XLOC_036999 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036999
Unique NameXLOC_036999
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000295_pilon:163832..181071+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036999 ID=XLOC_036999|Name=XLOC_036999|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17240bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:163832..181071+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCAAGACCAATAATGGGGATGCTACGTCGATTGCTCTTCATTTCTCTACT GATCTACATTGTCCAATCACACAAACTTGCAAAAAGATCAACACCATCGT ATCGAGTAGAAGGTTGTTTTCGGTCGGCACCTGGTGGtggaaaatcacaa aatatggGTCATTCCGCATCTAATGTAAGATGTCAAGATATTTGTCGTGA CCATGGCTATATCCTTGCTGCTACCAAAGGAACAATGTGTCATTGTCGAA ACATCTATCCTCAAGGTCGTAAAGTAGCTGATAGTCAATGTCGAACGAGA TGTAGATCTTGGTTGTCTTGTAACAATGCACAAGAATGCTGCGGAGGTTC ACAGGCGTACACAGTCAGCGTGGTGGGAAATATTGATGTTGCAAAGCAAG TAAgttcaaaattcaatattatGAAATAGGTTGTTACTTTTATGGtggct ttttctgattttaacaAATAGGACTAATTCCACTCTACAAAGCAAACTTG CGAGTTACAGTATCAACATAGCAGGgggtctgaaaaataaaatgcttCCT CACAAAAAGTAGAAATTGTCACCAGATGCTATCAAAATGTTAGAAATCAA AGAATGGACATTTTCTTAAATATTATTGAATAACTGAAATCCACATGTAA ATCGGTTTGGTGTCTTTTAAAGCGCTTTCTAAATTTCAGGTTTTGAGAAG GATTGCGCATAAATGGCAAGTTAGCACTCATTATCGAAAACACATGAGGA ATTTTGTCAACAAACCACAGTTTAGACACGTAGAAGCTGATTGGTGGAGG AGTTTTGATGTAAAAGGTTGGAGTAATTGTCCGGATGGAACCTACATGAC TGGTGTTTGGCGTAACAACAATAATCAGGATAATGATGGCATCCACTTGA TCGAACTGGCTGAATGTAAAAGCGCTGCTGCCCATCTGTTTTCGGGTGAG TTGTCttattttacacatttttttgaGAGAACATCCGGAATTTCTAAAGC CGTgtcggatattcttaatttaAAGAGTTTAAactctaaaaatgttctta aaaaagtttgtattttgGTGTGTTTTCATAAGAAACCGGGTTTTGAGTCC ACAAAACCATTGGATGTTCATAAACAAGTTATGAAAGGCGCGAAAAACAA ATTGCCGTCTGCTTGAAAATCGCTAGctgatttaagcgtattataatata ccttaagtggagaaattttggcgtgaatttaatttggcgattggccaaaa tacgtcTTTGGCGGGATTTAATTcggcgatagatcaatttcgtaaaattt ggcggaGATTGGCaaattgccgaatttggaaaTTTCGGCGAGGATTTAAT TTAAATTCGCCAAATTCGCCAAATTTAATCCCCGCCAAAATTTATCCCCT TAAGGGTTCTGGCCATAGTAAATTTTTCATAATAATCATGCTTACAATGT ATTTTCTGACTAATGTatccaacaaaactatggcatatcataaattttct gttagactaaactattcctgaatctgaaaattcaaaaattgcattgaaaa aattcgaagaagaagaaaatgaagacatttgcgaagacaagtatttcaac tttgaggagcttattttcggcgaataaaaaagattttgaaaagttttttg cacTAGATGGTGTATCGATAACCAAACTAACaagagatttttggaaaatg tttgtaGAAGCTTCttcgtctcaaaatcttgaaaatagtggcttcatccc aattttttgtacaaaaagagtctaacttttgaaacatcaatttagaaagt ttttccgaaattttttagatagttttatcttttgcagacaatttaaaaaa attcgaaacaaaaaggttaattacatATTAAATCGTAGcaatttttgtat aagaaggTAATACAACATTTCATTATcgtctttttaaggttcataacgtc atttttgtaattaaattgctaattactcttgatagaataaattcagaAAC GACTTATgaagacatttttttgtttaaagtgTTAAGCTACGGGGACACGG AAACAATTTTTATGCGAttgcaacaaaaacatttttttgttgcaaTCGCA TAAATATGTTTCACTGTGTCCCCACGTTAAATCTCCTTGATTGGCAACTT TTTTCGCTCAAAGTTTTTGttgctgaaacaaaaataaaattcaaatcgat ttgaattttatttttgtttctgcacaacaaaattttcatgttgcAATTGA