XLOC_037192 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037192
Unique NameXLOC_037192
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000084_pilon:1041640..1054428-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037192 ID=XLOC_037192|Name=XLOC_037192|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12789bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1041640..1054428- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CACATATATCTATTAAAAACACTAGAGATCTATTCCCATGGATTTGTCGT GCTTTGGCTGGAAAGTGTGCCGTAGTTAGGTAGAAAATCCTACATAGGTC ACGTGACATTACAATAGAATTTCAGCGCTTGACCAATCATAAGCTTCGCA GGTTTTCGAAAACAATAACAGCAATATTTTTGGCTATATTCCCTTTTTTT TTGCCTACGATGGCTTAAAACACGATATCTAGCCCTTCAGGCTTTATGAA TCTAAGGCTATTTCTGGCTGGAGAAAAACAATGCACCATTTTTTTAAAGT AGACCACAATTCGGTGTGGGTGATTTGATCATTTAAGAACATTCTCTCGC TAACTCGCTTCGGACAATACTAGTTGTTTACTTTAATTGAACAAATTGCC GGCGCCGAATTGTGGTCTACATTTCGAAAAGATGGCACATTCAACCCCAC AAGCGCAAATTACGAGTATATCCGACATTGATGTGGATAGGAGGAACAAT TTTTTTCCAAACTGAAAAAAAAACGTTTTTCAATCTCAAAAGAGATTGAC TGATATTCTGATCGTTTTTGAACCATAATATTTTGTGAGTCAAAAGTCGA AAAAAGATCTTAATGAATTATCGCTGCTAGATGTTTTGAGAATAGGTACC ACTGATTTTCACATTCAAATAATGTTTCAATATAATACAAGATCATGAGA ATCAATAATGCTTTATAGCTAACTTATGGTTGACGGGTGCCCTCGCAGCC ATTATGGATTATCATGGTTATGCTTGCTGAGTTTATACACGTTGTTTTTT ATAAGAACAAACTATATAAGAAAATAAGGCTTCAATGGCAAAAACGCTAA GAACAAGTTAGGAACATTTTAAGGCTTAGAAGGCTCGAAAACACCCGAAA CGGGTAAATATGGTCACAAAATGGAGAAAATAAGAACATTTTTATGCTTA 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TTCATTCAGAAGTTAAAGCTGAAAATTGATTAACTATGAAAGAAATAGCA CCGGAATTTTGACAATAATTGACCTACTAAAAATAATTCCGGTGGGTCTT TTAAAAAATATTTTTGTATCAAAAGTATAAAAAAAACACACCAAGCATAG AGTCTCAGTATGATTTCAAACAGTCAGACTCTTTCTTAATTTTCACTATA GGCTGTGTATGAAAAAACCTGGAAAACAGCGCACTAAAACTGCGAATCTA TTCCGGTCGATAAAGTTGTCCTACATAGCAAAAAAACAACATGATATTTC TAACACATTGAATTTAAAGCCCGAAGGGCTAGAGTAGAACTTCTAACCTT TCCCAGGCAAGAAAAAGTGAAGCCACTTTTTTCCCATCCAAGAACAATCA TGACGATGAATTTTATCTAGTGGTTCCTTTTCTTTTGAGAACTGCATTTT TTGAAATCTAGTGATAGATTTTACGTCATTTGTATAAAAACCACGCGTGG GCGTGTAAATAGCTTCATTTCCCATCCAGGAGTCTCGAGTCTAGCCATTC GGGCTTGAAAGTCAATGGTCTAACAAAATCTAGCCTGTCTTCCTCCCTGT AATACACCTTCAAAAAAAAAGCAAATATCTTATGCTGCTGACGTCAGCAT GTTCGAGATCATATTTTACGCAAGAAATCATTATGCGTTTCGATAAGAAC TATCGATTAGAGAATATACAGCTACCACTATTCAATTCGATCTGCTCTCT AGAGAACTTACATTTTTCTTCGAATTAGATTAAGGAGAGTATTTTACTCA ACTTTTCAGCAGAGCGGGCCGATGTTTTGTTCGGTTTTTAGAAAGATTCG