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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000086_pilon:671153..675305- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037066 ID=XLOC_037066|Name=XLOC_037066|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4153bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:671153..675305- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTGCAGTATGAACAAACGTAGATGTGGCGTTGGTGTATCAGTTCT
AGATGAATTACTTTATGCTGTTGGAGGACATGATGGTTCAAGCTATCTCA
ACTCTGTTGAAAGATATGACCCCAAAACAAACCAGTGGAGCTCTGACGTT
TCCCCAACAAGCACTTGTCGTACAAGTGTAGGCGTTGCTGTTCTTGATGG
GTAAGATGCTCAATTTATTTTTTATGATATTTTACATGTATGTATTATTT
TAAAAATATTTGACCTTCTGCATTCCTTTTAATTGAGAAATTCCTTTAAT
CAAATTTAGAATTGGAAACATATCTATCAAGCATAATAATAGGGTGGGGC
GTCAAATGTCAAAGTCAGAAAATTCAAGATGTAGTGTTTTTTTATGAAAA
TTTAACCTATTGTGAGGCATTCTGCGCAATTCTTAAGGTCAAAAGTTCAA
AATTGGCCGAACCCCCCTGGGGGTACTGATTCGCACTACAGGCAATAATT
GGAAAAAATGGCATTTTCTGGCCGTTTCAGGCCTGTAAATATGTCAAAAC
TATTGCAAATCTTATTTTTTTCACTTGCTGTACTAAATTTTATGAAGAAA
CAACAAAATAATCATATTGGTTTGAAAATTGTACCCATTGGAGCCCTAAA
CGAGCCGTTTTAAGCCAAATTTGGGTAGCAAAATGCTTTTTAAGGCCAAT
TTTGCAAGCTCATAAACTTTAAACTAATTGATTCACATATCTGAAATTTT
CAGAGATGGAAGTCTTCAATAAAGTCTTTAAGCAAAATGAATTTCAAGTT
TTTCACTTTTTTCAATAAATCATAATGGCGTCTTCAAAAATCGCTTTTTA
GCAAAAAAAAATCATATTTCTCAAAAAATAGCATTTTTTAAGGCAAGCTT
CTACAAACTGAGTTTAAATGCTGACTGAAATTTTTTTTGTAGTGATAGTA
TACTGGAGATACTCCAGGGAAATCAAAATCATTTGCGTCTGGGATGGGTC
TATGTCCGCCATTATGGAAATAAAATTCCTGCTAAGAGCCATTTTTCAGG
CAAAAACCCAAATTTGGACTGAAAAAATCTCTAAAATGTCAATAGACATG
GGTCCAAATTTTTTTGCAGTGATAGTATTCTGGAAATACTGCAGGAAAAT
CAAAGTCATCTGGGCTTGGGATTTGGGTATATCCACCATTTTGAAATTGA
AATTCCTGCTAAAACGCAATATTTCAATCAAAAATCCAAATTTTGACTCG
AAAAATCTTAAAAATGGCAATAGACATGAACCTAAAATCTTTTTGCAGTG
ATAGTCTTCTGGAAGTACTCCAGGAAAATCAAAATCATTTGGGTTTAGGA
TTTGGGTATATCCGCCATTATCGAATTGAAATCTGTGCTAAAACTGGCTA
AATTGCAACATTTAAAGCAAAAATCCCATATTGACTTAAAAACTGCTCTA
ATATGGCAATAGACATGAACCTAAAATCTTTTTGCAGTGATAGTATTCTG
TAAATACTCTAGGGGTAAAAACTATTCAGGTATAAGATGCTTCTGGACTG
AAGCCAGTTTTAAAATGTATATAATATTTCAAGCTAAAATTCATCTTTTT
TTGACGGAACAAGTCTTGAAAATGGAAATGTAAGTGGGCTATAAAAGAAT
TGTTGAGTGAAATGGGATTTTTTAAATAATTTATTTCAACTAGTATTTCT
AAATTAAAGGATTGTAAATTCACACTCTTTGCTTAATATAATATACAAAA
TATTTAGTCAATTATGATGTATTTTAACAGAGATTTCATTTCCATAAGGG
TGGATGTAAACAAATCTCAGACTGAAATGATTTTGTTTTTCCAGGAATAT
