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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:731769..740161+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036886 ID=XLOC_036886|Name=XLOC_036886|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8393bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:731769..740161+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAACGACCTCTACGATTGACCGACAGAAATCTTTTCTTCAGCGAAG
ACGCGATTTGAATCCAAACAATCCCAATATCAATGTTATGGCGCCTGATC
GAACTGATATTCTGACTCAAGGCCAAAAGAGTGGTAAGCTTATCattaaa
aataatgattttcttgttgttttttcggCTTATTATAAGCTTTTTGGGAG
GATCTTATCGTCTAGAGAAGGTCACAGAAATACCGCCCGGGGTGGTAAAA
AATCTAAGAGTTGAGTAAACACTATCAGAGGTGTTAACAGTTTTTTCTAA
CGCCAATAACGGCTCAAAACACCCTTGCCTGTCTCAGACagccacggctt
tttcctcgacaccgttCCATTTGTAGCTTTCTATATATTTATTCCCCAGA
AATCCGGGGAATAAAAATTCTCAGCTTCAAGCCAAAGAACCGTGGCTTTT
GACTGCATCAAAAACTCTACTAAAAATATTTGGTGGTAAAGTGATAGACC
TATGGCTTGTTAGCTCTGTACATGTTAATCTCCCACGTTCCATCCATTTA
ACGGGCAATATAGTATCGCACTATTTGGAGTCGAGTTCTTTTGTCAGATA
TCGTTATGTTTATATACTTTCAAGCTGATATTGTAGGGTTGAGATCCTTG
AaatgatttataaaattttgtcaaaattagtgGTTAACTAGTTTATTTGA
AGAGTATCCATCTAATTTCTTCTATGTTGATTAGCTCTGCAATTGATCTG
GTTAGCTTTGAAATTGATAGATACTTCATATATCTATTAATCCCAGAGAT
AACCAATAGGAAAGAAACTTCAACGAATTCGAAAGGAAATTCACCGATTT
CGATTTAATATCTTTAACTTTAGTCTTCAATTTACACACTTACGTACTgc
ttaaattttgaatttagaaattttgaagcCCGTAAAATCATACCGAATCC
GGCTAATGAGcctattttggcaaattttgttaAGATAATGAATCCGCTAT
TTCTATTTGCTTGAGTATCAGGAGGCTCGTGGGGCCCAATTTCGCAatta
tagacgctttcaatgagcgccccgtcagaccggactgactacccaatttc
CCTCACATTGCATTGGTTGACCTGGGCGAAGGTTCATACATTTGCCAATT
GAACTGCTGCGAGttggaatcgaacctcagtcgattttgcagcaaccaag
gtcaatgaccactataccacaacgccAGCGCTACTTCTTCCCTGCTGATT
ATCTTTACAATTGATGGATACTTCCTATCTATTAATCCGAGATATAACCA
ATAGGAAAGAAACTTTAGCGAATTCGAAAGGAAATTCAATTTACACTCTT
TTTTCGAGCTGCTTAAagctgaatttttaaaattcattcccacaaaattt
agaaatttgttcttgaatttctaaaataaatCCCGCAAAATCCCTCCAAA
TACTGCAAAAGTGAGCCCATTCTATTAAGTAAACTTCTATTATTTAGGTA
ATGgtattttcacgttttttctTTCTAGCCTTTCGCGAAGTGTTTGATTT
GTTTGACAGTAATGGTGGAGGTTCCATCGATGCGGATGAATTGGACGAAG
