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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000120_pilon:608797..612505+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037262 ID=XLOC_037262|Name=XLOC_037262|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3709bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:608797..612505+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGTTGATCAATATCTTCGAATGTCGCTCCAAACTTGCCGAAAATGA
AATGAACCAATATTCGTTGATTCCTGCATTACTGGCAGTCTTGGTGTTGT
ATGCTTTCGAATTATACAAAGAGCGAAAGATTAGTATCATACCACCATTT
GAGACACTGGTCAGTACAAGCTCCAATCAGAAGCTCACCATATTCGCATT
TGGTAAGTAAACCGTGCTATGAAATTTACAAGTCGGTACATTTCTCTTTT
AATGCAAAAAATATAATACCTCGCTGGGAAAGAGGTAACCATAGGAAATT
agtttaaaaaattgattaaaaacaagaaaaatatttttctacaaGGAAAT
AattgtttgaaagatttttgaaagtttcagaAGAGCATAGAATGACATTT
TCGCCCCAGTaggaaaatcttaaattttttgtaAGATTGGGTTTTAAGGT
AATAATGTCATGAACAGGACTACCTATACCTATTTTAATAGTCTATTCAT
TCGAGTTCAACAAAAGAATTCCCTTACCTTACTGTAAATACTTACATTAG
AGTCTGGTGTATTGGTACTTAATCCAGCATTAACATTGCCTTTTACATTG
GATTCTTAAGCCCTAAGGGTTAAAGAGGAATCTTTTAGTCTTatgtattt
ctttgtttttacgcAGTACATTTAAAAATTCTTGCTATATAATTGTCTTT
TCACCTTATTGGACAGCACCACTTCAACCCCCTCCTGAAATTTGTAATCA
TCCCATCCCCCACCTTATTGGGCCACCCCAAccgaaattctgaaaatatt
tctaaCCTCCCAGCTGGCTTTAAACCATTTTGGAAACTCTGAAAGCCCAG
TCAAATCTCCTGAGaactagaaaagaaaaaatagatttACTACTTCATTG
TTTTTGTATCATTTTATGAGCTAGGTTGAGGAAAGAACAATTTTTGACAC
AAAATTAAACTCTCCAATccccacctgaaaaaagtcACCCCACCTGCATA
GGGTTGCCCCCATCTAAAATTTGTTGACATCCTAACCCTCACCTGCTTAA
ATATTTCTGAAGACCTCCCActccccccccaaaaaaaaaaaattgggggg
gaGGGTCCCACTATGTTAACCCTTGAGCATCTTTgggggggTCTTTGtga
taactttttaaaatatttatgtcATTTATCTCATCGACCTTAAATTTTGC
AAACGTGCACCAAGTATGAATTGGCATCTTTGGGAAAAATTTTGgcatca
ttgatgacgtcatcattctttTAAAATACCGAAAATAGAACCCACCCTCT
AACTTGATTCTTTTTTGCTCGAATTATGTTATGCAACTCCTCGTGAAATG
TTAGGGCACAGGATCATTTGTGGCTGGTATCGTGTGTATTTTACTGACCG
GCCTAGAATATGCTCTTTTTGATTAAATCAGTCCTAGGACTTTATCCAAG
GGTTGGAAAATGCTATCGAAATTTCGACAAGCGTTACGTATTGATAATAC
AAGCTTACAGctaaaatttcagcaaaatcggaCGAGCGGTTCGcctgaaa
gtgagcatttcgAGTAAAATTCGGAACAATCACCTGACTAAATTGGAATT
TTGTACACTGTCTTATATGGTCAATATCTGGTCTATAAAATACCTACCAG
ACAGGTGGCCgaaccaaaatttttggaaattatctTTGATTATCCATATC
GAAAACtgccaaaatttcataatgattcccctagtaaaaaataggaagat
