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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:789536..798786+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036885 ID=XLOC_036885|Name=XLOC_036885|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9251bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:789536..798786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCACAGATTATTGATGGTAAAGATATTGCAAggtattgttattttct
ttagCGCATTCACTCAAATTACTAAACATTTTACTGTAGTGTTTCCAAAT
ACTTTAGCTGACCTAAAAATAGTAGTCTCTgagatgtatttgaaaaatct
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aattgaacggatagcgaaatggaacataaacttgcttcgtggacgaattt
ttatctaattttcgtatattaaaaggcgagaatcttcaatactgattatt
agaatgttcatagcaaacttgagttctactaaaaagtcttatttcatcgg
gcgagcttagaatttcttttgatacattttataaaagaaatcaaaagact
ttaacgaccaattaccgacacattcaactcctgtttttctttatacctct
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AGTGTACATTTTATACATCTGCGTATGTTATAAAAATAATGGCtttaaaa
tatctaaatttctTTTACTTGCAAGTTATTATCAACAGTTGAGAGGCTGA
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GAAAATCCAATCGATTCTGCACTCGCCACAAATGCTGTGTCGCCAGAAAA
AGATGTAGATGGGTACTTATCACTTTTCACATAAGttaaatttagaattt
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TTCTGTGAAATAGCCTTTGCCTGATTCTTTCCAGTGCTAatctttcaaac
atttttttcaatatttctcagtacaatAGAATCAAAATATAATCTGGAAA
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tttattcaattgagcatattatcctttgatctaatgaaccaaatttaata
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GCGATAGAAGTAAACAGTGCGAAGGAAAATAAAGGAAAGAAGCTTTTCTC
TTTTGAATTAAATCCCAATCAACATTAATATCTTTAAGTTTTCAATCATT
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taatgggagataacttttaaaatattgatatatggCTCTGGTTCTTTACT
AATCAAGCACTCTTTATGGCATTGATTAACCACACTTGgtttaatatctt
taaaaataaaattctctcgATATTATATTCAGGATCAACGACATCAATGC
CGGACGTTTAGCAAGAGGCAGTTTAGACACCTGTTTTGCTCCTTGTACTC
CAAATGGTTGTATGGAGCTCATCAAAACGACTGGTATTGTTTCAGATTGC
TTAGTTTTTTCTTCTCTTCCTTTTGTTTGGAATACTCTGTTTTACTAACA
CTAGTTTCTTCATTCTTCACGTTTCTTCATGGCACAGAATTAAAAACCTC
CTTGCCATTTGATTTTAAACTCATGAAAAATACAAGTCAGTTATAGTAGA
AACATTTCCCTGGTTATTGTGTCTTGGTAATTACATGCCTCAGGCCTCAG
ATAACACAGAATTTTCACGatacattttctttctttttatcatatactct
tttgtgcttaattgtagagGTGGGTTGAATAAACATGGGGGTTGGTATTC
TGGGAGAAAATCCATAAATTAAAATGGGAGTGGGGTCAATATTAACTcat
tttggggtgatttttcCTAAAACCCCTagaaaaatgaaggtttttgcatt
ttttcaggaaaatttcataaagtggggggggggtcattataaaatgGAAT
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aatatgggggtagaggatataacatttttttttaaatttacccCCCAggc
agcaggtctaaccccccggacaagcatcagttgaccccatggacaatcaa
aattacccccaaacagagtaagtttacccctggacaaggcaaattttgta
gatttttcactaccccacggacattatatcctccacccccatgtacagat
attttctggaagagcccaattaaGCACAAATAAATAACACTTTGCAGGTA
TGGAGGTATCTGGTCAGAATGCTGTGGTGCTTGGTAGAAGTAAAATTGTG
GTAAGTTGACGACTTTTAAATGGATATTTAGTCAAGTGTTAAAGCTCATA
