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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000174_pilon:582421..585177+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037243 ID=XLOC_037243|Name=XLOC_037243|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2757bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174_pilon:582421..585177+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTGGAGATAATGGAGCAGCCCCTTTCGTCCCTGTCTAcaaaaaact
actcaaaaaatggttgcccaaaaacaaaCGATTATTCTATCAAGGTGTTG
TATTGATTTTAACCTATATTACATACACATGTTACCATTGTGCTAAACGT
CCTGTTAGTGTGGTGAAAGGTGAATTAGCACCAAATTGTACTAAATATCC
AGATCCAAATAAAACTTGCAATGCATGGAAGCCTTTTGATACACCGAATA
GTAAAGAAATATTTGGACTGTTAGACTGCGCTTTCTTGATGTCCTATGCA
TTATCTATGTTTGTCAGTGGCTACATTGCTGAGCATACAAATATGAGAAT
TTATTTAGCTTCTGGCATGATTACGACTGGTTTGTTTACTTGCATGTTCG
GAATGGCATTTTACTGGCAGATTCATCAGCTCTCTTACTTCTTTTTGGTT
CAAATTCTTACTGGAATCACACAATCAACAGGTaatatatttgtttttta
tttcgcTCTTATATAAGCCAGGTAAAtttttttGTAACGATGTTTGAAAG
GGGTAGTCTAGTTTAAACACGTTAtccttttttaagttttcatcCACAAA
GCGGGTCAGGACTCTAAAAAGTGATTTGAGTGTTATCATTCTGAAAATGT
GAAAACAACCTCTATGACTGGACACAGATTTCGCGCGCTTTGATTCCaag
taatttgattgacaaaatgaaaaaagaaacataCTATGGTAAAAGCACCT
AACTTCATAAGGTCATGAATGTTAAGCATTGTCTGGTCAGGATAGTGCTT
GGATGGGGGACTGCCTGGGTACTTCCGGTTTTgtggaattttttccaagg
ATTCAATTGgcgcgtaagaggaagcccaagaacaaaactacgccttgtta
aaaaattgcaaaaccaaacaaaaatatcttcaaattataaaccaaaatac
tctacagaagaaatcgtcatcGATTGGGCActaacagatgatgatgaatg
attcatttttcaaataggcagtcgaactctattagctttaaagctagtac
agatttgtacacatttttcgactttaaagaatttaTATATACATTAAAAT
TAACACATACATTAAcattaattgataaaaattacgtcattttaATGTTT
GCTGTCAAACAAAGCTAGGGTGTGCTTGTTGACATGTCGACATTTGGACA
CTAGGTCTGATCAACTAGCATCAAAAAGCATTTTCCAATTCCCAAATAAA
GTAAACTAGAGCTGATTTAGATAAAAAGTACAAATCCCAATAAGAGTAAG
agtaataatgatttttttgcaggaaactcatttcaacttaTTCACAGATA
TTTCTAATCTCAGAATAATCATAAAAAACTAGCTATATTTATGCTTAACG
TGCAAAATAAGCTTAACATGAGGATAATCTGCTCTTTATCGTATATAGAG
AGGAAATTTGATTGATTGTGGCATACTCGATAAAATTCTTACTGTGCGTT
TACACAGGTTTAATTTCAAAGAAAGCTGAACTGTGGTACTCACAGTAGCA
TCCATACTCATTAAATATTCTTATTCTCTTTAGAATTTTGTGATGACCAT
GAAACAAACCCAATAAATCTATACTTTATTAGACTAAATTGGTATTTTAA
ATTAGGTATGATAATAAAATTAAATCACTTTTTCACTCTACAGGTTGGCC
