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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000120_pilon:586427..590528+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037260 ID=XLOC_037260|Name=XLOC_037260|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4102bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:586427..590528+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGCCAAAATTTGCTGTTCTTGGCTTGCTTATGATATTTGCATGTTC
ATCAGTATGTCTATATTTGTTATCAAGCTTGCTGCCAGCTAATAATGGGA
GGTAAATACTATTTCCTACGTTCAGTTTCAATCCATTTAGTTTGGTTTGT
GATTCAGCAGTTCCAGGGGTCGAATCAAATGTAACTCTGGGTAATTATTA
ACAATGTTTAATTTACTTAGGCCCTAAACCactagtaagtaagtctgtga
cCGCAGTCGAAGACGacctgaaggctcctcttttgtTAGATcctttttcg
atagctatctacccgaaggtaggggagggcgccgctctttctccctggat
tgctccacttagccttgatccttctcttaattgctgagcatcaagcagag
aggcatcaagtaccaattttgggaatctttggtatgacgcggctaggggt
tgaacccacaaccttgcacaccgtagccagatgctctaccactaCAATAC
GGTCACTATCCTAAACCATTACCCTTTCAATCAGGACTCAAGCTCTTTAC
TAATTGGACATCATTCCATAGATAATGTGTATAGTTTAAAGAAATATAGA
ACCTTGTTGTATTTGCCTTTCACTGATGCGACGTTAAATTTTTATCACGT
GGACTGTTGaggaaaataatttatcattttcattgtaATCAAATTTTCGA
TTATAGATACAAGCTTGGTTTCCCTAGCAAcctggaaaatttgaagtcac
ttGTGGAGGTGATGAAAAGATATAAAGAAGATCATTTTTATTCAGTGATG
ATCGTCTTCTGTGCTGCTTACCTTTATAAACAAACCTTCTCTATACCTGG
CTCTGTATTTATGGTgagtttctttttttgaaatattcaaaccaTAGAAG
ATTACCCTTTACCCCATGATCTTATAGGCACTCATTTATGAGGCAGTCAA
CCATAACAAAAGTGTTTATATTTTGACGTTATTGAGTTGGTTCTTTTAAT
GTGTAAAGGAATATATCAGGTAGTGTGAGATATTTGGAATGTAGATATTA
TTTTATAGTAGTTCTGAACAAAATCTCCATACCTTTAATTgtcaaattat
tttccaaagtcaagatattcaagttataccgggtgcaccaaaaaaaagta
tacaactttgtcgagatattgtgagcttcaggatttaaattttttgttca
ttctttttttatcgcttagaggatgctctaacttgaattttgagctatca
tacattaggtttgaaaaagtaattcgaaaactatttaaaaaaaactaact
tttttttaatgtcgaaatttcaaaaaatcatcaaaaacagcgagcaaact
tttctcttggcacttaccttctttacacataaaaataccaaaaaatgcaa
ctgtgttcatcaaatctcgttacggaatttaagaatatggcaaaacaagc
tattcccatgtggaaaaatatttttggtaaagctgaaaattttttttgga
aatctccaagagaggtgtGGTGTGCtacgtgagaaaatttttgaaaaaat
aaataaccattcctcaactagttgctcaaagaactttgGTCTGAATTGAG
TTTGTTGGTGTTGGAAATATTCATGACGTGTAAATAAGATGGACAAACAG
TTGgtaaaatataagataagagaaaaaataatcaaaaagacaatgaaatt
gtgtttttgtcattttgtcttatttatagcgtgattgcagtttttaatga
ttttttgaaatttcgacatggaaaaaaagtcagttttttggaaataactt
