XLOC_037241 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037241
Unique NameXLOC_037241
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000153_pilon:428511..439416+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037241 ID=XLOC_037241|Name=XLOC_037241|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10906bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000153_pilon:428511..439416+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGACTCAGATAGCGATGGAAGAAGTTCTGACCTCGAAGATTCTAT GCAAGATGAAGGCTCTTCATCGCAGAAAAATCCCTATTCTCCTAGATATG TTAATATCAAAAAGGGTCCAAGGGTTTTGGTTTCAATGTGAGAGGTCAAG TTGCTGAGGGAGGGCAGTTACGCTCTATAAATGGAGTGCTTTATCCACCT CTTCAAATGATTAGTGCAGTTTTGGAAAAAGGTCCTGCTGATGTGGCTGG TGTGCGTGTTGGTGATCGGATCCTAATGGTGTAAGAACAATTATAACTTC TTTCATTAGtctttatttataaaatttagGTTTTTTCAGCAGGAATAGTC TTTTAAAGATTGCACTACTTGTATATACTATGCTATTTTGATAGATCTCT ATTTCTTTTCACCTTTCCACaggttgggtgtttaagataaaaacagcAAT TATTTCTCTTTTGACAACTATTGCCAAAGACAGCAATTCTTTCAACAATA ACACGCTGAAtcagtaccgtcaactgctctatcTTGGGGGACAATTgttt gttgatatctggcctgtacagtattttcacttattgttaaatctctttga caacaaatttgttttcataactccaccaagtttatcaatcatacttcagt gtagacctaactcttcatacaaaaattacgggaaacgcatatttggactt tgtaccctatgctgctgcactcaagcacttgagccaaaatcccacaaagg cgggacaaaaatcagttttttgaagtttgcaaaaaaacgccacatagaag atctttcaaattcagtatgtgaatagagcagtaaaaaatacaacttttct atttttccttttttttgcaaaagttctaggaatgaaaataaagggataat gataattgaatactatccattgatgatcgcggcactatcgtaaagctaga 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000153_pilon:428511..439416+

>XLOC_037241 ID=XLOC_037241|Name=XLOC_037241|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1420bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000153_pilon:428511..439416+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGACTCAGATAGCGATGGAAGAAGTTCTGACCTCGAAGATTCTAT
GCAAGATGAAGGCTCTTCATCGCAGAAAAATCCCTATTCTCCTAGATATG
TTAATATCAAAAAGGGTCCAAGGGTTTTGGTTTCAATGTGAGAGGTCAAG
TTGCTGAGGGAGGGCAGTTACGCTCTATAAATGGAGTGCTTTATCCACCT
CTTCAAATGATTAGTGCAGTTTTGGAAAAAGGTCCTGCTGATGTGGCTGG
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TGGAAGAAGTTCTGACCTCGAAGATTCTATGCAAGATGAAGGCTCTTCAT
CGCAGAAAAATCCCTATTCTCCTAGATATGTTAATATCAAAAAGGGTCCA
AGGGTTTTGGTTTCAATGTGAGAGGTCAAGTTGCTGAGGGAGGGCAGTTA
CGCTCTATAAATGGAGTGCTTTATCCACCTCTTCAAATGATTAGTGCAGT
TTTGGAAAAAGGTCCTGCTGATGTGGCTGGTGTGCGTGTTGGTGATCGGA
TCCTAATGGTGAATGATCAAAATTGTGAAGGAGCAGACCATCGCACAGTT
GTTGATCTCATACGACAAGGTGAAAATGAATTATCAATGGCAATCATTTC
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GTGCATCTGACTACATAGATTACAGTGATCGTAGAAGTATTCCAATTTCA
ATTCCTGACTATAAACATGAAGAAAAGGGATCTGATAAATTTGTGGAATG
ATCAAAATTGTGAAGGAGCAGACCATCGCACAGTTGTTGATCTCATACGA
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AGCTCGTAAATTGGACGGTCCTACAAATATGTTTGGTGCATCTGACTACA
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TGGCAACTTGGTGACCTCAAAACGTTATAATGAATTTCACAGTCTAAACA
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TACAGTTGGATGCTCGTAGAAGACACTTAGAGACGTATCTTGAAGAAGGT
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GCCTTTGAAACTTTCTGAAGTACAGTTGGATGCTCGTAGAAGACACTTAG
AGACGTATCTTGAAGAAGGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037241XLOC_037241-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000153_pilongenomesc0000153_pilon:428511..439416 +
Properties
Property NameValue
Aaloc592-711:10787
Aaloc517-591:6143
Aaloc283-516:5588
Aaloc124-279:123
Aaloc1-120:1