GAATCATACAAAAACCCTCGTGTCCCCTCACCTTAAGaagatttcttgaa aatttttttcattcaagcCAATCAAATTCGTTTATACAACTCAAAACAAA TAATGACATAATCTTCCCATTTTCAACACGCAAGACATCCGTTCAAAATG GTGGAGttgctttgatttcatttttatgattttgtttcgTGTGCTAGGCC TATACGACacggtgtaaaattttattgcGATTGCgacaatttgtttttgt tgcaattgCACAAAAATTGTTTCCGTGTCCCCTTAGCTTTACGGAACTGA AGACACAAATTTTATCTTCAAGTCTCATAACAAatcttttgactatggtc agagcccttaaggtagATAATTTGGAAATGCCAACTTATGATTATGTGAT TTCTTTTTATGgaatgagctggagtttttacaagatacttcactaattgg tcatttaaattGATAGAgttgacgcgttctttagaaaaagtaatgcgatt cttttattacatcttaacgaccaaccaaatcaaataagagcttgtaaaaa ctccagcttgtcccctttTTATAACTCCCCGTTATTTGTCTCGCTTGTCT TTTTCAGCTGGAAAGGGTGATCAAGACTGTTACAAACTCGATATCTGGAA AACATGGGACAGTAAAAACTGGGCCACCTGCAAAGCTGGTTATTACATGT CGGGAATTTACAATACTGAAGGACATCGTTTGCATAATATCGAAGAATTC CACTGCTGTCGACCAAAATCGCAACATAAAAGCTGGGGAAGTTGCTACAA CCACGATGCATGGGTCTCCTTGAACGATAAAGGTTGGACGAAATGCAACA ACGGCTATTATATGGTTGGCATGTATCGGAACGACTGCAATAATTTGTGG TGTATTGAGGAATTCAAATGTTGTCAAATGGGAAGTTATAATCAAGATTC GTACGTCGATAAACCGATCATTACCATCAAGGTAAAAAGATGCTTTTATG TGGTTGTTATGGGAGCTCATTCTTTGTTCCCTTTGCCTTTAGAATTTTGG ACCTTGACTTAAAAGTTTCTAAGTTTGATATTCACaggaaaaattttcga tttccaagattggaaatttcaaattttcttagttggaaaaaagataaaat ccaatggaaaatccaacctgaaaatgtgggacattctccaaggttgaaaa tattgcattttccatggcttggaattttcgtaaatccaggttgaaaaaag ccaaaatcccaatttaacaaggttggatttttcttaaatccaggttgaaa aaaagccaaaatccaaatttaacaaggttggaatttttttaaattcaggt tgaaaaaagccaaaatccaaatttaacaaggttggaattttcgaaaatcg aggttgaaaaacccaaaatccaaatttaacaaggttggaatttttttaaa ttcacgttgaaaaaagccaaaatccaaatttaacaaggttggaattttcg taaatccaggttgaaaaaagccaaaatccaaatttaacaaggttggaatt ttttaaaactcacgttgaaaaaagccaaaatccgaaaagtgatggcagag atgtggaaaagagatcttaaacaaggtttttgtgaacagtcactcgctag cctaggctcgatggctcccggtcaatctctcgttattgttcgcacagata cgtggttgatcttagatcactcacacagctcagcagggcgctatttgaaa ctatgacacaagtaccctatgtgcttcactgtgcgaactcactgcgattg accgaggccgctccgaagagacgcctcacctgacggaaacttacagcttg actgctcacattatagcctaatatctaggttagctatatatcaaaacagt tttgagcgaaaaatcgcttgtggttttcccaaggacatgcgcagaaaata gttagaaaaacgtaatttccaaatggatttttatttcttttaaattgcca acccaaaaagtctacatggatttttaacgttttccaaactgtttggagaa acacaaatttccaacccaaaaagtctagttttccaagaaagggtctTAGA TCTTAGATCTTAGGGTCTTAgatcttagaaaaatgtaatttccacatgga tttttaacgatttccaaactgtttggagaaacacaaatttccaacccaaa aagtctagtttttcaacttgaggtatcaaatttactaaaatatgtatttt cacatcgatttttgaccttttttttcaattcccaaactgtttggaaaata aaaatttcccacccaaaaagtcatgttttccaaccagccttggaaaattg tcatttctacatgggtttttttcacttgatttttcaagggcattggttta ttctacaaaacctatgggtaatttacgttttccaaatcagcttaaggtaa tcgctcaaatttccaactttcaattataaaactaaaatttccaacccaaa aatattgaatttccaaccttggaaatcgaaatttttttcctgtgattgCA GTGTGATGTCATCATCAGGCATAagctttcgcgagcagaaatttCCTCAC ATaagtaaatttgagaaaaattttcgcgagcatagactttcgtgaatcgt