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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000295_pilon:183200..190404- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036976 ID=XLOC_036976|Name=XLOC_036976|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7205bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:183200..190404- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTACACTGCGAAGTGAAAAGACACTGCCTTCACTGTAAGTTTTTTCTTCA
ATTTTTACTTTACTTTGTCCATTCTCCTATATGTCACCATGTCACTGGTC
ACGTCTGATTTAGCTTAGGGTTTTGAAGTCGCGAAATTTTAAAATGCATT
TCTGAGTCTGACAAGGTCAACTATGGTCATTTTTACCACCATTCAAGGTG
GGTTCGATAGTTTCGATTAACTCGATTGGTTTGATTGATATTTCAACATG
GATTGAATATAAAATATTCGATATTGATCGAGAAGTGTTCAGAATCGGTA
TTACATGAGTCGTTGAATATAAATTGGATGTCTTCGATTCATCTTCGATT
GATCAAAAGCTAACTGAAAACAATACATTGATTCTACAAAACTGCAGATA
TTGTACAATCGCGGTAAAATTGCTAGAGGAGACAAGTTGATTTTTCAACT
AGTCCTGACCCCTCTCTGTTTGAGAAGATGTCTATGGGTGGTGGTCCGGT
GGTCTATTTGTCTAAGATTGGAGATTTGGAAAAAGTTTAAATTTTGAGTC
TTGATTATCGGAACTCAATCAGTCGGTACCGCTACATGAAAAAGGCAACT
ATTGCCTTAACGGGAAATATTTCCCGAACGGAAAGGTGAAAATAACCCGC
AAAGGAAACTTTCAAGATTGAAAATTTCCTCACAATTTTCTGTTTCCCGT
TTTGGTCAAGAAATTTTCATCGTTCCCGAACGGGAAATAGAATTTGTGTA
AACAAAGTAGTTTTTTGTTTCCCGATCGAAAAAAAGTTTCCGAATAGGCA
GGGAAGTTTTTAATTGGGAATGGGGAAAGTAGAATTAAGAAGCAAGTACT
CGGTGGATTTCTTAACTAGAACGAATACTACTCTCGGGTACTTAATAACC
GTCCCCCCCGCGCTAATTAATTTTTCGAAAATTTTCCACCCAGGACATTC
TTATTCCAACCCCCCCCGCTTATTAATTTTTGGGGAAATGTTTTTGAAAG
TTCCCTTTTTTGTCCTAATTCAGCTGTATTAGCCTCCTTTTCAAAAATTT
TCCACCCAGGACATTTTTATTCCAACCCCCCGCTTATTAAGTTTTGAGAT
TTTTTCCAACCCCCCCCCCCCGCTTATTCCAACCCCCCCGGCTATTAGGT
ACCCGAGAGTATTTATTTTCCCTCCTTTACAAAAGGGACAAGTTTTAAAC
TTTCCTCAGGCATTTCCGGAGTGCTCAGAGGCCACTTTCCTGATCGGGAA
ACTGGTGAATTTTCCGATTTGGAAAGTCTAGTCATTTCATTTTCCACCTT
TCCGTTCGGAAAATATTTCCAATGAAGGCAATAGTTGCCTTTTTCATGTA
GTGGTCCCAACTGTCAATGAAATGCTGTGGTTAACAAGTTCGAATAACTT
AATATTTGATCACAAAGTTTTATAAAAATATCCGATCCTGCTTCTGCTCC
AAAATATTAATAGCTGCTCTGATTTTTATCATATTGGAAAATTTTTGATG
GAAATGCGATATTTTTGAATGAAGAAGCTGAAAGGACTAGATAATTGAAA
TAAGCCCCTCGACAAGAATTATTTACACGGAATAAGAAAGTTTTCGAATT
TCCATGCAGTATGTTTTACTTCAAAAGGAAGTCGAGTCTTGAACTAGTCT
AGATTTGAGTAGAGTCTGGATTTATGTTGCAAAAAAGACTTAATGAATAC
GTGTGATGCCTTGAGTAATTGGAATCTTCTTGGACATTTGGGATAGAAGT
AGCTTGGATATACAGGTGGTAAACTATTTCACTGTCTAGATTTGGATATT
TTATGTTGTTGATTTACCGCCTGGTCTTCCTAAAGCGATGGCATCCTCAA