AATTACCTTAAGGGAACTTATTTTGACGGGAACTAATTTTGGCGGGCAGC AAATATCCTAAATTTTTTCAATTTTGGCGGTAACTTATTTTGGCGAATAG TGAATATTTTTAATTTTGGCGTGAACTAATTTTGGCGAATGACAGCGTAA ATCTGTTCTATTTTGCATTATTTTGAGCAATTTTGATGAATTTCAGGGGT TATTTAGGCAAGGAAACAAAAAAATTAATTTTGGCGGGAACTTATTTTGG CGAGTGAGCAAAATATTTAATTTTGGCGGGAACTAATTTCGCCAAATCCG CTAAAATTAGTTCCCGCCAAAATAAGGCCAGTTCGCTGGCGGACTATGAT GTGAAGAGACTCCACCGTATTGCAAAAGCAATGCAAATTATTTACTCCAT TGCTTACTTGGACCATCAAAATTGTAGATCGTTTTAATTCTTATTCAACA TTTTTTGACGTCAAAGCGTTCTAAATTGAGGGTTTGCATTATGTAATTAG AGGACATTCATTACATTTCGTTTTGATGATTCCTTTTAATAACTGCAATA ACAACTTCACAAACTCAGTGATTCAGACTCTAATCTAATTATCGTTAAAT TGACTTTAATACCTGAAATTCTCTAGTCCTAAAAACCGACTCATTAATCT TAAATCTTAAACAGGATATCTAGGCGGAGCAATTATTTCATCGAATCCAG GTATTTTAAACCTTGCGCAAACGTCTTCAGTGAATTACCATGCGCGTAAG AAAATTATGATCATCTGTTATCAGGTTACCTTACTATTATTGTACAGCGA CTGTAGTGCAGTGGTAGAGCAAGATTGTGAGTTCAAACCCCAGTCGGGTC ATACCAAAGATTCTCAAAATGGTACTCGATGCCTCTCTGCTTGATGCTTA GCAATGAAGAGAAAGATCAAGGGTAAGTGGAGAAATCTAGGGAGAAAGAG TGGCACCCTCCCCTACCTTCGGGTAAACAGCTATCGAACGAGGAGCCTTC GGGTCGCCTCCGACCGCAGTCTCAGCCTCACTTGCTATTATCGTATAATT TCGTTATTTTCCAGGCCTTGATACCTGGCTTAGTAAGCGTGATAACACTT GGAACAAGACAAAGCAGTGCCGTAAGTATTAAATTTTAATAATAATGTGA GCCTGATATAGGGGCAGATACTTGCTTATATGAAAAAACATGAATTAGTA TCTGGCACCCCGCGAACCCTTAAAACTTTCTTAACTTGTTCTTAATATTT TGGCCATCGAAGCCTCATTCATGTTCTTATATAGTCTAGTTAGATTGTTT TCCTTATTTCTTCCATAGTCAGGCACAGTGTTCCTAACAAGCCTCGTCAT CCTGGGTATCGGTATCTGGCACTCAGTTGAAATATATGAGAAGAAAGACT TCTGGGAGAAATATCGTGGCTACGCAGAGGAAACACCAGCGAAGCCATTG TGCAAACAACTGGAAAGAACGGTGGAAGATTATCTGGGCAATTATCATTG CTATTGTGATAATGATCCGCAAGAATATAATGAATCGGGATATGTTGGTA AGTTTATGAAGTCAATTAATCATTTACCATTTAAATTTTGGCGGAAAGAG AATTTGGTGGATTTGGCGAATTAAATTTTTCCCACCATCCGCCAAATTAA ATTCCCGCCAAATTTAACTTCAGGCCTTAAAAAAAGTTTTTTCCTCACGT AATACCGTTGTTTGGCCTAAAATATCCTTCATCCGCTAAATTAAGTTCCC GCAAAATTAGATTTTTTTAGCTATCCAGTAAATTAGATTCCCTCTGAAAA ATATTTTTTCTGGCGACCCACCAAGTTAAAGTCCCACCAAAATTTCTTCC CTTAAAAATGAAATTTTATTCATCTCAAACTAAGCCCTGCATTGTTTTTG TTAAATCTTGCTTGCAACTCAACTTTTAAGAATGTTTTTTTTGGCATACC GGATAAGTGGGATGGGGGAACCTGGGAACCTAAAGTGGGAACCTAAATGA ACACCTGAAAAGTGGGATGGGGGGACCTAAGTGGGAACCTAAATGAACAC CGGAAAAGTGGGATGGGGGAACCTAAAGTGGGAACCTAAATGAACACCTG AAAAGTGGGATGGGGGAACCTAAGTGGGAACCTAAACGACTACCGGAAAA GTGGGATGGGGGAACCTAAGTGGGAACCTAAGTTGTTTAATTATTAATAG AATTGAAATATTTTTCTTTAAAAACAAATACATAAAGATAAGAAAGATAT TATATGCAATGAAAGAAAAAACCTTTTATCATAATAAATAAGAACACCAG