TAAACATTACACTTGCATAGTTTGCATTGAACTTCCCAAACCGTATATAA
CGAACACCTCGACTTTGAATATTGTACATTTTTAGGAGATTTGAGAGAGC
CTTGAAAAAGGAAATTCCGTAGAAACTTTAATATTATAGTTCGTAAATGA
TGCATATATGTTTGATATTTCTAAGATCATACTTTAGTTAACAGGCTCAA
ACTAACACTTGAATTTTCTAAGTTTTTGTTTAAATCCAGTGTTAATTTTT
ACTGTAGGGCACACCCATGGAAGAACTATTAAAATGGCATAACGCAACAG
TCACCACTTGTCATTCAAGAACCAGAAATCTTCCTGAAGTTGTATGTGTG
ATTGTGTTTTTAGGGACAGTTTTTACTCATTTTATGATGCAAATCAAACT
CGAAAAACGCTTCCGCTTAACCCGCTTAGCAAGTTTTTTGCTATAAAGTA
ATTATTTTGTGGTGCGACCCTTTATATTAACCTTTGTCACAGAAATTGAA
TACGAAGGCAAGATTGTTACTTTGTGTACTGtgatatttttggacctacc
ccggtgggctgtaggtcctataaattaacctctgttcgtccgttcgtccg
ttcgtccgttcgttactagcttttctcgggattggctcattagtttttcc
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cccggaaatcgccgtttttgcagattttcattggacttttcccttatatt
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aaatcgccggaacagcctattttcgccggaaaaaacggtatttcttgaat
tctcgagctgtactttatattttttcatgaaattttgcacactgatgcaa
aatggcaatacctaaaatatgacagagcctgattttcaattaacgtactt
ttccggccgaaaatgccggaaatatgccggaaaaaccggttttttggcat
tttctcgagatttcatcattagttttttctgattttttgcacaaagatgc
gtagtaacaatgtctaaaacatggcctagtccgatttttgagaaaaattc
tattccggctgaaaatgccggaaatattccggaaatcgccgtttttgcag
attttcatcggactttttccttatatttcgttgttttttcacacaaaaac
attattgatagcaatgcccaccatcaagtatggtttaattgtcaataaaa
gtgatttttgaagccggaactttctaaaaatcgccggaacagcctatttt
cgccggaaaaacggtatttcttgaatttctcgagctgtactttatatttt
ttcatgaaattttgcacactgatgcaaaatggcaatacctaaaatatgac
agagcctgattttcaattaacgtacttttccggccgaaaatgccggaaat
atgccggaaaaaccggttttttggcattttctcgagatttcatcattagt
tttttctgattttttgcacaaagatgcgtagtAACAATatctaaaacatg
gcctagtccgatttttgagaaaaattctattccggctgaaaatgccggaa
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tatttcgttgttttttcacacaaaaacattattgatagcaatgcccacca
tcaagtatggtttaattgtcaataaagtgatttttgaagccggaactttc
taaaaatcgccggaaacagcctattttcgccggaaaaaaaacggtatttc
ttgaatttctcgagctgtactttatattttttcatgaaattttgcacact
gatgcaaaatgacaatacctaaaatgtgacggagcccgattttcgaaaaa
taTtttttcccggccgaaaatgccagaaatatgccggaaaaccgtttttt
tacattttctcgaattttcatctttagctttttctgattttttgcagaaa
gatgcgtatttgcaatgctcaaaacatggccgagttcgatttttgagaaa
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attatatgttttccttgtatttctatgttcttcacacaaaaacattattg
ataacaatgctcaccatcaagcatgattcaattgtcaataaaactgattt
ttgcgaccagaactttctattaatttttccctacaacccttccctctccc
cccatcaacaatcaatgatgaatttattgcgttatgcattttcgctaaac
gatatattttctgactgatttttttctcctcgcattgctatctaactttc
atcatcaggtaggtccattcagcatctagcttgttttcaTGGATATTTTA
ATGAGCTTAACGATGcgtatctgaaaaaaaaaaaaacattcaaaaaaccg
CTTAGAGGACGTGGTTTTATGAAAAAACAAATCAGAGGAATGCCTGCTAG
CAATCTTCATATTGTTTTGGAGGGAGTGCAGTATTATTACAAATTCCTTC
TTTTCTGTTCCATCGTTTCAGGTGGGCAGAGCTGATATTGTCGTGGCTGC
AGTTGGCGTTCCTGAAATGGTTAAGGTACAAACCTGTAATATTGATTTGA