CACTTCGATCAGCTGATATTCAAGTTACCAAAGATGAAATCAATGAAGTC
CTCTCTTCAATGGATAAAGATGGTTTGTGCCttttttttGAAACGACGCT
TTCTGACTTTATCGTCTTACTGTAGGCTAAtgatagcgagtttatgtatt
tgtgtTTTTCAGTGAAtgagacggttagcttctgatttcTCTAGAAcctg
atcaactgaggacaacggtaaacaagcactttttaccgtcctcgattatT
GTTGATCAAAAGTGCGGGTTTATTCAAATCGCCTCTGTCACtctgccgtc
ctcaaaagtgccaatatataaACTCTCTAATTCCCGATAATCACTTCAGA
TTCAGATATATAAAAGATGTATATAAGGTTGTGATCAGATCAGGGAAAAA
ATCTCTTAAGAGGAATAATTCAAGTTACTTATAAAGCGTATGCTTTTTCT
GCTAGAAATCTGAGACAGATATTTAACTAGCTTCCCTGGATATTTCTGAA
CTTCTACTGACTAtagataaattcaaaattatgcCATAAATTGCAAGAGA
GAAAAACTGTCGAGTGACCAATTCTAATTTGAAGTATAgtcttttaaata
aattttgtaagcAAAGGTCATCTTGTTCGTAAACATATTTTCGTATCCTC
AACAAATTTCTCGTTATTAGATAATCTATAAATTTTACTAGTTTCATTAA
AACTTCTTTATATATAAATCTTTGATAGAAATCATTATACCTTTATAATC
TtcaaattattgttatttttaggtAATGGAGAAATcgattttgaagaatt
tcttcaattGATGACCAACACTGAACGATTTCTGGAAAGTGTCAGTAAGT
GATACAAGAAATTGTccaagttgttttttttacttgaagtTTTCATTATA
CAgttcattgagtttgaagccccaaagaggctagagatgaatcttcaacc
tttctcaagcaagagtTTCGGATTTAGCCCATttggggctttgaaatcaa
cgATACACTTACAGTCTTCATAAATCGAGAGGTTTCTTACGAaccttttc
attcaaaaaataattcttgaaaatgtaaagataaaataactaaattagaa
aaaaaaaccttggaaaattCTTCTGATGAATTTGAAGTagtagttgaaaa
ataaagaccACTATGAATTAGtgctttttcgtttttttagtCAAAACATA
CAGAGATTTTGAAGAAAAGCCGTTGTATAATTATGATTAGATAGTCTATC
CTCGCCCTACAGGCAATTCACTATTGCTTTTTCTATTGatgttttattga
ttttttttgtagtCTGCAAAGAACAAGAAGCCGAAGCCACACAGCAACGC
GAAGTTTTACTCTTCGAAGCATTGACCCAATTCATGAGAAAATCTGCACT
ACATTCAATCAACGAAATTGTCGGGTAAGGATCGAGGCTTGTACGTTGAT
AATAACGCACAAATCTCATTTAAACATCTTTTTGATACAGcggagtctcc
ataattcgaatctctataactcgaataaatCCTTAACTCGAGCAAGTATT
CTTGTTCCTTCAGCTAACAATGCCTCATAAACCaatctccataattcgaa
attCCTTAACTCTAataacaagtttatgttccccGTGCGGGAACATCTGT
ATCTGTATTACAGCTGTATCTGTAATAGTAGGGCCAACCCTTAGGATTTA
GAAGTACAAGACAtgtagtatactttttttaCTTGGAATTTCGGCTCCAT
CCGAttataacaaaatttttttgaattcgtCTCTTGAATATCGTcaattt
tttactgattttgGAGGTGACGAGTTTTGGCTATAACGCCAGTTTTTTAC
TTATTGATAATTTTGTAAGGCCTTATTCGCGGGCCCCCTttcaaaaatat
ctcaaaatctcATCTACCTTCGAACCAATTATATGCATGTATTTCATGAA
TGATGGTATGGATCCCTGCTTTAACGTCCATGAACATTAGTTAGGTGAAA