tggataaaTATCATgcatttcaaaagaattgacTTAAAAAGGACATTTTC CTCGAGGCTGAAAAGTATTGCTTAAGAATGTGCTAAATGCTTAAAATACt tgtaatttaaaatttatcacaaattcgaatttttacaatttattttaatt ttgtgaATTGCCTGTCCTGTCACACACACGATGATTCTACGAAGCCTTTT TTATTTCCTCTCTCAACCAGACTATGGGAACAGATGGTCGACTTAAAGAA TGCACCATGGATGCCATGGATAAAACTCCAGAAAGCAAGACCTATTCTTG TAAAGCTGTATCGTCAcgtcaaaacattttgaaattagatGCTGTCGAGT TCAAAGTCGAAGATAAGACGCAACCTACAACAGCAAAACCCGAACgcgtc aaaaacttcaaaccagTTATCTGTTCTGCTTCTAACAACGTCTACACTTG caccaaaacattaaaaacagcCATCGAGACAACCACAAGTCTGGTGATTG GAACAGGTTTTGAGATGGGCGTTTCCGTTAGTAACACAGTCGGAGTTTCA GCCGAAGCCTTTGGCGTCAGTGCTTCATCAGAGTTCTCAGTTCAAGTTTC TGCATCAACTTCTTTCAACGTCGAACGAACCAAATCGAAAACCATTACTG TTGAAGACGAAACTAAAGTTGATGTCAAAGTCCCTGCCCACAAACAAATC ATGATCGACCTCCTTCGCAAGAAAGTGGATATTATCTATAAATGGAAGGG TATTTTCCGCCTTCTTGGTAAATACAAGCTCTCTTGGAGTAATGGTGATC AAACCACACAGGATATCACTACAGTCTTGTCTGGTACGAACCGAGACATG TATGCTTTTGGCACCTGGAATTACCCTGGTACCGACGTCCTTCAAGTTTT GGTGACTGATCAATACGGTAACAAGAAGACTGAATGTCAACACAAAACTG GATCTAAAAAAGACTGTTCCGTAGCAGGACTCTGACAGcttttcaaagtt tcaaaatagACTTGAACATTTAGTTTATGTTCCAGTTACTTTAACCATTA TAGGTATATTTTATTTAGCTCgtaaattgtaatttttaattaatgTCAGA TTATTTCACTATCAAATCATCAATTCTGAGGAGTAAATCACTCTCTTTCA GGAATTTTTAAGACATTGTATTTTTGGGGATTTTCAGGTATAAcaggatt ttttttaaattgaacaatatttatttcaaattgaacaatattttttcgag taatttaccCCTCACTGTAGCACACTTTCCTCGAGATCTTCTATGCACTG CCTAAAAATTCCAAGGTTCCTATACTTATGAAAATACAATCTCATTCCTT CCTTTATCACTTATAcatattatttttgaaagttttaccgTTTCCGTCAA TCCGGCTAGGTCCACAAATACTTCGACGTGTTCTGTAACTTATCAAAAGA ATGAACTAACTTCTAGAACTCTCTGAAGCCGTACAGGTGTAAAGCTTGGT TTTGGTATagcaaaaaaatggaaagagcaaaaacaaaaatttttaaacta caaattttaactaatatttcaaagaccactttataaagaaaatgagtAAT TTTTAAGTATACCCTCTAAAACTAAAGTAAAACTTGTTTCCAAAACTCAT TGAAGTCGGGTAAAAACcataaatttctgaaatttcagcccaagGATTAT GAACTCTTTGGCTTCAAATAACAAGGGGTTTGAAGTTAAAAGGGTGCTTT TACTTGCAAGCAAAAATGGTATTTTCACAAAAGAAATTTACTCCGAAGAA CAACATTCTAAATGCACGTTTTTTCAACCCGTCTGAATGCTAATATACAT ATCAATATCTGTTCCCATAATATTGGCAGTCCATTGCTATCGAAGGGATT atgttttttagattttttaccttttttaaatGTAAGTCAAAGCCCTGCAA AGTAGGCAAAATGATCCTTCGTTAAAAGAAAGATCAGGGGCGTTACAGCC GCATGGTTCTAAACCCACAGGGTACTAACCCTGATTTCAGAGAAATTCGT CTTAGGTACCACAATCCCCTTTTTAGTACCGGTTACTAACTTATTTTGAG TCCATTTCACCTCCCCAAAGAAGAGCTCTGAATCTGGAAAGTTTTCTACG Acaatgcaatttttcaaaattagaaaaatagaaaatcgaaaaatattttt agagttAGTTCATGTAATGTTTCCAGCGACTTTCCAGAGAATTATTGTTC TTTAAACCGTAGAAAAGCACGAAGTACAAAAAGTATTGAATATGTAGGGG TGGTAGTCACTGACCATGATCGGGGTTTGGGACGGaaaaatatgtcgttt tttgatggttagggtttgttgttctttttgtcgctttttaatagttattt gtcgttctttttagatggtctggaaacgttagatggacAGTCATGAAGTC TGATTTTATTTCTcggaaaattaggaaaatttcCAATCTGATTTCCCAAA ATAGGTAAAGTTTTACCAAATATCAAATTCTAGTACCAGGTACTAGCTTG AAATGGGTGAAATACTCACAACCACCCCAAATGAAGTACCATCttttttt AGATTCAAAATTAGACACCATCACTCGGCTATTGGTCAGCACCCTAGCGC TGTACTCCCTCTGAAGAGATATAAAAAATCGgaaaacatatttgaaatct