ATGTGTCGTTGAAGCTGTGGGATCGTGGTTTCCCGAGGGTCGCAGAGGTT
TTGTCATGGGAATATGGAATACACACGTATCCGTCGGCAATATTATAGGG
TCTGCAATCGCCGCCTCTTTCGTCAAAAGCGCCTGGGGATTATCATTCAT
CATCCCAGGAGCAATGATAGCGGTCATGGGTGTGTTGAATATTGTTTTCT
TGGTGCCCGAGCCTTCTTTTGTAGACATGGAGGATGAGAACAAAAAAGAT
GATGATTTGTCACAATCTGGTTCTGCAAACTTTAAACGTAAACATGAGCG
GTCGAATCTGGTCAGTCCGAATCCTTGGTCTTCTATCGATGAAGACGACC
TGACAGCACACGAGCCACAACCTATCGGACTCTGGGGTGCTTTACGTATT
CCTGGAGTCATTGAGTACTCCTTATGCCTATTTTTCGCCAAACTGGTAAG
CTATACTTTCTTATTTTGGTTGCCCCTTTACATTACCAATATCACTATTG
GAGGGGTACAGTATGATGATGCTAAGGCTGCAGACTGGGCCATCCTTTTC
GATGTTGGAGGCGCTTTAGGAGGGATCACTGCTGGGTTTTTAGTTGACCG
AACTAAAGCCCCAGGTATTATCAATGTTAGTATGTTGGTTTTGGCAGCTC
CTTGCTTATTCTTGTTTAAATTCCATGGTGAATCAAAATtatctttgttt
attttctacATGATTTTATCTGGCTTTTTTGTTAATGGTCCTTATGCTTT
GATAACTACCGCTGTGTCGGCAAGCCTTGGCACACACGAATGCTTACGAG
GAAATACGAAAGCAATGGCTGTTGTAACCTCTATTATTGATGCTACTGGG
TCACTAGGCGCTGCTGTAGGACCGTTAATGGCAGGTGTCATTTCAGCACA
CTCGTGGGATGACGTCTTCTATATGTTgattgcttgtgacgtcattgcCG
CTGTTCTCCTAATGAGACAATTTATCACTGAAGTCAATCAGTTTCGGCAA
AAACGACAGATTGCCAATTCGGTAGTCGACCCAGATGAAAATAAACCTTT
GATTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000174_pilon:582421..585177+ >XLOC_037243 ID=XLOC_037243|Name=XLOC_037243|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2562bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174_pilon:582421..585177+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTGGAGATAATGGAGCAGCCCCTTTCGTCCCTGTCTAcaaaaaact
actcaaaaaatggttgcccaaaaacaaaCGATTATTCTATCAAGATGTGT
GGAGATAATGGAGCAGCCCCTTTCGTCCCTGTCTAcaaaaaactactcaa
aaaatggttgcccaaaaacaaaCGATTATTCTATCAAGCTTCTGGCATGA
TTACGACTGGTTTGTTTACTTGCATGTTCGGAATGGCATTTTACTGGCAG
ATTCATCAGCTCTCTTACTTCTTTTTGGTTCAAATTCTTACTGGAATCAC
ACAATCAACAGCTTCTGGCATGATTACGACTGGTTTGTTTACTTGCATGT
TCGGAATGGCATTTTACTGGCAGATTCATCAGCTCTCTTACTTCTTTTTG
GTTCAAATTCTTACTGGAATCACACAATCAACAGGTTGGCCATGTGTCGT
TGAAGCTGTGGGATCGTGGTTTCCCGAGGGTCGCAGAGGTTTTGTCATGG
GAATATGGAATACACACGTATCCGTCGGCAATATTATAGGGTCTGCAATC
GCCGCCTCTTTCGTCAAAAGCGCCTGGGGATTATCATTCATCATCCCAGG
AGCAATGATAGCGGTCATGGGTGTGTTGAATATTGTTTTCTTGGTGCCCG
AGCCTTCTTTTGTAGACATGGAGGATGAGAACAAAAAAGATGATGATTTG
TCACAATCTGGTTCTGCAAACTTTAAACGTAAACATGAGCGGTCGAATCT