tcgaactacttttcaaatttaatgtataatagctcaaaattcaagttaga
gcatcctctatacaataaaaaaagaatgaacaaaaaatataaatcctgaa
gctcacaatatcccgacaaacctgtatacttttttttggtgcacccggta
tgtttttgacttttagcaagaaaacaatataattttaaCGTAAGAACCgt
caaaaaacccatttttaaagatttcaaatttaaaaaaagttaaagacaaa
aatatttggagGTTTTACTCTGGGCTATTTGCAGGTTTCTGTACAGGTCA
AATATCCCAAACCATCTGTTCACTAAGTTCTACTTCTTGCTATGATTAGA
CTATAATTTACTAAATCTATGTTTACTTATGATTACAAGAGATTCCATAG
AATTAAAGCAAGTTTTCAGGTCGCCACTAGCTTTCAATTTATTCATTTAT
CAACGATTAGTCATGTCATGGTCAAccttttaacgtttttgagcactttc
agaaagtaaagtaacttttttaatcaattgagcataactttcgatctaat
gaaccgaattcaataaatgacccatcagaatttaagtttatctttcttct
ttccaatggaataggaatggttcctttgaaattttcagatttcgagaaaa
ttagttttaaagagatacttttttgtggcgcacccggtaggcCAAAATGT
TTTCTACTTGTGAATTTAGCAACAAGCCTGCGAAAAACTCACGTGATAGA
TAGATTCTTAAAATTGCATAGCCATGATCTTTCTCAACCTCCCTGTTTCT
GCTTTTAGAATTTGCTTGCTGGTGCGTTATTTGGGATGCCGTTATCTTTC
GTGCTGGCGTGCTTGTTGTCAGCTAGTGGTGCCACCTGTTGCTTTTTGTT
GTCAATGGTCTTCGGTCGATCTATACTTATGCATTACTTCAAAGAGAAAG
TTGTCCATCTTCAAACAAAGGttttagtcatttttttttttacttcaagt
CTTAAATGGTAACGATTTTTCGTTATTGAATTGATTATTGAACCTTAGAG
AGTAAAACCCAACCCTTTGGTTTTCTTAGTGTTCTTACCTACCCCAATGG
AAGATGCTATTTATTCCATTAAATGAATCATTTTAAAGAATCGGGACTGA
ATTTTTCATAGAGACAACCTTCTAAAGATCCGAATCCCTTAATTTTCCCT
TTTAGAGATACCAAATGTATTATTTTATACACCATTgattaaaattgttt
tgttttcttattaATAGCTGGACGAAAATAGTGATGGGCTGTTCTTTTAT
TTGTTATGTGTTCGACTTTTCCCGATGACGCCGAATTGGTTATTGAACAT
GACTTTCCCGATCTTAGGTGTTCCTATGCATCTCTTCTTTCCTTCAGTTT
TCATTGGTAAgtatattttctttgaatacAGTAAACTCCCGGTCGTTCGA
TCCTGCATTTATTCGAATAATTCTGTTATTCGAAGTGAGATGAGGCTTCC
CTCGGACCTGCTTACCCAGCTCGGGCAAAAGCACTTTACGGTTATTCGAA
CTTCAGCTACTAACAAATTTATCCCCTTTGAAGCAACGGAATTTACTGTA
TCTTCTTTTACTCAGTCTAAAAAAGCCTAAAGTACTAGTATATGTCCAGC
GACAATACTTTTAAACTTCCATCTATGTCGCTTGTATGTATACAAGACTC
GATCACCGATCTCTAACTAGTTGGCTGGACCGGACTAACAGGTTACGGGA
AGTGTGTTTTGAGCTGATTTGTCCGCCATTTTACTATTTGATCAGCTTGA
TAACCTACgagttcgaatgttttgaaattcgaacattaaaaaatcacatt
tccacGGGAAATCTTTCCTGCAGTTAGCCTGTCTAATGTGTAAAGGATTA
CGATGTCTGTGggctcgacgttttttcgttgTGTGCTTTATGTATGAAGA
TTCTCTCTAAAATTTCAAGTTCTGAATAATTCCAATAAAAGGTTTTCTGG
TGACAAACTGCCAACAATAATTAATGGAGCCTCAGATTTGAATCATCTAA
ATGAAAACAAGAGCTGTGTTCTTTTTGAATAAAACTGTAAATAGCCAGGA
ATCTATCTTGAGTACCTATTTCGTCTTAGGATTGATGCCGTATAATTTCA
TTTGCTGTCAAACTGGTTGCATTTTATCCGAAATCTCATCCGTCAATGAC