ggtgaacgttgaaagaacgtctTGTAGATTAGCTCATATGAGCTAGATGT
ATACTTTACATACATTGGTTGTCATCCCGTTGTCATACGTGACAAAAGCT
GAGATAAGTTTATACGTGTTTTCTGACTAGAGGAATCCTCATCTGATATA
TATTTGAATGATacgctacacgtttttttataaggacattcaaaattttc
ttaaaattacttacttttggagtttcaagcctaaaaatgttcttatcatg
ttcttaatttcaccattttattaGTAATTTGGTCCATtctcctaagaaat
tggatgttttcaagtccgtgaagccttaaaatgttatccttaaaaacttg
ttcttaatattttgaccatcgaagccttattttcggtttcttataaagtt
tgttcttatgaaaaacgtgAAGTGAGACCGGCCGTTtagcttcaaatttt
gaatttacgcgctcgattattttcaaaacaatttttactCTCCAACATCT
CAGACACAGTTCGTGTTTGCAGCTATTTATCAAATCTTTAACAGCTATCA
AATAaacatctattttttattttttctaaaatttttcgGATTTCCTCTAA
TAAATTAGGATAACAGTGTGACTTTATAGAATCTGTGATAGAAgttttgt
tatttaaaaaagtaaagtacAGTAAAGAATAATGATATATTGTATATCTA
GTTTTGGGAAATATTTTGCCGAAGAACCATGAGTGTGGGAGCCATCGTCG
AACTTGATTTAGAAGATTGCTTTAGGAAATTCCATGGGGTTTTTTACTCA
ACAGATTTTAGAAGAAATCTTAAATTGTTAGCCCTTCTTATATATATTAT
CCACTTTTCTTTTAAAGCTATTACCATCAGAAATACAAGAAAGTTCAAAC
GCCTCATGTTATCCGCCATTATGCAGCAGGCGCCCGTCTGATTGGTTTAT
CTGAACAACAAATCAAACGCCACCTTGAACAATTGAGACGTTCATCTATG
AGTAATAATAAAAGTCCATACGCTCAACCACCATACGCATTCATGCATTT
ATGTAGACAAAAAGAGGTCCCAAGACCTGTTAAACTTGAAAAGGTAGCTT
TTATTTTAACACGCTTTGTCATGTTTATCAAtcacaaattttgattttat
ctccAGTCTTATTTTTCGAGATTCTCAGGCTTAATGTTCTGACAATTTTA
GCAAGGCTGTCTTAAAGTGGACttcaataaaaaaaccttttaaaaaaaaa
tataataaagcCTTTGTTGAAATGAGAACATCTCAAAAACAGCCAGCCTG
AGAATTGAAACAATTAGCCGAATTTGCTCAAAATTATCTGAAGTCATAAG
AAACTTTCCGGATTCTTTTAAATTCCTACATTTGAATTAGCAGAGCAGGT
TTGTTCAACTCTAGTCCTCTAGGGCCGATTTTTATAATCCAAGGTAATTC
TATAGTACACACGCATTAGAGTTattaaattttggctcaggtctgactgt
tcttaattttttgaaatcttatgAGATCTTATGAGtaatttcttaaaatc
tttgGCTCTGATtgctcttaatttgttcttaagtttGGGCTAAATTTAGG
CTTCTTGTTCCCATAAAACTGTTCTTTCTATAAAACtcttctcataaaaa
agtatttaaagttaattaattttaaaacgTCACCAACCAACCATAATTGT
TcttctttcgttttttttagatCACTGAGATCACGGAGGAGAGTTCGCCA
ACAAAAGTAAGGAGCTAAAATTCACGAAATGGTCCTTCTCTTACTTTTAC
AATGGTTGCATCGATAGGGAACTAGGCTTTTTGAGACATTCATCatgttt
tttaaaagatcttttttagtaatattatacattatacatcatctttcaaa
aaataacaCCACCAATTTTGTTAACCCTATTGAACCTTAgggggggCTta
tcctgtaccaccccttaacttttgatctagtgggtctttttggatgaaat