ATCAGAATGCAGTCTGCTCCCCTGCGCTCACACTTCGCTAAAGCCGACAA
AAATAAGGTAATTCTCCACTTGCTAGTGTAGATGAATAATATCACGGTGT
TTCATGCTGGTGCAATTTTCAGGCAAAGCAGTGTATTGCAGATTTTACTT
TGATACACATTCTGGATAAACTTTGATTGCACCAGCATGAAACATCGTAA
TTGTAAGTGAGTTATTTCTTGAGATCGCGCTCGAATTTTTCTCGAAATTT
ATGGAGGAGTACTCTCTAAGCAATCTTCAGGCAATGCAATGTATTGTAGA
TTTTATTTCAATTGGTTATAAATTTGGTTGGCTAGGAAATCTTTTGAAAA
CATGGGTATGGACTTTCATTCTTTAGGGAGACCAGGCTATAATTTCAGAA
CTTTGTATCCATGTCGAGGTAAAGTTTTATTTTTCTGAAAATTAAGCTTG
GATATCCAGGCTAGGATAAATTATTAATCTGGATAGGTGCCAATATTTTT
ATAATCCAATTCAATGATAAAATAACTTCGCACTCAAAGTAAGTCCCAGA
CCTCTCTGTGGCACTCGAGTGGAAATCCTTTGAAAATCCAAGTGCATTTC
AAAAGTTCTTAAGAACTGAGAATTTTGAAATACCATGTTTATGTCACACA
ACTCGAGCAAAATTGACGAACCTGATCAAAATCAATATACGTCTCTTTTG
TTTTTCTTTCTCTTTTATACCAAGAACAGAAAAGTCTGGTTCTGTCTCCC
ACTACACGTTTTTTTATAAGAATGTCCGGAATTTTTAAAGCCTTCGGTTG
TTTTTAACTTTTTGAGTCTTAAGCCTATAAGTGTTCTTATTTTCACTGTT
TTGTGAAGAATCTTTGTACATTTTTTAAGAAATTCATGTTTTAGAGAACG
CCAAGCCTCAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAATAATTTAGTGTCCCTTT
AGCTTTCTAGCCTTCGAAGTCTTATGTTCTTGCATAGTTTGTTCTTATAA
AAAAACGTGTATGGTGTTTAGTCAGCATAAATATCTTACTTAATAGACTG
TTTGACGAAAATCATTCGTAGATTGAATTGTGAATCAGTTGTTCAAATAA
ACGAAACCTACTTAGCAAGGATGTGCTATGGATCTGACAAAATTGTGGAA
TTTTCTTTCAAACTATTATTATTATGGTCGTTGACTAGTGATGATGATGG
ACAAAAATCTGATTGAACTTTCAGTTTTAGTCACTTACTGACTGAAGCAA
TAAGCAGTAAAGCAAATATGACAATGGTAACACCAGACTAGACTGGACTA
GCAAATTGTGTTAATGTTTTACGACTACACTATAGTGTTGATTCTTTTGT
CTGTCCATCATTCTACTGTATTTAAAAACTTTAAGAATCTCTTCTCGAGC
TCGAGATTGTCATTACTTCCGTTCAAGGGGGTGTCCTTAAAAAGCCAGAT
TTGGTGTCACTTGGTGTCGGGGACAAGAGCATAAGAAGAATTTGGTTTTT
AGTATTGTATAAACTAACAGCTTGTTTAGGGAAAATTTGAGCACAAGGAT
AATGTTTTTATTAATTAATTAATGGTTGTAAAATTATCTGCAGTCGCACC
TAGTTTAGATATTTTGTTGTTATGCTACATCTTTTGATAACCAGATGTTA
TATTTCCCTTGCCTTTGAACCTGTTCTTTTTACATAGGAATACGACCTTG
ACCCTTTTTCAGCCTCCCTTATAGTACCTGCCCTAACATAGGTTTTTTCA
TAGTCTTTTAAAAAGGTTTATACTTGAATGTTTTAAGCTTTTAAAATCTG
CCTCGGCGAATAAAGAGAATAATTTTGCTGAAAGAAAAATTAAAGATTTT
TTATTAAAGAAAATTGGTACGAGGCTACCATACTTGCCTTACTCAGCTTA
TCATGGCTTTCATTATTAATCTATTTGTAAAAGAAGTACAACCACTATTG
CGGATTTAGCATTACTTTTAGAATATGCAAAACGGAAAAAAGCAACGGAA
ATGTATAGTGTGTCCGGAAAAAAGCGGAAGGTACAGAATTTCTATAAATA
GAAATCTTCATTTCTATATTACGACATAATTGCTCAATTTTGTTCAAAAA
CCCATTTTGATTACCTTTGGGAATTAAATATCTAATGATAGAACAAAGTA
ATTCCATTCTAGGGCGCCCCATTCTAATTTCTATGATGTTTAATACCATT
GAGATGGTTGAGATTTTACTCTAAATCTATTCCAATTTTTTCGGACACAC