TATAGATCACAAGTGTAgttcagtggtagagcatccggctacagtgcgca
aggttgtgggttcaacccccagccgggccATACccaagattcccaaaatg
gtacttgatgtctctctgcttgatgctcggcaattaagagaaggattaag
agtaagtggagcaatccagggagaaagagtggtgccctcccctaccttgt
agtagatagctatcgaaagaggagccctCGGGTTGTCTCCGACTGAGGTT
GCAGATCATATAATCGTCAGCGCTCGCTATTTTTTAAGCTAAGTTTCAGT
GCTCTTAGTCCTGTCCTTCTCCTTCTAGTCCTATCTGAAGTCCATaagtc
ttttgttttatgtgTCACTAAAATTTATCTTTGAAGAAACCGTGTTGAAA
accaattttattttatccAGGGTAATTGGATAAAGCCTGGTGCAGTTGTA
ATCGATTGTGGAATAACTGCAGTGCCTGGTTAGTAGGATAAGTTCGACTT
TCTCTGACAGCGAAACTTTTTCCGATGAAAAACTATTATAGTGCAAAGGT
AGAGCAATGGCTTGGGTTCGATACTAAAAAGCTTTGTTCTAAGTACAAAA
TGGTACTTTATACTGCTTGAACTCagtaataaaagaaaaagatgaagGTT
GTGGACCAATCCAGGGAGAGAGTCTAGAAAGAGGAGCCTCCGGGTTGCAT
CCGACTGTGGTCACTGACTTATTAGAGTTATCAATGAATATCTGAAGTAA
TGGCTGACCAATCCAAGTAAGCCAATCCAAATAATCCAAGTTGATATCAC
ATACCAGAATATTTTCGTCGAATAACCTGAAGTTTACAAATCTACACATA
AAGTAGAAATAAGTGCGAGATTGGCCTGAATAACCTGATGTATTTTACCT
TCTTTTAGATTCGAGTAAGAAGAGTGGTCAGCGTCTAGTTGGAGATTGTG
ATTACAAAGCATGTAAAGAAAGAGCTAGTTGGATTACACCTGTTCCAGGA
GGTAATGTTTTTTATGAGTCCCCCGTTCGGACATCTTATTAATAATAATT
TCTGTCTTATCTTGTGTGTACAATTCGTTTAGAAGGATAATTAAATGGTT
TTAGGTATTTTGccctatacatgttttttataagcaagtgtctgccccta
tatcaggctcgcattatgcttagcattctattgttcttataaacaataga
gccattgcttaggtaccaaaaactgagcctgtatatgcttataaacgtta
tgcttatagaaaaaaaacacgTAGATTCCTTCAATGACTCAAAACATCTA
AATCGTTTTGCTTTTAGcttaactattttccaaagtcgaaaACTCGATGA
GTTTGTAAGCTTTTGGCTTTTGGTAAGAAACccatttttaaagatttaaa
acttTCATATCTCGACTTTTGAAAAGACGTAGACAAAAAGTGGAGGTTTT
AATCAGAACCAGGTAAGAAATCTCCAAACAAAAGATCTCAAACTACTGAA
TAGTATTAAacgtaatcacatgataacgagtacaattcaagaaaaattac
actagagatttttctcttttcaattttcCGAATTTTCCGTCCGGAAGGAC
GAGAAATGTTCGAGACTAAAAAATCACACAAGTGCAATCAATTTTCGAGT
TGCACGAGTTttcatgtgattacgagctaagaTGGTCAAATatataaaga
aatttgcttCAACATTTTTAGGTGTGGGTCCGATGACAGTAGCAATGTTG
TTATACAACACAGTGGAAAGTTGTAAACGGGTGGCTAAAGAAAGACAGTT
CTTAAAGGTATGTCATAATACACCCCCTCCCTCCCCATGCATTCTTTTGT
CcattcaatttcataaaaacaattttaaaagaattatcACCCGCCTATCC
AGAAACCTCtttcgtttttctagtttttgtagtatgaattttcttatttg
ttttcaacacccccttttcacaaaACCATAGGGACCCCTTCCGACTGGAA
AAATTAGCAAAGATATCGTCACTGGTGGAATTTTATACCTcactgaaaat
gatcaaaataaccctcactgcaaaatattatgctatttttctaatcccca
ctgaattttctgacttgaaaacaatgaaatttaaatccccagccttAAAC
AATATTGAAATATCGATCTCCATCGAGTTTTAGTTCGTGATTGATCCTCT
TTTTCGCATATGATCATAATCGAGGATAAGATTCACTGTTCTCTAACTTT
TTGACTGGATCAGGCTTTCCATTATAAAAAGAAGCGTGCTTAGCTTTAGA
GCTGACTTGTCTTCGACTGTTTTTAATTCTGGTCGGTCAACAGCGTGTTT
TGAAACTCGAAACTTGAAACTTTAGGTAAATTAGAAAACAACATCACGGA
CTAGTCGATCCAAAACTGGACACACTACCGGAAAAGCTTTGCAGTTAGCC
TATATCATTAAACTTGACTTTACCTGAATTAAGGCTCCAAGTTCGAAAGG
GGTAACCAATTTTAGCTTTAATGGTGTACAATCATAcgatgaaaatattt
atatttatacttCATTTGCTTATTTCTTTCAGTCTGGGTTTGGTATATCG
TTGAAAAATGCAAGAATGCTTCGCTCGATGCTCAGGCGGTTCCGATTTTG