ttggcacacaagatccttgtcacgtaaggtaacttttgacaaaaagtttt
ttttgatgacgtcactcatcatgcccaaaattagcaaaaaccgaaaattt
cctttgttcttataaatagctattgtattctaacaaaggctttagaaaaa
aagttgcctgagtttaaaatacttattttatcctaaataattacggttta
aacgatatatttgacactaaaaataaatttgtattggaaaagtgtcaatt
tttgtgacaccttactgtcagaaatgtcatcatgatCAAGGTGTGGAatt
ttttaggtgtcaaattttttttttattttgaagctaaataaaagttagga
atttaaagaaaatttcatggcaaaagctctattattttaggagctattac
caatagtttgacctccgaacagaaagagccccccccctaggccgaatagg
gtaaTACATGACCCTCAATATGTCGGTTTAATTCGAATTCACAGGAAGAG
ATACTTTACTTATTTAGATTCGTGAGAATTTGAAGATCTTGGTACCAGAT
GCTCCACGACAATCAACATGTAAAGGACGTATTCGTTTGAAGATTGTATG
GGACCAAAAAGAAAAGGATGAGAAGGTCAGTAATGTAGTAACCCATAGCA
ACCATACCAAGCAGTCGTACCCGTGTAACATAGTCCTTATATGCTGTTGA
CGGTGGTTCTTTTTTGTCGCTTTTTGACCTCTTGTTGAGGATCGGCCGAG
TAGAGAAGCCTCAAATTCCGATTTTTTATTCACACAGTTCACTTGGATTA
AACAAAACACTTTCCATCATTacttttgaaccattttcagcttaAGGGTA
TTTGGTGATTAACTTATATgtcctttttacaccggcccatattggcgtta
tttttgagctcgtggcgtaataagagcCGGTGTTAAAAGGGCCAGCATAA
AAAGAGCCAAGATTtagcaatttttacctaaaagcaGCGCTAAATTTTtc
tcattatttctcaatttaaaggatttatGGTATGATTCGCAatcgaaaat
tatccattgttttactccatatttaaaacttcagtgaaatatttaatatt
tttaaaatcagtgattttcgatggaattttcaagtttactactgaaaaat
gacattttatttattatttatattacttataatttgaagcataagtagcc
atttttacaatttgttGGCGTAATTAACAGCCCTGATTGGCGTAAgacca
aaattaggctgtggcgtaagGGCTGACGTAAAAGGGACCGGCGTTAAATT
GATGTTGCTGTAAATGATTGTTGCCATTAGTATAGTGGACACATGGCCCC
GGCGTGCtaatcgaattgagggggccaaaaaaatatgtccaTGGTTGGGC
ggtgaagaaaattttcgactttgcacccttatttcaccccctataaacgg
tatatataagattttttaaagtaaaaaaaaaaatttgcaaaatattgggg
ggccATGGGACAACACTCCTCCAAATCCTCTGTAAGCTTGTACTCAGATG
TTTCTATTACAGTATTTTACAGTATTATACTATTTTTCACCTGATCCAAT
TATTTATCCAATTTTCCTGTTCCTCTTTGTTACTGCTCTTGTTCTGTTCG
TAGTGGCCCtttgtggaaacaattcttGAGCTGTCTAAAAGCTCAACGAT
TTTTGGGAGCCAGCCACTTAAAACATTCGTTATTATAATTAGTATTCCAC
TTGGCAAATAATCATTCTAATAATCTCGATTTCTATTTCCACTTATGTAG
GCTGGTAAACTACCAAGTCTTATACCCACCAAACCTCACGAGACAGCTAC
ATCTCAATCATTACGTAAAAAGCGGCGCCATAACGGCTGGGTGGCACAAC
GCTTTAACCCAGCTAACATTCGTGACCATTTACCAATTTTGACTACAAAT
AGTGTCAAACGTGAACTGAAAGCCGATGGGGGTGTTCTTATTGATCCTGA