GGACACATTATTATCTATATTATAATACGCTTAAATCGGAACTCTCCCAT
TCTCGCATGAGGCTTTTTCGCTAGCGATTTTTAAATACACGGCAATTTTT
TTCGCGCCTTTTTGATTGTATATTCAATTCTATTCGCCAAGTGCACTTCC
ATTCAAGAGAGCACATTTCTCCTTGATGGAGAAACACAACTGACTGTGCA
ATAGCACTATCAGCATAATTTATAGTTTTTTAAAAAAAAGTTTATGTCGG
TTATGAAATAATTTTGATTCATATGGGAATACGTCGAAGATAAAATTTGA
GTTTTCAAAAAGACATCATTTTTATGATTACCCTTGAGATTAATAAAGCT
CCGATGACATTTCCCTTCTATTTGATACTCTGATAAAAACATTTCAATTT
AATGGACTTGACAATATGAGAAAAGTTGATGACTTATTCCCAATTCAATT
ATGAAATTTTTTAATCAATGTTTGCTATTTTTTGTTCTATTGAGATAGCA
AAATGAAAACGCTTTTACTTACGCATTGAGTTTAATTGTTAAATAATTGT
TGACTCTGTTAAGAGGTATTGAAAAAAGGCACTCTTTATATTCCACCGTA
AAGCACTGTGGTCTTTGGAGTGATCGGTGTTGCCAAGTACCTCTAATACT
GAATTTGAATTTCTATTTGTTTTTTATCTTCATCCTTGCGTGAGGAAAAT
AATAGTCTTTCCTCTCCCAAAAACCCAAAAAAAAGCACGTTTTAGAAAAG
TATGACTGATTTCTCGCGAGAAATTTTTAACTCAATTTTCACCAATATTT
GCATAAGCATTATTTTTAGCGAGTCAAGAACATTATTGTTTGAATGTTTT
CAACAAAAGAAATTATGACAAATTTATACAAGTTAATAAGGAGAAGAAAA
ATCAAAATTCAACTAAAAATACTTTCACCATATTTTTTAATGTGCATTAA
TTTTAGTGTCCCCTTAAAAATTTTAAACATCAATTTTTACGAAAAAGGCC
TAAATTTAAGAACATTTCTTCTCGCAAAATAAGTACATTAGTATACAAAT
CCCTACAAGTTTCTGAAAAATAGAAAAGCGAGCGAAGCGAGCGTATTAAA
AGGAGTAAGAAGTCGTCTCGGACGACGCCGGGACGGCTAGTATAGTTTTA
TTTCGACTGATTAGATGTGTTGGTTTTTCTATTACTAAGTGGAATATTTT
ACACTCGTTTACAGCCTACACCCTAACTTAAGAAGCACAAGTTGCTATTG
CTAATGATTTTTCTAGAGCTATCTGAACAGGTTGCAAATAACAACAGGTT
AAACATCGACACTTAAATGATAATTTGTCTTTCAGTTAATCTGATCTGAA
ATGCAAAGTTTGTTATTGTGCGTAGGAATTTGAGCTGCTTCCTTCAATAC
CGCCAAAAGAATTTATTTGCATGTTTTACATGGTTCTGTAAATTTTCTAA
GAACAAAAAAGAAGGCCGAAAATTTATAAGATGACGTAAATTTCGATTGA
ATGTGAATTTATTTAGTTACTTTTAGTGGAAAAGTAACCCTGTTTGTTTT
TTTTTATTAAATTTTTCCTTGTAACATCTTTCTTTTGTTTTGTTTCCTCA
TTTTTCCTTTAAGGAATCTTTTTCATTTACAGCTGAACAATTTTCAATTT
TATTTGATTTTCCATCTTCCGCCCACATTCTTGTATCCCGTCCTAATAAT
TCATCAAATTTTCCCCTTTTTAACCATGCATAACTCAAAAGGTTTGAAAT
TTGATCAAACCTGGCCTCTATCTGTTAATTAATTCCAAGCCTGCTTGAAA
TTGGATGTGCAATAAGCAAAGGCCCCTTATTCACACTGTTTTATTGTTGG
TCAAAGTTTCTTGGTTGTCAATAAATTATTTTTTTTTGGCAAAATTCAAT
CAGAGGGAGAACTAGTTAACAATTTTTATAGGGCCTTTATAACGAAAGAG
TATATTGTTAACTGGTCGCTAAAGAACTTGTTTATTGTTTTTTATATTAG
ATTTAAAAATCAATAAAACGATATTGGGAAAAAATTATTCGTTCATAGAG
TTGTGTTATAGTTTGTTGGTAACCTAGAGTTTGAGCAAAAGATTCTACTG
TCATTCTTTTGCACCATACTTTTCACACCTTTTAAAGAAGGTTACACCTT
GAACCAGAAGAATTGCATTTATTGGTGTTGGCAGTTTCACCTTATTCAAG
TTTAAAAAATAACGAAATCATCTTCATATCTATTCAGCTCAACTCAGAAA