ATCATGACAACAGGTACCATCTTGAAACTTACGCTTGTTGCTATGGTAGT
TGCGTTACCTGGTTACCTGATGCGTAGgaagaagaaagtgaagaaaaatt
ga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:586427..590528+ >XLOC_037260 ID=XLOC_037260|Name=XLOC_037260|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1464bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:586427..590528+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGCCAAAATTTGCTGTTCTTGGCTTGCTTATGATATTTGCATGTTC
ATCAGTATGTCTATATTTGTTATCAAGCTTGCTGCCAGCTAATAATGGGA
GATGAAGCCAAAATTTGCTGTTCTTGGCTTGCTTATGATATTTGCATGTT
CATCAGTATGTCTATATTTGTTATCAAGCTTGCTGCCAGCTAATAATGGG
AGATACAAGCTTGGTTTCCCTAGCAAcctggaaaatttgaagtcacttGT
GGAGGTGATGAAAAGATATAAAGAAGATCATTTTTATTCAGTGATGATCG
TCTTCTGTGCTGCTTACCTTTATAAACAAACCTTCTCTATACCTGGCTCT
GTATTTATGATACAAGCTTGGTTTCCCTAGCAAcctggaaaatttgaagt
cacttGTGGAGGTGATGAAAAGATATAAAGAAGATCATTTTTATTCAGTG
ATGATCGTCTTCTGTGCTGCTTACCTTTATAAACAAACCTTCTCTATACC
TGGCTCTGTATTTATGAATTTGCTTGCTGGTGCGTTATTTGGGATGCCGT
TATCTTTCGTGCTGGCGTGCTTGTTGTCAGCTAGTGGTGCCACCTGTTGC
TTTTTGTTGTCAATGGTCTTCGGTCGATCTATACTTATGCATTACTTCAA
AGAGAAAGTTGTCCATCTTCAAACAAAGAATTTGCTTGCTGGTGCGTTAT
TTGGGATGCCGTTATCTTTCGTGCTGGCGTGCTTGTTGTCAGCTAGTGGT
GCCACCTGTTGCTTTTTGTTGTCAATGGTCTTCGGTCGATCTATACTTAT
GCATTACTTCAAAGAGAAAGTTGTCCATCTTCAAACAAAGCTGGACGAAA
ATAGTGATGGGCTGTTCTTTTATTTGTTATGTGTTCGACTTTTCCCGATG
ACGCCGAATTGGTTATTGAACATGACTTTCCCGATCTTAGGTGTTCCTAT
GCATCTCTTCTTTCCTTCAGTTTTCATTGCTGGACGAAAATAGTGATGGG
CTGTTCTTTTATTTGTTATGTGTTCGACTTTTCCCGATGACGCCGAATTG
GTTATTGAACATGACTTTCCCGATCTTAGGTGTTCCTATGCATCTCTTCT
TTCCTTCAGTTTTCATTGGATTGATGCCGTATAATTTCATTTGCTGTCAA
ACTGGTTGCATTTTATCCGAAATCTCATCCGTCAATGACATCATGACAAC
AGGTACCATCTTGAAACTTACGCTTGTTGCTATGGTAGTTGCGTTACCTG
GTTACCTGATGCGTAGgaagaagaaagtgaagaaaaattgaGATTGATGC
CGTATAATTTCATTTGCTGTCAAACTGGTTGCATTTTATCCGAAATCTCA
TCCGTCAATGACATCATGACAACAGGTACCATCTTGAAACTTACGCTTGT
TGCTATGGTAGTTGCGTTACCTGGTTACCTGATGCGTAGgaagaagaaag
tgaagaaaaattga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000120_pilon | genome | sc0000120_pilon:586427..590528 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 562-732:3932 |
| Aaloc | 421-558:3068 |
| Aaloc | 259-420:2609 |
| Aaloc | 103-258:708 |
| Aaloc | 1-99:1 |
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