ttTTTAAGGGTTAATCTCGTTTTTGGCTGAAAACCACGTGGTTCAAGCGT
TTTGGATTGGAGATCATCagtggcttcatttctcatCCATTtctctcctc
tctctcCCTATTTCCTTTATATGAAAGTCACAAATGTAGTGGTCAGTGGT
CCTTGTGTATGAGAGCCACTCTTGacttaaaagtttattttgatctgatt
gtaattttttttctcaacattTACAGGTACGATGGCTAACTCGATCATTC
GTTTGATTGTCATAGCAAGCCAAAGCATTCAAAACGGAACATGGCTAGAA
GTGACGGAAAATCTTGGTTTGTTTCTGTTAAACTTTCTCATTATCGCTAC
AATCAATTATCCTACATTTTTATGTATCTGCTCCCCATATAAGTTTGTGG
CAGCTATTTTGGGTATTGTGGTGATTTTGCAGAAAATGGCTTTCTTTTTC
CTTTCAATCACCAATCTAAATTGCCAAGCTAACGTGAATCAAGGAGCAGC
TATTGGCGTACAGATTCTCCAATACCTACCGACTATTATTTGTTTCTTAT
TGGTTCTCTATAAATTCATCAGACAGTTTTTGACATAtttaaaacaaagg
aaattcGGGAGGATCGATACTCAGAATTCTCTTGCCAACGAGGTTCATTT
AAATCACTTGAAAGAACTGTTAAGAAAAGACAAACTACCAATTCTATCTC
CAGCAAAGATTCAGTGGTATAAAAAACCATACAGAAAATGTTTAAACGTC
TATAATAGCAGCGTTCAATACTCGAACCTCTTCTTGTGCTCTGTCGCAGT
AATCTTGATCGCATACTATTATTTCCTTGTTGTTTTCATCTATATTGGAG
CAAACAGCATCGATAAAATTACACTCTTATTGGATAATTACAACCTTACC
ACAAATGCCATTTTATTGGAATTCTCAGACGGCTTTTTAAATAGTTACTT
TATCGCTATGGTACTGACTTTCATTTTCTACACATGGTTGCTTCTGGATC
TCCTACAATCTCATCAAAACAATCTCCGTCAGATTTTTGCTGGTAAACAT
CAAATATCGATCGAGGAGCGCCTTTCACCGCAAGATTTAACACTTTACAA
TATCATCTTTCCTGGTTATTTCATCTCCTACATGATATGGGGTGTTATTG
TGTTCTTTGCAGTGACATTTATTTTGGTATTCCTTGTATATGGTTTTATC
TTGATTCTTGTGTTTATACCTGGATGGATAGATATGATTGTTGCTATTCT
GAAGTATCTGTATTTGGTACTAACCCTGCCTTTATTGGCGTACCTTATTC
AGTATGTTCTAGTTCTTTTCTACTTTACCGACCGAAAATCCAAGAAATTA
ACAATGCTTCGGAACAACAATTCGTATCATTTCGTTATGTATGTGTTTTT
CTTTTACAATTTGATTGTTGGTGTTGTATCCTGTATCAAACGCTCTATCA
CTGGTCTTTTGATTAGCTTACTGGTCTTAGGACGTATCGATCAAACGCCA
TTTGCCTTCTTAAAGCACTACGATACTGGCTACTGCGCTTATCATGGTTT
TCTGCGATTACAAGGGGTGTACAAGAATCCTGTCATGAGGTGTTTCCTTC
AAATGCTCAACGAGTCCATAGACAAGGATAACTTGTTGAAAACAATCGAA
GATGGCTTTCCCAGGATGCATCACTCTGGTGTTGACGGTTTCAACACTAA
TATGTTTCCTCAACATACACAACCCATCACCTCTAAAAAAGTTCGTAACA
GATGGTTTTTAGCTTACACCCTTCTCCGTAACCCAACACTGGTCAACGAA
AGGCGCCGTTCAGGGCGTAAAGAGGCGGGAGATCTCTTAGTGTCATTCGA
AGGGGAGGGTATTGAACATAACAATGAAAGAACCAATAATAATGCTGAGT
CAGATAATTATGACGGAGGACAAATTGAATATAGTGGTAAAGATCTATTC
TTGATTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:608797..612505+ >XLOC_037262 ID=XLOC_037262|Name=XLOC_037262|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3870bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:608797..612505+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGTTGATCAATATCTTCGAATGTCGCTCCAAACTTGCCGAAAATGA
AATGAACCAATATTCGTTGATTCCTGCATTACTGGCAGTCTTGGTGTTGT
ATGCTTTCGAATTATACAAAGAGCGAAAGATTAGTATCATACCACCATTT
GAGACACTGGTCAGTACAAGCTCCAATCAGAAGCTCACCATATTCGCATT
TGATGTCGTTGATCAATATCTTCGAATGTCGCTCCAAACTTGCCGAAAAT
GAAATGAACCAATATTCGTTGATTCCTGCATTACTGGCAGTCTTGGTGTT
GTATGCTTTCGAATTATACAAAGAGCGAAAGATTAGTATCATACCACCAT
TTGAGACACTGGTCAGTACAAGCTCCAATCAGAAGCTCACCATATTCGCA
TTTGGTACGATGGCTAACTCGATCATTCGTTTGATTGTCATAGCAAGCCA
AAGCATTCAAAACGGAACATGGCTAGAAGTGACGGAAAATCTTGGTTTGT
TTCTGTTAAACTTTCTCATTATCGCTACAATCAATTATCCTACATTTTTA
TGTATCTGCTCCCCATATAAGTTTGTGGCAGCTATTTTGGGTATTGTGGT
GATTTTGCAGAAAATGGCTTTCTTTTTCCTTTCAATCACCAATCTAAATT
GCCAAGCTAACGTGAATCAAGGAGCAGCTATTGGCGTACAGATTCTCCAA
TACCTACCGACTATTATTTGTTTCTTATTGGTTCTCTATAAATTCATCAG
ACAGTTTTTGACATAtttaaaacaaaggaaattcGGGAGGATCGATACTC
AGAATTCTCTTGCCAACGAGGTTCATTTAAATCACTTGAAAGAACTGTTA
AGAAAAGACAAACTACCAATTCTATCTCCAGCAAAGATTCAGTGGTATAA
AAAACCATACAGAAAATGTTTAAACGTCTATAATAGCAGCGTTCAATACT
CGAACCTCTTCTTGTGCTCTGTCGCAGTAATCTTGATCGCATACTATTAT
TTCCTTGTTGTTTTCATCTATATTGGAGCAAACAGCATCGATAAAATTAC
ACTCTTATTGGATAATTACAACCTTACCACAAATGCCATTTTATTGGAAT
TCTCAGACGGCTTTTTAAATAGTTACTTTATCGCTATGGTACTGACTTTC
ATTTTCTACACATGGTTGCTTCTGGATCTCCTACAATCTCATCAAAACAA
TCTCCGTCAGATTTTTGCTGGTAAACATCAAATATCGATCGAGGAGCGCC
TTTCACCGCAAGATTTAACACTTTACAATATCATCTTTCCTGGTTATTTC
ATCTCCTACATGATATGGGGTGTTATTGTGTTCTTTGCAGTGACATTTAT
TTTGGTATTCCTTGTATATGGTTTTATCTTGATTCTTGTGTTTATACCTG
GATGGATAGATATGATTGTTGCTATTCTGAAGTATCTGTATTTGGTACTA
ACCCTGCCTTTATTGGCGTACCTTATTCAGTATGTTCTAGTTCTTTTCTA
CTTTACCGACCGAAAATCCAAGAAATTAACAATGCTTCGGAACAACAATT
CGTATCATTTCGTTATGTATGTGTTTTTCTTTTACAATTTGATTGTTGGT
GTTGTATCCTGTATCAAACGCTCTATCACTGGTCTTTTGATTAGCTTACT
GGTCTTAGGACGTATCGATCAAACGCCATTTGCCTTCTTAAAGCACTACG
ATACTGGCTACTGCGCTTATCATGGTTTTCTGCGATTACAAGGGGTGTAC
AAGAATCCTGTCATGAGGTGTTTCCTTCAAATGCTCAACGAGTCCATAGA
CAAGGATAACTTGTTGAAAACAATCGAAGATGGCTTTCCCAGGATGCATC
ACTCTGGTGTTGACGGTTTCAACACTAATATGTTTCCTCAACATACACAA
CCCATCACCTCTAAAAAAGTTCGTAACAGATGGTTTTTAGCTTACACCCT
TCTCCGTAACCCAACACTGGTCAACGAAAGGCGCCGTTCAGGGCGTAAAG
