACCAATATTACTC
CTTGCATTTGATTTCTTATTATAAAGCCTTCAAAAAAATCAATATCTCGG
CTTCAAAATCAGTTCTACTGATCATGTATTTTCTCTTTCGTATTTTTAGA
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GTATGTTGGTCTAGAAAATGGACCAAAAACCTAAAATTGACCTTAATCGA
AGTGCTATTTTTTACTGTGTCTGAGCTTCAGTTAGTTCAGTCGGTAGAAC
ATTAGCCTTGCAATCCAAGGGTTGTGGGCTCGATCCCTTGTCACTGCCAA
CTCAGTGAATGAGTATCGTGGATTTAAGTAATTTGATCCGGGGGATAAGT
AACTTGGAGCTGATAGTAGATGTGACGCTCAACTTCAGCATTCCGTCTGA
CTGGTCTAGCGCAAATATAAAAGGGGGTGGACTCCCTCACTACTGGCTCC
ACCGACAGCCACTTGATGAATGTACTTACTTTACTGAATAGTAAGATGCA
GTTGTTTTGTCAACTTGAATCTTCTCCTTTTCTTGATTCCAGTACTGACA
CAGATGGTGAGATTAACAAAATGATCAGCCTTTCCAAAGAAGCTGGAGCT
TTTGATGCTGTCCTTTGTACTCATTATGCTGAAGGAGGTTAGTCTGCGTT
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GCGATGCCGGGATGAATAATATGTATTTTTCCTCTTCTTTTAATTAGTTT
TTCTTTTTCACATTCTTTCCAAAACTTGAATTCTGTTCACTTTGATTATA
GGTCAAGGTGCTGTTAATTTGTCCCAAGCAGTCATTAAAGCGTCCAAAGA
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AATCCCATATTCACGTTTGTAAACGGCTAAGAAAATGCTCTCCTAAGCCA
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TGGTTTCAGATGGCATTTCTGGGTATTTTAGCGTTTTGCAGAATTTAAAG
TTCGGGCGATTATGACATTTTCAGGCTTTCTACTTTATTTAATCGGATAT
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GACGATGATTTCTTACAGCTCCAGATTAATACTGTAAACATTTTTTTGTT
TTGCAGGGTTTCAGTGAACTACCGATCTGTATGGCAAAGACGCATTTGTC
ATTGTCTGATAACCCTGAACTGAAAGGCGCTCCCACAGGTAAGCTTGTTA
TGTCTTCAGTCGATCGATTAAATGTTAATTAATTAATTGGTTCACGTCTA
TTTATGAAAATATGCAAACCAAAATAGGTTGGGAGTACTAGTACTCTAAT
TGTAGAGGGGATTAGCAGGGGGGTTGGTACTCTCGAAGAAAATCCCTAAA
ATGGGGGGGGGGTCAATATTAACCCCTAGGAAAATGAAGGTTTTGGCACT
TTTGCAGGAAAATTTCATAAATGGGGTGGGGGGCTAGTCATTATAAAACG
GTATTGGGGTGATTTTTTTCGAATAATTGCAAAGTGATCCCCTACAATGA
AGCACAGAAGAGTCCCACACTTATGGCGTCTTTTGCCTCCCTGACCTTGT
TTTCATGACGATGTACAAATATTTTTATCAGGTTTCACTCTTCCTATTCG
TGACGTCAGAGCAAGTGTTGGTGCAGGCTTCGTCTTTCCACTGGTGGGAA
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TTACAATTTTTTTTTGCCTTTTCTCCGGAAAATATGATACCTTATCGGGG
AAAACTTCGTCGGGGAAAATTTTCTTCGGGGAAAAATATTCGTCACTCGC
TGGTTTTGGTAAACGCATTAAGGCCGGGGAAAATTTTCTTCGGGGAAAAA
TATTCGTCACTTGACCGAAATTTCGTCAGTTTTCCCCGACGAAGTTTTCC
CCGATAAGGTACCCTGTTGACCCGTCACGTCAATTCATATTTACCAATCA
TTGACTGGTCATGGTCAAGAAAGTTAGAAATGTTTTCGAATTATTCGCCT
ATTGCATTATGGTGTTACAACATAACTAAAGCTTAGAGGTTTTTGCGTTT
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GACTATTTCGACTGATTTTTCTTTTATTAGATGAGTACGATGCCAGGTTT