cagtaaagttgaaaatttcggaaaattattgattttaaatttttggtcaa gtagaaaaaatcttcatattttattttcaactttcatcttcattttcaaa attttcaaaagatagaGGAGGTATTTATTATATCTGTTTCACTTCACGCG ACttttttttATTGGAGCAGACTTTAGTATGATTAAAAGCACCAtcgaat atttctattttgAGACATACAACCATTGACTTAAAAGCCCCAAAGATTTG ATAGTCTTACTTCTTTTCCAACCAAAACGcgtgtggttttcacacaaacg ccagtTTGAAATTACAACCCATTCGGCTGATTTCGTAAGATATGCCGctt aaaaacaaagcaaaaggtctagattcaatccgtcattctagatgtttaac tttttcttgcttgagaaaggttgaagattcctgaTTTCTGTAGCCCCTAA TGGGCTTTAAATAAACTCAAAACCTCCGAATCGACATTTTCAAATATGTT AATAGGTATATCAAGCAACGAGAAGCCACGGTTTGACAGGGGAGTAAGGC ATAAAGTCGTCAAATTCACCCTGTCATTATAGTATCTTCCGCAAAAATGA AGtccttcaagtcgtcccgtcgtcctagaagtcgtcccgtcgcaaTTTTC GGTAGTCGAATCATCCCAAGtttcaagtcgtcccgtcgcactAGAAGTTC GCAGGTCATAACTCTTTTAAGTCGAACCATACCAAGTTTCTAGTGGTTCC TATCAGAAGTTAACTCGTCGGAACTTGGTGCATGTTCCAATCATGTACGT TTAACTGTTTTCATGTCATCCATCAGGtatattatggagataaaaatata aattcactttgttttcaaaattttgacatggTAGTTTTTAAGCTCTAATG AATAAGTAAATTTCCACACGTGTGTTTCCACCAACTTCTATTTTGAACAT TGAAGTTTTCCAGGGTGGCCACACttattttagatgaaaaatcCAGCTTT TTGGGTCAAAAACATCCTTTTTTCCAGGTATTTTCAGCTGGAAAATGTAC CTTTTTCCAGCCTTCACCCCAAAAATCTGTACTTTTTTCCAGCTATAAGC GAGTGCAAAATTATTACCAGCGGATACCCCtcaaaacctacaaaaaatag AGGTACCCTATCTGAAAACGTAGGTGGAATTTTAGGCTGAAACTTTTAGT GTTGAAAGTACAGGAAAGTACGCTGTCTGTGGTTcctaaaaaatggtttt tctccaataacttttttataaaatggtCCTTTTGGTCTCCAACGggacct aaatattttcaaaaacgtacgttaaaatcaaaatacaactTAAAACCTAA ATAATAACTTTGTGGGCCTTAAGATTTGTTTGGGGTCTAtccatgaagaa gaaaattatttttttcatacctactATAAGTATAGGTACCAAAAAGTATA GGTTTAAGACCTTAAATTCAACTAGTCGTATgtgcagcgtcgcacgctgt gTATCCCAATTCAGCGAATCACTATACATATAAAAAActctaaaagaaga aagatagctgCCGAAATAttaatgatacaattttcattttatgaaagaaa tgagaaaaaagataagaatgcattgcaatttttaaccacaattaagtaaa tggcttagaagaattatatttttatattcttaTAGATCTTATAGATATTC TATAAATCtttttagccatcgtggctggacattcgagggtgactttaatt gaaagtgatagggagccgctattgcaaacagaaagttttaaagagcatct gaataggaattcttcaaaatgaaaaattatatttgggaAGAGGGTTGATT TTTAACCCATCCAGCTCCAATCTTCCTGTATATAAAATGGTATCTTGGca tctcaaagttagtctagtggtaggataTCTGCATGAGGCGAAAACGATGA TGGtccaacgccatgaagaggaggctttgtagagctttgttagattttta aaaactttttacaaaacattgtaaacacacacgttttagcgtattactat taatatatagattgtgtaatttctaggtccgaaaaattaattttttgatg tGATTCTTGATAGAATTTAGATAACtttgaattttataacactttgcGAT AATTGAAATTCTCGAAATTAGGTATATATTTCATGAAagtacatttataa gaggttgttaAAAAGTGAACTAaacaatattaaattaagtttggtggctA AGAGAGCCCATAGTGCagctttgtaggttttaaggggtatccactggtac ttctagattttcaaaagacatttctttcaaatcggtcATAGAGATCTATC CTTTGACAAAAATATGTCTGATAAACTaaactgaaaatggctgaacTTAT ACTAGATAACATCTAATGAAAATTATATATGTATAATCACATAATAATTC TAACTATTCTAAactaattaaaatttcaaaaaagtttttccagtttttcc agctttcctgtttggaaaatgtacctatttccagtttttccagctagttt tcagaaaaaggcCATTTTCCCAGTTTTCCCTGGATGAGCTCTGCACGTGT ACAAAAACTGCACACCACACGAACATAACATTATCtccacaatattttga