XLOC_036992 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036992
Unique NameXLOC_036992
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000077_pilon:1108970..1122994-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036992 ID=XLOC_036992|Name=XLOC_036992|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14025bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1108970..1122994- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGTATAAAAGCACCATTTTGGAGTTCGAAAGTCGAATAATTTATCTTAAA AATAACGTCTTAGCATTTAGGATAGGTCACTCCATTGGGCTCTTCCAGAA AAAAAAATTGAATATGGGGGGGGGGTTGGAGGATATAACATTTTTTGGAA ATTTAACCCCCCCCCCCCCGGACATTGTGAATTTTGACCCCCCCGGACAA CGGATCTCACCCCCCCCCCCGGACAAGCATCAGTTGACCTCCCGGACAAG CATCAGTTGACCCCCCGGACATTCAAAATCACCCCTAATCAGAGCAAATT TACCACTAAAACAAGGCAAGTTTTGCAGATTTTTCACTACCCCCTGACAA AATATCCAATATATCCTCCACCCCCATGTACAAAAATGTTCTGGAAGAGC ACATTAATACATGGGTATTTAGAATAATATAAGAAGGTTACTCAAAGTTA AAAATAAATTTAGATAATTTGGTTTGCACCCTTCCAAATTTTTTACTAAT CTTTTCCGTAGAGAATGGGAAAGTTGGTGGTAAATTAGTGGGTATTGTCA CTAACCGAGATGTTGACTTCATCTCACCTGAAGATCATGAAAAACCAGCG TCAGAGGTGAATTCTTTTTTAACTCATTTGATAATATGCAATTTTTTTCA CATACGAATATCTAGAGTTCGGACTAGGATAATCTGGAGGTTTTCATGTA ATATAATCTCTACCATTGCGGTCGATTTGCGTAAGGAATCACCTCTGCAA AATTTGTTCTTCCATATTGGTCGATTTCCCGTTAAAGATACATAGCTTTG CCGAGCCTGAAAGCCTTTGGATCCCCTGCCTCGTCAGCCATTTCTAACTT AAGGAAGATATTTTTAGAATTCAATTTTTGTTTTTACTGACGGGTTTTTT ACCATGCTTTTTACCATGCTTGAATTGTGCATAGAAACATTTTTAGTGTT 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CTCGATTCTTCACAAGGAAATTCATCCTTCCAAATCGAACGTATCAAAGA AATCAAAGCCAAATATCCTAATCTAGAAGTCATTGCTGGAAACGTTGTCA CTGCTGCACAAGCTAAGAATTTAATTGATGCCGGCGCTGATGGCTTACGT GTGGGTATGGGTAGTGGATCCATTTGTATCACACAAGAAGTGTGTGCTGT TGGGCGGCCCCAAGGTACTGCCGTCTTTTACGTCAGTGAATACGCCCGTC GTTTCGGTGTTCCTTGTATCGCTGACGGGGGTATTTCAAATGCTGGACAC ATCATTAAAGCGTTAACGCTGGGAGCATCGACTGTGATGATGGGCTCGTT ATTAGCTGGTACTTTTGAAGCGCCTGGTGAATACTTCTATCAAAATGGCG TTCGTTTGAAGCGATACCGTGGTATGGGATCGCTCGGTGCTATGAAAAGC AAAGGAAGTCAAAGTCGCTATTTCGTGGAAAGTGACAAAGTGAAAGTTGC TCAAGGTGTCAGTGGTTCAGTGGAAGATAAAGGGAGTTTGTTCAAATTCA TCCCTTACCTTACCGCGGGTGTTCAACACGGATGTCAAGATATTGGAGCT AAATCTCTTACTTCGCTAAGGTATGAAAGGATGAAGTCGAATTTAGAGAA AGTTTCTCATGAAAGTTCTCTTTTCGCTTTAATGTAATATCACCTTATCA CTTTTGTTTCAGTTCTTCTTTATAATAGATTTAGAGTAAAATACTATTTA AAAAAAATGCACACACAAATTTCCTTACAGTTAAACATTCATGGTAAAAA AAGTAAAAATACCATGGCAGAAATTTTAAAATGTATGTCAGTAAAAAAAT ACTCTTGATATTATTTTTAGATCGATGACATACAGTGGACAATTAAGAGT TGAAAAACGCACACCATCCGCTCAAAGAGAAGGAGGGGTGCATGGCCTTC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000077_pilon:1108970..1122994-

>XLOC_036992 ID=XLOC_036992|Name=XLOC_036992|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1108970..1122994- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAGGATATATCGACTTTGGCACTGGAGATGTGGCATTGAATTCACCATTG
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CCATTCATAAGTTCTCCTATGGATACTGTCACAGAATCTGATATGGCAAA
GACTATGGCTAATCTGATATGGCAAAGACTATGGCTCTTCTTGGAGGTAT