ATGGTAAGCAGTGCAGAAACAGTGCCAGAGTCATGGGTTTATTTATGGAT
CTTGTTTTTCATTGAAGCGTGCATTCTGATTATCGCCAACATCATTGCTT
CGACAGTCATCTTATCTTCAAAGCATTTACGATCGATATTTAACTACATT
CTATTATGTTTATTATTTATCACGCACGTTTTCACGGGCCTCTTCATCGT
CATCCGTGTCGCATTATTGCTCTGGATCAAATCGGACACCACCAGTGCTT
TAGAATACGTCACGTTGCTACGGGATACAGCAACAAGCCTCGAAGTACAT
TTAACCATTTTGATTTCAGTGGAAAGATTTATAGCCATACGTAAGCCATT
CCTCTACGCTAAAATGACAAAAATACATGCTGCCATAGGTATTGGTATCG
CTTTTGCTTTGACTATTGTTTTTTCAATCAATCGTATTTTTTGGTCCGCT
TATTTCATTCCAGCTTTTGTTGTAACTTTCACAGGGGGCCTGGTCACCAC
AATATCTAATTACATTTTATACCGATCAGTTAAAAGACAATGCATGGAGA
TAGCAGCTACTATTGTTGATCGATCTGGTGAAAAACAAAAGAAAAGACGA
GAACTTATGAAGAAGCGGCAGTTAAGATCACTGAAGATTTGTATTTGGAT
CGCAGCCTCCTATATCTTGACTTGGTTCTTATTAATCGGTGGCGCGACTG
TCCAACAACAAGTCAAATCTATGAGTAGTAACTATTTGATTTTGTTCGCT
TTGGTTGGTTATTCGAATGGTCTATGGGACGTCATTATATTTTTCCATTG
GAATAATACGGCTAAAAGACAGTTCCGCAAGCTCATTCATGTTTCAAAAG
CGGGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000295_pilon:183200..190404- >XLOC_036976 ID=XLOC_036976|Name=XLOC_036976|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=852bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000295_pilon:183200..190404- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTACACTGCGAAGTGAAAAGACACTGCCTTCACTTTACACTGCGAAGTGA
AAAGACACTGCCTTCACTCTTTTGTTGTAACTTTCACAGGGGGCCTGGTC
ACCACAATATCTAATTACATTTTATACCGATCAGTTAAAAGACAATGCAT
GGAGATAGCAGCTACTATTGTTGATCGATCTGGTGAAAAACAAAAGAAAA
GACGAGAACTTATGAAGAAGCGGCAGTTAAGATCACTGAAGATTTGTATT
TGGATCGCAGCCTCCTATATCTTGACTTGGTTCTTATTAATCGGTGGCGC
GACTGTCCAACAACAAGTCAAATCTATGAGTAGTAACTATTTGATTTTGT
TCGCTTTGGTTGGTTATTCGAATGGTCTATGGGACGTCATTATATTTTTC
CATTGGAATAATACGGCTAAAAGACAGTTCCGCAAGCTCATTCATGTTTC
AAAAGCGGGCCTTTTGTTGTAACTTTCACAGGGGGCCTGGTCACCACAAT
ATCTAATTACATTTTATACCGATCAGTTAAAAGACAATGCATGGAGATAG
CAGCTACTATTGTTGATCGATCTGGTGAAAAACAAAAGAAAAGACGAGAA
CTTATGAAGAAGCGGCAGTTAAGATCACTGAAGATTTGTATTTGGATCGC
AGCCTCCTATATCTTGACTTGGTTCTTATTAATCGGTGGCGCGACTGTCC
AACAACAAGTCAAATCTATGAGTAGTAACTATTTGATTTTGTTCGCTTTG
GTTGGTTATTCGAATGGTCTATGGGACGTCATTATATTTTTCCATTGGAA
TAATACGGCTAAAAGACAGTTCCGCAAGCTCATTCATGTTTCAAAAGCGG
GC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000295_pilon | genome | sc0000295_pilon:183200..190404 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 37-426:391 |
| Aaloc | 1-33:7206 |
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