tttttgatatacgaaacaataaagttttttttcggaatAGCCTAGAGTCC AACTCTTTGGGATGAGTCGACTGCCGAAATTTGCGACGAGTCAACTTCTG AGGCAACGACTCGACTTAAAATTTGGAATGTTTCGACTTCCAAAAGATTC CGACTTGCGAATTTCTAGTGCGACCTGCGGACTTCTAGTGCGACGAGACG ACTTAAAagtacgacgggacgacttgaaggGTCGAATTTTGGCGGTGATC TAACTTTATAAAAGCAGGTAAAAAGCAAATTTTAGagactttgaaaaatg tttcattttcgCTTaaaaaaaTAACCATTCTTAGTTCAACTTAAAGTAGT GACAACCATTGCTGATGCTTAATACCCTGACGATGATTTCTAAGCGATCG ATCCTCAAGAATTAAAGCTATAAGATCAGTTAAGACGTGAAAATCACTTt gactttcacaaaatttcagatcaaactcaaaagttaacTGGGTCGCTTCA GCAAATTTCAGCTATGGAAGCTGAGCTTCTCTCAATAAAAACTGTGAAAG AGATAAGTTAGGAAAGGAGAACTCagtattctttttttataccttatcgg ctctttttacatcggcccttattggcgttattttttgactcgtggcgtaa taagggccggcgtaaaaaagggccaagattttgcaattttaacctaaaag cggcCTTAATTTtgtatcattatttctcaatttaaaggattttaggtatg taTCAAAGACGAAAAtgatccattgttttactccacaTTTAAAACTtctg tgaaatatttaatatatttaaaaatcagtgatttttgatggaattttcaa cagattgctactgaaaatgacattttaatgtaagtTTTGGTTATTATTTG CTAATTTGAAGTATAAGtagtagccatttttacaaatgttgGCGTTATTA ACAGCCCTAATTGGTGTAAGCCATGGCGTTCTtcgcgtaagcccaaaatt aggctgtggcgtaataagggccggcgtaaaaagggccgataaggtaaacT AGGCATATAAGCTGTACGTAGCTTCATAGCTATTACcccgattttttcag aaattttgctaGGTCGCTTCACAGCTATTTCTAGCTATGTCTCTTGGCTT TTTATTACCTCTAAATGAAAGGCGGCCAGTAAGATACGCAGTCATTAAAG GTCATTACACGTGAATATTAAAAGAAGCTGAGTTCGATAATGATATGATC CCGATTTGCTAGGGCGGAGGAGGTCAAAATCGACGTCTCTAAGTCACTCA AGCGAACGATATGGGTCGGGCGGTATTAGATAGGTTTTcggattatcaaa ataaaagcctCTAAATAGCGAAAGGTTCACTCGCGAAACATTAGGGAGGT AAAATTACGGGGATAAAtgtagcctgggtatccagactcaaaattttaga aaaaaactcttactcatcatacaaagtttctaaaattttagagtccggtg caactaaaaaagttgggtacagtttgtttgatactgtctgtgagtgaacc cttgttaacagactatcaaaactgtGTAAAACCATgcagacacacataat caacttactataaaacctcttttacaaactcaaaaaactttcaaaactac tttaaactacatcaaaacatcgccacatttaaaaaaGCTCGTTTCCagtg gccattttgtttagaaatgaacctgtgttttcattttcatttgtttatct ttttttgcaaggtcagctttttccttAAATTATGTGCGCGcatagaaaaa taacaaaatcccGCGGAAATTCTGATCAGTGACTGGTCGCGTATTGGCCA ATCACAcgcactcgcatatgcagggacaaatatccctgcagacgagttaa tTGGACCaaaccgtaaaccagagacaagataataaaaaaatagacggtga aatagtttacggtctggatatccaggctaggatAAATGTTATTCTAAGTT TAAACTGCCGTACGAATAAGACTTGAGAGGATACAAGACATGGGGTCCGA AGGAGACTTTGTATCactaaaaagaaaaggaagcgagtttcacaattttt catctttttcaaattctcgGAGCTCTGTCATTTGACCTACTTGACCTACC CTAAATACACCTCTACCATAACCTTCCAACTAATTGTCAGATAATAAGAA ATTTGGTATCGAAAAGATATTTAGATGCGCTtataaaatttgtcaaaaac ttTAACTTAAAAACCAATTTTCTACCATTCTGATTTGTTTCCTTTTTCTC TGATGGTGTTTCGAAGTACAAATTGAAGAAATAAAGTATGGCGGTATCTC GCTGTTAAACATCCCATTAGCCAGGGGACcactagcgagcacctcactaa aaaccgggattttttgcaaagtggaatagacgttaattgcgtaacaaaac gcgggtgacgtctagtataggctagggGACAACTCAAAGTTTTTTGATTA ATTGGATGGCTCTAATAAGTAGCCCAGCGTAATTTGGCAGACtccatttt ttggctttgctgAGGCTTTAGCAAATCCATATCACTAGATCCAGTCTTTT TATggagagaaaaaaacaacagaaaatcaTGACAAATAGACAAATATTTC ATTCACATCGATTTCCCTAAAGATTTGAAGTGAGAACAAATGGCCATAGG