CGGTATAATTCATCATAATTGTTCAATCGAATTCCAAGCAAACGAAGTAC
ACAAAGTCAAACGTTTCGAACAAGGTTTCATAACAGACCCTATTGTGATT
AGTCCTTCGCATACAGTCACTGATGTCAAAAATATTCACAAAAAGTTCGG
CTTCTCTGGCTTTCCTGTCACAGCTTCTTGGAGGTATCGGTATAATTCAT
CATAATTGTTCAATCGAATTCCAAGCAAACGAAGTACACAAAGTCAAACG
TTTCGAACAAGGTTTCATAACAGACCCTATTGTGATTAGTCCTTCGCATA
CAGTCACTGATGTCAAAAATATTCACAAAAAGTTCGGCTTCTCTGGCTTT
CCTGTCACAGAGAATGGGAAAGTTGGTGGTAAATTAGTGGGTATTGTCAC
TAACCGAGATGTTGACTTCATCTCACCTGAAGATCATGAAAAACCAGCGT
CAGAGAGAATGGGAAAGTTGGTGGTAAATTAGTGGGTATTGTCACTAACC
GAGATGTTGACTTCATCTCACCTGAAGATCATGAAAAACCAGCGTCAGAG
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AAAGAAGAATTGACCGTGGGAAGAGATGGCATCACCCTCAAAGAAGCAAA
CGAAATTCTGTCCAAAAGTAAAAAAGGAAAACTTCCGATCGTCGACGATG
ATTTCAATCTGGTTGCGTTGATCTCGCGGACTGATTTGCAAAAAAATCGT
GAATACCCTTTAGCTTCTAAAGATTCCAAGAAACAACTACTCGGAAAACT
TCCGATCGTCGACGATGATTTCAATCTGGTTGCGTTGATCTCGCGGACTG
ATTTGCAAAAAAATCGTGAATACCCTTTAGCTTCTAAAGATTCCAAGAAA
CAACTACTCGTTGGAGCTGCTATCAGTACACATGACGAAGATGTGCCACG
TCTAGCAGCACTCGTTGAAGCAGGGGTTGATGTTGTTGTTCTCGATTCTT
CACAAGGAAATTCATCCTTCCAAATCGAACGTATCAAAGAAATCAAAGCC
AAATATCCTAATCTAGAAGTCATTGCTGGAAACGTTGTCACTGCTGCACA
AGCTAAGAATTTAATTGATGCCGGCGCTGATGGCTTACGTGTGGGTATGG
GTAGTGGATCCATTTGTATCACACAAGAAGTGTGTGCTGTTGGGCGGCCC
CAAGGTACTGCCGTCTTTTACGTCAGTGAATACGCCCGTCGTTTCGGTGT
TCCTTGTATCGCTGACGGGGGTATTTCAAATGCTGGACACATCATTAAAG
CGTTAACGCTGGGAGCATCGACTGTGATGATGGGCTCGTTATTAGCTGGT
ACTTTTGAAGCGCCTGGTGAATACTTCTATCAAAATGGCGTTCGTTTGAA
GCGATACCGTGGTATGGGATCGCTCGGTGCTATGAAAAGCAAAGGAAGTC
AAAGTCGCTATTTCGTGGAAAGTGACAAAGTGAAAGTTGCTCAAGGTGTC
AGTGGTTCAGTGGAAGATAAAGGGAGTTTGTTCAAATTCATCCCTTACCT
TACCGCGGGTGTTCAACACGGATGTCAAGATATTGGAGCTAAATCTCTTA
CTTCGCTAAGGTATGAAAGGATGAAGTCGAATTTAGAGAAAGTTTCTCAT
GAAAGTTCTCTTTTCGCTTTAATTTGGAGCTGCTATCAGTACACATGACG
AAGATGTGCCACGTCTAGCAGCACTCGTTGAAGCAGGGGTTGATGTTGTT
GTTCTCGATTCTTCACAAGGAAATTCATCCTTCCAAATCGAACGTATCAA
AGAAATCAAAGCCAAATATCCTAATCTAGAAGTCATTGCTGGAAACGTTG
TCACTGCTGCACAAGCTAAGAATTTAATTGATGCCGGCGCTGATGGCTTA
CGTGTGGGTATGGGTAGTGGATCCATTTGTATCACACAAGAAGTGTGTGC
TGTTGGGCGGCCCCAAGGTACTGCCGTCTTTTACGTCAGTGAATACGCCC
GTCGTTTCGGTGTTCCTTGTATCGCTGACGGGGGTATTTCAAATGCTGGA
CACATCATTAAAGCGTTAACGCTGGGAGCATCGACTGTGATGATGGGCTC
GTTATTAGCTGGTACTTTTGAAGCGCCTGGTGAATACTTCTATCAAAATG
GCGTTCGTTTGAAGCGATACCGTGGTATGGGATCGCTCGGTGCTATGAAA
AGCAAAGGAAGTCAAAGTCGCTATTTCGTGGAAAGTGACAAAGTGAAAGT
TGCTCAAGGTGTCAGTGGTTCAGTGGAAGATAAAGGGAGTTTGTTCAAAT
TCATCCCTTACCTTACCGCGGGTGTTCAACACGGATGTCAAGATATTGGA
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GAAAGTTTCTCATGAAAGTTCTCTTTTCGCTTTAATATCGATGACATACA
GTGGACAATTAAGAGTTGAAAAACGCACACCATCCGCTCAAAGAGAAGGA
GGGGTGCATGGCCTTCATTCATCGATGACATACAGTGGACAATTAAGAGT
TGAAAAACGCACACCATCCGCTCAAAGAGAAGGAGGGGTGCATGGCCTTC
ATTCGTACGAGAAGCAACTTTTTTAAGTACGAGAAGCAACTTTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036992XLOC_036992-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000077_pilongenomesc0000077_pilon:1108970..1122994 -
Properties
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