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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000324_pilon:226434..228717+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037161 ID=XLOC_037161|Name=XLOC_037161|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2284bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000324_pilon:226434..228717+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTTTGTTTACAGTTTTTGGTTTGATTTGCATCCTATTCATAAGgta
atttcatattttattgaATTCTAGCTTACACAAGTAAtgtctattttttt
tctctgattaTTCGGATGTTTTGAGCTCAGAATCTTGGGCCAACTTGTCT
AGCTTTTTCTcgcttttgaatttgattttaaaatgtaATTCTTTAAAGTA
TCAATCAAATGAGgtgaaatcatattcaaagagtGAAATTCtttggtttt
gaaatatatttttgattaattctttaaagtatttatttatttcaaactGT
CATATATCTTTAGTACCGTCGTTTCTAATTACGAAAATGTACTCGATGTT
GCAGCTTTCAATGTTCAAGTTTTTGGAGTTCACAAAATGAACAAACCACT
CATTCACAAGTATTTACCAAAGGTATTGATTTATTTGTAGCCGACAAGAT
TTCTAGATACAACctctacacttttttataagaacatccaacatttttgc
agccttcggatgttcttaacattttaagttttaagcctaaaaatgttctt
aacatgttcttaacattttaagttttaagcctaaaaatgttcttaacatg
ttcttaacattttaagttttaagcataaaaatgttacatgttcttaattt
caccattttgagcatttttatccattttacTAAGAAAGAGTCTgcaagcc
ttaaaattttcccaacttgttcttgacattttggcatttcgaagccttat
gttcttatatagtttgttcataCAAACACATGTTCACatgtctttatttt
atttaaagttAAGGAATTGAGCAATAAATCAAAGATTTATTGGGTGAAAC
GCTAACTTTTCCCTCGTAATAATCGAAAAGAACCGTTTTATCGTCACTTT
TCTAATTCATTTAGATTGTGGCACGATAcgatttgattttgattcaaGAA
ATTCGTGATAGTTCTGGCGAAGCTATCCAGGAATTGATGAAACTTGTCCA
ACAGATTGATAGCAGGTTTGTTTCAAAGCTAAATCTTGAATTCATAATTT
TCCAAACTTTTATTAACACAAGTTCATTAAGCAATCTTAACCTTGACTAC
ATATTCCATGTCAAGCCACAGAGttgatatcaaaaaatatacattcttga
ttttcatttagagttgattatgttcttatttcatattttattttctacag
ATACAAATTAGAGCTTAGCGGACGACTCGGACGCTCGACGAGCAAAGAAC
AATATGGATATATTTACAGGTAACTCTTCTAAAAGATCTGACAGAACTAC
AGAATGTACATCCTGGAGTAGTATTTAAAGCAATCAGATtgattttctta
ggaaaaataaattcaaaattagtttgCTAGTAATTAAAGTGGCATGTGGT
CCTCTAGACTACAGTGCCTCCAACTCACGGGGGAcgcaaatttgtttgag
ttatggaaatttcgagatatAGCGAGTATATTGTTGAttgaagggaccag
aaaacgtattcgagttaagaagacatttgagttttctaggttcgaattat
ggagacacACTGTTTATAGtggtaaataaaaaacaatatgatgcttttct
tttcagatCAGATTGGTTAAGTGTGGTGGATTCGTATGTTTACGCTGATT
CTAATGATCATTTTGAACGTCCTCCTTTTGTTGTCCATTTCAAAAGCTCC
AAAGCAGGTATTGAAACTAAAATGTAATTCGTTCACTTACCCTGATTGAA
CTTAAAACATCAAGTTCTGTATTATAACATCTCTACTGGTTCTATTTTAG
TACTTTCATACAACATATCATATCAAATAAATCAGTTAAAGTCAAAGTGG
TGATGAATCAGGGGAATCAAGTTTTAaatcaaacttcattttttactttt
tttgaattCACTTTCACAGAGGTGAAGAATTTTGTGACGATCGGCATCCA
CACCAAACCTGACGATGCAGAGAACGAAATCAACCGTCTCGTTGATGTCT
ATGATGACGCCGTAAACAAATGGTCTGTCCAAAACGCTATCCTGATGGGA