GGTCAGTCCGAATCCTTGGTCTTCTATCGATGAAGACGACCTGACAGCAC
ACGAGCCACAACCTATCGGACTCTGGGGTGCTTTACGTATTCCTGGAGTC
ATTGAGTACTCCTTATGCCTATTTTTCGCCAAACTGGTAAGCTATACTTT
CTTATTTTGGTTGCCCCTTTACATTACCAATATCACTATTGGAGGGGTAC
AGTATGATGATGCTAAGGCTGCAGACTGGGCCATCCTTTTCGATGTTGGA
GGCGCTTTAGGAGGGATCACTGCTGGGTTTTTAGTTGACCGAACTAAAGC
CCCAGGTATTATCAATGTTAGTATGTTGGTTTTGGCAGCTCCTTGCTTAT
TCTTGTTTAAATTCCATGGTGAATCAAAATtatctttgtttattttctac
ATGATTTTATCTGGCTTTTTTGTTAATGGTCCTTATGCTTTGATAACTAC
CGCTGTGTCGGCAAGCCTTGGCACACACGAATGCTTACGAGGAAATACGA
AAGCAATGGCTGTTGTAACCTCTATTATTGATGCTACTGGGTCACTAGGC
GCTGCTGTAGGACCGTTAATGGCAGGTGTCATTTCAGCACACTCGTGGGA
TGACGTCTTCTATATGTTgattgcttgtgacgtcattgcCGCTGTTCTCC
TAATGAGACAATTTATCACTGAAGTCAATCAGTTTCGGCAAAAACGACAG
ATTGCCAATTCGGTAGTCGACCCAGATGAAAATAAACCTTTGATTTGAGT
TGGCCATGTGTCGTTGAAGCTGTGGGATCGTGGTTTCCCGAGGGTCGCAG
AGGTTTTGTCATGGGAATATGGAATACACACGTATCCGTCGGCAATATTA
TAGGGTCTGCAATCGCCGCCTCTTTCGTCAAAAGCGCCTGGGGATTATCA
TTCATCATCCCAGGAGCAATGATAGCGGTCATGGGTGTGTTGAATATTGT
TTTCTTGGTGCCCGAGCCTTCTTTTGTAGACATGGAGGATGAGAACAAAA
AAGATGATGATTTGTCACAATCTGGTTCTGCAAACTTTAAACGTAAACAT
GAGCGGTCGAATCTGGTCAGTCCGAATCCTTGGTCTTCTATCGATGAAGA
CGACCTGACAGCACACGAGCCACAACCTATCGGACTCTGGGGTGCTTTAC
GTATTCCTGGAGTCATTGAGTACTCCTTATGCCTATTTTTCGCCAAACTG
GTAAGCTATACTTTCTTATTTTGGTTGCCCCTTTACATTACCAATATCAC
TATTGGAGGGGTACAGTATGATGATGCTAAGGCTGCAGACTGGGCCATCC
TTTTCGATGTTGGAGGCGCTTTAGGAGGGATCACTGCTGGGTTTTTAGTT
GACCGAACTAAAGCCCCAGGTATTATCAATGTTAGTATGTTGGTTTTGGC
AGCTCCTTGCTTATTCTTGTTTAAATTCCATGGTGAATCAAAATtatctt
tgtttattttctacATGATTTTATCTGGCTTTTTTGTTAATGGTCCTTAT
GCTTTGATAACTACCGCTGTGTCGGCAAGCCTTGGCACACACGAATGCTT
ACGAGGAAATACGAAAGCAATGGCTGTTGTAACCTCTATTATTGATGCTA
CTGGGTCACTAGGCGCTGCTGTAGGACCGTTAATGGCAGGTGTCATTTCA
GCACACTCGTGGGATGACGTCTTCTATATGTTgattgcttgtgacgtcat
tgcCGCTGTTCTCCTAATGAGACAATTTATCACTGAAGTCAATCAGTTTC
GGCAAAAACGACAGATTGCCAATTCGGTAGTCGACCCAGATGAAAATAAA
CCTTTGATTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000174_pilon | genome | sc0000174_pilon:582421..585177 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 220-1281:1696 |
| Aaloc | 97-216:361 |
| Aaloc | 1-93:1 |
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