XLOC_037074 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037074
Unique NameXLOC_037074
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000086_pilon:520444..535699-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037074 ID=XLOC_037074|Name=XLOC_037074|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15256bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:520444..535699- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATAGAAGAAAAAAAGGACATGACCACATAACATTGAGATCAAAACCAAA ACAGTGGTGTTCTCAGTTTGGACTTTCTGTTCTGCCATTTCCATATAAAG CATGTTGTTCTTTCCATCCAGCAAGCATGTTCCCGCCGTCCCACCATGCG CGGGTCATGCATGCAAACTTTAAAATGAGCAAGGCAAGACGTGCCAACCT CGTTTCCAGACTGTTTTCGAAAAGATAGTATGTTTTAAAAAAGATAGTAT CGTTTTAAAATAGATAGTATTGTTTAAAAAAGATAGTATCATTACAAAAG ATAGTATGTTTTTAAACGAAGATAGTATGTTTTTAAACGAAGATAGTATG TTTTAAACGAGAATAGTATTTTTTCAAACGGAAATAGTATTTTTTCAACG AAAATAGTATTTTTTGAACGAAAATAGTATGTTTTAATCGAAAATAGTAT TTTTTAAAAAAGATAGTATGTTTTAAAGAGATAGTATTTATTTCCGCTTT GGCGCGCCATATCATATTACCTTCATTAGTTTAGTTTTGCCCACTTTTTA TTAGGCTTATTCGGATATTTCGCATGTTTAGATTGGATTGTATGCCCAGT AGTGAGATCTCGCCTAATTATTGAAAAATGTTTTCTCCCCATTTTAGACT CGTTGGAAAGTTTTCAACCTGAGCTTGTGGTCATTTCTGGACTTCATTTA CTGGAAGGGCAAACCGAAGAAATTCGTAAAACAAAACTGGAAGATCTACG TCATCATTTACGTGCTATTGAAGAAGACACTCCCATACATTTAGAGTTGG CTAGTATGACTTCACCAAAGCTTATGGAAGATATTGCCTACATGATTTTT CCGATGGTCGACTCTGTTGGATTAAATGAACAAGAACTGGCTTTCTTGTC TTCATCTTTGAATGGACCAGGAGGAAAAGAAGAACTCACTCAAAGCCCAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:520444..535699-

>XLOC_037074 ID=XLOC_037074|Name=XLOC_037074|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2898bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:520444..535699- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCAGCAGCAGAAAGATTTGTTTCTTCTAAAGAAGTGTTTGAACAAATTGT
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GTCATTGTGTCAGCCACAAAAACCTTTTCAAAGTTGGGTCTGCAACCTTC
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AATGTTTTGCGTACTATTTTGAAAGATGTGCAGCAGCAGAAAGATTTGTT
TCTTCTAAAGAAGTGTTTGAACAAATTGTGCAGGCTGCCACAAATGTGGA
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AGGAGGACCAGTAGGAAAAAGATTGAAATCCATGCTTGATGGTCGGATCG
TGATTCCTAAGCAACTTCTACAAGAAGAAGACGAATACCATCTTATACTG
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CCGTTTCATCATATCACATGATAAGGCTAATGGTCAGATGGCTGCATTGG
ATAATTTCTTTAGTGCTACTAGGAGGACCAGTAGGAAAAAGATTGAAATC
CATGCTTGATGGTCGGATCGTGATTCCTAAGCAACTTCTACAAGAAGAAG
ACGAATACCATCTTATACTGGAATATCCGAGAGGTGAAAGCTGGGGTGAA
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AACCTGAGCTTGTGGTCATTTCTGGACTTCATTTACTGGAAGGGCAAACC
GAAGAAATTCGTAAAACAAAACTGGAAGATCTACGTCATCATTTACGTGC
TATTGAAGAAGACACTCCCATACATTTAGAGTTGGCTAGTATGACTTCAC
CAAAGCTTATGGAAGATATTGCCTACATGATTTTTCCGATGGTCGACTCT
GTTGGATTAAATGAACAAGAACTGGCTTTCTTGTCTTCATCTTTGAATGG
ACCAGGAGGAAAAGAAGAACTCACTCAAAGCCCACCAGAAATCGACTCGT
TGGAAAGTTTTCAACCTGAGCTTGTGGTCATTTCTGGACTTCATTTACTG
GAAGGGCAAACCGAAGAAATTCGTAAAACAAAACTGGAAGATCTACGTCA
TCATTTACGTGCTATTGAAGAAGACACTCCCATACATTTAGAGTTGGCTA
GTATGACTTCACCAAAGCTTATGGAAGATATTGCCTACATGATTTTTCCG
ATGGTCGACTCTGTTGGATTAAATGAACAAGAACTGGCTTTCTTGTCTTC
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AAATCGGGTTGATGGCTGACATATTAGATTGGGCTTTGAATACTTTTGGT
CGAAACACGCGATACGGTGGTGCTAGTTCACGCTTAACACGAATCCATTT
TCACTGCTTAATCTACCATGTTATTTGTGTACATGAAGGTTACTGGGGTA
ACGCTTTAGCCGCGACGGCTGCTGGATCGCGAGCAGCGTCAAGACAGGCT
TGTGATAAGGAAGATGTTTCGACTTCAGAACTGGAGTTACGTACACCGGA
ATACTTTGCACGTTCTGTACAGAATTGGCAACTACGCCGGAATTTAGTAA
AACATGACGATGCGAATCCTGTCACTCAATGGACGAATAATCATCTTAAT
TTTTATTTTAGTGCAGTTTTGGTTTGTAAGAAACCGAAGCGAACTGTTGG
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GAGGTTGATGGCTGACATATTAGATTGGGCTTTGAATACTTTTGGTCGAA
ACACGCGATACGGTGGTGCTAGTTCACGCTTAACACGAATCCATTTTCAC
TGCTTAATCTACCATGTTATTTGTGTACATGAAGGTTACTGGGGTAACGC
TTTAGCCGCGACGGCTGCTGGATCGCGAGCAGCGTCAAGACAGGCTTGTG
ATAAGGAAGATGTTTCGACTTCAGAACTGGAGTTACGTACACCGGAATAC
TTTGCACGTTCTGTACAGAATTGGCAACTACGCCGGAATTTAGTAAAACA
TGACGATGCGAATCCTGTCACTCAATGGACGAATAATCATCTTAATTTTT
ATTTTAGTGCAGTTTTGGTTTGTAAGAAACCGAAGCGAACTGTTGGTCTG
GGTGATTGTATTTCTGCCACAGGCTTACAGCAATCTAAATTTCTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037074XLOC_037074-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086_pilongenomesc0000086_pilon:520444..535699 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1006-1449:445
Aaloc694-1002:1308
Aaloc472-690:3080
Aaloc406-471:3365
Aaloc178-405:4038
Aaloc1-174:15257