TTATTTACTTTTTACATTACGGTTCGCAAACAATAATGTTGAAAATAAAA CAAAGGGAATTTATTTATTCAATTAGCTCAAAAAAGCATGTTTATTTATC AGCAGTTTTATAGTGCATCTTTTTGAAAGGTTCTTTTTAGTAAATTGACT TAATTGACTTTAAACTTTAAACTTTAAACCGTCATATCTTCAAATCTAGA AGGAATTAGAAGTTCGTTCATAGCTCGATGGATAACTTAGAGCCTCTTCT TTCTTTTGCACGGATCTAATTTGCTTGAATACAGAATCTAGTAAAACATT ATTTACGATCTAGTTTTTGTTCACTCTTGATGCAATACACATTGTTTTTT ATTAGCAGCTCCAATTTTCGGGTCAGGGCTGGGGTCGCTTAGCATTTAAC GGATTCTAGCTCGTTTTTCTTTCTGTACCAACCAAACAGTACAGCGTGTG AATACACTTCATTAATTAAAAATGTTTGATAGTAAAATAGAACATATTGC ACGGCTTGCCACGTTTCAATACACATAGGCATAGATCCACGGGGGGGGGC ACTCAAGGTAAACGACCTACCGTACGTGCGGCCCTTTTTTCCAAGCTTCC CAAAGTACACTGTAAGGGTGGAAATGAGCAAAAATTAGAATAAGTTCACT CTAAGGGTTTAAAATTTGGTCAAAGGACTGGCTTTTAGAATTTCATCCGA ACAAGTGTCATGTTTTAACACTGGGTAAATTTTGGAACATCAAATATGTC CATCCCTATACCATAGCAGGATCTGTTCTAGAACATGTTGACCAAGAAAA AGATCTAGGAGTGATAATCGATAGTAACCTGACCTTTGAAGCCCATATAT TCAGTAAAATCAAGAAAGCTAACTCTATCGTTGGCTTGATTAGCAGGAGC TTCGAATTTCTCTCACCAGATATGTTTCGAACGCTTTTCATTGCATTTGT CAGACCCCATTTGGAATATGCACATGTAGTATGGTCTCCAAGGCTAATCA AACATATCAAAGCAATTGAGGGCGTCCAACGAAGAGCTACAAGGCTAGTT AGTTGCTATAGAAACTACTCATACGAAGATCGGCTACGACTCATCAATCT ACCTAGCCTAAAGACCAGGCGGCAAGTTGGTGATATGGTGGAAGTTTTCA AGAACCTCCACATTTATGACGAGTCTATAAGATCAGAGAAATTTACTCCT CGAACACGACCACGACGTCAGCATGATTACGAGCTTCAAAGGAACTTTGC TAATGACGGTATGAGAGGCTACCAAAGCAACTCTCTTTTTCACAGAAGTG TGAACCCTTGGATGATCTAGAAGAAGATATTGTTGAAGCACCATCCTTAC AAGTCTTCAAAGAGCGTTTGATAAAAGAAAGGGAGAAAAAACTTTATAAA ATGTAAAATCAAAAGTTCTGTTTCATAGAGGTCAATAGACCTGCGAAATA TATTGTATATTGCTATAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAAAA TAAAAATTTAGGTTCCCACTTTAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCCGGTGT TCATTTAGGTTCCCACTTAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCAGGTGTTAAT TTAGGTTCCTACTTAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCAGGTGTTAATTTAG GTTCCCACTTAGGTTCCCCCATCCCCACTTTTAGTTCATTTAGGTTCCAC TAGGTTCCCCCATCCCACTTTTCAGGTGTTCATTTAGGTTCCCACTTAGG TTCCCCCATCCCACTTTTCAGGTGTTCATTTAGGTTCCCACTTAGGTTCT CCCATCCCACTTTTCAGGTGTTCATTTAGGTTCCCACTTAGGTTCCCCCA TCCCACTTTTCAGGTGTTCATTTAGGTTCCCACTTTAGGTTCCCGGGTTC CCCCATCCCACTTATCCGGTATGCCGTTTTTTTTTATATATACAACTTGA TTTTTATAAAAGAATCATGCTGATTTGTGAGTAAAATAAAAAGAAACATT CATAAAGTGAGGATTTAAAAAATTGGGGAAATGTTTCTCTCACTCTACTT TTTTCTCAAAAAAGTTTACTTCGTAATCACAGTTTGGAGCCTTTAGCAAT TGAAGATAAATATTCAAAATGAAAGAGTGTCCAGTTTTTAGAGATATTGT