TAAGCCGCATTCGTTGGATTTCGATGACGCGCCTGGATTAAGATTCAAGG
TAAAAATTTAATACACACAGCCTCGGAAAATCAAAAAGTGCTGCAAGGGA
CTCTGGTCACAATTGGGCCTAAAAAAGATCCTCTTTAAATGCTTTATAGT
TACATATAGTTCTAAAAGTCatcaatcaaaaagtggtgcaaggCTCTGGG
TACTATATATTCATATAATGGTTCTCAGCCGGGAGCGAGGGTgcctatcc
ccttttctatttgcgctagacctagGAAGTCGAATGccgaggtggagcgc
cacaccaaCTCTACTctatcagattacccaatctaagctactaaCCCACT
GAGGTGAACGGGGATCTAACCTACAACCCTTGAACTGTAAGGTGAATACA
CCATTTCAACCATAGCCctcaattgccgcgcgggcatttttttgtacgct
ttatcccactaaaaccgtcccagtcctttttttcacacctataAACATTA
GAAAAAGGTGTCGAAAAAGGATTAGATCCAGTTTAGGGGGGATAAttgaa
taattaagtggcacgcgttAAACAGTTTTCTCTTCGTCTTTTCAGGTTAC
AGGCCTTACAAACCAATACTACAAAGGGATTCAGAATCAGAAAAGTAGAG
AAGCTGAAACACATTGGCATAGTCTCGGCGTCAACCGGATGCCGTCACAA
CATTTACGCGAGTCTTATCGACGTGTATTTAAGGCTTACGTAGATTATCg
taacacccctgtatcatcgCTGTGCTCCAGCTCGATTGCATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:731769..740161+ >XLOC_036886 ID=XLOC_036886|Name=XLOC_036886|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2556bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:731769..740161+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAACGACCTCTACGATTGACCGACAGAAATCTTTTCTTCAGCGAAG
ACGCGATTTGAATCCAAACAATCCCAATATCAATGTTATGGCGCCTGATC
GAACTGATATTCTGACTCAAGGCCAAAAGAGTGATGTTAACGACCTCTAC
GATTGACCGACAGAAATCTTTTCTTCAGCGAAGACGCGATTTGAATCCAA
ACAATCCCAATATCAATGTTATGGCGCCTGATCGAACTGATATTCTGACT
CAAGGCCAAAAGAGTGCCTTTCGCGAAGTGTTTGATTTGTTTGACAGTAA
TGGTGGAGGTTCCATCGATGCGGATGAATTGGACGAAGCACTTCGATCAG
CTGATATTCAAGTTACCAAAGATGAAATCAATGAAGTCCTCTCTTCAATG
GATAAAGATGCCTTTCGCGAAGTGTTTGATTTGTTTGACAGTAATGGTGG
AGGTTCCATCGATGCGGATGAATTGGACGAAGCACTTCGATCAGCTGATA
TTCAAGTTACCAAAGATGAAATCAATGAAGTCCTCTCTTCAATGGATAAA
GATGgtAATGGAGAAATcgattttgaagaatttcttcaattGATGACCAA
CACTGAACGATTTCTGGAAAGTGTCAgtAATGGAGAAATcgattttgaag
aatttcttcaattGATGACCAACACTGAACGATTTCTGGAAAGTGTCAtC
TGCAAAGAACAAGAAGCCGAAGCCACACAGCAACGCGAAGTTTTACTCTT
CGAAGCATTGACCCAATTCATGAGAAAATCTGCACTACATTCAATCAACG
AAATTGTCGGtCTGCAAAGAACAAGAAGCCGAAGCCACACAGCAACGCGA
AGTTTTACTCTTCGAAGCATTGACCCAATTCATGAGAAAATCTGCACTAC