TCGTGttcatttcaaagttttttaatttaGTTTAATTCGATTATAATCAC TAAGGATAAGTGATACTAATTGATTTTCCATATATCAAAAGAGCACTGCT AATATTAGCTTTAAGgggttttgtgaaaaaaatttaattaaaaatgccac aaatgacttttttataaaatttcaaccaatggGAATCAAGCATAACAGTG ATGCGTGTATTATTTCAATCTTTTAGTCATATTTCCGCCCTTGTGAATTA AATGCTCACTATTCTCTTGGGAGTTCCCTTTTGAACAAAGAATCGAATAA ATACCACAAATTTTTgatcaacaatcaaatcaatcatTCAGTCAATGAAT TGGTATCAGATCGTCGAACTTGAGAGGTAGGTTGAAACAATTTTGGTAAA ATGTGATTTAATGTTAGAGAGAGATGACATAAAACGATAACTTACCAACT TATAGGTGTACAAAGATTCGTTTACATGTCACAGATCATTAGGGGAGATT ATATTTCAAGATCGCTATTTATTTGAGGTTTTCTTTCACCACTGGCATAC GTGAGAATAAGGAACTATAAAACTCGAAGGTTTTAACGGGGTTTTAACTT CAGTAATGATTTTCTACTTGTAGTTCAAGACCAATAATGGGGATGCTACG TCGATTGCTCTTCATTTCGCTACTGATCTCGATTGTCCAATCACACAAAC TTGCAAAAAGATCAACACCATCGTATCGAGTAGAAGGTTGTTTTCAGTCG GCCCCTGGTGAtggaaaatcacaaaatatggGTCATTCCGCATCTAATGT AAGATGTCAAGATATTTGTCGTGATCATGGCTACATCCTTGCTGCTACCA AAGGAACAATGTGTCATTGTCGAAACATTTATCCTCAAGGTCGTAAAGTA GCTGATAGTCAATGTCGAACGAGATGTAGATCTTGGTTGTCTTGTAACAA TGCACAAGAATGCTGCGGAGGTTCACAGGCGTACACAGTCAGCGTGGTGG GAAATATTGATGTTGCAAAGCAAGTAAgttcaaaattcaatattatGAAA TAGGGTGTTACATTTATGGtggctttttctgattttaacaAATGGGACTA ATTCCACTCTACAAAGCAAACTTGCGAGTTACAGTATCAACATAGCAGGg gatctgaaaaataaaatgcttCCTcacaaaaagtagaaattttcaCCAGA TGCTATCAAAATGTTAGAAATCAAAGAATGGACATTTTCTTAAATATCAT TGGTAACTGAAATCCACATGTAGATCGGCTTGGTGTCTTTTAAAGCTCTT TCTAAATTTCAGGTTTTGAGAAGGATTGCGCATAAATGGCAAGTTAGCAC TCATTATCGAAAACACATGAGGAATTTTGTCAACAAACCACAGTTTAGAC ACGTAGAAGCTGATTGGTGGAGGAGTTTTGATGTAAAAGGTTGGAGTAAT TGTCCGGATGGAACCTACATGACTGGTGTTTGGCGTAACAACAACAATCA GGATAATGATGGCATCCACTTGATCGAACTGGCTGAATGTAAAAGCGCTG CTGCCCATCTGTTTTCGGGTGAGTTGTCttgttttacacatttttttgaG AGAACATCCGGAATTTCTAAAGCCGTgtcggatattcttaattttaagag tttaaaaaattttaagtttgtatttaggtgtgtttttataagaaaccgGG TTTTGAGTCCACAAAACCATTGGATGTTCATAAACAAGTTATGAAAGGCG CGAAAAACAAATTGCCGTCTGCTTGAAAATCTCTAGctgatttaagcgta ttataatataccttaagtggataaattttggcgtgaatttaatttggcga ttggccaaaatacgtcTTTGGCGGGATTTAATTcggcgatagatcaattt cgtaaaatttggcggaGATTGGCaaattgccgaatttggaaattttggcg aggatttaatttaaattcgctaaattcgccaaatttatcCCCTTAAGGAT TCTGGCCATAGtaaatttttcataataatCATGCTTACAATGTATTTTCT GACTAATGTatccaacaaaactatggcatatcatacattttctgttagac aaactatacctgaatctgaaatttcaaaaattgcattgaaaaaatttgaa gaagaagaaaatgaagacatttgtgaagacaagtatttcaactttgagga gcttattttcggcgaataaaaaagattttgaaaagtctTTTGCACTAGAT AGTGTATCGATAACCAAACTAACAatagattttggaaaatttttgtaaaa gcttcttcgtctcaaaatcttgaaaatagtggcttCGTCccaattttttg tacaaaaagagtcaaaacttttgaaacatcaatttagaaagtttttccga aaatttctaAATAGTTTTATCTTTTgcagacaatttaaaaaaattcgaaa caaaaaggatAATTACATATTAAATCTTAGcaatttttgtataagaaggT AATACAACATTTTATTATcgtctttttaaggttcataacttcatttttgt aatcaaattgctaattactcttgaaagaataaattcagaaacgacttata aagacaattttttgttaaagtcTCATAACAAatcttttgactatggtcag agcccttaaggtgcATAATTTGGAAATGCCAACTTATGATTATGAGATTT