TCACAGAATACTATCACTTCATAAAAATTTGGGTCCATGTCTATTGTCAT
TTTAGAGCAGTTTTTATTCAAAAACGGGGTTTTTGCTTGAAACGTTGTAT
TTTAGCCAGTTTTAACACATATTTCAATTCCATAATGGCGGATATACCCA
AATCCTAAACCCAAACGATTTTGATTTCCCTGGAGTATTTCCAGAAGACT
ATCACTGCAAAAAGATTTTAGGTTCATGTCTATTGCCATTTTTAAGATTT
TTTGAGTCAAAAATTGGATTTTTGATTGAAATATTGCGTTTTAACAGGAA
TTTCTATTCCAAAATGGTGGATATACCCAAATCCCAAGCCCAGATGACTT
TGATTTTCCTGTAGTATTTCCAGAATACTATCACTGCAAGAAAGTTTGGA
CCCATGTCTATTGACATTTTAGAGATTTTTTCAGTCCAAATTTGGGTTTT
TGCCTGAAAAATGGCTCTTAGCAGGAATTTAATTTCCATAATGGCAGACG
TAGACACATCCCAGACCCAAATGATTTTGATTTCCCTGGAGTATCTCCAG
TATACTATCACTGCAAAAAAAAAATCAGTCAGCATTTAAACTCAGTTTGT
AGAAGCTTGCCTTAAAAAATGCTATTTTTTGAGAAATATGACTTTTTTTT
GCTAAAAAGCGATTTTTGAAGACGCCATTATGATTTTTTGAAAAAAGTGA
AAAACTTGAAATTCATTTTGCTTAAAGACTTTATTGAAGACTTCCATCTC
TGAAAATTTCAGACATGTGAATCAATCAGTTTAAAGTTTATGAGCTTGCA
AAATTGGCCTTAAAAAGCATTTTGCTACCCAAATTTGGCTTAAAACGGCT
CGTATAGGGCTCCAATGGGCACAATTTTCAAACCAATATGATTATTTTGT
CGTTTCTTCATAAAATTTAGTACAGCAAGTGAAAAAAATAAGATTTGCAA
TAGTTTTGACATATTTACAGGCCTGAAACGGCCAGAAAATGCCATTTTTT
CCAATTTTTGCCTGTAGTGCGAATCAGTACCCCCAGGGGGGTTCGGCCAA
TTTTGAACTTTTGACCTTAAAAATTGCGCAGAATGCCTCACAATAGGTTA
AATTTTCATAAAAAAACACTACATCTTGAATTTTCTGACTTTGCCCCAAA
AATGACTGTTGACGCCCTACCCTAATAATAATTCTTATTTTATAAAGCTT
AATTTCATTTCTTGATAGTTATTTGTATGCAGTTGGTGGGCAAGATGGTG
TATCTTGTTTGAATATTGTTGAACGCTACGATTCCAAAGCTAATTCTTGG
TCACGTGTCACTCCAATGAGCTGTAGGCGTCTAGGTATGTTTTGATGTGT
AGAATTGGTGTAGTTTTTATCGATTTCCAATCAGTAAAAATTATAATTGT
TATTGATGTTATAAGGGTATTTAAATATTTTGAATATTTTCAAATTTTTG
AATTTTTAGATATATTGAGGTATGTTAGCTATCATCCTTTTAGCTTTTCA
TTCACTGTTCGATAGTTTTCAATTCAGAGAACTATTCTTCTTTTTGATTT
TCAGGGGTTGCGGTGTCAGTATTGGATGGATATCTATATGCGATTGGTGG
ATCAGACGGAACATCGCCTTTAGCTTCAGTTGAAAGGTTTGATCCAGCAA
CTAGTACCTGGACATCAGCCAAACAAATGGGAACCAAACGTAAACATTTA
GGTGCTGCTGTTTACCAAGGATGTATATATGCTGGTAAGAACAATCTTGA
AAGTATGATCTTAAGATGCACCTGTCTTGTAACACTATTCGTTATTTCTA
ATACAAAATAAAGACTGTTTTCTAAGCTAATGTGTTGCTTCTTTCTAACT
TAAAATCAGTATTATATACTAGGTGGTGAATCCCTTAACTTTGTGTGCAA
CATGGGCTGTCCAAAGTACTCATTAACCATGTCTGTTTGTTATTATTTTT
TATGATTTTAATTTTTTCCATTTATTCTAGTTGGTGGTAGAGATGATGCT
ACAGAGTTGAGCAGTGCTGAGAAATATGACGCAAAAAGTAACACTTGGAT
TCCAGTTGTGGCGCTGAACTCGAGAAGAAGTGGTGTTGGTTTATCAGTAG
TTAATGGACAATTAATTGCAGTGGGTGGTTTTGATGGTACAACCTATTTG
AAATCCATCGAAATTTACGACCCTACTGGGAAACAGTGGAAATTGCAATG
TGGTATGAATTACAGGAGGCTTGGAGGAGGTGTTGGAGTTGTGACGCTGC