A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:789536..798786+ >XLOC_036885 ID=XLOC_036885|Name=XLOC_036885|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1932bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:789536..798786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCACAGATTATTGATGGTAAAGATATTGCAAgATGGCACAGATTATT
GATGGTAAAGATATTGCAAgacGAATCAGAGaccaaatcaaaattgatgt
cAGTCAACTTCATTCTGAGACTGGATTAACTCCAGGTCTAGCTATTGTAC
AAacGAATCAGAGaccaaatcaaaattgatgtcAGTCAACTTCATTCTGA
GACTGGATTAACTCCAGGTCTAGCTATTGTACAAGTTGGCAACAGGGAAG
ATTCAAACGTCTATGTCAGAACTAAACTTAAGTTTGCACAACAGGTTGGC
AACAGGGAAGATTCAAACGTCTATGTCAGAACTAAACTTAAGTTTGCACA
ACAGcttgGAATGAATGCTGAAATTTTAAAGCTACCAAATACATCAACAG
AGCAAGAActtgGAATGAATGCTGAAATTTTAAAGCTACCAAATACATCA
ACAGAGCAAGAATTATTATCAACAGTTGAGAGGCTGAACAATGATGATAA
TGTTCATGGCATCATTGTACAACTCCCACTTGATTCTGAAAATCCAATCG
ATTCTGCACTCGCCACAAATGCTGTGTCGCCAGAAAAAGATGTAGATGGT
TATTATCAACAGTTGAGAGGCTGAACAATGATGATAATGTTCATGGCATC
ATTGTACAACTCCCACTTGATTCTGAAAATCCAATCGATTCTGCACTCGC
CACAAATGCTGTGTCGCCAGAAAAAGATGTAGATGGGATCAACGACATCA
ATGCCGGACGTTTAGCAAGAGGCAGTTTAGACACCTGTTTTGCTCCTTGT
ACTCCAAATGGTTGTATGGAGCTCATCAAAACGACTGGATCAACGACATC
AATGCCGGACGTTTAGCAAGAGGCAGTTTAGACACCTGTTTTGCTCCTTG
TACTCCAAATGGTTGTATGGAGCTCATCAAAACGACTGGTATGGAGGTAT
CTGGTCAGAATGCTGTGGTGCTTGGTAGAAGTAAAATTGTGGTATGGAGG
TATCTGGTCAGAATGCTGTGGTGCTTGGTAGAAGTAAAATTGTGGGCACA
CCCATGGAAGAACTATTAAAATGGCATAACGCAACAGTCACCACTTGTCA
TTCAAGAACCAGAAATCTTCCTGAAGTTGGCACACCCATGGAAGAACTAT
TAAAATGGCATAACGCAACAGTCACCACTTGTCATTCAAGAACCAGAAAT
CTTCCTGAAGTTGTGGGCAGAGCTGATATTGTCGTGGCTGCAGTTGGCGT
TCCTGAAATGGTTAAGGTGGGCAGAGCTGATATTGTCGTGGCTGCAGTTG
GCGTTCCTGAAATGGTTAAGGGTAATTGGATAAAGCCTGGTGCAGTTGTA
ATCGATTGTGGAATAACTGCAGTGCCTGGGTAATTGGATAAAGCCTGGTG
CAGTTGTAATCGATTGTGGAATAACTGCAGTGCCTGATTCGAGTAAGAAG
AGTGGTCAGCGTCTAGTTGGAGATTGTGATTACAAAGCATGTAAAGAAAG
AGCTAGTTGGATTACACCTGTTCCAGGAGATTCGAGTAAGAAGAGTGGTC
AGCGTCTAGTTGGAGATTGTGATTACAAAGCATGTAAAGAAAGAGCTAGT
TGGATTACACCTGTTCCAGGAGGTGTGGGTCCGATGACAGTAGCAATGTT
GTTATACAACACAGTGGAAAGTTGTAAACGGGTGGCTAAAGAAAGACAGT
TCTTAAAGGTGTGGGTCCGATGACAGTAGCAATGTTGTTATACAACACAG
TGGAAAGTTGTAAACGGGTGGCTAAAGAAAGACAGTTCTTAAAGTCTGGG
TTTGGTATATCGTTGAAAAATGCAAGAATGCTTCGCTCGATGCTCAGGCG
GTTCCGATTTTGATCTGGGTTTGGTATATCGTTGAAAAATGCAAGAATGC
TTCGCTCGATGCTCAGGCGGTTCCGATTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:789536..798786 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 898-966:9183 |
| Aaloc | 814-897:8324 |
| Aaloc | 721-810:7511 |
| Aaloc | 661-717:7021 |
| Aaloc | 607-660:6522 |
| Aaloc | 523-606:3958 |
| Aaloc | 472-522:3600 |
| Aaloc | 370-468:2734 |
| Aaloc | 232-366:1826 |
| Aaloc | 178-231:827 |
| Aaloc | 118-177:665 |
| Aaloc | 37-117:285 |
| Aaloc | 1-33:1 |
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