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AAGTTCAAGGTCTCATGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:541938..552307- >XLOC_037271 ID=XLOC_037271|Name=XLOC_037271|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3810bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:541938..552307- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTGGGATATTGAATATTTGCCTTTGAATTTGGAAAATCCAGTGCCAAG ATGTGGGATATTGAATATTTGCCTTTGAATTTGGAAAATCCAGTGCCAAG TGACATCTCAATTTCACGTTCCCAAAAGCCAAAATATATTGGAAAGCTTG CTGAAGAATTGAAGATTCAACCAGAGGAGTGACATCTCAATTTCACGTTC CCAAAAGCCAAAATATATTGGAAAGCTTGCTGAAGAATTGAAGATTCAAC CAGAGGAGGTTGATTATTATGGAAAAACAAAGGCAAAAGTTGGTCTCTCC ATTCTTGAAAGATTGAAGGATCAAAAGGATGGAAAATATGTTGTGGTTGC TGGGTTGATTATTATGGAAAAACAAAGGCAAAAGTTGGTCTCTCCATTCT TGAAAGATTGAAGGATCAAAAGGATGGAAAATATGTTGTGGTTGCTGGAA TAACTCCAACTCCTCTTGGAGAAGGCAAAAGTACAACAACTATTGGTCTG GCACAATCACTTAGCTCTGCATTGAAAAAGCAGTGTTTTGCATGTGTTCG TCAGCCTTCCCAAGGACCTACATTTGGAATTAAAGAATAACTCCAACTCC TCTTGGAGAAGGCAAAAGTACAACAACTATTGGTCTGGCACAATCACTTA GCTCTGCATTGAAAAAGCAGTGTTTTGCATGTGTTCGTCAGCCTTCCCAA GGACCTACATTTGGAATTAAAGGAGGAGCTGCTGGCGGGGGATATTCCCA AGTCATCCCTATGGAAGAGGAGGAGCTGCTGGCGGGGGATATTCCCAAGT CATCCCTATGGAAGAGTTCAATCTGCATTTAACAGGAGATATTCATGCCA TAACTGCTGCAAATAATCTACTTGTTCAATCTGCATTTAACAGGAGATAT TCATGCCATAACTGCTGCAAATAATCTACTTGCTGCTGCCATTGATGCAC GAATCTTCCATGAATCTACTCAATCAGATAAGCTGCTGCCATTGATGCAC GAATCTTCCATGAATCTACTCAATCAGATAAGGCTCTGTTTAATCGACTA TGCCCAAAGAAGAAAGGGATCAGAGAATTTACTCCAATTATGTTACGTAG ATTGAAAGCTCTGTTTAATCGACTATGCCCAAAGAAGAAAGGGATCAGAG AATTTACTCCAATTATGTTACGTAGATTGAAAAAATTGGGAATCGAGAAG AGCAATCCTGATGATTTAACAGACGAAGAGAAAGGCAAATTTGCAAGATT GGATTTCGATACAAGTACTATCACGTGGCAAAGAGTACTCGATACCAATG ACAGATACCTTCGGAAAATTACTGTAGGACAATCACCAACTGAAAAAGGA AGAACCAGGGAGAAATTGGGAATCGAGAAGAGCAATCCTGATGATTTAAC AGACGAAGAGAAAGGCAAATTTGCAAGATTGGATTTCGATACAAGTACTA TCACGTGGCAAAGAGTACTCGATACCAATGACAGATACCTTCGGAAAATT ACTGTAGGACAATCACCAACTGAAAAAGGAAGAACCAGGGAGTGTCAGTT CGATATCACTGTAGCAAGTGAAATCATGGCTGTTCTTGCCTTAACAACTG ATCTTCGTGATATGAGAGATAGTGTCAGTTCGATATCACTGTAGCAAGTG AAATCATGGCTGTTCTTGCCTTAACAACTGATCTTCGTGATATGAGAGAT AGATTGGGAAACATGGTAGTTGCAAGCAACAAAGAAGGAATGCCAATTAC TGCTGATGATCTGATTGGGAAACATGGTAGTTGCAAGCAACAAAGAAGGA ATGCCAATTACTGCTGATGATCTGGGTGTGGGAGGAGCATTGACTGTCCT CATGAAAGATGCTATCAAACCAAATCTAATGCAAACTTTAGAGGGTGTGG GAGGAGCATTGACTGTCCTCATGAAAGATGCTATCAAACCAAATCTAATG CAAACTTTAGAGGGATCACCAGTGTTTGTTCATGCAGGTCCTTTTGCAAA TATTGCTCATGGAAATTCATCCATCCTGGCAGACAAAATAGCATTGAAGC TGGTGGGCCAAGATGGTTTTGTTGGGATCACCAGTGTTTGTTCATGCAGG TCCTTTTGCAAATATTGCTCATGGAAATTCATCCATCCTGGCAGACAAAA