AACACGATTGAAAATATAAACTATGAAAATTAAGTATTTGAATAATCGCA CGCCTAGACCACTATAAATCAAAATCTAGGCGTGCGATGATCACACGTGA ATTTTTCTTATGCCGAAGCACTTCTACGAGTGCTTTAAAAAATCGATTTT TTGGGATCGAAATTTAGCAAAAAAAAATTTTTTTGCGGCCGGCCGGGTGA GTGTTTTTTTCGTCACCCGGTGGACCGGAAACAAAAATATTTTTAGGGTT CGCCTAAGGTATTTATCTTGGTTTAAACTTTCTGTAATCGTGAATCTCTG GAAACCATTGAATTTGATCGAACTTTTCGAGTATTCTAAGACTTCCTGTA ATTTAATTTGTTTTTTAGAGAAAACTCTAAAGTTATTTTCAAAATTAGCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000084_pilon:1041640..1054428-

>XLOC_037192 ID=XLOC_037192|Name=XLOC_037192|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1302bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084_pilon:1041640..1054428- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTCATTTCGAGAACATTAGCGCAATGGGTGTGCGGTATCGGGTTGGT
CCAACTTTTCTTTGCTACTGCACTGACCGTTTGTGGATTTATTGCTTTGG
GCTTATTTCATAATGTCAATGGTTATGGTATATGGCTTGGATTACCGATG
CTCATTTCGAGAACATTAGCGCAATGGGTGTGCGGTATCGGGTTGGTCCA
ACTTTTCTTTGCTACTGCACTGACCGTTTGTGGATTTATTGCTTTGGGCT
TATTTCATAATGTCAATGGTTATGGTATATGGCTTGGATTACCGGCCTTG
ATACCTGGCTTAGTAAGCGTGATAACACTTGGAACAAGACAAAGCAGTGC
CGCCTTGATACCTGGCTTAGTAAGCGTGATAACACTTGGAACAAGACAAA
GCAGTGCCTCAGGCACAGTGTTCCTAACAAGCCTCGTCATCCTGGGTATC
GGTATCTGGCACTCAGTTGAAATATATGAGAAGAAAGACTTCTGGGAGAA
ATATCGTGGCTACGCAGAGGAAACACCAGCGAAGCCATTGTGCAAACAAC
TGGAAAGAACGGTGGAAGATTATCTGGGCAATTATCATTGCTATTGTGAT
AATGATCCGCAAGAATATAATGAATCGGGATATGTTGTCAGGCACAGTGT
TCCTAACAAGCCTCGTCATCCTGGGTATCGGTATCTGGCACTCAGTTGAA
ATATATGAGAAGAAAGACTTCTGGGAGAAATATCGTGGCTACGCAGAGGA
AACACCAGCGAAGCCATTGTGCAAACAACTGGAAAGAACGGTGGAAGATT
ATCTGGGCAATTATCATTGCTATTGTGATAATGATCCGCAAGAATATAAT
GAATCGGGATATGTTGTTCAATTTTGTGACGAATTTCGTGTCGGGGAGGA
CCTCTTCAACGCCATGTTCATTTTCTCCATTGCTGTTTCCGTTTTCTCAT
TATTAAACGCGTTGCTGTCAATCATCGCATGTTGTATATGCAAACCTAAA
GAGTTCAATTTTGTGACGAATTTCGTGTCGGGGAGGACCTCTTCAACGCC
ATGTTCATTTTCTCCATTGCTGTTTCCGTTTTCTCATTATTAAACGCGTT
GCTGTCAATCATCGCATGTTGTATATGCAAACCTAAAGAGCTACCACCAT
ATCAGAAGAACCCACCCCCTGGTTATTATCACTCAGATGATCACAAAAAT
ATCTACGCTGTGACGCGCTAACTACCACCATATCAGAAGAACCCACCCCC
TGGTTATTATCACTCAGATGATCACAAAAATATCTACGCTGTGACGCGCT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037192XLOC_037192-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000084_pilongenomesc0000084_pilon:1041640..1054428 -
Properties
Property NameValue
Aaloc571-651:82
Aaloc436-570:1825
Aaloc205-432:5872
Aaloc148-204:6126
Aaloc1-147:12790