ACCAATCTGAAGGTTATACGTGGGGTTATTTTCAAGCAGGTTGTATACAG
TAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:671153..675305- >XLOC_037066 ID=XLOC_037066|Name=XLOC_037066|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1638bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:671153..675305- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTGCAGTATGAACAAACGTAGATGTGGCGTTGGTGTATCAGTTCT
AGATGAATTACTTTATGCTGTTGGAGGACATGATGGTTCAAGCTATCTCA
ACTCTGTTGAAAGATATGACCCCAAAACAAACCAGTGGAGCTCTGACGTT
TCCCCAACAAGCACTTGTCGTACAAGTGTAGGCGTTGCTGTTCTTGATGG
ATGGTTTGCAGTATGAACAAACGTAGATGTGGCGTTGGTGTATCAGTTCT
AGATGAATTACTTTATGCTGTTGGAGGACATGATGGTTCAAGCTATCTCA
ACTCTGTTGAAAGATATGACCCCAAAACAAACCAGTGGAGCTCTGACGTT
TCCCCAACAAGCACTTGTCGTACAAGTGTAGGCGTTGCTGTTCTTGATGG
TTATTTGTATGCAGTTGGTGGGCAAGATGGTGTATCTTGTTTGAATATTG
TTGAACGCTACGATTCCAAAGCTAATTCTTGGTCACGTGTCACTCCAATG
AGCTGTAGGCGTCTAGTTATTTGTATGCAGTTGGTGGGCAAGATGGTGTA
TCTTGTTTGAATATTGTTGAACGCTACGATTCCAAAGCTAATTCTTGGTC
ACGTGTCACTCCAATGAGCTGTAGGCGTCTAGGGGTTGCGGTGTCAGTAT
TGGATGGATATCTATATGCGATTGGTGGATCAGACGGAACATCGCCTTTA
GCTTCAGTTGAAAGGTTTGATCCAGCAACTAGTACCTGGACATCAGCCAA
ACAAATGGGAACCAAACGTAAACATTTAGGTGCTGCTGTTTACCAAGGAT
GTATATATGCTGGGGTTGCGGTGTCAGTATTGGATGGATATCTATATGCG
ATTGGTGGATCAGACGGAACATCGCCTTTAGCTTCAGTTGAAAGGTTTGA
TCCAGCAACTAGTACCTGGACATCAGCCAAACAAATGGGAACCAAACGTA
AACATTTAGGTGCTGCTGTTTACCAAGGATGTATATATGCTGTTGGTGGT
AGAGATGATGCTACAGAGTTGAGCAGTGCTGAGAAATATGACGCAAAAAG
TAACACTTGGATTCCAGTTGTGGCGCTGAACTCGAGAAGAAGTGGTGTTG
GTTTATCAGTAGTTAATGGACAATTAATTGCAGTGGGTGGTTTTGATGGT
ACAACCTATTTGAAATCCATCGAAATTTACGACCCTACTGGGAAACAGTG
GAAATTGCAATGTGGTATGAATTACAGGAGGCTTGGAGGAGGTGTTGGAG
TTGTGACGCTGCACCAATCTGAAGGTTATACGTGGGGTTATTTTCAAGCA
GGTTGTATACAGTAATTGGTGGTAGAGATGATGCTACAGAGTTGAGCAGT
GCTGAGAAATATGACGCAAAAAGTAACACTTGGATTCCAGTTGTGGCGCT
GAACTCGAGAAGAAGTGGTGTTGGTTTATCAGTAGTTAATGGACAATTAA
TTGCAGTGGGTGGTTTTGATGGTACAACCTATTTGAAATCCATCGAAATT
TACGACCCTACTGGGAAACAGTGGAAATTGCAATGTGGTATGAATTACAG
GAGGCTTGGAGGAGGTGTTGGAGTTGTGACGCTGCACCAATCTGAAGGTT
ATACGTGGGGTTATTTTCAAGCAGGTTGTATACAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000086_pilon | genome | sc0000086_pilon:671153..675305 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 499-819:322 |
| Aaloc | 319-495:748 |
| Aaloc | 202-315:1085 |
| Aaloc | 1-198:4154 |
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