AGGCGGGAGATCTCTTAGTGTCATTCGAAGGGGAGGGTATTGAACATAAC
AATGAAAGAACCAATAATAATGCTGAGTCAGATAATTATGACGGAGGACA
AATTGAATATAGTGGTAAAGATCTATTCTTGATTTGAGTACGATGGCTAA
CTCGATCATTCGTTTGATTGTCATAGCAAGCCAAAGCATTCAAAACGGAA
CATGGCTAGAAGTGACGGAAAATCTTGGTTTGTTTCTGTTAAACTTTCTC
ATTATCGCTACAATCAATTATCCTACATTTTTATGTATCTGCTCCCCATA
TAAGTTTGTGGCAGCTATTTTGGGTATTGTGGTGATTTTGCAGAAAATGG
CTTTCTTTTTCCTTTCAATCACCAATCTAAATTGCCAAGCTAACGTGAAT
CAAGGAGCAGCTATTGGCGTACAGATTCTCCAATACCTACCGACTATTAT
TTGTTTCTTATTGGTTCTCTATAAATTCATCAGACAGTTTTTGACATAtt
taaaacaaaggaaattcGGGAGGATCGATACTCAGAATTCTCTTGCCAAC
GAGGTTCATTTAAATCACTTGAAAGAACTGTTAAGAAAAGACAAACTACC
AATTCTATCTCCAGCAAAGATTCAGTGGTATAAAAAACCATACAGAAAAT
GTTTAAACGTCTATAATAGCAGCGTTCAATACTCGAACCTCTTCTTGTGC
TCTGTCGCAGTAATCTTGATCGCATACTATTATTTCCTTGTTGTTTTCAT
CTATATTGGAGCAAACAGCATCGATAAAATTACACTCTTATTGGATAATT
ACAACCTTACCACAAATGCCATTTTATTGGAATTCTCAGACGGCTTTTTA
AATAGTTACTTTATCGCTATGGTACTGACTTTCATTTTCTACACATGGTT
GCTTCTGGATCTCCTACAATCTCATCAAAACAATCTCCGTCAGATTTTTG
CTGGTAAACATCAAATATCGATCGAGGAGCGCCTTTCACCGCAAGATTTA
ACACTTTACAATATCATCTTTCCTGGTTATTTCATCTCCTACATGATATG
GGGTGTTATTGTGTTCTTTGCAGTGACATTTATTTTGGTATTCCTTGTAT
ATGGTTTTATCTTGATTCTTGTGTTTATACCTGGATGGATAGATATGATT
GTTGCTATTCTGAAGTATCTGTATTTGGTACTAACCCTGCCTTTATTGGC
GTACCTTATTCAGTATGTTCTAGTTCTTTTCTACTTTACCGACCGAAAAT
CCAAGAAATTAACAATGCTTCGGAACAACAATTCGTATCATTTCGTTATG
TATGTGTTTTTCTTTTACAATTTGATTGTTGGTGTTGTATCCTGTATCAA
ACGCTCTATCACTGGTCTTTTGATTAGCTTACTGGTCTTAGGACGTATCG
ATCAAACGCCATTTGCCTTCTTAAAGCACTACGATACTGGCTACTGCGCT
TATCATGGTTTTCTGCGATTACAAGGGGTGTACAAGAATCCTGTCATGAG
GTGTTTCCTTCAAATGCTCAACGAGTCCATAGACAAGGATAACTTGTTGA
AAACAATCGAAGATGGCTTTCCCAGGATGCATCACTCTGGTGTTGACGGT
TTCAACACTAATATGTTTCCTCAACATACACAACCCATCACCTCTAAAAA
AGTTCGTAACAGATGGTTTTTAGCTTACACCCTTCTCCGTAACCCAACAC
TGGTCAACGAAAGGCGCCGTTCAGGGCGTAAAGAGGCGGGAGATCTCTTA
GTGTCATTCGAAGGGGAGGGTATTGAACATAACAATGAAAGAACCAATAA
TAATGCTGAGTCAGATAATTATGACGGAGGACAAATTGAATATAGTGGTA
AAGATCTATTCTTGATTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000120_pilon | genome | sc0000120_pilon:608797..612505 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 205-1935:1979 |
| Aaloc | 1-201:1 |
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