CTTTTTATGgaatgagctggagtttttacaagatacttcactaattggtc atttaaattGATAGAgttgacgcgttctttagaaaaagtaatgagattct tttattacatcttaacgaccaaccaaatcaaataagagcttgtaaaaact ccagcttgccCCTTTTTATAACTCCCCGTTATTTGTCTCGCTTGTCTTTT TCAGCTGGAAAGGGTGATCAAGACTGTTACAAACTCAACATCTGGAAAAC ATGGGACAGTAAAAACTGGGCCACCTGCAAAGCTGGTTATTACATGTCGG GAATTTACAATACTGAAGGACATCGTTTGCATAATATCGAAGAATTCCAC TGCTGTCGACCAAAATCGCAACATAAAAGCTGGGGAAGTTGCTACAACCA CGATGCATGGGCCTCCTTGAACGATAAAGGTTGGACGAAATGCAACAACG GCTATTATATGGTTGGCATGTATCGGAACGACTGCAATAATTTGTGGTGT ATTGAGGAATTCAAATGCTGTCAAATGGGAAGTTATAATCAAGATTCGTA CGTCGATAAACCGATCATTACAATTAAGGTGAAAATGCTTTTATGCCCTT TGAATTTCGGATCTTAACTTAAAAGTTTCTTAAGTTTGATATTGTAGTGT GTTCATGACAGGTTGATTgaacaaactttcgcgagcagaaatttCCTCAC ATTAACTTTagcgaattaaaaaaaaaaaaaaattcacgagcatcgtgaat cgttggataaatatcataaatttcaaaagaattggcCTAAAAAGAACATA TTCCTCGAGGCTACAAAATATTGAATAAGAATGTGCTAAATGCTTCAAAT ATACTTGTAATTTATGATTTATCACAAAGTCGGATTTTaacaaaattcta attttttaaagaaattttgtgcATTGCCTAGTTTagaattttcgaagaaa aatttcCCATTAAAAGAAcccaaaaatcgcaaaaattccTTAGAattctt ttctaaaatttatatttttcatcgATGTCTACCAAATATTCTTATATCCA AGTAAATCTGTGGGTTTTAAGGTTTGACTTGTCGTACCAGAAAGATTTCA TCCAGTCACACACACTAATATTCTACGAAGCCTTTTTTATTTCCTCTCTC AACCAGACTATGGGAACAGATGGTCGACTTAAAGAATGCACCATGGATGC CATGGATAAAACTCCAGAAAGCAAGACCTATTCTTGTAAAGCTGTATCAT CAcgtcaaaacattttaaaattagaTGCTGTCGAGTTCAAAGTCGAAGAT AAGACACAACCCACAACAGCAAAACCCGAACgcgtcaaaaacttcaaacc agTTATCTGTTCTGCTTCTAACAACGCCTACACTTGcaccaaaacattaa aaacagcCATCCAGACGACCACAAGTCTGGTGATTGGAACAGGTTTTCAG ATGGGCGTTTCCGTTAGTAACACAGTTGGAGTTTCAGCCGAAGCCTTTGG CGTCAGTGCTTCATCAGAGTTCTCAGTTCAAGTTTCTGCATCCACTTCTT TCAACGTAGAACGAACCAAATCGAAAACCATTACTGTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000295_pilon:163832..181071+

>XLOC_036999 ID=XLOC_036999|Name=XLOC_036999|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3150bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:163832..181071+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCAAGACCAATAATGGGGATGCTACGTCGATTGCTCTTCATTTCTCTACT
GATCTACATTGTCCAATCACACAAACTTGCAAAAAGATCAACACCATCGT
ATCGAGTAGAAGGTTGTTTTCGGTCGGCACCTGGTGGtggaaaatcacaa
aatatggGTCATTCCGCATCTAATGTAAGATGTCAAGATATTTGTCGTGA
CCATGGCTATATCCTTGCTGCTACCAAAGGAACAATGTGTCATTGTCGAA
ACATCTATCCTCAAGGTCGTAAAGTAGCTGATAGTCAATGTCGAACGAGA
TGTAGATCTTGGTTGTCTTGTAACAATGCACAAGAATGCTGCGGAGGTTC
ACAGGCGTACACAGTCAGCGTGGTGGGAAATATTGATGTTGCAAAGCAAT
CAAGACCAATAATGGGGATGCTACGTCGATTGCTCTTCATTTCTCTACTG
ATCTACATTGTCCAATCACACAAACTTGCAAAAAGATCAACACCATCGTA
TCGAGTAGAAGGTTGTTTTCGGTCGGCACCTGGTGGtggaaaatcacaaa
atatggGTCATTCCGCATCTAATGTAAGATGTCAAGATATTTGTCGTGAC
CATGGCTATATCCTTGCTGCTACCAAAGGAACAATGTGTCATTGTCGAAA
CATCTATCCTCAAGGTCGTAAAGTAGCTGATAGTCAATGTCGAACGAGAT
GTAGATCTTGGTTGTCTTGTAACAATGCACAAGAATGCTGCGGAGGTTCA