ATTCAATCAACGAAATTGTCGGCTATTACCATCAGAAATACAAGAAAGTT
CAAACGCCTCATGTTATCCGCCATTATGCAGCAGGCGCCCGTCTGATTGG
TTTATCTGAACAACAAATCAAACGCCACCTTGAACAATTGAGACGTTCAT
CTATGAGTAATAATAAAAGTCCATACGCTCAACCACCATACGCATTCATG
CATTTATGTAGACAAAAAGAGGTCCCAAGACCTGTTAAACTTGAAAAGCT
ATTACCATCAGAAATACAAGAAAGTTCAAACGCCTCATGTTATCCGCCAT
TATGCAGCAGGCGCCCGTCTGATTGGTTTATCTGAACAACAAATCAAACG
CCACCTTGAACAATTGAGACGTTCATCTATGAGTAATAATAAAAGTCCAT
ACGCTCAACCACCATACGCATTCATGCATTTATGTAGACAAAAAGAGGTC
CCAAGACCTGTTAAACTTGAAAAGatCACTGAGATCACGGAGGAGAGTTC
GCCAACAAAAatCACTGAGATCACGGAGGAGAGTTCGCCAACAAAAATTC
GTGAGAATTTGAAGATCTTGGTACCAGATGCTCCACGACAATCAACATGT
AAAGGACGTATTCGTTTGAAGATTGTATGGGACCAAAAAGAAAAGGATGA
GAAGATTCGTGAGAATTTGAAGATCTTGGTACCAGATGCTCCACGACAAT
CAACATGTAAAGGACGTATTCGTTTGAAGATTGTATGGGACCAAAAAGAA
AAGGATGAGAAGGCTGGTAAACTACCAAGTCTTATACCCACCAAACCTCA
CGAGACAGCTACATCTCAATCATTACGTAAAAAGCGGCGCCATAACGGCT
GGGTGGCACAACGCTTTAACCCAGCTAACATTCGTGACCATTTACCAATT
TTGACTACAAATAGTGTCAAACGTGAACTGAAAGCCGATGGGGGTGTTCT
TATTGATCCTGATAAGCCGCATTCGTTGGATTTCGATGACGCGCCTGGAT
TAAGATTCAAGGCTGGTAAACTACCAAGTCTTATACCCACCAAACCTCAC
GAGACAGCTACATCTCAATCATTACGTAAAAAGCGGCGCCATAACGGCTG
GGTGGCACAACGCTTTAACCCAGCTAACATTCGTGACCATTTACCAATTT
TGACTACAAATAGTGTCAAACGTGAACTGAAAGCCGATGGGGGTGTTCTT
ATTGATCCTGATAAGCCGCATTCGTTGGATTTCGATGACGCGCCTGGATT
AAGATTCAAGGTTACAGGCCTTACAAACCAATACTACAAAGGGATTCAGA
ATCAGAAAAGTAGAGAAGCTGAAACACATTGGCATAGTCTCGGCGTCAAC
CGGATGCCGTCACAACATTTACGCGAGTCTTATCGACGTGTATTTAAGGC
TTACGTAGATTATCgtaacacccctgtatcatcgCTGTGCTCCAGCTCGA
TTGCATGAGTTACAGGCCTTACAAACCAATACTACAAAGGGATTCAGAAT
CAGAAAAGTAGAGAAGCTGAAACACATTGGCATAGTCTCGGCGTCAACCG
GATGCCGTCACAACATTTACGCGAGTCTTATCGACGTGTATTTAAGGCTT
ACGTAGATTATCgtaacacccctgtatcatcgCTGTGCTCCAGCTCGATT
GCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:731769..740161 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1081-1278:8196 |
| Aaloc | 832-1080:7401 |
| Aaloc | 724-831:6118 |
| Aaloc | 688-723:5321 |
| Aaloc | 463-687:4469 |
| Aaloc | 352-459:2915 |
| Aaloc | 280-348:2375 |
| Aaloc | 136-276:1531 |
| Aaloc | 1-132:1 |
|