GATTTTAATGCTGGATGTAATTACGTTAAATCGTATGATAATATCGCCTT
GGCAACTGATAAACGATTTTATTGGATGATTGGTAACCGAGCTGATTCAA
CTACGAAAGATACTGATTGCCCATATGATCGTATTGTTTTGGCTGGTTCG
CAATTATTGAATGTCGTTGTGATGAATAGCCCACGTGTCTTTGATTTCGC
CACTGCGTATGGCTTGACTGAAGATGAGGTAATC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000324_pilon:226434..228717+ >XLOC_037161 ID=XLOC_037161|Name=XLOC_037161|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1584bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000324_pilon:226434..228717+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTTTGTTTACAGTTTTTGGTTTGATTTGCATCCTATTCATAAGATG
ACTTTGTTTACAGTTTTTGGTTTGATTTGCATCCTATTCATAAGTACCGT
CGTTTCTAATTACGAAAATGTACTCGATGTTGCAGCTTTCAATGTTCAAG
TTTTTGGAGTTCACAAAATGAACAAACCACTCATTCACAAGTATTTACCA
AAGTACCGTCGTTTCTAATTACGAAAATGTACTCGATGTTGCAGCTTTCA
ATGTTCAAGTTTTTGGAGTTCACAAAATGAACAAACCACTCATTCACAAG
TATTTACCAAAGATTGTGGCACGATAcgatttgattttgattcaaGAAAT
TCGTGATAGTTCTGGCGAAGCTATCCAGGAATTGATGAAACTTGTCCAAC
AGATTGATAGCAGATTGTGGCACGATAcgatttgattttgattcaaGAAA
TTCGTGATAGTTCTGGCGAAGCTATCCAGGAATTGATGAAACTTGTCCAA
CAGATTGATAGCAGATACAAATTAGAGCTTAGCGGACGACTCGGACGCTC
GACGAGCAAAGAACAATATGGATATATTTACAGATACAAATTAGAGCTTA
GCGGACGACTCGGACGCTCGACGAGCAAAGAACAATATGGATATATTTAC
AGatCAGATTGGTTAAGTGTGGTGGATTCGTATGTTTACGCTGATTCTAA
TGATCATTTTGAACGTCCTCCTTTTGTTGTCCATTTCAAAAGCTCCAAAG
CAGatCAGATTGGTTAAGTGTGGTGGATTCGTATGTTTACGCTGATTCTA
ATGATCATTTTGAACGTCCTCCTTTTGTTGTCCATTTCAAAAGCTCCAAA
GCAGAGGTGAAGAATTTTGTGACGATCGGCATCCACACCAAACCTGACGA
TGCAGAGAACGAAATCAACCGTCTCGTTGATGTCTATGATGACGCCGTAA
ACAAATGGTCTGTCCAAAACGCTATCCTGATGGGAGATTTTAATGCTGGA
TGTAATTACGTTAAATCGTATGATAATATCGCCTTGGCAACTGATAAACG
ATTTTATTGGATGATTGGTAACCGAGCTGATTCAACTACGAAAGATACTG
ATTGCCCATATGATCGTATTGTTTTGGCTGGTTCGCAATTATTGAATGTC
GTTGTGATGAATAGCCCACGTGTCTTTGATTTCGCCACTGCGTATGGCTT
GACTGAAGATGAGGTAATCAGGTGAAGAATTTTGTGACGATCGGCATCCA
CACCAAACCTGACGATGCAGAGAACGAAATCAACCGTCTCGTTGATGTCT
ATGATGACGCCGTAAACAAATGGTCTGTCCAAAACGCTATCCTGATGGGA
GATTTTAATGCTGGATGTAATTACGTTAAATCGTATGATAATATCGCCTT
GGCAACTGATAAACGATTTTATTGGATGATTGGTAACCGAGCTGATTCAA
CTACGAAAGATACTGATTGCCCATATGATCGTATTGTTTTGGCTGGTTCG
CAATTATTGAATGTCGTTGTGATGAATAGCCCACGTGTCTTTGATTTCGC
CACTGCGTATGGCTTGACTGAAGATGAGGTAATC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000324_pilon | genome | sc0000324_pilon:226434..228717 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 430-792:1922 |
| Aaloc | 328-426:1608 |
| Aaloc | 259-324:1202 |
| Aaloc | 157-255:915 |
| Aaloc | 49-156:315 |
| Aaloc | 1-45:1 |
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