CAGGCGTACACAGTCAGCGTGGTGGGAAATATTGATGTTGCAAAGCAAGT
TTTGAGAAGGATTGCGCATAAATGGCAAGTTAGCACTCATTATCGAAAAC
ACATGAGGAATTTTGTCAACAAACCACAGTTTAGACACGTAGAAGCTGAT
TGGTGGAGGAGTTTTGATGTAAAAGGTTGGAGTAATTGTCCGGATGGAAC
CTACATGACTGGTGTTTGGCGTAACAACAATAATCAGGATAATGATGGCA
TCCACTTGATCGAACTGGCTGAATGTAAAAGCGCTGCTGCCCATCTGTTT
TCGGGTTTTGAGAAGGATTGCGCATAAATGGCAAGTTAGCACTCATTATC
GAAAACACATGAGGAATTTTGTCAACAAACCACAGTTTAGACACGTAGAA
GCTGATTGGTGGAGGAGTTTTGATGTAAAAGGTTGGAGTAATTGTCCGGA
TGGAACCTACATGACTGGTGTTTGGCGTAACAACAATAATCAGGATAATG
ATGGCATCCACTTGATCGAACTGGCTGAATGTAAAAGCGCTGCTGCCCAT
CTGTTTTCGGCTGGAAAGGGTGATCAAGACTGTTACAAACTCGATATCTG
GAAAACATGGGACAGTAAAAACTGGGCCACCTGCAAAGCTGGTTATTACA
TGTCGGGAATTTACAATACTGAAGGACATCGTTTGCATAATATCGAAGAA
TTCCACTGCTGTCGACCAAAATCGCAACATAAAAGCTGGGGAAGTTGCTA
CAACCACGATGCATGGGTCTCCTTGAACGATAAAGGTTGGACGAAATGCA
ACAACGGCTATTATATGGTTGGCATGTATCGGAACGACTGCAATAATTTG
TGGTGTATTGAGGAATTCAAATGTTGTCAAATGGGAAGTTATAATCAAGA
TTCGTACGTCGATAAACCGATCATTACCATCAAGCTGGAAAGGGTGATCA
AGACTGTTACAAACTCGATATCTGGAAAACATGGGACAGTAAAAACTGGG
CCACCTGCAAAGCTGGTTATTACATGTCGGGAATTTACAATACTGAAGGA
CATCGTTTGCATAATATCGAAGAATTCCACTGCTGTCGACCAAAATCGCA
ACATAAAAGCTGGGGAAGTTGCTACAACCACGATGCATGGGTCTCCTTGA
ACGATAAAGGTTGGACGAAATGCAACAACGGCTATTATATGGTTGGCATG
TATCGGAACGACTGCAATAATTTGTGGTGTATTGAGGAATTCAAATGTTG
TCAAATGGGAAGTTATAATCAAGATTCGTACGTCGATAAACCGATCATTA
CCATCAAGACTATGGGAACAGATGGTCGACTTAAAGAATGCACCATGGAT
GCCATGGATAAAACTCCAGAAAGCAAGACCTATTCTTGTAAAGCTGTATC
GTCAcgtcaaaacattttgaaattagatGCTGTCGAGTTCAAAGTCGAAG
ATAAGACGCAACCTACAACAGCAAAACCCGAACgcgtcaaaaacttcaaa
ccagTTATCTGTTCTGCTTCTAACAACGTCTACACTTGcaccaaaacatt
aaaaacagcCATCGAGACAACCACAAGTCTGGTGATTGGAACAGGTTTTG
AGATGGGCGTTTCCGTTAGTAACACAGTCGGAGTTTCAGCCGAAGCCTTT
GGCGTCAGTGCTTCATCAGAGTTCTCAGTTCAAGTTTCTGCATCAACTTC
TTTCAACGTCGAACGAACCAAATCGAAAACCATTACTGTTGAAGACGAAA
CTAAAGTTGATGTCAAAGTCCCTGCCCACAAACAAATCATGATCGACCTC
CTTCGCAAACTATGGGAACAGATGGTCGACTTAAAGAATGCACCATGGAT
GCCATGGATAAAACTCCAGAAAGCAAGACCTATTCTTGTAAAGCTGTATC
GTCAcgtcaaaacattttgaaattagatGCTGTCGAGTTCAAAGTCGAAG
ATAAGACGCAACCTACAACAGCAAAACCCGAACgcgtcaaaaacttcaaa
ccagTTATCTGTTCTGCTTCTAACAACGTCTACACTTGcaccaaaacatt
aaaaacagcCATCGAGACAACCACAAGTCTGGTGATTGGAACAGGTTTTG
AGATGGGCGTTTCCGTTAGTAACACAGTCGGAGTTTCAGCCGAAGCCTTT
GGCGTCAGTGCTTCATCAGAGTTCTCAGTTCAAGTTTCTGCATCAACTTC
TTTCAACGTCGAACGAACCAAATCGAAAACCATTACTGTTGAAGACGAAA
CTAAAGTTGATGTCAAAGTCCCTGCCCACAAACAAATCATGATCGACCTC
CTTCGCAACTTCTTTCAACGTAGAACGAACCAAATCGAAAACCATTACTG
TTGACTTCTTTCAACGTAGAACGAACCAAATCGAAAACCATTACTGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036999XLOC_036999-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000295_pilongenomesc0000295_pilon:163832..181071 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1531-1575:17196
Aaloc1030-1527:5121
Aaloc658-1029:2860
Aaloc400-654:690
Aaloc1-399:1