TAGCATTGAAGCTGGTGGGCCAAGATGGTTTTGTTGTGACTGAATGTGGA TTTGGAGCTGACATTGGGATGGAGAAATTCTTCAACATCAAATGCAGATA CAGCGTGACTGAATGTGGATTTGGAGCTGACATTGGGATGGAGAAATTCT TCAACATCAAATGCAGATACAGCGGACTTCTACCATCATGTGTAGTACTT GTAGCGACAGTTCGTGCTCTCAAGATGCATGGCGGTGGTCCTAAAGACTT CTACCATCATGTGTAGTACTTGTAGCGACAGTTCGTGCTCTCAAGATGCA TGGCGGTGGTCCTAAAGTTGTAGCTGGTTCCCCTTTACCTGAAGCTTATA CAACCGAGGTTGTAGCTGGTTCCCCTTTACCTGAAGCTTATACAACCGAG AACATCGAACTTGTGGAGAAAGGCTTCTGTAACTTACGTAAACAAATCGA AAATGCGCTCTGCTTTGGTGTACCTGTTGTAGTTGCAGTCAATAAATTCC AAACATCGAACTTGTGGAGAAAGGCTTCTGTAACTTACGTAAACAAATCG AAAATGCGCTCTGCTTTGGTGTACCTGTTGTAGTTGCAGTCAATAAATTC CATACTGACACAGATGGTGAGATTAACAAAATGATCAGCCTTTCCAAAGA AGCTGGAGCTTTTGATGCTGTCCTTTGTACTCATTATGCTGAAGGAGTAC TGACACAGATGGTGAGATTAACAAAATGATCAGCCTTTCCAAAGAAGCTG GAGCTTTTGATGCTGTCCTTTGTACTCATTATGCTGAAGGAGGTCAAGGT GCTGTTAATTTGTCCCAAGCAGTCATTAAAGCGTCCAAAGAAAAAACGAA TTTCCAATTTCTGTATGATTTGAAGGTCAAGGTGCTGTTAATTTGTCCCA AGCAGTCATTAAAGCGTCCAAAGAAAAAACGAATTTCCAATTTCTGTATG ATTTGAAGCTTCCTTTGGAAGAGAAAATCGAAATCATTGCCAAAAGAATA TATGGTGCAGATGGCGTCTCATTCTCTGATCAAGCAAAAGAAAGTTTGGC GCGCTATACTAAACAACTTCCTTTGGAAGAGAAAATCGAAATCATTGCCA AAAGAATATATGGTGCAGATGGCGTCTCATTCTCTGATCAAGCAAAAGAA AGTTTGGCGCGCTATACTAAACAAGGTTTCAGTGAACTACCGATCTGTAT GGCAAAGACGCATTTGTCATTGTCTGATAACCCTGAACTGAAAGGCGCTC CCACAGGGTTTCAGTGAACTACCGATCTGTATGGCAAAGACGCATTTGTC ATTGTCTGATAACCCTGAACTGAAAGGCGCTCCCACAGGTTTCACTCTTC CTATTCGTGACGTCAGAGCAAGTGTTGGTGCAGGCTTCGTCTTTCCACTG GTGGGAACTGTTTCACTCTTCCTATTCGTGACGTCAGAGCAAGTGTTGGT GCAGGCTTCGTCTTTCCACTGGTGGGAACTATGAGTACGATGCCAGGTTT ACCAACACGTCCATGTTTTTATGACATCGACCTCGATCCCGATACCGAAG AAGTTCAAGGTCTCATGTAAATGAGTACGATGCCAGGTTTACCAACACGT CCATGTTTTTATGACATCGACCTCGATCCCGATACCGAAGAAGTTCAAGG TCTCATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000120_pilon | genome | sc0000120_pilon:541938..552307 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1816-1905:91 |
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| Aaloc | 1378-1470:2428 |
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| Aaloc | 1234-1275:3250 |
| Aaloc | 1165-1233:3547 |
| Aaloc | 1096-1161:4999 |
| Aaloc | 982-1092:5384 |
| Aaloc | 913-981:6001 |
| Aaloc | 853-912:6660 |
| Aaloc | 772-849:7063 |
| Aaloc | 592-771:7547 |
| Aaloc | 517-591:8105 |
| Aaloc | 469-516:8364 |
| Aaloc | 409-465:8673 |
| Aaloc | 364-408:9073 |
| Aaloc | 226-360:9400 |
| Aaloc | 130-222:9710 |
| Aaloc | 52-129:10218 |
| Aaloc | 1-48:10371 |
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